專利名稱：一種多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45和編碼這種多肽的多核苷酸的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域，具體地說，本發(fā)明描述了一種多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，以及編碼此多肽的多核苷酸序列。本發(fā)明還涉及此多核苷酸和多肽的制備方法和應(yīng)用。
背景技術(shù)：
糖是一種重要的生物化合物。糖類是細(xì)胞結(jié)構(gòu)的一種組成成分，調(diào)節(jié)粘稠度，儲存能量，也是細(xì)胞表面的組成成分。幾乎所有的位點專一性的細(xì)胞內(nèi)反應(yīng)都涉及細(xì)胞表面糖類。例如，精卵結(jié)合時精子和卵子都需要細(xì)胞表面的糖類介導(dǎo)。有些糖蛋白是與腫瘤相關(guān)的抗體，現(xiàn)在已經(jīng)被用來檢測許多種腫瘤的存在。甚至游離的寡糖也能起到生物學(xué)作用。寡糖對與之結(jié)合的蛋白或脂類也會產(chǎn)生影響[Rademacher et al.，Ann.Rev.，Biochem.，(1998)，57785]。對蛋白來說，寡糖與之結(jié)合會影響其穩(wěn)定性、蛋白水解速率、從血液中清除的速率、熱穩(wěn)定性和溶解度。細(xì)胞表面糖類的寡糖部分的改變可能會引起癌變。在細(xì)胞分化時也發(fā)現(xiàn)某些種類的寡糖的改變[Toone et al.，Tetrahedron Report(1989)45(17)5365-5422]。
糖蛋白常有O-連接的寡糖，這是寡糖共價連接到蛋白質(zhì)的絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸殘基側(cè)鏈上的OH基團。涉及O連接的寡糖糖基化作用全部或主要的發(fā)生在高爾基體內(nèi)，N-乙酰半乳糖胺從UDP-N-乙酰半乳糖胺轉(zhuǎn)移到絲氨酸或蘇氨酸上。催化此反應(yīng)的酶是N-乙酰半乳糖胺轉(zhuǎn)移酶家族。現(xiàn)在已經(jīng)克隆并鑒定了四種人N-乙酰半乳糖胺轉(zhuǎn)移酶，分別是GalNAc-T1/T2/T3/T4[Homa et al.1993；Hagen etal.1993；White et al.1995]。它們催化不同的受體底物，但這些受體底物的結(jié)構(gòu)是有聯(lián)系的。相應(yīng)的，這兩種已知的糖胺轉(zhuǎn)移酶的基因也有一段61個氨基酸序列的相似性為82％[White et al.1995，EMBL accession#L16621]。
現(xiàn)在，關(guān)于蛋白O-連接糖基化反應(yīng)的了解都來自于上述的兩種轉(zhuǎn)移酶。但是已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并非所有的O-連接糖基化反應(yīng)都由這兩種轉(zhuǎn)移酶所催化。例如，一種從HIV.sub.IIIB gp120(GRAFVTIGKIG<210>4)中提取的多肽是多種器官中提取出來的GalNAc-轉(zhuǎn)移酶的有效的受體底物。但是純化的GalNAc-T1/T2/T3/T4并不能催化這種多肽糖基化。這就提示了有另外的糖基轉(zhuǎn)移酶的存在。
尋找新的糖基轉(zhuǎn)移酶可以對更深入的了解糖基化作用提供新的線索。新的糖基轉(zhuǎn)移酶還可以用來治療由于體內(nèi)糖蛋白合成失常而導(dǎo)致的各種免疫疾病，內(nèi)分泌系統(tǒng)分泌失常等；新的糖基轉(zhuǎn)移酶可以用于人工合成糖基化的多肽，這些多肽可以應(yīng)用于藥用制品或其他商業(yè)應(yīng)用中。
本發(fā)明與豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因在蛋白水平上有40％的同源性，并且具有此類基因保守的幾個氨基酸位點?；谝陨细鼽c，故認(rèn)為本發(fā)明的新基因為編碼人與豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶相似的基因，命名為人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，并以此推斷其蛋白與豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶相似，具有相似的生物學(xué)功能。
由于如上所述人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45蛋白在調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂和胚胎發(fā)育等機體重要功能中起重要作用，而且相信這些調(diào)節(jié)過程中涉及大量的蛋白，因而本領(lǐng)域中一直需要鑒定更多參與這些過程的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45蛋白，特別是鑒定這種蛋白的氨基酸序列。新人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45蛋白編碼基因的分離也為研究確定該蛋白在健康和疾病狀態(tài)下的作用提供了基礎(chǔ)。這種蛋白可能構(gòu)成開發(fā)疾病診斷和/或治療藥的基礎(chǔ)，因此分離其編碼DNA是非常重要的。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的一個目的是提供分離的新的多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45以及其片段、類似物和衍生物。
本發(fā)明的另一個目的是提供編碼該多肽的多核苷酸。
本發(fā)明的另一個目的是提供含有編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸的重組載體。
本發(fā)明的另一個目的是提供含有編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸的基因工程化宿主細(xì)胞。
本發(fā)明的另一個目的是提供生產(chǎn)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的方法。
本發(fā)明的另一個目的是提供針對本發(fā)明的多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的抗體。
本發(fā)明的另一個目的是提供了針對本發(fā)明多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的模擬化合物、拮抗劑、激動劑、抑制劑。
本發(fā)明的另一個目的是提供診斷治療與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45異常相關(guān)的疾病的方法。
本發(fā)明涉及一種分離的多肽，該多肽是人源的，它包含具有<210>2氨基酸序列的多肽、或其保守性變體、生物活性片段或衍生物。較佳地，該多肽是具有<210>2氨基酸序列的多肽。
本發(fā)明還涉及一種分離的多核苷酸，它包含選自下組的一種核苷酸序列或其變體(a)編碼具有<210>2氨基酸序列的多肽的多核苷酸；(b)與多核苷酸(a)互補的多核苷酸；(c)與(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70％相同性的多核苷酸。
更佳地，該多核苷酸的序列是選自下組的一種(a)具有<210>1中51-1274位的序列；和(b)具有<210>1中1-2466位的序列。
本發(fā)明另外涉及一種含有本發(fā)明多核苷酸的載體，特別是表達(dá)載體；一種用該載體遺傳工程化的宿主細(xì)胞，包括轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)或轉(zhuǎn)染的宿主細(xì)胞；一種包括培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞和回收表達(dá)產(chǎn)物的制備本發(fā)明多肽的方法。
本發(fā)明還涉及一種能與本發(fā)明多肽特異性結(jié)合的抗體。
本發(fā)明還涉及一種篩選的模擬、激活、拮抗或抑制人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45蛋白活性的化合物的方法，其包括利用本發(fā)明的多肽。本發(fā)明還涉及用該方法獲得的化合物。
本發(fā)明還涉及一種體外檢測與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45蛋白異常表達(dá)相關(guān)的疾病或疾病易感性的方法，包括檢測生物樣品中所述多肽或其編碼多核苷酸序列中的突變，或者檢測生物樣品中本發(fā)明多肽的量或生物活性。
本發(fā)明也涉及一種藥物組合物，它含有本發(fā)明多肽或其模擬物、激活劑、拮抗劑或抑制劑以及藥學(xué)上可接受的載體。
本發(fā)明還涉及本發(fā)明的多肽和/或多核苷酸在制備用于治療癌癥、發(fā)育性疾病或免疫性疾病或其它由于人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45表達(dá)異常所引起疾病的藥物的用途。
本發(fā)明的其它方面由于本文的技術(shù)的公開，對本領(lǐng)域的技術(shù)人員而言是顯而易見的。
本說明書和權(quán)利要求書中使用的下列術(shù)語除非特別說明具有如下的含義“核酸序列”是指寡核苷酸、核苷酸或多核苷酸及其片段或部分，也可以指基因組或合成的DNA或RNA，它們可以是單鏈或雙鏈的，代表有義鏈或反義鏈。類似地，術(shù)語“氨基酸序列”是指寡肽、肽、多肽或蛋白質(zhì)序列及其片段或部分。當(dāng)本發(fā)明中的“氨基酸序列”涉及一種天然存在的蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列時，這種“多肽”或“蛋白質(zhì)”不意味著將氨基酸序列限制為與所述蛋白質(zhì)分子相關(guān)的完整的天然氨基酸。
蛋白質(zhì)或多核苷酸“變體”是指一種具有一個或多個氨基酸或核苷酸改變的氨基酸序列或編碼它的多核苷酸序列。所述改變可包括氨基酸序列或核苷酸序列中氨基酸或核苷酸的缺失、插入或替換。變體可具有“保守性”改變，其中替換的氨基酸具有與原氨基酸相類似的結(jié)構(gòu)或化學(xué)性質(zhì)，如用亮氨酸替換異亮氨酸。變體也可具有非保守性改變，如用色氨酸替換甘氨酸。
“缺失”是指在氨基酸序列或核苷酸序列中一個或多個氨基酸或核苷酸的缺失。
“插入”或“添加”是指在氨基酸序列或核苷酸序列中的改變導(dǎo)致與天然存在的分子相比，一個或多個氨基酸或核苷酸的增加?！疤鎿Q”是指由不同的氨基酸或核苷酸替換一個或多個氨基酸或核苷酸。
