專利名稱：一種sult1a1基因多態(tài)性檢測特異性引物和液相芯片的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于分子生物學領(lǐng)域，涉及醫(yī)學和生物技術(shù)，具體的是涉及一種SULT1A1基因多態(tài)性檢測特異性引物和液相芯片。
背景技術(shù)：
近年來分子生物學及酶化學研究表明，與激素、藥物和外源性致癌物在人體代謝相關(guān)的酶及其基因多態(tài)性可能與癌癥的發(fā)生發(fā)展有關(guān)，通過研究這些酶基因的多態(tài)性，闡明激素依賴性腫瘤發(fā)生的分子遺傳學基礎(chǔ)，逐漸成為腫瘤病因?qū)W研究的新方向。硫酸基轉(zhuǎn)移酶(Sulfotransferases, SULTs)是調(diào)節(jié)雌激素合成與代謝的重要的酶之一，SULTs主要催化人體內(nèi)硫酸化反應，在外源性化合物(藥物、食品添加劑、致癌物等)的生物代謝和化學防御過程中起著關(guān)鍵的作用，在調(diào)節(jié)各種內(nèi)源性化合物的生物學活性方面也發(fā)揮著重要的作用。這種硫酸化作用在許多激素(包括可作用于子宮內(nèi)膜的雌激素)，藥物和外源性復合物的生物代謝和化學防御過程中是一種重要的代謝反應。國內(nèi)外目前研究表明，SULTs編碼基因SULT1A1的多態(tài)性與癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。本發(fā)明目標檢測的SULT1A1基因突變位點，如表所示
權(quán)利要求
1.一種SULT1A1基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，包括有(A).針對SULT1A1基因不同多態(tài)性位點分別設(shè)計的野生型和突變型的ASPE引物每種ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態(tài)性位點的特異性引物序列組成,所述特異性引物序列為針對G89A位點的SEQ ID NO. 5和SEQ ID NO. 6 ;和/或針對G118A位點的 SEQ ID NO. 7 和 SEQ ID NO. 8 ;所述 tag 序列選自 SEQ ID NO. I SEQ ID NO. 4 ；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對； (C).用于擴增出需要檢測的、具有相應多態(tài)性位點的目標序列的引物。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SULT1A1基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述擴增引物為針對 G89A、G118A 位點的 SEQ ID NO. 13 和 SEQ ID NO. 14。
3.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SULT1A1基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述ASPE引物為針對G89A位點的由SEQ ID NO. I和SEQ ID NO. 5組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID N06組成的序列；和/或針對G118A位點的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 7組成的序列及由SEQ IDN0. 4和SEQ ID NO. 8組成的序列。
4.根據(jù)權(quán)利要求I所述的SULT1A1基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，(A).所述ASPE引物為針對G89A位點的由SEQID NO. I和SEQ ID NO. 5組成的序列及由SEQ ID NO. 2和SEQ ID NO. 6組成的序列；和針對G118A位點的由SEQ ID NO. 3和SEQID NO. 7組成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 8組成的序列；(B).有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球,所述anti-tag序列與微球連接中間還設(shè)有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ ID NO. 9 SEQ ID NO. 12，且所述anti-tag序列能相應地與(A)中所選的tag序列互補配對；(C).所述擴增引物為針對G89A、G118A位點的SEQID NO. 13和SEQ ID NO. 14。
5.根據(jù)權(quán)利要求1-4任一項所述的SULT1A1基因多態(tài)性檢測液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。
6.用于SULT1A1基因多態(tài)性檢測的特異性引物，其特征是，所述特異性引物序列為針對 G89A 位點的 SEQ ID NO. 5 和 SEQ ID NO. 6 ;和 / 或針對 Gl 18A 位點的 SEQ ID NO. 7 和 SEQIDN0. 8。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種SULT1A1基因多態(tài)性檢測特異性引物和液相芯片，該液相芯片主要包括有每種由5’端的tag序列和3’端針對目的基因多態(tài)性位點的特異性引物序列組成的ASPE引物，所述特異性引物序列為針對G89A位點的SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6；和/或針對G118A位點的SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8；所述tag序列選自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.4；有anti-tag序列包被的微球；擴增引物。本發(fā)明所提供的檢測液相芯片的檢測結(jié)果與測序法的吻合率高達100％，實現(xiàn)多個突變位點的野生型和突變型并行檢測。
文檔編號C12Q1/68GK102952871SQ20111025166
公開日2013年3月6日 申請日期2011年8月29日 優(yōu)先權(quán)日2011年8月29日
發(fā)明者許嘉森, 何嘉英 申請人:廣州益善生物技術(shù)有限公司