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一種非甲醇誘導(dǎo)生產(chǎn)抗菌肽的方法與流程

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一種非甲醇誘導(dǎo)生產(chǎn)抗菌肽的方法與流程

本發(fā)明涉及生物工程和生物制藥技術(shù)領(lǐng)域,更具體地,涉及一種使用無(wú)毒誘導(dǎo)物來(lái)誘導(dǎo)改良石斑魚(yú)抗菌肽pisl9k22wk在粉紅畢赤酵母(pichiapink)高效表達(dá)的方法。



背景技術(shù):

抗菌肽(amp)是生物體內(nèi)帶正電荷、富含陽(yáng)離子和具有兩親性結(jié)構(gòu)的小分子多肽,主要特點(diǎn)如下:抗菌活性高,抗菌譜廣,種類(lèi)多,對(duì)細(xì)菌不易產(chǎn)生耐藥性,進(jìn)入機(jī)體后代謝速度快,不易在機(jī)體產(chǎn)生有害殘留,而且對(duì)真菌、病毒、原生動(dòng)物甚至腫瘤都具有殺傷作用或抑制作用。由于其突出的生物學(xué)特性,最有潛力作為型新安全無(wú)害抗生素替代品,從而備受科學(xué)界關(guān)注,但是抗菌肽的天然提取或者化學(xué)合成的成本過(guò)高,造成抗菌肽產(chǎn)品的價(jià)格昂貴,無(wú)法在實(shí)際生產(chǎn)中大規(guī)模應(yīng)用。

pisl9k22wk是以馬拉巴石斑魚(yú)多肽piscidin為基礎(chǔ)的改良抗菌肽(如申請(qǐng)201410545484.8中公開(kāi)),相比于改造前,pisl9k22wk的溶血活性降低,細(xì)胞毒性減少,而抗菌活性基本保持不變,具有更優(yōu)良的臨床應(yīng)用價(jià)值,是一種最具潛力的臨床的抗生素替代藥物。

利用畢赤酵母生產(chǎn)抗菌肽是降低抗菌肽產(chǎn)品成本的重要途徑,畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)具有其它表達(dá)系統(tǒng)不可比擬的優(yōu)勢(shì),如畢赤酵母基因操作簡(jiǎn)單;外源蛋白表達(dá)量高,既可以胞內(nèi)表達(dá),也可以分泌表達(dá);外源蛋白基因遺傳穩(wěn)定,另外,作為真核表達(dá)系統(tǒng),畢赤酵母具有糖基化、脂肪酰化、蛋白磷酸化等翻譯后修飾加工功能。

粉紅畢赤酵母(pichiapink)表達(dá)系統(tǒng)是基于巴斯德畢赤酵母的真核生物蛋白表達(dá)系統(tǒng),可用于外源蛋白的高產(chǎn)量及大規(guī)模生產(chǎn)。該系統(tǒng)除了具有巴斯德畢赤酵母的優(yōu)點(diǎn)外,還有以下特點(diǎn):ade2基因缺失型標(biāo)記利于表達(dá)克隆的篩選,只有整合ade2基因標(biāo)記的多克隆拷貝的轉(zhuǎn)化子才能在缺乏腺嘌呤的培養(yǎng)基中生長(zhǎng),轉(zhuǎn)化子的顏色與目的基因的表達(dá)量直接相關(guān);

但是目前的畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)在發(fā)酵放大過(guò)程中面臨諸多的問(wèn)題:誘導(dǎo)外源重組蛋白表達(dá)時(shí)需使用甲醇作為碳源,甲醇有毒,不適于用于食品或者添加劑的生產(chǎn),并且易燃易爆易揮發(fā),在工業(yè)化生產(chǎn)中車(chē)間需進(jìn)行防暴設(shè)計(jì),導(dǎo)致成本增大;甲醇發(fā)酵強(qiáng)耗氧,一般靠增大空氣的通氣量和提高轉(zhuǎn)速很難滿(mǎn)足氧氣的需求,因此需要通很多純氧,給工業(yè)化生產(chǎn)帶來(lái)不便,另外消耗的甲醇越多所產(chǎn)的熱量也越大,所需設(shè)備的冷卻能力要求越高;畢赤酵母aox1啟動(dòng)子的高效轉(zhuǎn)錄離不開(kāi)甲醇,在其它碳源中遭受碳源阻遏作用。

這些問(wèn)題導(dǎo)致抗菌肽在畢赤酵母中的表達(dá)效果差,更重要的是利用甲醇誘導(dǎo)表達(dá)的抗菌肽產(chǎn)品中存留甲醇,甲醇毒性使這種抗菌肽產(chǎn)品無(wú)法在食品、飼料和醫(yī)藥領(lǐng)域中應(yīng)用。因此,通過(guò)基因工程手段,開(kāi)發(fā)一種非甲醇誘導(dǎo)生產(chǎn)抗菌肽的方法有重要的應(yīng)用價(jià)值。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的是提供一種能利用氯化膽堿誘導(dǎo)的改良石斑魚(yú)抗菌肽pisl9k22wk的酵母表達(dá)載體及工程菌構(gòu)建方法,抗菌肽發(fā)酵制備pisl9k22wk方法及應(yīng)用,本發(fā)明的酵母菌及表達(dá)產(chǎn)物可以用于表達(dá)醫(yī)藥與食品級(jí)抗菌肽,安全環(huán)保,操作簡(jiǎn)單,適于大規(guī)模推廣應(yīng)用。