“生物活性”是指具有天然分子的結(jié)構(gòu)、調(diào)控或生物化學(xué)功能的蛋白質(zhì)。類似地，術(shù)語“免疫學(xué)活性”是指天然的、重組的或合成蛋白質(zhì)及其片段在合適的動物或細(xì)胞中誘導(dǎo)特定免疫反應(yīng)以及與特異性抗體結(jié)合的能力。
“激動劑”是指當(dāng)與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合時，一種可引起該蛋白質(zhì)改變從而調(diào)節(jié)該蛋白質(zhì)活性的分子。激動劑可以包括蛋白質(zhì)、核酸、碳水化合物或任何其它可結(jié)合人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的分子。
“拮抗劑”或“抑制物”是指當(dāng)與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合時，一種可封閉或調(diào)節(jié)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的生物學(xué)活性或免疫學(xué)活性的分子。拮抗劑和抑制物可以包括蛋白質(zhì)、核酸、碳水化合物或任何其它可結(jié)合人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的分子。
“調(diào)節(jié)”是指人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的功能發(fā)生改變，包括蛋白質(zhì)活性的升高或降低、結(jié)合特性的改變及人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的任何其它生物學(xué)性質(zhì)、功能或免疫性質(zhì)的改變。
″基本上純″是指基本上不含天然與其相關(guān)的其它蛋白、脂類、糖類或其它物質(zhì)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能用標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)純化技術(shù)純化人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45?；旧霞兊娜艘阴０肴樘擒辙D(zhuǎn)移酶45在非還原性聚丙烯酰胺凝膠上能產(chǎn)生單一的主帶。人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45多肽的純度可用氨基酸序列分析。
“互補的”或“互補”是指在允許的鹽濃度和溫度條件下通過堿基配對的多核苷酸天然結(jié)合。例如，序列“C-T-G-A”可與互補的序列“G-A-C-T”結(jié)合。兩個單鏈分子之間的互補可以是部分的或全部的。核酸鏈之間的互補程度對于核酸鏈之間雜交的效率及強度有明顯影響。
“同源性”是指互補的程度，可以是部分同源或完全同源?！安糠滞础笔侵敢环N部分互補的序列，其至少可部分抑制完全互補的序列與靶核酸的雜交。這種雜交的抑制可通過在嚴(yán)格性程度降低的條件下進行雜交(Southern印跡或Northern印跡等)來檢測。基本上同源的序列或雜交探針可競爭和抑制完全同源的序列與靶序列在的嚴(yán)格性程度降低的條件下的結(jié)合。這并不意味嚴(yán)格性程度降低的條件允許非特異性結(jié)合，因為嚴(yán)格性程度降低的條件要求兩條序列相互的結(jié)合為特異性或選擇性相互作用。
“相同性百分率”是指在兩種或多種氨基酸或核酸序列比較中序列相同或相似的百分率。可用電子方法測定相同性百分率，如通過MEGALIGN程序(Lasergenesoftware package，DNASTAR，Inc.，Madison Wis.)。MEGALIGN程序可根據(jù)不同的方法如Cluster法比較兩種或多種序列(Higgins，D.G.和P.M.Sharp(1988)Gene 73237-244)。Cluster法通過檢查所有配對之間的距離將各組序列排列成簇。然后將各簇以成對或成組分配。兩個氨基酸序列如序列A和序列B之間的相同性百分率通過下式計算序列A與序列B之間匹配的殘基個數(shù)序列A的殘基數(shù)—序列A中間隔殘基數(shù)—序列B中間隔殘基數(shù)×100也可以通過Cluster法或用本領(lǐng)域周知的方法如Jotun Hein測定核酸序列之間的相同性百分率(Hein J.，(1990)Methods in emzumology 183625-645)。
“相似性”是指氨基酸序列之間排列對比時相應(yīng)位置氨基酸殘基的相同或保守性取代的程度。用于保守性取代的氨基酸例如，帶負(fù)電荷的氨基酸可包括天冬氨酸和谷氨酸；帶正電荷的氨基酸可包括賴氨酸和精氨酸；具有不帶電荷的頭部基團有相似親水性的氨基酸可包括亮氨酸、異亮氨酸和纈氨酸；甘氨酸和丙氨酸；天冬酰胺和谷氨酰胺；絲氨酸和蘇氨酸；苯丙氨酸和酪氨酸。
“反義”是指與特定的DNA或RNA序列互補的核苷酸序列?！胺戳x鏈”是指與“有義鏈”互補的核酸鏈。
“衍生物”是指HFP或編碼其的核酸的化學(xué)修飾物。這種化學(xué)修飾物可以是用烷基、?；虬被鎿Q氫原子。核酸衍生物可編碼保留天然分子的主要生物學(xué)特性的多肽。
“抗體”是指完整的抗體分子及其片段，如Fa、F(ab’)2及Fv，其能特異性結(jié)合人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的抗原決定簇。
“人源化抗體”是指非抗原結(jié)合區(qū)域的氨基酸序列被替換變得與人抗體更為相似，但仍保留原始結(jié)合活性的抗體。
“分離的”一詞指將物質(zhì)從它原來的環(huán)境(例如，若是自然產(chǎn)生的就指其天然環(huán)境)之中移出。比如說，一個自然產(chǎn)生的多核苷酸或多肽存在于活動物中就是沒有被分離出來，但同樣的多核苷酸或多肽同一些或全部在自然系統(tǒng)中與之共存的物質(zhì)分開就是分離的。這樣的多核苷酸可能是某一載體的一部分，也可能這樣的多核苷酸或多肽是某一組合物的一部分。既然載體或組合物不是它天然環(huán)境的成分，它們?nèi)匀皇欠蛛x的。
多如本發(fā)明所用，“分離的”是指物質(zhì)從其原始環(huán)境中分離出來(如果是天然的物質(zhì)，原始環(huán)境即是天然環(huán)境)。如活體細(xì)胞內(nèi)的天然狀態(tài)下的多聚核苷酸和肽是沒有分離純化的，但同樣的多聚核苷酸或多肽如從天然狀態(tài)中同存在的其他物質(zhì)中分開，則為分離純化的。
如本文所用，“分離的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45”是指人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45基本上不含天然與其相關(guān)的其它蛋白、脂類、糖類或其它物質(zhì)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員能用標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)純化技術(shù)純化人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45?；旧霞兊亩嚯脑诜沁€原聚丙烯酰胺凝膠上能產(chǎn)生單一的主帶。人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45多肽的純度能用氨基酸序列分析。
本發(fā)明提供了一種多肽——人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，其基本上是由<210>2所示的氨基酸序列組成的。本發(fā)明的多肽可以是重組多肽、天然多肽、合成多肽，優(yōu)選重組多肽。本發(fā)明的多肽可以是天然純化的產(chǎn)物，或是化學(xué)合成的產(chǎn)物，或使用重組技術(shù)從原核或真核宿主(例如，細(xì)菌、酵母、高等植物、昆蟲和哺乳動物細(xì)胞)中產(chǎn)生。根據(jù)重組生產(chǎn)方案所用的宿主，本發(fā)明的多肽可以是糖基化的，或可以是非糖基化的。本發(fā)明的多肽還可包括或不包括起始的甲硫氨酸殘基。
本發(fā)明還包括人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的片段、衍生物和類似物。如本發(fā)明所用，術(shù)語“片段”、“衍生物”和“類似物”是指基本上保持本發(fā)明的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45相同的生物學(xué)功能或活性的多肽。本發(fā)明多肽的片段、衍生物或類似物可以是(I)這樣一種，其中一個或多個氨基酸殘基被保守或非保守氨基酸殘基(優(yōu)選的是保守氨基酸殘基)取代，并且取代的氨基酸可以是也可以不是由遺傳密碼子編碼的；或者(II)這樣一種，其中一個或多個氨基酸殘基上的某個基團被其它基團取代包含取代基；或者(III)這樣一種，其中成熟多肽與另一種化合物(比如延長多肽半衰期的化合物，例如聚乙二醇)融合；或者(IV)這樣一種，其中附加的氨基酸序列融合進成熟多肽而形成的多肽序列(如前導(dǎo)序列或分泌序列或用來純化此多肽的序列或蛋白原序列)通過本文的闡述，這樣的片段、衍生物和類似物被認(rèn)為在本領(lǐng)域技術(shù)人員的知識范圍之內(nèi)。
本發(fā)明提供了分離的核酸(多核苷酸)，基本由編碼具有<210>2氨基酸序列的多肽的多核苷酸組成。本發(fā)明的多核苷酸序列包括<210>1的核苷酸序列。本發(fā)明的多核苷酸是從人胎腦組織的cDNA文庫中發(fā)現(xiàn)的。它包含的多核苷酸序列全長為2466個堿基，其開放讀框(51-1274)編碼了407個氨基酸。根據(jù)氨基酸序列同源比較發(fā)現(xiàn)，此多肽與豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因有40％的同源性，可推斷出該人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45具有豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因相似的結(jié)構(gòu)和功能。
本發(fā)明的多核苷酸可以是DNA形式或是RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因組DNA或人工合成的DNA。DNA可以是單鏈的或是雙鏈的。DNA可以是編碼鏈或非編碼鏈。編碼成熟多肽的編碼區(qū)序列可以與<210>1所示的編碼區(qū)序列相同或者是簡并的變異體。如本發(fā)明所用，“簡并的變異體”在本發(fā)明中是指編碼具有<210>2的蛋白質(zhì)或多肽，但與<210>1所示的編碼區(qū)序列有差別的核酸序列。
