本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種同時(shí)表達(dá)n個(gè)蛋白或蛋白亞基的方法及其專用系統(tǒng)。
背景技術(shù):
桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)(baculovirusexpressionsystem,bves)是在昆蟲(chóng)細(xì)胞中高效表達(dá)外源蛋白質(zhì)的用力工具,具有安全性好、表達(dá)水平高、可進(jìn)行翻譯后加工等優(yōu)點(diǎn)。由于桿狀病毒的基因組龐大,外源基因的克隆不能通過(guò)酶切連接的方法直接插入,所以人們對(duì)桿狀病毒基因組進(jìn)行改造,并構(gòu)建與之相匹配的轉(zhuǎn)移載體,使兩者重組為能夠感染昆蟲(chóng)細(xì)胞的含外源基因的重組桿狀病毒。在目前廣泛使用的bactobac系統(tǒng)中,桿狀病毒穿梭載體(bacmid)既可以在大腸桿菌中復(fù)制,又可以感染鱗翅目昆蟲(chóng)細(xì)胞,其在大腸桿菌中可以與含外源基因的匹配轉(zhuǎn)移載體發(fā)生tn7位點(diǎn)特異性重組。重組得到的桿狀病毒穿梭載體能在大腸桿菌中高效復(fù)制,被提純后可用于轉(zhuǎn)染昆蟲(chóng)細(xì)胞。
桿狀病毒基因組容量大,可以在轉(zhuǎn)移載體上插入多個(gè)開(kāi)放閱讀框(orf,openreadingframe),繼而使得到的重組桿狀病毒穿梭載體在昆蟲(chóng)細(xì)胞中同時(shí)表達(dá)多個(gè)蛋白質(zhì)。這也是目前在昆蟲(chóng)細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)多種蛋白質(zhì)共表達(dá)的通用思路。
質(zhì)粒pfastbac-dual含有兩個(gè)頭對(duì)頭放置的開(kāi)放閱讀框(orf,openreadingframe),一個(gè)orf以p10啟動(dòng)子起始,hsvtkpolyadenylation信號(hào)序列終止;另一個(gè)orf以polyhedrin啟動(dòng)子起始,sv40polyadenylation信號(hào)序列終止。質(zhì)粒pfastbac-dual可以作為轉(zhuǎn)移載體,但只能同時(shí)表達(dá)兩種蛋白質(zhì),若要表達(dá)兩種以上的蛋白質(zhì),則需要另構(gòu)建其它轉(zhuǎn)移載體。例如要表達(dá)由四種不同亞基構(gòu)成的蛋白質(zhì)復(fù)合物,需要經(jīng)過(guò)如下步驟:(1)構(gòu)建重組質(zhì)粒pfastbac-dual-a-b(含a基因和b基因的質(zhì)粒pfastbac-dual)和重組質(zhì)粒pfastbac-dual-c-d(含c基因和d基因的質(zhì)粒pfastbac-dual);(2)將步驟(1)構(gòu)建的重組質(zhì)粒分別與bacmid進(jìn)行重組,得到兩種重組bacmid;(3)將步驟(2)得到的兩種重組bacmid分別轉(zhuǎn)染昆蟲(chóng)細(xì)胞,得到兩種病毒。(4)用步驟(3)得到的兩種病毒同時(shí)感染昆蟲(chóng)細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)四種亞基的共表達(dá)。這種多病毒共感染方法的蛋白表達(dá)量通常要低于單一病毒感染細(xì)胞的蛋白表達(dá)量。
近幾年流行的multibac系統(tǒng)考慮到這一點(diǎn),只用一種重組bacmid感染細(xì)胞,進(jìn)行蛋白質(zhì)復(fù)合體的表達(dá)。該系統(tǒng)的表達(dá)思路也是一個(gè)orf表達(dá)一種蛋白質(zhì)。通過(guò)受體質(zhì)粒與供體質(zhì)粒上loxp位點(diǎn)介導(dǎo)的重組,實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的融合,將不同來(lái)源的orf整合到一個(gè)轉(zhuǎn)移載體上,然后與bacmid重組,實(shí)現(xiàn)多種蛋白質(zhì)的共表達(dá)。這種方法的局限性為要構(gòu)建多種含目的基因的供體質(zhì)粒與受體質(zhì)粒,供體質(zhì)粒與受體質(zhì)粒要經(jīng)過(guò)多次整合與篩選,才能得到最終用于表達(dá)的轉(zhuǎn)移載體,耗時(shí)耗力。
上述兩種方法除了分子克隆操作繁瑣外,還含有以下幾種缺陷:一是在表達(dá)過(guò)程中無(wú)法控制各個(gè)亞基的拷貝數(shù),最終無(wú)法純化到性質(zhì)較為均一的蛋白質(zhì)復(fù)合體;二是在病毒感染過(guò)程中無(wú)法判斷目的蛋白是否表達(dá)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是如何同時(shí)表達(dá)n個(gè)蛋白或蛋白亞基。
