一種鑒別白玉菇的特征性核苷酸序列、核酸分子引物、試劑盒和方法
【技術(shù)領(lǐng)域】:
[0001] 本發(fā)明屬于利用分子生物學(xué)方法鑒別食用菌真?zhèn)渭夹g(shù)領(lǐng)域,具體設(shè)及一種鑒別白 玉茹的特征性核巧酸序列、核酸分子引物、試劑盒和方法。
【背景技術(shù)】:
[0002] 白玉茹(whiteHypsizigusmarmoreus)又名白色斑玉葦、白色真姬茹、白色蟹味 茹,在日本則稱之為御茹或者稱為御茸,是斑玉葦(真姬茹)(Hypsizygusmarmoreus)的白 色品系。白玉茹的茹體潔白如玉,質(zhì)地細膩,口感特佳,其多糖、總黃酬、SOD等活性成分含量 均高于真姬茹,倍受國內(nèi)外市場青睞,是食用菌中的"金枝玉葉"和上乘山珍佳品。因此,白 玉茹產(chǎn)業(yè)發(fā)展較快,日產(chǎn)量已達到鮮茹200噸W上,成為我國工廠化生產(chǎn)的主要品種之一。 因此,建立快速鑒別白玉茹的方法非常重要。
[0003] 目前,對白玉茹的鑒別需要將白玉茹菌種接種于培養(yǎng)基中形成菌絲體并培育成 子實體后,再利用子實體的形態(tài)特征進行鑒別,即目前白玉茹和真姬茹在菌絲體階段時無 法從根據(jù)形態(tài)特征進行區(qū)分,它們的不同之處是白玉茹子實體通體白色而真姬茹則呈深褐 色。顯然,利用形態(tài)特征鑒別的方法從菌絲體到子實體所需時間至少需要85天,鑒別時間 相當(dāng)長?,F(xiàn)有的研究主要集中于:利用不同菌株的括抗性及部分同工酶、ITSrDNA、RAPD、 SRAP和mtDNA技術(shù)對真姬茹和白玉茹的種內(nèi)聚類分析和鑒定研究。然而括抗性和同工酶 技術(shù)操作復(fù)雜耗時長,白玉茹與真姬茹的口SrDNA序列一致,難于通過ITS序列鑒定,而 RFLP、RAPD、SRAP等因不能很好地與目標性狀連鎖而應(yīng)用受到限制,mtDNA則存在遺傳穩(wěn)定 性的問題,因此,白玉茹的快速鑒別難于實現(xiàn)(張永杰,2015 ;牛臉東,2001)。W目標起始密 碼子多態(tài)性(startcodontargetedpolymo巧hism,SCoT)分子標記是一種基于翻譯起始 位點的目的基因分子標記新技術(shù),依據(jù)基因中ATG翻譯起始位點側(cè)翼序列的保守性,設(shè)計 單引物并對基因組進行擴增。具有重復(fù)性好,引物設(shè)計簡單,可W在物種間通用的特點,能 有效產(chǎn)生和性狀連鎖的標記,可用于分子標記輔助育種、遺傳多樣性分析、Q化定位和集群 分離分析等諸多領(lǐng)域研究(CollardBCΥ,2009)。
【發(fā)明內(nèi)容】
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[0004] 本發(fā)明的第一個目的是提供一種利用分子生物學(xué)手段,從遺傳本質(zhì)上鑒別白玉 茹,尤其是提供針對白玉茹菌絲體及其他白玉茹相關(guān)制品真假的鑒別白玉茹的特征性核巧 酸序列。
[0005] 本發(fā)明用于鑒別白玉茹的特征性核巧酸序列來源于目標起始密碼子多態(tài)性 (SCoT)分子標記中的31號引物(即序列為5' -CCATGGCTACCACCGCCT-3'的非特異性引物), 擴增白玉茹的基因組DNA,得到的立條基因片段,再經(jīng)克隆、測序,并篩選特異性分子片段的 序列。所述的鑒別白玉茹的特征性核巧酸序列如SEQIDNO. 1所示。 陽006] 本發(fā)明的第二個目的是提供W白玉茹的特征性核巧酸序列(SEQIDNO. 1)為基礎(chǔ) 的,設(shè)計用于鑒別白玉茹的核酸分子引物,該核酸分子引物序列如下:
[0007]FCHS:5'-GCGTGAAAGGTAGGAAGC-3';
[0008] RCHS:5 --GGAGCACCGAGGGTTAGT-3 -。
[0009] 上述核酸分子引物序列FC服和RC服,它們的退火溫度相近(53°C~54°C),GC含 量相當(dāng)(55%~62%),均不能形成引物二聚體,具有極高的專一性,僅能與白玉茹發(fā)生反 應(yīng),而不與真姬茹或其他食用菌擴增生成PCR條帶。因此,利用該核酸分子引物通過PCR擴 增可W快速的對白玉茹(菌絲體、子實體)進行鑒別。
[0010] 本發(fā)明的第Ξ個目的是提供一種白玉茹快速鑒定試劑盒,包括上述的白玉茹的核 酸分子引物FC服、RC服和PCR反應(yīng)試劑。
[0011] 所述的白玉茹快速鑒定試劑盒優(yōu)選還包括真姬茹子實體DNA或真姬茹菌絲體 DNA,該DNA可W作為鑒定白玉茹的陰性對照,W及白玉茹菌絲體DNA或白玉茹子實體DNA, 該DNA可W作為鑒定白玉茹的陽性對照。
[0012] 本發(fā)明的第四個目的是提供一種鑒別白玉茹的方法,其特征在于,采用上述核酸 分子引物FC服和RC服作為擴增引物,W待測樣品基因組DNA為模板,利用PCR的方法鑒定 待測樣品是否是白玉茹。具體是經(jīng)PCR擴增,電泳檢測,可W直接獲得清晰的白玉茹特異 性條帶,無需測序步驟,實現(xiàn)對白玉茹菌絲體無需培養(yǎng)成子實體,直接鑒別其品種的快速鑒 別。
[0013] 優(yōu)選,利用真姬茹菌絲體DNA或真姬茹子實體DNA作為PCR模板,W白玉茹的核酸 分子引物FC服和RC服作為PCR引物,進行常規(guī)的PCR,W作為陰性對照(如圖3)。
[0014] 本發(fā)明基于SCoT分子標記中第31號引物擴增白玉茹基因組DNA,經(jīng)克隆測序,獲 得白玉茹的特征性核巧酸序列,該特征性核巧酸序列如SEQIDNO. 1,并根據(jù)該序列設(shè)計特 異性的核酸分子引物FC服和RC服。用該核酸分子引物,W白玉茹基因組DNA為模板,按照 常規(guī)PCR方法進行擴增,獲得的DNA片段,經(jīng)測序其具體序列為序列SEQIDNO. 1中第27~ 476位堿基所示,長度為45化P(如圖1)。利用本發(fā)明的核酸分子引物FC服和RC服進行PCR 擴增,僅有白玉茹能夠擴增獲得該特異性片段,而其他樣品沒有擴增到任何片段(如圖3), 而利用真姬茹DNA作為PCR模板,W白玉茹的核酸分子引物FC服和RC服作為PCR引物,進 行常規(guī)的PCR,作為陰性對照(如圖3)。本發(fā)明的核酸分子引物FC服和RC服具有極高的 專一性,可W用于快速的鑒別白玉茹(菌絲體和子實體)及其相關(guān)制品的真?zhèn)巍?br>[0015] 本發(fā)明采用PCR技術(shù)進行檢測,材料用量少,僅20mg就足夠,方法簡單,特異性好, 用時短,3h內(nèi)即可完成。
【附圖說明】:
[0016] 圖1是本發(fā)明所述的鑒別白玉茹的特征性核巧酸序列,左側(cè)為5'端,右側(cè)為3' 端,其中黑色部分為核酸分子引物FC服和RC服擴增的片段大小及位置。 陽017] 圖2是利用SCoT分子標記中第31號引物作為PCR引物按照常規(guī)的PCR方法對不 同樣品進行PCR的產(chǎn)物的電泳圖,其中1、白玉茹菌絲體DNA,2、白玉茹子實體DNA,3、真姬 茹菌絲體DNA,4、真姬茹子實體DNA,Μ為2肺的DNA分子量標準,從上到下分別是2000bp、 1000bp、750bp、500bp、250bp、lOObp。
[0018] 圖3是利用白玉茹的核酸分子引物FC服和RC服作為PCR引物按照常規(guī)的PCR方 法對不同樣品進行PCR的產(chǎn)物的電泳圖,其中1、白玉茹菌