專利名稱：用于治療病毒感染的化合物和藥物組合物的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明提供了用于對有需要的宿主治療病毒感染(包括丙型肝炎病毒感染和乙型肝炎病毒感染)的化合物、方法和藥物組合物。
背景技術(shù)：
黃病毒科病毒病毒的黃病毒科包含至少三個(gè)不同的屬瘟病毒屬，其在牛和豬中引起疾??；黃病毒屬，其是疾病例如登革熱和黃熱病的主要起因；和丙肝病毒屬，它的唯一成員是HCV。 黃病毒屬包括超過68個(gè)成員，根據(jù)血清學(xué)相關(guān)性分成若干組(Calisher等，J. Gen. Virol, 1993，70，37-43)。臨床癥狀多變，包括發(fā)熱、腦炎和出血熱(Fields Virology，編輯 Fields,B. N. >Knipe,D. Μ.禾口Howley,P. Μ· ,Lippincott-Raven Publishers,Philadelphia, PA, 1996，第31章，931-959)。與人類疾病相關(guān)的全球關(guān)注的黃病毒包括登革出血熱病毒 (DHF)、黃熱病病毒、休克綜合癥和日本腦炎病毒(Halstead，S. B. ,Rev. Infect. Dis.，1984， 6，251-264；Halstead, S. B.，Science,239 :476_481，1988 ；Monath,T.P.，New Eng.J. Med.， 1988，319，641-643)。瘟病毒屬包括牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)、典型性豬瘟病毒(CSFV，也叫豬霍亂病毒)和綿羊的邊界病病毒(BDV) (Moennig V.等，Adv. Vir. Res. 1992，41，53-98)。馴化家畜 (牛、豬和綿羊)的瘟病毒感染，在世界范圍內(nèi)引起重大的經(jīng)濟(jì)損失。BVDV在牛中引起黏膜疾病，而且對畜牧業(yè)具有重大的經(jīng)濟(jì)重要性(Meyers G.和Thiel H. J. ,Advances in Virus Research，1996，47，53-118 ；Moennig V.等，Adv. Vir. Res. 1992，41，53-98)。人的瘟病毒還沒有像動(dòng)物瘟病毒那樣被廣泛表征。但是，血清學(xué)鑒定顯示了人體內(nèi)相當(dāng)多的瘟病毒暴露。瘟病毒屬和丙肝病毒屬是黃病毒科內(nèi)緊密相關(guān)的病毒群組。這 個(gè)科中其它緊密相關(guān)的病毒包括GB病毒A、類GB病毒A物質(zhì)、GB病毒-B和GB病毒_C(也叫肝炎G病毒， HGV)。丙肝病毒群組(丙肝病毒；HCV)由許多緊密相關(guān)但基因型上可區(qū)分的感染人類的病毒組成。有大約6種HCV基因型和超過50種亞型。由于瘟病毒和丙肝病毒之間的相似性， 以及丙肝病毒在細(xì)胞培養(yǎng)中有效生長的低劣能力，牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)經(jīng)常被用作研究HCV病毒的替代物。瘟病毒和丙肝病毒的遺傳組成非常類似。這些正鏈RNA病毒具有單個(gè)大開放讀碼框(ORF)，該ORF編碼病毒復(fù)制所必需的所有病毒蛋白。這些蛋白被表達(dá)為多聚蛋白，該多聚蛋白在翻譯中和翻譯后被細(xì)胞蛋白酶和病毒編碼蛋白酶處理，產(chǎn)生成熟的病毒蛋白。負(fù)責(zé)病毒基因組RNA復(fù)制的病毒蛋白位于大約羧基末端內(nèi)。ORF的三分之二被稱作非結(jié)構(gòu)(NS)蛋白。瘟病毒和丙肝病毒的ORF的非結(jié)構(gòu)蛋白部分的遺傳組成和多聚蛋白處理非常類似。對瘟病毒和丙肝病毒兩者，成熟的非結(jié)構(gòu)(NS)蛋白按照從非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)的氨基末端到ORF的羧基末端的順序由p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B組成。瘟病毒和丙肝病毒的NS蛋白均具有特定蛋白功能所特有的序列域。舉例來說，兩個(gè)群組中病毒的NS3蛋白均具有絲氨酸蛋白酶和解螺旋酶所特有的氨基酸序列基序(Gorbalenya 等(1988)Nature 333 22 ；Bazan 和 Fletterick(1989)Virology 171 637-639 ;Gorbalenya 等(1989)Nucleic Acid Res. 17. 