本實(shí)用新型涉及生物技術(shù)檢測(cè)用具領(lǐng)域,尤其涉及一種快速診斷雞肉品質(zhì)基因試劑盒。
背景技術(shù):
隨著生活水平的不斷提高和消費(fèi)觀念的轉(zhuǎn)變,人們對(duì)于雞肉的質(zhì)量和口味的要求越來(lái)越高,對(duì)優(yōu)質(zhì)雞的需求日漸擴(kuò)大。優(yōu)質(zhì)雞主要強(qiáng)調(diào)的是肉質(zhì),而肌纖維是構(gòu)成肌肉組織的基本單位,大量的研究表明肌纖維類型是直接影響肌肉品質(zhì)的重要因素,慢肌纖維含量較多的肉品質(zhì)相對(duì)較好,選育慢肌纖維比例高的肌纖維類型形狀是優(yōu)質(zhì)雞育種中的主要目標(biāo)之一,從分子水平上鑒定影響肌纖維類型的基因或標(biāo)記是目前雞功能基因研究的熱點(diǎn)之一,但前提是要找到與該形狀緊密聯(lián)系的標(biāo)記,以及適用于此研究的試劑盒。
過(guò)氧化物體增殖物激活受體γ輔激活因子1-α(PGC-1α)對(duì)肌肉中的能量代謝產(chǎn)生著非常重要的作用,其在肌肉纖維細(xì)胞中表達(dá)豐富,慢肌纖維的表達(dá)要高于快肌纖維,研究表明,PGC-1α可能是調(diào)控肌纖維的關(guān)鍵因子并可以組合肌纖維轉(zhuǎn)化過(guò)程中的多條信號(hào)通路,但關(guān)于PGC-1α基因的試劑盒卻很少,并且常見(jiàn)的試劑盒結(jié)構(gòu)都較為簡(jiǎn)單,空間利用率低,在有限的空間內(nèi)不能盛放多種試劑,實(shí)驗(yàn)人員需要另行購(gòu)買(mǎi)或配置所需試劑,從而影響實(shí)驗(yàn)效率。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
為了解決上述問(wèn)題,本實(shí)用新型提供一種快速診斷雞肉品質(zhì)基因試劑盒來(lái)滿足所有用戶需求,該試劑盒結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、使用方便,檢測(cè)過(guò)程不易受污染,診斷過(guò)程敏感性高、特異性強(qiáng)、耗時(shí)短,密封安全,方便運(yùn)輸。
本實(shí)用新型是通過(guò)以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的:一種快速診斷雞肉品質(zhì)基因試劑盒,包括盒體和連接在盒體上的盒蓋,盒體內(nèi)設(shè)有隔板,隔板將盒體內(nèi)部分隔成左、右兩個(gè)空間,右部空間內(nèi)分別架設(shè)上安裝板a、上安裝板b、下安裝板a和下安裝板b;上安裝板a和上安裝板b通過(guò)右部空間內(nèi)壁上開(kāi)設(shè)的插槽固定,插槽中嵌有安裝件;上安裝板a、下安裝板a對(duì)應(yīng)開(kāi)通孔形成試管槽a,上安裝板b和下安裝板b上分別開(kāi)設(shè)試管槽b,試管槽a和試管槽b內(nèi)均嵌裝試管,左部空間設(shè)有上下層疊的上襯墊和下襯墊,兩襯墊上開(kāi)設(shè)有容器槽,容器槽內(nèi)裝有試劑瓶。
進(jìn)一步地,PCR擴(kuò)增引物為:
上游引物序列為:5’-GGAGCAATAAAGCGAAGAGC-3’,
下游引物序列為:5’-CTGTGCTCCCACACCTACCT-3’。
進(jìn)一步地,LDR檢測(cè)反應(yīng)探針為:
A探針PGC-1α_modify序列:
5’-P-GTTCGTAGTCAGATATTTGAGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-FAM-3’,
B探針PGC-1α_G序列:
5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGTTTGGTCTGAGGAGGGTCATC-3’,
C探針PGC-1α_A序列:
5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGTTTGGTCTGAGGAGGGTCATT-3’。
進(jìn)一步地,試管包括含PGC-1α基因PCR擴(kuò)增引物的試管、含LDR檢測(cè)反應(yīng)探針的試管、含Taq酶的試管、含DNA連接酶的試管、含DNA模板的試管和含Mg2+的試管。
進(jìn)一步地,試劑瓶包括PCR緩沖液試劑瓶、含dNTP的試劑瓶、含Q-solution的試劑瓶和含去離子水的試劑瓶。
進(jìn)一步地,上襯墊底部設(shè)有凸起,下襯墊頂部設(shè)有凹槽,凸起和凹槽相配合,實(shí)現(xiàn)貼合連接,保持兩者的穩(wěn)定。
