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一種高通量測定化合物體外代謝穩(wěn)定性的方法及應(yīng)用與流程

文檔序號:11131757閱讀:1712來源:國知局
本發(fā)明屬于藥物代謝動(dòng)力學(xué)研究領(lǐng)域,涉及一種測定方法及其應(yīng)用,具體涉及一種高通量測定化合物體外代謝穩(wěn)定性的方法及應(yīng)用。
背景技術(shù)
:高通量的測定化合物體外代謝穩(wěn)定性的方法,現(xiàn)有技術(shù)分兩種,一種是使用離心管操作,不能實(shí)現(xiàn)高通量,并且不能測定回收率;一種是96孔板操作,此法實(shí)現(xiàn)了高通量,但是不能測定回收率?,F(xiàn)有方法中都是將微粒體、化合物、NADPH混合后,按照時(shí)間點(diǎn)依次終止反應(yīng):使用離心管時(shí),每到一個(gè)時(shí)間點(diǎn),從反應(yīng)體系中取出混合物加入乙腈終止,缺點(diǎn)是繁瑣,不能同時(shí)做很多化合物,并且如果混合不充分,取出的混合物可能不一致,影響測定結(jié)果,并且沒有設(shè)計(jì)不加NADPH的對照,不能計(jì)算回收率;已有的96孔板法,也是在每到一個(gè)時(shí)間點(diǎn),用乙腈終止反應(yīng)后還要繼續(xù)孵育,因?yàn)槠渌走€在反應(yīng),乙腈是易揮發(fā)的溶劑,等到后面的時(shí)間點(diǎn)終止好,前面孔中的乙腈已經(jīng)揮發(fā)很多,直接影響測定的準(zhǔn)確性,并且也沒有設(shè)計(jì)不加NADPH的對照,不能計(jì)算回收率。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:為解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的上述問題,本發(fā)明是在96孔板操作的基礎(chǔ)上,將試驗(yàn)操作方案進(jìn)行改進(jìn),并設(shè)計(jì)了回收率的測定,不但實(shí)現(xiàn)高通量篩選,還能檢測出化合物的代謝過程是否是NADPH依賴。本發(fā)明的技術(shù)方案為:一種高通量測定化合物體外代謝穩(wěn)定性的方法,其包括以下步驟:(1)設(shè)計(jì)96孔板:準(zhǔn)備兩個(gè)96孔板,一個(gè)為體系配置板;一個(gè)為體系孵育板;體系配置板上設(shè)定有微粒體孔、回收率孔,體系孵育板上設(shè)定有空白對照孔、回收率孔、反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔;(2)稀釋微粒體:向體系配置板的微粒體孔中加入肝微粒體28.8μl/孔,使用PBS稀釋肝微粒體至蛋白濃度為0.58mg/ml,將體系配置板移至振蕩器上,低速振蕩30s,得到稀釋的微粒體;(3)轉(zhuǎn)移空白對照孔:從步驟(2)的稀釋的微粒體中取出130μl,轉(zhuǎn)移至體系孵化板的空白對照孔中作為空白對照組,并加入20μl的PBS;(4)微粒體與化合物混合:向體系配置板的微粒體孔中加入10μl化合物,并低速振蕩1min,得到混合微粒體;(5)轉(zhuǎn)移各反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔:從步驟(4)的混合微粒體中依次取出130μl,轉(zhuǎn)移至體系孵化板中的反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔;(6)轉(zhuǎn)移回收率孔:從步驟(4)的混合微粒體中取出130μl,轉(zhuǎn)移至體系配置板的回收率孔中;并加入20μlPBS和300μl含有內(nèi)標(biāo)的終止試劑終止反應(yīng),完成之后將體系配置板熱封;(7)孵育體系孵化板:把體系孵化板放在37℃的恒溫孵育器上開始溫孵,在不同的時(shí)間點(diǎn)依次向相對應(yīng)的反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔中加入20μlNADPH,在第35min向0min孔中加入20μlNADPH,即反應(yīng)時(shí)間為0min,然后立刻向所有孔中各加入300μl的含有內(nèi)標(biāo)的終止試劑終止反應(yīng);(8)再次轉(zhuǎn)移回收率孔:將體系配置板中所有回收率孔中的混合物對應(yīng)的轉(zhuǎn)移至體系孵化板的回收率孔中,將體系孵化板熱封;(9)振蕩離心:將體系孵化板振蕩10min后,4℃,