本發(fā)明涉及一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法及其探針引物組合與試劑盒,屬于病毒核酸檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
豬流行性腹瀉(Porcine Epidemic Diarrhea,PED)和豬傳染性胃腸炎(Transmissible Gastroenteritis,TGE)二者均為高度接觸性腸道疾病,主要發(fā)生在冬季和春季等寒冷季節(jié),感染后,主要引起豬的嘔吐、腹瀉、食欲下降和脫水,各年齡段的豬均易感染。分別由兩種RNA病毒:豬流行性腹瀉病毒(Porcine Epidemic Diarrhea virus,PEDV)和傳染性胃腸炎病毒(Transmissible Gastroenteritis virus,TGEV)引起。該兩種病毒均可以破壞小腸上皮細(xì)胞而引起腸絨毛萎縮,對(duì)哺乳仔豬的致死率分別為30%-80%、80%-100%。由于二者引起的臨床癥狀、病理變化和流行病學(xué)極為相似,且往往混合感染,單憑臨床癥狀和組織病理學(xué)難以鑒別診斷。近幾年二者已成為當(dāng)前豬場(chǎng)常見(jiàn)的病毒性腹瀉,給養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。
目前常規(guī)的病毒診斷方法有病毒分離、熒光抗體檢測(cè)、血清學(xué)診斷方法和免疫組織化學(xué)以及PCR方法等,病毒分離困難,PCR方法因其具有快速、特異、準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),現(xiàn)己經(jīng)廣泛應(yīng)用于畜禽傳染病的快速診斷。以上這些診斷方法在特異性上尚存在一定的缺陷,在敏感性方面對(duì)早期感染往往不能做出準(zhǔn)確的判定;并且單一的RT-PCR方法用于多種病毒感染的臨床鑒別診斷,不能一次達(dá)到目的,且因?yàn)樾枰獙?duì)不同檢測(cè)病毒分別進(jìn)行擴(kuò)增,不僅樣品需求量較大,且耗時(shí)較長(zhǎng)。此外疾病的嚴(yán)重程度與病毒的含量相關(guān),傳統(tǒng)的檢測(cè)方法很難準(zhǔn)確測(cè)定樣品中的病毒含量,這使得實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法不僅在定量研究中具有重要意義,而且在檢測(cè)病毒存在及其在疾病發(fā)展過(guò)程中病毒對(duì)機(jī)體持續(xù)性作用方面也起重要作用。因此,開(kāi)發(fā)出一種同時(shí)特異檢測(cè)兩種豬病毒感染的雙重實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)試劑盒,有助于提升病毒檢測(cè)水平,在疾病診斷和防治及食品安全等方面具有重要的應(yīng)用前景。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
為了克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,本發(fā)明的目的在于提供一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR探針引物組合,包括以下引物對(duì)和探針:
PEDV上游引物:CGTGGAATTTCATTAGGTTTGCTTA
PEDV下游引物:CAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGT
PEDV探針:CAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGT
TGEV上游引物:GCAGGTAAAGGTGATGTGACAAGAT
TGEV下游引物:ACATTCAGCCAGTTGTGGGTAAT
TGEV探針:CTTGGCACTGCTCCCATTGGCAAC。
作為優(yōu)選,所述PEDV探針和TGEV探針序列的3’端結(jié)合相同的熒光淬滅基團(tuán);所述PEDV探針和TGEV探針序列的5’端結(jié)合不同的熒光報(bào)告基團(tuán)。
作為優(yōu)選,所述熒光淬滅基團(tuán)為BHQ1;所述PEDV探針的熒光報(bào)告基團(tuán)為HEX;所述TGEV探針的熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM。
本發(fā)明的另一目的在于提供一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法,包括以下步驟:
1)病毒總RNA提??;
2)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA;
3)RT-PCR擴(kuò)增:利用上述探針引物組合,以cDNA為模板進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,收集熒光信號(hào);
4)結(jié)果判定:若擴(kuò)增產(chǎn)物產(chǎn)生的Ct值≤38,則為陽(yáng)性。
作為優(yōu)選,步驟3)中,RT-PCR擴(kuò)增的反應(yīng)體系如下:2μL 10×PCR buffer、2μL 2.5mΜdNTP、1U Ace Taq DNA聚合酶、0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O。
作為優(yōu)選,步驟3)中,RT-PCR擴(kuò)增的反應(yīng)程序如下:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào)。
本發(fā)明的目的之三在于提供一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)試劑盒,包括上述的探針引物組合。