為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明首先提供了一種同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng),所述目的物 為蛋白或蛋白亞基或蛋白片段或多肽或多肽片段。
本發(fā)明所提供的一種同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng),包含dna甲和dna乙;
所述dna甲依次包括如下元件:?jiǎn)?dòng)子甲、融合基因甲、終止序列甲;所述融合基因甲中含有片段ⅰ;所述片段ⅰ包括m1個(gè)區(qū)段,每個(gè)區(qū)段編碼一個(gè)所述目的物,每相鄰兩個(gè)區(qū)段之間具有一個(gè)特異區(qū);所述特異區(qū)編碼蛋白酶的酶切識(shí)別序列;
所述dna乙依次包括如下元件:?jiǎn)?dòng)子乙、融合基因乙、終止序列乙;所述融合基因乙中含有片段ⅱ;所述片段ⅱ包括m2個(gè)區(qū)段,每個(gè)區(qū)段編碼一個(gè)所述目的物,每相鄰兩個(gè)區(qū)段之間具有一個(gè)所述特異區(qū);融合基因乙中還含有編碼所述蛋白酶的區(qū)段;所述編碼所述蛋白酶的區(qū)段與所述片段ⅱ之間具有一個(gè)所述特異區(qū);
所述目的物為蛋白或蛋白亞基或蛋白片段或多肽或多肽片段;
m1為2以上的自然數(shù);m2為2以上的自然數(shù);m1+m2=n。
所述融合基因甲整體形成一個(gè)完整的開(kāi)放閱讀框,5’末端為起始密碼子,3’末端為終止密碼子。
所述融合基因乙整體形成一個(gè)完整的開(kāi)放閱讀框,5’末端為起始密碼子,3’末端為終止密碼子。
所述dna甲和所述dna乙可分別存在,也可以存在于同一個(gè)dna分子中。
所述dna甲和所述dna乙可分別存在于不同的表達(dá)載體,也可存在于同一個(gè)表達(dá)載體。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因甲中還可含有一個(gè)編碼熒光蛋白甲的區(qū)段,所述編碼熒光蛋白甲的區(qū)段與所述片段ⅰ之間具有一個(gè)以上所述特異區(qū)。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因乙中還可含有一個(gè)編碼熒光蛋白乙的區(qū)段,所述編碼熒光蛋白乙的區(qū)段與所述片段ⅱ之間具有一個(gè)所述特異區(qū)。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因甲依次可包括:所述片段ⅰ、所述編碼熒光蛋白甲的區(qū)段。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因乙依次可包括:所述編碼所述蛋白酶的區(qū)段、所述片段ⅱ、所述編碼熒光蛋白乙的區(qū)段。
所述編碼所述蛋白酶的區(qū)段可位于所述片段ⅱ的上游。
上述系統(tǒng)中,所述啟動(dòng)子甲可為p10啟動(dòng)子或p6.9啟動(dòng)子。
上述系統(tǒng)中,所述啟動(dòng)子乙可為p10啟動(dòng)子或p6.9啟動(dòng)子。
上述系統(tǒng)中,所述終止序列甲可為hsvtkpolyadenylation信號(hào)序列或sv40polyadenylation信號(hào)序列。
上述系統(tǒng)中,所述終止序列乙可為hsvtkpolyadenylation信號(hào)序列或sv40polyadenylation信號(hào)序列。
上述系統(tǒng)中,所述編碼熒光蛋白甲的區(qū)段可為編碼綠色熒光蛋白的基因或編碼紅色熒光蛋白的基因。
上述系統(tǒng)中,所述編碼熒光蛋白乙的區(qū)段可為編碼綠色熒光蛋白的基因或編碼紅色熒光蛋白的基因。
上述系統(tǒng)中,所述p10啟動(dòng)子的反向互補(bǔ)序列如序列表中序列2自5'末端起第7820至7929位所示。
上述系統(tǒng)中,所述p6.9啟動(dòng)子的核苷酸序列如序列表中序列2自5'末端起第7953至8047位所示。
上述系統(tǒng)中,所述編碼綠色熒光蛋白的基因如序列表中序列1自5'末端起第778至1497 位所示。
上述系統(tǒng)中,所述編碼紅色熒光蛋白的基因的反向互補(bǔ)序列如序列表中序列1自5'末端起第9至719位所示。
上述系統(tǒng)中,所述目的物中不具有所述蛋白酶的酶切識(shí)別序列。
所述蛋白酶具體可為tev蛋白酶。
上述系統(tǒng)中,所述tev蛋白酶的編碼基因如序列表中序列2自5'端起8051至8821位所示。
上述系統(tǒng)中,所述tev蛋白酶的酶切識(shí)別序列如序列表中序列2自5'末端起第16304至16324位所示。
上述系統(tǒng)中,所述dna甲和所述dna乙,可同向表達(dá),也可反向表達(dá)。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因甲的核苷酸序列的反向互補(bǔ)序列如序列表中序列2自5'末端起第1至第7812位所示。
