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Midkine穩(wěn)定低表達的LM3細胞系及其構(gòu)建方法與流程

文檔序號:12696993閱讀:1164來源:國知局
Midkine穩(wěn)定低表達的LM3細胞系及其構(gòu)建方法與流程

本發(fā)明涉及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體地說涉及一種穩(wěn)定低表達Midkine蛋白的LM3穩(wěn)定細胞系及其構(gòu)建方法。



背景技術(shù):

Midkine蛋白是一種重要的細胞因子,分子量大小為13kDa,可以與肝素結(jié)合,是肝素結(jié)合生長因子家族成員之一。近些年研究發(fā)現(xiàn),Midkine蛋白在正常人組織中不表達或低表達,而在多種惡性腫瘤中過度表達,包括肝癌、胰腺癌、乳腺癌、腸癌等。研究發(fā)現(xiàn),Midkine蛋白具有多種生物學(xué)功能,如促進細胞有絲分裂、細胞增殖、血管生成、誘導(dǎo)細胞惡性轉(zhuǎn)化、抗凋亡等活性,從而影響腫瘤細胞的增殖、分化和凋亡,成為腫瘤生物學(xué)研究的熱點之一。此外,Midkine蛋白還具有分泌性,在惡性腫瘤患者血清中發(fā)現(xiàn)Midkine蛋白表達量顯著提高,而在正常人血清中幾乎檢測不到。因此,血清Midkine有望成為一種新的腫瘤標志物,用于腫瘤臨床早期診斷、預(yù)后判斷等輔助性治療,成為腫瘤生物標志物研究的目標。

肝癌在我國的發(fā)病率和死亡率很高,嚴重危害國民身體健康。對肝癌發(fā)病機制的研究是腫瘤生物學(xué)研究的重要課題。目前關(guān)于Midkine功能研究主要發(fā)生在腫瘤增殖、遷移和表皮細胞間質(zhì)化(Epithelial-to-Mesenchymal Transition,EMT)等方面,而Midkine蛋白對肝癌細胞發(fā)生發(fā)展的生物學(xué)調(diào)控機制報道很少,尤其是Midkine與肝癌能量代謝的調(diào)控機制尚不清楚。本發(fā)明通過慢病毒轉(zhuǎn)染體系構(gòu)建Midkine低表達穩(wěn)定肝癌細胞株,為研究Midkine對肝癌的致病機制以及生物學(xué)功能提供有力工具。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的是提供一種低表達Midkine蛋白的LM3穩(wěn)定細胞系及其構(gòu)建方法,該細胞系可作為細胞模型,用于研究Midkine對腫瘤尤其是肝癌發(fā)生發(fā)展的調(diào)控機制以及對細胞代謝通路的影響等生物學(xué)功能。

本發(fā)明提供的一種低表達Midkine蛋白的LM3穩(wěn)定細胞系,是以肝癌細胞 系LM3作為宿主細胞,感染帶有Midkine shRNA基因的病毒培養(yǎng)液,經(jīng)過Puromycin抗性篩選、細胞擴大培養(yǎng)后獲得低表達Midkine蛋白的穩(wěn)定細胞系。由于Midkine基因與tGFP報告基因融合表達,可以在熒光顯微鏡下直接觀測到Midkine重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染效率。

本發(fā)明提供的一種低表達Midkine蛋白的LM3穩(wěn)定細胞系的構(gòu)建方法,包括如下步驟:

(1)從Open Biosystems公司購買攜帶Midkine shRNA序列的pSM2載體。設(shè)計對應(yīng)Midkine shRNA的PCR引物(如下),采用PCR方法擴增Midkine shRNA基因;

Forward primer:5′-AAGCCCTTTGTACACCCTAAGCCT-3′

Reverse primer:5′-ACTGGTGAAACTCACCCAGGGATT-3′

(2)采用PCR產(chǎn)物清潔試劑盒將上述PCR產(chǎn)物清潔后,測定OD值。

(3)采用Mlu I和Xho I酶對慢病毒表達載體pLenti進行雙酶切,切膠回收線性載體。

(4)利用T4DNA連接酶將步驟(2)中PCR片斷與步驟(3)中線性載體pLenti于16℃過夜連接,構(gòu)建pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒。

(5)將上述連接反應(yīng)液轉(zhuǎn)化E.coli.DH5a感受態(tài)細胞,放入37℃過夜培養(yǎng)16小時以上;次日收集菌體,從細菌培養(yǎng)液中提取重組質(zhì)粒pLenti-MDKshRNA,進行Mlu I和Xho I雙酶切鑒定。