本發(fā)明采用的技術(shù)方案如下:

首先,構(gòu)建改良石斑魚(yú)抗菌肽pisl9k22wk的畢赤酵母胞內(nèi)表達(dá)載體,包括如下步驟:

1)克隆畢赤酵母fld1啟動(dòng)子基因;

提取畢赤酵母全基因組,以全基因組為模板,以seqidno.4和seqidno.5為引物對(duì)fld1啟動(dòng)子基因進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得seqidno.1;

2)克隆石斑魚(yú)抗菌肽基因pisl9k22wk;

將seqidno.1連接t載體,得到fld-t,以fld-t為模板,以seqidno.4和seqidno.6為引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,將得到的pcr產(chǎn)物作為模板,以seqidno.4和seqidno.7為引物再次進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得fldpis如seqidno.9所示。編碼抗菌肽pisl9k22wk的氨基酸序列如seqidno.2所示。編碼抗菌肽pisl9k22wk的dna序列是按照酵母所偏愛(ài)的密碼子進(jìn)行優(yōu)化的序列,具有如seqidno.3所示的核苷酸序列;

3)將畢赤酵母表達(dá)載體ppinklc采用bglii和kpni雙酶切去除醇氧化酶啟動(dòng)子,與seqidno.9采用bglii和kpni雙酶切后的片段連接,獲得表達(dá)載體fplc。

改良石斑魚(yú)抗菌肽pisl9k22wk的畢赤酵母胞內(nèi)表達(dá)載體的應(yīng)用,構(gòu)建所述抗菌肽pisl9k22wk工程菌包括以下步驟:

1)采用spei酶酶切表達(dá)載體fplc,獲得線性化載體;

2)通過(guò)電轉(zhuǎn)化的方法將線性化載體轉(zhuǎn)入粉紅畢赤酵母(pichiapink)中,電轉(zhuǎn)化的參數(shù)為1000-2000v,3-6ms;進(jìn)一步電轉(zhuǎn)化的參數(shù)優(yōu)選為1500v,5ms;

3)通過(guò)缺腺嘌呤的pad培養(yǎng)基篩選粉紅畢赤酵母(pichiapink)轉(zhuǎn)化子,經(jīng)過(guò)3-7天培養(yǎng)后從白色的轉(zhuǎn)化子中進(jìn)一步篩選出表達(dá)pisl9k22wk基因的工程菌。

本發(fā)明還提供含有上述表達(dá)載體的宿主細(xì)胞。所述宿主細(xì)胞優(yōu)選為畢赤酵母,更優(yōu)選為pichiapink酵母。

本發(fā)明還提供培養(yǎng)上述抗菌肽pisl9k22wk工程菌的方法,包括以下步驟:

1)種子液的制備:從ypd平板挑取抗菌肽pisl9k22wk工程菌單菌落,接種于5-10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rmp,搖床培養(yǎng)18-24h,獲得發(fā)酵種子液;

2)發(fā)酵培養(yǎng):以1%-5%(v/v)接種量接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rmp,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm(轉(zhuǎn)/分),搖床培養(yǎng)24h-48h,待發(fā)酵液od600的吸光度在2.0左右;

3)山梨醇/氯化膽堿補(bǔ)加:每24h,補(bǔ)加誘導(dǎo)物氯化膽堿1%-5%(w/v)和碳源山梨醇0.5%-5%(w/v)。

本發(fā)明進(jìn)一步提供一種在畢赤酵母中表達(dá)抗菌肽pisl9k22wk的方法,其是利用上述表達(dá)載體fplc轉(zhuǎn)化pichiapink酵母,獲得抗菌肽pisl9k22wk工程菌,發(fā)酵培養(yǎng)后胞內(nèi)產(chǎn)生抗菌肽pisl9k22wk。

本發(fā)明通過(guò)優(yōu)化抗菌肽pisl9k22wk基因序列,構(gòu)建特異表達(dá)載體,首次實(shí)現(xiàn)了抗菌肽pisl9k22wk在pichiapink酵母中的高效表達(dá),克服了大規(guī)模生產(chǎn)中產(chǎn)量過(guò)低或化學(xué)合成成本過(guò)高的問(wèn)題。本發(fā)明得到的表達(dá)系統(tǒng),能通過(guò)在誘導(dǎo)過(guò)程中添加氯化膽堿和山梨醇,有效誘導(dǎo)外源基因的表達(dá),且目標(biāo)蛋白表達(dá)量與表達(dá)活性方面比采用甲醇誘導(dǎo)更好。