3889-3897)。類似地，癌病毒和丙肝病毒的NS5B蛋白具有RNA指導(dǎo)的RNA聚合酶所特有的基序(Koonin，Ε. V.和Dol ja， V. V. (1993) Crit. Rev. Biochem. Molec. Biol. 28 :375-430)。瘟病毒和丙肝病毒的NS蛋白在病毒生命周期中的實(shí)際作用和功能是直接類似的。在兩種情況下，NS3絲氨酸蛋白酶負(fù)責(zé)ORF中在其位置下游的多聚蛋白前體的所有蛋白水解處理(Wiskerchen 和 Collett (1991) Virology 184 :341-350 ；Bartenschlager 等(1993)J. Virol. 67 :3835-3844 ；Eckart 等(1993)Biochem. Biophys. Res. Comm. 192 399-406 ；Grakoui 等(1993)J. Virol. 67 :2832-2843 ；Grakoui 等(1993)Proc. Natl. Acad. Sci.USA 90 :10583-10587 ；Hijikata 等(1993)J. Virol. 67 :4665-4675 ；Tome 等(1993) J. Virol. 67 :4017-4026)。NS4A蛋白在兩種情況下都作為NS3絲氨酸蛋白酶的輔因子(Bartenschlager 等(1994)J. Virol. 68 :5045-5055 ；Failla ^ (1994)J. Virol. 68 3753-3760 ；Lin 等(1994) 68 :8147-8157 ；Xu 等(1997) J. Virol. 71 :5312-5322)。兩種病毒的 NS3 蛋白也起解螺旋酶作用(Kim 等(1995) Biochem. Biophys. Res. Comm. 215 :160-166 ； Jin 禾口 Peterson(1995)Arch. Biochem. Biophys.，323 :47-53 ；Warrener 禾口 Collett(1995) J. Virol. 69 :1720-1726)。最后，瘟病毒和丙肝病毒的NS5B蛋白具有預(yù)期的RNA指導(dǎo)的 RNA 聚合酶活性(Behrens 等(1996) EMBO J. 15 12-22 ；Lchmann 等(1997) J. Virol. 71 8416-8428 ；Yuan 等(1997)Biochem. Biophys. Res. Comm.232 :231-235 ；Hagedorn, PCT WO 97/12033 ；美國專利號(hào) 5，981，247 ；6，248，589 和 6，461，845 Zhong 等(1998) J. Virol. 72. 9365-9369)。丙型肝炎病毒丙肝病毒(HCV)是世界范圍內(nèi)慢性肝臟疾病的主要病因。(Boyer，N.等 J. Hepatol. 32 =98-112,2000)。HCV引起緩慢增長的病毒感染，而且是肝硬化和肝細(xì)胞癌的主要病因(Di Besceglie, A.M.和 Bacon，B. R.，Scientific American, 10 月80_85， (1999) ；Boyer, N.等J. H印atol. 32 :98_112，2000)。估計(jì)世界范圍內(nèi)有一億七千萬人感染 7 HCV0 (Boyer, N.等J. H印atol. 32 :98_112，2000)。由慢性丙肝感染引起的肝硬化每年在美國導(dǎo)致了 8，000-12，000例死亡，而且HCV感染是肝臟移植的首要病癥。已知HCV引起了至少80%的輸液后肝炎和主要比例的偶發(fā)性急性肝炎。初步證據(jù)還暗示在“特發(fā)性”慢性肝炎、“隱源性”肝硬化以及可能與其它肝炎病毒例如乙肝病毒 (HBV)不相關(guān)的肝細(xì)胞癌中涉及HCV。一小部分健康人群顯示為慢性HCV攜帶者，隨地理和其它流行病學(xué)因素而變化。盡管信息仍然是初步的，但HCV攜帶者的人數(shù)可能遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出HBV攜帶者的人數(shù)；還不清楚這些人中有多少患有亞臨床的慢性肝臟疾病。(The Merck Manual，第 18 版，Q006))。HCV是包膜病毒，包含大約9. 4kb的正義單鏈RNA基因組。病毒基因組由5'非翻譯區(qū)(UTR)、編碼具有大約3011個(gè)氨基酸的多聚蛋白前體的長開放讀碼框和短的3' UTR 組成。