編碼<210>2的成熟多肽的多核苷酸包括只有成熟多肽的編碼序列；成熟多肽的編碼序列和各種附加編碼序列；成熟多肽的編碼序列(和任選的附加編碼序列)以及非編碼序列。
術(shù)語“編碼多肽的多核苷酸”是指包括編碼此多肽的多核苷酸和包括附加編碼和/或非編碼序列的多核苷酸。
本發(fā)明還涉及上述描述多核苷酸的變異體，其編碼與本發(fā)明有相同的氨基酸序列的多肽或多肽的片斷、類似物和衍生物。此多核苷酸的變異體可以是天然發(fā)生的等位變異體或非天然發(fā)生的變異體。這些核苷酸變異體包括取代變異體、缺失變異體和插入變異體。如本領(lǐng)域所知的，等位變異體是一個多核苷酸的替換形式，它可能是一個或多個核苷酸的取代、缺失或插入，但不會從實質(zhì)上改變其編碼的多肽的功能。
本發(fā)明還涉及與以上所描述的序列雜交的多核苷酸(兩個序列之間具有至少50％，優(yōu)選具有70％的相同性)。本發(fā)明特別涉及在嚴(yán)格條件下與本發(fā)明所述多核苷酸可雜交的多核苷酸。在本發(fā)明中，“嚴(yán)格條件”是指(1)在較低離子強度和較高溫度下的雜交和洗脫，如0.2×SSC，0.1％SDS，60℃；或(2)雜交時加用變性劑，如50％(v/v)甲酰胺，0.1％小牛血清/0.1％Ficoll，42℃等；或(3)僅在兩條序列之間的相同性至少在95％以上，更好是97％以上時才發(fā)生雜交。并且，可雜交的多核苷酸編碼的多肽與<210>2所示的成熟多肽有相同的生物學(xué)功能和活性。
本發(fā)明還涉及與以上所描述的序列雜交的核酸片段。如本發(fā)明所用，”核酸片段”的長度至少含10個核苷酸，較好是至少20-30個核苷酸，更好是至少50-60個核苷酸，最好是至少100個核苷酸以上。核酸片段也可用于核酸的擴增技術(shù)(如PCR)以確定和/或分離編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸。
本發(fā)明中的多肽和多核苷酸優(yōu)選以分離的形式提供，更佳地被純化至均質(zhì)。
本發(fā)明的編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的特異的多核苷酸序列能用多種方法獲得。例如，用本領(lǐng)域熟知的雜交技術(shù)分離多核苷酸。這些技術(shù)包括但不局限于1)用探針與基因組或cDNA文庫雜交以檢出同源的多核苷酸序列，和2)表達(dá)文庫的抗體篩選以檢出具有共同結(jié)構(gòu)特征的克隆的多核苷酸片段。
本發(fā)明的DNA片段序列也能用下列方法獲得1)從基因組DNA分離雙鏈DNA序列；2)化學(xué)合成DNA序列以獲得所述多肽的雙鏈DNA。
上述提到的方法中，分離基因組DNA最不常用。DNA序列的直接化學(xué)合成是經(jīng)常選用的方法。更經(jīng)常選用的方法是cDNA序列的分離。分離感興趣的cDNA的標(biāo)準(zhǔn)方法是從高表達(dá)該基因的供體細(xì)胞分離mRNA并進行逆轉(zhuǎn)錄，形成質(zhì)?；蚴删wcDNA文庫。提取mRNA的方法已有多種成熟的技術(shù)，試劑盒也可從商業(yè)途徑獲得(Qiagene)。而構(gòu)建cDNA文庫也是通常的方法(Sambrook，et al.，MolecularCloning，A Laboratory Manual，Cold Spring Harbor Laboratory.New York，1989)。還可得到商業(yè)供應(yīng)的cDNA文庫，如Clontech公司的不同cDNA文庫。當(dāng)結(jié)合使用聚合酶反應(yīng)技術(shù)時，即使極少的表達(dá)產(chǎn)物也能克隆。
可用常規(guī)方法從這些cDNA文庫中篩選本發(fā)明的基因。這些方法包括(但不限于)(1)DNA-DNA或DNA-RNA雜交；(2)標(biāo)志基因功能的出現(xiàn)或喪失；(3)測定人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的轉(zhuǎn)錄本的水平；(4)通過免疫學(xué)技術(shù)或測定生物學(xué)活性，來檢測基因表達(dá)的蛋白產(chǎn)物。上述方法可單用，也可多種方法聯(lián)合應(yīng)用。
在第(1)種方法中，雜交所用的探針是與本發(fā)明的多核苷酸的任何一部分同源，其長度至少10個核苷酸，較好是至少30個核苷酸，更好是至少50個核苷酸，最好是至少100個核苷酸。此外，探針的長度通常在2000個核苷酸之內(nèi)，較佳的為1000個核苷酸之內(nèi)。此處所用的探針通常是在本發(fā)明的基因序列信息的基礎(chǔ)上化學(xué)合成的DNA序列。本發(fā)明的基因本身或者片段當(dāng)然可以用作探針。DNA探針的標(biāo)記可用放射性同位素，熒光素或酶(如堿性磷酸酶)等。
在第(4)種方法中，檢測人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45基因表達(dá)的蛋白產(chǎn)物可用免疫學(xué)技術(shù)如Western印跡法，放射免疫沉淀法，酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)等。
應(yīng)用PCR技術(shù)擴增DNA/RNA的方法(Saiki，et al.Science1985；2301350-1354)被優(yōu)選用于獲得本發(fā)明的基因。特別是很難從文庫中得到全長的cDNA時，可優(yōu)選使用RACE法(RACE-cDNA末端快速擴增法)，用于PCR的引物可根據(jù)本文所公開的本發(fā)明的多核苷酸序列信息適當(dāng)?shù)剡x擇，并可用常規(guī)方法合成?？捎贸Ｒ?guī)方法如通過凝膠電泳分離和純化擴增的DNA/RNA片段。
如上所述得到的本發(fā)明的基因，或者各種DNA片段等的多核苷酸序列可用常規(guī)方法如雙脫氧鏈終止法(Sanger et al.PNAS，1977，745463-5467)測定。這類多核苷酸序列測定也可用商業(yè)測序試劑盒等。為了獲得全長的cDNA序列，測序需反復(fù)進行。有時需要測定多個克隆的cDNA序列，才能拼接成全長的cDNA序列。
本發(fā)明也涉及包含本發(fā)明的多核苷酸的載體，以及用本發(fā)明的載體或直接用人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45編碼序列經(jīng)基因工程產(chǎn)生的宿主細(xì)胞，以及經(jīng)重組技術(shù)產(chǎn)生本發(fā)明所述多肽的方法。
本發(fā)明中，編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸序列可插入到載體中，以構(gòu)成含有本發(fā)明所述多核苷酸的重組載體。術(shù)語“載體”指本領(lǐng)域熟知的細(xì)菌質(zhì)粒、噬菌體、酵母質(zhì)粒、植物細(xì)胞病毒、哺乳動物細(xì)胞病毒如腺病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒或其它載體。在本發(fā)明中適用的載體包括但不限于在細(xì)菌中表達(dá)的基于T7啟動子的表達(dá)載體(Rosenberg，et al.Gene，1987，56125)；在哺乳動物細(xì)胞中表達(dá)的pMSXND表達(dá)載體(Lee and Nathans，J Bio Chem.2633521，1988)和在昆蟲細(xì)胞中表達(dá)的來源于桿狀病毒的載體?？傊?，只要能在宿主體內(nèi)復(fù)制和穩(wěn)定，任何質(zhì)粒和載體都可以用于構(gòu)建重組表達(dá)載體。表達(dá)載體的一個重要特征是通常含有復(fù)制起始點、啟動子、標(biāo)記基因和翻譯調(diào)控元件。
本領(lǐng)域的技術(shù)人員熟知的方法能用于構(gòu)建含編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的DNA序列和合適的轉(zhuǎn)錄/翻譯調(diào)控元件的表達(dá)載體。這些方法包括體外重組DNA技術(shù)、DNA合成技術(shù)、體內(nèi)重組技術(shù)等(Sambroook，et al.Molecular Cloning，aLaboratory Manual，cold Spring Harbor Laboratory.New York，1989)。所述的DNA序列可有效連接到表達(dá)載體中的適當(dāng)啟動子上，以指導(dǎo)mRNA合成。這些啟動子的代表性例子有大腸桿菌的lac或trp啟動子；λ噬菌體的PL啟動子；真核啟動子包括CMV立即早期啟動子、HSV胸苷激酶啟動子、早期和晚期SV40啟動子、反轉(zhuǎn)錄病毒的LTRs和其它一些已知的可控制基因在原核細(xì)胞或真核細(xì)胞或其病毒中表達(dá)的啟動子。表達(dá)載體還包括翻譯起始用的核糖體結(jié)合位點和轉(zhuǎn)錄終止子等。在載體中插入增強子序列將會使其在高等真核細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄得到增強。增強子是DNA表達(dá)的順式作用因子，通常大約有10到300個堿基對，作用于啟動子以增強基因的轉(zhuǎn)錄?？膳e的例子包括在復(fù)制起始點晚期一側(cè)的100到270個堿基對的SV40增強子、在復(fù)制起始點晚期一側(cè)的多瘤增強子以及腺病毒增強子等。
此外，表達(dá)載體優(yōu)選地包含一個或多個選擇性標(biāo)記基因，以提供用于選擇轉(zhuǎn)化的宿主細(xì)胞的表型性狀，如真核細(xì)胞培養(yǎng)用的二氫葉酸還原酶、新霉素抗性以及綠色熒光蛋白(GFP)，或用于大腸桿菌的四環(huán)素或氨芐青霉素抗性等。
本領(lǐng)域一般技術(shù)人員都清楚如何選擇適當(dāng)?shù)妮d體/轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件(如啟動子、增強子等)和選擇性標(biāo)記基因。
本發(fā)明中，編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸或含有該多核苷酸的重組載體可轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)入宿主細(xì)胞，以構(gòu)成含有該多核苷酸或重組載體的基因工程化宿主細(xì)胞。術(shù)語“宿主細(xì)胞”指原核細(xì)胞，如細(xì)菌細(xì)胞；或是低等真核細(xì)胞，如酵母細(xì)胞；或是高等真核細(xì)胞，如哺乳動物細(xì)胞。代表性例子有大腸桿菌，鏈霉菌屬；細(xì)菌細(xì)胞如鼠傷寒沙門氏菌；真菌細(xì)胞如酵母；植物細(xì)胞；昆蟲細(xì)胞如果蠅S2或Sf9；動物細(xì)胞如CHO、COS或Bowes黑素瘤細(xì)胞等。