本發(fā)明有效避免通常采用甲醇帶來(lái)的一系列問(wèn)題,如甲醇易燃易爆易揮發(fā)的特性,使得誘導(dǎo)過(guò)程中難于控制其濃度,且存在巨大的安全隱患,特別是以甲醇誘導(dǎo)生產(chǎn)的藥品與食品據(jù)美國(guó)fda標(biāo)準(zhǔn)被認(rèn)為是不安全的。本發(fā)明表達(dá)的抗菌肽可實(shí)現(xiàn)規(guī)?;a(chǎn),可應(yīng)用于抗菌藥物開(kāi)發(fā),飼料添加劑開(kāi)發(fā)等領(lǐng)域,具有廣闊的應(yīng)用價(jià)值和市場(chǎng)前景。

附圖說(shuō)明

圖1為實(shí)例1中pcr法擴(kuò)增fld1啟動(dòng)子的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)果;

圖2所示為pcr產(chǎn)物經(jīng)2.5%瓊脂糖凝膠電泳的檢測(cè)結(jié)果;

圖3為實(shí)例2中大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子鑒定結(jié)果;

圖4為實(shí)例3中表達(dá)載體fplc經(jīng)spei酶切線性化的電泳結(jié)果;

圖5為實(shí)例3中重組酵母轉(zhuǎn)化子的pcr鑒定結(jié)果;

圖6為實(shí)例4中重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清的瓊脂糖孔穴擴(kuò)散法抑菌結(jié)果;

圖7為實(shí)例5中不同濃度氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌搖瓶水平發(fā)酵96h后,收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清的od抑菌法第24h抑菌結(jié)果;

圖8為實(shí)例5中空載體畢赤酵母菌株和重組酵母轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清經(jīng)過(guò)70℃分別處理5min、25min和45min后離心得到的上清od法抑菌第8h結(jié)果;

圖9為實(shí)例5中為空載體畢赤酵母菌株和重組酵母轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清經(jīng)過(guò)100℃分別處理5min、25min和45min后離心得到的上清od法抑菌第8h結(jié)果;

圖10為實(shí)例6中抗菌肽pisl9k22wk工程菌搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清od法抑菌實(shí)驗(yàn)結(jié)果;

圖11為實(shí)例6中重組酵母菌株96h誘導(dǎo)搖瓶水平發(fā)酵后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清tricine-sds-page電泳檢測(cè)結(jié)果。

具體實(shí)施方式

以下實(shí)施例用于說(shuō)明本發(fā)明,但不用來(lái)限制本發(fā)明的范圍,若未特別指明,實(shí)施例均按照常規(guī)實(shí)驗(yàn)條件。

以下實(shí)施例中使用的酶和試劑:限制性?xún)?nèi)切酶spei、限制性?xún)?nèi)切酶stui、bglii、kpni、t4dna連接酶等分別購(gòu)自takara、invitrogen和北京全式金生物技術(shù)(transgenbiotech)有限公司。

小分子量蛋白預(yù)染marker:spectratmmulticolorlowrangeproteinladder(#sm1861),購(gòu)自fermentas生物技術(shù)有限公司。

10×tris-tticine緩沖液、丙烯酰胺/甲叉雙丙烯酰胺(29:1)、丙烯酰胺/甲叉雙丙烯酰胺(19:1)、temed、購(gòu)自上海生工生物有限公司;其它常規(guī)試劑采用進(jìn)口分裝或國(guó)產(chǎn)分析純。

以下實(shí)施例中涉及的培養(yǎng)基配方:

lb培養(yǎng)基:胰蛋白胨10g/l,酵母浸提取物5g/l,nacl10g/l;固體lb培養(yǎng)基則加入1.5%(w/v)的瓊脂粉。

pad培養(yǎng)基(/l):8g粉狀pad培養(yǎng)基,950ml去離子水,用naoh調(diào)ph至6.0-6.5左右,加入20g瓊脂粉,高壓滅菌后再加入50ml40%無(wú)菌葡萄糖。ypd培養(yǎng)基:蛋白胨20g/l,酵母浸提取物10g/l,葡萄糖20g/l;固體ypd培養(yǎng)基則加入2%(w/v)瓊脂粉。

發(fā)酵培養(yǎng)基:1%-5%(w/v)酵母提取物,1%-10%(w/v)蛋白胨,100-500mm磷酸鉀緩沖液(ph6.0),0.5%-5%(w/v)ynb,4×10-5生物素,0.5%-5%山梨醇。

優(yōu)選的發(fā)酵培養(yǎng)基:1%(w/v)酵母提取物,2%(w/v)蛋白胨,100mm磷酸鉀緩沖液(ph6.0),1.34%(w/v)ynb,4×10-5生物素,1%(w/v)山梨醇。