6000g下,離心10min(離心條件優(yōu)選為4℃,6000g),然后取上清70μl至一個(gè)96孔淺孔板中,進(jìn)LC-MS/MS分析,檢測各孔中化合物原形的質(zhì)譜響應(yīng)As和內(nèi)標(biāo)的質(zhì)譜響應(yīng)Ai;(10)計(jì)算清除率及回收率:利用化合物質(zhì)譜響應(yīng)As、內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)Ai,計(jì)算As/Ai值,計(jì)算剩余百分比,計(jì)算LN;剩余百分比(%)=不同時(shí)間點(diǎn)的(As/Ai)/0min的(As/Ai)×100;LN=ln(剩余百分比);以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程,確定趨勢線的斜率,計(jì)算清除率和回收率,清除率(CL,μl/min/mgprotein)=斜率的絕對值/微粒體蛋白濃度(單位mg/ml)×1000,回收率(recovery,%)=(反應(yīng)時(shí)間為0min的孔的As/Ai)/(回收率孔的As/Ai)×100。其中微粒體蛋白濃度是指加入含有內(nèi)標(biāo)的終止試劑終止反應(yīng)之前的微粒體的蛋白濃度,即0.58mg/ml×130μl/(130+20)μl=0.5mg/ml。回收率的計(jì)算可以用于初步判斷化合物的代謝過程是否是NADPH依賴,即比較加NADPH和不加NADPH時(shí)化合物響應(yīng)的變化,當(dāng)回收率<80%時(shí),化合物可能存在非NADPH依賴的代謝,具體的確認(rèn)還需進(jìn)步一研究。優(yōu)選的,步驟(5)中的反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔分別設(shè)定為0min孔、5min孔、10min孔和30min孔;即相對應(yīng)的,步驟(7)中,在第5min向30min孔中加入NADPH,即反應(yīng)時(shí)間為5min;在第25min向10min孔中加入NADPH,即反應(yīng)時(shí)間為10min;在第30min向5min孔中加入NADPH,即反應(yīng)時(shí)間為5min;在第35min向0min孔中加入NADPH,即反應(yīng)時(shí)間為0min, 完成之后立刻用多道移液器向所有的孔中加入含有內(nèi)標(biāo)的終止試劑終止反應(yīng)。本發(fā)明所述的高通量測定化合物體外代謝穩(wěn)定性的方法可以同時(shí)測定n個(gè)化合物,即對應(yīng)n個(gè)化合物,在體系配置板上設(shè)定有n個(gè)微粒體孔、n個(gè)回收率孔,在體系孵育板上設(shè)定有n個(gè)空白對照孔、n個(gè)回收率孔、以及n個(gè)化合物的反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔,1≤n≤16。所述終止試劑優(yōu)選為乙腈或甲醇。本發(fā)明還提供了使用上述測定方法來初步判斷代謝類型是NADPH依賴型代謝還是非NADPH依賴型代謝的應(yīng)用。即比較加NADPH和不加NADPH時(shí)化合物響應(yīng)的變化,如果化合物的回收率在80%-120%的范圍內(nèi),則認(rèn)為該化合物主要經(jīng)NADPH依賴的肝微粒酶代謝,則其代謝穩(wěn)定性也主要與肝微粒酶相關(guān);如果化合物的回收率低于80%,則化合物可能還存在非NADPH依賴的代謝,具體的確認(rèn)還需進(jìn)步一研究。有益效果:本發(fā)明中,使用96孔板解決了高通量問題;運(yùn)用倒序的加入NADPH啟動(dòng)反應(yīng),并在同一時(shí)間加入終止試劑終止反應(yīng),解決了乙腈等終止試劑揮發(fā)的問題;還設(shè)計(jì)了不加NADPH的對照組recovery,能夠計(jì)算回收率,繼而發(fā)現(xiàn)篩選出那些不依賴于NADPH代謝的化合物。具體實(shí)施方式1、設(shè)計(jì)96孔板(以16個(gè)化合物為例)其中:板1為體系配置板;板2為體系孵育板;testNumber:化合物序號(96孔板最 多可同時(shí)測定16個(gè)化合物,即用test1-test16代表化合物1-16);Blank:空白對照孔;Recovery:回收率孔;0min、5min、10min、30min:反應(yīng)不同時(shí)間點(diǎn)孔。