用本發(fā)明所述的DNA序列或含有所述DNA序列的重組載體轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞可用本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知的常規(guī)技術(shù)進行。當(dāng)宿主為原核生物如大腸桿菌時，能吸收DNA的感受態(tài)細(xì)胞可在指數(shù)生長期后收獲，用CaCl2法處理，所用的步驟在本領(lǐng)域眾所周知?？晒┻x擇的是用MgCl2。如果需要，轉(zhuǎn)化也可用電穿孔的方法進行。當(dāng)宿主是真核生物，可選用如下的DNA轉(zhuǎn)染方法磷酸鈣共沉淀法，或者常規(guī)機械方法如顯微注射、電穿孔、脂質(zhì)體包裝等。
通過常規(guī)的重組DNA技術(shù)，利用本發(fā)明的多核苷酸序列可用來表達(dá)或生產(chǎn)重組的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45(Science，1984；2241431)。一般來說有以下步驟(1).用本發(fā)明的編碼人人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸(或變異體)，或用含有該多核苷酸的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)合適的宿主細(xì)胞；(2).在合適的培養(yǎng)基中培養(yǎng)宿主細(xì)胞；(3).從培養(yǎng)基或細(xì)胞中分離、純化蛋白質(zhì)。
在步驟(2)中，根據(jù)所用的宿主細(xì)胞，培養(yǎng)中所用的培養(yǎng)基可選自各種常規(guī)培養(yǎng)基。在適于宿主細(xì)胞生長的條件下進行培養(yǎng)。當(dāng)宿主細(xì)胞生長到適當(dāng)?shù)募?xì)胞密度后，用合適的方法(如溫度轉(zhuǎn)換或化學(xué)誘導(dǎo))誘導(dǎo)選擇的啟動子，將細(xì)胞再培養(yǎng)一段時間。
在步驟(3)中，重組多肽可包被于細(xì)胞內(nèi)、或在細(xì)胞膜上表達(dá)、或分泌到細(xì)胞外。如果需要，可利用其物理的、化學(xué)的和其它特性通過各種分離方法分離和純化重組的蛋白。這些方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的。這些方法包括但并不限于常規(guī)的復(fù)性處理、蛋白沉淀劑處理(鹽析方法)、離心、滲透破菌、超聲波處理、超離心、分子篩層析(凝膠過濾)、吸附層析、離子交換層析、高效液相層析(HPLC)和其它各種液相層析技術(shù)及這些方法的結(jié)合。
本發(fā)明的多肽以及該多肽的拮抗劑、激動劑和抑制劑可直接用于疾病治療，例如，可治療惡性腫瘤、腎上腺缺乏癥、皮膚病、各類炎癥、HIV感染和免疫性疾病等。
蛋白質(zhì)的糖基化是在細(xì)胞中普遍存在的生理過程。糖蛋白是細(xì)胞膜的組成部分，構(gòu)成細(xì)胞表面抗原，并且分泌蛋白也普遍糖基化。N-乙酰半乳糖苷酶是一種催化O-連接糖基化的酶類，它可以用來治療或預(yù)防各種免疫系統(tǒng)疾病，內(nèi)分泌失常甚至癌癥等疾病。
具體就本發(fā)明人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45來說，其多肽或其一部分可以用來治療或預(yù)防各種免疫系統(tǒng)疾病，包括但不限于類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、免疫復(fù)合物型腎小球腎炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、硬皮病、自身免疫性溶血性貧血、自身免疫性間質(zhì)性腎炎、自身免疫性胃炎、胰島素自身免疫性綜合癥等。
本發(fā)明的多肽或其一部分還可以用來治療或預(yù)防內(nèi)分泌失常導(dǎo)致的疾病，包括但不限于Sheenhan綜合癥、Simond綜合癥、垂體性侏儒癥、呆小癥、黏液水腫、腎上腺皮質(zhì)功能低下癥、糖尿病等。
本發(fā)明的多肽或其一部分還可以用來治療或預(yù)防癌癥，例如上皮細(xì)胞腫瘤等。
本發(fā)明還可以用于人工合成糖基化的多肽，這些多肽可以應(yīng)用于藥用制品或其他商業(yè)應(yīng)用中。
本發(fā)明也提供了篩選化合物以鑒定提高(激動劑)或阻遏(拮抗劑)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的藥劑的方法。激動劑提高人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45刺激細(xì)胞增殖等生物功能，而拮抗劑阻止和治療與細(xì)胞過度增殖有關(guān)的紊亂如各種癌癥。例如，能在藥物的存在下，將哺乳動物細(xì)胞或表達(dá)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的膜制劑與標(biāo)記的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45一起培養(yǎng)。然后測定藥物提高或阻遏此相互作用的能力。
人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的拮抗劑包括篩選出的抗體、化合物、受體缺失物和類似物等。人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的拮抗劑可以與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合并消除其功能，或是抑制該多肽的產(chǎn)生，或是與該多肽的活性位點結(jié)合使該多肽不能發(fā)揮生物學(xué)功能。
在篩選作為拮抗劑的化合物時，可以將人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45加入生物分析測定中，通過測定化合物對人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45和其受體之間相互作用的影響來確定化合物是否是拮抗劑。用上述篩選化合物的同樣方法，可以篩選出起拮抗劑作用的受體缺失物和類似物。能與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合的多肽分子可通過篩選由各種可能組合的氨基酸結(jié)合于固相物組成的隨機多肽庫而獲得。篩選時，一般應(yīng)對人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45分子進行標(biāo)記。
本發(fā)明提供了用多肽，及其片段、衍生物、類似物或它們的細(xì)胞作為抗原以生產(chǎn)抗體的方法。這些抗體可以是多克隆抗體或單克隆抗體。本發(fā)明還提供了針對人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45抗原決定簇的抗體。這些抗體包括(但不限于)多克隆抗體、單克隆抗體、嵌合抗體、單鏈抗體、Fab片段和Fab表達(dá)文庫產(chǎn)生的片段。
多克隆抗體的生產(chǎn)可用人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45直接注射免疫動物(如家兔，小鼠，大鼠等)的方法得到，多種佐劑可用于增強免疫反應(yīng)，包括但不限于弗氏佐劑等。制備人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的單克隆抗體的技術(shù)包括但不限于雜交瘤技術(shù)(Kohler and Milstein.Nature，1975，256495-497)，三瘤技術(shù)，人B-細(xì)胞雜交瘤技術(shù)，EBV-雜交瘤技術(shù)等。將人恒定區(qū)和非人源的可變區(qū)結(jié)合的嵌合抗體可用已有的技術(shù)生產(chǎn)(Morrison et al，PNAS，1985，816851)。而已有的生產(chǎn)單鏈抗體的技術(shù)(U.S.Pat No.4946778)也可用于生產(chǎn)抗人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的單鏈抗體。
抗人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的抗體可用于免疫組織化學(xué)技術(shù)中，檢測活檢標(biāo)本中的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45。
與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合的單克隆抗體也可用放射性同位素標(biāo)記，注入體內(nèi)可跟蹤其位置和分布。這種放射性標(biāo)記的抗體可作為一種非創(chuàng)傷性診斷方法用于腫瘤細(xì)胞的定位和判斷是否有轉(zhuǎn)移。
抗體還可用于設(shè)計針對體內(nèi)某一特殊部位的免疫毒素。如人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45高親和性的單克隆抗體可與細(xì)菌或植物毒素(如白喉毒素，蓖麻蛋白，紅豆堿等)共價結(jié)合。一種通常的方法是用巰基交聯(lián)劑如SPDP，攻擊抗體的氨基，通過二硫鍵的交換，將毒素結(jié)合于抗體上，這種雜交抗體可用于殺滅人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45陽性的細(xì)胞。
本發(fā)明中的抗體可用于治療或預(yù)防與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45相關(guān)的疾病。給予適當(dāng)劑量的抗體可以刺激或阻斷人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的產(chǎn)生或活性。
本發(fā)明還涉及定量和定位檢測人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45水平的診斷試驗方法。這些試驗是本領(lǐng)域所熟知的，且包括FISH測定和放射免疫測定。試驗中所檢測的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45水平，可以用作解釋人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45在各種疾病中的重要性和用于診斷人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45起作用的疾病。
