1.一種結(jié)合分子,其包含:
能夠結(jié)合于糖基化葡萄球菌表面蛋白的第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域,和
能夠結(jié)合于葡萄球菌白細(xì)胞毒素的第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域。
2.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述糖基化葡萄球菌表面蛋白為糖基化含絲氨酸-天冬氨酸二肽重復(fù)序列(SDR)蛋白。
3.如權(quán)利要求2所述的結(jié)合分子,其中所述糖基化含SDR蛋白為ClfA、ClfB、SdrC、SdrD、SdrE、SdrF、SdrG或SdrH。
4.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域為全長抗體或抗體片段。
5.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段抵抗由裂解野生型IgG1的葡萄球菌蛋白酶引起的蛋白水解降解。
6.如權(quán)利要求5所述的結(jié)合分子,其中所述葡萄球菌蛋白酶在SEQ ID NO:60內(nèi)的殘基222-237(EU編號)之間或所述殘基處裂解野生型IgG1。
7.如權(quán)利要求6所述的結(jié)合分子,其中所述葡萄球菌蛋白酶為金黃色葡萄球菌V8蛋白酶。
8.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段不能特異性結(jié)合于人類FcγRI。
9.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段為人類、人類化或嵌合抗體或抗體片段。
10.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段不能特異性結(jié)合于蛋白A。
11.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段不能特異性結(jié)合于Sbi。
12.如權(quán)利要求4所述的結(jié)合分子,其中所述全長抗體或抗體片段能夠特異性結(jié)合于FcRn。
13.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域為替代骨架。
14.如權(quán)利要求13所述的結(jié)合分子,其中所述替代骨架包含纖連蛋白III型(FN3)結(jié)構(gòu)域。
15.如權(quán)利要求14所述的結(jié)合分子,其中所述FN3結(jié)構(gòu)域結(jié)合于具有氨基酸序列SEQ ID NO:10的LukA、具有氨基酸序列SEQ ID NO:11的LukB、具有氨基酸序列SEQ ID NO:12的LukD、具有氨基酸序列SEQ ID NO:13的LukE或其任何組合。
16.如權(quán)利要求14所述的結(jié)合分子,其中所述FN3結(jié)構(gòu)域結(jié)合于包含具有以SEQ ID NO:10陳述的氨基酸序列的LukA和具有以SEQ ID NO:11陳述的氨基酸序列的LukB的LukAB復(fù)合物。
17.如權(quán)利要求14所述的結(jié)合分子,其中所述FN3結(jié)構(gòu)域結(jié)合于包含具有以SEQ ID NO:13陳述的氨基酸序列的LukE和具有以SEQ ID NO:12陳述的氨基酸序列的LukD的LukED復(fù)合物。
18.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域與具有氨基酸序列SEQ ID NO:14-59或SEQ ID NO:113-666中任一者的FN3結(jié)構(gòu)域競爭結(jié)合于(i)具有以SEQ ID NO:10陳述的氨基酸序列的LukA,(ii)具有以SEQ ID NO:11陳述的氨基酸序列的LukB;(iii)具有以SEQ ID NO:12陳述的氨基酸序列的LukD;或(iv)具有以SEQ ID NO:13陳述的氨基酸序列的LukE。
19.如權(quán)利要求14所述的結(jié)合分子,其中所述FN3結(jié)構(gòu)域包含選自由SEQ ID NO:14-59和SEQ ID NO:113-666組成的組的氨基酸序列。
20.如權(quán)利要求14所述的結(jié)合分子,其中所述FN3結(jié)構(gòu)域包含氨基酸序列SEQ ID NO:14或SEQ ID NO:22。
21.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述葡萄球菌白細(xì)胞毒素選自由白細(xì)胞毒素A(LukA)、白細(xì)胞毒素B(LukB)、白細(xì)胞毒素AB(LukAB)、白細(xì)胞毒素D(LukD)、白細(xì)胞毒素E(LukE)、白細(xì)胞毒素ED(LukED)、Panton-Valentine殺白細(xì)胞素S(LukS-PV)、Panton-Valentine殺白細(xì)胞素F(LukF-PV)、Panton-Valentine殺白細(xì)胞素(LukSF/PVL)、γ溶血素A(HlgA)、γ溶血素C(HlgC)、γ溶血素B(HlgB)、γ溶血素AB(HlgAB)和γ溶血素BC(HlgBC)組成的組。
22.如權(quán)利要求21所述的結(jié)合分子,其中所述葡萄球菌白細(xì)胞毒素為LukAB、LukD或LukE。
23.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一和所述第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域經(jīng)由連接肽連接。
24.根據(jù)權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含具有氨基酸序列SEQ ID NO:60、62、64或66的免疫球蛋白重鏈可變(VH)區(qū)。
25.根據(jù)權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含具有氨基酸序列SEQ ID NO:61、63、65或67的免疫球蛋白輕鏈可變(VL)區(qū)。
26.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含:
具有氨基酸序列SEQ ID NO:60、62、64或66的VH區(qū),和
具有氨基酸序列SEQ ID NO:61、63、65或67的VL區(qū)。
27.根據(jù)權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含:
