發(fā)明背景
患者中耐藥性的進(jìn)行性發(fā)展為使用許多類型藥物長期治療的標(biāo)志,尤其是在癌癥和感染性疾病的治療領(lǐng)域中。已經(jīng)鑒定了介導(dǎo)某些類型的耐藥性現(xiàn)象的分子機(jī)制,而在其它情況中,獲得的以及重新形成的耐受性的機(jī)制目前仍然未知。
最初認(rèn)為在癌癥療法領(lǐng)域中相關(guān)的誘導(dǎo)的(獲得的)耐藥性的一種機(jī)制包括稱作P-糖蛋白(P-gp)的蛋白質(zhì)表達(dá)增加。P-gp位于細(xì)胞膜中并且起藥物流出泵的作用。該蛋白質(zhì)能夠從細(xì)胞中泵出毒性化學(xué)活性劑,包括許多類型的抗癌藥。因此,P-糖蛋白的增量調(diào)節(jié)通常產(chǎn)生對多種藥物的耐藥性。P-糖蛋白在腫瘤細(xì)胞中增量調(diào)節(jié)可以代表一種防御機(jī)制,該機(jī)制在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中發(fā)展以便防止受到毒性化學(xué)活性劑損害。目前已經(jīng)鑒定了具有與P-gp類似的功能的其它相關(guān)耐藥性蛋白質(zhì),包括多藥物-抗性-相關(guān)蛋白家族成員,諸如MRP1和ABCG2。在任何情況下,在研發(fā)對指定靶蛋白具有特異性且毒性較低的化合物時(shí),P-糖蛋白和相關(guān)ATP-結(jié)合彈夾(ABC)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白在臨床顯著性耐藥性中的重要性已經(jīng)下降。
另一種可能的獲得性耐藥的分子機(jī)制在于可選的信號途徑導(dǎo)致持續(xù)的細(xì)胞存活和代謝,即使原始藥物仍然對其靶標(biāo)有效。此外,藥物胞內(nèi)代謝的改變也可以導(dǎo)致治療功效喪失。此外,可以發(fā)生基因表達(dá)和基因擴(kuò)增結(jié)果的改變,從而導(dǎo)致指定靶蛋白的表達(dá)增加或減少,并且通常需要增加藥物劑量以便維持相同作用(Adcock和Lane,2003)。
突變誘導(dǎo)的耐藥性通常為感染性疾病領(lǐng)域中出現(xiàn)的情況。例如,已經(jīng)研發(fā)了幾種抑制在人免疫缺陷(HIV)病毒基因組中編碼的病毒逆轉(zhuǎn)錄酶或病毒蛋白酶的藥物。在文獻(xiàn)中充分確立了使用例如逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑反復(fù)治療HIV-感染的AIDS患者最終產(chǎn)生了病毒突變體形式,它們具有因已經(jīng)在編碼逆轉(zhuǎn)錄酶的基因中出現(xiàn)的突變而導(dǎo)致的對藥物的敏感性降低,所述的突變賦予所述酶的突變體形式受藥物的影響降低。
考慮到錯(cuò)誤被引入HIV基因組的比例,在HIV治療過程中耐藥性的出現(xiàn)并不令人意外。已知HIV逆轉(zhuǎn)錄酶特別具有錯(cuò)誤趨向性,其中正向突變率約為3.4x 10-5種突變/堿基對/復(fù)制循環(huán)(Mansky等,J.Virol.69:5087-94(1995))。然而,在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中編碼的內(nèi)源性基因的類似突變率低一個(gè)數(shù)量級以上。
新的證據(jù)表明耐藥性還可能因涉及編碼藥物靶標(biāo)的基因的突變結(jié)果產(chǎn)生(Gorre等,Science,2001;PCT/US02/18729)。在這種情況中,使患者接觸具體的治療物質(zhì),諸如靶向特異性所關(guān)注的蛋白質(zhì)(POI或"靶"蛋白)的指定癌癥藥物后,隱含在編碼為治療物質(zhì)靶標(biāo)的蛋白質(zhì)的基因中出現(xiàn)的突變的一組細(xì)胞的過度生長。目前還不了解該細(xì)胞群的過度生長是否因已經(jīng)隱含產(chǎn)生藥物抗性的POI的突變的患者的小百分比的預(yù)先存在的細(xì)胞所致,或這類突變是否在動(dòng)物或人接觸能夠活化或抑制所述POI的治療劑過程中或之后重新產(chǎn)生。任一情況中,這類突變結(jié)果均可以產(chǎn)生突變的蛋白(下文定義為theramutein),它受所述治療物質(zhì)的影響程度較低或可能完全不受影響。
慢性髓細(xì)胞性白血病(CML)的特征在于在該病穩(wěn)定或慢性期過程中保持分化能力的骨髓先祖(progenitor)過度增殖。多線證據(jù)已經(jīng)確立了作為某些形式的CML中的致病性癌基因的Abl酪氨酸激酶的失調(diào)。這種失調(diào)通常與稱作費(fèi)城染色體(Ph)的染色體易位相關(guān),導(dǎo)致由與Abelson酪氨酸激酶融合的BCR基因產(chǎn)物組成的融合蛋白表達(dá),由此形成具有酪氨酸激酶活性的p210Bcr-Abl。相關(guān)的融合蛋白稱作p190Bcr-Abl,其由BCR基因中的不同斷點(diǎn)產(chǎn)生并且已經(jīng)證實(shí)出現(xiàn)在具有費(fèi)城染色體陽性(Ph+)的急性成淋巴細(xì)胞性白血病(ALL)的患者中(Melo,1994;Ravandi等,1999)。轉(zhuǎn)化看起來因多信號途徑,包括那些涉及RAS、MYC和JUN的途徑活化所致。甲磺酸伊馬替尼(“STI-571”或)為靶向Abl的激酶結(jié)構(gòu)域的ATP結(jié)合位點(diǎn)的2-苯氨基嘧啶(Druker等,NEJM 2001,p.1038)。隨后還通過其它方法已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了血小板衍生的生長因子(PDGF)β受體的抑制劑和Kit酪氨酸激酶,其中后者涉及胃腸道間質(zhì)瘤的發(fā)生(參見下文)。
直到近期為止,尚未觀察到在使用指定內(nèi)源性細(xì)胞蛋白的特異性抑制劑治療的過程中,其相應(yīng)的內(nèi)源性基因中的突變可以導(dǎo)致蛋白質(zhì)不同的表達(dá),所述蛋白質(zhì)變體的細(xì)胞功能耐受所述抑制劑。Charles Sawyers和同事所做的工作(Gorre等,Science 293:876-80(2001);PCT/US02/18729)首次證實(shí)了使用能夠抑制p210Bcr-Abl酪氨酸激酶的藥物(即STI-571)治療患者后,在編碼產(chǎn)生p210Bcr-Abl癌的含有Abelson酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域的靶蛋白的基因中隱含突變的所述患者中可能出現(xiàn)具有臨床意義的細(xì)胞群。各種這類突變產(chǎn)生p210Bcr-Abl的突變體形式,它們對Gleevec治療的反應(yīng)性低于產(chǎn)生最初癌癥的形式。值得注意的是,出現(xiàn)的突變對突變蛋白賦予了對蛋白激酶抑制劑藥物作用的相對抗性,同時(shí)維持了一定程度的突變蛋白激酶的原始底物特異性。在Gorre等的工作前,本領(lǐng)域技術(shù)人員一般認(rèn)為可以在接觸抑制Abelson蛋白激酶的化合物,諸如STI-571的患者中觀察到的抗性類型可能因上述藥物抗性的其它機(jī)制中的一種或多種或由某些其它尚不了解的機(jī)制導(dǎo)致,但在任何情況下,所述的抗性均可以涉及不同于藥物靶標(biāo)POI的靶標(biāo)(蛋白質(zhì)或其它)。
因此,治療臨床相關(guān)的還為現(xiàn)存療法靶標(biāo)的蛋白質(zhì)突變體形式可能極為有用。這類突變蛋白(如下文定義的theramuteins)正在被公認(rèn)和理解為復(fù)發(fā)性癌癥中的重要靶標(biāo),并且還在其它疾病中變得具有重要性。存在對治療劑的需求,這類治療劑對可能在一般有效藥物療法之前、過程中或之后產(chǎn)生的細(xì)胞蛋白的這類藥物抗性變體形式具有活性。本發(fā)明的關(guān)鍵目的在于提供可以用作用于克服在內(nèi)源性出現(xiàn)的蛋白質(zhì)中的突變-誘導(dǎo)的耐藥性的可能治療劑的化合物。
發(fā)明概述
本發(fā)明涉及為內(nèi)源性蛋白質(zhì)的變體形式的抑制劑或活化劑的活性劑以及鑒定這類變體的新方法。特別關(guān)注的是由已經(jīng)突變的基因編碼的內(nèi)源性蛋白質(zhì)變體的抑制劑和活化劑,所述的變體通常在接觸已知為相應(yīng)未突變內(nèi)源性蛋白質(zhì)的抑制劑或活化劑的化學(xué)活性劑后產(chǎn)生或至少在已經(jīng)產(chǎn)生后首先得到鑒定。這類蛋白質(zhì)變體(突變蛋白)在本文中稱作"theramuteins",它們可以自發(fā)在生物體內(nèi)出現(xiàn)(并且在某些情況中預(yù)先存在突變)或所述的突變體可以作為使用當(dāng)能夠抑制所述theramutein的未突變形式(本文稱作“prototheramutein”)的指定化學(xué)活性劑治療生物體時(shí)產(chǎn)生的選擇壓力的結(jié)果產(chǎn)生??梢岳斫庠谀承┣闆r中,prototheramutein可以為POI的“野生型"形式(例如因失調(diào)產(chǎn)生疾病的蛋白質(zhì))。在其它情況中,prototheramutein為引起疾病的“野生型”蛋白質(zhì)的變體,它已經(jīng)突變且由此促使作為所述在先突變結(jié)果的患病狀態(tài)發(fā)生。Prototheramutein的后一種類型的一個(gè)實(shí)例為P210BCR-ABL癌蛋白,并且在315位上隱含蘇氨酸(T)到異亮氨酸(I)突變的這種蛋白質(zhì)的突變體形式稱作P210BCR-ABL-T315I,并且為theramutein的一個(gè)實(shí)例。本文所用的命名“P210BCR-ABL“與術(shù)語“p210Bcr-Abl”、“野生型Bcr-Abl蛋白質(zhì)”等為同義詞。
Theramuteins為一類罕有的內(nèi)源性蛋白質(zhì),它們隱含了賦予所述蛋白質(zhì)對藥物的抗性的突變,已知所述的藥物以治療有效方式抑制或活化它們的未突變對應(yīng)體。目前已知編碼少數(shù)幾種這類蛋白質(zhì)的內(nèi)源性基因在某些情況下表現(xiàn)出這類突變。本發(fā)明涉及抑制Abelson酪氨酸激酶蛋白質(zhì)的某些耐藥性突變體(theramuteins)的組合物,所述的Abelson酪氨酸激酶蛋白質(zhì)在文獻(xiàn)中最初稱作P210-Bcr-Abl,它涉及慢性髓細(xì)胞性白血病的發(fā)生。本發(fā)明還涉及鑒定抑制或活化任意theramutein的一般方法。
本發(fā)明的方法特別涉及鑒定theramuteins的特異性抑制劑或特異性活化劑的方法。術(shù)語“特異性”在上下文中術(shù)語“抑制劑”或“活化劑”中的應(yīng)用(參見下文中的定義)指的是所述的抑制劑或活化劑結(jié)合theramutein并且抑制或活化theramutein的細(xì)胞功能,但不結(jié)合和活化或抑制細(xì)胞中的各種其它蛋白質(zhì)或非-蛋白質(zhì)靶標(biāo)。本領(lǐng)域技術(shù)人員充分了解,在醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)中討論蛋白質(zhì)抑制劑或活化劑的作用時(shí),在特異性抑制劑或特異性活化劑的概念和靶蛋白“特異性”的相關(guān)概念方面存在一定程度的可變性。因此,就本發(fā)明的目的而言,物質(zhì)為指定theramutein的特異性抑制劑或特異性活化劑,條件是所述物質(zhì)能夠以指定濃度抑制或活化所述theramutein,使得相應(yīng)的表型反應(yīng)(phenoresponse)以適當(dāng)方式得到調(diào)節(jié),而在相同指定濃度下對相應(yīng)對照細(xì)胞的表型反應(yīng)不具有可感覺到的作用,所述的相應(yīng)對照細(xì)胞基本上不表達(dá)theramutein或其相應(yīng)的prototheramutein。
在某些實(shí)施方案中,物質(zhì)可以為prototheramutein和theramutein的調(diào)節(jié)劑。在其它實(shí)施方案中,除為prototheramutein和theramutein的調(diào)節(jié)劑外,物質(zhì)還可以調(diào)節(jié)具有相似功能的蛋白質(zhì)的活性。如上所述,除抑制p210Bcr Abl酪氨酸激酶外,甲磺酸伊馬替尼還能夠抑制在某些胃腸道間質(zhì)瘤中超表達(dá)的c-kit癌基因產(chǎn)物(也為酪氨酸激酶)以及在某些慢性骨髓單核細(xì)胞性白血病(CMML)中表達(dá)的PDGFβ受體(也為酪氨酸激酶)。這類化合物有時(shí)稱作“適度特異性”抑制劑。
本發(fā)明還提供了可以用于鑒定活化或抑制theramutein的物質(zhì)的一般方法,所述的物質(zhì)將theramutein活化或抑制到相同程度、并且優(yōu)選到甚至大于能夠抑制該蛋白質(zhì)的相應(yīng)"野生型"形式的已知藥物物質(zhì)的程度(然而,本領(lǐng)域技術(shù)人員充分了解這類蛋白質(zhì)的所述"野生型"形式已經(jīng)在產(chǎn)生所述蛋白質(zhì)參與的相應(yīng)疾病的過程中突變)。
在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式I的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R2選自-CR21a-、-NR22b-和-(C=R23)-;
各個(gè)R21獨(dú)立地選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-O-(C1-3烷基)、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R23選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R3選自-CR31c-、-NR32d-和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43各自選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R2為-NR22b-且R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、NR0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
本發(fā)明提供了治療癌癥和其它疾病的基礎(chǔ)新方式,其中無論通過何種機(jī)制,使用現(xiàn)存的藥物化合物治療后均跟隨可鑒定的(臨床顯著的)theramutein-介導(dǎo)的藥物抗性,通過提供在theramuteins產(chǎn)生和照此鑒定時(shí)(Wakai等,2004報(bào)導(dǎo)了一個(gè)實(shí)例,其中theramutein可以在持續(xù)治療方案過程中產(chǎn)生)或在表達(dá)theramutein的細(xì)胞的臨床顯著性群體過度生長前預(yù)先給予備選藥物來進(jìn)行。此外,如果對特定疾病的藥物治療在表達(dá)藥物靶向的蛋白質(zhì)的某種theramutein的個(gè)體亞群中有效性較低,那么本發(fā)明能夠通過提供有效針對所述theramutein的備選藥物物質(zhì)來適應(yīng)那些受試者的治療。
1.本發(fā)明提供了測定化學(xué)活性劑作為細(xì)胞中theramutein的調(diào)節(jié)劑是否至少與作為已知的相應(yīng)prototheramutein調(diào)節(jié)劑的物質(zhì)同樣有效的方法。該方法的一個(gè)實(shí)施方案包括使表達(dá)prototheramutein并且能夠表現(xiàn)出反應(yīng)性表型特征(與細(xì)胞中prototheramutein的功能相關(guān))的對照細(xì)胞與已知的prototheramutein調(diào)節(jié)劑接觸,使表達(dá)theramutein并且也能夠表現(xiàn)出反應(yīng)性表型特征(與細(xì)胞中theramutein的功能相關(guān))的測試細(xì)胞與化學(xué)活性劑接觸,并且比較測試細(xì)胞的反應(yīng)與處理的對照細(xì)胞的反應(yīng);以便確定該化學(xué)活性劑作為theramutein的調(diào)節(jié)劑至少與作為已知的prototheramutein調(diào)節(jié)劑的物質(zhì)同樣有效。在某些其它實(shí)施方案中,一種類型的對照細(xì)胞可能完全不表達(dá)prototheramutein。在其它實(shí)施方案中,對照細(xì)胞可以表達(dá)的prototheramutein的量與測試細(xì)胞表達(dá)的theramutein的量大體相同。在其它實(shí)施方案中,在某些條件下,對照細(xì)胞能夠表現(xiàn)出的反應(yīng)性表型特征的程度與測試細(xì)胞大體相同。
2.本發(fā)明特別關(guān)注的Theramuteins為那些涉及調(diào)節(jié)功能的Theramuteins,諸如酶;蛋白激酶;酪氨酸激酶;受體酪氨酸激酶;絲氨酸蘇氨酸蛋白激酶;雙向特異性蛋白激酶;蛋白酶;基質(zhì)金屬蛋白酶;磷酸酶;細(xì)胞周期控制蛋白;停靠蛋白質(zhì),諸如IRS家族成員;細(xì)胞表面受體;G-蛋白;離子通道;DNA-和RNA-結(jié)合蛋白;聚合酶等。不打算限止可以用于本發(fā)明的theramutein的類型。同時(shí),已知三種theramuteins:BCR-ABL、c-Kit和EGFR。
3.可能與細(xì)胞中存在的theramutein(或prototheramutein)相關(guān)的任意反應(yīng)性表型特征可以用于本方法,包括:例如生長或培養(yǎng)特性、theramutein底物的磷酸化狀態(tài)(或其它修飾)和任意類型的細(xì)胞的暫時(shí)特征,正如所定義和詳細(xì)討論的。
附圖說明