(6)細胞轉(zhuǎn)染實驗前一天,在100mm培養(yǎng)皿中接種0.5×106~1×106cells個HEK293T細胞,次日細胞匯合度達到50~70%。

(7)細胞轉(zhuǎn)染實驗。采用慢病毒轉(zhuǎn)染方法,將步驟(5)獲得的重組質(zhì)粒pLenti-MDKshRNA與病毒包裝質(zhì)粒psPAX2、pVSVG按照10:9:1質(zhì)量比例混合(總質(zhì)量6μg),添加到580μl Opti-MEM基本培養(yǎng)基中,然后加入12μl轉(zhuǎn)染試劑,混勻、室溫靜置20min;取出HEK293T細胞,除去培養(yǎng)基,添加5ml PBS清洗1次;除去PBS溶液,添加3ml DMEM基本培養(yǎng)基室溫培養(yǎng)20min;然后將上述轉(zhuǎn)染試劑混合液逐滴添加到預(yù)先接種HEK293細胞的100mm培養(yǎng)皿中,輕輕搖勻,放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱里培養(yǎng);6個小時后取出培養(yǎng)皿,補加7ml DMEM完全培養(yǎng)基,放入培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)。

(8)培養(yǎng)48小時后,收集含有上述含有病毒的細胞培養(yǎng)液,使用0.45μm 低吸附無菌濾膜過濾并保留濾液。該病毒培養(yǎng)液可以直接使用或濃縮后使用,也可放置-80℃長期保存。

(9)病毒轉(zhuǎn)染實驗前一天,在6孔板中接種LM3細胞,每孔接種2×105cells,次日細胞匯合度可達50~70%。

(10)病毒轉(zhuǎn)染實驗。從細胞培養(yǎng)箱中取出培養(yǎng)LM3細胞的6孔板,除去細胞培養(yǎng)液,將步驟(8)中獲得的含有病毒的細胞培養(yǎng)液添加到上述LM3細胞培養(yǎng)皿中,每孔添加2.5ml,然后放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱,繼續(xù)培養(yǎng)24小時。

(11)次日從細胞培養(yǎng)箱中取出上述6孔板,除去含有病毒的培養(yǎng)液,添加含有體積濃度10%胎牛血清和終濃度1×P/S的DMEM新鮮培養(yǎng)液,放入細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48~72小時。

(12)培養(yǎng)48~72小時以后,在熒光顯微鏡下可見細胞發(fā)出綠色熒光。在培養(yǎng)液中添加終濃度為2μg/ml的Puromycin進行陽性細胞系篩選。每三天更換一次含有2μg/ml Puromycin的DMEM新鮮培養(yǎng)液。連續(xù)篩選七周以上,直到熒光顯微鏡下可見所有細胞都發(fā)出綠色熒光,說明獲得了穩(wěn)定生長的陽性細胞系。

(13)陽性細胞系鑒定。取出部分篩選后的LM3細胞,分別采用細胞倒置熒光顯微鏡、RT-qPCR和Western Blot鑒定Midkine基因和蛋白的表達。采用該轉(zhuǎn)染方法,Midkine基因沉默效率可達80%以上,并且持續(xù)低表達,證明Midkine低表達LM3細胞系構(gòu)建成功。

(14)與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明通過調(diào)整慢病毒轉(zhuǎn)染時間、轉(zhuǎn)染體系等條件,獲得了穩(wěn)定低表達Midkine細胞系,該方法具有轉(zhuǎn)染效率高,能特異、持續(xù)、穩(wěn)定的低表達Midkine優(yōu)點。本發(fā)明為研究Midkine蛋白在肝癌中的作用機制與腫瘤能量代謝提供有力工具。

附圖說明

圖1:pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒的酶切圖;其中M表示λ-HindⅢdigest,泳道1表示重組質(zhì)粒,泳道2表示重組質(zhì)粒酶切圖。

圖2:低表達人Midkine基因的LM3穩(wěn)定細胞系在倒置熒光顯微鏡(100倍)的細胞熒光鑒定圖。

圖3:低表達人Midkine基因的LM3穩(wěn)定細胞系RT-qPCR鑒定圖。

圖4:低表達人Midkine基因的LM3穩(wěn)定細胞系Western Blot鑒定圖。泳道1為對照,泳道2為穩(wěn)定細胞系,抗體為Rabbit Anti-Midkine Antibody。