本發(fā)明的多肽還可用作肽譜分析，例如，多肽可用物理的、化學(xué)或酶進行特異性切割，并進行一維或二維或三維的凝膠電泳分析，更好的是進行質(zhì)譜分析。
編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸也可用于多種治療目的?；蛑委熂夹g(shù)可用于治療由于人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的無表達(dá)或異常/無活性表達(dá)所致的細(xì)胞增殖、發(fā)育或代謝異常。重組的基因治療載體(如病毒載體)可設(shè)計用于表達(dá)變異的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，以抑制內(nèi)源性的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45活性。例如，一種變異的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45可以是縮短的、缺失了信號傳導(dǎo)功能域的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，雖可與下游的底物結(jié)合，但缺乏信號傳導(dǎo)活性。因此重組的基因治療載體可用于治療人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45表達(dá)或活性異常所致的疾病。來源于病毒的表達(dá)載體如逆轉(zhuǎn)錄病毒、腺病毒、腺病毒相關(guān)病毒、單純皰疹病毒、細(xì)小病毒等可用于將編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。構(gòu)建攜帶編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸的重組病毒載體的方法可見于已有文獻(Sambrook，et al.)。另外重組編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸可包裝到脂質(zhì)體中轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi)。
多核苷酸導(dǎo)入組織或細(xì)胞內(nèi)的方法包括將多核苷酸直接注入到體內(nèi)組織中；或在體外通過載體(如病毒、噬菌體或質(zhì)粒等)先將多核苷酸導(dǎo)入細(xì)胞中，再將細(xì)胞移植到體內(nèi)等。
抑制人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45mRNA的寡核苷酸(包括反義RNA和DNA)以及核酶也在本發(fā)明的范圍之內(nèi)。核酶是一種能特異性分解特定RNA的酶樣RNA分子，其作用機制是核酶分子與互補的靶RNA特異性雜交后進行核酸內(nèi)切作用。反義的RNA和DNA及核酶可用已有的任何RNA或DNA合成技術(shù)獲得，如固相磷酸酰胺化學(xué)合成法合成寡核苷酸的技術(shù)已廣泛應(yīng)用。反義RNA分子可通過編碼該RNA的DNA序列在體外或體內(nèi)轉(zhuǎn)錄獲得。這種DNA序列已整合到載體的RNA聚合酶啟動子的下游。為了增加核酸分子的穩(wěn)定性，可用多種方法對其進行修飾，如增加兩側(cè)的序列長度，核糖核苷之間的連接應(yīng)用磷酸硫酯鍵或肽鍵而非磷酸二酯鍵。
編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸可用于與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的相關(guān)疾病的診斷。編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸可用于檢測人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的表達(dá)與否或在疾病狀態(tài)下人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的異常表達(dá)。如編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的DNA序列可用于對活檢標(biāo)本進行雜交以判斷人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的表達(dá)狀況。雜交技術(shù)包括Southern印跡法，Northern印跡法、原位雜交等。這些技術(shù)方法都是公開的成熟技術(shù)，相關(guān)的試劑盒都可從商業(yè)途徑得到。本發(fā)明的多核苷酸的一部分或全部可作為探針固定在微陣列(Microarray)或DNA芯片(又稱為“基因芯片”)上，用于分析組織中基因的差異表達(dá)分析和基因診斷。用人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45特異的引物進行RNA-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)體外擴增也可檢測人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
檢測人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45基因的突變也可用于診斷人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45相關(guān)的疾病。人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45突變的形式包括與正常野生型人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45DNA序列相比的點突變、易位、缺失、重組和其它任何異常等?？捎靡延械募夹g(shù)如Southern印跡法、DNA序列分析、PCR和原位雜交檢測突變。另外，突變有可能影響蛋白的表達(dá)，因此用Northern印跡法、Western印跡法可間接判斷基因有無突變。
本發(fā)明的序列對染色體鑒定也是有價值的。該序列會特異性地針對某條人染色體具體位置且并可以與其雜交。目前，需要鑒定染色體上的各基因的具體位點?，F(xiàn)在，只有很少的基于實際序列數(shù)據(jù)(重復(fù)多態(tài)性)的染色體標(biāo)記物可用于標(biāo)記染色體位置。根據(jù)本發(fā)明，為了將這些序列與疾病相關(guān)基因相關(guān)聯(lián)，其重要的第一步就是將這些DNA序列定位于染色體上。
簡而言之，根據(jù)cDNA制備PCR引物(優(yōu)選15-35bp)，可以將序列定位于染色體上。然后，將這些引物用于PCR篩選含各條人染色體的體細(xì)胞雜合細(xì)胞。只有那些含有相應(yīng)于引物的人基因的雜合細(xì)胞會產(chǎn)生擴增的片段。
體細(xì)胞雜合細(xì)胞的PCR定位法，是將DNA定位到具體染色體的快捷方法。使用本發(fā)明的寡核苷酸引物，通過類似方法，可利用一組來自特定染色體的片段或大量基因組克隆而實現(xiàn)亞定位?？捎糜谌旧w定位的其它類似策略包括原位雜交、用標(biāo)記的流式分選的染色體預(yù)篩選和雜交預(yù)選，從而構(gòu)建染色體特異的cDNA庫。
將cDNA克隆與中期染色體進行熒光原位雜交(FISH)，可以在一個步驟中精確地進行染色體定位。此技術(shù)的綜述，參見Verma等，Human Chromosomesa Manualof Basic Techniques，Pergamon Press，New York(1988)。
一旦序列被定位到準(zhǔn)確的染色體位置，此序列在染色體上的物理位置就可以與基因圖數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)。這些數(shù)據(jù)可見于例如，V.Mckusick，Mendelian Inheritancein Man(可通過與Johns Hopkins University Welch Medical Library聯(lián)機獲得)。然后可通過連鎖分析，確定基因與業(yè)已定位到染色體區(qū)域上的疾病之間的關(guān)系。
接著，需要測定患病和未患病個體間的cDNA或基因組序列差異。如果在一些或所有的患病個體中觀察到某突變，而該突變在任何正常個體中未觀察到，則該突變可能是疾病的病因。比較患病和未患病個體，通常涉及首先尋找染色體中結(jié)構(gòu)的變化，如從染色體水平可見的或用基于cDNA序列的PCR可檢測的缺失或易位。根據(jù)目前的物理作圖和基因定位技術(shù)的分辨能力，被精確定位至與疾病有關(guān)的染色體區(qū)域的cDNA，可以是50至500個潛在致病基因間之一種(假定1兆堿基作圖分辨能力和每20kb對應(yīng)于一個基因)。
可以將本發(fā)明的多肽、多核苷酸及其模擬物、激動劑、拮抗劑和抑制劑與合適的藥物載體組合后使用。這些載體可以是水、葡萄糖、乙醇、鹽類、緩沖液、甘油以及它們的組合。組合物包含安全有效量的多肽或拮抗劑以及不影響藥物效果的載體和賦形劑。這些組合物可以作為藥物用于疾病治療。
本發(fā)明還提供含有一種或多種容器的藥盒或試劑盒，容器中裝有一種或多種本發(fā)明的藥用組合物成分。與這些容器一起，可以有由制造、使用或銷售藥品或生物制品的政府管理機構(gòu)所給出的指示性提示，該提示反映出生產(chǎn)、使用或銷售的政府管理機構(gòu)許可其在人體上施用。此外，本發(fā)明的多肽可以與其它的治療化合物結(jié)合使用。
藥物組合物可以以方便的方式給藥，如通過局部、靜脈內(nèi)、腹膜內(nèi)、肌內(nèi)、皮下、鼻內(nèi)或皮內(nèi)的給藥途徑。人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45以有效地治療和/或預(yù)防具體的適應(yīng)癥的量來給藥。施用于患者的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的量和劑量范圍將取決于許多因素，如給藥方式、待治療者的健康條件和診斷醫(yī)生的判斷。


下列附圖用于說明本發(fā)明的具體實施方案，而不用于限定由權(quán)利要求書所界定的本發(fā)明范圍。
圖1是本發(fā)明人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45和豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因的氨基酸序列同源性比較圖。上方序列是人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，下方序列是豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因。相同氨基酸在兩個序列間用單字符氨基酸表示，相似氨基酸用“+”表示。