作為優(yōu)選,上述試劑盒還包括RT-PCR緩沖液、DNA聚合酶、酶混合物、陽(yáng)性對(duì)照品、陰性對(duì)照品;所述陰性對(duì)照為滅菌后焦碳酸二乙酯處理水。
作為優(yōu)選,所述RT-PCR緩沖液為氯化鎂和三磷酸脫氧核糖核苷酸的混合物;所述酶混合物包括RNA酶抑制劑,M-MLV逆轉(zhuǎn)錄酶和Ace Taq DNA聚合酶。
相比現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明的有益效果在于:
本發(fā)明運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù),采用PEDV和TGEV兩種病毒的特異性引物和探針,提供了一種PEDV和TGEV雙重TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)試劑盒。該發(fā)明是通過(guò)一個(gè)RT-PCR反應(yīng)可以從樣本中同時(shí)檢測(cè)出PEDV和TGEV的存在,比傳統(tǒng)的普通PCR和單重?zé)晒舛縋CR方法更簡(jiǎn)便、省時(shí)和快捷,并且能夠?qū)Υ龣z測(cè)的病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)準(zhǔn)確定量。本發(fā)明提供的試劑盒可判定在疾病爆發(fā)時(shí)哪種病毒在起主要作用,從而為實(shí)現(xiàn)臨床早期診斷和及時(shí)制定治療方案、減少死亡率及后遺癥成為可能。
附圖說(shuō)明
圖1為實(shí)施例2步驟1)的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖,其中,曲線A為PEDV病毒,曲線B為T(mén)GEV病毒;
圖2為實(shí)施例2步驟2)的特異性試驗(yàn)結(jié)果圖;
圖3為實(shí)施例2步驟3)的敏感性試驗(yàn)結(jié)果圖;
圖4為實(shí)施例2步驟3)的普通RT-PCR敏感性試驗(yàn)結(jié)果圖。
具體實(shí)施方式
下面,結(jié)合附圖以及具體實(shí)施方式,對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步描述:
以下具體實(shí)施方式中,如未特殊說(shuō)明,所采用的試劑或儀器均可通過(guò)市售的途徑獲得。采用的DNA聚合酶為DNA聚合酶為Vazyme公司生產(chǎn)的Ace Taq DNA Polymerase(Code NO P401-d2)。
本發(fā)明提供一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR探針引物組合,包括以下引物對(duì)和探針:
PEDV上游引物SEQ ID No.1:CGTGGAATTTCATTAGGTTTGCTTA
PEDV下游引物SEQ ID No:2:CAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGT
PEDV探針SEQ ID No.3:CAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGT
TGEV上游引物SEQ ID No.4:GCAGGTAAAGGTGATGTGACAAGAT
TGEV下游引物SEQ ID No.5:ACATTCAGCCAGTTGTGGGTAAT
TGEV探針SEQ ID No.6:CTTGGCACTGCTCCCATTGGCAAC。
以下具體實(shí)施方式中,PEDV和TGEV的上下游引物和探針委托上海Invitrogen公司合成。以下具體實(shí)施例中,使用的PEDV探針為HEX-CAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGT-BHQ1,使用的TGEV探針為FAM-CTTGGCACTGCTCCCATTGGCAAC-BHQ1。
本發(fā)明同時(shí)提供了一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法,包括以下步驟:
1)病毒總RNA提??;
2)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA;
3)RT-PCR擴(kuò)增:利用上述的探針引物組合,以cDNA為模板進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,收集熒光信號(hào);
4)結(jié)果判定:若擴(kuò)增產(chǎn)物產(chǎn)生的Ct值≤38,則為陽(yáng)性。
本發(fā)明提供的PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)試劑盒,包括上述的探針引物組合。
本發(fā)明中,PEDV上游引物和PEDV下游引物的Tm值范圍為59.2-61.3℃;PEDV探針的Tm值為71℃;TGEV上游引物和TGEV下游引物為58-62.1℃、TGEV探針的Tm值為70.6℃。
實(shí)施例1:制備質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品
1)病毒總RNA提取
將含有PEDV和TGEV病毒的組織樣品各100mg置于1.5mL離心管中,用病毒RNA/DNA抽提試劑盒Axyprep Body Fluid Vial DNA/RNA Miniprep Kit(AXYGEN)提取,得到病毒總RNA;
2)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
在無(wú)RNase的0.2mL PCR管中依次加入步驟1)制備的病毒總RNA 10μL,OligodT-Adaptor primer(10pmol/L)2μL,5×Buffer 4μL,dNTP Mixture(10mM)2μL,RNase Inhibitor(40U/μL)0.5μL,M-MLV(200U/μL)1μL,不含RNase的ddH2O補(bǔ)足至20μL。37℃60min,72℃10min。待反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)結(jié)束后,所得反應(yīng)液即為cDNA模板;
