本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,特別地,涉及一種磁珠法分離純化dna的方法。
背景技術(shù):
dna測序作為一種重要的實(shí)驗(yàn)技術(shù),在生物學(xué)研究中有著廣泛的應(yīng)用。早在dna雙螺旋結(jié)構(gòu)(watsonandcrick,1953)被發(fā)現(xiàn)后不久就有人報(bào)道過dna測序技術(shù),但是當(dāng)時的操作流程復(fù)雜,沒能形成規(guī)模。隨后在1977年sanger發(fā)明了具有里程碑意義的末端終止測序法,同年a.m.maxam和w.gilbert發(fā)明了化學(xué)降解法。sanger法因?yàn)榧群啽阌挚焖?,并?jīng)過后續(xù)的不斷改良,成為了迄今為止dna測序的主流。然而隨著科學(xué)的發(fā)展,傳統(tǒng)的sanger測序已經(jīng)不能完全滿足研究的需要,對模式生物進(jìn)行基因組重測序以及對一些非模式生物的基因組測序,都需要費(fèi)用更低、通量更高、速度更快的測序技術(shù),第二代測序技術(shù)(next-generationsequencing)應(yīng)運(yùn)而生。第二代測序技術(shù)的核心思想是邊合成邊測序(sequencingbysynthesis),即通過捕捉新合成的末端的標(biāo)記來確定dna的序列,現(xiàn)有的技術(shù)平臺主要包括roche/454flx、illumina/solexagenomeanalyzer和appliedbiosystemssolidsystem。在整個dna測序過程中,分離提取的dna的純度起到至關(guān)重要的作用。
磁珠法純化dna主要是利用利息交換吸附材料以吸附核酸,從而將核酸和蛋白質(zhì)等其細(xì)胞中其他物質(zhì)分離。核酸在細(xì)胞中總是與各種蛋白質(zhì)結(jié)合在一起的,核酸的分離主要是指將核酸與蛋白質(zhì)、多糖、脂肪等生物大分子物質(zhì)分開。在分離核酸時應(yīng)遵循保證核酸分子一級結(jié)構(gòu)的完整性以及排除其他分子污染的原則。
大多數(shù)核酸分離與純化的方法一般都包括了細(xì)胞裂解、酶處理、核酸與其他生物大分子物質(zhì)分離、核酸純化等幾個主要步驟。每一步驟又可由多種不同的方法單獨(dú)或聯(lián)合實(shí)現(xiàn)。
現(xiàn)有磁珠法純化dna方法中,磁珠純化過程中,在洗滌磁珠時,通常采用磁力架上下顛倒的方式進(jìn)行洗滌磁珠,但是,上述磁珠洗滌方法存在磁珠洗滌不夠徹底的問題,常導(dǎo)致dna產(chǎn)物的純度不高;而且離心管蓋上也會有酒精殘留,容易造成交叉污染。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明提供了一種磁珠法分離純化dna的方法,解決了現(xiàn)有技術(shù)中磁珠洗滌不徹底、影響dna產(chǎn)物純度的問題。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提出了一種磁珠法純化dna的磁珠洗滌方法,包括如下步驟:
(1)將吸附dna分子后的磁珠置于離心管中;
(2)將所述離心管置于磁力架上轉(zhuǎn)動洗滌;
(3)固液分離。
所述步驟(2)中,所述轉(zhuǎn)動洗滌為轉(zhuǎn)動一周。
所述步驟(1)中還包括加入70v/v%酒精的步驟。
所述磁珠為agencourtampurexp。
本發(fā)明還公開了一種磁珠法分離純化dna的方法,包括如所述洗滌方法對磁珠進(jìn)行洗滌的步驟。
本發(fā)明還公開了一種磁珠法分離純化dna的方法,包括如下步驟:
(1)將dna轉(zhuǎn)入分裝好磁珠的離心管中,混勻并于室溫下靜置處理;
(2)將離心管置于磁力架上,吸附至溶液澄清,去除上清;