有關(guān)lb培養(yǎng)基、pad、ypd等培養(yǎng)基的使用參照invitrogen畢赤酵母操作手冊(cè)。

以下實(shí)施例中涉及的基因擴(kuò)增及轉(zhuǎn)化子鑒定方法為pcr法及dna測(cè)序法。

以下實(shí)施例中涉及的蛋白檢測(cè)方法為tricine-sds-page。

以下實(shí)施例中涉及的菌種和質(zhì)粒概述于表1:

表1供試菌種和質(zhì)粒:

實(shí)例1fld1啟動(dòng)子的擴(kuò)增和pisl9k22wk基因表達(dá)框的構(gòu)建

根據(jù)抗菌肽pisl9k22wk的aa序列,設(shè)計(jì)抗菌肽pisl9k22wk編碼基因,通過(guò)密碼子優(yōu)化后dna序列如下:

atgttcttcttccacatcatcaagggtaagttccacgctggtagaatgatccacggtttggtctggaagtaa(seqidno.3)

pcr擴(kuò)增fld1啟動(dòng)子和pisl9k22wk基因表達(dá)框

fld5bz(seqidno.4):5′-gcgagatctgcatgcaggaatctctgg-3′;

fld3hz(seqidno.5):5′-gcggaattctgtgaatatcaagaattgtatgaacaagc-3′;

pis3r(seqidno.6):

5′-ccagcgtggaatttgcctttgattatatgaaagaagaacataggccttgtgaatatcaa-3′;

pis3r-pis(seqidno.7):5′-aatagtggtacctcattatttccagaccaaaccatgaatcatcctaccagcgtggaatttgcct-3′;

以酵母基因組為模板,反應(yīng)體系如下:

pcr反應(yīng)體系如下:

反應(yīng)條件如下:

將得到的pcr產(chǎn)物連接t載體,得到fld-t,以fld-t為模板,以seqidno.4和seqidno.6為引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增:

反應(yīng)條件如下:

將得到的pcr產(chǎn)物,以seqidno.4和seqidno.7為引物再次進(jìn)行pcr擴(kuò)增。

反應(yīng)條件如下:

pcr產(chǎn)物經(jīng)2.5%瓊脂糖凝膠電泳后切膠回收試劑盒進(jìn)行回收,得到fld1啟動(dòng)子和pisl9k22wk基因表達(dá)框,連接t-vector,得到fldpis-t,轉(zhuǎn)化e.colidh5α。

圖1為實(shí)例1中pcr法擴(kuò)增fld1啟動(dòng)子的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)果;其中,m:5000bpdnamarker,上樣量為5μl;1:以fld5bz(seqidno.4)、fld3hz(seqidno.5)為引物,畢赤酵母全基因組為模板的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物,上樣量為50μl;

圖2為實(shí)例1中pcr法擴(kuò)增得到seqidno.9的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)果;其中,m:5000bpdnamarker,上樣量為5μl;1:以fld5bz(seqidno.4)、pis3r-pis(seqidno.7)為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,上樣量為50μl。

實(shí)施例2抗菌肽pisl9k22wk的畢赤酵母胞內(nèi)表達(dá)載體的構(gòu)建

2.1將實(shí)施例1獲得fldpis-t,經(jīng)bglii和kpni核酸內(nèi)切酶雙酶切。同時(shí),用bglii和kpni雙酶切ppinklc載體(購(gòu)自invitrogen)。

雙酶切體系如下:

酶切條件:37℃水浴1h。

酶切產(chǎn)物用切膠回收試劑盒回收(購(gòu)自takara),-20℃保存?zhèn)溆?,fldpis-t和ppinklc載體均經(jīng)過(guò)bglii和kpni雙酶切0后,用t4dna連接酶進(jìn)行連接。

連接體系如下:

連接條件:22℃,1h;16℃,1h;4℃過(guò)夜。

2.2將獲得的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到大腸桿菌dh5α中:取出-80℃冷凍保存大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞100μl,立即置于冰上,加入10μl連接產(chǎn)物,輕輕混勻,冰浴30min,迅速置于42℃水浴鍋熱激90s,快速置于冰上冰浴2min。向每個(gè)離心管中加入500μllb培養(yǎng)基(不含抗生素),混勻,37℃,200rpm培養(yǎng)1h。4000rpm離心1min,去掉部分上清,留下約100μllb培養(yǎng)基,重懸菌體,將重懸后的菌液涂布在含有amp的lb固體平板上,37℃,倒置培養(yǎng),16h。

2.3大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子鑒定

挑取在lb平板上長(zhǎng)出的單菌落,通過(guò)菌落pcr鑒定大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子。挑取經(jīng)引物fld5bz(seqidno.4)和引物pis3r-pis(seqidno.7)驗(yàn)證的大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子接種于5mllb液體培養(yǎng)基中(含5μlamp),37℃,200rpm過(guò)夜培養(yǎng),送廣州艾基生物技術(shù)有限公司測(cè)序,與設(shè)計(jì)基因序列進(jìn)行比對(duì),從dna水平上驗(yàn)證外源基因插入是否完全正確。