進(jìn)一步地,試管槽a和試管槽b的深度為試管高度的1/3-2/3。
進(jìn)一步地,盒蓋和盒體通過(guò)鎖扣扣合。
進(jìn)一步地,盒體上設(shè)有視窗,方便實(shí)驗(yàn)員觀測(cè)盒體內(nèi)部的情況。
進(jìn)一步地,上襯墊和下襯墊上均設(shè)有扣手,方便兩襯墊的取放。
本實(shí)用新型結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、使用方便,檢測(cè)過(guò)程不易受污染,能有效防止試劑交叉引起的污染,特異性強(qiáng)、耗時(shí)短,密封安全,方便運(yùn)輸,在有限的空間內(nèi)可以容納多種試劑,方便實(shí)驗(yàn)的操作,本實(shí)用新型自帶的含PCR擴(kuò)增引物的試管、含LDR檢測(cè)反應(yīng)探針的試管、PCR緩沖液試劑瓶、含Taq酶的試管等設(shè)備使得實(shí)驗(yàn)人員能夠快速診斷出不同個(gè)體肉雞上有利于標(biāo)記的基因以及適合育種的情況。
附圖說(shuō)明
圖1為本實(shí)用新型的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖2為盒體和盒蓋的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖3為安裝板的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖4為上襯墊和下襯墊的結(jié)構(gòu)示意圖;
圖中,1、盒體;2、盒蓋;3、隔板;4-1、上安裝板a;4-2、上安裝板b;4-3、下安裝板a;4-4、下安裝板b;5-1、試管槽a;5-2、試管槽b;6、試管;7、含PGC-1α基因PCR擴(kuò)增引物的試管;8、含LDR檢測(cè)反應(yīng)探針的試管;9、插槽;10、安裝件;11、海綿墊;12、上襯墊;13、下襯墊;14、凸起;15、凹槽;16、容器槽;17、試劑瓶;18、含Taq酶的試管;19、含DNA連接酶的試管;20、含DNA模板的試管;21、含Mg2+的試管;22、PCR緩沖液試劑瓶;23、含dNTP的試劑瓶;24、含Q-solution的試劑瓶;25、含去離子水的試劑瓶;26、鎖扣;27、視窗;28、扣手。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖對(duì)本實(shí)用新型做進(jìn)一步的說(shuō)明。
如圖1-4所示的快速診斷雞肉品質(zhì)基因試劑盒,包括盒體1和連接在盒體1上的盒蓋2,盒體1和盒蓋2通過(guò)鎖扣26扣合,盒蓋2內(nèi)側(cè)設(shè)有海綿墊11,起保護(hù)試管和試劑瓶的作用,盒體上設(shè)有視窗27,透過(guò)視窗可以判斷盒體1內(nèi)的試管和試劑瓶有無(wú)損壞情況,盒體1內(nèi)設(shè)有隔板3,隔板3將盒體1內(nèi)部分隔成左、右兩個(gè)空間,右部空間內(nèi)分別架設(shè)上安裝板a4-1、上安裝板b4-2、下安裝板a4-3和下安裝板b4-4;上安裝板a4-1和上安裝板b4-2通過(guò)右部空間內(nèi)壁上開(kāi)設(shè)的插槽9固定,插槽9中嵌有安裝件10;上安裝板a4-1、下安裝板a4-3對(duì)應(yīng)開(kāi)通孔形成試管槽a5-1,上安裝板b4-2和下安裝板b4-4分別開(kāi)設(shè)試管槽b5-2,試管槽a5-1和試管槽b5-2內(nèi)均嵌裝試管6,試管槽a5-1和試管槽b5-2的深度為試管6高度的1/3-2/3;左部空間設(shè)有上下層疊的上襯墊12和下襯墊13,上襯墊12底部設(shè)有凸起14,下襯墊13頂部設(shè)有凹槽15,凸起14和凹槽15相配合,實(shí)現(xiàn)貼合連接,上襯墊12和下襯墊13上均設(shè)有扣手28,兩襯墊上均開(kāi)設(shè)有容器槽16,容器槽16內(nèi)裝有試劑瓶17。
安裝件10使得下層試管距上層安裝板有一定間距,保證下層試管不會(huì)因?yàn)樯蠈影惭b板的擠壓而破碎。
上襯墊12上開(kāi)設(shè)的容器槽小于下襯墊13上開(kāi)設(shè)的容器槽,由此可以將不同大小的試劑瓶分層排放,提高盒體的空間利用率,上襯墊12的底部可開(kāi)設(shè)凹槽,與下襯墊13上的試劑瓶形成卡扣結(jié)構(gòu)。
PCR擴(kuò)增引物為:
上游引物序列為:5’-GGAGCAATAAAGCGAAGAGC-3’,
下游引物序列為:5’-CTGTGCTCCCACACCTACCT-3’;
含PCR擴(kuò)增引物的試管包括含PCR擴(kuò)增上游引物的試管和含PCR擴(kuò)增下游引物的試管。