上述系統(tǒng)中,所述融合基因乙的核苷酸序列如序列表中序列2自5'末端起第8051至第10324位所示。
上述系統(tǒng)中,所述dna甲的核苷酸序列的反向互補(bǔ)序列如序列表中序列3自5'末端起第3992至第12927位所示。
上述系統(tǒng)中,所述dna乙的核苷酸序列如序列表中序列3自5'末端起第12951至第22314位所示。
上述任一所述系統(tǒng)可為同時(shí)表達(dá)alpha亞基、beta亞基、beta’亞基、gamma亞基、delta亞基、epsilon亞基和zeta亞基的系統(tǒng);所述alpha亞基、所述beta亞基、所述beta’亞基、所述gamma亞基、所述delta亞基、所述epsilon亞基和所述zeta亞基可組成人源copi復(fù)合體。
為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了一種轉(zhuǎn)移載體。本發(fā)明所提供的轉(zhuǎn)移載體可為將上述任一所述dna甲和上述任一所述dna乙分別插入骨架載體的多克隆位點(diǎn),得到的重組載體。
所述轉(zhuǎn)移載體的制備方法具體如下:
(1)將質(zhì)粒pfastbac-dual的限制性內(nèi)切酶kpnⅰ識(shí)別序列和限制性內(nèi)切酶hindⅲ識(shí)別序列間的dna小片段替換為核苷酸序列是序列表的序列1所示的dna分子,得到重組質(zhì)粒;
(2)將步驟(1)得到的重組質(zhì)粒的限制性內(nèi)切酶xbaⅰ識(shí)別序列和切刻內(nèi)切酶nb.bbvcⅰ識(shí)別序列間的dna小片段替換為核苷酸序列是序列表的序列2所示的dna分子,得到轉(zhuǎn)移載體。
所述轉(zhuǎn)移載體具體可為重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi。重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的核苷酸序列如序列表中序列3所示。
上述任一所述同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng)或所述轉(zhuǎn)移載體在表達(dá)n個(gè)目的物中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍;所述目的物為蛋白或蛋白亞基或蛋白片段或多肽或多肽片段;n為2以上的自然數(shù)。
為解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明還提供了一種同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的方法。
本發(fā)明所提供的同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的方法,包括如下步驟:將上述任一所述轉(zhuǎn)移載體轉(zhuǎn)化受體菌并培養(yǎng),獲得重組桿狀病毒穿梭載體;將所述重組桿狀病毒穿梭載體轉(zhuǎn)染昆蟲(chóng)細(xì)胞,繼而表達(dá)的n個(gè)目的物;
所述目的物為蛋白或蛋白亞基或蛋白片段或多肽或多肽片段;n為2以上的自然數(shù)。
上述方法中,所述受體菌為含有桿狀病毒穿梭載體的受體菌。
本發(fā)明中,所述蛋白酶的種類可為一種或多種。
實(shí)驗(yàn)證明,將編碼人源copi復(fù)合體的各個(gè)亞基的基因插入重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi,轉(zhuǎn)化受體菌,獲得重組桿狀病毒穿梭載體;將所述重組桿狀病毒穿梭載體轉(zhuǎn)染昆蟲(chóng)細(xì)胞,即為獲得有活性的人源copi復(fù)合體。因此,利用本發(fā)明提供的同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng)可以同時(shí)表達(dá)多個(gè)蛋白或蛋白亞基或多肽或多肽片段。本發(fā)明所提供的同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng)具有如下優(yōu)點(diǎn):一是在表達(dá)過(guò)程中可控制各個(gè)蛋白亞基的拷貝數(shù),可純化到性質(zhì)較為均一的蛋白質(zhì)復(fù)合體;二是在病毒感染過(guò)程中可判斷目的蛋白是否表達(dá);三是省時(shí)省力。本發(fā)明提供的同時(shí)表達(dá)n個(gè)目的物的系統(tǒng)在同時(shí)表達(dá)多個(gè)蛋白或蛋白亞基或多肽或多肽片段中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。
附圖說(shuō)明
圖1為重組質(zhì)粒pfbd-mceg的圖譜。