2.3.1引物檢測(cè)

fld5bz(seqidno.4):5′-gcgagatctgcatgcaggaatctctgg-3′

pis3r-pis(seqidno.7):5′-aatagtggtacctcattatttccagaccaaaccatgaatcatcctaccagcgtggaatttgcct-3′

菌落pcr反應(yīng)體系如下:

pcr反應(yīng)條件如下:

pcr產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)目的條帶(圖3),圖3為實(shí)例2中大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子鑒定結(jié)果:其中轉(zhuǎn)化子pcr產(chǎn)物點(diǎn)樣量為10μl;m:5000bpdnamarker;測(cè)序結(jié)果表明,pisl9k22wk基因片段插入位點(diǎn)、方向及序列完全正確,與設(shè)計(jì)相符。成功得到抗菌肽pisl9k22wk的畢赤酵母胞內(nèi)表達(dá)載體fplc。

2.3.2表達(dá)載體fplc的提取:挑取鑒定正確的大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,接種于10ml含10μlamp抗生素的lb液體培養(yǎng)基,37℃,200rpm過(guò)夜培養(yǎng)。采用質(zhì)粒提取試劑盒提取大腸桿菌dh5α陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子中的表達(dá)載體fplc。

實(shí)施例3pisl9k22wk工程菌的構(gòu)建

3.1表達(dá)載體fplc的線性化

將實(shí)施例2中獲得的表達(dá)載體fplc用spei核酸內(nèi)切酶線性化后用于pichiapink酵母轉(zhuǎn)化。

線性化體系如下:

反應(yīng)條件:37℃,14h。

圖4為實(shí)例3中表達(dá)載體fplc經(jīng)spei酶切線性化的電泳結(jié)果:其中,m:1kbdnamarker,點(diǎn)樣量為5μl;1:沒(méi)有被線性化的表達(dá)載體fplc,點(diǎn)樣量為10μl;2:線性化的表達(dá)載體fplc,上樣量為10μl;電泳結(jié)果(圖4)顯示:抗菌肽pisl9k22wk的表達(dá)載體fplc完全線性化。

3.2pichiapink酵母感受態(tài)細(xì)胞的制備

挑取pichiapink酵母(購(gòu)自invitrogen)單菌落接種至10mlypd培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rmp,搖床培養(yǎng)過(guò)夜,1%-5%(v/v)的接種量接種pichiapink酵母過(guò)夜培養(yǎng)物至50mlypd培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rmp,搖床培養(yǎng)至od600nm=1.2-1.5,4℃,5000xg,離心5min,去上清液,50ml冰預(yù)冷的無(wú)菌水洗2次,10ml冰預(yù)冷的1m山梨醇洗一次,4℃,5000xg,離心5min,去上清液,加200-400μl冰預(yù)冷的1m山梨醇重懸菌體,分裝80μl/管用于電轉(zhuǎn)化。

3.3電轉(zhuǎn)化

向80μlpichiapink酵母感受態(tài)細(xì)胞中加入5-10μg線性化的質(zhì)粒溶于10μlddh2o,輕輕混勻,轉(zhuǎn)至冰預(yù)冷的電轉(zhuǎn)杯中,冰上放置5min,電轉(zhuǎn)化,參數(shù)為1000-2000v,3-6ms。電轉(zhuǎn)后立即加入1ml冰預(yù)冷的1m山梨醇溶液,混勻后轉(zhuǎn)入1.5ml離心管中,30℃,溫育2-4h,4000xg,離心1min,去掉部分上清,留下約100μl上清重懸菌體,將重懸后的菌液涂布在pad平板上,30℃倒置培養(yǎng),直至長(zhǎng)出單菌落。

3.4含有pisl9k22wk基因的重組酵母轉(zhuǎn)化子鑒定

pcr方法鑒定重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子:挑取白色的重組酵母轉(zhuǎn)化子進(jìn)行鑒定,以白色的重組酵母轉(zhuǎn)化子基因組作為模板,以引物:fld5bz(seqidno.4):5′-gcgagatctgcatgcaggaatctctgg-3′;引物cyc13rrr(seqidno.8):gcataggctagtgaagagtcaagtcgc進(jìn)行pcr鑒定;

pcr反應(yīng)體系如下:

pcr反應(yīng)條件如下:

圖5為實(shí)例3中重組酵母轉(zhuǎn)化子的pcr鑒定結(jié)果;其中,m:2000bpdnamarker;1:陽(yáng)性對(duì)照,2-14:重組酵母轉(zhuǎn)化子;pcr鑒定結(jié)果(圖5)表明:在1000bp處出現(xiàn)條帶,與設(shè)計(jì)產(chǎn)物長(zhǎng)度相符,故得到多個(gè)重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,可用于后續(xù)的誘導(dǎo)表達(dá)。

