技術(shù)特征：

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種適用于電壓?門控鈉離子通道的結(jié)構(gòu)預(yù)測的方法，具體涉及一種基于模板構(gòu)建真核電壓?門控鈉離子通道Nav1.5孔道結(jié)構(gòu)域開放態(tài)的結(jié)構(gòu)模建方法。首先通過rosetta的膜蛋白同源模建方法，以獲得晶體三極結(jié)構(gòu)的細菌鈉離子通道模板，初步構(gòu)建組成Nav1.5孔道結(jié)構(gòu)域的四個亞基結(jié)構(gòu)；然后根據(jù)各個構(gòu)建模型的打分情況進行排序，挑選得分最高的結(jié)構(gòu)作為各個結(jié)構(gòu)域的初始結(jié)構(gòu)；然后利用將構(gòu)建完成的四個亞基結(jié)構(gòu)分別比對到4CBC的四個亞基上并對組裝完成的整體結(jié)構(gòu)進行優(yōu)化；以已有局部麻醉劑類藥物的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)和試驗數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，與優(yōu)化完的結(jié)構(gòu)進行分子對接，根據(jù)已有實驗結(jié)果設(shè)定篩選和評價策略，確定構(gòu)建模型的可靠性。

技術(shù)研發(fā)人員：紀(jì)曉峰;盛軍;鄭媛;王致鵬
受保護的技術(shù)使用者：中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所
技術(shù)研發(fā)日：2017.07.06
技術(shù)公布日：2017.10.13