附圖1顯示了不同濃度的化合物2(C2)對未轉(zhuǎn)化的載體對照Ba/F3細(xì)胞(為IL-3依賴性)以及表達(dá)"野生型"p210Bcr-Abl的Ba/F3細(xì)胞(命名為p210Bcr-Abl-wt)和表達(dá)p210Bcr-Abl-T315I藥物抗性突變株的Ba/F3細(xì)胞的生長和存活率的作用。如本說明書中詳細(xì)描述的用自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)器測定細(xì)胞計(jì)數(shù)和存活率。細(xì)胞計(jì)數(shù)由實(shí)心顏色條表示;細(xì)胞存活率由虛線條表示。注意STI-571有效抑制P210細(xì)胞系生長(灰色條),而甚至在10μM濃度下也不能抑制T315I細(xì)胞系生長(白色條)。500nM C2在該劑量響應(yīng)系列范圍內(nèi)表現(xiàn)出最大的特異性缺口。將10μM的STI-571與500nM的C2對T315I細(xì)胞系的作用進(jìn)行比較(白色條)??s寫:DMSO:二甲亞砜(用于藥物溶解的溶劑)。
附圖2顯示了不同濃度的化合物6(C6)對未轉(zhuǎn)化的載體對照Ba/F3細(xì)胞以及表達(dá)p210Bcr-Abl-T315I藥物抗性突變株的Ba/F3細(xì)胞的生長和存活率的作用。所有其它詳細(xì)描述均如附圖1中所。
附圖3顯示了通過比較篩選中鑒定的不同化合物就其對表達(dá)prototheramutein和theramutein的細(xì)胞系中的作用而言得到的特異性缺口的不同測定結(jié)果?;衔?(C3)顯示了用于鑒定化合物的能力的最佳實(shí)例,該化合物對theramutein所施加的作用甚至大于其相應(yīng)對prototheramutein的作用。(E組).A組:對照組DMSO治療;B:陰性異源特異性缺口;C:輕度陽性的異源特異性缺口;D:顯著陽性的同源特異性缺口;E:陽性異源特異性缺口。參見用于解釋的正文。A組:對照組DMSO治療;B:陰性異源特異性缺口;C:輕度陽性的異源特異性缺口;D:顯著陽性的同源特異性缺口;參見解釋部分。
附圖4顯示了用于自磷酸化活性檢測的重組P210Bcr-Abl野生型和T315I突變體激酶結(jié)構(gòu)域的放射自顯影照片。將200ng蛋白質(zhì)預(yù)先與測試物質(zhì)在標(biāo)準(zhǔn)自磷酸化反應(yīng)條件下一起溫育10分鐘,然后加入放射性標(biāo)記的ATP并使反應(yīng)在30℃下進(jìn)行30分鐘,此后通過SDS-PAGE分離樣品。將凝膠進(jìn)行銀染色,在真空中干燥并且接觸X-光片。注意在10μM STI 571對野生型P210Bcr-Abl有效的同時(shí),它實(shí)際上在濃度甚至達(dá)100μM時(shí)對T315I激酶結(jié)構(gòu)域無效。C2和C6為最佳的兩種鑒定的化合物,隨后是C5、C7和C4。所有這些化合物均測試顯陽性至一定程度?!癙210細(xì)胞系”指的是表達(dá)p210BCR-ABL-wt的細(xì)胞?!癟315I細(xì)胞系”指的是表達(dá)p210BCR-ABL-T315I的細(xì)胞。
附圖5表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖6表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖7表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖8表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖9表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖10表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖11表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖12表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
附圖13表示本發(fā)明有代表性的化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu)。
發(fā)明詳述
本文所用的術(shù)語“鹵素(halo)”或“鹵素(halogen)”包括氟、氯、溴和碘。
本文所用的術(shù)語“烷基”關(guān)注的是帶有1-6個(gè)碳原子的取代和未被取代的直鏈和支鏈烷基。優(yōu)選的烷基包括甲基、乙基、丙基、異丙基、丁基、異丁基、叔丁基等。另外,烷基可以任選地被一個(gè)或多個(gè)選自鹵素、CN、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR的取代基取代。
本文所用的術(shù)語“環(huán)烷基”關(guān)注的是取代和未被取代的環(huán)烷基。優(yōu)選的環(huán)烷基為那些含有3-7個(gè)碳原子的單環(huán),并且包括環(huán)丙基、環(huán)戊基、環(huán)己基等。其它環(huán)烷基可以選自C7-C10雙環(huán)系或C9-C14三環(huán)系。另外,環(huán)烷基可以任選地被一個(gè)或多個(gè)選自鹵素、CN、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR的取代基取代。
本文所用的術(shù)語“鏈烯基”關(guān)注的是取代和未被取代的直鏈和支鏈烯基團(tuán)。優(yōu)選的鏈烯基為那些含有2-6個(gè)碳原子的鏈烯基。另外鏈烯基可以任選地被一個(gè)或多個(gè)選自鹵素、CN、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR的取代基取代。
本文所用的術(shù)語“炔基”關(guān)注的是取代和未被取代的直鏈和支鏈炔基。優(yōu)選的炔基為那些含有2-6個(gè)碳原子的炔基。另外,炔基可以任選地被一個(gè)或多個(gè)選自鹵素、CN、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR的取代基取代。
本文所用的術(shù)語“芳烷基”關(guān)注的是帶有芳族基團(tuán)作為取代基的烷基,所述的芳族基團(tuán)可以被取代和未被取代。芳烷基可以任選地在芳基上被一個(gè)或多個(gè)取代基取代,所述的取代基選自鹵素、CN、CF3、NR2、環(huán)-氨基、NO2、OR、CF3、-(CH2)xC(O)(CH2)yR、-(CH2)xC(O)N(R')(R")、-(CH2)xC(O)O(CH2)yR、-(CH2)xN(R')(R")、-N(R)SO2R、-O(CH2)xC(O)N(R')(R")、-SO2N(R')(R")、-(CH2)xN(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-O-(CH2)y-R、-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xC(O)N(R)-(CH2)y-R、-O-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、取代和未被取代的烷基、取代和未被取代的環(huán)烷基、取代和未被取代的芳烷基、取代和未被取代的鏈烯基、取代和未被取代的炔基、取代和未被取代的芳基和取代和未被取代的雜環(huán),其中所述取代的烷基、取代的環(huán)烷基、取代的芳烷基、取代的鏈烯基、取代的炔基、取代的芳基和取代的雜環(huán)可以被鹵素、CN、CF3、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR中的一個(gè)或多個(gè)取代。
本文所用的術(shù)語“雜環(huán)基”或"雜環(huán)"關(guān)注的是帶有至少一個(gè)雜原子作為環(huán)成員的芳族和非-芳族環(huán)狀基團(tuán)。優(yōu)選的雜環(huán)基為那些含有5或6個(gè)環(huán)原子的包括至少一個(gè)雜原子的雜環(huán)基,并且包括:環(huán)狀胺類,諸如嗎啉代、哌啶子基、吡咯烷并等;和環(huán)醚類,諸如四氫呋喃、四氫吡喃等。芳族雜環(huán)基,也稱作“雜芳基”關(guān)注的是可以包括1-3個(gè)雜原子的單-環(huán)雜-芳族基團(tuán),例如吡咯、呋喃、噻吩、咪唑、唑、噻唑、三唑、吡唑、吡啶、吡嗪、噠嗪、嘧啶等。本文所用的術(shù)語雜芳基還包括帶有兩個(gè)或多個(gè)環(huán)的多環(huán)雜-芳族系統(tǒng),其中的兩個(gè)原子為兩個(gè)相鄰的環(huán)共用(這些環(huán)是"稠合的"),其中環(huán)中的至少一個(gè)為雜芳基,例如其它環(huán)可以為環(huán)烷基、環(huán)烯基、芳基、雜環(huán)和/或雜芳基。多環(huán)雜芳族系統(tǒng)的實(shí)例包括喹啉、異喹啉、四氫異喹啉、喹喔啉、quinaxoline、苯并咪唑、苯并呋喃、嘌呤、咪唑并吡啶、苯并三唑等。另外,雜環(huán)基可以任選地被如下基團(tuán)取代:鹵素、CN、CF3、NR2、環(huán)-氨基、NO2、OR、CF3、-(CH2)xC(O)(CH2)yR、-(CH2)xC(O)N(R')(R")、-(CH2)xC(O)O(CH2)yR、-(CH2)xN(R')(R")、-N(R)SO2R、-O(CH2)xC(O)N(R')(R")、-SO2N(R’)(R”)、-(CH2)xN(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-O-(CH2)y-R、-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xC(O)N(R)-(CH2)y-R、-O-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、取代和未被取代的烷基、取代和未被取代的環(huán)烷基、取代和未被取代的芳烷基、取代和未被取代的鏈烯基、取代和未被取代的炔基、取代和未被取代的芳基和取代和未被取代的雜環(huán),其中所述取代的烷基、取代的環(huán)烷基、取代的芳烷基、取代的鏈烯基、取代的炔基、取代的芳基和取代的雜環(huán)可以被鹵素、CN、CF3、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR中的一個(gè)或多個(gè)取代。
本文所用的術(shù)語“芳基”或“芳族基團(tuán)”關(guān)注的是單-環(huán)芳族基團(tuán)(例如苯基、吡啶基、吡唑基等)和多環(huán)環(huán)系(萘基、喹啉等)。多環(huán)可以帶有兩個(gè)或多個(gè)環(huán),其中的兩個(gè)原子為兩個(gè)相鄰的環(huán)共用(這些環(huán)是"稠合的"),其中環(huán)中的至少一個(gè)為芳族環(huán),例如其它環(huán)可以為環(huán)烷基、環(huán)烯基、芳基、雜環(huán)和/或雜芳基。另外,芳基可以任選地被一個(gè)或多個(gè)取代基取代,所述的取代基選自鹵素、CN、CF3、NR2、環(huán)-氨基、NO2、OR、CF3、-(CH2)xC(O)(CH2)yR、-(CH2)xC(O)N(R')(R")、-(CH2)xC(O)O(CH2)yR、-(CH2)xN(R')(R")、-N(R)SO2R、-O(CH2)xC(O)N(R')(R")、-SO2N(R')(R")、-(CH2)xN(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-(CH2)y-R、-(CH2)xN(R)-C(O)-O-(CH2)y-R、-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、-(CH2)xC(O)N(R)-(CH2)y-R、-O-(CH2)x-C(O)-N(R)-(CH2)y-R、取代和未被取代的烷基、取代和未被取代的環(huán)烷基、取代和未被取代的芳烷基、取代和未被取代的鏈烯基、取代和未被取代的炔基、取代和未被取代的芳基和取代和未被取代的雜環(huán),其中所述取代的烷基、取代的環(huán)烷基、取代的芳烷基、取代的鏈烯基、取代的炔基、取代的芳基和取代的雜環(huán)可以被鹵素、CN、CF3、CO2R、C(O)R、C(O)NR2、NR2、環(huán)-氨基、NO2和OR中的一個(gè)或多個(gè)取代。
本文所用的術(shù)語"雜原子",特別是作為環(huán)雜原子指的是N、O和S。
各個(gè)R獨(dú)立地選自H、取代和未被取代的烷基、取代和未被取代的環(huán)烷基、取代和未被取代的芳烷基、取代和未被取代的芳基和取代和未被取代的雜環(huán),其中所述取代的烷基、取代的環(huán)烷基、取代的芳烷基、取代的芳基和取代的雜環(huán)可以被一個(gè)或多個(gè)鹵素、CN、CF3、OH、CO2H、NO2、C1-6烷基、-O-(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)和-N(C1-6烷基)2取代。
各個(gè)R'和R"獨(dú)立地選自H或取代和未被取代的烷基、取代和未被取代的環(huán)烷基、取代和未被取代的芳烷基、取代和未被取代的芳基和取代和未被取代的雜環(huán),其中所述取代的烷基、取代的環(huán)烷基、取代的芳烷基、取代的芳基和取代的雜環(huán)可以被一個(gè)或多個(gè)鹵素、CN、CF3、OH、CO2H、NO2、C1-6烷基、-O-(C1-6烷基)、-NH2、-NH(C1-6烷基)和-N(C1-6烷基)2取代;或R'和R"可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有至多三個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán)。每個(gè)x和每個(gè)y獨(dú)立地選自0-4。
在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式I的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R2選自-CR21a-、-NR22b-和-(C=R23)-;
各個(gè)R21獨(dú)立地選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-O-(C1-3烷基)、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R23選自-O、S、N-R0和N-OR0;
R3選自-CR31c-、-NR32d-和-(C=R33)-;
R31基團(tuán)各自選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
R32基團(tuán)各自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R2為-NR22b-且R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、NR0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
本文所述的本發(fā)明中的重要組成部分和概念教導(dǎo)在于本發(fā)明化合物的R2和R3位置均非任意芳族或非-芳族環(huán)結(jié)構(gòu)的成員。我們發(fā)現(xiàn)帶有R2和/或R3位置作為任意芳族或非-芳族環(huán)結(jié)構(gòu)的成員的化合物無法有效地抑制T315I theramutein,而除具有其它優(yōu)選的活性基團(tuán)外,在這些位置上缺乏這樣的環(huán)成分的本發(fā)明化合物為T315I theramutein的有效抑制劑。
在本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,環(huán)A為芳族環(huán)。
在本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,X1或X2為N。在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,X1和X2均為N。在本發(fā)明特別優(yōu)選的實(shí)施方案中,環(huán)A為吡啶環(huán)或嘧啶環(huán)。在進(jìn)一步優(yōu)選的實(shí)施方案中,環(huán)A選自如下提供的結(jié)構(gòu):
在一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,如果R2或R4被分別選為-NR22b-或-NR42-,那么R31不選自鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0或OH。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式Ia的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R3選自-CR31c-、-NR32d-,和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式Ib的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
各個(gè)R22各自獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-(C=R43)-和-O-;
R41各自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
在本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方案中,選擇通式I的R2、R3和R4以便得到下列化學(xué)基團(tuán):
-N(R22)-N=C(R41)-
-N(R22)-N(R32)-C(=O)-
-N(R22)-N(R32)-C(R41)(R41)-
-N(R22)-C(R31)(R31)-C(R41)(R41)-
-N(R22)-C(R31)(R31)-C(=O)-
-N=N-C(R41)(R41)-
-C(R21)=C=C(R41)-
-C(R21)=C(R31)-C(=O)-
-C(R21)=C(R31)-C(R41)(R41)-
-C(R21)(R21)-C(R31)=C(R41)-
-C(R21)(R21)-C(R31)(R31)-C(=O)-
-C(R21)(R21)-C(R31)(R31)-C(R41)(R41)-
-C(R21)(R21)-N(R32)-C(=O)-
-C(R21)(R21)-N(R32)-C(R41)(R41)-
-N(R22)-C(=O)-C(R41)(R41)-
-N(R22)-C(=O)-N(R41)-
-N(R22)-C(=O)-O-
-C(R21)(R21)-C(=O)-C(R41)(R41)-
-C(R21)(R21)-C(=O)-N(R42)-
-N(R22)-C(=NR34)-N(R42)-
-C(=O)-N(R32)-N(R42).