LDR檢測(cè)反應(yīng)探針為:
A探針PGC-1α_modify序列:
5’-P-GTTCGTAGTCAGATATTTGAGAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-FAM-3’,
B探針PGC-1α_G序列:
5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGTTTGGTCTGAGGAGGGTCATC-3’,
C探針PGC-1α_A序列:
5’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGGTTTGGTCTGAGGAGGGTCATT-3’;
含LDR檢測(cè)反應(yīng)探針的試管為含三種探針混合物的試管。
如圖3所示,上安裝板a4-1和下安裝板a4-3上的試管槽a5-1內(nèi)插裝含PGC-1α基因PCR擴(kuò)增引物的試管7和含LDR檢測(cè)反應(yīng)探針的試管8,上安裝板b4-2的試管槽b5-2內(nèi)插裝含Taq酶的試管18和含DNA連接酶的試管19,下安裝板b4-4的試管槽b5-2內(nèi)插裝含DNA模板的試管20和含Mg2+的試管21。
如圖4所示,試劑瓶17可為PCR緩沖液試劑瓶22、含dNTP的試劑瓶23、含Q-solution的試劑瓶24和含去離子水的試劑瓶25。
由于本實(shí)用新型中的安裝板、上襯墊12或下襯墊13均可活動(dòng)的放置在盒體內(nèi),根據(jù)不同試劑的保存條件,可將安裝板從盒體1內(nèi)取出,或?qū)⑸弦r墊12或下襯墊13取出,放置在對(duì)應(yīng)的保存條件下,由此,增加了本實(shí)用新型的實(shí)用性。
利用本實(shí)用新型診斷雞肉品質(zhì)的操作步驟如下:
1.DNA提取:
對(duì)隨機(jī)選取的雞進(jìn)行采血,放入含有抗凝劑的EP管中,然后進(jìn)行DNA提??;
2.PCR擴(kuò)增:
PCR擴(kuò)增包含PGC-1α基因外顯子G646A突變位點(diǎn)的核苷酸序列,長(zhǎng)度為210bp,在該序列的第87bp處有一個(gè)G87-A87的堿基突變,所用的引物信息即為上述內(nèi)容中的上游引物和下游引物。
PCR擴(kuò)增SNP位點(diǎn)所在片段,PCR擴(kuò)增體系為:50ng/μL DNA模板1μL、20mMdNTP2μL、100mM Mg2+0.6μL、10×PCR反應(yīng)緩沖液2μL、10μM上下游引物各0.4μL、5U/μLTaq酶0.2μL、5×Q-solution 4μL、加ddH2O至總體積20μL。
PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5min、94℃變性30s、56℃退火30s、72℃延伸30s、35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸8min。
用2%瓊脂糖凝膠檢測(cè)PCR產(chǎn)物,判定PCR擴(kuò)增片段是否正確。
3.LDR分型:
剩余PCR產(chǎn)物用于LDR分型,LDR三根探針信息同上述內(nèi)容中的A、B、C探針。
LDR體系為:PCR產(chǎn)物1μL、10×PCR反應(yīng)緩沖液1μL、0.5μM探針混合物1μL、40U/μLDNA連接酶0.05μL、加ddH2O至總體積10μL。
LDR檢測(cè)反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性2min、94℃變性30s、60℃退火2mi,30個(gè)循環(huán)。
最后,對(duì)試驗(yàn)雞的基因進(jìn)行分析,并判斷何種基因更利于標(biāo)記和育種。
由于在上述實(shí)驗(yàn)中,需要多種試劑,且實(shí)驗(yàn)次數(shù)較多,需要大量的實(shí)驗(yàn),因此需要的每種試劑也較多,每種試劑的試管或試劑瓶至少為2個(gè),可為不同體積,根據(jù)需要取用,能有效防止試劑交叉引起的污染,可以保證在某種試劑污染后,不影響后續(xù)實(shí)驗(yàn)的進(jìn)行。
以上所述實(shí)施方式僅表達(dá)了本實(shí)用新型的一種實(shí)施方式,其描述較為具體和詳細(xì),但并不能因此而理解為對(duì)本實(shí)用新型專利范圍的限制。應(yīng)當(dāng)指出的是,對(duì)于本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō),在不脫離本實(shí)用新型構(gòu)思的前提下,還可以做出若干變形和改進(jìn),這些都屬于本實(shí)用新型的保護(hù)范圍。