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用于預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)志物及其應(yīng)用

文檔序號(hào):40397909發(fā)布日期:2024-12-20 12:21閱讀:8來源:國知局
用于預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)志物及其應(yīng)用

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體涉及用于預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)志物及其應(yīng)用,特別涉及一系列基因作為評(píng)估指標(biāo)或標(biāo)志物在臨床預(yù)測(cè)異基因造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)中的應(yīng)用。


背景技術(shù):

1、異基因造血細(xì)胞移植目前仍是惡性血液病有效乃至唯一的治愈手段。急性移植物抗宿主病(agvhd)是一種移植后常見并發(fā)癥,能夠累積一個(gè)或多個(gè)器官,主要包括皮膚、腸道以及肝臟。手掌背部皮膚斑丘疹往往為agvhd的先發(fā)征象,胃腸道累積通常于皮膚發(fā)病后數(shù)周內(nèi)出現(xiàn),也可在無皮膚及肝臟受累的情況下單獨(dú)出現(xiàn),起病常表現(xiàn)為惡心、嘔吐和綠色水樣便,嚴(yán)重者伴有劇烈腹痛、鮮血便。

2、agvhd是移植相關(guān)死亡的主要原因之一,其發(fā)生率高達(dá)40%至60%,死亡率接近15%。研究供者和受者遺傳學(xué)改變對(duì)患者移植后發(fā)生agvhd的影響,有助于進(jìn)一步揭示急性移植物抗宿主病的分子機(jī)制、增加預(yù)警指標(biāo)和潛在干預(yù)靶點(diǎn),對(duì)于提高造血細(xì)胞移植受者預(yù)后及生存質(zhì)量具有至關(guān)重要的意義。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明的目的在于提供與急性移植物抗宿主病發(fā)生相關(guān)的變異基因及其在預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)及篩選造血細(xì)胞移植前供者中的應(yīng)用。

2、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明首先提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)的新用途。

3、本發(fā)明提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在制備預(yù)測(cè)或輔助預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

4、本發(fā)明又提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在預(yù)測(cè)或輔助預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)中的應(yīng)用。

5、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在制備診斷或輔助診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

6、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在診斷或輔助診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病中的應(yīng)用。

7、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在制備篩選或輔助篩選造血細(xì)胞移植前供者的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

8、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在篩選或輔助篩選造血細(xì)胞移植前供者中的應(yīng)用。

9、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在制備造血細(xì)胞移植前供者和受者之間的配對(duì)(對(duì)造血細(xì)胞移植前供者和受者進(jìn)行匹配)的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

10、本發(fā)明還提供了檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)在造血細(xì)胞移植前供者和受者之間的配對(duì)(對(duì)造血細(xì)胞移植前供者和受者進(jìn)行匹配)中的應(yīng)用。

11、為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明又提供了一種具有如下a1)-a4)任一種功能的試劑盒:

12、a1)預(yù)測(cè)或輔助預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn);

13、a2)診斷或輔助診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病;

14、a3)篩選或輔助篩選造血細(xì)胞移植前供者;

15、a4)造血細(xì)胞移植前供者和受者之間的配對(duì)(對(duì)造血細(xì)胞移植前供者和受者進(jìn)行匹配);

16、所述試劑盒包括檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)。

17、以上任一所述應(yīng)用或試劑盒中,所述供者基因?yàn)楣┱咧械膃if3c基因和/或efcab5基因和/或card8基因和/或krt24基因;所述受者基因?yàn)槭苷咧械膍agec1基因和/或spata31c1基因。

18、進(jìn)一步的,所述供者基因?yàn)楣┱咄庵苎械膃if3c基因和/或efcab5基因和/或card8基因和/或krt24基因;所述受者基因?yàn)槭苷咄庵苎械膍agec1基因和/或spata31c1基因。

19、以上任一所述應(yīng)用或試劑盒中,所述檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的物質(zhì)可為檢測(cè)供者基因和/或受者基因是否發(fā)生突變的試劑和/或儀器。