用于R2、R3和R4的特別優(yōu)選的化學(xué)基團(tuán)包括:
-N(R22)-N=C(R41)-
-N(R22)-N(R32)-C(=O)-
-N(R22)-C(R31)(R31)-C(R41)(R41)-
-N(R22)-C(R31)(R31)-C(=O)-
-C(R21)(R21)-C(=O)-C(R41)(R41)-
-C(R21)(R21)-C(=O)-N(R42)-
-N(R22)-C(=NR34)-N(R42)-
-C(=O)-N(R32)-N(R42)。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,R6或R7為可以任選被取代的芳基。特別優(yōu)選的芳基包括取代或未被取代的苯基和吡啶基。在額外或備選的實(shí)施方案中,優(yōu)選取代基R21和R22獨(dú)立地選自具有小的空間體積的基團(tuán)并且優(yōu)選自H和CH3,且更優(yōu)選H。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式II的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
R9選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式IIa的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式IIb的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
R14選自H和F;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R60;
各個(gè)R60獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR0、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組;
R61選自芳基和雜環(huán);
Q選自化學(xué)鍵或具有式-O-、-(CH2)i-、-(CH2)iC(O)(CH2)j-、-(CH2)i-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)O(CH2)j-、-(CH2)iN(R62)C(O)-(CH2)j-、-(CH2)iOC(O)N(R62)-(CH2)j-和-O-(CH2)i-C(O)N(R62)-(CH2)j-的基團(tuán);
R62選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
h為0-4;
i為0-4;且
j為0-4。
在通式IIb化合物的優(yōu)選實(shí)施方案中,R60選自鹵素、CF3和OH。
通式II、IIa或IIb的典型化合物包括下列結(jié)構(gòu):
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式III的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R10選自-Y'-R18;
Y'選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R18選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基,環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
在另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式IIIa的P210BCR-ABL-T315Itheramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
通式III或IIIa的典型化合物包括下列結(jié)構(gòu):
在另一個(gè)實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式IV的P210BCR-ABL-T315I theramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R44選自H、烷基、環(huán)烷基、-(C=O)R0、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R45選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
通式IV的典型化合物包括下列結(jié)構(gòu):
在另一個(gè)實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式V的P210BCR-ABL-T315I theramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
在另一個(gè)實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式Va的P210BCR-ABL-T315I theramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
通式V或Va的典型化合物包括下列結(jié)構(gòu):
在另一個(gè)實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式VI的P210BCR-ABL-T315I theramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
在另一個(gè)實(shí)施方案中,本發(fā)明提供了具有通式VIa的P210BCR-ABL-T315I theramutein的抑制劑:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
通式VI或VIa的典型化合物包括下列結(jié)構(gòu):
本文所用的每種表達(dá)方式的定義,例如烷基、m、n、R、R'等在任何結(jié)構(gòu)中出現(xiàn)一次以上時(shí),與其在同一結(jié)構(gòu)中的其它處的定義無關(guān)。
就對結(jié)構(gòu)I、Ia、Ib、II、IIa、IIb、III、IIIa、IV、IVa、V、Va、VI和VIa化合物的上述描述中的每一種而言,對術(shù)語鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基、雜環(huán)基或雜環(huán)的每次敘述獨(dú)立地選自本節(jié)開始部分中提供的這些術(shù)語的定義。
可以理解本文提供的化學(xué)結(jié)構(gòu)包括如下隱含條件,即取代按照取代原子和取代基的允許價(jià)鍵進(jìn)行并且取代產(chǎn)生穩(wěn)定的化合物,例如,該化合物不會(huì)通過諸如重排、環(huán)化、消除等自發(fā)進(jìn)行轉(zhuǎn)化。
當(dāng)本發(fā)明的化合物中存在一個(gè)或多個(gè)手性中心時(shí),本文所述的通式包括各異構(gòu)體及其混合物(例如外消旋物等)。
當(dāng)本發(fā)明的化合物中存在一個(gè)或多個(gè)雙鍵時(shí),本文所述的通式包括順式-和反式-異構(gòu)體。盡管本文描述了順式或反式(cis of trans)構(gòu)型的化學(xué)結(jié)構(gòu)(諸如,例如結(jié)構(gòu)II、IIa、V、Va、VI和VIa),兩種構(gòu)型的含義是每種通式均包括。
在某些實(shí)施方案中,本發(fā)明的化合物可以以幾種互變異構(gòu)體形式存在。因此,本文所述的化學(xué)結(jié)構(gòu)包括所有可能的列舉的化合物的互變異構(gòu)形式。
本發(fā)明的化合物一般由商購原料和公知化學(xué)技術(shù)制備??梢匀缦潞铣杀景l(fā)明的實(shí)施方案。藥物或合成化學(xué)領(lǐng)域技術(shù)人員易于熟知實(shí)施如下所述的合成手段所必不可少的操作步驟和技術(shù)。
可以通過在Gineinah等的p.562(Arch.Pharm.Pharm.Med.Chem.2002,11,556-562)所述相似的條件下使合適的肼化合物諸如A和合適的醛,諸如B反應(yīng)制備實(shí)施方案,其中R2=NH,R3=N,R4=CH且R5=-芳基。
例如,在質(zhì)子溶劑,諸如C1-C6醇中將A與1.1當(dāng)量的B一起加熱1-24小時(shí),隨后冷卻并且收集沉淀,可以得到C?;蛘?,可以通過蒸發(fā)溶劑并且通過使用硅膠、氧化鋁或C4-C18反相介質(zhì)的色譜法純化分離產(chǎn)物C。類似方法可以適用于“芳基”被如R5中定義的其它基團(tuán)取代的情況。
可以通過使合適的肼化合物,諸如D和活化的羧酸,諸如E反應(yīng)制備實(shí)施方案,其中R2=NH,R3=NR32,R4=C(O)且R5=雜環(huán),其中LG為離去基團(tuán),諸如鹵素、1-氧基苯并三唑、五氟苯氧基、對-硝基苯氧基等;或化合物E還可以為不對稱羧酸酐,其中可以使用與Nair和Mehta的p.408(Indian J.Chem.1967 5,403-408)中所述相似的條件。
例如,在0℃-溶劑沸點(diǎn)的合適的溫度下,在有堿,諸如吡啶或另一種叔胺存在和任選在有催化劑,諸如4-N,N-二甲氨基吡啶存在下的惰性溶劑,諸如二氯甲烷、1,2-二氯乙烷或N,N-二甲基甲酰胺中用活性酯,諸如雜環(huán)-C(O)-OC6F5處理D可以得到F,可以通過蒸發(fā)溶劑,隨后使用硅膠、氧化鋁或C4-C18反相介質(zhì)的色譜法對其進(jìn)行分離。易于由相應(yīng)的羧酸和五氟苯酚,使用碳二亞胺,諸如二環(huán)己基碳二亞胺作為縮合試劑制備E的上述活性酯實(shí)例。類似方法可以適用于“雜環(huán)”被如R5中定義的其它基團(tuán)取代的情況。
可以通過使合適的親核體,例如,肼衍生物和在與氮原子相鄰位置上帶有鹵素取代基的雜芳族化合物反應(yīng)制備前體,諸如A和D。例如,可以使用與Wu等(J.Heterocyclic Chem.1990,27,1559-1563)、Breshears等(J.Am.Chem.Soc.1959,81,3789-3792)或Gineinah等(Arch.Pharm.Pharm.Med.Chem.2002,11,556-562)所述類似的方法,由例如,2,4-二鹵代嘧啶衍生物為原料制備化合物A和D的實(shí)例,所述原料中的許多為商購可得,或者易于由本領(lǐng)域技術(shù)人員制備。因此,用胺或其它親核體(Z),任選在有添加的堿存在下處理合適的2,4-二鹵代嘧啶衍生物G,選擇性取代嘧啶環(huán)上的4-鹵素取代基。隨后用第二種親核試劑,諸如肼或肼衍生物任選在溶劑,諸如C1-C6醇和任選在有添加的堿存在下處理產(chǎn)物,取代嘧啶環(huán)上的2-鹵素取代基,從而得到為上述結(jié)構(gòu)A和D的實(shí)例的化合物。
可以通過諸如下列或其直接修飾的這類方法合成實(shí)施方案,其中R2為-NR22且R3為-C(=R33)??梢砸院线m的環(huán)A衍生物J為原料進(jìn)行合成,所述的環(huán)A衍生物J帶有與必需的環(huán)氮相鄰的離去基團(tuán)(LG)。如上所述,上述結(jié)構(gòu)G與結(jié)構(gòu)G與親核體Z的反應(yīng)產(chǎn)物為這類合適的環(huán)A衍生物J的實(shí)例。合適的LG’基團(tuán)為鹵素、烷硫基、烷基磺?;⑼榛撬狨セ蚍蓟撬狨?。用胺R12NH2處理J對LG’進(jìn)行取代得到中間體K。該化學(xué)轉(zhuǎn)化的實(shí)例由Capps等在J.Agric.Food Chem.1993,41,2411-2415中報(bào)導(dǎo),其中R12為H且LG’為CH3SO2-,并且R12為H且LG’為Cl的實(shí)例報(bào)導(dǎo)在Marshall等的J.Chem.Soc.1951,1004-1015中。
通過同時(shí)或依次引入R3、R4和R5的元素,結(jié)構(gòu)K的中間體轉(zhuǎn)化成本發(fā)明的化合物。例如,用異氰酸酯R6-N=C=O各自處理結(jié)構(gòu)K的中間體而在單一步驟中得到結(jié)構(gòu)M的化合物,其為本發(fā)明的化合物,其中R2=-NR22-,R3=-C=O-,R4=-NH-且R5=-化學(xué)鍵-R6。將結(jié)構(gòu)K的化合物轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu)M的化合物的備選方法為本領(lǐng)域技術(shù)人員眾所周知,其中,首先引入R3與離去基團(tuán)(例如對-硝基苯氧基或氯),隨后用例如胺R6-NH2取代離去基團(tuán)以便引入R5和R6。
或者,一般在加熱條件和任選在有溶劑,諸如乙酸乙酯或二烷存在下用試劑,諸如,氨基氰(NH2-CN)處理結(jié)構(gòu)K的中間體而得到中間體N。氨基氰的備選物為硝基胍或脒基磺酸(NH2-C(=NH)-SO3H)。使用氨基氰進(jìn)行這類轉(zhuǎn)化的實(shí)例由Latham等在J.Org.Chem.1950,15,884中報(bào)導(dǎo)。使用硝基胍的實(shí)例由Davis在Proc.Natl.Acad.Sci.USA1925,11,72報(bào)導(dǎo)。脒基磺酸的應(yīng)用由Shearer等Bioorg.Med.Chem.Lett.1997,7,1763報(bào)導(dǎo)。
按照將中間體A或D轉(zhuǎn)化成由C或F表示的實(shí)施方案類似的方式,將中間體K分別轉(zhuǎn)化成由P或Q表示的化合物,它們?yōu)楸景l(fā)明進(jìn)一步的實(shí)施方案。
在上述方案中,用酮S處理A或K以便取代B,其中R如上所述,而分別得到結(jié)構(gòu)T或U的化合物,它們?yōu)楸景l(fā)明進(jìn)一步的實(shí)施方案。
用合適的還原劑諸如金屬(硼、鋁、硅等)氫化物試劑,優(yōu)選一種具有堿性的還原劑選擇性還原U的非-胍基碳-氮雙鍵而得到本發(fā)明的化合物V。
可以如下制備本發(fā)明的實(shí)施方案,其中R2=CO,R3=-NR32-,R4=N-且R5=ZR7,其中Z為烴鏈且R7如上所述。當(dāng)R32=H時(shí),通過轉(zhuǎn)化成相應(yīng)的酰基氯或轉(zhuǎn)化成活性酯或類似的活化衍生物來活化環(huán)A-衍生的羧酸W,上述過程中的許多為本領(lǐng)域眾所周知。用肼處理活化的羧酸得到相應(yīng)的酰肼Y。用醛或酮處理Y(如果必要,在加熱條件和/或溫和酸催化下)而得到所需的終產(chǎn)物Z。
如果不是商購可得,那么可以通過用氰化物離子處理上述原料J,任選通過加熱或過渡金屬催化以便用氰基殘基取代離去基團(tuán)LG’,制備環(huán)A-衍生的羧酸W。氰基的堿性或酸性水解得到酸性的羧酸中間體W。
當(dāng)R32不為H時(shí),單取代的肼的被保護(hù)形式可以用于上述方案以便替代肼。因此,用R32NHNH-PG,其中PG為氮保護(hù)基團(tuán),諸如芐氧羰基或叔-丁氧羰基處理來自W的活化羧酸,隨后脫保護(hù)并且如上所述用合適的醛或酮處理而得到Z’,其為本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案。
有機(jī)合成領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見,上述反應(yīng)過程為列舉的方法中合乎邏輯的擴(kuò)展的一組廣泛方法的代表。因此,通過上述方法的顯而易見的變型可以制備本發(fā)明要求保護(hù)的引入額外的R2、R3、R4和R5變化形式的本發(fā)明進(jìn)一步的實(shí)施方案。
作為本領(lǐng)域技術(shù)人員公認(rèn)的,有利的是在獲得終產(chǎn)物中使用臨時(shí)的保護(hù)基團(tuán)。本文所用的術(shù)語"保護(hù)基團(tuán)"指的是可能的反應(yīng)官能基團(tuán)的臨時(shí)變型,所述的反應(yīng)官能基團(tuán)可以防止不需要的化學(xué)轉(zhuǎn)化。這類保護(hù)基團(tuán)的實(shí)例包括羧酸的酯類、醇的甲硅烷基醚類以及醛和酮分別的縮醛類和酮縮醇類。已經(jīng)綜述了保護(hù)基團(tuán)化學(xué)的領(lǐng)域(Greene,T.W.;Wuts,P.G.M.Protective Groups in Organic Synthesis,2nd ed.;Wiley:New York,1991)。
“突變蛋白”為具有作為在相應(yīng)基因中出現(xiàn)的作為突變結(jié)果而改變的氨基酸序列的蛋白質(zhì)(Weigel等,1989)。這類突變可以導(dǎo)致編碼的蛋白質(zhì)特性中的一種或多種改變。例如,具有因一種或多種氨基酸改變產(chǎn)生的修飾的催化化學(xué)的酶變體為突變蛋白。
本發(fā)明涉及隱含至少一種氨基酸殘基改變的蛋白質(zhì)(術(shù)語"氨基酸序列改變(amino acid sequence change)”或"氨基酸序列改變(amino acid sequence alteration)"包括至少一種氨基酸殘基的改變、缺失或添加,或缺失、添加、改變的任意組合),以使所得突變蛋白相對于所述蛋白質(zhì)的未-突變形式對治療劑的敏感性而言變得(作為突變的結(jié)果)對已知治療劑產(chǎn)生抗性。這種特定類型的突變蛋白在下文中稱作theramutein,并且缺乏突變的相應(yīng)的蛋白質(zhì)在本文中稱作prototheramutein。
本文所用的"prototheramutein"指的是在細(xì)胞中內(nèi)源性出現(xiàn)的蛋白質(zhì),所述的細(xì)胞對賦予治療化合物相對無敏感性(即抗性)的突變敏感,否則,所述的治療化合物抑制或活化所述蛋白質(zhì)。因此,"theramutein"指的是在含有相對于蛋白質(zhì)的內(nèi)源性形式而言至少一種氨基酸序列改變的細(xì)胞中內(nèi)源性出現(xiàn)的蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)部分,其中在使至少一個(gè)人接觸已知抑制或活化prototheramutein的物質(zhì)后,所述的氨基酸序列改變得到或被鑒定或成為可鑒定,并且經(jīng)顯示或已經(jīng)顯示對指定疾病的發(fā)生或發(fā)展而言具有臨床意義。就確定上句中的目的而言,唯一的是物質(zhì)不需限于用于首次定義theramutein存在目的的化學(xué)活性劑。因此,作為定義,theramutein是在其相應(yīng)的內(nèi)源性基因中隱含了突變的蛋白質(zhì),其中所述的突變與患者對一般能夠活化或抑制未-突變蛋白的藥物發(fā)生臨床耐受性相關(guān)。就指定的theramutein而言,本文所用的術(shù)語“相應(yīng)的prototheramutein”指的是通過突變產(chǎn)生所述的theramutein的prototheramutein。類似地,就指定的prototheramutein而言,相應(yīng)的theramutein”指的是通過由所述prototheramutein突變產(chǎn)生的theramutein。
因此,本領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見,當(dāng)編碼theramutein的基因限于內(nèi)源性出現(xiàn)的基因時(shí),theramutein的定義不包括由導(dǎo)致疾病的病原體,諸如病毒和細(xì)菌編碼的蛋白質(zhì)。本文所用的術(shù)語"內(nèi)源性基因"指的是自攝入以后已經(jīng)至少以其未突變形式存在于生物體的染色體中的基因。本文所用的術(shù)語"細(xì)胞"指的是活的真核細(xì)胞,無論是在生物體,還是維持在生物體外合適的實(shí)驗(yàn)室組織或器官培養(yǎng)條件下。
在本發(fā)明的一個(gè)方面中,theramutein為相對于該蛋白質(zhì)的通常存在的“野生型”形式(即prototheramutein)而言首次改變的蛋白質(zhì)。在本發(fā)明的另一個(gè)方面中,theramutein為蛋白質(zhì)變體(prototheramutein),即其自身已經(jīng)為突變蛋白。在另一個(gè)實(shí)施方案中,theramutein與先前存在的theramutein相比可以得到進(jìn)一步突變。在這類情況中,可以將第一種theramutein(諸如p210BCR-ABL的T315I突變體(參見下文)視為"初級"theramutein,而隨后(已經(jīng)突變的)T315I變體的突變可以稱作二級theramutein、三級theramutein等。作為下文中典型的,本發(fā)明的突變蛋白為脫離“野生型”Bcr-Abl抑制劑抑制的Bcr-Abl酪氨酸激酶的變體。這類Bcr-Abl突變蛋白相對于Bcr-Abl的更常見或“野生型”形式而言得到改變(也稱作突變蛋白),以這類方式改變蛋白質(zhì)的特性。
可以理解主要關(guān)注的突變蛋白為相對于其prototheramutein而言具有相同、增加或減少的比活性,并且不受能夠抑制prototheramutein的活性劑抑制或難以受到其抑制的theramutein。同樣,另一種主要關(guān)注的theramutein為具有相同、增加或減少的比活性(相對于其prototheramutein而言)并且不受能夠活化prototheramutein的活性劑活化或難以受到其活化的theramutein。其它變化形式對本領(lǐng)域技術(shù)人員而言顯而易見。進(jìn)一步理解theramuteins可以包括天然存在或通常觀察到的蛋白質(zhì)變體,例如,由特定基因的不同等位基因表達(dá)的變體。在某些情況中,這類變體就其正常細(xì)胞功能而言可能并不顯著,其中功能差異僅在有差別抑制或活化變體細(xì)胞功能的活性劑存在下變得明顯。例如,特定酶的天然存在的變體可以具有基本上不同的活性譜,但調(diào)節(jié)一種變體的治療劑可能對調(diào)節(jié)另一種變體無效。