5' UTR是HCV基因組中最高度保守的部分而且對多聚蛋白翻譯的起始和控制是重要的。HCV基因組的翻譯通過被稱作內(nèi)部核糖體進(jìn)入的帽(cap)依賴性機(jī)制起始。這一機(jī)制包括核糖體與被稱作內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)(IRES)的RNA序列的結(jié)合。RNA假結(jié)體結(jié)構(gòu)最近被確定為HCVIRES的基本結(jié)構(gòu)元件。病毒的結(jié)構(gòu)蛋白包括核殼體核心蛋白(C)和兩種包膜糖蛋白El和E2。HCV也編碼兩種蛋白酶，由NS2-NS3區(qū)域編碼的鋅依賴性金屬蛋白酶和在NS3區(qū)域中編碼的絲氨酸蛋白酶。需要這些蛋白酶將前體多聚蛋白的特定區(qū)域裂解為成熟的肽。非結(jié)構(gòu)蛋白5的羧基一半NS5B，包含RNA依賴性RNA聚合酶。剩下的非結(jié)構(gòu)蛋白 NS4A和NS4B以及NS5A(非結(jié)構(gòu)蛋白5的氨基末端一半)的功能仍然是未知的。目前抗病毒研究的重大焦點(diǎn)針對治療人體中慢性HCV感染的改良方法的開發(fā)(Di Besceglie, Α. M.和 Bacon，B. R.，Scientific American,10 月80_85，(1999))。由于HCV感染已經(jīng)在世界范圍內(nèi)達(dá)到了流行病等級(jí)且對受感染的患者具有悲劇性的影響的事實(shí)，對提供治療丙肝的對宿主具有低毒性的新有效藥劑，仍然存在強(qiáng)烈需求。此外，考慮到其它黃病毒科感染日益增加的威脅，對提供對宿主具有低毒性的新有效藥劑仍然存在強(qiáng)烈需求。發(fā)明概述在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有式I的化合物
權(quán)利要求
1.一種具有下式的非對映異構(gòu)體純的化合物
2. 一種具有下式的非對映異構(gòu)體純的化合物
3. 一種具有下式的純化的化合物
4.權(quán)利要求3所述的其具有式II純化的化合物
5.權(quán)利要求3所述的具有式III的純化的化合物
6.權(quán)利要求3所述的具有式IV的純化的化合物
7.權(quán)利要求3所述的具有式V的純化的化合物
8.權(quán)利要求3所述的純化的化合物，選自
9.權(quán)利要求3所述的純化的化合物，選自
10. 一種化合物的純化的代謝物，所述化合物具有式
11. 一種化合物的純化的代謝物，所述化合物具有式
12. 一種化合物的純化的代謝物，所述化合物具有式
13. 一種具有式I的同位素富集的化合物
14.權(quán)利要求13所述的同位素富集的化合物，其中所述化合物是同位素富集的化合物 2、同位素富集的化合物2a、同位素富集的化合物2b、同位素富集的化合物3、同位素富集的化合物3a、同位素富集的化合物3b、同位素富集的化合物4、同位素富集的化合物5、同位素富集的化合物6、同位素富集的化合物7、同位素富集的化合物8、同位素富集的化合物8a、 同位素富集的化合物8b、同位素富集的化合物9、同位素富集的化合物9a、同位素富集的化合物％、同位素富集的化合物10、同位素富集的化合物10a、同位素富集的化合物10b、同位素富集的化合物11、同位素富集的化合物11a、和同位素富集的化合物lib。
15.一種同位素富集的化合物，其選自同位素富集的化合物1、同位素富集的化合物 la、和同位素富集的化合物lb。
16.一種治療感染了黃病毒科病毒的宿主的方法，包括施用治療有效量的權(quán)利要求 1-15任一項(xiàng)的化合物。
17.權(quán)利要求16所述的方法，其中所述病毒是丙型肝炎病毒。
18.權(quán)利要求17所述的方法，其中所述宿主是人。
19.權(quán)利要求16所述的方法，其中所述施用指向所述宿主的肝臟施用大量所述化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽或立體異構(gòu)體。
20.權(quán)利要求16所述的方法，其中所述化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽或立體異構(gòu)體與第二抗病毒劑組合或交替施用，所述第二抗病毒劑選自干擾素、利巴韋林、白細(xì)胞介素、 NS3蛋白酶抑制劑、半胱氨酸蛋白酶抑制劑、菲醌、噻唑烷衍生物、噻唑烷、苯甲酰苯胺、解旋酶抑制劑、聚合酶抑制劑、核苷酸類似物、膠霉毒素、淺藍(lán)菌素、反義硫代磷酸寡聚脫氧核苷酸、IRES依賴性翻譯抑制劑、和核酶。