20、進(jìn)一步的,所述試劑和/或儀器包括但不限于提取人體外周血細(xì)胞基因組dna的試劑,采用現(xiàn)有技術(shù)中的各種常規(guī)方法(如dna測(cè)序、限制性酶切片段長度多態(tài)性、單鏈構(gòu)象多態(tài)性、等位基因特異性的寡核苷酸雜交等等)檢測(cè)外周血中eif3c基因、efcab5基因、card8基因、krt24基因、magec1基因和/或spata31c1基因是否發(fā)生突變所需的試劑和/或儀器。

21、更進(jìn)一步的,利用dna測(cè)序(如高通量測(cè)序或一代測(cè)序等等)檢測(cè)外周血中eif3c基因、efcab5基因、card8基因、krt24基因、magec1基因和/或spata31c1基因是否發(fā)生突變所需的試劑和/或儀器包括測(cè)序中所用的各種引物、探針和測(cè)序儀。

22、在本發(fā)明的一個(gè)具體實(shí)施例中,所述dna測(cè)序的方法具體可包括如下步驟:

23、1、抽取造血細(xì)胞移植前供者、受者靜脈血,并抽提基因組dna;

24、2、使用酶切方法將200ng基因組dna隨機(jī)片段化為150-200bp平均長度,經(jīng)末端修復(fù)補(bǔ)平并在3’末端加a堿基形成粘性末端,然后與含有特異性barcode序列的接頭連接,再用磁珠篩選去除連接不完整的產(chǎn)物以及接頭自連產(chǎn)物,最后利用與接頭序列互補(bǔ)的通用引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增,形成測(cè)序文庫;

25、3、使用discovery?pool探針在雜交緩沖液中進(jìn)行雜交,然后使用磁珠捕獲雜交的目的片段并分離純化,再pcr擴(kuò)增捕獲的dna片段并進(jìn)行捕獲文庫的質(zhì)檢(包括qubit濃度測(cè)定和2100bioanalyzer片段長度測(cè)定),最后在novaseq6000測(cè)序儀上,按照illumina的標(biāo)準(zhǔn)流程進(jìn)行pe150高通量測(cè)序;

26、4、使用測(cè)序圖譜進(jìn)行基因型分析。

27、以上任一所述試劑盒還包括數(shù)據(jù)處理裝置,所述數(shù)據(jù)處理裝置內(nèi)設(shè)模塊,所述模塊具有如下功能:根據(jù)供者外周血中eif3c基因、efcab5基因、card8基因和/或krt24基因是否發(fā)生突變和/或受者外周血中magec1基因和/或spata31c1基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)或診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病或篩選造血細(xì)胞移植前供者。

28、具體的,

29、根據(jù)供者外周血中eif3c基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為供者外周血中eif3c基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)高于供者外周血中eif3c基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

30、根據(jù)供者外周血中eif3c基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若供者外周血中eif3c基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主?。蝗艄┱咄庵苎衑if3c基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主病。

31、根據(jù)供者外周血中efcab5基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為供者外周血中efcab5基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)低于供者外周血中efcab5基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

32、根據(jù)供者外周血中efcab5基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若供者外周血中efcab5基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主??;若供者外周血中efcab5基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主病。

33、根據(jù)供者外周血中card8基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為供者外周血中card8基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)低于供者外周血中card8基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

34、根據(jù)供者外周血中card8基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若供者外周血中card8基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主??;若供者外周血中card8基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主病。

35、根據(jù)供者外周血中krt24基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為供者外周血中krt24基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)高于供者外周血中krt24基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

36、根據(jù)供者外周血中krt24基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若供者外周血中krt24基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主??;若供者外周血中krt24基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主病。

37、根據(jù)受者外周血中magec1基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為受者外周血中magec1基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)低于受者外周血中magec1基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

