技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及一種環(huán)狀RGD肽的虛擬篩選方法。步驟如下：(1)虛擬篩選過(guò)程：以RGD三肽為先導(dǎo)化合物，通過(guò)計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)軟件Surflex?dock，采用Hammerhead打分函數(shù)打分，從合成的現(xiàn)實(shí)角度出發(fā)，綜合靜電作用、范德華力、疏水作用和氫鍵進(jìn)行打分，根據(jù)打分結(jié)果排序，初步確定環(huán)狀RGD肽化合物；(2)對(duì)接過(guò)程：從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)PDB中下載編號(hào)1L5G蛋白，編號(hào)1L5G蛋白包括RGD肽和αvβ3，去除其中的RGD肽，將1L5G蛋白中剩余的αvβ3與步驟(1)中確定的環(huán)狀RGD肽進(jìn)行對(duì)接，篩選出打分高的六元環(huán)肽。本發(fā)明還提供一種上述環(huán)狀RGD肽，所述環(huán)狀RGD肽具有RGDfVK、RGDfKV、RGDKfV或RGDf(N?me)VK氨基酸序列。有益效果：通過(guò)本發(fā)明虛擬篩選方法得到的環(huán)狀RGD肽，與已知環(huán)肽相比具有較好的活性，與整合素受體親和力強(qiáng)。

技術(shù)研發(fā)人員：孫考祥;張雪梅;李學(xué)娟
受保護(hù)的技術(shù)使用者：煙臺(tái)大學(xué)
文檔號(hào)碼：201610164049
技術(shù)研發(fā)日：2016.03.22
技術(shù)公布日：2016.11.30