可以理解,本發(fā)明的一個(gè)方面在于鑒定針對在治療指定疾病過程中產(chǎn)生或變得占優(yōu)勢(通過任何機(jī)制)的theramutein具有活性的活性劑,另一個(gè)方面在于鑒定針對在未受侵害個(gè)體群體中常見的突變蛋白具有活性的活性劑,但其中所述的突變蛋白對已經(jīng)批準(zhǔn)的藥物的調(diào)節(jié)的敏感性較低,并且其中突變蛋白的活性譜變化在疾病狀態(tài)中變得重要(且由此首次鑒定為theramutein),諸如,在所述的疾病狀態(tài)中,該突變蛋白得到超表達(dá)或參與信號傳導(dǎo)過程,否則成為異常調(diào)節(jié)。例如,腫瘤性疾病可以因非theramutein或其prototheramutein的細(xì)胞成分的異常調(diào)節(jié)所致,并且仍然可使用prototheramutein抑制劑治療,而相同的治療對存在theramutein的情況有效性較低或無效。這可能是一種結(jié)果,其中觀察到特定腫瘤類型對抗癌藥的反應(yīng)在個(gè)體中改變,所述的個(gè)體表達(dá)抗癌藥定向于的酶的不同變體(Lynch等,2004)。在此處,變體在治療疾病的過程中可以不產(chǎn)生或變得占優(yōu)勢,但預(yù)先存在于健康群體中并且僅根據(jù)其對建立的治療的特定過程中改變的反應(yīng)性來檢測。
本文所用的術(shù)語蛋白質(zhì)的“激動(dòng)劑”和“活化劑”可以互換使用。活化劑(激動(dòng)劑)限于結(jié)合和活化指定蛋白質(zhì)功能的物質(zhì)。除非另有說明,"活化劑"、"激動(dòng)劑"和"蛋白質(zhì)的活化劑"在含義上相同。通過活化劑激活可以是部分或完全的。同樣,本文所用的術(shù)語蛋白質(zhì)的“拮抗劑”和“抑制劑”可以互換使用。抑制劑(拮抗劑)限于結(jié)合和抑制指定蛋白質(zhì)的功能的物質(zhì)。描述物質(zhì)“抑制”蛋白質(zhì)指的含義是指該物質(zhì)在細(xì)胞中結(jié)合蛋白質(zhì)并且降低蛋白質(zhì)的活性,但實(shí)質(zhì)上不減少細(xì)胞中蛋白質(zhì)的量。類似地,描述物質(zhì)“活化”蛋白質(zhì),諸如prototheramutein或theramutein是指該物質(zhì)增加細(xì)胞中蛋白質(zhì)的限定的功能,但基本上不改變細(xì)胞中蛋白質(zhì)的水平。除非另有說明,"抑制劑"、"拮抗劑"和"蛋白質(zhì)的抑制劑"也為同義詞。抑制劑的抑制可以為部分或完全的。調(diào)節(jié)劑為活化劑或抑制劑。作為實(shí)例,"PKCβ1的活化劑"應(yīng)解釋為指結(jié)合并且活化PKCβ1的物質(zhì)。類似地,“p210Bcr-Abl的抑制劑”為結(jié)合并且抑制p210Bcr-Abl功能的物質(zhì)。描述物質(zhì)"抑制蛋白質(zhì)"要求該物質(zhì)結(jié)合所述蛋白質(zhì)以便發(fā)揮其抑制作用。類似地,描述物質(zhì)"活化蛋白質(zhì)X"是指該物質(zhì)結(jié)合并且活化蛋白質(zhì)X。術(shù)語“結(jié)合(bind(s))”、“結(jié)合(binding)”和“結(jié)合(binds to)”在描述兩種物質(zhì)之間相互作用方面(例如酶-底物、蛋白質(zhì)-DNA、受體-配體等)具有其在生物化學(xué)領(lǐng)域中通常的含義。本文所用的術(shù)語“結(jié)合(binds to)”在討論物質(zhì)與其相應(yīng)靶蛋白之間相關(guān)性的上下文中和“與…相互作用”為同義詞。本文所用的描述物質(zhì)對蛋白質(zhì)“起作用”、“影響”蛋白質(zhì)、“發(fā)揮其對蛋白質(zhì)的作用”等以及所有這類相關(guān)術(shù)語含義一致(正如本領(lǐng)域技術(shù)人員充分了解的),即所述物質(zhì)活化或抑制所述蛋白質(zhì)。
首次定義了將內(nèi)源性蛋白質(zhì)的突變形式抑制或活化至大于相應(yīng)未-突變對應(yīng)蛋白(counterpart protein)的程度的概念,并且在本文中稱作陽性"特異性缺口"。一般來說,并且以使用抑制劑的情況作為實(shí)例,特異性缺口指的是在基于細(xì)胞的試驗(yàn)系統(tǒng)中抑制theramutein的可比的條件下,指定物質(zhì)與如下情況之一相比的能力之間的差異:
a)在可比的條件下相同物質(zhì)抑制prototheramutein的能力;或
b)在可比的條件下第二種物質(zhì)(通常為prototheramutein的已知抑制劑)抑制theramutein的能力;或
c)在可比的條件下第二種物質(zhì)抑制prototheramutein的能力。
當(dāng)對兩種不同物質(zhì)(分別測試的)單獨(dú)對theramutein的作用之間進(jìn)行比較時(shí),將結(jié)果稱作同源性特異性缺口測定。
或者,當(dāng)對兩種不同物質(zhì)(一般,但不總是)的作用之間進(jìn)行比較時(shí),分別將其中之一用于對theramutein的測試,而另一種用于對prototheramutein的測試,將結(jié)果稱作異源性特異性缺口(SG)測定。因此,作為上述給出的(a)和(c)為異源性特異性缺口(SG)測定的實(shí)例(盡管在兩種情況中均使用相同的物質(zhì)),而(b)為特異性特異性缺口測定的實(shí)例。
附圖3涉及的內(nèi)容為在理解和闡明這些概念中的信息。
在情況涉及活化劑時(shí)應(yīng)用類似的結(jié)果。對本領(lǐng)域技術(shù)人員即刻顯而易見的是,本文所用的術(shù)語“可比的條件”包括測試兩種不同的化合物,例如在相同濃度下(諸如比較兩種緊密相關(guān)的化合物以便測定相對功效),或通過將兩種在其相應(yīng)IC50值下測試的不同化合物對相應(yīng)prototheramutein和theramutein的作用進(jìn)行比較。本領(lǐng)域技術(shù)人員易于認(rèn)可其它有用的變化形式和可比的條件。
因此,在該方法應(yīng)用的一個(gè)實(shí)施方案中,對theramutein更為有效的物質(zhì)具有"陽性特異性缺口"。“零、無效或無"特異性缺口表示在物質(zhì)對theramutein的作用與其對prototheramutein的作用之間不存在顯著的可測定的差異(不過,這類化合物可能在其抑制或活化theramutein及其相應(yīng)prototheramutein的能力方面相當(dāng)有用),并且"陰性特異性缺口"表示在指定濃度下的物質(zhì)對指定theramutein的有效性低于對theramutein的相應(yīng)prototheramutein形式或另一種相當(dāng)形式(諸如可以隱含一種不同的突變)的有效性。對后者化合物類別的關(guān)注程度一般低于前者化合物的類別,但除外以下情況:其中化合物如此有效,使得其對theramutein的相對較低作用從治療功效的前景來看并無實(shí)際的擔(dān)憂。本領(lǐng)域技術(shù)人員易于識(shí)別以適合于他或她需求的方式量化特異性缺口評價(jià)的各種手段。
本發(fā)明還提供了用于鑒定表現(xiàn)出所需特異性缺口的化合物的方式。鑒定這類化合物并且使用體外基于細(xì)胞的試驗(yàn)系統(tǒng)測定其抑制或活化theramutein的能力,其中將物質(zhì)對該蛋白質(zhì)的突變內(nèi)源性形式的細(xì)胞功能的作用與相同藥物對該蛋白質(zhì)非-突變內(nèi)源性形式的細(xì)胞功能的作用進(jìn)行比較。
因此,所述系統(tǒng)能夠發(fā)現(xiàn)這類化合物,所述化合物能夠結(jié)合theramutein并且對所述theramutein的細(xì)胞功能發(fā)揮的調(diào)節(jié)作用大于對其相應(yīng)prototheramutein的細(xì)胞功能發(fā)揮的調(diào)節(jié)作用。此外,該系統(tǒng)能夠發(fā)現(xiàn)這類化合物,所述化合物能夠結(jié)合theramutein并且對theramutein的細(xì)胞功能發(fā)揮的調(diào)節(jié)作用至少大于或大于上述已知化合物能夠?qū)ο鄳?yīng)prototheramutein的細(xì)胞功能發(fā)揮的調(diào)節(jié)作用。在本發(fā)明的一個(gè)具體的實(shí)施方案中,為以下結(jié)果篩選和鑒定化合物:1)對theramutein的有效性至少與原始藥物對prototheramutein的有效性相同;和/或2)對prototheramutein的有效性與對theramutein的有效性類似(即展示出小或基本上為零的特異性缺口)。
在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,超表達(dá)所關(guān)注的theramutein的細(xì)胞用于鑒定為至少選擇的theramutein的抑制劑或活化劑(即結(jié)合和抑制或結(jié)合和活化)的化學(xué)活性劑。這些化學(xué)活性劑還可以為prototheramutein乃至相同prototheramutein的其它theramuteins的抑制劑或活化劑。本文所用的術(shù)語"化學(xué)活性劑"和"化合物"可以互換使用,并且兩術(shù)語僅指具有至多,但不一定包括2000原子質(zhì)量單位(道爾頓)的分子量的物質(zhì)。這類物質(zhì)有時(shí)稱作“小分子”。除非另有說明,本文所用的術(shù)語物質(zhì)僅指化學(xué)活性劑/化合物,并且不指生物活性劑。本文所用的"生物活性劑"為包括蛋白質(zhì)、多肽類和核酸的分子并且具有等于或大于2000原子質(zhì)量單位(道爾頓)的分子。
按照本發(fā)明選擇theramutein并且用于基于細(xì)胞的試驗(yàn)系統(tǒng),設(shè)計(jì)該系統(tǒng)是為了鑒定為theramutein的抑制劑或活化劑的活性劑。如果已知兩種或多種不同theramuteins來源于相同的prototheramutein,那么優(yōu)先選擇最具有抗性的可利用theramutein用于試驗(yàn)系統(tǒng)。一般來說,使用首先給予并且已知抑制或活化prototheramutein且針對theramutein"出現(xiàn)"的藥物測定theramutein與其未-突變對應(yīng)體(prototheramutein)相比較對指定化學(xué)活性劑的抗性程度。例如,通過分析IC50或AC50值測定這類抗性程度的方法為眾所周知的并且在本領(lǐng)域中是標(biāo)準(zhǔn)的,且在本文中未重復(fù)。然而,因果關(guān)系并非是必不可少的或應(yīng)在使用自身指定的治療劑治療患者與隨后theramutein的出現(xiàn)之間進(jìn)行推斷。而為實(shí)施本發(fā)明所需的是按照本文的教導(dǎo)適當(dāng)選擇正確的theramutein。
因此,例如,在實(shí)驗(yàn)室中產(chǎn)生,但尚未在臨床相關(guān)性上得以證實(shí)的已知蛋白質(zhì)的隨機(jī)產(chǎn)生的定向位點(diǎn)突變體并非用于本發(fā)明范圍內(nèi)的合適的突變蛋白。當(dāng)然,不會(huì)將這類突變蛋白劃為theramuteins。
例如,在獲得p210Bcr-Abl突變體的潛在抑制劑的嘗試中,Huron等(2003)使用了重組c-abl制品并且篩選了一系列已知抑制c-src酪氨酸激酶活性的化合物。作者對他們的化合物進(jìn)行了c-abl激酶試驗(yàn)并且鑒定了在8nM時(shí)為對c-ab1最有效的化合物。然而當(dāng)測試該化合物(PD166326)抗各種p210Bcr-Abl theramuteins時(shí),它表現(xiàn)出對突變體中的某些,諸如p210Bcr-Abl-E255K的活性,但發(fā)現(xiàn)p210Bcr-Abl-T315I theramutein保留了10倍以上的抗性(Huron等 2003,表3)。此外,在每種情況中,化合物對p210Bcr-Abl theramuteins的作用仍然顯著低于它對野生型p210Bcr-Abl的作用。當(dāng)測試化合物對p210Bcr-Abl-T315I突變體的活性時(shí),它不能將活性抑制到任何可評估的程度(p.1270,左手欄,第二段;另外,參見附圖4)。因此披露的化合物能夠抑制對STI-571產(chǎn)生部分抗性的theramutein,但對Bcr-Abl的T315I突變體無活性,在當(dāng)時(shí)已知所述的theramutein為對STI-571表現(xiàn)出最大抗性的theramutein。因此,精確和簡單而言,Huron的方法無法鑒定p210Bcr-AblT315I theramutein的有效抑制劑。
實(shí)際上,在披露本發(fā)明,包括本文首次描述的詳述方法以及本文提供的組合物前,世界上尚無人在任何地方成功地鑒定一種化學(xué)活性劑,更不必說一種能夠鑒定將p210Bcr-AblT315I theramutein有效抑制至等于或高于STI-571能夠?qū)σ吧蚿210Bcr-Abl蛋白質(zhì)所抑制的程度的化學(xué)活性劑的方法(參見Shah等,Science,2004年8月;O'Hare等,Blood,2004;Tipping等,Leukemia,2004;Weisberg等,Leukemia,2004)。
不能過分強(qiáng)調(diào)這類化合物可能非常有用,因?yàn)槟壳吧袩o用于發(fā)展成p210Bcr-Abl-T315I theramutein-介導(dǎo)的甲磺酸伊馬替尼(imatinib)-抗性狀態(tài)的患者的備選方法。一旦患者發(fā)生這類抗性,則沒有可利用的其它有效備用手段,且死亡是肯定的。本文所述的方法提供了用于鑒定、從藥理學(xué)方式上表征和化學(xué)合成p210Bcr-Abl-T315I theramutein的有效抑制劑的第一個(gè)報(bào)導(dǎo)的方法。此外,本領(lǐng)域技術(shù)人員立即認(rèn)可了這種手段在任何高度藥物抗性theramutein中的可應(yīng)用性和會(huì)推廣性。
在本發(fā)明中,使用展示出謹(jǐn)慎選擇的表型特征(如下所述)的測試細(xì)胞,所述的特征與在適當(dāng)條件下細(xì)胞中特定所關(guān)注的theramutein(TOI)的存在和功能活性相關(guān)。從定性上看,這一結(jié)果與表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞展示出的表型特征相同。表型特征(即細(xì)胞的非-基因型特征)為觀察到(測定的)、選擇和/或隨后用于如本文所述試驗(yàn)方法限定的特性。表型特征的表達(dá)是對細(xì)胞中theramutein的總體活性的反應(yīng),并且為theramutein的絕對量及其比活性的結(jié)果。表型特征通常可作為theramutein活性水平升高的結(jié)果觀察到并且在表達(dá)少量theramutein或少量其相應(yīng)的prototheramutein的細(xì)胞中并不明顯。此外,通常可以證實(shí)通過用theramutein的抑制劑或活化劑調(diào)節(jié)theramutein的比活性調(diào)節(jié)表型特征,不過,這并非是始終如一的情況,因?yàn)門OI的抑制劑或活化劑在本領(lǐng)域技術(shù)人員從事這類項(xiàng)目時(shí)可能并非始終可得。因此,為了確定隨后用于為試驗(yàn)?zāi)康牡闹付y試細(xì)胞的表型特征的目的,本領(lǐng)域技術(shù)人員還可以使用能夠增加或減少theragene表達(dá)的物質(zhì),由此使得相應(yīng)theramutein的水平增加或減少。這使得本領(lǐng)域技術(shù)人員可以模擬某些類型的theramutein活化劑或抑制劑(諸如theramutein的自殺性抑制劑,為不可逆結(jié)合和共價(jià)修飾TOI而賦予其持久無活性的化學(xué)活性劑類型),但實(shí)際上為了精確了解隨后用于建立有用的細(xì)胞試驗(yàn)系統(tǒng)的合適表型特征的目的而可以使用這類化合物。有助于這類目的的本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的實(shí)例包括利用反義DNA寡核苷酸、小干涉RNAs、其它基于RNA干涉的方法和含有誘導(dǎo)型啟動(dòng)子系統(tǒng)的載體構(gòu)建體。在這種方式中,選擇的表型特征與測試細(xì)胞中theramutein的活性相關(guān)。對theramuteins值得注意的是,選擇的表型特征通常也由超表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞展示,且其中表型特征由已知的prototheramutein的抑制劑或活化劑調(diào)節(jié)。
表型特征單純?yōu)榉羌?xì)胞基因型特征的細(xì)胞特征。除如本文披露的適當(dāng)確定的表型特征在按照本發(fā)明某些實(shí)施方案的教導(dǎo)產(chǎn)生有用的細(xì)胞試驗(yàn)系統(tǒng)目的中的具體需求外,對用于或適合于適當(dāng)和有效實(shí)施本發(fā)明的術(shù)語任意類型或性質(zhì)的表型特征沒有其它限制。實(shí)際上,本領(lǐng)域技術(shù)人員必須能夠選擇將建立用于他或她需求的適當(dāng)?shù)幕诩?xì)胞的試驗(yàn)的應(yīng)用最大化的細(xì)胞的任意特征。表型特征可以為定量或定性的并且可直接觀察或測定(例如可用裸眼或用顯微鏡),但最常見的是使用本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的標(biāo)準(zhǔn)自動(dòng)化實(shí)驗(yàn)室設(shè)備和試驗(yàn)操作步驟間接測定所述特征。術(shù)語"可觀察到"指的是可以測定特征,否則就是在適當(dāng)條件下可通過無論何種方式,包括使用任意類型的實(shí)驗(yàn)室可利用的儀器操作測。術(shù)語"可測定"與"測定的"的含義不同。特征對于本領(lǐng)域技術(shù)人員來說是可以檢測的但不在任意指定的時(shí)間測定,這取決于本領(lǐng)域技術(shù)人員選擇如何設(shè)計(jì)試驗(yàn)系統(tǒng)。例如,在尋找prototheramutein(或theramutein)活化劑的過程中,需要僅在添加能夠活化POI的已知活化劑或測試物質(zhì)后檢測相關(guān)表型特征。這提供了使在試驗(yàn)中由測試細(xì)胞產(chǎn)生的信號強(qiáng)度最大化的能力。
表型特征包括但不限于生長特征、轉(zhuǎn)化狀態(tài)、分化狀態(tài)、底物磷酸化狀態(tài)、催化活性、跨細(xì)胞膜的離子流(鈣、鈉、氯化物、鉀、氫離子等)、pH改變、第二信使分子或其它胞內(nèi)化學(xué)種類,諸如cAMP、磷酸肌醇類、環(huán)核苷酸的變動(dòng)、基因表達(dá)的調(diào)節(jié)等??蛇B續(xù)(例如細(xì)胞生長率),或在一定時(shí)間期限后(例如細(xì)胞培養(yǎng)物的最終密度)或瞬時(shí)(例如突變蛋白的調(diào)節(jié)導(dǎo)致突變蛋白底物磷酸化瞬時(shí)改變,或離子流的瞬時(shí)流量跨膜,或胞內(nèi)cAMP水平升高或降低)觀察到或測定細(xì)胞特征。在某些實(shí)施方案中,可以僅在有prototheramutein或theramutein調(diào)節(jié)劑存在下檢測選擇的表型特征。對可以為測定而選擇的特征沒有指定的限制。本文所用的術(shù)語“細(xì)胞的特征”和“表型特征”以及單純的“特征”在用以指用物質(zhì)處理測試細(xì)胞后完整細(xì)胞或細(xì)胞的亞細(xì)胞部分的具體可測定特性時(shí)的含義是相同的。例如,表型特征可以為灶性形成,當(dāng)將在超表達(dá)選擇的蛋白質(zhì)的細(xì)胞在有該蛋白質(zhì)活化劑存在下培養(yǎng),或胞內(nèi)代謝物或離子,諸如cAMP、鈣、鈉、氯化物、鉀、鋰、磷脂酰肌醇、cGMP、碳酸氫鹽等的水平瞬時(shí)增加或降低時(shí),這種灶性形成變得可以觀察到。本領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見,在細(xì)胞接觸測試物質(zhì)后,可以對細(xì)胞的亞細(xì)胞部分測定如此測定(檢測)的特征。然而,必須對完整細(xì)胞而非亞細(xì)胞部分用物質(zhì)進(jìn)行最初的處理,由此使該物質(zhì)接觸所述細(xì)胞。
為細(xì)胞內(nèi)測定而選擇的特征不一定為theramutein或prototheramutein本身內(nèi)在物理或化學(xué)特性(諸如僅是細(xì)胞內(nèi)部的蛋白質(zhì)的量(質(zhì)量)),而必須是因細(xì)胞內(nèi)部theramutein活性產(chǎn)生而由此影響不同于theramutein本身的細(xì)胞特征的特征,正如上文詳細(xì)討論的。例如,如果theramutein為能夠進(jìn)行自磷酸化的蛋白激酶,所述的自磷酸化即該酶能夠通過從其自身上的ATP中轉(zhuǎn)移末端磷酸部分而催化自身磷酸化的過程,那么可能不適合于選擇TOI的磷酸化狀態(tài)作為用于測定的細(xì)胞的合適的表型特征。這是因?yàn)檫@類特征不會(huì)反映出TOI對其它細(xì)胞成分的活性。正如本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的,自磷酸化不必然反映出細(xì)胞中蛋白激酶的活性,因?yàn)橐阎鞍准っ傅耐蛔凅w保留了足以進(jìn)行自磷酸化的酶活性,但失去了在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的能力。White等的經(jīng)典論文(1988)在這方面既具有教導(dǎo)性,又值得關(guān)注。
術(shù)語"反應(yīng)性表型特征"指的是對指定蛋白質(zhì)(prototheramutein或theramutein)的抑制劑或活化劑起反應(yīng)的細(xì)胞特征。將術(shù)語"已知的治療劑"定義為在世界范圍內(nèi)的國家中對人給藥用于治療疾病的任意活性劑。
