綜上分析可知,本發(fā)明提供的柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型核酸巧光PCR檢 測試劑盒在同一樣本中同時檢測2種腸道病毒,而不能檢測出其他病原體RNA,采用磁珠法 提取RNA,可W獲得高純度和高得率的核酸,大大提高了檢測靈敏度、準(zhǔn)確度和穩(wěn)定性,檢測 靈敏度可達400copie/ml,檢測范圍為4. 0E+02~4. 0E+08copies/ml,為早期診斷柯薩奇病 毒A16型和腸道病毒71型感染提供可靠的實驗證據(jù)。
【主權(quán)項】
1. 一種柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型核酸熒光PCR檢測試劑盒,其特征在于,包 括以下各組分:RNA提取溶液、RNA洗脫液、內(nèi)標(biāo)、PCR反應(yīng)液、CA16/EV71酶混合液、CA16/ EV71陽性對照、CA16/EV71陰性對照,其中,所述內(nèi)標(biāo)為插入pUC18T載體的長為90堿基對 的人工合成DNA序列的重組體,其濃度為1. 00E+03copies/ml~1. 00E+06copies/ml;所述 90喊基對的序列為: 5'-CAGCTTGTTGTAACAAAGCATCCGCTCCCCCATTCATGTTGCTGGGTACAGACAGTTACCTCTCCACTAG GCAAATCTCAACAGGATCAG-3, 。2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述RNA提取溶液包括如下組分: RNA提取溶液I:十二烷基硫酸鈉,質(zhì)量/體積0.3 %~1.2%、曲拉通,體積/體積 1. 0%~5. 0%,異硫氰酸胍 0·lmol/L~1. 2mol/L、50μg/ml~350μg/ml的磁珠; RNA提取溶液II :4-羥乙基哌嗪乙磺酸150mmol/L~350mmol/L、pH6. 5±0. 2,氯化鈉150mmol/L~400mmol/L; RNA提取溶液III:曲拉通,體積/體積0. 5%~3. 0%、氯化鈉100mmol/L~400mmol/L; RNA提取溶液IV:礦物油。3. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述RNA洗脫液為Tris-HCl 0· 5mol/L~L5mol/L、EDTAO. 2mol/L~L5mol/L〇4. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述PCR反應(yīng)液為5XPCR反應(yīng)緩 沖液10μl,2mmol/L脫氧核糖核苷三磷酸,0· 1μ mol/L~0· 5μ mol/L用于祀多核苷酸擴 增的上下游引物CA16-F、EV71-F與CA16-R、EV71-R,0. 1ymol/L~0· 5ymol/L用于靶多 核苷酸檢測的探針CA16-P、EV71-P,0· 1μmo1 /L~0· 4μmo1 /L用于檢測內(nèi)標(biāo)的上下游引物 IC-F與IC-R,0.lymol/L~0. 4ymol/L用于檢測內(nèi)標(biāo)的探針I(yè)C-P。5. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述用于靶多核苷酸擴增的上下 游引物以及用于靶多核苷酸檢測的探針,其堿基對序列分別為: CA16 上游引物CA16-F:5' -TATGTTAATTGGGACATTGATTTGA-3' ; CA16 下游引物CA16-R:5' -ACCATTGGGTTTGGCTACG-3' ; CA16 探針CA16-P:5' -FAM-ATATGCTCAGCTGCGGCGG-BHQ1-3' ; EV71 上游引物EV71-F:5' -TCCCACATTCGGAGAACACA-3' ; EV71 下游引物EV71-R:5' -AAGGGTACTTGGACTTGGAGGT-3' ; EV71 探針EV71-P:5' -HEX-AGGAGAAAGATCTTGAATACGGGGC-BHQ1-3'。6. 根據(jù)權(quán)利要求4所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述用于檢測內(nèi)標(biāo)的上下游引物 以及用于檢測內(nèi)標(biāo)的探針I(yè)C-P,其堿基對序列分別為: 內(nèi)標(biāo)上游引物IC-F:5' -CAGCTTGTTGTAACAAAGCA-3' ; 內(nèi)標(biāo)下游引物IC-R:5' -CTGATCCTGTTGAGATTTGCC-3' ; 內(nèi)標(biāo)探針I(yè)C-P:5'R0X-CTCCCCCATTCATGTTGCTGGG-BHQ13'。