具體的,testNumber-微粒體孔:該化合物的微粒體孔;testNumber-Blank:該化合物的空白對照孔;testNumber-Recovery:該化合物的回收率孔;testNumber-0min:該化合物的反應(yīng)0min孔;testNumber-10min:該化合物的反應(yīng)10min孔;testNumber-15min:該化合物的反應(yīng)15min孔;testNumber-30min:該化合物的反應(yīng)30min孔。2、稀釋微粒體實(shí)驗(yàn)之前從-70℃取出肝微粒體(HLM,微粒體蛋白濃度20mg/ml),37℃溶解后,按28.8μl/孔加入板1的test1-test16微粒體孔中,再向每孔中加入958μl預(yù)冷的磷酸緩沖鹽(PBS,pH7.4),將板1移至振蕩器上,低速振蕩30s,得到稀釋的微粒體,稀釋后的微粒體的蛋白濃度為0.58mg/ml。3、轉(zhuǎn)移空白對照孔使用8道移液器,從稀釋的微粒體中取出130μl,轉(zhuǎn)移至板2的test1-Blank---test16-Blank孔作為Blank,并分別加入20μlPBS。4、微粒體與化合物混合向板1的test1-test16微粒體孔中加入10μl的化合物test1-test16的工作液(化合物用乙腈調(diào)配至濃度為100μM的工作液),并低速振蕩1min,得到混合微粒體。5、轉(zhuǎn)移各反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔使用8道移液器,從步驟4制備好的板1的混合微粒體中各取出130μl,對應(yīng)的轉(zhuǎn)移至板2的test1-0min---test16-0min作為0min;再次取出130μl轉(zhuǎn)移至板2的test1-5min---test16-5min孔作為5min孔;再次取出130μl轉(zhuǎn)移至板2的test1-10min---test16-10min孔作為10min孔;再次取出130μl轉(zhuǎn)移至板2的test1-30min---test16-30min孔作為30min孔。6、轉(zhuǎn)移回收率孔使用8道移液器,從步驟4制備好的板1的混合微粒體中各取出130μl,對應(yīng)的轉(zhuǎn)移至板1的test1-Recovery---test16-Recovery孔作為Recovery,并各加入20μlPBS和300μl含有內(nèi)標(biāo)的乙腈終止反應(yīng),完成之后將板1熱封,熱封溫度170℃左右,時(shí)間10秒。7、孵育板2把板2放在37℃的恒溫孵育器上開始溫孵。在第5min,用8道移液器向30min孔中加入20μlNADPH。在第25min,用8道移液器向10min孔中加入20μlNADPH。在第30min,用8道移液器向5min孔中加入20μlNADPH。在第35min,用8道移液器向0min孔中加入20μlNADPH,完成之后立刻用多道移液器向所有的孔中加入300μl含有內(nèi)標(biāo)的乙腈終止反應(yīng)。8、再次轉(zhuǎn)移Recovery使用8道移液器,將板1中的所有Recovery孔中的混合物,轉(zhuǎn)移至板2的test1-Recovery---test16-Recovery孔中,完成之后將板2熱封,熱封溫度170℃左右,時(shí)間10秒。9、振蕩離心將板2震搖10min后,4℃,6000g下,離心10min,然后取上清70μl至96孔淺孔板中,進(jìn)LC-MS/MS分析,檢測每孔中化合物原形的質(zhì)譜響應(yīng)As和內(nèi)標(biāo)的質(zhì)譜響應(yīng)Ai。質(zhì)譜響應(yīng)是指在質(zhì)譜檢測時(shí),化合物和內(nèi)標(biāo)本身的分子離子峰的峰面積。10、計(jì)算清除率及回收率利用化合物質(zhì)譜響應(yīng)As、內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)Ai,計(jì)算As/Ai值,計(jì)算剩余百分比,計(jì)算LN。剩余百分比(%)=不同時(shí)間點(diǎn)的(As/Ai)/0min的(As/Ai)×100。LN=ln(剩余百分比)。以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程,確定趨勢線的斜率,計(jì)算清除率和回收率,清除率(CL,μl/min/mgprotein)=斜率的絕對值/微粒體蛋白濃度(單位mg/ml)×1000,回收率(recovery,%)=(反應(yīng)時(shí)間為0min的孔的As/Ai)/(回收率孔的As/Ai)×100。其中微粒體蛋白濃度是指加入含有內(nèi)標(biāo)的乙腈終止反應(yīng)之前的微粒體的蛋白濃度,即0.58mg/ml×130μl/(130+20)μl=0.5mg/ml。