實(shí)施例4搖瓶發(fā)酵篩選高效表達(dá)抗菌肽pisl9k22wk的工程菌

挑取實(shí)施例3中鑒定得到的重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,接種于10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rpm培養(yǎng)18-24h,篩選出在搖瓶中呈現(xiàn)白色的重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子,以1%-5%(v/v)接種量接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rpm,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm,搖床培養(yǎng)至od600nm約2.0,此時(shí)計(jì)為初始誘導(dǎo)0h,隨后,每24h加甲醇至終濃度1%,誘導(dǎo)96h,12000rpm離心10min,棄上清液,收集沉淀,1xpbs洗2次,50mlpbs重懸沉淀,經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,12000rpm離心10min收集破碎液上清,沉淀存于﹣80℃。

使用抑菌圈法來(lái)檢測(cè)重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子的總蛋白抑菌活性。s.aureusatcc25923作為受試菌。挑取s.aureusatcc25923單菌落接種于10mllb培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)過(guò)夜,取200μl過(guò)夜培養(yǎng)物接至20ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,37℃200rpm,培養(yǎng)至od600nm=0.6,取培養(yǎng)液按1:1000的比例加入到未凝固的含1%瓊脂的培養(yǎng)基中(大約5×105cfu/ml),搖勻,傾倒至空平板上。待平板凝固后,用無(wú)菌槍頭在平板中央打孔。向平板中央上樣孔內(nèi)加入總量約為100μg重組酵母總蛋白,對(duì)照組則加入2.5μg氨芐青霉素。上樣后,平板于4℃水平放置30min,隨后置于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)9-12h。

圖6為實(shí)例4中重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清的瓊脂糖孔穴擴(kuò)散法抑菌結(jié)果;其中,s.aureusatcc25923作為受試菌。1:空載體破碎液上清100μl上樣量;2-7:重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子破碎液上清100μl上樣量(約100μg);8:20μl的氨芐青霉素(約2.5μg);

抑菌圈實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖6)表明:重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子均有抑菌活性,而對(duì)照空載體沒(méi)有抑菌活性,陽(yáng)性對(duì)照(8)amp有抗菌活性。將pisl9k22wk表達(dá)量高的重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子作為抗菌肽pisl9k22wk工程菌。

實(shí)施例5氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌的誘導(dǎo)條件優(yōu)化。

5.1抗菌肽pisl9k22wk的誘導(dǎo)表達(dá)條件優(yōu)化

5.1.11%(w/v)氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌發(fā)酵

挑取抗菌肽pisl9k22wk工程菌接種于10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rpm培養(yǎng)18-24h,以1%-5%(v/v)接種量接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rpm,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm,搖床培養(yǎng)至od600的吸光度在2.0左右,此時(shí)計(jì)為初始誘導(dǎo)0h,隨后從第24h開(kāi)始每24h補(bǔ)加氯化膽堿和山梨醇,山梨醇補(bǔ)加量為1.89%(w/v),氯化膽堿補(bǔ)加量為1%(w/v),誘導(dǎo)96h。

使用od抑菌法檢測(cè)抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白抑菌活性。e.colitop10作為受試菌。挑取e.colitop10單菌落接種于20mllb培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)過(guò)夜,取200μl過(guò)夜培養(yǎng)物接至20ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,37℃200rpm,培養(yǎng)至od600nm=0.3,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到5×107cfu/ml,取菌液30μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×106cfu/ml,取菌液(1×106cfu/ml)150μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×105cfu/ml,取菌液(1×105cfu/ml)100μl加入96孔板,將100μl抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白加入含有100μl菌液的96孔板。每隔2h、4h、8h、12h、20h、24h測(cè)量od600。

圖7為實(shí)例5中不同濃度氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌搖瓶水平發(fā)酵96h后,收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清的od抑菌法第24h抑菌結(jié)果;如圖7所示,結(jié)果表明氯化膽堿補(bǔ)加量為1%(w/v)時(shí),有良好的抑菌效果。

圖8為實(shí)例5中空載體畢赤酵母菌株和重組酵母轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清經(jīng)過(guò)70℃分別處理5min、25min和45min后離心得到的上清od法抑菌第8h結(jié)果,其中s.aureusatcc25923作為受試菌。

圖9為實(shí)例5中為空載體畢赤酵母菌株和重組酵母轉(zhuǎn)化子搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清經(jīng)過(guò)100℃分別處理5min、25min和45min后離心得到的上清od法抑菌第8h結(jié)果,其中s.aureusatcc25923作為受試菌;

5.1.22%(w/v)氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌發(fā)酵

挑取抗菌肽pisl9k22wk工程菌接種于10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rpm培養(yǎng)18-24h,以1%-5%(v/v)接種量接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rpm,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm,搖床培養(yǎng)至od600的吸光度在2.0左右,此時(shí)計(jì)為初始誘導(dǎo)0h,隨后從第24h開(kāi)始每24h補(bǔ)加氯化膽堿和山梨醇,山梨醇補(bǔ)加量為1.89%(w/v),氯化膽堿補(bǔ)加量為2%(w/v),誘導(dǎo)96h。