作為本文中與p210Bcr-Abl及其theramuteins相關(guān)的典型的有用的表型特征為細(xì)胞生長和增殖失調(diào)。注意相同或相似試驗(yàn)可以適用于許多不同所關(guān)注的蛋白質(zhì)。例如,生長、增殖和/或分化失調(diào)為因各種不同細(xì)胞蛋白質(zhì)超表達(dá)產(chǎn)生的常見表型特征。本發(fā)明的重要教導(dǎo)在于通過超表達(dá)選擇的蛋白質(zhì)而導(dǎo)致這類表型特征出現(xiàn),所述的特征變得在合適的條件下與選擇的蛋白質(zhì)的存在、量和比活性相關(guān),并且這種相關(guān)性能夠使得本領(lǐng)域技術(shù)人員根據(jù)需要鑒定所關(guān)注的theramutein(TOI)的抑制劑或活化劑。因此,表型特征為對選擇的蛋白質(zhì)的水平和/或比活性改變的反應(yīng)。這類反應(yīng)性表型特征在本文中稱作“表型反應(yīng)(phenoresponse)”。
盡管并非始終必要,但是通常有利的是使用表達(dá)高水平theramutein的細(xì)胞并且選擇因theramutein超表達(dá)產(chǎn)生的表型特征。這是因?yàn)榕ctheramutein功能相關(guān)的表型特征一般比theramutein被超表達(dá)至更大程度時(shí)更加可區(qū)分(更易于測定)。此外,在theramutein的功能水平增加時(shí),對theramutein調(diào)節(jié)劑的反應(yīng)觀察到的表型反應(yīng)通常得到擴(kuò)大。如果以另一種方式表達(dá),那么在超表達(dá)theramutein的細(xì)胞觀察到的選擇的表型反應(yīng)對theramutein的調(diào)節(jié)劑特別敏感。
優(yōu)選theramutein在測試細(xì)胞中得到穩(wěn)定表達(dá)。穩(wěn)定表達(dá)theramutein導(dǎo)致細(xì)胞中的水平在試驗(yàn)過程中保持相對不會(huì)改變。例如,刺激或活化信號傳導(dǎo)途徑中的成分后為不應(yīng)期,在此過程中,信號傳導(dǎo)因所述成分的減量調(diào)節(jié)而受到抑制。就本發(fā)明的theramuteins而言,這類減量調(diào)節(jié)通常通過人工超表達(dá)theramutein而足以克服。如果以另一種方式表達(dá),那么充分維持表達(dá),即在試驗(yàn)過程中觀察到的這些表型特征改變主要是因theramutein抑制或活化,而非其水平改變所致,即使theramutein的減量調(diào)節(jié)隨之發(fā)生也是如此。由于這些原因,所以盡管優(yōu)選theramutein的穩(wěn)定表達(dá),但是在轉(zhuǎn)染后可以使用theramutein的瞬時(shí)表達(dá),條件是選擇的表型特征可測定并且試驗(yàn)系統(tǒng)的期限比其在這類系統(tǒng)中隨時(shí)間預(yù)計(jì)的瞬時(shí)表達(dá)的theramutein的水平進(jìn)行性下降短。由于這些原因,優(yōu)選穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞系(美國專利US4,980,281)。
本發(fā)明優(yōu)選的藥物篩選方法包括下列步驟:
1)鑒定需要新抑制劑或活化劑的theramutein。可以使用標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)對合適的theramutein進(jìn)行鑒定(參見,Gorre等,Science,2001;另外,參見PCT/US02/18729)。簡單的說,鑒定使用已知或可疑的prototheramutein的活化劑或抑制劑給予治療有效的治療過程且隨后已經(jīng)表現(xiàn)出與疾病復(fù)發(fā)一致的臨床征兆和癥狀的患者,并且獲得來源于這類患者的細(xì)胞或組織。使用標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室技術(shù),諸如RT-PCR測定prototheramutein的序列并且與已知prototheramutein基因或cDNA序列的預(yù)先測定的核酸序列進(jìn)行比較。如果存在,那么鑒定突變并且再次使用標(biāo)準(zhǔn)方法與基于細(xì)胞或更常用的基于細(xì)胞的試驗(yàn)系統(tǒng)中prototheramutein的功能的功能抗性建立相關(guān)。一旦證實(shí)了誘導(dǎo)抗性的突變,那么所述的一種或多種經(jīng)證實(shí)的突變體包括可以用于如本文所述的隨后方法限定的theramutein。
2)提供表達(dá)所關(guān)注的theramutein并且展示出可觀察到(可測定的)表型特征的測試細(xì)胞,已經(jīng)預(yù)先證實(shí)所述的表型特征對theramutein,或更常見的是相應(yīng)的prototheramutein的抑制劑或活化劑有反應(yīng)。將已經(jīng)預(yù)先證實(shí)對所關(guān)注的theramutein(TOI)和/或所關(guān)注的prototheramutein(pTOI)有反應(yīng)的特異性表型特征在本文中首次定義為“表型反應(yīng)(phenoresponse)”。本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案在于所述表型反應(yīng)在鑒定能夠成為TOI抑制劑或活化劑的化合物的目的中的確定應(yīng)用。這一過程可以通過使用應(yīng)用過度產(chǎn)生指定的TOI并且已經(jīng)鑒定和表征了適當(dāng)?shù)谋硇头磻?yīng)的細(xì)胞系的高流通量篩選來進(jìn)行?;蛘?,可以使用應(yīng)用更一般性的細(xì)胞系表型特征(按照本文的教導(dǎo)并不定為表型反應(yīng))的高流通量初級篩選且然后按照本文的教導(dǎo)使用二次篩選,以便從并非所關(guān)注的theramutein的抑制劑或活化劑的假陽性化合物中區(qū)分確實(shí)為陽性的“命中數(shù)”的化合物,即所關(guān)注的theramutein的抑制劑或活化劑。在一個(gè)實(shí)施方案中,選擇天然表達(dá)theramutein的細(xì)胞,以便反應(yīng)性表型特征在對本領(lǐng)域技術(shù)人員而言顯而易見的適當(dāng)培養(yǎng)條件下存在。在其它實(shí)施方案中,theramutein在某些情況中在宿主細(xì)胞中得到超表達(dá),否則,該宿主細(xì)胞完全不表達(dá)theramutein。這一過程通常包括構(gòu)建表達(dá)載體,可以將該表達(dá)載體導(dǎo)入合適的宿主細(xì)胞并且使用標(biāo)準(zhǔn)載體系統(tǒng)和方法超表達(dá)(Gorre等,2001;Housey等,1988)。在一個(gè)實(shí)施方案中,超表達(dá)產(chǎn)生的theramutein水平至少約3倍于該蛋白質(zhì)通常存在于細(xì)胞中的量?;蛘?,該量至少約為通常存在于細(xì)胞中的量的10倍。在另一個(gè)實(shí)施方案中,該量至少約為通常存在于細(xì)胞中的量的20倍或更優(yōu)選至少約為50倍。
3)提供表達(dá)相應(yīng)于所關(guān)注的theramutein的prototheramutein的對照細(xì)胞。當(dāng)本文所述的某些突變蛋白也為酶時(shí),它們通常保留了催化活性并且由此對照細(xì)胞通常展示出基本上與測試細(xì)胞相同的表型特征。不過,這種表型特征不需要如兩種細(xì)胞那樣進(jìn)行定量。例如,使prototheramutein再活化的突變蛋白就其在細(xì)胞中的底物中的一種或多種而言也可以增加、減少乃至影響其比活性。作為結(jié)果,它可以將選擇的表型特征展示出較大或較小的程度。因此,在某些情況中,需要調(diào)整prototheramutein和theramutein之一或它們兩者的表達(dá),以便測試和對照細(xì)胞將表型特征展示至近似相同的程度。例如,均可以使用標(biāo)準(zhǔn)方法,通過由啟動(dòng)子表達(dá)蛋白質(zhì)達(dá)到這一目的,其中可以通過調(diào)整存在的誘導(dǎo)物的量來調(diào)整啟動(dòng)子的活性(例如,參見Maniatis等)。
本領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見,適當(dāng)定義的表型反應(yīng)在表達(dá)prototheramutein與theramutein的細(xì)胞系中可以存在定量差異作為與其相應(yīng)的prototheramutein之間比活性差異(如果有的話)的結(jié)果。誘導(dǎo)Theramutein的突變可以增加或減少所述theramutein相對于相應(yīng)的prototheramutein而言的比活性。當(dāng)將表達(dá)theramutein的細(xì)胞系與表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞系進(jìn)行比較時(shí),優(yōu)選選擇的表型反應(yīng)在兩種細(xì)胞類型中定性地相同。因此,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以選擇將表達(dá)theramutein的細(xì)胞系的活性與表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞系的活性校準(zhǔn)或反之亦然。這類歸一化法在本領(lǐng)域中是標(biāo)準(zhǔn)的。例如,參見Bolstad等(2003)。
或者,本領(lǐng)域技術(shù)人員還可以希望使用未修飾的宿主細(xì)胞或僅隱含了表達(dá)載體作為用于某些實(shí)驗(yàn)操作步驟的對照細(xì)胞的宿主細(xì)胞(宿主細(xì)胞為導(dǎo)入了編碼theramutein的表達(dá)載體而產(chǎn)生測試細(xì)胞的細(xì)胞)。這可能就是研究人員僅對所關(guān)注的theramutein的特異性抑制劑或活化劑感興趣,而與所述化合物是否還對所關(guān)注的prototheramutein(pTOI)有效無關(guān)的情況[取代工作活性]。
4)然后在合適的條件下將測試和對照細(xì)胞維持或使其增殖(不過不一定在同時(shí))在生長培養(yǎng)基(乃至在完整動(dòng)物體內(nèi))中,以便可以表達(dá)和檢測表型反應(yīng)。可以用prototheramutein的已知調(diào)節(jié)劑或用測試物質(zhì)處理表達(dá)prototheramutein的對照細(xì)胞,并且用測試化合物處理測試細(xì)胞以便確定它們是否如所述物質(zhì)以預(yù)計(jì)方式調(diào)節(jié)表型反應(yīng)的能力所測定的對theramutein具有活性?;蛘撸€可以根據(jù)本領(lǐng)域技術(shù)人員選擇用于研究的特定表型反應(yīng)的不同取代不表達(dá)prototheramutein的對照細(xì)胞。然后檢測物質(zhì)對測試細(xì)胞的作用,并且任選地同時(shí)或在另一時(shí)間測試對對照細(xì)胞的作用,并且比較結(jié)果。
在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,根據(jù)以例如與prototheramutein的已知調(diào)節(jié)劑改變表達(dá)prototheramutein的對照細(xì)胞的表型反應(yīng)相同的方式調(diào)節(jié)測試細(xì)胞的表型反應(yīng)的能力快速鑒定對測試細(xì)胞具有活性的物質(zhì)。在另一個(gè)實(shí)施方案中,可以通過調(diào)節(jié)測試細(xì)胞中theramutein的活性而對未修飾(不表達(dá)prototheramutein和/或theramutein)的對照細(xì)胞幾乎或沒有作用的能力來鑒定活性物質(zhì)。例如,本領(lǐng)域技術(shù)人員易于理解該手段的許多變化形式可以用于鑒定為對theramutein更為有效或?qū)rototheramutein和一種或多種相應(yīng)的具體theramuteins等效的調(diào)節(jié)劑。
可以觀察到和/或測定其它表型反應(yīng),并且包括:例如,檢測prototheramutein的底物和檢測通過theramutein活性調(diào)節(jié)的基因表達(dá)的改變。在最簡單的術(shù)語中,本領(lǐng)域技術(shù)人員預(yù)先建立的與theramutein的功能活性相關(guān)性的細(xì)胞的任意特征適用于這類方法。然而,在選擇指定特征的過程中,本領(lǐng)域技術(shù)人員必須首先按照作為本文詳述中給出的教導(dǎo)驗(yàn)證所述的特征滿足作為表型反應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)。本領(lǐng)域技術(shù)人員還可以希望將使用表達(dá)theramutein的細(xì)胞的表型反應(yīng)與表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞的表型反應(yīng)校準(zhǔn)。
可以通過本領(lǐng)域技術(shù)人員眾所周知的各種方法測定適合于檢測的特征。這類方法包括但不限于:檢測適當(dāng)標(biāo)記的蛋白質(zhì)的熒光(FACS);用于檢測蛋白質(zhì)表達(dá)的免疫組織化學(xué)(IHC);競爭放射性配體結(jié)合測定;固相基質(zhì)印跡技術(shù),諸如細(xì)胞提取物的RNA印跡、DNA印跡和蛋白質(zhì)印跡;逆轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR);酶聯(lián)免疫吸附測定(ELISA);磷酸化測定;凝膠阻留測定;膜電位干擾等。可以在使用測試物質(zhì)處理后檢測完整細(xì)胞上的相關(guān)表型特征,或者在使用測試物質(zhì)處理完整細(xì)胞后檢測在細(xì)胞的亞細(xì)胞部分上的相關(guān)表型特征。
一旦鑒定了對表達(dá)theramutein的測試細(xì)胞具有所需作用的化合物,就需要(但不一定)獨(dú)立地驗(yàn)證所鑒定的化合物通過直接結(jié)合機(jī)制對theramutein發(fā)揮其作用,即按照本發(fā)明的教導(dǎo),這些化合物滿足作為theramutein的抑制劑或活化劑(作為理想的)的標(biāo)準(zhǔn)(讀者如上所述涉及的術(shù)語"活化劑"和"抑制劑"的定義)??梢允褂帽绢I(lǐng)域技術(shù)人員公知的大量標(biāo)準(zhǔn)結(jié)合測定法達(dá)到這一目的,包括純化的蛋白質(zhì)樣品或使用用合適的prototheramutein或theramutein轉(zhuǎn)染的細(xì)胞與如通過聲科學(xué)法所述的合適的對照品進(jìn)行的完整細(xì)胞結(jié)合測定法。由于這類方法為本領(lǐng)域中充分確立的,所以不在此處重復(fù)它們。大量參考文獻(xiàn)文本綜合討論了這類技術(shù)(例如,參見Foreman和Johansen,2002;Enna S.J.等(1991)Current Protocols in Pharmacology,Wiley&Sons,Incorporated;Bonifacino,J.S.等(1999)Current Protocols in Cell Biology,Wiley&Sons,Incorporated).還參見Housey,G.M.1988,Chapter 4及其中的參考文獻(xiàn);另外,參見Horowitz等,1981。
在本發(fā)明的一個(gè)具體的實(shí)施方案中,該方法用于鑒定為p210Bcr-Abl-T315Itheramutein的抑制劑的物質(zhì)。使用標(biāo)準(zhǔn)方法在Ba/F3(鼠)細(xì)胞中各自表達(dá)prototheramutein和theramutein,并且觀察到的表型反應(yīng)為生長特征(謹(jǐn)慎確定的細(xì)胞培養(yǎng)物的末端細(xì)胞密度和在沒有白細(xì)胞介素-3(IL-3)存在下的生長)。還可以任選使用未修飾的宿主細(xì)胞或僅含有表達(dá)載體的宿主細(xì)胞或它們兩者。在另一個(gè)實(shí)施方案中,將測試細(xì)胞單獨(dú)與或不與涉及的已知抑制劑或活化劑一起使用。
另一種有用的測定法為測定p210Bcr-Abl-T315I的直接底物的磷酸化狀態(tài)。一種這類底物為Crkl(Gorre等,Science 293:876-80(2001)),即一種介導(dǎo)Bcr-Abl與Ras之間的連接的銜接蛋白。CRKL的磷酸化狀態(tài)為細(xì)胞中p210Bcr-Abl的信號傳導(dǎo)活性的代表。另一種下游底物為p62DOK。對這些目的而言,任意這類底物均可滿足,當(dāng)然,條件是已經(jīng)證實(shí)所述底物的磷酸化在細(xì)胞內(nèi)部發(fā)生,并且不非簡單地如上所述為TOI或PTOI的自磷酸化活動(dòng)。還可以監(jiān)測其它信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)成分,包括src族激酶、STAT5、PI3激酶、raf激酶、RAS、MEK、ERK1和ERK2、JNK1、2和3、MLK1、2和3、MKK4、MKK7、AKT、mTOR、HSP90等。
作為本文中的典型,已經(jīng)鑒定了T315I theramutein的抑制劑。此外,這些抑制劑還對野生型prototheramutein p210Bcr-Abl-wt具有不同程度的活性。
按照本發(fā)明,對需要的哺乳動(dòng)物給予治療有效量的調(diào)節(jié)p210Bcr-Abl theramutein的功能活性的一種或多種化合物。本文所用的術(shù)語“給予”指的是通過可以實(shí)現(xiàn)尋找的結(jié)果的任意方法將本發(fā)明的化合物遞送給哺乳動(dòng)物。例如,可以通過口服、非腸道(靜脈內(nèi)或肌內(nèi))、局部、透皮或通過吸入給予它們。本文所用的術(shù)語“哺乳動(dòng)物”用以包括,但不限于人、實(shí)驗(yàn)室動(dòng)物、馴養(yǎng)寵物和農(nóng)場動(dòng)物?!爸委熡行Я俊敝傅氖窃趯Σ溉閯?dòng)物給藥時(shí)有效產(chǎn)生所需治療作用,諸如抑制激酶活性、抑制癌細(xì)胞生長和分裂等的化合物用量。
本發(fā)明提供了治療哺乳動(dòng)物疾病的方法,通過對該哺乳動(dòng)物給予有效量的theramutein的調(diào)節(jié)劑來進(jìn)行。按照本發(fā)明治療的合適的疾病包括但不限于已經(jīng)對預(yù)先給予的藥物產(chǎn)生抗性的復(fù)發(fā)性腫瘤或其它增殖性病癥。該方法還用于克服個(gè)體中存在對因治療靶標(biāo)中的等位基因差異產(chǎn)生的藥物治療的敏感性方面的變化形式。例如,已經(jīng)廣泛證實(shí)了在CML中p210Bcr-Abl酪氨酸激酶信號傳導(dǎo)的作用,因?yàn)閜210Bcr-Abl的theramuteins在CML的藥物抗性復(fù)發(fā)中具有作用。此外,不同的p210Bcr-Abl的突變蛋白表現(xiàn)出對p210Bcr-Abl的抑制劑的可變敏感性。盡管某些theramuteins在藥物療法過程中出現(xiàn),但是其它可能預(yù)先存在于群體中。對后面這些實(shí)例并不公認(rèn)為theramuteins,直到疾病狀態(tài)隨之發(fā)生并且隨后用已知類型的治療劑治療時(shí)為止。僅在所述治療后,這類預(yù)先存在的theramuteins顯示出其自身在導(dǎo)致隱含theramutein的患者中的疾病發(fā)展的相對非-反應(yīng)性方面的臨床顯著性。
在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,給予theramutein調(diào)節(jié)劑與一種或多種抗腫瘤劑??梢允褂萌我夂线m的抗腫瘤劑,諸如化療劑、放射或其組合??鼓[瘤藥可以為烷化劑或抗代謝物。烷化劑的實(shí)例包括但不限于順鉑、環(huán)磷酰胺、美法侖和達(dá)卡巴嗪??勾x物的實(shí)例包括但不限于多柔比星、柔紅霉素和紫杉醇、吉西他濱和拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑伊立替康(CPT-11)、氨基喜樹堿、喜樹堿、DX-8951f、托泊替康(拓?fù)洚悩?gòu)酶I抑制劑)和依托泊苷(VP-16;拓?fù)洚悩?gòu)酶II抑制劑)和替尼泊苷(VM-26;拓?fù)洚悩?gòu)酶II抑制劑)。當(dāng)抗腫瘤藥為放射時(shí),放射源可以在所治療患者的體外(外線束放療-EBRT)或體內(nèi)(近距離放射療法-BT)。所給予的抗腫瘤劑的劑量取決于許多因素,包括:例如,活性劑的類型、所治療的腫瘤的類型和嚴(yán)重程度以及活性劑的給藥途徑。然而,應(yīng)強(qiáng)調(diào)本發(fā)明并不限于任何特定的劑量、給藥途徑或合并給予theramutein條件的化療劑或其它治療方案的組合。
可以將目前本領(lǐng)域中公知或評價(jià)的抗腫瘤劑分成不同類型,包括:例如,有絲分裂抑制劑;烷化劑;抗代謝物;嵌入抗生素;生長因子抑制劑;細(xì)胞周期抑制劑;酶;拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑;抗存活劑;生物學(xué)反應(yīng)修飾劑;抗激素和抗血管發(fā)生劑,可以將所有這類活性劑與theramuteins的抑制劑或活化劑一起給藥。
