一種基于scar標(biāo)記鑒定壇紫菜品系的方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明的目的在于提供一種基于SCAR標(biāo)記鑒定壇紫菜品系的方法，即用SCAR標(biāo)記鑒定壇紫菜“浙東1號(hào)”品系，其中SCAR標(biāo)記的核苷酸序列為SEQ ID NO:1；從SCAR標(biāo)記上設(shè)計(jì)的引物的序列為SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3，PCR擴(kuò)增片段大小為220bp。本發(fā)明采用分子標(biāo)記技術(shù)鑒定壇紫菜“浙東1號(hào)”，結(jié)果不受環(huán)境因素影響，準(zhǔn)確可靠；本發(fā)明提供的SCAR標(biāo)記具有操作快速簡(jiǎn)單、檢測(cè)結(jié)果穩(wěn)定及成本低廉等優(yōu)點(diǎn)；本發(fā)明提供的SCAR標(biāo)記法也可應(yīng)用于壇紫菜其它品系的特異性標(biāo)記篩查。
【專(zhuān)利說(shuō)明】-種基于SCAR標(biāo)記鑒定壇紫菜品系的方法

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于分子生物學(xué)DNA標(biāo)記檢測(cè)【技術(shù)領(lǐng)域】，涉及一種基于SCAR標(biāo)記鑒定壇紫 菜品系的方法，即用SCAR標(biāo)記鑒定壇紫菜"浙東1號(hào)"品系的方法。

【背景技術(shù)】
[0002] 壇紫菜是我國(guó)特有的具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值的暖溫帶大型海洋藻類(lèi)，主要栽培于浙 江、福建、廣東三省，產(chǎn)量約占全國(guó)紫菜產(chǎn)量的80%。早些年因使用未進(jìn)行人工選育的野 生種質(zhì)而發(fā)生紫菜爛苗、抗逆性低、產(chǎn)量下降等現(xiàn)象，造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失，因此，壇紫菜良 種選育的工作迫在眉睫。特別是浙江海域和福建北部海域，海水渾濁，含有大量的砂質(zhì)顆 粒，在潮流、風(fēng)浪作用下，對(duì)海區(qū)栽培的紫菜造成機(jī)械損傷，藻體較薄的紫菜損傷的程度更 大。而藻體厚的紫菜具有一定是抵御泥沙的沖擊能力，能夠減輕藻體的損傷程度。壇紫菜 多是潮間帶插桿的方式栽培，栽培的位置往往在沿海的內(nèi)灣，海水的透明度差，一般僅僅在 15?50cm。如果藻體過(guò)于細(xì)長(zhǎng)，不易及時(shí)漂浮，光合效率下降，造成減產(chǎn)。而經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期選育 出的"浙東1號(hào)"壇紫菜品系的藻體長(zhǎng)/寬比值小、葉片厚、皺褶多、基部發(fā)達(dá)、色素含量高， 生長(zhǎng)快，可以適應(yīng)浙閩海域混水區(qū)大規(guī)模栽培生產(chǎn)，而且能夠提高產(chǎn)量，滿足加工要求，提 高經(jīng)濟(jì)效益。
[0003] 但不同的壇紫菜品系，盡管在藻體的色澤、形態(tài)等方面存有差異，但這些差異易受 海區(qū)栽培環(huán)境的影響，以往依靠形態(tài)學(xué)特征的分類(lèi)法很難準(zhǔn)確區(qū)分不同品系。導(dǎo)致養(yǎng)殖過(guò) 程中品系之間發(fā)生混淆。因此，應(yīng)積極開(kāi)展種質(zhì)鑒定來(lái)保證壇紫菜栽培的良種化，從而提高 紫菜采收的經(jīng)濟(jì)效益。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明的目的在于提供一種基于SCAR標(biāo)記鑒定壇紫菜品系的方法，即用SCAR標(biāo) 記鑒定壇紫菜"浙東1號(hào)"品系，從而彌補(bǔ)現(xiàn)有技術(shù)的不足。
[0005] 本發(fā)明首先提供一種SCAR標(biāo)記，其核苷酸序列為SEQIDNO: 1 ;
[0006]上述的SCAR標(biāo)記用于制備檢測(cè)壇紫菜品系的分子標(biāo)記；
[0007]所述的分子標(biāo)記為探針或引物；
[0008]作為實(shí)施例的一種優(yōu)選，所述的引物的信息如下：
[0009]正向引物

【權(quán)利要求】
1. 一種SCAR標(biāo)記，其特征在于，所述的標(biāo)記的核苷酸序列為SEQ ID NO: 1。
2. 權(quán)利要求1所述的標(biāo)記在制備檢測(cè)壇紫菜品系的分子標(biāo)記中的應(yīng)用。
3. 如權(quán)利要求1所述的應(yīng)用，其特征在于，所述的分子標(biāo)記為探針或引物。
4. 一種引物，其特征在于，所述的引物是從權(quán)利要求1所述的SCAR標(biāo)記上設(shè)計(jì)的，用于 檢測(cè)壇紫菜品系。
5. 如權(quán)利要求4所述的引物，其正向引物和反向引物的序列分別為SEQ ID NO: 2和SEQ ID N0:3。
6. -種鑒定壇紫菜"浙東1號(hào)"品系的方法，其特征在于，所述的方法步驟如下： 1) 總DNA的提?。菏占b定壇紫菜葉狀體，液氮研磨，使用植物基因組DNA提取試劑 盒提取總DNA ; 2) 使用權(quán)利要求5所述的引物對(duì)上述獲得的總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增； 3) 步驟2)的？〇?反應(yīng)體系為：25111反應(yīng)體系中，1^12.5111，(1(111208.5 111，正反向 引物各1 iil，模板DNA2 yl ;PCR擴(kuò)增條件為：94°C預(yù)變性5min，接著設(shè)置40個(gè)循環(huán)：94°C 變性458,6〇1：退火3〇8,721：延伸3〇8，循環(huán)結(jié)束后721：延伸71^11; 4) 將3)所得PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳檢測(cè)，若PCR擴(kuò)增產(chǎn)物中出現(xiàn)長(zhǎng)度220bp的特異性片 段，則所鑒定的壇紫菜為"浙東1號(hào)";若未出現(xiàn)220bp的特異性片段，則所鑒定的壇紫菜不 是"浙東1號(hào)"。
【文檔編號(hào)】C12N15/11GK104328115SQ201410623378
【公開(kāi)日】2015年2月4日 申請(qǐng)日期:2014年11月6日 優(yōu)先權(quán)日:2014年11月6日
【發(fā)明者】駱其君, 徐佳麗, 楊銳, 陳海敏, 王亞軍, 嚴(yán)小軍 申請(qǐng)人:寧波大學(xué)