圖2為人源copi復(fù)合體各亞基的位置示意圖。
圖3為重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的圖譜。
圖4為實(shí)施例2步驟二的熒光顯微鏡觀察結(jié)果。
圖5為copi復(fù)合體的sds-page。
圖6為實(shí)施例2步驟三的copi復(fù)合體的生物學(xué)活性檢測(cè)結(jié)果。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施方式對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)描述,給出的實(shí)施例僅為了闡明本發(fā)明,而不是為了限制本發(fā)明的范圍。
下述實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法,如無(wú)特殊說(shuō)明,均為常規(guī)方法。
下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等,如無(wú)特殊說(shuō)明,均可從商業(yè)途徑得到。
以下實(shí)施例中的定量試驗(yàn),均設(shè)置三次重復(fù)實(shí)驗(yàn),結(jié)果取平均值。
kpnⅰ-hf、hindⅲ-hf和cip為neb公司產(chǎn)品。膠回收試劑盒為genstar公司產(chǎn)品。dnaligationkit為takara公司產(chǎn)品。質(zhì)粒pfastbac-dual和dh10bac感受態(tài)細(xì)胞均為invitrogen公司產(chǎn)品。質(zhì)粒pmcherry-n1和質(zhì)粒pegfp-n1均為clontech公司產(chǎn)品。sf9細(xì)胞、cellfectinii、sf-900tmiisfm培養(yǎng)基和grace’sinsectcellculturemedium,unsupplemented均為invitrogen公司產(chǎn)品,產(chǎn)品目錄號(hào)分別為b82501、10362100、10902096和11595030。monoq5/50gl陰離子交換柱為ge公司產(chǎn)品,產(chǎn)品目錄號(hào)為17-5166-01。gtpγs為sigma-alorich公司產(chǎn)品,產(chǎn)品目錄號(hào)為g8634。1,2-二-(9z-十八碳烯酰基)-sn-甘油-3-磷酸膽堿(dopc)、1,2-二-(9z-十八碳烯酰基)-sn-甘油-3-磷酸乙醇胺(dope)、1,2-二-十八碳烷?;?sn-甘油-3-磷酸膽堿(dspc)、phosphoinositides(pips)和sphingolipid(在下文中簡(jiǎn)稱sm)和膽固醇為avanti公司的產(chǎn)品。nzcym培養(yǎng)基和肉豆蔻酸鈉為sigma公司產(chǎn)品,貨號(hào)分別n3643m8005和m8005。
裂解緩沖液:含100mmnacl、10%甘油和1mmdtt的ph8.0、50mmtris-cl緩沖液。
洗脫緩沖液:含100mmnacl、10%甘油、1mmdtt和5mm脫硫生物素的ph8.0、50mmtris-cl緩沖液。
低鹽buffer:含100mmnacl和10%甘油的ph8.0、20mmbicine緩沖液。
高鹽buffer:含1mnacl和10%甘油的ph8.0、20mmbicine緩沖液。
buffera:含1mmedta、0.2mmgdp和1mmdtt的ph8.0、20mmtris緩沖液。
bufferb:含1mmmgcl2、5μmgdp和1mmdtt的ph8.0、20mmtris緩沖液。
bufferc:含1mnacl的bufferb。
bufferd:含1mmmgcl2、5μmgdp和1mmdtt的ph5.7、10mmmes緩沖液。
buffere:含0.5mnacl的bufferd。
bufferf:含2.5mmmg(oac)2、0.2m蔗糖、25mmkcl的ph7.2、20mmhepes緩沖液。
質(zhì)粒pet11d-arf1記載在如下文獻(xiàn)中:mannevillejb,casellajf,etal.copicoatassemblyoccursonliquid-disordereddomainsandtheassociatedmembranedeformationsarelimitedbymembranetension.procnatlacadsciusa.2008nov4;105(44):16946-51.
質(zhì)粒pbb131-nmt記載在如下文獻(xiàn)中:duroniorj,jackson-machelskie,heuckerothro,etal.proteinn-myristoylationinescherichiacoli:reconstitutionofaeukaryoticproteinmodificationinbacteria.procnatlacadsciusa.1990feb;87(4):1506-10.
