本發(fā)明屬于生物。具體地,涉及用于活動(dòng)性結(jié)核病篩查的風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、目前活動(dòng)性結(jié)核的篩查方法主要包括癥狀篩查和x-光胸片篩查,然而這些方法均存在一些缺陷:癥狀篩查靈敏度低,會(huì)遺漏50~60%的患者;x-光胸片篩查靈敏度高,但通量較低,一次只能檢測(cè)一位患者,且可及性差,在實(shí)地篩查中需要首先將受檢人群集中起來(lái)再統(tǒng)一檢測(cè)。基于結(jié)核菌dna的快速分子檢測(cè)方法也能夠用于結(jié)核病的篩查,但成本較高。而且基于痰液標(biāo)本,正常人沒(méi)有痰標(biāo)本,難以檢測(cè)。而基于血液的轉(zhuǎn)錄標(biāo)識(shí)物,其樣本容易獲取,具有快捷、簡(jiǎn)便、靈敏等優(yōu)勢(shì),能夠彌補(bǔ)現(xiàn)有篩查方法的缺陷。
2、xpert-mtb-hr-prototype作為唯一一個(gè)商品化的血液轉(zhuǎn)錄標(biāo)識(shí)物檢測(cè)試劑盒,對(duì)于結(jié)核病的檢測(cè)效果并不穩(wěn)定,在一些前瞻性研究隊(duì)列中能夠達(dá)到who制定的篩查標(biāo)準(zhǔn)(特異性70%,靈敏度90%),而在一些隊(duì)列中則達(dá)不到標(biāo)準(zhǔn)。其中,標(biāo)志物中的klf2基因在實(shí)際臨床評(píng)估中的表現(xiàn)與預(yù)期不符:該基因在結(jié)核患者中的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平被認(rèn)為會(huì)下降,但在在一些評(píng)估研究中,該基因在結(jié)核患者中的表達(dá)水平卻上升,即該基因在實(shí)際臨床檢測(cè)中的表達(dá)量存在與預(yù)期相反的情況。這是導(dǎo)致該標(biāo)識(shí)物檢測(cè)效果不佳的重要原因。
3、因此,現(xiàn)有標(biāo)識(shí)物(xpert-mtb-hr-prototype)鑒別活動(dòng)性結(jié)核的效果非常不穩(wěn)定,不能夠有效地對(duì)結(jié)核病進(jìn)行篩查。
4、因此,本領(lǐng)域迫切需要開(kāi)發(fā)出可準(zhǔn)確高效、且檢測(cè)效果穩(wěn)定的活動(dòng)性結(jié)核病篩查的方法及其應(yīng)用。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明提供了一種可準(zhǔn)確高效、且檢測(cè)效果穩(wěn)定的活動(dòng)性結(jié)核病篩查的方法及其應(yīng)用。
2、在本發(fā)明的第一方面,提供了一種活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、蛋白、或其檢測(cè)試劑的用途,用于制備一檢測(cè)試劑或試劑盒,所述檢測(cè)試劑或試劑盒用于判斷活動(dòng)性結(jié)核病的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn);
3、其中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:(a1)nxph4。
4、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括選自下組b的任一標(biāo)志物、或其組合:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
5、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括:(c1)klf2。
6、在另一優(yōu)選例中,所述的a1和b1-b12和c1標(biāo)志物選自表a:
7、表a
8、
9、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物表a所示的任一標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、或蛋白來(lái)源于人。
10、在另一優(yōu)選例中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:
11、(a1)nxph4;和
12、選自組b的一種或多種標(biāo)志物:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
13、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括(a1)nxph4和選自組b標(biāo)志物的至少2種。
14、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物選自下組:
15、(1)(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b10)lhfpl2;
16、(2)(b1)batf2;(b4)fcgr1a;和(c1)klf2。
17、在本發(fā)明另一個(gè)優(yōu)選的方面中,提供了一種活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、蛋白、或其檢測(cè)試劑的用途,用于制備一檢測(cè)試劑或試劑盒,所述檢測(cè)試劑或試劑盒用于判斷活動(dòng)性結(jié)核病的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn);
18、其中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:(b1)batf2;(b4)fcgr1a;和(c1)klf2。
19、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、或蛋白來(lái)源于人。
20、在另一優(yōu)選例中,所述檢測(cè)試劑或試劑盒用于檢測(cè)待測(cè)樣品中所述風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的表達(dá)水平。
21、在本發(fā)明的第二方面,提供了一種試劑盒,所述的試劑盒含有一檢測(cè)試劑,所述檢測(cè)試劑用于檢測(cè)活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、或蛋白、或其組合,
22、其中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:(a1)nxph4。
23、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括選自下組b的任一標(biāo)志物、或其組合:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
24、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括:(c1)klf2。
25、在另一優(yōu)選例中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:
26、(a1)nxph4;和
27、選自組b的一種或多種標(biāo)志物:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