根據(jù)計(jì)算結(jié)果,判斷化合物的體外代謝穩(wěn)定性情況,在新藥研發(fā)早期實(shí)現(xiàn)高通量篩選的目的,并發(fā)現(xiàn)那些非NADPH依賴代謝的化合物,為化合物結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)提供依據(jù)?;厥章实挠?jì)算可以用于初步判斷化合物的代謝過程是否是NADPH依賴,即比較加NADPH和不加NADPH時(shí)化合物響應(yīng)的變化,當(dāng)回收率<80%時(shí),化合物可能存在非NADPH依賴的代謝,具體的確認(rèn)還需進(jìn)步一研究?;衔?-5的測定根據(jù)上述步驟,我們具體的選擇了5種化合物在肝微粒體中進(jìn)行試驗(yàn),對化合物1-5進(jìn)行了檢測和計(jì)算,檢測和計(jì)算結(jié)果如下?;衔?-5分別為咪達(dá)唑侖、普萘洛爾、阿替洛爾、化合物4、化合物5,內(nèi)標(biāo)為替硝唑?;衔?的測試結(jié)果化合物1的As、Ai測定結(jié)果,剩余百分比及LN的計(jì)算結(jié)果見表1:表1化合物1測試結(jié)果化合物質(zhì)譜響應(yīng)As內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)AiAs/Ai剩余百分比,%LNtest1-HLM-Blank737376740.00test1-HLM-Recovery21166157714312.74test1-HLM-0min22559687286573.10100.04.6test1-HLM-5min11286747241241.5650.33.9test1-HLM-10min5904187122590.8326.83.3test1-HLM-30min571586925880.082.71.0test1-HLM-Blank代表化合物1的空白對照孔,test1-HLM-Recovery代表化合物1的回收率孔,test1-HLM-0min代表化合物1的反應(yīng)時(shí)間為0min的反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔,test1-HLM-5min代表化合物1的反應(yīng)時(shí)間為5min的反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔,test1-HLM-10min代表化合物1的反應(yīng)時(shí)間為10min的反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔,test1-HLM-30min代表化合物1的反應(yīng)時(shí)間為30min的反應(yīng)時(shí)間點(diǎn)孔,其他化合物2~15的表格中的縮寫定義參照此表。以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程y=-0.1318x+4.5960,確定趨勢線的斜率絕對值為0.1318,計(jì)算得到清除率為262μl/min/mgprotein,回收率為113%?;衔?的測試結(jié)果化合物2的As、Ai測定結(jié)果,剩余百分比及LN的計(jì)算結(jié)果見表2:表2化合物2測試結(jié)果化合物質(zhì)譜響應(yīng)As內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)AiAs/Ai剩余百分比,%LNtest2-HLM-Blank786680560.00test2-HLM-Recovery1596557278700.22test2-HLM-0min1480416824830.22100.04.6test2-HLM-5min1427297015800.2093.84.5test2-HLM-10min1426687097600.2092.74.5test2-HLM-30min1500436919820.22100.04.6以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程為y=0.0009x+4.5594,確定趨勢線的斜率為0,計(jì)算得到清除率為0μl/min/mgprotein,回收率為99%。