可以將theramutein的調(diào)節(jié)劑與中和涉及腫瘤生長的其它受體的抗體一起給藥。此外,可以將theramutein的調(diào)節(jié)劑與另外調(diào)節(jié)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的成分,優(yōu)選與在一種或多種其它信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中具有活性并且對這些途徑而言為常見的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的成分一起給藥。在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,將theramutein調(diào)節(jié)劑與特異性結(jié)合表皮生長因子受體(EGFR)的受體拮抗劑聯(lián)用。特別優(yōu)選抗原結(jié)合蛋白,這些蛋白結(jié)合EGFR的胞外域并且阻斷結(jié)合其配體中的一種或多種和/或中和配體-誘導(dǎo)的EGFR活化。EGFR拮抗劑可以為結(jié)合EGFR或EGFR配體并且抑制和EGFR與其配體結(jié)合的抗體。EGFR的配體的實(shí)例包括:例如,EGF、TGF-α、雙調(diào)蛋白、肝素-結(jié)合EGF(HB-EGF)和β動(dòng)物纖維素。認(rèn)為EGF和TGF-α為導(dǎo)致EGFR-介導(dǎo)的刺激的主要內(nèi)源性配體,不過,已經(jīng)證實(shí)TGF-α在促進(jìn)血管發(fā)生中更為有效。應(yīng)理解EGFR拮抗劑可以在外部結(jié)合EGFR的胞外部分,可以抑制,也可以不抑制配體的結(jié)合,或在化學(xué)活性劑的情況下,在內(nèi)部結(jié)合酪氨酸激酶結(jié)構(gòu)域。結(jié)合EGFR的EGFR拮抗劑的實(shí)例包括但不限于生物制劑,諸如對EGFR具有特異性的抗體(及其功能等效物);和化學(xué)活性劑(小分子),諸如對EGFR的胞質(zhì)域直接起作用的合成激酶抑制劑。
腫瘤發(fā)生中涉及的生長因子受體的其它實(shí)例為血管內(nèi)皮生長因子(VEGFR-1和VEGFR-2)、血小板衍生的生長因子(PDGFR)、神經(jīng)生長因子(NGFR)、成纖維細(xì)胞生長因子(FGFR)等的受體。
在聯(lián)合療法中,在使用另一種活性劑開始治療之前、過程中或之后給予theramutein抑制劑及其任意的組合,即在使用抗腫瘤藥療法開始之前和過程中,在之前和之后,在過程中和之后或在之前、過程中和之后。例如,可以在開始放療前1-30天,優(yōu)選3-20天,更優(yōu)選5-12天給予theramutein抑制劑。在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,在使用抗體療法前、與之同時(shí)或更優(yōu)選在其后給予化療。
在本發(fā)明中,可以將任意合適的方法或途徑用于給予本發(fā)明的theramutein抑制劑,并且任選共同給予抗腫瘤劑和/或其它受體拮抗劑。按照本發(fā)明使用的抗腫瘤藥方案包括認(rèn)為最適合于治療患者腫瘤病情的任意方案。不同的惡性腫瘤可能需要使用特異性抗腫瘤抗體和特異性抗腫瘤劑,這需要基于患者與患者的不同來決定。給藥途徑包括:例如,口服、靜脈內(nèi)、腹膜內(nèi)、皮下或肌內(nèi)給藥。給予的拮抗劑劑量取決于許多因素,包括:例如,拮抗劑的類型、所治療的腫瘤的類型和嚴(yán)重程度以及拮抗劑的給藥途徑。然而,應(yīng)強(qiáng)調(diào)本發(fā)明并不限于任何特定的方法和給藥途徑。
合適的載體包括:例如,水、鹽水、磷酸緩沖鹽水、葡萄糖、甘油、乙醇等中的一種或多種及其組合。載體可以進(jìn)一步包括少量輔助物質(zhì),諸如濕潤劑或乳化劑、防腐劑或緩沖劑,它們可以增加作為活性組分的theramutein調(diào)節(jié)劑的貯存期限或有效性。作為本領(lǐng)域眾所周知的,可以將組合物配制成對哺乳動(dòng)物給藥后使活性組分快速、持續(xù)或延緩釋放的劑型。
本發(fā)明的組合物可以為各種形式。它們包括:例如,固體、半固體和液體劑型,諸如片劑、丸劑、粉劑、液體溶液、分散液或混懸液、脂質(zhì)體、栓劑、可注射和可輸注溶液。優(yōu)選的劑型取決于指定的給藥方式和治療應(yīng)用。
可以按照制藥領(lǐng)域中眾所周知的方式制備本發(fā)明的這類組合物。在制備組合物的過程中,通常將活性組分與載體混合或用載體稀釋組合物和/或?qū)⒔M合物包封在載體內(nèi),所述的載體用作稀釋劑,它可以為固體、半固體或液體物質(zhì),它起活性組分的媒介物、賦形劑或介質(zhì)的作用。因此,組合物可以為片劑、錠劑、小藥囊、扁囊劑、酏劑、混懸液、氣溶膠(作為固體或在液體介質(zhì)中)、含有例如達(dá)10%重量的活性化合物的軟膏劑、軟和硬明膠膠囊、栓劑、注射溶液、混懸液、無菌包裝的粉末和作為局部貼劑。
應(yīng)理解可以將本發(fā)明的方法和組合物對任意合適的哺乳動(dòng)物給藥,諸如家兔、大鼠或小鼠。更優(yōu)選所述的哺乳動(dòng)物為人。
本發(fā)明的化合物還可以作為鹽存在。在本發(fā)明的上下文中,優(yōu)選給予藥物上可接受的鹽。藥物上可接受的鹽指的是本發(fā)明化合物的酸加成的鹽或堿加成的鹽,其中將所得抗衡離子理解為在本領(lǐng)域中一般對藥物應(yīng)用而言是可接受的。藥物上可接受的鹽可以為本發(fā)明化合物與無機(jī)酸或有機(jī)酸形成的鹽。優(yōu)選得到與無機(jī)酸形成的鹽,所述的無機(jī)酸諸如:例如,鹽酸、氫溴酸、磷酸或硫酸,或優(yōu)選得到與有機(jī)羧酸或磺酸形成的鹽,所述的有機(jī)羧酸或磺酸諸如:例如,乙酸、馬來酸、富馬酸、蘋果酸、檸檬酸、酒石酸、乳酸、苯甲酸或甲磺酸、乙磺酸、苯磺酸、甲苯磺酸或萘二磺酸。藥物上可接受的鹽還可以為本發(fā)明化合物的金屬或銨鹽。特別優(yōu)選得到:例如,鈉、鉀、鎂或鈣的鹽,并且還特別優(yōu)選得到來源于氨或有機(jī)胺類的銨鹽,所述的有機(jī)胺類諸如:例如,乙胺、二-或三乙胺、二-或三乙醇胺、二環(huán)己胺、二甲氨基乙醇、精氨酸、賴氨酸、乙二胺或2-苯乙胺(參見Berge等J.Pharm.Sci.1977,66,1-19)。
1.在本申請的上下文中,參照了各種公開文獻(xiàn)、參考文獻(xiàn)正文、教科書、技術(shù)手冊、專利和專利公開文獻(xiàn)。將這些公開文獻(xiàn)、專利、專利申請和其它對比文件教導(dǎo)的和披露的內(nèi)容完整地引入本申請作為參考,以便更完整地描述本發(fā)明涉及的本領(lǐng)域的狀態(tài)。
2.應(yīng)理解和預(yù)計(jì)本領(lǐng)域技術(shù)人員可以實(shí)施本文披露的本發(fā)明的原理的變化形式并且認(rèn)為這類變型包括在本發(fā)明的范圍內(nèi)。
3.下列實(shí)施例進(jìn)一步解釋本發(fā)明,但不應(yīng)視為以任何方式限定本發(fā)明的范圍。常用方法,諸如那些用于載體和質(zhì)粒構(gòu)建、將編碼多肽類的基因插入這類載體和質(zhì)粒、將質(zhì)粒導(dǎo)入宿主細(xì)胞以及基因和基因產(chǎn)物的表達(dá)及其測定的方法的詳細(xì)描述可以獲自大量公開文獻(xiàn),包括:Sambrook,J等,(1989)Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press;Coligan,J.等(1994)Current Protocols in Immunology,Wiley&Sons,Incorporated;Enna,S.J.等(1991)Current Protocols in Pharmacology,Wiley&Sons,Bonifacino,J.S.等(1999)Current Protocols in Cell Biology,Wiley&Sons;和U.S.Patent4,980,281。將所有本文提及的參考文獻(xiàn)完整地引入。
實(shí)施例
p210Bcr-Abl-T315I為對甲磺酸伊馬替尼的抑制作用產(chǎn)生抗性的p210Bcr-Abl蛋白質(zhì)(p210Bcr-Abl)的theramutein(Gleevec,STI-571)。315位上的突變將蘇氨酸轉(zhuǎn)化成異亮氨酸殘基,并且為在抗性或復(fù)發(fā)性患者中觀察到的幾種突變之一。然而,這種特定的突變體為鑒定的最具抗性的這類theramutein。
為用于超表達(dá)p210Bcr-Abl-T315I theramutein改造的Ba/F3細(xì)胞系測定表型反應(yīng)。測定相對于未轉(zhuǎn)化的Ba/F3細(xì)胞和表達(dá)p210Bcr-Abl-wt prototheramutein的Ba/F3細(xì)胞而言的表型反應(yīng)。表型反應(yīng)為T315I突變體在類似的培養(yǎng)條件下生長至高于對照組的未轉(zhuǎn)化Ba/F3細(xì)胞系的細(xì)胞飽和密度并且在維持對照組未轉(zhuǎn)化的Ba/F3細(xì)胞系所需的白細(xì)胞介素3(IL-3)不存在下生長的能力。按照上述給出的教導(dǎo)定義和表征表型反應(yīng)。
使用的檢測系統(tǒng)為高速細(xì)胞成像和計(jì)數(shù)系統(tǒng),其中將3μl的細(xì)胞樣品體積順序通過5μl光學(xué)微量比色池注射、數(shù)字成像并且以電方式貯存、掃描且然后計(jì)數(shù),所有操作均在基于微型計(jì)算機(jī)的控制系統(tǒng)中進(jìn)行。該系統(tǒng)具有對來自小至500μl的培養(yǎng)物的樣品進(jìn)行直接細(xì)胞計(jì)數(shù)的能力,并且提供來自含有少至12,500個(gè)細(xì)胞的培養(yǎng)樣品的具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的總細(xì)胞計(jì)數(shù)。所有展示出細(xì)胞計(jì)數(shù)和存活率試驗(yàn)的圖均使用數(shù)據(jù)獲取和分析用的該系統(tǒng)。在進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)的同時(shí),該系統(tǒng)還能夠通過區(qū)分計(jì)數(shù)、成像的細(xì)胞測定總體細(xì)胞存活率,所述的計(jì)數(shù)、成像的細(xì)胞從吸收錐蟲藍(lán)染料(計(jì)為"未存活"細(xì)胞)的細(xì)胞中排除錐蟲藍(lán)(計(jì)為"存活"細(xì)胞)。將錐蟲藍(lán)注入細(xì)胞樣品,此后即刻依次將樣品注入微量比色池以便同時(shí)進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù)和成像。
將系統(tǒng)整合入高流通量篩選裝置的工作流程以便提供靈敏和精確的細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞存活率試驗(yàn)系統(tǒng),它更可靠并且較不易于發(fā)生基于代謝存活率的細(xì)胞試驗(yàn),諸如XTT或Alamar藍(lán)的混雜效應(yīng)。
最初,以一般在10-20μM范圍的濃度篩選約113,000種化合物,以便鑒定能夠通過任意方式影響超表達(dá)p210Bcr-Abl-T315I theramutein的Ba/F3細(xì)胞(Ba/F3T315I細(xì)胞)生長的亞群。
總計(jì)約11,760種化合物表現(xiàn)出大于50%的生長抑制作用,認(rèn)為這相當(dāng)于約4500種不同的化學(xué)類型。使用相同細(xì)胞系重新測試這些化合物產(chǎn)生了化合物反應(yīng)性數(shù)據(jù)庫,然后將其分類并且根據(jù)表現(xiàn)出最高總體生長抑制作用的那些化合物進(jìn)行等級排序。然后在使用Ba/F3T315I作為測試細(xì)胞和野生型Ba/F3作為對照細(xì)胞的確定的基于細(xì)胞的試驗(yàn)系統(tǒng)中按照本發(fā)明的方法從該等級排序的數(shù)據(jù)庫中重新篩選最高評分的130種化合物(基于在測試化合物的最低濃度下觀察到的最大程度的生長抑制作用)。所關(guān)注的化合物為那些與未轉(zhuǎn)化的野生型Ba/F3細(xì)胞相比區(qū)別抑制表達(dá)p210Bcr-Abl-T315I theramutein的Ba/F3細(xì)胞生長的化合物。鑒定滿足所需標(biāo)準(zhǔn)的6種化合物并且還使用Ba/F3p210Bcr-Abl-wt細(xì)胞系(Ba/F3P210細(xì)胞)進(jìn)一步詳細(xì)分析這些化合物中的某些。因缺乏可利用的來自化學(xué)供應(yīng)商的額外物質(zhì)而導(dǎo)致一種化合物不能用于進(jìn)一步測試。在使用上述細(xì)胞系的額外基于細(xì)胞的試驗(yàn)和使用分離自野生型P210Bcr-Abl和P210T315I突變體激酶結(jié)構(gòu)域的人重組產(chǎn)生的120Kd激酶結(jié)構(gòu)域片段的不含細(xì)胞的純化蛋白激酶試驗(yàn)中獨(dú)立地評價(jià)剩余的5種化合物。
所有5種化合物均如自磷酸化活性抑制所測定的抑制p210Bcr-Abl-T315I 120Kd活性,如附圖4中所示。因此,在篩選的113,000種以上的化合物中的6種最高評分的化合物中,這6種中的至少5種直接抑制p210Bcr-Abl-T315I突變體。值得注意的是,化合物5看起來在SDS聚丙烯酰胺凝膠上使重組蛋白質(zhì)帶鋪展開。這種情況在銀染色的凝膠上也是明顯的(數(shù)據(jù)未顯示)??赡艿那闆r是這種化合物實(shí)際上可以為能夠共價(jià)交聯(lián)POI以便持久抑制其活性的"自殺"抑制劑,但這一結(jié)果需要進(jìn)一步研究。
本文所述的教導(dǎo)和結(jié)果共同提供了結(jié)論性證據(jù),即該系統(tǒng)能夠鑒定選擇的theramutein的抑制劑或活化劑,并且本領(lǐng)域技術(shù)人員立即意識(shí)到這類系統(tǒng)在僅進(jìn)行顯而易見的最小變型的情況下就易應(yīng)用于任意其它theramutein。
證實(shí)Ba/F3T315I細(xì)胞系與野生型未轉(zhuǎn)化Ba/F3細(xì)胞相比的生長抑制作用的基于細(xì)胞的試驗(yàn)結(jié)果的有代表性的實(shí)例如附圖1和2中所示。這些化合物在野生型Ba/F3未轉(zhuǎn)化細(xì)胞(不表達(dá)p210Bcr-Abl-wt或p210Bcr-Abl-T315I)的生長和存活率相對不受影響的濃度下抑制表達(dá)T315I theramutein的細(xì)胞生長并且降低其存活率,而表達(dá)prototheramutein和theramutein的細(xì)胞基本上得到抑制。在某些情況中,對表達(dá)T315I的細(xì)胞的抑制程度甚至大于對表達(dá)P210prototheramutein的細(xì)胞的抑制程度(例如,參見附圖3,右手側(cè),化合物3對P210和T315I細(xì)胞的結(jié)果。
概括地說,本文提供的方法提供了用于產(chǎn)生或鑒定任意指定theramutein的調(diào)節(jié)劑的可推廣方法形式的基本發(fā)展。結(jié)果結(jié)論性地證實(shí)了該方法在鑒定關(guān)鍵需求的化合物方面的能力,這些化合物用于克服在某些患者群體中一致性地成為致命性的并且目前不可治療的具體類型的獲得性藥物抗性。此外,對本領(lǐng)域技術(shù)人員顯而易見的是,可以使用顯而易見的變型將本文所述的技術(shù)和方法直接廣泛應(yīng)用于任何具有臨床意義的可能的theramutein。
值得注意的是,在100,000種以上化合物的初步篩選中,其中約10,000種化合物表現(xiàn)出一定程度的生長抑制作用,當(dāng)使用本文詳述的方法重新篩選最有效的生長抑制物質(zhì)時(shí),鑒定了6種不同的化合物并且隨后測試的所有化合物在使用T315I突變體的不含細(xì)胞的純化蛋白激酶試驗(yàn)中均表現(xiàn)出了抑制活性(一種化合物不能用于進(jìn)一步測試)?;谶@類值得注意的結(jié)果,本領(lǐng)域技術(shù)人員立即明確基于上述部分和引入本文作為參考的對比文件中的教導(dǎo)的表型反應(yīng)的適當(dāng)選擇和確定,該方法可以有效地應(yīng)用于鑒定任意theramutein的抑制劑或活化劑。例如,本領(lǐng)域技術(shù)人員使用上述知識(shí)容易地設(shè)計(jì)分析系統(tǒng)來鑒定來源于其它prototheramuteins的theramuteins的抑制劑,已知所述的其它prototheramuteins顯示出賦予藥物抗性的突變,諸如c-kit基因產(chǎn)物或表皮生長因子(EGF)受體(EGFR)或血小板衍生的生長因子(PDGF)受體α和β。在使用該方法時(shí),就方法用于在其相應(yīng)的表型反應(yīng)是可檢測的任意哺乳動(dòng)物細(xì)胞類型中表達(dá)的任意指定theramutein的能力而言,推斷應(yīng)沒有限制。
將所有涉及的任意公開文獻(xiàn)、專利或其它引用的參考文獻(xiàn)引入本文作為參考。
參考文獻(xiàn)
Adcock,I.M.,Lane,S.J.“類固醇作用和炎癥抗性機(jī)制”-Journal of Endocrinology,Volume 178(2003年9月)347-355頁
Allen,P.B.,Wiedemann,L.M.“ABL激酶結(jié)構(gòu)域的ATP結(jié)合位點(diǎn)中的活化突變”-The Journal of Biological Chemistry,Volume 271(1996年8月9日)19585-19591頁
Barthe,C.,Cony-Makhoul,P.,Melo,J.V.,Reiffers,J.,Mahon,F,X.Roots of Clinical Resistance to STI-571Cancer Therapy.Science,Volume 293(September 21,2001)Page 2163a
Berge,S.M.,Bighley,L.D.,Monkhouse,D.C.“藥用鹽”-Journal of Pharmaceutical Science,Volume 66(1977年1月)1-19頁
Bolstad,B.M.,Irizarry,R.A.,Astrand,M.,Speed,T.P.“基于變量和系統(tǒng)誤差的高密度寡核苷酸陣列數(shù)據(jù)的歸一化方法的比較”-Bioinformatics,Volume 19(2003年1月22日)185-193頁
Bonifacino,J.S.Current Protocols in Cell Biology,Wiley&Sons,New York,1999
Branford,S.,Rudzki,Z.,Walsh,S.,Grigg,A.,Arthur,C.,Taylor,K.,Hermann,R.,Lynch,K.P.,Hughes,T.P.“患有慢性髓細(xì)胞樣白血病或發(fā)生伊馬替尼(STI571)耐藥性的Ph-陽性急性成淋巴細(xì)胞性白血病的患者BCR/ABL腺苷三磷酸-結(jié)合區(qū)內(nèi)簇生的高頻率點(diǎn)突變”-Blood,Volume 99(2002年5月1日)3472-3475
Breshears,S.R.,Wang,S.S.,Bechtolt,S.G.,Christensen,B.E.“嘌呤類.VIII:某些氯取代的嘌呤類的氨基分解”-Journal of the American Chemical Society,Volume 81(1959年7月20日)3789-3792頁
Capps,T.M.,Heard,N.E.,Simmons,D.P.,Connor,C.L.“小鼠Primisulfuron-methyl的獨(dú)特二硫化物二聚化代謝物的鑒定和合成”-Journal of Agricultural和Food Chemistry,Volume 41(1993)2411-2415頁
Coligan,J.Current Protocols in Immunology,Wiley&Sons,New York,1994
Corbin,A.S.,Buchdunger,E.,Pascal,F.,Druker,B.J.“STI571抑制Abl激酶的特異性的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)分析”-The Journal of Biological Chemistry,Volume 277(2002年8月30日)32214-32219頁
Cunningham,B.C.,De Vos,A.M.,Mulkerrin,M.G.,Ultsch,M,Wells,J.A.“選擇性配體激動(dòng)劑和拮抗劑”-美國專利US 5,506,107(1996年4月9日)
Cunningham,B.C.,Wells,J.A.,Clark,R.G.,Olson,K.,Fuh,G.G.“用于抑制生長激素作用的方法”-美國專利US 6,004,931(1999年12月21日)
Daley,G.Q.,Van Etten,R.A.,Baltimore,D.“費(fèi)城染色體的P210brc/abl基因誘導(dǎo)小鼠的慢性髓細(xì)胞性白血病”-Science,Volume247(1990年2月16日)824-830頁
Davis,T.L.“脲系列中的反應(yīng)機(jī)制”-Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,Volume 11(1925)68-73頁
Druker,B.J.,M.D.,Sawyers,C.L.,M.D.,Kantarjian,H.,M.D.,Resta,D.J.,R.N.,Reese,S.F.,M.D.,Ford,J.M.,M.D.,Capdeville,R.,M.D.,Talpaz,M.,M.D.“帶有費(fèi)城染色體的慢性髓細(xì)胞樣白血病和急性成淋巴細(xì)胞性白血病的白血病急性發(fā)作中BCR-ABL酪氨酸激酶的特異性抑制劑活性”-The New England Journal of Medicine,Volume 344(2001年4月5日)1038-1042頁
Druker,B.J.,M.D.,Talpaz,M.,M.D.,Resta,D.J.,R.N.,Peng,B.,Ph.D.,Buchdunger,E.,Ph.D.,Ford,J.M.,M.D.,Lydon,N.B.,Ph.D.,Kantarjian,H.,M.D.,Capdeville,R.,M.D.,Ohno-Jones,S.,B.S.,Sawyers,C.L.,M.D.“慢性髓細(xì)胞樣白血病中BCR-ABL酪氨酸激酶的特異性抑制劑的功效和安全性”-The New England Journal of Medicine,Volume 344(2001年4月5日)1031-1037頁
Druker,B.J.,Tamura,S.,Buchdunger,E.,Ohno,S.,Segal,G.M.,Fanning,S.,Zimmermann,J.,Lydon,N.B.“Abl酪氨酸激酶的選擇性抑制劑對Bcr-Abl陽性細(xì)胞生長的作用”-Nature Medicine,Volume 2(1996年5月)561-566頁
Enna,S.J.Current Protocols in Pharmacology,Wiley&Sons,New York,1991