7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述CA16/EV71酶混合液為mMLV 酶10U/μ1~150U/μ1,H-Taq DNA聚合酶1U/μ1~10U/μ1。8. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述CA16/EV71陽性對照品為經(jīng)過 標(biāo)定的已知濃度的假病毒,其濃度為1. 〇〇~5. 00E+05copie/ml。9. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述CA16/EV71陰性對照:品為經(jīng) 過滅菌處理的生理鹽水。10. 使用根據(jù)權(quán)利要求1-9任一項所述的檢測試劑盒用于檢測樣本中CA16/EV71-RNA 的方法,包括如下步驟: (1) 試劑準(zhǔn)備; 按照提取試劑I200μ1~lml/人份,CA16/EV71-內(nèi)標(biāo)1μ1/人份的比例,取相應(yīng)量 的RNA提取溶液I及CA16/EV71-內(nèi)標(biāo),充分混勻得提取溶液Ι-mix,瞬時離心后備用; 根據(jù)待測樣本、陰性對照、陽性對照的數(shù)量,按照PCR反應(yīng)液38μ1/人份,CA16/EV71-酶混合液2μ1/人份的比例,取相應(yīng)量的PCR反應(yīng)液及CA16/EV71-酶混合液,充分混 勻,得PCR-mix,瞬時離心后備用; (2)RNA提?。捍胖榉ㄌ崛-RNA; S01裂解病毒:每個離心管中加入100μΙ~lmlRNA提取溶液Ι-mix,然后加入 100μ1~lml待測樣本,蓋上管蓋,震蕩混勻,瞬時離心后備用; S02磁珠吸附核酸:在步驟S01瞬時離心后備用的溶液中加入30μ1~400μ1RNA提 取溶液II,震蕩混勻,室溫靜置10~30分鐘; S03去除雜質(zhì):靜止結(jié)束瞬時離心后,將離心管置于磁珠分離器上,2~5分鐘后緩慢將 溶液吸出棄用,磁珠備用; S04洗滌:在步驟S03保留備用的磁珠內(nèi)加入200μ1~lmlRNA提取溶液III和 100μ1~400μ1RNA提取溶液IV,震蕩混勻,瞬時離心后將離心管再次置于分離器上; S05去除廢液:靜止,上清液分為兩層,將吸頭插入離心管底部,從底部開始緩慢將液 體完全吸出丟棄,靜置,將管底殘余液體完全吸出丟棄,磁珠備用; S06洗脫核酸:在步驟S05保留備用的磁珠中加入10μ1~100ulRNA洗脫液,將離 心管壁上磁珠洗脫到管底,吸打混勻,室溫靜置5~30分鐘后將離心管再次置于分離器上 2~5分鐘,然后將洗脫下來的RNA吸至新的1. 5ml滅菌離心管中; S07根據(jù)待測樣本、陰性對照、陽性對照的數(shù)量,每個反應(yīng)管加入40μ1PCR-mix,并 吸取步驟S06的新的滅菌離心管中已處理的樣本RNA、陰性對照、陽性對照各10μ1加入 PCR-mix中,蓋好管蓋,形成待測樣品; (3) 熒光PCR反應(yīng):采用實時熒光定量PCR技術(shù),以CA16、EV71病毒蛋白外殼VP1基 因為擴增靶目標(biāo),使用所述試劑盒,在實時熒光PCR儀上通過PCR擴增對待測樣品中CA16/ EV71-RNA進行定性檢測; (4) 結(jié)果分析:選擇FAM通道(Reportere:FAM,Quencher:None)檢測CA16 ; 選擇HEX或VIC通道(Reporter:VIC,Quencher:None)檢測EV71 ;選擇R0X通道 (Reporter:R0X,Quencher:none)檢測內(nèi)標(biāo);利用儀器自帶的軟件進行自動分析或者手動 調(diào)芐基線的開始值、結(jié)束值以及閾值線值進行分析,然后記錄樣本Ct值結(jié)果,根據(jù)各樣本 Ct值大小,判斷檢測結(jié)果。
【專利摘要】本發(fā)明實施例公開了一種柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型核酸熒光PCR檢測試劑盒,其包括以下組分:RNA提取溶液、RNA洗脫液、內(nèi)標(biāo)、PCR反應(yīng)液、CA16/EV71酶混合液、CA16/EV71陽性對照、CA16/EV71陰性對照,本試劑盒在同一樣本中同時檢測柯薩奇病毒A16型、腸道病毒71型兩種腸道病毒,而不能檢測出其他病原體RNA,采用磁珠法提取RNA,提高了檢測靈敏度、準(zhǔn)確度和穩(wěn)定性,檢測靈敏度可達400copie/ml,檢測范圍為4.0E+02~4.0E+08copies/ml,為早期診斷柯薩奇病毒A16型和腸道病毒71型感染提供可靠的實驗證據(jù)。
【IPC分類】C12Q1/68, C12R1/93, C12Q1/70
【公開號】CN105368986
【申請?zhí)枴緾N201510925723
【發(fā)明人】戴立忠, 黃河, 鄧中平, 易曉明
【申請人】湖南圣湘生物科技有限公司
【公開日】2016年3月2日
【申請日】2015年12月11日