3)qPCR擴(kuò)增
qPCR反應(yīng)體系(總反應(yīng)體積20μL):取2μL步驟2)獲得的cDNA為模板進(jìn)行TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),其中10×PCR buffer2μL,2.5mΜdNTP 2μL,Ace Taq DNA聚合酶1.5U,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O;反應(yīng)參數(shù)為:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào)。
4)獲得質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品
將步驟3)獲得的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,按照DNA Gel Extraction Kit操作方法回收目的片段,將回收產(chǎn)物連接到PMD18-T載體上,通過(guò)大腸桿菌DH-5α感受態(tài)轉(zhuǎn)化,挑取其中白色單菌落進(jìn)行鑒定,重組質(zhì)粒序列委托上海Invitrogen公司進(jìn)行序列測(cè)定。利用Plasmid Miniprep Kit提取測(cè)序正確的重組質(zhì)粒DNA,PEDV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的序列如SEQ ID No.7所示;TGEV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品序列如SEQ ID No.8所示,利用核酸蛋白檢測(cè)儀(thermo)定量重組質(zhì)粒PEDV為1.8×1011Copies/μL,TGEV為8.1×1011Copies/μL。
實(shí)施例2:檢測(cè)方法的建立及驗(yàn)證
1)制作標(biāo)準(zhǔn)曲線
取實(shí)施例1獲得的PEDV和TGEV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,以無(wú)菌去離子水將質(zhì)粒按照1.0×101Copies/μL-1.0×106Copies/μL 10倍梯度稀釋制備質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)溶液,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),反應(yīng)體系:2μL標(biāo)準(zhǔn)溶液作為模板,10×buffer 2μL,2.5mΜdNTP 2μL,Ex Taq DNA聚合酶1U,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O。反應(yīng)參數(shù)為:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào)。擴(kuò)增完成后,以Ct值為縱坐標(biāo),log10X(X為標(biāo)準(zhǔn)品系列濃度)為橫坐標(biāo),Ct值與log10X呈線性關(guān)系,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,結(jié)果如圖1所示,呈良好的線性關(guān)系。
2)特異性試驗(yàn)
配制12份相同的實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系反應(yīng)液,分別單獨(dú)加入2μL提取的PCV2、PRV核酸DNA或已反轉(zhuǎn)錄的PRRSV、CSFV、PEDV以及TGEV的cDNA為模板,即,反應(yīng)體系為10×PCR buffer2μL,2.5mΜdNTP 2μL,Ace Taq DNA聚合酶1.5U,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O。反應(yīng)參數(shù)為:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào)。
結(jié)果如圖2所示,圖2中,上曲線從左到右依次為T(mén)GEV、PEDV,下曲線為PRV、CSFV、PRRSV、PCV2及陰性對(duì)照。該方法能很好地同時(shí)通過(guò)雙重TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR擴(kuò)增出對(duì)應(yīng)兩種病毒擴(kuò)增產(chǎn)物,并通過(guò)擴(kuò)增曲線及熒光集團(tuán)的不同,將兩種產(chǎn)物明顯區(qū)分開(kāi)來(lái)。
由此,我們可得以下結(jié)論:PEDV和TGEV兩種病毒可同時(shí)通過(guò)一次雙重實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR反應(yīng),擴(kuò)增出相應(yīng)目的產(chǎn)物,并能在擴(kuò)增曲線上,通過(guò)Ct和所標(biāo)記熒光基團(tuán)的不同,將兩種病毒有效區(qū)分開(kāi)來(lái),可以很直觀通過(guò)擴(kuò)增曲線來(lái)判定試驗(yàn)結(jié)果,證明所檢測(cè)兩種病毒正是PEDV和TGEV。
3)敏感性試驗(yàn)
以本實(shí)施例步驟1)的10倍系列稀釋的PEDV和TGEV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品(1.0×101~1.0×106Copies/μL)作為模板,每個(gè)稀釋度設(shè)立3個(gè)重復(fù),分別進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR、普通RT-PCR檢測(cè)敏感度,比較敏感性。