28、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b10)lhfpl2。
29、在本發(fā)明另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方式中,提供了一種試劑盒,所述的試劑盒含有一檢測(cè)試劑,所述檢測(cè)試劑用于檢測(cè)活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna、或蛋白、或其組合,
30、其中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:(b1)batf2、(b4)fcgr1a和(c1)klf2。
31、在另一優(yōu)選例中,所述檢測(cè)試劑包括:
32、(a)針對(duì)所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的特異性抗體、特異性結(jié)合分子;和/或
33、(b)特異性擴(kuò)增所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的mrna或cdna的引物或引物對(duì)、探針或芯片(如核酸芯片或蛋白質(zhì)芯片)。
34、在另一優(yōu)選例中,待檢測(cè)的對(duì)象為人。
35、在另一優(yōu)選例中,待測(cè)對(duì)象為非活動(dòng)性結(jié)核病患者、活動(dòng)性結(jié)核病患者。
36、在另一優(yōu)選例中,所述檢測(cè)是針對(duì)離體樣本的檢測(cè)。
37、在另一優(yōu)選例中,所述的離體樣本包括:組織樣本、細(xì)胞樣本、血液樣本、血清樣本。
38、在另一優(yōu)選例中,所述的檢測(cè)試劑偶聯(lián)有或帶有可檢測(cè)標(biāo)記。
39、在另一優(yōu)選例中,所述可檢測(cè)標(biāo)記選自下組:生色團(tuán)、化學(xué)發(fā)光基團(tuán)、熒光團(tuán)、同位素或酶。
40、在另一優(yōu)選例中,所述的抗體是單克隆抗體或多克隆抗體。
41、在另一優(yōu)選例中,所述診斷(或檢測(cè))試劑包括抗體、引物、探針、測(cè)序文庫(kù)、核酸芯片(如dna芯片)或蛋白質(zhì)芯片。
42、在另一優(yōu)選例中,所述的核酸芯片包括基片和點(diǎn)樣在基片上的特異性寡核苷酸探針,所述的特異性寡核苷酸探針包括與任一所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的多核苷酸(mrna或cdna)特異性結(jié)合的探針。
43、在另一優(yōu)選例中,所述的蛋白質(zhì)芯片包括基片和點(diǎn)樣在基片上的特異性抗體,所述的特異性抗體包括抗所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的特異性抗體。
44、在另一優(yōu)選例中,所述的抗體是單克隆抗體或多克隆抗體。
45、在另一優(yōu)選例中,所述的試劑盒含有活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的基因、mrna、cdna和/或蛋白作為對(duì)照品或質(zhì)控品。
46、在另一優(yōu)選例中,所述的試劑盒還包括標(biāo)簽或說(shuō)明書,所述標(biāo)簽或說(shuō)明書注明所述試劑盒用于(a)判斷活動(dòng)性結(jié)核病的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn),和/或(b)對(duì)活動(dòng)性結(jié)核病治療效果進(jìn)行評(píng)價(jià)。
47、在另一優(yōu)選例中,所述的試劑包括引物、探針、grna或其組合,更佳地為用于pcr(例如,qpcr、rt-pcr)的引物對(duì)或探針。
48、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的檢測(cè)可通過(guò)如下的方法進(jìn)行檢測(cè):測(cè)序、pcr、或其組合。
49、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的檢測(cè)可定量檢測(cè)。
50、在本發(fā)明的第三方面,提供了一種檢測(cè)方法,包括步驟:
51、(a)提供一檢測(cè)樣本,所述檢測(cè)樣本選自血液樣本;
52、(b)檢測(cè)所述檢測(cè)樣本中活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物基因的表達(dá)量,記為c1;和
53、(c)將所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物濃度c1與對(duì)照參比值c0進(jìn)行比較;
54、其中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:
55、(a1)nxph4;或
56、(b1)batf2、(b4)fcgr1a和(c1)klf2。
57、當(dāng)所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括(a1)nxph4時(shí),如果檢測(cè)對(duì)象的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)的檢測(cè)結(jié)果滿足以下條件時(shí),則提示所述對(duì)象的活動(dòng)性結(jié)核病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)高:
58、(1)當(dāng)某一標(biāo)志物在檢測(cè)對(duì)象中是表a中上調(diào)的標(biāo)志物,且所述標(biāo)志物的表達(dá)水平高于參考值或標(biāo)準(zhǔn)值c0時(shí),所述檢測(cè)對(duì)象發(fā)生活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)高;
59、(2)當(dāng)某一標(biāo)志物在檢測(cè)對(duì)象中是表a中下調(diào)的標(biāo)志物,且所述標(biāo)志物的表達(dá)水平低于參考值或標(biāo)準(zhǔn)值c0時(shí),所述檢測(cè)對(duì)象發(fā)生活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)高。
60、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括選自下組b的任一標(biāo)志物、或其組合:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
61、在另一優(yōu)選例中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:
62、(a1)nxph4;和
63、選自組b的一種或多種標(biāo)志物:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
64、在另一優(yōu)選例中,所述方法是體外方法。
65、在另一優(yōu)選例中,所述方法是非診斷和非治療性的。
66、在本發(fā)明的第四方面,提供了一種活動(dòng)性結(jié)核病診斷設(shè)備,所述設(shè)備包括:
