專利名稱：一段白色念珠菌dna序列的特異性確定及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌(Candida albicans)DNA序列的特異性確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
本發(fā)明的技術(shù)方案為本發(fā)明利用現(xiàn)有的方法確定了長度為241bp的一段白色念珠菌(Candida albicans)特異DNA序列及其PCR引物，用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，其序列如下1 gagaccaact ggttgggaaa aacaagattt acaattataa tgatttgttt gtttgtttgc61 tttatattta tggtttggta taagttagat agtctagttt gatagtcttg tttgattgtt121 tatatatgta tagatttaat ggtttgcttt gttttatgag tttttttgat atctggagta181 gttaaagact catctttgag aaataggaga ccaaacttgt tgagttacaa ttgacgtcgc241 a引物序列為1.5’-gagaccaactggttgggaaa-3’2.5’-tgcgacgtcaattgtaactca-3’上述的白色念珠菌特異DNA序列作為基因芯片診斷的探針及PCR擴(kuò)增檢測(cè)序列，用于白色念珠菌的臨床診斷。
圖2、圖2續(xù)是測(cè)序圖。其中圖2是測(cè)定的序列、圖2續(xù)是原始測(cè)序圖譜。
圖3是用Blast軟件對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果與預(yù)計(jì)序列的比較分析。
圖4、圖4續(xù)(1)、圖4續(xù)(2)是基因數(shù)據(jù)庫中Blast搜索結(jié)果。
圖5.基因芯片雜交結(jié)果。
本發(fā)明可用于PCR方法或基因芯片方法進(jìn)行白色念珠菌的臨床檢測(cè)。用本發(fā)明提供的序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，根據(jù)PCR方法獲得產(chǎn)物是否出現(xiàn)和大小判斷是否為白色念珠菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個(gè)檢測(cè)位點(diǎn)，然后用本發(fā)明中的PCR引物序列擴(kuò)增臨床標(biāo)本，并標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)。
權(quán)利要求
1.一段白色念珠菌DNA序列的特異性確定，其特征在于該序列的長度為241bp，序列及PCR引物如下1 gagaccaact ggttgggaaa aacaagattt acaattataa tgatttgttt gtttgtttgc61 tttatattta tggtttggta taagttagat agtctagttt gatagtcttg tttgattgtt121 tatatatgta tagatttaat ggtttgcttt gttttatgag tttttttgat atctggagta181 gttaaagact catctttgag aaataggaga ccaaacttgt tgagttacaa ttgacgtcgc241 a引物序列為1.5’-gagaccaactggttgggaaa-3’2.5’-tgcgacgtcaattgtaactca-3’
2.一段白色念珠菌DNA序列的應(yīng)用，其特征在于該序列作為白色念珠菌的特異序列用于基因芯片診斷的探針，及PCR擴(kuò)增檢測(cè)序列。
全文摘要
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌DNA序列的特異性確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過基因數(shù)據(jù)庫資料的搜尋和分析，確定了一段白色念珠菌DNA序列的特異性及PCR擴(kuò)增引物，該序列長度為241bp。通過對(duì)婦女生殖道白色念珠菌感染標(biāo)本的PCR擴(kuò)增，克隆，獲得該序列，測(cè)序證明與預(yù)計(jì)序列一致。再經(jīng)生物信息學(xué)方法分析，基因芯片雜交分析，結(jié)果證實(shí)了該序列對(duì)于白色念珠菌的特異性。本發(fā)明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴(kuò)增檢測(cè)序列，用于白色念珠菌的診斷。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK1436857SQ0211335
公開日2003年8月20日 申請(qǐng)日期2002年2月6日 優(yōu)先權(quán)日2002年2月6日
發(fā)明者譚德勇, 朱寶生 申請(qǐng)人:昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司