本發(fā)明涉及一種試劑盒及其應(yīng)用,尤其涉及一種直接pcr檢測(cè)豬支原體肺炎病原的試劑盒及其應(yīng)用,屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
豬支原體肺炎(mycoplasmalpneumoniaofswine,mps),又稱豬地方流行性肺炎(swineenzooticpneumonia),俗稱豬氣喘病,是由豬肺炎支原體引起的豬的一種慢性呼吸道傳染病。主要臨診癥狀為咳嗽和氣喘,病理變化特征是肺的尖葉、心葉、中間葉和隔葉前緣呈肉樣或蝦肉羊?qū)嵶?。本病廣泛分布于世界各地,主要特點(diǎn)是高接觸性、高傳染性、高發(fā)病率和低死亡率為主要特點(diǎn)。臨床主要表現(xiàn)為咳嗽,氣喘,呼吸困難,日增重減少,長(zhǎng)期生長(zhǎng)不良,飼料報(bào)酬率大幅下降。該病常與其他呼吸道病原如多殺性巴氏桿菌、副豬嗜血桿菌或胸膜肺炎放線桿菌等病原協(xié)同引起豬地方性肺炎,常與豬繁殖與呼吸綜合征病毒、豬流感病毒和豬圓環(huán)病毒2型的協(xié)同感染引起豬呼吸道綜合征。mps發(fā)病率一般在50%-80%,個(gè)別新建豬場(chǎng)發(fā)病率可達(dá)100%,死亡率高達(dá)14%-37%。流行后期或老疫區(qū)則以哺乳仔豬和斷奶小豬多發(fā),死亡率較高,母豬和成年豬多呈慢性和隱性感染。病豬與健康豬群混合飼養(yǎng),常引起豬支原體肺炎的爆發(fā)。本病目前尚無特效藥物療法,主要采取綜合防制措施及對(duì)癥療法。最根本的辦法是消除患病動(dòng)物和徹底消毒,切斷傳播途徑。因此應(yīng)加強(qiáng)檢疫和本病監(jiān)測(cè),以防本病擴(kuò)散。支原體可在豬群中持續(xù)存在,各種年齡的豬都易感。本病主要在冬季多發(fā),夏季也可發(fā)生。病豬和帶毒豬是主要傳染源,無臨診癥狀有病理變化豬,或無臨診癥狀無病理變化陰性帶菌豬較多常見。mps的診斷方法主要有細(xì)菌分離和鑒定,elisa方法檢測(cè)抗體和pcr。pcr方法敏感性和特異性較好,是臨床病原學(xué)診斷中較為普遍的一種方法。但是從細(xì)菌分離培養(yǎng)到純化及dna提取至少需要3-4天才能做出初步鑒定,不僅費(fèi)時(shí)費(fèi)力,結(jié)果也不準(zhǔn)確,而且敏感性差,容易產(chǎn)生假陽性的結(jié)果,不利于養(yǎng)殖戶和規(guī)?;髽I(yè)采取相應(yīng)的血清型疫苗和藥物來進(jìn)行及時(shí)的治療。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)存在的缺陷,提出的一種直接pcr檢測(cè)豬支原體肺炎病原的試劑盒及其應(yīng)用,檢測(cè)迅速,靈敏性佳。
本發(fā)明通過以下技術(shù)方案解決技術(shù)問題:一種直接pcr檢測(cè)豬支原體肺炎病原的試劑盒,包含以下試劑:裂解液5μl,pcr擴(kuò)增試劑20μl,陽性對(duì)照和陰性對(duì)照。
上述試劑的所述裂解液含有2~4m異硫氰酸酯、7~10m乙二胺四乙酸、15~20m十二烷基肌氨酸和3~6%體積比的聚乙烯基吡咯烷酮;所述pcr擴(kuò)增試劑含有5×pcrbuffer、2.0mdntp、10pm正向引物、10pm反向引物、高保真taq酶5u/μl、20mmmgcl2和純凈水。所述正向引物為mpsf:gaagctatcaaaaaaggggaaacta,所述反向引物為mpsr:tgtatcggtttcagaagaag。
本發(fā)明提供的試劑盒能快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)出豬支原體肺炎病原支原體??蓪?duì)豬支原體肺炎感染的單個(gè)樣品檢測(cè),也可對(duì)臨床病例中混合感染的檢測(cè),可用于豬支原體肺炎病原普查、分子流行病學(xué)調(diào)查及疫苗篩選和監(jiān)測(cè)。
本發(fā)明進(jìn)一步提供一種直接pcr檢測(cè)豬支原體肺炎病原的試劑盒的應(yīng)用,包括以下步驟:
第一步、樣品的采集,分為病料和鼻咽拭子采集,所述病料采集為無菌條件下采集病料0.1mg~100mg,裝入無rna酶污染的離心管中備用,所述鼻咽拭子采集為采集鼻咽液,裝入無rna酶污染的離心管中備用;
第二步、樣品裂解,取液體狀樣品10μl~100μl或研磨后的固體狀樣品0.1mg~100mg,加400~600μl裂解液,震蕩混勻;
第三步、直接pcr反應(yīng),反應(yīng)體系為25μl,取裂解后的樣品5μl,加入pcr擴(kuò)增試劑20μl,充分混合均勻后短暫離心,pcr擴(kuò)增程序?yàn)?5℃3min;然后35個(gè)循環(huán):94℃1min,55℃1min,72℃1mins;最后72℃10min;
第四步、pcr產(chǎn)物的檢測(cè),取5μl擴(kuò)增產(chǎn)物和2μlloadingbuffer混勻,加到含溴化乙錠的瓊脂糖凝膠中,同時(shí)加入對(duì)照和dnamarker(dl2000),電壓為120v,電泳30min,然后在凝膠成像儀中觀察結(jié)果。
上述方法的所述第三步中的反應(yīng)體系為25μl,裂解后的樣品5μl,10pmol/μl的正向引物2μl,10pmol/μl的反向引物2μl,5×pcrbuffer5μl,2.0mm/ldntps5μl,5u/μl的高保真taq酶0.5μl,20mmmgcl23.5μl,純凈水2μl,充分混合均勻后短暫離心。擴(kuò)增長(zhǎng)度為600bp。所述第四步中瓊脂糖凝膠電泳時(shí)的凝膠濃度為1.0%,其中含有1%的凝膠燃料。
本發(fā)明的方法是建立在分子生物學(xué)基礎(chǔ)上的,檢測(cè)中提供了陰性和陽性對(duì)照,大大提高了檢測(cè)的準(zhǔn)確度,降低假陽性的出現(xiàn)幾率,特異性較強(qiáng),省時(shí)省力,該試劑盒將檢測(cè)時(shí)間縮短至2h,大大提高了工作效率。本發(fā)明特別適合于豬支原體肺炎感染的大量臨床樣本的快速診斷,可以為臨床和科研上豬支原體肺炎病防治和治療提供科學(xué)依據(jù),而且對(duì)提高豬支原體肺炎病原的檢測(cè)、監(jiān)控、疫苗研制等具有重要意義。
附圖說明
圖1為rt-pcr產(chǎn)物的檢測(cè)結(jié)果圖,圖中的marker為dl2000bp,從上到下依次為2000bp、1000bp、700bp、500bp、250bp,從圖1可以看出,mps模板pcr擴(kuò)增片段約為600bp,證明擴(kuò)增片段為目的片段,符合預(yù)期設(shè)計(jì)大小,1為陽性對(duì)照,2為樣品,為支原體擴(kuò)增的片段;3為陰性對(duì)照。
圖2為敏感性試驗(yàn),將直接pcr模板dna定量,依次10倍稀釋,使其為1pg,10-1pg,10-2pg,10-3pg,10-4pg,10-5pg,10-6pg,10-7pg。分別進(jìn)行直接pcr擴(kuò)增,確定其敏感性。然后在凝膠成像儀中觀察結(jié)果,結(jié)果如圖2所示,其敏感性可達(dá)10-2pg。
具體實(shí)施方式
以下通過實(shí)施例進(jìn)一步說明本發(fā)明,文中的百分含量,如沒有特別說明均指重量百分比。
實(shí)施例1
本實(shí)施例的直接pcr檢測(cè)豬支原體肺炎病原的試劑盒,組成包括:
(1)裂解液:2-4m異硫氰酸酯、7-10m乙二胺四乙酸、15-20m十二烷基肌氨酸、3-6%(體積比)聚乙烯基吡咯烷酮。
(2)pcr擴(kuò)增試劑:5×pcrbuffer、2.0mdntp、10pm正向引物、10pm反向引物、高保真taq酶(5u/μl)、20mmmgcl2,純凈水。
各成分的具體組成:
反應(yīng)體系為25μl,裂解后的樣品5μl,mpsf(5′-gaagctatcaaaaaaggggaaacta-3′)(10pmol/μl)2μl,mpsr(3′-tgtatcggtttcagaagaag-5′)(10pmol/μl)2μl,5×pcrbuffer5μl,2.0mm/ldntps5μl,高保真taq酶0.5μl(5u/μl),20mmmgcl23.5μl,純凈水2μl,充分混合均勻后短暫離心。