67、(a)輸入模塊,所述輸入模塊被配置為用于輸入某一對(duì)象血液樣本的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物數(shù)據(jù);
68、其中,所述的風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括:(a1)nxph4;
69、(b)處理模塊,所述處理模塊被配置為用于處理活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物數(shù)據(jù),并給出發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的評(píng)估結(jié)果;其中,所述處理包括:對(duì)于輸入的標(biāo)志物的表達(dá)水平c1與對(duì)照參比值c0進(jìn)行比較;
70、其中,若輸入的標(biāo)志物是表a中上調(diào)的標(biāo)志物,則當(dāng)c1顯著高于c0時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)高;當(dāng)c1不顯著高于c0時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)不高;若輸入的標(biāo)志物是表a中下調(diào)的標(biāo)志物,則當(dāng)c1顯著低于c0時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)高;當(dāng)c1不顯著低于c0時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)不高;和
71、(c)輸出模塊,所述輸出模塊被配置為用于輸出所述的評(píng)估結(jié)果。
72、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括選自下組b的任一標(biāo)志物、或其組合:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
73、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物還包括(c1)klf2。
74、在另一優(yōu)選例中,所述的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:
75、(a1)nxph4;和
76、選自組b的一種或多種標(biāo)志物:(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;(b12)c1qb。
77、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b10)lhfpl2。
78、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b4)fcgr1a;和(b8)gbp5。
79、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b4)fcgr1a。
80、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b4)fcgr1a。
81、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b4)fcgr1a;和(b12)c1qb。
82、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b4)fcgr1a。
83、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b12)c1qb。
84、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b10)lhfpl2。
85、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b8)gbp5。
86、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b11)etv7。
87、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b8)gbp5。
88、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b10)lhfpl2。
89、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b12)c1qb。
90、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b4)fcgr1a。
91、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b4)fcgr1a;和(b5)c1qc。
92、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b8)gbp5。
93、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b2)ankrd22。
94、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b5)c1qc。
95、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;和(b2)ankrd22。
96、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b3)serping1。
97、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b2)ankrd22;和(b11)etv7。
98、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b8)gbp5;和(b10)lhfpl2。
99、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b8)gbp5。
100、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b10)lhfpl2;和(b12)c1qb。
101、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b12)c1qb。
102、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b1)batf。
103、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b10)lhfpl2。
104、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf和(b5)c1qc。
105、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b8)gbp5;和(b11)etv7。
106、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b12)c1qb。
107、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf和(b3)serping1。