圖2為分離的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的聚丙烯酰胺凝膠電泳圖(SDS-PAGE)。45kDa為蛋白質(zhì)的分子量。箭頭所指為分離出的蛋白條帶。
具體實施例方式
下面結(jié)合具體實施例，進一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解，這些實施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實施例中未注明具體條件的實驗方法，通常按照常規(guī)條件如Sambrook等人，分子克隆實驗室手冊(New YorkCold SpringHarbor Laboratory Press，1989)中所述的條件，或按照制造廠商所建議的條件。
實施例1人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的克隆用異硫氰酸胍/酚/氯仿一步法提取人胎腦總RNA。用Quik mRNA Isolation Kit(Qiegene公司產(chǎn)品)從總RNA中分離poly(A)mRNA。2ug poly(A)mRNA經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄形成cDNA。用Smart cDNA克隆試劑盒(購自Clontech)將cDNA片段定向插入到pBSK(+)載體(Clontech公司產(chǎn)品)的多克隆位點上，轉(zhuǎn)化DH5α，細(xì)菌形成cDNA文庫。用Dyeterminate cycle reaction sequencing kit(Perkin-Elmer公司產(chǎn)品)和ABI 377自動測序儀(Perkin-Elmer公司)測定所有克隆的5′和3′末端的序列。將測定的cDNA序列與已有的公共DNA序列數(shù)據(jù)庫(Genebank)進行比較，結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中一個克隆0015B11的cDNA序列為新的DNA。通過合成一系列引物對該克隆所含的插入cDNA片段進行雙向測定。結(jié)果表明，0015B11克隆所含的全長cDNA為2466bp(如<210>1所示)，從第51bp至1274bp有一個1224bp的開放閱讀框架(ORF)，編碼一個新的蛋白質(zhì)(如<210>2所示)。我們將此克隆命名為pBS-0015B11，編碼的蛋白質(zhì)命名為人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45。
實施例2cDNA克隆的同源檢索將本發(fā)明的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的序列及其編碼的蛋白序列，用Blast程序(Basiclocal Alignment search tool)[Altschul，SF et al.J.Mol.Biol.1990；215403-10]，在Genbank、Swissport等數(shù)據(jù)庫進行同源檢索。與本發(fā)明的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45同源性最高的基因是一種已知的豬N-乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶基因，其編碼的蛋白在Genbank的準(zhǔn)入號為{同源蛋白號}。蛋白質(zhì)同源結(jié)果示于圖1，兩者高度同源，其相同性為75％；相似性為88％。
實施例3用RT-PCR方法克隆編碼人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的基因用胎腦細(xì)胞總RNA為模板，以oligo-dT為引物進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA，用Qiagene的試劑盒純化后，用下列引物進行PCR擴增Primer15’-GAGATGACTTCAGTGAGAGAG-3’(<210>3)Primer25’-CGGTGTCAGAAACACTTTATT-3’(<210>4)Primer1為位于<210>1的5’端的第1bp開始的正向序列；Primer2為<210>1的中的3’端反向序列。
擴增反應(yīng)的條件在50μl的反應(yīng)體積中含有50mmol/L KCl，10mmol/LTris-Cl，(pH8.5)，1.5mmol/L MgCl2，200μmol/L dNTP，10pmol引物，1U的Taq DNA聚合酶(Clontech公司產(chǎn)品)。在PE9600型DNA熱循環(huán)儀(Perkin-Elmer公司)上按下列條件反應(yīng)25個周期94℃ 30sec；55℃ 30sec；72℃ 2min。在RT-PCR時同時設(shè)β-actin為陽性對照和模板空白為陰性對照。擴增產(chǎn)物用QIAGEN公司的試劑盒純化，用TA克隆試劑盒連接到pCR載體上(Invitrogen公司產(chǎn)品)。DNA序列分析結(jié)果表明PCR產(chǎn)物的DNA序列與<210>1所示的1-2466bp完全相同。
實施例4Northern印跡法分析人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45基因的表達(dá)用一步法提取總RNA[Anal.Biochem 1987，162，156-159]。該法包括酸性硫氰酸胍苯酚-氯仿抽提。即用4M異硫氰酸胍-25mM檸檬酸鈉，0.2M乙酸鈉(pH4.0)對組織進行勻漿，加入1倍體積的苯酚和1/5體積的氯仿-異戊醇(49∶1)，混合后離心。吸出水相層，加入異丙醇(0.8體積)并將混合物離心得到RNA沉淀。將得到的RNA沉淀用70％乙醇洗滌，干燥并溶于水中。用20μg RNA，在含20mM 3-(N-嗎啉代)丙磺酸(pH7.0)-5mM乙酸鈉-1mM EDTA-2.2M甲醛的1.2％瓊脂糖凝膠上進行電泳。然后轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上。用α-32P dATP通過隨機引物法制備32P-標(biāo)記的DNA探針。所用的DNA探針為圖1所示的PCR擴增的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45編碼區(qū)序列(51bp至1274bp)。將32P-標(biāo)記的探針(約2×106cpm/ml)與轉(zhuǎn)移了RNA的硝酸纖維素膜在一溶液中于42℃雜交過夜，該溶液包含50％甲酰胺-25mM KH2PO4(pH7.4)-5×SSC-5×Denhardt’s溶液和200μg/ml鮭精DNA。雜交之后，將濾膜在1×SSC-0.1％SDS中于55℃洗30min。然后，用Phosphor Imager進行分析和定量。
實施例5重組人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的體外表達(dá)、分離和純化根據(jù)<210>1和圖1所示的編碼區(qū)序列，設(shè)計出一對特異性擴增引物，序列如下Primer35’-CCCCATATGATGGCCCGATTTTCCAAAGTG-3’(<210>5)Primer45’-CCCGAATTCCTAGGAGTTGGCATGGTGGTT-3’(<210>6)此兩段引物的5’端分別含有NdeI和EcoRI酶切位點，其后分別為目的基因5’端和3’端的編碼序列，NdeI和EcoRI酶切位點相應(yīng)于表達(dá)載體質(zhì)粒pET-28b(+)(Novagen公司產(chǎn)品，Cat.No.69865.3)上的選擇性內(nèi)切酶位點。以含有全長目的基因的pBS-0015B11質(zhì)粒為模板，進行PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)條件為總體積50μl中含pBS-0015B11質(zhì)粒10pg、引物Primer-3和Primer-4分別為10pmol、Advantage polymerase Mix(Clontech公司產(chǎn)品)1μl。循環(huán)參數(shù)94℃ 20s，60℃ 30s，68℃ 2min，共25個循環(huán)。用NdeI和EcoRI分別對擴增產(chǎn)物和質(zhì)粒pET-28(+)進行雙酶切，分別回收大片段，并用T4連接酶連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化用氯化鈣法大腸桿細(xì)菌DH5α，在含卡那霉素(終濃度30μg/ml)的LB平板培養(yǎng)過夜后，用菌落PCR方法篩選陽性克隆，并進行測序。挑選序列正確的陽性克隆(pET-0015B11)用氯化鈣法將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)plySs(Novagen公司產(chǎn)品)。在含卡那霉素(終濃度30μg/ml)的LB液體培養(yǎng)基中，宿主菌BL21(pET-0015B11)在37℃培養(yǎng)至對數(shù)生長期，加入IPTG至終濃度1mmol/L，繼續(xù)培養(yǎng)5小時。離心收集菌體，經(jīng)超聲波破菌，離心收集上清，用能與6個組氨酸(6His-Tag)結(jié)合的親和層析柱His.Bind Quick Cartridge(Novagen公司產(chǎn)品)進行層析，得到了純化的目的蛋白人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45。經(jīng)SDS-PAGE電泳，在45kDa處得到一單一的條帶(圖2)。將該條帶轉(zhuǎn)移至PVDF膜上用Edams水解法進行N-端氨基酸序列分析，結(jié)果N-端15個氨基酸與<210>2所示的N-端15個氨基酸殘基完全相同。
實施例6抗人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45抗體的產(chǎn)生用多肽合成儀(PE公司產(chǎn)品)合成下述人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45特異性的多肽NH2-Met-Ala-Arg-Phe-Ser-Lys-Val-Arg-Ile-Val-Arg-Thr-Lys-Lys-Arg-COOH將該多肽分別與血藍(lán)蛋白和牛血清白蛋白耦合形成復(fù)合，方法參見Avrameas，etal.Immunochemistry，1969；643。用4mg上述血藍(lán)蛋白多肽復(fù)合物加上完全弗氏佐劑免疫家兔，15天后再用血藍(lán)蛋白多肽復(fù)合物加不完全弗氏佐劑加強免疫一次。采用經(jīng)15μg/ml牛血清白蛋白多肽復(fù)合物包被的滴定板做ELISA測定兔血清中抗體的滴度。用蛋白A-Sepharose從抗體陽性的家兔血清中分離總IgG。將多肽結(jié)合于溴化氰活化的Sepharose4B柱上，用親和層析法從總IgG中分離抗多肽抗體。免疫沉淀法證明純化的抗體可特異性地與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45結(jié)合。