實(shí)施例1、重組質(zhì)粒pfbd-mceg的構(gòu)建
構(gòu)建重組質(zhì)粒pfbd-mceg的步驟如下:
1、引物合成
表1.tail-pcr擴(kuò)增引物
人工合成表1中所示的引物。
2、第一輪pcr反應(yīng)
(1)以質(zhì)粒pmcherry-n1為模板,以步驟1合成的mcherry-f和mcherry-mut-r為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-l。
反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃2min;98℃15s,57℃15s,72℃1min40s,共30個(gè)循環(huán);72℃10min。
(2)以質(zhì)粒pmcherry-n1為模板,以步驟1合成的mcherry-mut-f和mcherry-r1為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-r。
反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃2min;98℃15s,57℃15s,72℃1min40s,共30個(gè)循環(huán);72℃10min。
(3)以質(zhì)粒pegfp-n1為模板,以步驟1合成的egfp-f和egfp-r為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得pcr擴(kuò)增產(chǎn)物egfp。
反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃2min;98℃15s,57℃15s,72℃1min40s,共30個(gè)循環(huán);72℃10min。
3、第二輪pcr反應(yīng)
(1)將步驟2中(1)獲得的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-l和步驟2中(2)獲得的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物 mcherry-r等摩爾比混合,得到混合液甲。
(2)以混合液甲為模板,以步驟1合成的mcherry-f和mcherry-r2為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-mut。
反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃2min;98℃15s,57℃15s,72℃1min40s,共30個(gè)循環(huán);72℃10min。
4、第三輪pcr反應(yīng)
(1)將步驟3中獲得的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-mut和步驟2中(3)獲得的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物egfp等摩爾比混合,得到混合液乙。
(2)以混合液乙為模板,以步驟1合成的mcherry-f和egfp-r為引物,進(jìn)行pcr擴(kuò)增,獲得pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-egfp。
反應(yīng)程序?yàn)椋?8℃2min;98℃15s,57℃15s,72℃1min40s,共30個(gè)循環(huán);72℃10min。
5、用限制性內(nèi)切酶kpnⅰ-hf和hindⅲ-hf酶切pcr擴(kuò)增產(chǎn)物mcherry-egfp,然后利用膠回收試劑盒回收酶切產(chǎn)物。
6、用限制性內(nèi)切酶kpnⅰ-hf和hindⅲ-hf酶切質(zhì)粒pfastbac-dual;然后加入cip,37℃處理1h;最后利用膠回收試劑盒回收約4.8kb的載體骨架。
7、將酶切產(chǎn)物與載體骨架通過(guò)dnaligationkit連接,得到重組質(zhì)粒pfbd-mceg。重組質(zhì)粒pfbd-mceg的圖譜見(jiàn)圖1。
根據(jù)測(cè)序結(jié)果,對(duì)重組質(zhì)粒pfbd-mceg進(jìn)行結(jié)構(gòu)描述如下:將質(zhì)粒pfastbac-dual的限制性內(nèi)切酶kpnⅰ和hindⅲ的識(shí)別序列間的dna小片段替換為核苷酸序列是序列表的序列1所示的dna分子,得到重組質(zhì)粒pfbd-mceg。序列表中的序列1自5’末端起,第9至719位為mcherry蛋白的編碼基因的反向互補(bǔ)序列,第722至728位為切刻內(nèi)切酶nb.bbvcⅰ的識(shí)別序列的反向互補(bǔ)序列,第740至745位為限制性內(nèi)切酶xbaⅰ的識(shí)別序列,第746至751位為限制性內(nèi)切酶bamhⅰ的識(shí)別序列,第752至757位為限制性內(nèi)切酶xbaⅰ識(shí)別位點(diǎn),第757至762位為限制性內(nèi)切酶ageⅰ識(shí)別位點(diǎn),第769至775位為切刻內(nèi)切酶nb.bbvcⅰ識(shí)別序列;第778至1497位為egfp蛋白的編碼基因。
實(shí)施例2、利用實(shí)施例構(gòu)建的重組質(zhì)粒pfbd-mceg在昆蟲(chóng)細(xì)胞中表達(dá)人源copi復(fù)合體