108、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b11)etv7;和(b12)c1qb。
109、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b10)lhfpl2;和(b11)etv7。
110、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b10)lhfpl2。
111、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b10)lhfpl2。
112、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b8)gbp5。
113、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b5)c1qc。
114、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b3)serping1。
115、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b12)c1qb。
116、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b3)serping1;和(b11)etv7。
117、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b5)c1qc;和(b11)etv7。
118、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b11)etv7。
119、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;和(b5)c1qc。
120、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(a1)nxph4;(b1)batf2;(b2)ankrd22;(b3)serping1;(b4)fcgr1a;(b5)c1qc;(b6)fcgr1bp;(b7)fcgr1cp;(b8)gbp5;(b9)septin4;(b10)lhfpl2;(b11)etv7;和(b12)c1qb。
121、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性肺結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(b1)batf2、(b4)fcgr1a和(c1)klf2。
122、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性肺結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(b4)fcgr1a、(b8)gbp5和(c1)klf2。
123、在另一優(yōu)選例中,所述活動(dòng)性肺結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物為:(b1)batf2、(b8)gbp5和(c1)klf2。
124、在本發(fā)明另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方式中,提供了一種活動(dòng)性結(jié)核病評(píng)估設(shè)備,所述設(shè)備包括:
125、(a)輸入模塊,所述輸入模塊被配置為用于輸入某一對(duì)象血液樣本的活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物數(shù)據(jù);
126、其中,所述的風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物包括選自下組的標(biāo)志物(組合):
127、(b1)batf2、(b4)fcgr1a和(c1)klf2;
128、(a1)nxph4;(b5)c1qc和(b10)lhfpl2;
129、(b)處理模塊,所述處理模塊被配置為用于處理活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物數(shù)據(jù),并給出發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的評(píng)估結(jié)果;
130、其中,所述處理包括:對(duì)輸入的標(biāo)志物基因按照既定的打分公式進(jìn)行計(jì)算,獲得風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分;并將所述評(píng)分與截點(diǎn)值進(jìn)行比較,從而獲得判別結(jié)果;其中,當(dāng)所述風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分高于所述截點(diǎn)值時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)高;當(dāng)所述風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分低于所述截點(diǎn)值時(shí),則提示該對(duì)象活動(dòng)性結(jié)核病風(fēng)險(xiǎn)低;和
131、(c)輸出模塊,所述輸出模塊被配置為用于輸出所述的評(píng)估結(jié)果;
132、其中,所述風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分公式為:tb分?jǐn)?shù)=上調(diào)基因的平均ct-下調(diào)基因的平均ct。
133、在另一優(yōu)選例中,所述風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分為:tb分?jǐn)?shù)=(batf2+fcgr1a)/2-klf2;其中,公式中batf2、fcgr1a和klf2分別指的是batf2、fcgr1a和klf2的ct值。
134、在另一優(yōu)選例中,所述風(fēng)險(xiǎn)度評(píng)分為:tb分?jǐn)?shù)=(c1qc+lhfpl2)/2-nxph4;其中,公式中c1qc、lhfpl2和nxph4分別指的是c1qc、lhfpl2和nxph4的ct值。
135、在另一優(yōu)選例中,所述設(shè)備還包括檢測(cè)模塊,所述檢測(cè)模塊被配置為用于檢測(cè)所述風(fēng)險(xiǎn)標(biāo)志物的轉(zhuǎn)錄或表達(dá)水平。
136、在另一優(yōu)選例中,所述設(shè)備還包括存儲(chǔ)模塊,所述存儲(chǔ)模塊被配置為用于存儲(chǔ)預(yù)先設(shè)定的標(biāo)志物的閾值和比較結(jié)果值。
137、在另一優(yōu)選例中,所述設(shè)備還包括控制模塊,所述控制模塊被配置為控制各模塊的運(yùn)行。
138、在另一優(yōu)選例中,所述檢測(cè)模塊選自下組:elisa分析儀、pcr測(cè)序儀、測(cè)序儀、或其組合。
139、應(yīng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi)中,本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實(shí)施例)中具體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在此不再一一累述。