使用od抑菌法檢測(cè)抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白抑菌活性。e.colitop10作為受試菌。挑取e.colitop10單菌落接種于20mllb培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)過(guò)夜,取200μl過(guò)夜培養(yǎng)物接至20ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,37℃200rpm,培養(yǎng)至od600nm=0.3,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到5×107cfu/ml,取菌液30μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×106cfu/ml,取菌液(1×106cfu/ml)150μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×105cfu/ml,取菌液(1×105cfu/ml)100μl加入96孔板,將100μl抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白加入含有100μl菌液的96孔板。每隔2h、4h、8h、12h、20h、24h測(cè)量od600。

第24hod抑菌法結(jié)果如圖7所示,結(jié)果表明氯化膽堿補(bǔ)加量為2%(w/v)時(shí),有良好的抑菌效果。

5.1.35%(w/v)氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌發(fā)酵

挑取抗菌肽pisl9k22wk工程菌接種于10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rpm培養(yǎng)18-24h,以1%-5%(v/v)接種量接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rpm,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm,搖床培養(yǎng)至od600的吸光度在2.0左右,此時(shí)計(jì)為初始誘導(dǎo)0h,隨后從第24h開(kāi)始每24h補(bǔ)加氯化膽堿和山梨醇,山梨醇補(bǔ)加量為1.89%(w/v),氯化膽堿補(bǔ)加量為5%(w/v),誘導(dǎo)96h。

使用od抑菌法檢測(cè)抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白抑菌活性。e.colitop10作為受試菌。挑取e.colitop10單菌落接種于20mllb培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)過(guò)夜,取200μl過(guò)夜培養(yǎng)物接至20ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,37℃200rpm,培養(yǎng)至od600nm=0.3,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到5×107cfu/ml,取菌液30μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×106cfu/ml,取菌液(1×106cfu/ml)150μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×105cfu/ml,取菌液(1×105cfu/ml)100μl加入96孔板,將100μl抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白加入含有100μl菌液的96孔板。每隔2h、4h、8h、12h、20h、24h測(cè)量od600。

第24hod抑菌法結(jié)果如圖7所示,結(jié)果表明氯化膽堿補(bǔ)加量為5%(w/v)時(shí),有微弱抑菌效果。

不同濃度氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌發(fā)酵96h后,od抑菌法第24h抑菌結(jié)果顯示,氯化膽堿補(bǔ)加量為1%(w/v)和2%(w/v)時(shí)均有良好的抑菌效果,且氯化膽堿補(bǔ)加量為2%(w/v)時(shí)抑菌效果最好,故氯化膽堿的最佳誘導(dǎo)濃度為2%(w/v)。

5.2抗菌肽pisl9k22wk初步提純

分別采用70℃和100℃處理氯化膽堿誘導(dǎo)抗菌肽pisl9k22wk工程菌發(fā)酵96h后的總蛋白5min、25min和45min,在冰上放置10min。12000rpm,4℃,離心20min,收集上清,采用od抑菌法檢測(cè)上清抑制金黃色葡萄球菌的活性。

od抑菌法第8h抑菌結(jié)果顯示,70℃處理25min和45min后的蛋白液上清抑菌效果明顯優(yōu)于70℃處理5min,且70℃處理25min抑菌效果優(yōu)于70℃處理45min。圖9顯示100℃處理5min后的蛋白液上清依舊有抑菌活性,且抑菌效果優(yōu)于100℃處理25min和45min,隨著100℃處理時(shí)間的增加,抑菌活性減弱。70℃處理25min抑菌效果優(yōu)于100℃處理5min,故70℃處理25min為最佳處理?xiàng)l件。

實(shí)例6抗菌肽pisl9k22wk工程菌的抑菌活性檢測(cè)及蛋白水平檢測(cè)

6.1抗菌肽pisl9k22wk工程菌的抑菌活性檢測(cè)

取抗菌肽pisl9k22wk工程菌單克隆接種于10mlypd液體培養(yǎng)基中,28-30℃,200-250rpm培養(yǎng)18-24h,以1%-5%(v/v)的接種量將菌液接種于100ml發(fā)酵培養(yǎng)基中,24-28℃,200-250rpm,進(jìn)一步優(yōu)選為25℃,250rpm,搖床培養(yǎng)至od600的吸光度在2.0左右,此時(shí)計(jì)為初始誘導(dǎo)0h,隨后從24h開(kāi)始每24h補(bǔ)加氯化膽堿,氯化膽堿補(bǔ)加量為2%(w/v),誘導(dǎo)96h。

使用od抑菌法檢測(cè)抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白抑菌活性。e.colitop10作為受試菌。挑取e.colitop10單菌落接種于20mllb培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)過(guò)夜,取200μl過(guò)夜培養(yǎng)物接至20ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,37℃200rpm,培養(yǎng)至od600nm=0.3,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到5×107cfu/ml,取菌液30μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×106cfu/ml,取菌液(1×106cfu/ml)150μl加入1.5ml無(wú)菌lb培養(yǎng)基中,此時(shí)菌體細(xì)胞濃度達(dá)到1×105cfu/ml,取菌液(1×105cfu/ml)100μl加入96孔板,將抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白用70℃處理25min后離心取上清100μl(20μg)加入含有100μl菌液的96孔板。每隔2h、4h、8h、12h、20h、24h測(cè)量od600。