21.權(quán)利要求20所述的方法，其中所述第二抗病毒劑選自聚乙二醇化的干擾素ah、 復(fù)合α干擾素、天然干擾素、albuferon、干擾素β _la、ω干擾素、干擾素α、干擾素Υ、干擾素τ、干擾素δ和干擾素Y-lb。
22.權(quán)利要求20所述的方法，其中所述第二抗病毒劑是利巴韋林。
23.權(quán)利要求16所述的方法，其中所述宿主是人。
24.一種藥物組合物，其包含權(quán)利要求1-15任一項(xiàng)所述的化合物以及藥學(xué)上可接受的賦形劑、載體或稀釋劑。
25.權(quán)利要求18所述的組合物，其中所述組合物是口服劑型。
26.一種制備權(quán)利要3-9任一項(xiàng)所述純化的化合物的方法，該方法包括(a)將具有下式的前體化合物1
27.權(quán)利要求24所述的方法，其中所述分離包括從含介質(zhì)的反相柱中洗脫所述化合物。
28.具有式VI的化合物
29.權(quán)利要求28所述的化合物，其中Ra和Rb選自i)Ra是氫；和Rb是異丙基、叔丁基、環(huán)己基、乙氧基羰基甲基、叔丁氧基羰基甲基、羧甲基或二甲基氨基乙基；或Rb與它們?nèi)〈牡右黄鹦纬?-甲基哌嗪或嗎啉環(huán)。
30.權(quán)利要求28所述的化合物，該化合物選自
31.權(quán)利要求觀所述的化合物，其中該化合物是
32.權(quán)利要求28所述的化合物，其中該化合物是
33.一種治療感染了黃病毒科病毒的宿主的方法，該方法包括施用治療有效量的權(quán)利要求觀-32任一項(xiàng)的化合物。
34.一種治療感染了黃病毒科病毒的宿主的方法，該方法包括以約Img/天至約150mg/ 天施用化合物1。
35.權(quán)利要求34所述的方法，其中所述量是約5mg/天至約IOOmg/天。
36.權(quán)利要求34所述的方法，其中所述量是約5、10、25、50、75或IOOmg/天。
37.權(quán)利要求33-36任一項(xiàng)所述的方法，該方法進(jìn)一步包括施用第二抗病毒劑，所述第二抗病毒劑選自干擾素、利巴韋林、白細(xì)胞介素、NS3蛋白酶抑制劑、半胱氨酸蛋白酶抑制劑、菲醌、噻唑烷衍生物、噻唑烷、苯甲酰苯胺、解旋酶抑制劑、聚合酶抑制劑、核苷酸類似物、膠霉毒素、淺藍(lán)菌素、反義硫代磷酸寡聚脫氧核苷酸、IRES依賴性翻譯抑制劑、和核酶。
38.權(quán)利要求37所述的方法，其中所述第二抗病毒劑選自聚乙二醇化的干擾素ah、 復(fù)合α干擾素、天然干擾素、albuferon、干擾素β _la、ω干擾素、干擾素α、干擾素Υ、干擾素τ、干擾素δ和干擾素Y-lb。
39.權(quán)利要求38所述的方法，其中所述第二抗病毒劑是利巴韋林。
40.權(quán)利要求39所述的方法，其中化合物1以約Img/天至約150mg/天的量施用，利巴韋林以800mg至約1400mg的量施用。
41.權(quán)利要求40所述的方法，其中利巴韋林的施用量是約800mg、1000mg、1200mg或 1400mgo
42.權(quán)利要求33-41任一項(xiàng)所述的方法，其中所述病毒是丙型肝炎病毒。
43.權(quán)利要求33-42任一項(xiàng)所述的方法，其中所述宿主是人。
44.一種藥物組合物，該組合物包含權(quán)利要求28-32任一項(xiàng)所述的化合物和藥學(xué)上可接受的賦形劑、載體或稀釋劑。
45.權(quán)利要求34所述的組合物，其中所述組合物是口服劑型。
46.一種藥物組合物，其包含約Img至約150mg量的化合物1。
47.權(quán)利要求46所述的藥物組合物，其中所述量是約5mg或25mg。
48.權(quán)利要求47所述的組合物，其中該組合物是口服膠囊。
49.一種制備化合物1的方法，該方法包括i)使2’ -C-甲基鳥苷與硫酸鈉和苯硼酸反應(yīng)，獲得式10-2化合物
全文摘要
本發(fā)明提供了用于治療肝臟病癥包括HCV感染的化合物、組合物和方法。具體地，本發(fā)明公開了核苷酸衍生物化合物和組合物，它們可以單獨(dú)施用或與其它抗病毒劑組合施用。
文檔編號(hào)A61P31/12GK102177172SQ200980134342
公開日2011年9月7日 申請日期2009年7月1日 優(yōu)先權(quán)日2008年7月2日
發(fā)明者布蘭達(dá)·赫爾南德斯-圣地亞哥, 庫蘇姆·古普塔, 艾麗卡·克里頓-斯科特, 馬里塔·拉爾森 申請人:埃迪尼克斯醫(yī)藥公司