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檢測(cè)突變簇的方法和裝置與流程

文檔序號(hào):11285528閱讀:284來(lái)源:國(guó)知局

pct國(guó)內(nèi)申請(qǐng),說(shuō)明書(shū)已公開(kāi)。



技術(shù)特征:

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)一種檢測(cè)突變簇的方法,該方法包括:獲取待測(cè)樣本的突變數(shù)據(jù),突變數(shù)據(jù)包括N個(gè)SNP在參考序列上的位置信息;將參考序列劃分為多個(gè)多重重疊窗口,使每個(gè)窗口包含Num個(gè)SNP;棄去不符合(a)和/或(b)的窗口,獲得第一候選突變簇,(a)窗口的大小D<Len,Len為預(yù)定的Num個(gè)SNP突變間距閾值,Len≤ADL,ADL為1/Num的平均突變間距,i為SNP在參考序列上的編號(hào),di為SNPi的突變間距,SNPi的突變間距為參考序列上SNPi到SNPi+1或SNPi?1的距離,(b)窗口的突變密度顯著高于待測(cè)樣本整體的突變密度;合并有重疊的第一候選突變簇。

技術(shù)研發(fā)人員:宋彬;李波;侯勇;劉耿
受保護(hù)的技術(shù)使用者:深圳華大基因股份有限公司
技術(shù)研發(fā)日:2015.03.06
技術(shù)公布日:2017.09.26
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