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一種確定最佳SNP數(shù)量及其通過(guò)篩選標(biāo)記對(duì)大黃魚(yú)生產(chǎn)性能進(jìn)行基因組選擇育種的方法與流程

文檔序號(hào):12900752閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了一種確定最佳SNP數(shù)量及通過(guò)篩選標(biāo)記對(duì)大黃魚(yú)生產(chǎn)性能進(jìn)行基因組選擇育種的方法。先對(duì)參考群個(gè)體進(jìn)行生產(chǎn)性能的表型測(cè)定和基因組測(cè)序,獲得SNP位點(diǎn);篩選出合格的SNP位點(diǎn),并將缺失的基因型補(bǔ)齊;將參考群分為訓(xùn)練集和驗(yàn)證集進(jìn)行雜交驗(yàn)證;通過(guò)單標(biāo)記分析篩選與性狀最顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),然后只使用這些位點(diǎn)通過(guò)GBLUP方法計(jì)算驗(yàn)證集個(gè)體的GEBV;進(jìn)一步得到各個(gè)篩選SNP數(shù)量下的育種值估計(jì)準(zhǔn)確度;最后確定SNP篩選的最佳數(shù)量。再根據(jù)該最佳數(shù)量,通過(guò)GBLUP方法計(jì)算出GEBV,進(jìn)一步得到育種值估計(jì)準(zhǔn)確度,根據(jù)該值的高低進(jìn)行基因組選擇育種。本發(fā)明可顯著節(jié)省對(duì)大黃魚(yú)生產(chǎn)性能的基因組選擇費(fèi)用。

技術(shù)研發(fā)人員:王志勇;董林松;肖世俊
受保護(hù)的技術(shù)使用者:集美大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:2017.08.29
技術(shù)公布日:2017.11.10
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