O稀釋至25nM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為5nM);
[0080] 對照組 I (5nM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至25nM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為5nM,體系內不含蛋白);
[0081] 實驗組 2 (IOnM):將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul DBeQ (儲存母液為100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至50nM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為IOnM);
[0082] 對照組 2 (IOnM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至50nM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為10nM,體系內不含蛋白);
[0083] 實驗組 3 (15nM):將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul DBeQ (儲存母液為100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至75nM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為15nM);
[0084] 對照組 3 (15nM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至75nM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為15nM,體系內不含蛋白);
[0085] 實驗組 4 (20nM):將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul DBeQ (儲存母液為100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至IOOnM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為20nM);
[0086] 對照組 4 (20nM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至IOOnM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入 IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為20nM,體系內不含蛋白);
[0087] 實驗組 5 (30nM):將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul DBeQ (儲存母液為100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至150nM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為30nM);
[0088] 對照組 5 (30nM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至150nM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入 IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為30nM,體系內不含蛋白);
[0089] 實驗組 6 (40nM):將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul DBeQ (儲存母液為100 % DMSO溶解濃度為5mM,使用前12 % DMSO稀釋至200nM)混勻得到 的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中的終濃度為 25nM、DBeQ在體系中的終濃度為40nM);
[0090] 對照組 6 (40nM 對照):將 30ul 5*assay buffer 和 IOul DBeQ (儲存母液為 100% DMSO溶解濃度為5mM,使用前12% DMSO稀釋至200nM)混勻得到的測活體系(后續(xù)加入 IOul ATP,體系終體積為50ul,故DBeQ在體系中的終濃度為40nM,體系內不含蛋白);
[0091] 對照組 0 :將 30ul Vps4 蛋白(41. 67nM,溶劑為 5*assay buffer)和 IOul 12 % DMSO混勻得到的測活體系(后續(xù)加入IOul ATP,體系終體積為50ul,故Vps4蛋白在體系中 的終濃度為25nM,體系內不含DBeQ);
[0092] 將上述各組測活體系,每個體系做4個平行?;靹蚝笫覝胤跤齦Omin。
[0093] 2、測活反應
[0094] 向上述各組測活體系中加入IOul ImM的ATP (ATP終濃度為200mM),混勻,室溫反 應30min ;避光加入50ul孔雀綠試劑,混勾,室溫反應10min ;加入IOul 0. 2M檸檬酸鈉,混 勻,室溫反應5min ;測定0D630。
[0095] 3、數據處理
[0096] 計算相對活性(RA,relative activity)。相對活性=(實驗組η-對照組η)/(對 照組O-對照組η),最后用SPSS19. O分析IC50。
[0097] 使用孔雀綠法可以通過測定磷酸根的濃度,來測定Vps4蛋白的ATPase的活性。結 果如圖3所示:隨著DBeQ濃度的增加,RA的值越來越低,進而說明DBeQ可以抑制白色念珠 菌Vps4蛋白的ATPase活性,其IC 5。為13. 325 μ M。
[0098] 實施例2、DBeQ對白色念珠菌Cps (羧肽酶)分布的影響
[0099] 白色念珠菌中含有液泡這一結構(圖8a),如果野生型的ESCRT系統(tǒng)完好時,細胞 表達連有綠色熒光蛋白的cps (GFP-CPS),其液泡內會充滿綠色(圖8b);如果突變型(比如 敲除Vps4)的ESCRT系統(tǒng)缺陷時,細胞表達連有綠色熒光蛋白的cps (GFP-CPS)不能有效的 被轉運進入液泡,所以只有液泡膜是綠色,而且由于細胞的膜轉運體系缺陷,在液泡膜的某 處還會有積聚,顯示為綠色的亮點,此結構成為E型區(qū)域(class E compartment)(圖8c), 本實施例通過研究DBeQ對白色念珠菌Cps分布的影響,進而研究DBeQ對ESCRT系統(tǒng)的影 響。具體步驟如下:
[0100] 1、重組載體 Pmet-GFP-Cps CIplO 的構建
[0101] (1)以白色念珠菌BWP17gDNA為模板,采用Cps-ClaI F和Cps-PstI R引物進行 PCR擴增,得到PCR擴增產物,即Cps基因,引物序列如下:
[0102] Cps-ClaI F:5'GCCGATCGATATGATTGGACTTCCATTG3' ;
[0103] Cps-PstI R :5'CGAACTGCAGTTATTTATTGTTTGCCTTG3'。
[0104] 將PCR擴增產物1 %瓊脂糖凝膠電泳,100V,30min,切膠回收。
[0105] (2)用ClaI和PstI將步驟⑴得到的PCR產物雙酶切,得到大小為1743bp的 PCR產物;用ClaI和PstI酶將Pmet-GFP CIplO載體雙酶切,得到大小為約5500bp的骨 架載體,過夜將1743bp的PCR產物和大小為約5500bp的骨架載體連接,得到重組載體 Pmet-GFP-Cps CIp 10。并對其進行測序驗證。
[0106] 結果表明:重組載體Pmet-GFP-Cps CIplO為將Pmet-GFP CIplO載體的ClaI和 PstI酶切位點間的DNA片段替換為序列表中序列3所示的Cps基因,保持Pmet-GFP CIplO 載體的其他序列不變得到的載體。
[0107] 2、重組載體的線性化
[0108] 用Sail內切酶將重組載體Pmet-GFP-Cps CIplO線性化,得到線性化的重組載體 Pmet-GFP-Cps CIp10。
[0109] 3、重組菌的獲得
[0110] 采用醋酸鋰法將線性化的重組載體Pmet-GFP-Cps CIplO分別轉化BWP17菌株 和 vps4-/_ 菌株,分別得到重組菌 Pmet-GFP-Cps CIplO/BWP17 和 Pmet-GFP-Cps CIplO/ vps4_/_〇
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