其中一對(duì)特異性引物如下:mpsf:gaagctatcaaaaaaggggaaacta,mpsr:tgtatcggtttcagaagaag。
將試劑盒用于直接檢測(cè)豬支原體肺炎病原,包括以下步驟:
(1)樣品的采集:
①病料:無菌采集病料0.1mg-100mg,裝入無rna酶污染的離心管中備用。
②鼻咽拭子:用鼻咽拭子采集鼻咽液,裝入無rna酶污染的離心管中備用。
(2)樣品裂解
①將固體狀的動(dòng)物組織先進(jìn)行研磨處理,液體狀的動(dòng)物組織直接用于裂解;
②取液體狀10μl-100μl或研磨后的固體狀動(dòng)物組織0.1mg-100mg,加400-600μl裂解液,震蕩混勻;
(3)直接pcr
反應(yīng)體系為25μl,取裂解后的樣品5μl,加入pcr擴(kuò)增試劑20μl,充分混合均勻后短暫離心。pcr擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃3min;然后35個(gè)循環(huán):94℃1min,55℃1min,72℃1mins;最后72℃10min。
(4)rt-pcr產(chǎn)物的檢測(cè)
取5μl擴(kuò)增產(chǎn)物和2μlloadingbuffer混勻,加到含eb的1.0%的瓊脂糖凝膠中,同時(shí)加入對(duì)照和dnamarker(dl2000),電壓為120v,電泳30min,然后在凝膠成像儀中觀察結(jié)果,結(jié)果如圖1所示,1為陽性對(duì)照,2為樣品,3為陰性對(duì)照。如果擴(kuò)增出600bp條帶,說明陽品為陽性,否則為陰性。
將直接pcr模板dna定量,依次10倍稀釋,使其為1pg,10-1pg,10-2pg,10-3pg,10-4pg,10-5pg,10-6pg,10-7pg。分別進(jìn)行直接pcr擴(kuò)增,確定其敏感性。然后在凝膠成像儀中觀察結(jié)果,結(jié)果如圖2所示,其敏感性可達(dá)10-2pg。
除上述實(shí)施外,本發(fā)明還可以有其他實(shí)施方式。凡采用等同替換或等效變換形成的技術(shù)方案,均落在本發(fā)明要求的保護(hù)范圍。
序列表
豬肺炎支原體(mycoplasmahyopneumoniae,mps)
catttgaagctatcaaaaaaggggaaactacaaaagaaggtaaaagagaagaagtagataaaaaagttaaggaattagataataaaataaaaggtatattgcctcagcccccagcggctaaaccagaagcagcaaaaccagtagcggctaaaccagaagcggctaaaccagtagcagctaaacctgaagcagctaaacctgaagcagcaaaaccagttgcagctaaacctgaagcagcaaaaccagttgcagctaaacctgaagcagcaaaaccagttgctactaatactaatactaatactggcttttcacttacaaataaaccaaaagaagactatttcccaatggcttttagttataaattagaatatactgacgaaaataaattaagcctaaaaacaccggaaattaatgtatttttagaactagttcatcaaagcgagtatgaagaccaaaaaataataaaggaactagataaaactgttttaaatcttcaatatcaattccaggaagtcaaggtaactagtgaccaatatcagaaacttagccacccaatgatgaccgaaggatcttcaaatcaaggtaaaaaaagcgaaggaactcctaaccaaggtaaaaaagcagaaggcgcgcctaaccaaggtaaaaaaagcgaaggaactcctaaccaaggtaaaaaagcagaaggcgcgcctagtcaacaaagcccaactaccgaatta
mpsf:gaagctatcaaaaaaggggaaacta,上游引物
mpsr:tgtatcggtttcagaagaag,下游引物