化合物3的測試結(jié)果化合物3的As、Ai測定結(jié)果,剩余百分比及LN的計(jì)算結(jié)果見表3:表3化合物3測試結(jié)果化合物質(zhì)譜響應(yīng)As內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)AiAs/Ai剩余百分比,%LNtest3-HLM-Blank1326850960.00test3-HLM-Recovery432367441980.06test3-HLM-0min412266765420.06100.04.6test3-HLM-5min388026623120.0696.14.6test3-HLM-10min357026427700.0691.24.5test3-HLM-30min307956651320.0576.04.3以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程y=-0.0092x+4.6074,確定趨勢線的斜率絕對值為0.009,計(jì)算得到清除率為18μl/min/mgprotein,回收率為105%?;衔?的測試結(jié)果化合物4的As、Ai測定結(jié)果,剩余百分比及LN的計(jì)算結(jié)果見表4:表4化合物4測試結(jié)果化合物質(zhì)譜響應(yīng)As內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)AiAs/Ai剩余百分比,%LNtest4-HLM-Blank10136757490.00test4-HLM-Recovery8047577504611.07test4-HLM-0min8714006817181.28100.04.6test4-HLM-5min8540586726641.2799.34.6test4-HLM-10min8157486814501.2093.74.5test4-HLM-30min7830446671721.1791.84.5以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程y=-0.0028x+4.5978,確定趨勢線的斜率的絕對值為0.0028,計(jì)算得到清除率為4μl/min/mgprotein,回收率為119%?;衔?的測試結(jié)果化合物5的As、Ai測定結(jié)果,剩余百分比及LN的計(jì)算結(jié)果見表1:表5化合物5測試結(jié)果化合物質(zhì)譜響應(yīng)As內(nèi)標(biāo)質(zhì)譜響應(yīng)AiAs/Ai剩余百分比,%LNtest5-HLM-Blank19693980.00test5-HLM-Recovery21004630800.33test5-HLM-0min7607646490.12100.04.6test5-HLM-5min2168581270.0431.73.5test5-HLM-10min1158644370.0215.32.7test5-HLM-30min243593490.003.51.2以時(shí)間為橫坐標(biāo),以LN為縱坐標(biāo),做散點(diǎn)圖,添加趨勢線,得到線性回歸方程為y=-0.187x+4.535,確定趨勢線的斜率的絕對值為0.187,計(jì)算得到清除率為374μl/min/mgprotein,回收率為35%。因?yàn)楦闻K為藥物代謝的主要器官,而肝臟的主要代謝酶為肝微粒體酶。大部分藥物在肝臟代謝,最終清除到體外。所以考察化合物在肝臟的代謝穩(wěn)定性,能反映化合物在體內(nèi)的清除情況。本試驗(yàn)中,如果化合物的清除率比較低,則說明其代謝穩(wěn)定性比較好,即被肝微粒體酶代謝比較少;如果化合物的清除率比較高,則說明其代謝穩(wěn)定性比較差,即被肝微粒體酶代謝比較多?;厥章实挠?jì)算與化合物的代謝類型有關(guān),肝微粒酶的代謝是NADPH依賴的,如果化合物的回收率在80%-120%的范圍內(nèi),則認(rèn)為該化合物主要經(jīng)NADPH依賴的肝微粒酶代謝,則其代謝穩(wěn)定性也主要與肝微粒酶相關(guān);如果化合物的回收率低于80%,則提示該化合物可能還被非NADPH依賴的其他酶代謝,則其代謝穩(wěn)定性就比較復(fù)雜,需要將此化合物與其他可能的代謝酶進(jìn)行孵育,來判斷其的代謝類型。以上所述,僅為本發(fā)明的具體實(shí)施方式,但本發(fā)明的保護(hù)范圍并不局限于此,任何熟悉本領(lǐng)域的技術(shù)人員在本發(fā)明所揭示的技術(shù)范圍內(nèi),可不經(jīng)過創(chuàng)造性勞動(dòng)想到的變化或替換,都應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。當(dāng)前第1頁1 2 3 
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