具體實施方式

實施例1、重組表達載體pLenti-MDKshRNA構(gòu)建

(1)從Open Biosystems公司購買商品化帶有Midkine shRNA序列的pSM2載體。采用PCR方法擴增Midkine shRNA基因,引物序列如下:

MDKshRNA Forward Primer:5′-AAGCCCTTTGTACACCCTAAGCCT-3′

MDKshRNA Reverse primer:5′-ACCTGGTGAAACTCACCCAGGGATT-3′

PCR擴增反應(yīng)體系如下:

PCR反應(yīng)條件:

(2)采用寶生物公司TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit將上述PCR產(chǎn)物進行清潔回收,并溶于110μl無菌水。操作步驟參照說明書。

(3)將回收的PCR產(chǎn)物進行Mlu I和Xho I雙酶切,酶切反應(yīng)體系如下:50μl酶切體系,分別添加5μl PCR產(chǎn)物、10U Mlu I、10U Xho I、5μl 10×H buffer,其余用dH2O補足,混勻后,放入37℃水浴孵育1小時。

(4)將酶切產(chǎn)物在1.2%~1.5%(g/ml)瓊脂糖凝膠上電泳,并進行切膠回收。采用寶生物公司凝膠回收試劑盒TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit,參照產(chǎn)品說明書操作。Midkine shRNA片斷長度為345bp,最終溶于50μl無菌水。

(5)采用NanoDrop1000測定Midkine shRNA片斷濃度。

(6)準備慢病毒載體plenti。采用Mlu I和Xho I限制酶對重組質(zhì)粒pLenti進行雙酶切,在37℃水浴孵育1小時;然后在0.8%瓊脂糖凝膠電泳,并切 膠回收線性載體。

(7)利用T4DNA連接酶將plenti線性載體和Midkine shRNA片斷,于16℃過夜連接。

(8)采用熱轉(zhuǎn)化方法,將上述連接反應(yīng)液轉(zhuǎn)化E.coli.DH5a感受態(tài)細胞后,在含有100μg/ml Ampicillin的LB培養(yǎng)基過夜培養(yǎng),次日提取pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒。質(zhì)粒提取試劑盒采用TaKaRa MiniBEST Plasmid Purification Kit,具體操作步驟參照說明書。

(9)對提取的pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒進行Mlu I和Xho I雙酶切鑒定(見圖1)。酶切反應(yīng)體系如下:50μl酶切體系,含有1μg的pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒、10U Mlu I、10U Xho I、5μl 10×H buffer,其余用dH2O補足,混勻后,放入37℃水浴孵育1小時;然后在1%(g/ml)瓊脂糖凝膠電泳檢測。

實施例2、低表達Midkine穩(wěn)定細胞系的建立,具體實施步驟如下:

(1)將pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒大量提取后,測定OD值。

(2)在100mm培養(yǎng)皿中接種1×106個HEK293T細胞,添加10ml含有10%胎牛血清、1×P/S的DMEM培養(yǎng)基,放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱里培養(yǎng),次日細胞匯合度約50~70%。

(3)細胞轉(zhuǎn)染實驗。將重組質(zhì)粒pLenti-MDKshRNA和病毒包裝質(zhì)粒psPAX2、pVSVG按照10:9:1質(zhì)量比例混合到Opti-MEM基本培養(yǎng)液中,具體操作如下:分別將3μg pLenti-MDKshRNA重組質(zhì)粒、2.7μg psPAX2和0.3μg pVSVG包裝質(zhì)粒添加到580μl Opti-MEM基本培養(yǎng)液中,混合均勻,然后添加12μl Transfect Reagent(ThermoFisher)轉(zhuǎn)染試劑,混勻、室溫靜置20分鐘;取出HEK293T細胞,除去培養(yǎng)液,添加5ml PBS清洗一次;除去PBS溶液、添加3ml DMEM基本培養(yǎng)液室溫放置20min;然后將上述含有轉(zhuǎn)染試劑的培養(yǎng)液逐滴添加到HEK293T細胞培養(yǎng)皿中,輕輕搖勻,放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱里培養(yǎng);培養(yǎng)6小時以后,補加含有10%胎牛血清和終濃度1×P/S的DMEM培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48小時。

(4)培養(yǎng)48小時后,收集含有病毒的細胞培養(yǎng)液,采用0.45μm濾膜過濾含有病毒的細胞培養(yǎng)液,保留含有病毒的濾出液。該病毒培養(yǎng)液可以直接使用或濃縮后使用,也可以放置在-80℃長期保存?zhèn)溆谩?/p>