序列表<110>上海博德基因開發(fā)有限公司<120>一種多肽--人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45和編碼這種多肽的多核苷酸<130>0015b11<160>6<170>PatentIn version 3.1<210>1<211>2040<212>DNA<213>Homo sapiens<220><221>CDS<222>(51)..(1274)<223><400>1gagatgactt cagtgagaga gaacacctga aggataaatt ggaagaatac atg gcc 56Met Ala1cga ttt tcc aaa gtg agg att gtt cgc acc aag aaa aga gaa gga ctc 104Arg Phe Ser Lys Val Arg Ile Val Arg Thr Lys Lys Arg Glu Gly Leu5 10 15atc cgg acc cgt ctc ctg ggg gca tct atg gcc aga gga gaa gtc ctg 152Ile Arg Thr Arg Leu Leu Gly Ala Ser Met Ala Arg Gly Glu Val Leu20 25 30aca ttc ctg gac tcc cac tgc gag gtc aat gtg aac tgg ctg ccc cca 200Thr Phe Leu Asp Ser His Cys Glu Val Asn Val Asn Trp Leu Pro Pro35 40 45 50ctc ctc aac caa att gca cta aac cac aaa acc atc gtg tgt ccc atg 248Leu Leu Asn Gln Ile Ala Leu Asn His Lys Thr Ile Val Cys Pro Met55 60 65atc gat gtc att gac cac aat cacttc ggg tat gag gca caa gct ggg 296Ile Asp Val Ile Asp His Asn His Phe Gly Tyr Glu Ala Gln Ala Gly70 75 80gat gcc atg cga gga gcc ttc gac tgg gaa atg tac tac aaa aga atc 344Asp Ala Met Arg Gly Ala Phe Asp Trp Glu Met Tyr Tyr Lys Arg Ile85 90 95ccc atc cct cca gag ctc cag agg gca gat ccc agc gac cct ttt gag 392Pro Ile Pro Pro Glu Leu Gln Arg Ala Asp Pro Ser Asp Pro Phe Glu100 105 110tct cct gtt atg gct gga ggt ctc ttt gct gtg gat cgg aaa tgg ttt 440Ser Pro Val Met Ala Gly Gly Leu Phe Ala Val Asp Arg Lys Trp Phe115 120 125 130tgg gaa ttg ggt ggc tat gat cca ggt tta gaa atc tgg gga gga gaa 488Trp Glu Leu Gly Gly Tyr Asp Pro Gly Leu Glu Ile Trp Gly Gly Glu135 140 145cag tat gaa atc tct ttt aag gtt tgg atg tgt gga gga gaa atg ttt 536Gln Tyr Glu Ile Ser Phe Lys Val Trp Met Cys Gly Gly Glu Met Phe150 155 160gat gtt cca tgt tct aga gtt ggt cat atc tac agg aag tac gtt cca 584Asp Val Pro Cys Ser Arg Val Gly His Ile Tyr Arg Lys Tyr Val Pro165 170 175tac aaa gtt cca tct ggg aca agc ctg gca aga aac ctg aag cgg gta 632Tyr Lys Val Pro Ser Gly Thr Ser Leu Ala Arg Asn Leu Lys Arg Val180 185 190gct gag acc tgg atg gat gaa ttt gcc gag tac att tac cag cgg cgg 680Ala Glu Thr Trp Met Asp Glu Phe Ala Glu Tyr Ile Tyr Gln Arg Arg195 200 205 210ccg gag tac agg cat ctc tcc acg ggg gac atc tct gcc cag aag gag 728Pro Glu Tyr Arg His Leu Ser Thr Gly Asp Ile Ser Ala Gln Lys Glu215 220 225ctg cgc aag cag ctc aag tgc aag gac ttc aaa tgg ttc atg gct gct 776Leu Arg Lys Gln Leu Lys Cys Lys Asp Phe Lys Trp Phe Met Ala Ala
230 235 240gtg gcc tgg gac gtg cct aaa tac tac cct cca gtg gag ccc ccg cct 824Val Ala Trp Asp Val Pro Lys Tyr Tyr Pro Pro Val Glu Pro Pro Pro245 250 255gct gcc tgg ggg gag atc cga aat gtg gca gca aat ctc tgt gtg gac 872Ala Ala Trp Gly Glu Ile Arg Asn Val Ala Ala Asn Leu Cys Val Asp260 265 270agc aag cat gga gcc acc gga aca gag ctg agg ctg gac atc tgt gtc 920Ser Lys His Gly Ala Thr Gly Thr Glu Leu Arg Leu Asp Ile Cys Val275 280 285 290aag gat ggt tct gaa aga aca tgg tct cat gaa cag ctt ttt acc ttt 968Lys Asp Gly Ser Glu Arg Thr Trp Ser His Glu Gln Leu Phe Thr Phe295 300 305gga tgg aga gaa gat att cga ccc ggt gag cca ctg cat acc cgg aaa1016Gly Trp Arg Glu Asp Ile Arg Pro Gly Glu Pro Leu His Thr Arg Lys310 315 320ttc tgc ttt gat gcg atc tca cac aac agc ccc gtt aca ctc tat gac1064Phe Cys Phe Asp Ala Ile Ser His Asn Ser Pro Val Thr Leu Tyr Asp325 330 335tgt cat ggc atg aag ggg aac cag ctc tgg gga tac cgg aag gac aga1112Cys His Gly Met Lys Gly Asn Gln Leu Trp Gly Tyr Arg Lys Asp Arg340 345 350aca tta ttc cat cct gtg agc aac agc tgc atg gat tgc aac ccc gca1160Thr Leu Phe His Pro Val Ser Asn Ser Cys Met Asp Cys Asn Pro Ala355 360 365 370gag aag aag att ttc atg gcc aga tgt gac cct ctc tct gag act cag1208Glu Lys Lys Ile Phe Met Ala Arg Cys Asp Pro Leu Ser Glu Thr Gln375 380 385cag tgg att ttt gaa cac att aat atg act gtt tta gaa aaa ttt aac1256Gln Trp Ile Phe Glu His Ile Asn Met Thr Val Leu Glu Lys Phe Asn390 395 400cac cat gcc aac tcc tag aaagaagaaa ggaagaaaga gtgattacct1304His His Ala Asn Ser405acaggttata aattaaattt tagccagcat ctgggtcgaa ggagtcagga ataacatttc 1364ctcgatccag gaaggctggt ttaaaaattt gcaaatgcca tgtcaaagta ggttgttttg 1424aagaacttcc tgcatctgaa gaacttggct gagaatctca ccagctgctt ctgagaactc 1484gagactagca gttcccttgc tggccaaggg caaagataat ttagggactt ttcaaaacaa 1544ctgctgagct aataaatcct agcatttctc aggtcaaatc ctgcagtagt gagtagctat 1604gaatggatcc tattaactgg gtgggagggg ggtgaaaatg gagtgcatga ctgctctgac 1664aacctgaggg tatcacaggt ttagaactag ccaagcttaa ggggtgagct gtactctttg 1724gtgccattct ctgactaaga atgggttcag caggtttaac ccttaaaagt gctgcagatg 1784atttcagagt gctcacacta ttctgttttt tttattttta tttttaaatg agggtgcaat 1844atctaatgta agacttaaat tacataatga aatggacatc cagtgttccc attctttcgt 1904ttatatttgc catttttttt tcagagcaaa gtttcttttt tatgaaagtt catgctccat 1964gaatccactg aatttctaat tcagtgccct tctatgaatc cagttaaaaa caaaagcaaa 2024agcaaaaatc tatgct 2040<210>2<211>407<212>PRT<213>Homo sapiens<400>2Met Ala Arg Phe Ser Lys Val Arg Ile Val Arg Thr Lys Lys Arg Glu1 5 10 15Gly Leu Ile Arg Thr Arg Leu Leu Gly Ala Ser Met Ala Arg Gly Glu