(3)權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述洗滌方法對磁珠進(jìn)行洗滌;
(4)將洗滌后的離心管置于40℃干式加熱器上干燥磁珠至磁珠表面不反光;
(5)向離心管加入ddh2o,回溶磁珠;
(6)將離心管于室溫下靜置處理,并置于磁力架上吸附至澄清;
(7)將上清液轉(zhuǎn)移到新的離心管中備用,進(jìn)行后續(xù)測序處理。
所述步驟(3)中,所述磁珠洗滌的步驟為重復(fù)2次。
所述步驟(1)中,所述靜置處理步驟為10min。
所述步驟(6)中,所述靜置處理步驟為5min。
本發(fā)明還公開了一種二代dna測序方法,即包括所述的分離純化dna的方法。
本發(fā)明還公開了一種的磁珠法分離純化dna的方法,包括如下步驟:
本發(fā)明所述磁珠法分離純化dna的方法,在磁珠洗滌步驟中,采用在磁力架上轉(zhuǎn)動洗滌的方式,使得每個磁珠小微粒都能洗滌到,具有更好的洗滌效果,進(jìn)一步提高了dna產(chǎn)物純度;同時,由于采用轉(zhuǎn)動洗滌的方式,不需顛倒,離心管蓋上沒有液體,能最大程度的減少交叉污染的風(fēng)險(xiǎn)。
附圖說明
圖1是本發(fā)明實(shí)施例1中轉(zhuǎn)動洗滌磁珠的操作示意圖;
圖2為本發(fā)明對比例中上下顛倒磁力架洗滌磁珠的操作示意圖。
具體實(shí)施方式
為使本發(fā)明的上述目的、特征和優(yōu)點(diǎn)能夠更加明顯易懂,下面結(jié)合附圖和具體實(shí)施方式對本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的說明。
實(shí)施例1
本實(shí)施例所述磁珠法分離純化dna的方法,具體包括如下步驟:
(1)將收集的dna轉(zhuǎn)入分裝好磁珠的1.5ml離心管中,吹打混勻,室溫靜置10分鐘;
(2)將離心管置于磁力架上,吸附至溶液澄清,去除上清;
(3)向離心管中加入70%酒精,蓋下管蓋,如圖1所示,轉(zhuǎn)動離心管一周以洗滌磁珠,隨后開蓋去除上清,并重復(fù)上述洗滌步驟2次;
(4)將離心管置于40℃干式加熱器上干燥磁珠至磁珠表面不反光;
(5)向離心管加入ddh2o,以回溶磁珠;
(6)將離心管于室溫靜置5分鐘后,置于磁力架上吸附至澄清;
(7)將上清液轉(zhuǎn)移到新離心管中備用,進(jìn)行后續(xù)測序處理。
對比例
本對比例所述磁珠法分離純化dna的方法,與實(shí)施例1相同,其區(qū)別僅在于,所述磁珠洗滌步驟(3)中,如圖2中(a)和(b)所示,采用現(xiàn)有技術(shù)中的常規(guī)方法,即在磁力架上以上下顛倒磁力架的方式進(jìn)行洗滌。
實(shí)驗(yàn)例
對上述實(shí)施例1中以優(yōu)化后轉(zhuǎn)動洗滌的方法和以現(xiàn)有上下顛倒磁力架的方式所提取得到的dna樣本濃度純度進(jìn)行檢測并對比,記錄數(shù)據(jù)如下表1。
表1兩種洗滌方法dna樣本濃度純度檢測
從上表數(shù)據(jù)可知,采用本發(fā)明優(yōu)化后的磁珠洗滌方法可以充分的洗滌磁珠,進(jìn)一步提高產(chǎn)物純度;同時,由于樣本在洗滌過程中,不會接觸到離心管蓋上,因而不會有液體殘留,并最大限度的減少了交叉污染的風(fēng)險(xiǎn)。
以上對本發(fā)明實(shí)施例進(jìn)行了詳細(xì)介紹,本文中應(yīng)用了具體個例對本發(fā)明的原理及實(shí)施方式進(jìn)行了闡述,以上實(shí)施例的說明只是用于幫助理解本發(fā)明的方法及其核心思想;同時,對于本領(lǐng)域的一般技術(shù)人員,依據(jù)本發(fā)明的思想,在具體實(shí)施方式及應(yīng)用范圍上均會有改變之處,綜上所述,本說明書內(nèi)容不應(yīng)理解為對本發(fā)明的限制。