38、根據(jù)受者外周血中magec1基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若受者外周血中magec1基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主?。蝗羰苷咄庵苎衜agec1基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主病。

39、根據(jù)受者外周血中spata31c1基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法為受者外周血中spata31c1基因發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)低于受者外周血中spata31c1基因未發(fā)生突變的造血細(xì)胞移植后患者。

40、根據(jù)受者外周血中spata31c1基因是否發(fā)生突變?cè)\斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法為若受者外周血中spata31c1基因發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主病;若受者外周血中spata31c1基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主病。

41、在實(shí)際應(yīng)用中,可以選擇六個(gè)基因中的任意一個(gè)或任意兩個(gè)或任意三個(gè)或任意四個(gè)或任意五個(gè)基因進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷,也可選擇全部六個(gè)基因共同進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷。當(dāng)采用多個(gè)基因共同進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷時(shí),需要滿足每個(gè)基因均符合各自的判定標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷,否則該預(yù)測(cè)或診斷方法無效。如采用eif3c基因和efcab5基因共同進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷時(shí),若供者外周血中的eif3c基因發(fā)生突變且efcab5基因未發(fā)生突變,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主病,若供者外周血中的eif3c基因發(fā)生突變且efcab5基因發(fā)生突變,則該預(yù)測(cè)方法無效。

42、采用全部六個(gè)基因共同進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷時(shí),除了可通過檢測(cè)供者和受者中六個(gè)基因突變情況進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷外,還可以按照如下方法進(jìn)行預(yù)測(cè)或診斷:

43、先根據(jù)供者外周血中eif3c基因、efcab5基因、card8基因和krt24基因突變情況和受者外周血中magec1基因和spata31c1基因突變情況,得到基因突變合計(jì)數(shù),然后根據(jù)基因突變合計(jì)數(shù)和閾值預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)或診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病。

44、所述基因突變合計(jì)數(shù)的獲得方法如下:若供者外周血中eif3c基因、efcab5基因、card8基因或krt24基因發(fā)生突變或受者外周血中magec1基因或spata31c1基因發(fā)生突變記為1,累計(jì)六個(gè)基因發(fā)生突變分?jǐn)?shù),即得到基因突變合計(jì)數(shù)。

45、所述根據(jù)基因突變合計(jì)數(shù)和閾值預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)的方法如下:基因突變合計(jì)數(shù)大于或等于閾值的造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn)高于基因突變合計(jì)數(shù)小于閾值的造血細(xì)胞移植后患者。

46、所述根據(jù)基因突變合計(jì)數(shù)和閾值診斷造血細(xì)胞移植后患者是否發(fā)生急性移植物抗宿主病的方法如下:若基因突變合計(jì)數(shù)大于或等于閾值,則造血細(xì)胞移植后患者發(fā)生或候選發(fā)生急性移植物抗宿主??;若基因突變合計(jì)數(shù)小于閾值,則造血細(xì)胞移植后患者不發(fā)生或候選不發(fā)生急性移植物抗宿主病。

47、所述閾值具體可為1.5。

48、在實(shí)際應(yīng)用中,可先根據(jù)上述方法預(yù)測(cè)造血細(xì)胞移植后發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn),然后再根據(jù)急性移植物抗宿主病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的高低篩選造血細(xì)胞移植前供者,或結(jié)合其它臨床指標(biāo)輔助篩選造血細(xì)胞移植前供者,以優(yōu)化造血細(xì)胞移植前供者的選擇,提高造血細(xì)胞移植前患者的生存率及生存質(zhì)量。

49、以上任一所述基因發(fā)生突變包括任何可改變?cè)摶蛩幋a蛋白氨基酸序列的堿基突變,所述堿基突變的形式包括堿基插入、堿基缺失、堿基替換等,所述堿基突變的個(gè)數(shù)包括1個(gè)或2個(gè)或多個(gè)堿基突變。