人源copi復(fù)合體由7種單拷貝亞基組成,7種單拷貝亞基分別為alpha亞基、beta亞基、beta’亞基、gamma亞基、delta亞基、epsilon亞基和zeta亞基,其總分子量高達(dá)558kda。人源copi復(fù)合體以下簡(jiǎn)稱copi復(fù)合體。
一、構(gòu)建重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi
構(gòu)建重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的方法有兩種:
第一種方法是按照如下步驟構(gòu)建:(1)用限制性內(nèi)切酶xbaⅰ和切刻內(nèi)切酶nb.bbvcⅰ雙酶切實(shí)施例1構(gòu)建的重組質(zhì)粒pfbd-mceg,回收約6300bp的線性化質(zhì)粒。(2)完成步驟(1)后,將線性化質(zhì)粒和序列表中的序列2所示的雙鏈dna分子按照gibsonassembly的方法(gibsondg,youngl,chuangry,venterjc,hutchisonca3rd,smithho.enzymaticassemblyofdnamoleculesuptoseveralhundredkilobases.natmethods.2009may;6(5):343-5.)進(jìn)行單段重組或多段重組,得到重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi。重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的序列如序列表中的序列3所示。
第二種方法是將重組質(zhì)粒pfbd-mceg和序列表中序列3所示的核苷酸序列提供給基因公司,由基因公司完成重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的構(gòu)建。
本發(fā)明采用第二種方法構(gòu)建重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi,完成構(gòu)建的基因公司為蘇州金唯 智生物科技有限公司。重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的圖譜見(jiàn)圖3。
根據(jù)測(cè)序結(jié)果,重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi的核苷酸序列如序列表中序列3所示。重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi含有序列表中的序列2所示的雙鏈dna分子,序列表中的序列2自5’末端起,第1至21位為tev酶剪切位點(diǎn)(tevcleavagesite,tcs)識(shí)別序列的反向互補(bǔ)序列,第22至552位為zeta亞基的編碼基因(又稱zeta基因)的反向互補(bǔ)序列,第553至582位為myc標(biāo)簽的編碼基因的反向互補(bǔ)序列,第583至603位為tcs識(shí)別序列的反向互補(bǔ)序列,第604至2136位為delta亞基的編碼基因(又稱delta基因)的反向互補(bǔ)序列,第2137至2160位為flag標(biāo)簽的編碼基因的反向互補(bǔ)序列,第2161至2181位為tcs識(shí)別序列的反向互補(bǔ)序列,第2182至4803位為gamma亞基的編碼基因(又稱gamma基因)的核苷酸序列,第4804至4827位為flag標(biāo)簽的編碼基因的核苷酸序列,第4828至4848位為tcs識(shí)別序列的反向互補(bǔ)序列,第4849至7707位為beta亞基的編碼基因(又稱beta基因)的反向互補(bǔ)序列,第7708至7812位為twin-streptag的編碼基因(又稱twin-strep基因)的反向互補(bǔ)序列,第7820至7929位為p10啟動(dòng)子的反向互補(bǔ)序列,第7953至8047位為p6.9啟動(dòng)子的核苷酸序列,第8051至8821位為tev酶的編碼基因(又稱tev基因)的核苷酸序列,第8822至8842位為tcs的識(shí)別序列,第8843至8866位為flag標(biāo)簽的編碼基因的核苷酸序列,第8867至12565位為alpha亞基的編碼基因(又稱alpha基因)的核苷酸序列,第12566至12586位為tcs的識(shí)別序列,第12587至12616位為myc標(biāo)簽的編碼基因的核苷酸序列,第12617至15334位為beta’亞基的編碼基因(又稱beta’基因)的核苷酸序列,第15335至15355位為tcs的識(shí)別序列,第15356至15379位為flag標(biāo)簽的編碼基因(又稱flag基因)的核苷酸序列,第15380至16303位為epsilon亞基的編碼基因(又稱epsilon基因)的核苷酸序列,第16304至16324位為tcs的識(shí)別序列。alpha亞基、beta亞基、beta’亞基、gamma亞基、delta亞基、epsilon亞基和zeta亞基的位置示意圖如圖2所示。
二、在昆蟲(chóng)細(xì)胞中表達(dá)人源copi復(fù)合體
參考invitrogen公司的“