20 25 30Val Leu Thr Phe Leu Asp Ser His Cys Glu Val Asn Val Asn Trp Leu35 40 45Pro Pro Leu Leu Asn Gln Ile Ala Leu Asn His Lys Thr Ile Val Cys50 55 60Pro Met Ile Asp Val Ile Asp His Asn His Phe Gly Tyr Glu Ala Gln65 70 75 80Ala Gly Asp Ala Met Arg Gly Ala Phe Asp Trp Glu Met Tyr Tyr Lys85 90 95Arg Ile Pro Ile Pro Pro Glu Leu Gln Arg Ala Asp Pro Ser Asp Pro100 105 110Phe Glu Ser Pro Val Met Ala Gly Gly Leu Phe Ala Val Asp Arg Lys115 120 125Trp Phe Trp Glu Leu Gly Gly Tyr Asp Pro Gly Leu Glu Ile Trp Gly130 135 140Gly Glu Gln Tyr Glu Ile Ser Phe Lys Val Trp Met Cys Gly Gly Glu145 150 155 160Met Phe Asp Val Pro Cys Ser Arg Val Gly His Ile Tyr Arg Lys Tyr165 170 175Val Pro Tyr Lys Val Pro Ser Gly Thr Ser Leu Ala Arg Asn Leu Lys180 185 190Arg Val Ala Glu Thr Trp Met Asp Glu Phe Ala Glu Tyr Ile Tyr Gln195 200 205Arg Arg Pro Glu Tyr Arg His Leu Ser Thr Gly Asp Ile Ser Ala Gln210 215 220Lys Glu Leu Arg Lys Gln Leu Lys Cys Lys Asp Phe Lys Trp Phe Met225 230 235 240Ala Ala Val Ala Trp Asp Val Pro Lys Tyr Tyr Pro Pro Val Glu Pro
245 250 255Pro Pro Ala Ala Trp Gly Glu Ile Arg Asn Val Ala Ala Asn Leu Cys260 265 270Val Asp Ser Lys His Gly Ala Thr Gly Thr Glu Leu Arg Leu Asp Ile275 280 285Cys Val Lys Asp Gly Ser Glu Arg Thr Trp Ser His Glu Gln Leu Phe290 295 300Thr Phe Gly Trp Arg Glu Asp Ile Arg Pro Gly Glu Pro Leu His Thr305 310 315 320Arg Lys Phe Cys Phe Asp Ala Ile Ser His Asn Ser Pro Val Thr Leu325 330 335Tyr Asp Cys His Gly Met Lys Gly Asn Gln Leu Trp Gly Tyr Arg Lys340 345 350Asp Arg Thr Leu Phe His Pro Val Ser Asn Ser Cys Met Asp Cys Asn355 360 365Pro Ala Glu Lys Lys Ile Phe Met Ala Arg Cys Asp Pro Leu Ser Glu370 375 380Thr Gln Gln Trp Ile Phe Glu His Ile Asn Met Thr Val Leu Glu Lys385 390 395 400Phe Asn His His Ala Asn Ser405<210>3<211>21<212>DNA<213>Homo sapiens<400>3gagatgactt cagtgagaga g 21<210>4<211>21<212>DNA<213>Homo sapiens<400>4cggtgtcaga aacactttat t 21<210>5<211>30<212>DNA<213>Homo sapiens<400>5ccccatatga tggcccgatt ttccaaagtg 30<210>6<211>30<212>DNA<213>Homo sapiens<400>6cccgaattcc taggagttgg catggtggtt 30
權(quán)利要求
1.一種分離的多肽-人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，其特征在于它包含有<210>2所示的氨基酸序列的多肽、或其多肽的活性片段、類似物或衍生物。
2.如權(quán)利要求1所述的多肽，其特征在于所述多肽、類似物或衍生物的氨基酸序列具有與<210>2所示的氨基酸序列至少95％的相同性。
3.如權(quán)利要求2所述的多肽，其特征在于它包含具有<210>2所示的氨基酸序列的多肽。
4.一種分離的多核苷酸，其特征在于所述多核苷酸包含選自下組中的一種(a)編碼具有<210>2所示氨基酸序列的多肽或其片段、類似物、衍生物的多核苷酸；(b)與多核苷酸(a)互補的多核苷酸；或(c)與(a)或(b)有至少70％相同性的多核苷酸。
5.如權(quán)利要求4所述的多核苷酸，其特征在于所述多核苷酸包含編碼具有<210>2所示氨基酸序列的多核苷酸。
6.如權(quán)利要求4所述的多核苷酸，其特征在于所述多核苷酸的序列包含有<210>1中51-1274位的序列或<210>1中1-2466位的序列。
7.一種含有外源多核苷酸的重組載體，其特征在于它是由權(quán)利要求4-6中的任一權(quán)利要求所述多核苷酸與質(zhì)粒、病毒或運載體表達(dá)載體構(gòu)建而成的重組載體。
8.一種含有外源多核苷酸的遺傳工程化宿主細(xì)胞，其特征在于它是選自于下列一種宿主細(xì)胞(a)用權(quán)利要求7所述的重組載體轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞；或(b)用權(quán)利要求4-6中的任一權(quán)利要求所述多核苷酸轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)導(dǎo)的宿主細(xì)胞。
9.一種具有人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45活性的多肽的制備方法，其特征在于所述方法包括(a)在表達(dá)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45條件下，培養(yǎng)權(quán)利要求8所述的工程化宿主細(xì)胞；(b)從培養(yǎng)物中分離出具有人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45活性的多肽。
10.一種能與多肽結(jié)合的抗體，其特征在于所述抗體是能與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45特異性結(jié)合的抗體。
11.一類模擬或調(diào)節(jié)多肽活性或表達(dá)的化合物，其特征在于它們是模擬、促進、拮抗或抑制人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的活性的化合物。
12.如權(quán)利要求11所述的化合物，其特征在于它是<210>1所示的多核苷酸序列或其片段的反義序列。
13.一種權(quán)利要求11所述化合物的應(yīng)用，其特征在于所述化合物用于調(diào)節(jié)人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45在體內(nèi)、體外活性的方法。
14.一種檢測與權(quán)利要求1-3中的任一權(quán)利要求所述多肽相關(guān)的疾病或疾病易感性的方法，其特征在于其包括檢測所述多肽的表達(dá)量，或者檢測所述多肽的活性，或者檢測多核苷酸中引起所述多肽表達(dá)量或活性異常的核苷酸變異。
15.如權(quán)利要求1-3中的任一權(quán)利要求所述多肽的應(yīng)用，其特征在于它應(yīng)用于篩選人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的模擬物、激動劑，拮抗劑或抑制劑；或者用于肽指紋圖譜鑒定。
16.如權(quán)利要求4-6中的任一權(quán)利要求所述的核酸分子的應(yīng)用，其特征在于它作為引物用于核酸擴增反應(yīng)，或者作為探針用于雜交反應(yīng)，或者用于制造基因芯片或微陣列。
17.如權(quán)利要求1-6及11中的任一權(quán)利要求所述的多肽、多核苷酸或化合物的應(yīng)用，其特征在于用所述多肽、多核苷酸或其模擬物、激動劑、拮抗劑或抑制劑以安全有效劑量與藥學(xué)上可接受的載體組成作為診斷或治療與人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45異常相關(guān)的疾病的藥物組合物。
18.權(quán)利要求1-6及11中的任一權(quán)利要求所述的多肽、多核苷酸或化合物的應(yīng)用，其特征在于用所述多肽、多核苷酸或化合物制備用于治療如惡性腫瘤，血液病，HIV感染和免疫性疾病和各類炎癥的藥物。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種多肽—人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45，編碼此多肽的多核苷酸和經(jīng)DNA重組技術(shù)產(chǎn)生這種多肽的方法。本發(fā)明還公開了此多肽用于治療多種疾病的方法，如惡性腫瘤，血液病，HIV感染和免疫性疾病和各類炎癥等。本發(fā)明還公開了抗此多肽的拮抗劑及其治療作用。本發(fā)明還公開了編碼這種新的人乙酰半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶45的多核苷酸的用途。
文檔編號C12N15/54GK1485424SQ0213721
公開日2004年3月31日 申請日期2002年9月27日 優(yōu)先權(quán)日2002年9月27日
發(fā)明者毛裕民, 謝毅 申請人:上海博德基因開發(fā)有限公司