50、具體的,

51、所述eif3c基因突變包括如下突變中的至少一種:chr16-28727173位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr16-28388130位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr16-28723250位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr16-28392031位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入;chr16-28392043位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入;chr16-28391825位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr16-28392046位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr16-28392056位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr16-28392020位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr16-28723313位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr16-28392043位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入;chr16-28392025位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼缺失。

52、所述efcab5發(fā)生基因突變包括如下突變中的至少一種:chr17-29993230位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-29969309位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-29993284位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr17-29969251位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr17-29993230位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-29969309位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30078487位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30051184位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30051119位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30057709位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30090638位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30092059位點(diǎn)位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30090516位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-30078356位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變。

53、所述card8基因突變包括如下突變中的至少一種:chr19-48234449位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr19-48230957位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr19-48234507位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr19-48231760位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼缺失。

54、所述krt24基因突變包括如下突變中的至少一種:chr17-40699466位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-40699520位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-40701194位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-40703444位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr17-40701882位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼缺失。

55、所述magec1基因突變包括如下突變中的至少一種:chrx-141906385位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141906494位點(diǎn)位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141905856位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141905478位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141907529位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141906126位點(diǎn)位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141906066位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141905959位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141905478位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chrx-141906056位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入。

56、所述spata31c1基因突變包括如下突變中的至少一種:chr9-87923373位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因片段缺失;chr9-87919291位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr9-87919297位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr9-87922513位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr9-87922941位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr9-87922977位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因錯(cuò)義突變;chr9-87919289位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入;chr9-87919291位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼插入;chr9-87919275位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼缺失;chr9-87919290位點(diǎn)突變導(dǎo)致的基因移碼缺失。

57、以上任一所述基因未發(fā)生突變包括沒有發(fā)生堿基突變(與該基因的野生型序列完全相同)或任何沒有改變?cè)摶蛩幋a蛋白氨基酸序列的堿基突變。

58、以上任一所述應(yīng)用或試劑盒中,所述供者為進(jìn)行造血細(xì)胞移植前提供造血細(xì)胞的健康個(gè)體,所述受者為進(jìn)行造血細(xì)胞移植前患者。

59、以上任一所述應(yīng)用或試劑盒中,所述造血細(xì)胞移植為異基因造血細(xì)胞移植。

60、所述異基因造血細(xì)胞移植為hla單倍型相合異基因造血細(xì)胞移植。

61、所述造血細(xì)胞移植前患者可為急性髓系白血病患者、急性淋系白血病患者、慢性髓系白血病患者、慢性淋系白血病患者、多發(fā)性骨髓瘤患者、骨髓增生異常綜合征患者或原發(fā)性系統(tǒng)性淀粉樣變性患者。

62、eif3c基因和/或efcab5基因和/或card8基因和/或krt24基因和/或magec1基因和/或spata31c1基因作為靶點(diǎn)在制備預(yù)防和/或治療急性移植物抗宿主病的產(chǎn)品中的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。

63、以上任一所述eif3c基因在ncbi中的id為8663。

64、以上任一所述efcab5基因在ncbi中的id為37476。

65、以上任一所述card8基因在ncbi中的id為22900。

66、以上任一所述krt24基因在ncbi中的id為192666。

67、以上任一所述magec1基因在ncbi中的id為9947。

68、以上任一所述spata31c1基因在ncbi中的id為441452。

69、本發(fā)明通過全基因組測(cè)序篩選出了與移植后agvhd發(fā)生相關(guān)的致病突變基因eif3c、efcab5、card8、krt24、magec1、spata31c1,一方面,可根據(jù)供者或受者外周血中致病突變基因是否發(fā)生突變預(yù)測(cè)移植后患者發(fā)生急性移植物抗宿主病的風(fēng)險(xiǎn),為潛在的agvhd診斷提供依據(jù)。另一方面,本發(fā)明為agvhd的發(fā)病提供新的可能機(jī)制,為尋找治療agvhd提供可能的藥物靶點(diǎn)。

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