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一種植物內(nèi)生菌16SrRNA基因擴(kuò)增方法及應(yīng)用與流程

文檔序號(hào):12346361閱讀:來源:國知局
技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種植物內(nèi)生菌16S?rRNA基因擴(kuò)增方法及應(yīng)用,其擴(kuò)增步驟包括植物預(yù)處理、植物樣本總DNA提取、樣本16S?rRNA基因的擴(kuò)增和基于Illumina平臺(tái)的高通量測序及生物信息分析,樣本16S?rRNA基因的擴(kuò)增包括16S?rRNA基因全長的乳液PCR擴(kuò)增和16S?rRNA基因高變區(qū)/保守區(qū)擴(kuò)增子擴(kuò)增,基于Illumina平臺(tái)的高通量測序及生物信息分析包括植物內(nèi)生細(xì)菌16S?rRNA基因擴(kuò)增子純化回收、擴(kuò)增子測序文庫構(gòu)建、Illumina?HiSeq測序和測序數(shù)據(jù)生物信息學(xué)分析。該基因擴(kuò)增方法用于高通量測序的植物病害檢測及植食性動(dòng)物腸道微生物檢測。本發(fā)明采用高通量測序技術(shù)進(jìn)行植物內(nèi)生細(xì)菌的測序分析,數(shù)據(jù)量更大,檢測結(jié)果更完整,而且最大程度降低了植物宿主的污染,結(jié)果多樣性更高,而且成本低。

技術(shù)研發(fā)人員:張時(shí)恒;孫梓健;安家興;劉馳;涂波
受保護(hù)的技術(shù)使用者:成都羅寧生物科技有限公司
文檔號(hào)碼:201610716279
技術(shù)研發(fā)日:2016.08.24
技術(shù)公布日:2017.01.04

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