圖10為實(shí)例6中抗菌肽pisl9k22wk工程菌搖瓶水平發(fā)酵96h后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清od法抑菌實(shí)驗(yàn)結(jié)果;其中,受試菌為大腸桿菌top10??咕膒isl9k22wk工程菌破碎液上清100μl;空載體:空載體畢赤酵母菌株破碎液上清100μl上樣量;結(jié)果顯示(圖10)抗菌肽pisl9k22wk工程菌具有明顯抑菌效果,其od600值遠(yuǎn)低于空載體對(duì)照,顯著的抑制了菌的生長(zhǎng),在24h后抑菌率仍然達(dá)到45.5%。

6.2抗菌肽pisl9k22wk工程菌的蛋白水平檢測(cè)

對(duì)6.1中獲得的高活性的抗菌肽pisl9k22wk工程菌進(jìn)一步采用tricine-sds-page分析重組pisl9k22wk表達(dá)水平。

圖11為實(shí)例6中重組酵母菌株96h誘導(dǎo)搖瓶水平發(fā)酵后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清tricine-sds-page電泳檢測(cè)結(jié)果;其中,6和7分別為抗菌肽pisl9k22wk工程菌和空載體畢赤酵母菌株96h搖瓶水平誘導(dǎo)發(fā)酵后收集細(xì)胞經(jīng)高壓均質(zhì)機(jī)破碎,破碎液上清30μl上樣量;m為超低分子量蛋白marker。結(jié)果圖11可見(jiàn),從蛋白電泳圖譜來(lái)看,抗菌肽pisl9k22wk工程菌總蛋白在1.7kd與4.2kd之間有目的條帶,而空載體對(duì)照在此大小區(qū)間無(wú)條帶。

本發(fā)明成功優(yōu)化了編碼抗菌肽pisl9k22wk基因,并構(gòu)建了表達(dá)載體fplc,經(jīng)spei酶酶切線性化后成功轉(zhuǎn)化到pichiapink酵母中獲得表達(dá)水平較高的抗菌肽pisl9k22wk工程菌,抗菌肽pisl9k22wk在pichiapink酵母中實(shí)現(xiàn)了高水平的胞內(nèi)表達(dá)。將抗菌肽pisl9k22wk工程菌進(jìn)行氯化膽堿誘導(dǎo)發(fā)酵后,對(duì)誘導(dǎo)表達(dá)的抗菌肽pisl9k22wk進(jìn)行了抗菌活性檢測(cè),結(jié)果表明有明顯抑菌效果。通過(guò)熱穩(wěn)定性試驗(yàn)表明,抗菌肽pisl9k22wk熱穩(wěn)定性好,70℃加熱45min活性沒(méi)有損失,100℃加熱處理5min活性也沒(méi)有損失。另外,通過(guò)時(shí)間–抑菌曲線結(jié)果反應(yīng)抗菌肽pisl9k22wk在低濃度下24h后抑菌率仍然達(dá)到45.5%。

sequencelisting

<110>深圳大學(xué)

<120>一種非甲醇誘導(dǎo)生產(chǎn)抗菌肽的方法

<130>20170323

<160>9

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>609

<212>dna

<213>人工序列

<400>1

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tagtcgatatatctggatatgccgcctataggataaaaacaggagagggtgaaccttgct120

tatggctactagattgttcttgtactctgaattctcattatgggaaactaaactaatctc180

atctgtgtgttgcagtactattgaatcgttgtagtatctacctggagggcattccatgaa240

ttagtgagataacagagttgggtaactagagagaataatagacgtatgcatgattactac300

acaacggatgtcgcactctttccttagttaaaactatcatccaatcacaagatgcgggct360

ggaaagacttgctcccgaaggataatcttctgcttctatctcccttcctcatatggtttc420

gcagggctcatgccccttcttccttcgaactgcccgatgaggaagtccttagcctatcaa480

agaattcgggaccatcatcgatttttagagccttacctgatcgcaatcaggatttcacta540

ctcatataaatacatcgctcaaagctccaactttgcttgttcatacaattcttgatattc600

acaaggcct609

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<212>prt

<213>人工序列

<400>2

metphephephehisileilelysglylysphehisalaglyargmet

151015

ilehisglyleuvaltrplys

20

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<212>dna

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<212>dna

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tagtcgatatatctggatatgccgcctataggataaaaacaggagagggtgaaccttgct120

tatggctactagattgttcttgtactctgaattctcattatgggaaactaaactaatctc180

atctgtgtgttgcagtactattgaatcgttgtagtatctacctggagggcattccatgaa240

ttagtgagataacagagttgggtaactagagagaataatagacgtatgcatgattactac300

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