Fader l,S.,M.D.,Talpaz,M.,M.D.,Estrov,Z.,M.D.,O’Brien,S.,M.D.,Kurzrock,R.,M.D.,Kantarjian,H.M.,M.D.“慢性髓細(xì)胞樣白血病生物學(xué)”-The New England Journal of Medicine,Volume 341(1999年7月15日)164-172頁
Foreman,J.C.和Johansen,T.Textbook of Receptor Pharmacology.CRC Press,Boca Raton,2002
Gambacorti-Passerini,C.,Barni,R.,Le Coutre,P.,Zucchetti,M.,Cabrita,G.,Cleris,L.,Rossi,F.,Gianazza,E.,Brueggen,J.,Cozens,R.,Pioltelli,P.,Pogliani,E.,Corneo,G.,Formelli,F.,D’Incalci,M.“人BCR-ABL+白血病細(xì)胞對Abl抑制劑STI571的體內(nèi)耐受性中的α1酸性糖蛋白的作用”-Journal of the National Cancer Institute,Volume 92(2000年10月18日)1641-1650頁
Gineinah,M.M.,El-Sherbeny,M.A.,Nasr,M.N.,Maarouf,A.R.“某些喹唑啉和喹唑啉基-4-氧代喹唑啉衍生物的合成和抗炎篩選”-Archiv der Pharmazie-Pharmaceutical and Medicinal Chemistry,Volume 335(2002)556-562頁
Gorre,M.E.,Mohammed,M.,Ellwood,K.,Hsu,N.,Paquette,R.,Rao,P.N.,Sawyers,C.L.“BCR-ABL基因突變或擴(kuò)增導(dǎo)致的對STI-571癌癥療法的臨床耐受性”-Science,Volume 293(2001年8月3日)876-880頁
Greene,T.W.;Wuts,P.G.M.Protective Groups in Organic Synthesis,2nd ed.,Wiley,New York,1991
Hofmann,W.K.,Jones,L.C.,Lemp,N.A.,DeVos,S.,Gschaidmeier,H.,Hoelzer,D.,Ottmann,O.G.,Koeffler,H.P.“Ph+急性成淋巴細(xì)胞性白血病對酪氨酸激酶抑制劑STI571的耐受性具有唯一的BCR-ABL基因突變”-Blood,Volume 99(2002年3月1日)1860-1862頁
Horowitz,A.D.,Greenebaum,E.,Weinstein,I.B.“完整哺乳動(dòng)物細(xì)胞中佛波醇酯腫瘤啟動(dòng)子的受體的和生物流體中受體結(jié)合抑制劑的降低”-Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,Volume 78(1981年4月)2315-2319頁
Hou,Y.Y.,Tan,Y.S.,Sun,M.H.,Wei,Y.K.,Xu,J.F.,Lu,S.H.,A-Ke-Su,S.J.,Zhou,Y.N.,Gao,F.,Zheng,A.H.,Zhang,T.M.,Hou,W.Z.,Wang,J.,Du,X.,Zhu,X.Z.“人胃腸道間質(zhì)瘤中的C-kit基因突變”-World Journal of Gastroenterology,Volume 10(2004年5月1日)1310-1314頁
Housey,G.M.“用于篩選蛋白質(zhì)抑制劑和活化劑的方法”-美國專利US4,980,281(1990年12月25日)
Housey,G.M.“生長控制和腫瘤啟動(dòng)中蛋白激酶C的作用”-Ph.D.Dissertation,(1988)
Housey,G.M.,Johnson,M.D.,Hsiao,W.L.,O'Brian,C.A.,Murphy,J.P.,Kirschmeier,P.,Weinstein,I.B.“蛋白激酶C的超表達(dá)導(dǎo)致大鼠成纖維細(xì)胞中生長控制障礙”-Cell,Volume 52(1988年2月12日)343-354頁
Huron,D.R.,Gorre,M.E.,Kraker,A.J.,Sawyers,C.L.,Rosen,N.,Moasser,M.M.“Abl激酶的新吡啶并嘧啶抑制劑為Bcr-Abl-驅(qū)動(dòng)的K562細(xì)胞的皮摩爾抑制劑并且對抗STI571-抗性Bcr-Abl突變體有效”-Clinical Cancer Research,Volume 9(2003年4月)1267-1273頁
La Rosee,P.,Corbin,A.S.,Stoffregen,E.P.,Deininger,M.W.,Druker,B.J.“對臨床相關(guān)的對甲磺酸伊馬替尼(Gleevec,STI-571)產(chǎn)生耐受性的Bcr-Abl同種型的Bcr-Abl激酶抑制劑PD180970的活性”-Cancer Research,Volume 62(2002年12頁15日)7149-7153頁
Latham,H.G.Jr.,May,E.L.,Mosettig,E.“氨基-和胍基-苯基糖苷類”-Journal of Organic Chemistry,Volume 15(1950)884-889頁
Le Coutre,P.,Tassi,E.,Varella-Garcia,M.,Barni,R.,Mologni,L.,Cabrita,G.,Marchesi,E.,Supino,R.,Gambacorti-Passerini,C.“通過基因擴(kuò)增誘導(dǎo)STI571人白血病細(xì)胞中Abelson抑制劑的耐受性”-Blood,Volume 95(20003月1日)1758-1766頁
Leonard,G.D.,Fojo,T.,Bates,S.E.“臨床實(shí)踐中ABC轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的作用”-The Oncologist,Volume 8(2003)411-424頁
Loutfy,M.R.,Walmsley,S.L.“HIV感染中抗逆轉(zhuǎn)錄病毒療法的補(bǔ)救作用”-Expert Opinion,Volume 3(2002年2月)81-90頁
Lynch,T.J.,M.D.,Bell,D.W.,Ph.D.,Sordella,R.,Ph.D.,Gurubhagavatula,S.,M.D.,Okimoto,R.A.,B.S.,Brannigan,B.W.,B.A.,Harris,P.L.,M.S.,Haserlat,S.M.,B.A.,Supko,J.G.,Ph.D.,Haluska,F.G.,M.D.,Ph.D.,Louis,D.N.,M.D.,Christiani,D.C.,M.D.,Settleman,J.,Ph.D.,Haber,D.A.,M.D.,Ph.D.“基于非-小-細(xì)胞肺癌對Gefitinib的反應(yīng)性的表皮生長因子受體中的活化突變”-The New England Journal of Medicine,Volume 350(2004年5月20日)2129-2139頁
Mahon,F.X.,Deininger,M.W.N.,Schultheis,B.,Chabrol,J.,Reiffers,J.,Goldman,J.M.,Melo,J.V.“對酪氨酸激酶抑制劑STI571具有差別敏感性的BCR-ABL陽性細(xì)胞系的選擇和表征:不同抗性機(jī)制”-Blood,Volume 96(20008月1日)1070-1079頁
Mansky,L.M.,Temin,H.M.“人免疫缺陷病毒1型的體內(nèi)突變率低于根據(jù)純化的逆轉(zhuǎn)錄酶精確度預(yù)測的體內(nèi)突變率”-Journal of Virology,Volume 69(19958月)5087-5094頁
Marshall,J.R.,Walker,J.“某些潛在的互變異構(gòu)2-和4(6)-取代的嘧啶類的實(shí)驗(yàn)研究”-Journal of the Chemical Society,(1951)1004-1017頁
Marx,J.“為何新癌癥藥物在某些患者中作用充分”-Science,Volume 304(2004年4月30日)658-659頁
Melo,J.V.,Myint,H.,Galton,D.A.,Goldman,J.M.“P190BCR-ABL慢性髓細(xì)胞樣白血?。壕哂新运鑶魏思?xì)胞樣白血病的缺少的環(huán)節(jié)?”-Leukemia,Volume 8(1994年1月)208-211頁
Nair,M.D.,Mehta,S.R.“稠合的異喹啉類*-咪唑并、嘧啶并、三唑并和四唑并異喹啉類的合成和反應(yīng)”-Indian Journal of Chemistry,Volume 5(1967年9月)403-408頁
Noble,M.E.M.,Endicott,J.A.,Johnson,L.N.“蛋白激酶抑制劑:根據(jù)結(jié)構(gòu)洞察藥物設(shè)計(jì)”-Science,Volume 303(2004年3月19日)1800-1805頁
O'Hare,T.,Pollock,R.,Stoffregen,E.P.,Keats,J.A.,Abdullah,O.M.,Moseson,E.M.,Rivera,V.M.,Tang,H.,Metcalf,C.A.3rd,Bohacek,R.S.,Wang,Y.,Sundaramoorthi,R.,Shakespeare,W.C.,Dalgarno,D.,Clackson,T.,Sawyer,T.K.,Deininger,M.W.,Druker,B.J.“一種有效的基于ATP的致癌蛋白激酶抑制劑AP23464對野生型和突變體Bcr-Abl的抑制:涉及CML”-Blood,Volume 104(2004年10月15日)2532-2539頁
Paez,J.G.,P.A.,Lee,J.C.,Tracy,S.,Greulich,H.,Gabriel,S.,Herman,P.,Kaye,F.J.,Lindeman,N.,Boggon,T.J.,Naoki,K.,Sasaki,H.,Fujii,Y.,Eck,M.J.,Sellers,W.R.,Johnson,B.E.,Meyerson,M.“肺癌中的EGFR突變:與對Gefitinib療法臨床反應(yīng)的相關(guān)性”-Sciencexpress(2004年4月29日)1-4頁
Ravandi,F.,Cortes,J.,Albitar,M.,Arlinghaus,R.,Qiang,Guo J.,Talpaz,M.,Kantarjian,H.M.“具有p185(BCR/ABL)表達(dá)的慢性髓細(xì)胞性白血?。禾卣骱团R床重要性”-British Journal of Haematology,Volume 107(1999年12月)581-586頁
Sambrook,J.,Fritsch,E.F.,Maniatis,T.Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd ed.,Cold Sp環(huán)Harbor Laboratory Press;New York,1989
Sambrook和Russell,Molecular Cloning:A Laboratory Manual.Cold Spring Harbor Laboratory Press,New York,2001,Volumes 1-3
Sawyers,C.L.,Gorre,M.E.,Shah,N.P.,Nicoll,J.“與對STI-571耐受性相關(guān)的Bcr-Abl酪氨酸激酶中的突變”-WO2002US0018729(US2002000171889)
Sawyers,C.L.M.D.“慢性髓細(xì)胞樣白血病”-The New England Journal of Medicine,Volume 340(19994月29日)1330-1340頁
Schindler,T.,Bornmann,W.,Pellicena,P.,Miller,W.T.,Clarkson,B.,Kuriyan,J.“Abelson酪氨酸激酶的STI-571抑制的結(jié)構(gòu)機(jī)制”-Science,Volume 289(2000年9月15日)1938-1942頁
Senechal,K.,Halpern,J.,Sawyers,C.L.“CRKL銜接蛋白轉(zhuǎn)化成纖維細(xì)胞和通過BCR-ABL癌基因在轉(zhuǎn)化中的功能”-The Journal of Biological Chemistry,Volume 271(1996年9月20日)23255-23261頁
Senechal,K.,Heaney,C.,Druker,B.,Sawyers,C.L.“Crkl銜接蛋白在成纖維細(xì)胞和造血細(xì)胞中功能的結(jié)構(gòu)要求”-Molecular and Cellular Biology,Volume 18(1998年9月)5082-5090頁
Shah,N.P.,Tran,C.,Lee,F.Y.,Chen,P.,Norris,D.,Sawyers,C.L.“使用新ABL激酶抑制劑消除伊馬替尼耐受性”-Science,Volume 305(2004年7月16日)399-401頁
Shearer,B.G.,Lee,S.,Franzmann,K.W.,White,H.A.R.,Sanders,D.C.J.,Kiff,R.J.,Garvey,E.P.,Furfine,E.S.“作為人一氧化氮合酶抑制劑的構(gòu)象限制的精氨酸類似物”-Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,Volume 7(1997年7月8日)1763-1768頁
Tipping,A.J.,Baluch,S.,Barnes,D.J.,Veach,D.R.,Clarkson,B.M.,Bornmann,W.G.,Mahon,F.X.,Goldman,J.M.,Melo,J.V.“雙向特異性Bcr-Abl和Src-族激酶抑制劑在對甲磺酸伊馬替尼的細(xì)胞敏感性和耐受性中的功效”-Leukemia,Volume 18(2004年8月)1352-1356頁
Von Bubnoff,N.,Schneller,F.,Peschel,C.,Duyster,J.“與費(fèi)城-染色體-陽性白血病對STI571的臨床耐受性相關(guān)的BCR-ABL基因突變:前瞻性研究”-The Lancet,Volume 359(2002年2月9日)487-491頁
Von Bubnoff,N.,Veach,D.R.,Van Der Kuip,H.,Aulitzky,W.E.,Sanger,J.,Seipel,P.,Bornmann,W.G.,Peschel,C.,Clarkson,B.,Duyster,J.“Bcr-Abl陽性白血病的抗性的基于細(xì)胞的篩選鑒定了作為備選Abl激酶抑制劑的PD166326的突變模式”-Blood,Volume 105(2005年2月15日)1652-1659頁
Wakai,T.,Kanda,T.,Hirota,S.,Ohashi,A.,Shirai,Y.Hatakeyama,K.“轉(zhuǎn)移型胃腸道間質(zhì)瘤中伊馬替尼療法的晚期耐受性與二次KIT突變相關(guān)”-British Journal of Cancer,Volume 90(2004年6月1日)2059-2061頁
Weigel,U.,Meyer,M.,Sebald,W.“人白細(xì)胞介素2的突變蛋白:復(fù)性產(chǎn)率、增殖活性和受體結(jié)合”-European Journal of Biochemistry,Volume 180(1989年3月15日)295-300頁
Weisberg,E.,Catley,L.,Kujawa,J.,Atadja,P.,Remiszewski,S.,Fuerst,P.,Cavazza,C.,Anderson,K.,Griffin,J.D.“組蛋白脫乙?;敢种苿㎞VP-LAQ824在體外和體內(nèi)對髓細(xì)胞性白血病細(xì)胞具有顯著性活性”-Leukemia,Volume 18(2004年12月)1951-1963頁
Weisberg,E.,Griffin,J.D.“ABL酪氨酸激酶抑制劑STI 571在BCR/ABL-轉(zhuǎn)化的造血細(xì)胞系中的耐受性的機(jī)制”-Blood,Volume 95(2000年6月1日)3498-3505頁
Weisberg,E.,Manley,P.W.,Breitenstein,W.,Bruggen,J.,Cowan-Jacob,S.W.,Ray,A.,Huntly,B.,Fabbro,D.,Fendrich,G.,Hall-Meyers,E.,Kung,A.L.,Mestan,J.,Daley,G.Q.,Callahan,L.,Catley,L.,Cavazza,C.,Azam,M.,Neuberg,D.,Wright,R.D.,Gilliland,D.G.,Griffin,J.D.“一種選擇性天然和突變Bcr-Abl抑制劑AMN107的表征”-Cancer Cell,Volume 7(2005年2月)129-141頁
White,M.F.,Livingston,J.M.,Backer,Lauris,V.,Dull,T.J.,Ullrich,A.,Kahn,C.R.“酪氨酸960上的胰島素受體突變抑制信號傳遞,但不會(huì)影響其酪氨酸激酶活性”-Cell,Volume 54(1988年8月26日)641-649頁
Wu,M.T.,MacCoss,M.,Ikeler,T.J.,Hirshfield,J.,Arison,B.H.,Tolman,R.L.“增環(huán)的哌嗪基-7,8-二氫-6H-硫代吡喃并[3,2-d]嘧啶類”-Journal of Heterocyclic Chemistry,Volume 27(1990)1559-1563頁
本發(fā)明涉及以下實(shí)施方式:
1.治療人腫瘤性疾病或增殖性障礙的方法,包括給予治療有效量的具有通式I的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R2選自-CR21a-、-NR22b-和-(C=R23)-;
各個(gè)R21獨(dú)立地選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-O-(C1-3烷基)、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R23選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R3選自-CR31c-、-NR32d-和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0),-N(R0)2、-O-R0,OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、
C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、
C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R2為-NR22b-且R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、NR0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;并且
f為0或1。
2.實(shí)施方式1所述的方法,其中X1為N。
3.實(shí)施方式2所述的方法,其中X2為N。
4.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式Ia的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22各自獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R3選自-CR31c-、-NR32d-和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、
C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、
C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
5.實(shí)施方式4所述的方法,其中X1為N。
6.實(shí)施方式5所述的方法,其中X2為N。
7.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式Ib的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、
C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
8.實(shí)施方式7所述的方法,其中X1為N。
9.實(shí)施方式8所述的方法,其中X2為N。
10.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式II的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
R9選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
11.實(shí)施方式10所述的方法,其中X1為N。
12.實(shí)施方式11所述的方法,其中X2為N。
13.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式IIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
14.實(shí)施方式13所述的方法,其中X1為N。
15.實(shí)施方式14所述的方法,其中X2為N。
16.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式IIb的化合物:
其中:
R14選自H和F;
R8選自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R60;
各個(gè)R60獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR0、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組;
R61選自芳基和雜環(huán);