1、將重組質(zhì)粒pfbd-mceg-copi轉(zhuǎn)化dh10bac感受態(tài)細(xì)胞,得到重組菌落。
2、完成步驟1后,提取重組菌落的重組bacmiddna。
3、用grace’sinsectcellculturemedium,unsupplemented稀釋處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的sf9細(xì)胞,得到稀釋液,稀釋液中sf9細(xì)胞的密度為5.0×105個(gè)/ml。
4、向直徑為35mm的平皿中加入2ml步驟3得到的稀釋液,28℃、培養(yǎng)4h。
5、向溶液b中加入溶液a,混勻,室溫放置25min,得到混合物;其中溶液a的制備方法為向100μlgrace’sinsectcellculturemedium,unsupplemented加入2.5μg步驟2提取的重組bacmiddna;溶液b的制備方法為取100μlgrace’sinsectcellculturemedium,unsupplemented加入8μlcellfectinii。
6、完成步驟4后,取所述平皿,逐滴加入步驟5得到的混合物,然后28℃、培養(yǎng)4h;棄上清,加入2mlsf-900tmiisfm培養(yǎng)基,28℃靜置培養(yǎng)144h。
完成步驟6后,取所述平皿,用nikonts100倒置熒光顯微鏡觀察。結(jié)果見(jiàn)圖4(左圖為egfp的熒光(使用nikonb-2a熒光模塊觀察,激發(fā)波長(zhǎng)范圍450~490nm),右圖為mcherry的熒光(使用nikon-2a熒光模塊觀察,激發(fā)波長(zhǎng)范圍510~560nm)。結(jié)果表明,用熒光顯微鏡可以觀察到紅光和綠光。因此,alpha亞基、beta亞基、beta’亞基、gamma亞基、delta亞基、epsilon亞基和zeta亞基均可以正常表達(dá)。
7、完成步驟6后,取上清,獲得p1代病毒液。
8、完成步驟7后,取p1代病毒液200μl,接種于裝有180ml、sf9細(xì)胞濃度為2.0×106個(gè)/ml的昆蟲(chóng)細(xì)胞培養(yǎng)基的2l三角搖瓶中,28℃、150rpm培養(yǎng)96h。然后4℃、2000g離心5min,取上清液,獲得p2代病毒液。
9、取10mlp2代病毒液,接種于裝有500ml、sf9細(xì)胞濃度為2.0×106個(gè)/ml的昆蟲(chóng)細(xì)胞培養(yǎng)基的2l三角搖瓶中,28℃、150rpm培養(yǎng)72h。然后4℃、2000g離心5min,收集沉淀,即為感染細(xì)胞。
10、完成步驟9后,取所述感染細(xì)胞,先用裂解緩沖液重懸,使用dounce勻漿器勻漿40次(整個(gè)勻漿過(guò)程中,細(xì)胞一直處于冰浴中)得到細(xì)胞裂解液;然后4℃、15000rpm離心40min,收集上清液。
11、完成步驟10后,將收集的上清液上樣至strep自裝柱(strep親和介質(zhì)為iba公司產(chǎn)品),先用50個(gè)柱體積的裂解緩沖液洗脫以去除雜蛋白,再用10個(gè)柱體積的洗脫緩沖液洗脫,收集過(guò)柱后的洗脫液。
12、完成步驟11后,將收集的過(guò)柱后的洗脫液上樣至monoq5/50gl陰離子交換柱,然后用洗脫液進(jìn)行洗脫,bio-radngc層析儀進(jìn)行檢測(cè)。洗脫液由低鹽buffer和高鹽buffer組成,流速為1ml/min。梯度洗脫程序:洗脫液中高鹽buffer的體積百分含量由0%勻速增至1000%,低鹽buffer的體積百分含量由100%勻速降至0%,線性梯度洗脫20個(gè)柱體積。檢測(cè)波長(zhǎng)為280nm。收集并合并洗脫峰。得到的溶液即為copi復(fù)合體溶液。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)圖5。結(jié)果表明,經(jīng)過(guò)上述步驟可獲得純度在95%以上的copi復(fù)合體,每升昆蟲(chóng)細(xì)胞中可以純化得到1.5mgcopi復(fù)合體。
三、在昆蟲(chóng)細(xì)胞中表達(dá)copi復(fù)合體的生物學(xué)活性檢測(cè)
1、myr-arf1蛋白的表達(dá)和純化
(1)myr-arf1蛋白的表達(dá)
將質(zhì)粒pet11d-arf1和質(zhì)粒pbb131-nmt導(dǎo)入大腸桿菌bl21(de3),得到重組大腸桿菌,將該重組大腸桿菌的單克隆接種于25ml含50μg/ml卡那霉素和50μg/ml氨芐青霉素的nzcym培養(yǎng)基中,37℃、200rpm振蕩培養(yǎng)至od600值為0.8,得到培養(yǎng)菌液1;取5ml培養(yǎng)菌液1,以1:180(體積比)接種至nzcym培養(yǎng)基中,37℃、180rpm振蕩培養(yǎng)至od600值為0.4,得到培養(yǎng)菌液2;向培養(yǎng)菌液2中加入肉豆蔻酸鈉水溶液(使肉豆蔻酸鈉在培養(yǎng)體系中的濃度為50μm),37℃、180rpm振蕩培養(yǎng)至od600值為0.8,得到培養(yǎng)菌液3;向培養(yǎng)菌液3中加入iptg(使其在培養(yǎng)體系中的濃度為1mm),37℃誘導(dǎo)4h,離心收集菌體。
(2)myr-arf1蛋白的純化
①取步驟(1)收集到的菌體,置于冰上超聲破碎(功率300w,工作時(shí)間8s,間歇5s,總破碎時(shí)間10min),得到菌體破碎液。