(1)具有氨基酸序列SEQ ID NO:60的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:61的VL區(qū);
(2)具有氨基酸序列SEQ ID NO:62的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:63的VL區(qū);
(3)具有氨基酸序列SEQ ID NO:64的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:65的VL區(qū);
(4)具有氨基酸序列SEQ ID NO:66的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:67的VL區(qū);
(5)具有氨基酸序列SEQ ID NO:68的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:69的VL區(qū);
(6)具有氨基酸序列SEQ ID NO:70的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:71的VL區(qū);
(7)具有氨基酸序列SEQ ID NO:72的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:73的VL區(qū);
(8)具有氨基酸序列SEQ ID NO:74的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:75的VL區(qū);
(9)具有氨基酸序列SEQ ID NO:76的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:77的VL區(qū);或
(10)具有氨基酸序列SEQ ID NO:78的VH區(qū),和具有氨基酸序列SEQ ID NO:79的VL區(qū)。
28.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其中所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含(i)具有氨基酸序列SEQ ID NO:60、62、64或66的VH區(qū);和(ii)具有氨基酸序列SEQ ID NO:61、63、65或67的VL區(qū);并且所述第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域包含氨基酸序列SEQ ID NO:14-59或SEQ ID NO:113-666中任一者。
29.如權(quán)利要求1所述的結(jié)合分子,其進(jìn)一步包含:
一個或多個額外結(jié)合結(jié)構(gòu)域,所述額外結(jié)合結(jié)構(gòu)域能夠(i)結(jié)合于與所述第一結(jié)合結(jié)構(gòu)域所結(jié)合不同的糖基化葡萄球菌表面蛋白和/或(ii)結(jié)合于與所述第二結(jié)合結(jié)構(gòu)域所結(jié)合不同的葡萄球菌白細(xì)胞毒素。
30.一種編碼如權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子的核酸序列。
31.一種包含如權(quán)利要求30所述的核酸序列的載體。
32.一種包含如權(quán)利要求31所述的載體的宿主細(xì)胞。
33.一種用于制造結(jié)合分子的方法,所述方法包括:
在允許所述結(jié)合分子的表達(dá)的條件下培養(yǎng)如權(quán)利要求32所述的宿主細(xì)胞,和
從培養(yǎng)物回收所述結(jié)合分子。
34.一種藥物組合物,其包含:
根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子,和
藥學(xué)上可接受的載體。
35.根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子,其用于治療或改善葡萄球菌感染。
36.一種用于治療、預(yù)防或改善葡萄球菌感染的方法,所述方法包括:
在有效治療、預(yù)防或改善所述葡萄球菌感染的條件下向有需要的受試者施用根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子。
37.如權(quán)利要求36所述的方法,其進(jìn)一步包括:
選擇感染金黃色葡萄球菌或處于金黃色葡萄球菌感染的風(fēng)險中的受試者,其中所述結(jié)合分子施用于所述選擇的受試者。
38.如權(quán)利要求37所述的方法,其中所述金黃色葡萄球菌為耐甲氧西林金黃色葡萄球菌或甲氧西林敏感性金黃色葡萄球菌。
39.如權(quán)利要求36所述的方法,其進(jìn)一步包括:
重復(fù)所述施用。
40.如權(quán)利要求36所述的方法,其進(jìn)一步包括:
聯(lián)合所述結(jié)合分子施用一種或多種選自由抗感染劑、抗生素劑和抗微生物劑組成的組的試劑。
41.一種用于診斷受試者中的葡萄球菌感染的方法,所述方法包括:
使根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子與來自受試者的樣品接觸;
基于所述接觸檢測所述樣品中糖基化葡萄球菌表面蛋白和/或葡萄球菌白細(xì)胞毒素的存在或不存在;以及
基于所述檢測診斷所述受試者中的所述葡萄球菌感染。
42.一種用于檢測樣品中的葡萄球菌的方法,所述方法包括:
使根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子與所述樣品接觸;
基于所述接觸檢測所述樣品中糖基化葡萄球菌表面蛋白和/或葡萄球菌白細(xì)胞毒素的存在或不存在,由此所述糖基化葡萄球菌表面蛋白和/或葡萄球菌白細(xì)胞毒素的存在指示所述樣品中葡萄球菌的存在。
43.一種用于預(yù)防受試者中的葡萄球菌感染的方法,所述方法包括:
使根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子或根據(jù)權(quán)利要求33的方法制造的結(jié)合分子與來自所述受試者的樣品接觸;
基于所述接觸檢測所述樣品中的糖基化葡萄球菌表面蛋白和/或葡萄球菌白細(xì)胞毒素;以及
基于所述檢測向所述受試者施用適用于預(yù)防葡萄球菌感染的試劑。
44.一種包含如權(quán)利要求1至29中任一項所述的結(jié)合分子的試劑盒。
45.一種包含如權(quán)利要求30所述的核酸分子、如權(quán)利要求31所述的載體和/或如權(quán)利要求32所述的宿主細(xì)胞的試劑盒。