Q選自化學(xué)鍵或具有式-O-、-(CH2)i-、-(CH2)iC(O)(CH2)j-、-(CH2)i-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)O(CH2)j-、-(CH2)iN(R62)C(O)-(CH2)j-、-(CH2)iOC(O)N(R62)-(CH2)j-和-O-(CH2)i-C(O)N(R62)-(CH2)j-的基團(tuán);
R62選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
h為0-4;
i為0-4;且
j為0-4。
17.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式III的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R10選自-Y'-R18;
Y'選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R18選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
18.實(shí)施方式17所述的方法,其中X1為N。
19.實(shí)施方式18所述的方法,其中X2為N。
20.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式IIIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
21.實(shí)施方式20所述的方法,其中X1為N。
22.實(shí)施方式21所述的方法,其中X2為N。
23.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式IV的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R44選自H、烷基、環(huán)烷基、-(C=O)R0、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R45選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán);且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
24.實(shí)施方式23所述的方法,其中X1為N。
25.實(shí)施方式24所述的方法,其中X2為N。
26.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式V的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
27.實(shí)施方式26所述的方法,其中X1為N。
28.實(shí)施方式27所述的方法,其中X2為N。
29.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式Va的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
30.實(shí)施方式29所述的方法,其中X1為N。
31.實(shí)施方式30所述的方法,其中X2為N。
32.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式VI的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
33.實(shí)施方式32所述的方法,其中X1為N。
34.實(shí)施方式33所述的方法,其中X2為N。
35.實(shí)施方式1所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式VIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
36.實(shí)施方式35所述的方法,其中X1為N。
37.實(shí)施方式36所述的方法,其中X2為N。
38.抑制P210BCR-ABL-T315I theramutein的方法,包括對人給予具有通式I的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R2選自-CR21a-、-NR22b-和-(C=R23)-;
各個(gè)R21獨(dú)立地選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(C1-3烷基)、-N(C1-3烷基)2、-O-(C1-3烷基)、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R23選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R3選自-CR31c-、-NR32d-和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
R41各自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R43各自選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R2為-NR22b-且R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、NR0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子的烴鏈,并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
39.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予治療有效量的具有通式Ia的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
R3選自-CR31c-、-NR32d-,和-(C=R33)-;
各個(gè)R31基團(tuán)選自H、鹵素、-NH2、-N(H)(R0)、-N(R0)2、-O-R0、OH和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R33選自O(shè)、S、N-R34和N-OR0;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-NR42f-、-(C=R43)-和-O-;
各個(gè)R41選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R42基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
條件是當(dāng)R4為-NR42f-時(shí),R3不為-NR32d-;且R3和R4不同時(shí)分別選自-(C=R33)-和-(C=R43)-;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子的烴鏈,并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
40.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式Ib的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
各個(gè)R22獨(dú)立地選自H和C1-3烷基;
各個(gè)R32基團(tuán)選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、芳基和雜環(huán);
R4選自-CR41e-、-(C=R43)-和-O-;
R41各自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R43選自O(shè)、S、N-R0和N-OR0;
R5選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0,
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子的烴鏈,并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基,環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
a為1或2;
b為0或1;
c為1或2;
d為0或1;
e為1或2;且
f為0或1。
41.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式II的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
R9選自-Y-R6和-Z-R7;
Y選自化學(xué)鍵、O、N-R0;
R6選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
Z為帶有1-4個(gè)碳原子的烴鏈,并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代;
R7為H或選自芳基和雜環(huán);且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
42.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式IIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R8選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
43.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式IIb的化合物:
其中:
R14選自H和F;
R8選自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R60;
各個(gè)R60獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR0、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組;
R61選自芳基和雜環(huán);
Q選自化學(xué)鍵或具有式-O-、-(CH2)i-、-(CH2)iC(O)(CH2)j-、-(CH2)i-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)O(CH2)j-、-(CH2)iN(R62)C(O)-(CH2)j-、-(CH2)iOC(O)N(R62)-(CH2)j-和-O-(CH2)i-C(O)N(R62)-(CH2)j-的基團(tuán);
R62選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
h為0-4;
i為0-4;且
j為0-4。
44.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式III的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R10選自-Y'-R18;
Y'選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R18選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
45.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式IIIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、
-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
X3為N、CH或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、
-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
46.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式IV的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R44選自H、烷基、環(huán)烷基、-(C=O)R0、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R45選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
47.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式V的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R22選自H和C1-3烷基;
R34選自H、NO2、CN、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
48.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式Va的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
各個(gè)R1獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
R0各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
49.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式VI的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R56選自-Y"-R19;
Y"選自化學(xué)鍵、O、NR0-和帶有1-4個(gè)碳原子并且任選地被鹵素、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CO2R0、C(O)R0、C(O)N(R0)2、CN、CF3、N(R0)2、NO2和OR0中的一個(gè)或多個(gè)取代的烴鏈;
R19選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CF3、芳基和雜環(huán)組成的組;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
50.實(shí)施方式38所述的方法,包括給予具有通式VIa的化合物:
其中:
環(huán)A為5-、6-或7-元環(huán)或7-至12-元稠合雙環(huán);
X1選自N、N-R0或C-R1;
X2選自N、N-R0或C-R1;
虛線表示任選的雙鍵;
R1各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR11、-(CH2)pC(O)(CH2)qR11、-(CH2)pC(O)N(R12)(R13)、-(CH2)pC(O)O(CH2)qR11、-(CH2)pN(R11)C(O)R11、-(CH2)pN(R12)(R13)、-N(R11)SO2R11、-OC(O)N(R12)(R13)、-SO2N(R12)(R13)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R1基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
n為0-6;
各個(gè)R11獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
各個(gè)R12和R13獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R12和R13可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
p為0-4;
q為0-4;
R55選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
X3為N或C-R50;
各個(gè)R50獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR51、-(CH2)rC(O)(CH2)sR51、-(CH2)rC(O)N(R52)(R53)、-(CH2)rC(O)O(CH2)sR51、-(CH2)rN(R51)C(O)R51、-(CH2)rN(R52)(R53)、-N(R51)SO2R51、-OC(O)N(R52)(R53)、-SO2N(R52)(R53)、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組,并且另外或可選地,相鄰環(huán)原子上的兩個(gè)R50基團(tuán)形成含有0-3個(gè)雜原子的5-或6-元稠合環(huán);
R51選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
R52和R53各自獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、芳基和雜環(huán);或R52和R53可以與它們所連接的氮一起形成可以任選地含有一個(gè)額外雜原子的5-至7-元環(huán);
r為0-4;
s為0-4;
m為0-4;且
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán)。
51.具有通式IIb的化合物:
其中:
R14選自H和F;
R8選自選自H、烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、CO2R0、C(O)R0、芳烷基、芳基和雜環(huán)組成的組;
X3為N、CH或C-R60;
各個(gè)R60獨(dú)立地選自烷基、環(huán)烷基、鏈烯基、炔基、芳烷基、CN、CF3、NO2、OR0、鹵素、芳基和雜環(huán)組成的組;
R61選自芳基和雜環(huán);
Q選自化學(xué)鍵或具有式-O-、-(CH2)i-、-(CH2)iC(O)(CH2)j-、-(CH2)i-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)-N(R62)-(CH2)j-、-(CH2)iC(O)O(CH2)j-、-(CH2)iN(R62)C(O)-(CH2)j-、-(CH2)iOC(O)N(R62)-(CH2)j-和-O-(CH2)i-C(O)N(R62)-(CH2)j-的基團(tuán);
R62選自芳基和雜環(huán);
各個(gè)R0獨(dú)立地選自H、烷基、環(huán)烷基、芳烷基、芳基和雜環(huán);
h為0-4;
i為0-4;且
j為0-4。
52.用于確定物質(zhì)是否為能夠引起可檢測到的表型反應(yīng)的theramutein的抑制劑或活化劑的方法,該方法包括:
a)將以基本上恒定水平表達(dá)theramutein的第一種細(xì)胞與所述物質(zhì)一起溫育;
b)將以基本上恒定水平表達(dá)相應(yīng)的prototheramutein的第二種細(xì)胞與已知的prototheramutein的抑制劑或活化劑一起溫育;
c)將第二種細(xì)胞對已知的prototheramutein的抑制劑或活化劑的表型反應(yīng)與第一種細(xì)胞對所述物質(zhì)的表型反應(yīng)進(jìn)行比較;和
d)確定將第一種細(xì)胞的表型反應(yīng)抑制或活化至至少與用已知的prototheramutein的抑制劑或活化劑抑制或活化第二種細(xì)胞的表型反應(yīng)相同的程度,由此將所述物質(zhì)鑒定為theramutein的抑制劑或活化劑。
53.實(shí)施方式52所述的方法,其中表達(dá)theramutein的細(xì)胞對所述物質(zhì)的表型反應(yīng)大于表達(dá)prototheramutein的細(xì)胞對已知的theramutein的抑制劑或活化劑的表型反應(yīng)。
54.用于確定物質(zhì)是否為theramutein的特異性抑制劑或特異性活化劑的方法,該方法包括:
a)提供表達(dá)theramutein和產(chǎn)生可檢測到的表型反應(yīng)的測試細(xì)胞;
b)用所述物質(zhì)處理該測試細(xì)胞;
c)檢驗(yàn)處理的細(xì)胞以便確定是否可以通過用所述物質(zhì)處理調(diào)節(jié)表型反應(yīng)。
55.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein或prototheramutein為信號轉(zhuǎn)導(dǎo)級聯(lián)的成分。
56.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein或prototheramutein為酶。
57.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein或prototheramutein為蛋白激酶。
58.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein或prototheramutein為酪氨酸激酶。
59.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein或prototheramutein為受體酪氨酸激酶。
60.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中prototheramutein為p210Bcr-Abl。
61.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中theramutein為p210Bcr-Abl的T315I突變體。
62.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中表型反應(yīng)為細(xì)胞的培養(yǎng)、形態(tài)或瞬時(shí)特征的改變。
63.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中表型反應(yīng)包括theramutein胞內(nèi)底物的磷酸化。
64.實(shí)施方式52或54所述的方法,其中在細(xì)胞的亞細(xì)胞部分上檢測到表型反應(yīng)。