②將菌體破碎液4℃、100000g離心20min,得到上清液1;將上清液14℃、100000g離心60min,得到上清液2。
③將上清液2置于冰上,邊攪拌邊按照35%飽和度緩緩加入硫酸銨粉末(加入總時(shí)間控制在45min內(nèi),加入硫酸銨的作用為富集修飾過(guò)的arf1蛋白),然后繼續(xù)在冰上攪拌1h,得到混合體系。
④將混合體系4℃、8000g離心25min,棄上清,沉淀用buffera懸浮,得到懸浮液;然后將懸浮液4℃、10000rpm離心40min,得到上清液3。
⑤將上清液3上樣至bufferb平衡的hitrapdesalting層析脫鹽柱(ge公司產(chǎn)品)上,用bufferb進(jìn)行洗脫,得到脫鹽后溶液;將脫鹽后溶液上樣至bufferb平衡的hitrapdeaeff層析柱(ge公司產(chǎn)品)上,用混合液(由bufferc和bufferb組成,體積比為1:19)洗脫目的蛋白,根據(jù)sds-page考染檢測(cè)結(jié)果,將只含有修飾過(guò)的arf1蛋白的洗脫液用截留值為3kda的縮濾管濃縮,得到濃縮液。
⑥將濃縮液上樣至bufferb平衡的hitrapdesalting層析脫鹽柱中,用bufferb進(jìn)行洗脫,得到脫鹽后的濃縮液。
⑦將脫鹽后的濃縮液上樣至bufferd平衡好的monos5/50gl陽(yáng)離子交換層析柱(ge公司產(chǎn)品)上,然后用20ml洗脫液進(jìn)行洗脫。洗脫液由buffere和水組成。梯度洗脫程序:洗脫液中buffere的體積百分含量由0%勻速增至100%,水的體積百分含量由100%勻速降至0%。根據(jù)sds-page考染檢測(cè)結(jié)果收集只含有修飾過(guò)的arf1蛋白的洗脫液,然后用截留值為3kda的縮濾管濃縮,得到濃度為10mg/ml的myr-arf1蛋白溶液。分裝后-80℃保存。
2、脂質(zhì)體的制備
將快速凍融法和extrusion方法結(jié)合使用制備脂質(zhì)體,具體步驟如下:
(1)將dopc、dope、dops、sm和pips溶解于氯仿中,得到混合液甲,混合液甲中dopc、dope、dops、sm和pips的濃度均為10mg/ml。
(2)將膽固醇溶解于60℃的甲醇中,得到混合液乙,混合液乙中膽固醇的濃度為5mg/ml。
(3)將混合液甲和混合液乙按照不同的比例混合,用氮?dú)庑⌒拇蹈?,在真空腔體內(nèi)抽氣3h以上,保證有機(jī)溶劑全部除去,得到脂質(zhì)混合物。
(4)完成步驟(3)后,將脂質(zhì)混合物用bufferf重懸,37℃渦旋震蕩孵育30min。
(5)完成步驟(4)后,將脂質(zhì)混合物用液氮快速冷凍1min,37℃水浴融化1min,如此反復(fù)凍融5次,以減少多室脂質(zhì)體。最后將extruder(avanti公司產(chǎn)品)裝配上0.2μm的濾膜在室溫下反復(fù)擠壓脂質(zhì)混合物21次,即為制備的脂質(zhì)體。
3、制備copi活性檢測(cè)體系
對(duì)照組i的檢測(cè)體系包括步驟2制備的脂質(zhì)體。
對(duì)照組ii的檢測(cè)體系包括步驟2制備的脂質(zhì)體、步驟1制備的myr-arf1蛋白溶液和gtpγs。
對(duì)照組iii的檢測(cè)體系包括步驟2制備的脂質(zhì)體、步驟二制備的copi復(fù)合體和gtpγs。
對(duì)照組iv的檢測(cè)體系包括步驟2制備的脂質(zhì)體、步驟1制備的myr-arf1蛋白溶液和步驟二制備的copi復(fù)合體。
檢測(cè)組的檢測(cè)體系包括步驟2制備的脂質(zhì)體、步驟1制備的myr-arf1蛋白溶液、步驟二制備的copi復(fù)合體和gtpγs。
上述各檢測(cè)體系的體積均為250μl,反應(yīng)環(huán)境為bufferf。
上述各組的檢測(cè)體系中,myr-arf1蛋白的濃度為0.1mg/ml,gtpγs的濃度為25μm,脂質(zhì)體的濃度為1.5mg/ml,copi復(fù)合體的濃度為0.1mg/ml。
4、完成步驟3后,將各檢測(cè)體系均37℃孵育30min。
5、完成步驟4后,向beckman344090離心管底部依次加入10μl含45%(質(zhì)量體積比)蔗糖的bufferf、50μl的含37.5%(質(zhì)量體積比)蔗糖的bufferf,然后用beckman超速離心機(jī)的mls-50轉(zhuǎn)子和適配器356860,以100000g離心50min,吸取兩層蔗糖間的10μl液相作為樣品。
6、完成步驟5后,各取樣品5μl,加到經(jīng)過(guò)輝光放電處理的、碳包被的電鏡載網(wǎng) (lifetrust公司產(chǎn)品)上,用超純水漂洗后,然后加入濃度為2%(質(zhì)量體積比)的醋酸鈾水溶液,室溫染色1分鐘。用200kv的feitalos場(chǎng)發(fā)射電鏡觀察載網(wǎng)上的樣品。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)圖6(i為對(duì)照組i,ii為對(duì)照組ii,iii為對(duì)照組iii,iv為對(duì)照組iv,v為檢測(cè)組,標(biāo)尺為200nm,白色虛線方框?yàn)橹亟M小泡)。結(jié)果表明,僅有檢測(cè)組中產(chǎn)生重組小泡。因此,步驟二制備的copi復(fù)合體是有生物活性的。