(5)病毒轉(zhuǎn)染實驗前一天,在6孔板中接種LM3細胞,每孔接入2×105cells,添加含有10%胎牛血清、1×P/S的DMEM培養(yǎng)基,放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱里培養(yǎng),次日細胞匯合度約50~70%。

(6)病毒轉(zhuǎn)染實驗當(dāng)天,取出預(yù)先接種LM3細胞的6孔板,除去細胞培養(yǎng)液,每孔添加2ml PBS清洗一次,除去PBS溶液,然后將步驟(3)獲得的病毒培養(yǎng)液,按照250μl/孔添加到6孔板中,輕輕混勻,放入CO2培養(yǎng)箱,培養(yǎng)24小時。

(7)次日取出6孔板,除去病毒培養(yǎng)液,每孔添加2.5ml含有10%胎牛血清、1×P/S的DMEM新鮮培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48~72小時。期間在熒光顯微鏡下觀察細胞是否發(fā)出綠色熒光。

(8)陽性細胞系篩選。培養(yǎng)48~72小時以后,在熒光顯微鏡下可見細胞發(fā)出綠色熒光,然后在細胞培養(yǎng)液中添加終濃度為2μg/ml Puromycin篩選陽性細胞;每三天更換一次含有2μg/ml Puromycin的DMEM完全培養(yǎng)基,連續(xù)篩選七周以上,直到觀測到幾乎所有細胞都發(fā)出綠色熒光為止(見圖2);當(dāng)細胞匯合度達到80~90%時,按照1/5比例傳代,同時添加含有2μg/ml Puromycin的DMEM完全培養(yǎng)基進行篩選;也可以在熒光顯微鏡下挑取陽性細胞簇,使用培養(yǎng)基稀釋到1cell/孔,利用96孔板篩選陽性單克隆細胞系。

(9)低表達Midkine基因檢測。根據(jù)人Midkine基因的外顯子序列,設(shè)計一對特異性引物(如下)。提取陽性細胞系總RNA,進行RT-qPCR檢測,電泳檢測(結(jié)果如圖3)。核酸提取試劑和qPCR檢測試劑分別采用寶生物公司RNAiso Plus和One Step SYBR PrimeScrip RT-PCR Kit,操作步驟參照產(chǎn)品說明書。引物序列如下:

MDK Forward Primer:5’-TGCCCTGCAACTGGAAGAA-3’

MDK Reverse Primer:5’-CTTGGTGACGCGGATGGT-3’

(10)轉(zhuǎn)染效率檢測。提取穩(wěn)定細胞株總蛋白,采用BCA方法進行蛋白定量,然后進行Western Blot檢測Midkine蛋白表達量(見圖4)。具體操作方法如下:將Midkine低表達的LM3細胞傳代至100mm培養(yǎng)皿中,添加8ml預(yù)冷的PBS清洗1次,棄上清,加入350μl預(yù)冷的RIPA細胞裂解液(ThermoFisher)到上述培養(yǎng)皿中,將培養(yǎng)皿置于冰上裂解細胞30min,期間輕輕混勻幾次;然后使用預(yù)冷的細胞刮鏟將細胞快速刮下,并轉(zhuǎn)移到1.5ml離 心管中;然后12000rpm,4℃離心30min,小心吸取上清液,轉(zhuǎn)移到新的1.5ml離心管中。采用BCA法測定蛋白濃度(ThermoFisher),操作方法參考產(chǎn)品說明書。吸取20μg蛋白提取液,加入終體積1/5的4×SDS PAGE Loading Buffer,于100℃變性5min,進行10%SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,恒定電壓80V;然后將蛋白電轉(zhuǎn)至PVDF膜,恒定電流250mA;轉(zhuǎn)膜后,將PVDF膜用質(zhì)量體積比為5%的脫脂奶粉(用TBST溶液配制)封閉1小時,然后加入TBST溶液洗膜3次,每次10min,加入rabbit anti-MDK抗體,于4℃過夜孵育。次日早上,回收一抗,添加TBST洗膜3次,每次10min,再加入鼠二抗,室溫孵育1小時,TBST洗膜3次,每次10min。加入ECL化學(xué)發(fā)光試劑后進行成像分析。如圖4所示,對照細胞可見Midkine蛋白帶,而轉(zhuǎn)染Midkine shRNA重組質(zhì)粒后該蛋白表達量很低,幾乎看不到條帶,沉默效率超過80%以上,表明Midkine低表達LM3細胞系構(gòu)建成功。

(11)將步驟(8)獲得的低表達Midkine的LM3穩(wěn)定細胞系,擴大培養(yǎng)后,放置在液氮中長期保存。

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