敏感性實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,本發(fā)明可檢測(cè)出10Copies/μL的病毒量見(jiàn)圖3,曲線a至f分別對(duì)應(yīng)PEDV的1×106,1×105,1×104,1×103,1×102和1×101各自的拷貝;曲線1至6分別對(duì)應(yīng)TGEV的1×106,1×105,1×104,1×103,1×102和1×101各自的拷貝;由此可見(jiàn)本發(fā)明檢測(cè)病毒的敏感性高于常規(guī)PCR約100倍。
普通RT-PCR只能檢測(cè)到1000Copies/μL的病毒量見(jiàn)圖4,泳道1至7分別對(duì)應(yīng)PEDV的1×106,1×105,1×104,1×103,1×102和1×101;泳道8至14分別對(duì)應(yīng)TGEV的1×106,1×105,1×104,1×103,1×102和1×101各自的拷貝;普通RT-PCR檢測(cè)只能檢測(cè)到1×103Copies/μL的病毒量。
4)穩(wěn)定性試驗(yàn)
取本實(shí)施例步驟1)的10倍系列稀釋的PEDV和TGEV質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品溶液,取DEPC-H2O作為陰性對(duì)照品,分別進(jìn)行批內(nèi)、批間重復(fù)試驗(yàn)。批內(nèi)重復(fù)試驗(yàn)是將3份樣品在同一次實(shí)時(shí)熒光定量試驗(yàn)中重復(fù)3次;批間重復(fù)試驗(yàn)是在3次不同時(shí)間的試驗(yàn)中(間隔1月)進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR試驗(yàn)。穩(wěn)定性結(jié)果如下表所示顯示,本發(fā)明2種病毒批內(nèi)的變異系數(shù)分別為0.05%、0.58%、0.16%、0.09%、0.41%、0.32%;批間的變異系數(shù)分別為1.8%、2.7%、3.3%、2.4%、3.2%、3.7%,由此可見(jiàn)本發(fā)明檢測(cè)過(guò)程中具有良好的穩(wěn)定性。
表1穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果
實(shí)施例3:試樣檢測(cè)
一種PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法,包括以下步驟:
1)病毒總RNA提取:將含有PEDV、TGEV病毒的細(xì)胞上清各200μL置于1.5mL離心管中,用病毒RNA/DNA抽提試劑盒Axyprep Body Fluid Vial DNA/RNA Miniprep Kit(AXYGEN)從細(xì)胞株提取病毒總RNA;
2)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA:
在無(wú)RNase的0.2mL PCR管中依次加入步驟1)制備的病毒總RNA 10μL,OligodT-Adaptor primer(10pmol/L)2μL,5×Buffer 4μL,dNTP Mixture(10mM)2μL,RNase Inhibitor(40U/μL)0.5μL,M-MLV(200U/μL)1μL,不含RNase的ddH2O補(bǔ)足至20μL。37℃60min,72℃10min。待反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)結(jié)束后,所得反應(yīng)液即為cDNA模板;
3)PEDV和TGEV兩種病毒雙重TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR擴(kuò)增:
qPCR反應(yīng)體系(總反應(yīng)體積20μL):取2μL步驟2)得到的cDNA為模板進(jìn)行TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),其中10×PCR buffer2μL,2.5mΜdNTP 2μL,Ace Taq DNA聚合酶1.5U,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O;反應(yīng)參數(shù)為:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào)。
4)結(jié)果判定:若擴(kuò)增產(chǎn)物產(chǎn)生的Ct值≤38,則為陽(yáng)性。
實(shí)施例4:臨床檢驗(yàn)
1)樣本采集
樣本共計(jì)52份,其中在廣東地區(qū)采集血清22份,感染不同代次的細(xì)胞19份,組織病料11份。
2)總RNA小量抽提
用病毒RNA/DNA抽提試劑盒Axyprep Body Fluid Vial DNA/RNA Miniprep Kit(AXYGEN)從細(xì)胞株提取病毒總RNA;
3)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA:
同實(shí)施例3步驟2);
4)RT-PCR檢測(cè)和雙重TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR
qPCR反應(yīng)體系(總反應(yīng)體積20μL):取2μL已反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板進(jìn)行TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng),其中10×PCR buffer 2μL,2.5mΜdNTP 2μL,Ace Taq DNA聚合酶1.5U,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.2μM PEDV探針、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物和0.25μM TGEV探針、補(bǔ)足至20μL的ddH2O;反應(yīng)參數(shù)為:95℃1min;95℃10s,60℃30s,40個(gè)循環(huán),從60℃開(kāi)始收集熒光信號(hào),記載Ct值。
5)定量分析
根據(jù)實(shí)施例2步驟1)的標(biāo)準(zhǔn)曲線及待測(cè)樣品Ct值,計(jì)算待測(cè)標(biāo)本病毒Copies/μL。通過(guò)結(jié)果分析得出所采集樣本中PEDV和TGRV兩種病毒的總cDNA大都在101~109Copies/μL之間(超過(guò)以及等于106拷貝/μL的樣品,均稀釋100后再次檢測(cè)),而在普通PCR檢測(cè)呈陰性通過(guò)本發(fā)明檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性的樣本,其對(duì)應(yīng)拷貝數(shù)值在103Copies/μL左右。
對(duì)比例:普通RT-PCR檢測(cè)
對(duì)比例中,樣本采集、總RNA小量抽提以及反轉(zhuǎn)錄合成cDNA步驟均于實(shí)施例4相同,后采用普通RT-PCR進(jìn)行檢測(cè),其中RT-PCR反應(yīng)體系(總反應(yīng)體積25μL):10×PCR buffer 2.5μL,25mM MgCl22μL,2.5mM dNTP 2.5μL,Ace Taq DNA聚合酶2U,以cDNA2μL為模板,0.3μM PEDV上游引物、0.3μM PEDV下游引物、0.3μM TGEV上游引物、0.3μM TGEV下游引物,加ddH2O至反應(yīng)體系總體積為25μL,分別進(jìn)行普通RT-PCR擴(kuò)增。反應(yīng)在Bio-Rad S1000PCR擴(kuò)增儀進(jìn)行反應(yīng)參數(shù)為:95℃5min;94℃30s,60℃30s,72℃30s,35個(gè)循環(huán),72℃10min。
5)結(jié)果檢測(cè):通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。
實(shí)施例4與對(duì)比例相比,對(duì)于同一批待測(cè)樣品,實(shí)施例4檢測(cè)出21份PEDV陽(yáng)性,9份TGEV陽(yáng)性,其中PEDV和TGEV混合感染3份;對(duì)比例檢測(cè)出19份PEDV陽(yáng)性,8份TGEV陽(yáng)性,其中PEDV和TGEV混合感染3份。
由上述結(jié)果可知,采用本發(fā)明提供的PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)方法的實(shí)施例4,其檢測(cè)效果明顯好于采用普通RT-PCR方法的對(duì)比例,可以減少假陰性的發(fā)生,同時(shí)一次可以檢測(cè)出混合感染,減少二次RT-PCR驗(yàn)證及不需要RT-PCR擴(kuò)增后續(xù)處理,大大節(jié)約時(shí)間,提高工作效率。
本發(fā)明的提供的PEDV和TGEV雙重RT-PCR檢測(cè)試劑盒,包括a)熒光定量RT-PCR反應(yīng)液、b)陽(yáng)性對(duì)照品、c)陰性對(duì)照品和d)定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)品;
其中,所述a)熒光定量RT-PCR反應(yīng)液包含RT-PCR緩沖液、DNA聚合酶、PEDV上游引物SEQ ID No.1、PEDV下游引物SEQ ID No:2、PEDV探針SEQ ID No.3、TGEV上游引物SEQ ID No.4、TGEV下游引物SEQ ID No.5、TGEV探針SEQ ID No.6;
所述RT-PCR緩沖液為氯化鎂和三磷酸脫氧核糖核苷酸混合物;
所述b)陽(yáng)性對(duì)照品為含有PEDV和TGEV兩種病毒的陽(yáng)性質(zhì)?;旌衔铮?/p>
所述c)陰性對(duì)照品為滅菌后焦碳酸二乙酯處理水;
所述d)定量RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)品為PEDV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品和TGEV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品。
所述PEDV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品序列為SEQ ID No.7:GTGGAATTTCATTAGGTTTGCTTAAGTAGCCATCGCAAGTGCTGTGCTGTCCTCTAGTTCCTGGTTGGCGTTCCGTCGCCTTCTACATACTAGACAAACAGCCTTCCTCCG;
所述TGEV陽(yáng)性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品序列為SEQ ID No.8:GCAGGTAAAGGTGATGTGACAAGATTTTATGGAGCTAGAAGCAGTTCAGCCAATTTTGGTGACACTGACCTCGTTGCCAATGGGAGCAGTGCCAAGCATTACCCACAACTGGCTGAATGT。
上述試劑盒應(yīng)避光保存于-20℃,盡量減少反復(fù)凍融。
對(duì)于本領(lǐng)域的技術(shù)人員來(lái)說(shuō),可根據(jù)以上描述的技術(shù)方案以及構(gòu)思,做出其它各種相應(yīng)的改變以及變形,而所有的這些改變以及變形都應(yīng)該屬于本發(fā)明權(quán)利要求的保護(hù)范圍之內(nèi)。