專利名稱:啟動子BgIosP545、制備方法及應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及基因工程技術(shù)領(lǐng)域,特別是涉及一種啟動子BgIosPM5,含有該啟動子 的核酸構(gòu)建體、載體、重組細胞、植物愈傷組織,該啟動子的制備方法以及利用該啟動子來 調(diào)控植物中基因表達的方法。
背景技術(shù):
啟動子是基因的一個組成部分,通常位于結(jié)構(gòu)基因5’端上游,是RNA聚合酶識別、 結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。啟動子能夠指導(dǎo)全酶(holoenzyme)同模板正確結(jié)合,活 化RNA聚合酶,啟動基因轉(zhuǎn)錄,從而控制基因表達(轉(zhuǎn)錄)的起始時間和表達的程度。在轉(zhuǎn) 基因植物中,啟動子是影響轉(zhuǎn)基因表達效率的重要因素之一,選擇高效率的啟動子是高效 率表達外源基因的關(guān)鍵。根據(jù)啟動子的轉(zhuǎn)錄模式可將其分為3類組成型啟動子、組織或器官特異性啟動 子和誘導(dǎo)型啟動子。所謂組成型啟動子是指在組成型啟動子調(diào)控下,不同組織器官和發(fā)育 階段的基因表達沒有明顯差異,因而稱之組成型啟動子。雙子葉植物中最常使用的組成型 啟動子是花椰菜花葉病毒(CaMV) 35S啟動子。另一種高效的組成型啟動子CsVMV是從木薯 葉脈花葉病毒(cassava vein mosaic virus)中分離的。人們高度重視從植物本身克隆組成型啟動子。例如肌動蛋白(actin)和泛素 (ubiquitin)等基因的啟動子已被克隆。用這些啟動子代替CaMV 35S啟動子,可以更有效 地在單子葉植物中驅(qū)動外源基因的轉(zhuǎn)錄。Naomi等分別從擬南芥的色氨酸合酶β亞基基因 和植物光敏色素基因中克隆了相應(yīng)啟動子,用其代替CaMV 35S啟動子,在轉(zhuǎn)基因煙草中也 取得了很好的表達效果(Plant biotechnology, 2002,19(1) :19-26)。單子葉植物基因中常見的啟動子有山bi啟動子(Plant ubiquitin promoter)、Actin 啟動子(Plant Actin promoter)禾口 Adh-1 啟動子(Maize alcohol dehydrogenaselpromoter)。Ubi啟動子以其啟動效率高、甲基化程度低、遺傳性狀穩(wěn)定等因素而倍受青睞。目 前,已經(jīng)從很多泛素基因中分離得到啟動子序列,包括玉米基因組中的WDi-I啟動子、水稻 泛素RUBQ2啟動子、擬南芥泛素啟動子、向日葵泛素WdBI啟動子、煙草泛素Ubi. U4啟動子、 馬鈴薯泛素證丨7啟動子、番茄泛素W^il-I啟動子,大麥泛素Mubl啟動子。玉米泛素W^i-I 啟動子已經(jīng)廣泛地應(yīng)用于玉米、小麥、水稻等單子葉植物中,水稻泛素RUBQ2啟動子在水稻 和甘蔗中也有較多的應(yīng)用。Actin啟動子1990年由康奈爾大學(xué)的McElroy等首次在水稻中發(fā)現(xiàn),屬于強組成 型啟動子。Actin啟動子在單子葉禾本科中作用顯著,但是鄰近科屬的植物中的基因調(diào)控功 能卻十分不理想。因此,許多相關(guān)研究通過其他單子葉植物尋找Actin啟動子,并成功在香 蕉、甜瓜、玉米和擬南芥中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)。Actin啟動子由于對基因表達的強調(diào)控作用,在單子葉 植物優(yōu)良性狀的轉(zhuǎn)基因中已經(jīng)得到越來越廣泛的應(yīng)用。Adh-I啟動子調(diào)控乙醇脫氫酶(alcohol dehydrogenase)基因,對植物在缺氧環(huán)境下乙醇脫氫酶的表達至關(guān)重要。Adh-I啟動子對單子葉植物特別是谷類植物如水稻、燕麥 和大麥,和少部分雙子葉植物如煙草,基因的調(diào)控功能比花椰菜花葉病毒CaMV 35S啟動子 提高10-50倍。Adh-I啟動子主要應(yīng)用于單子葉植物,對絕大部分雙子葉植物基因表達的調(diào) 控效果都很有限。單子葉植物是被子植物的主要類群,單子葉植物中的禾本科、百合科、棕櫚科和天 南星等,是非常重要的農(nóng)業(yè)作物。單子葉植物基因的強效啟動子,能夠調(diào)控植物高效率表達 具有特殊性狀的外源基因,對優(yōu)良作物的分子育種研究意義重大。在強效啟動子相關(guān)研究領(lǐng)域,發(fā)現(xiàn)并驗證了許多單子葉植物的啟動子。此外,雙子 葉植物中的一些強效啟動子如CsVMV啟動子、番茄E8啟動子、白藜蘆醇合酶基因Vstl啟動 子等高效啟動子,在單子葉植物中也有很強的基因調(diào)控作用。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種新的啟動子,能夠在植物中調(diào)控基因的表達。本發(fā)明的另一目的在于提供含有上述啟動子的核酸構(gòu)建體、載體、重組細胞、植物 愈傷組織、植物外植體及植物。本發(fā)明的再一目的在于提供一種制備上述啟動子的引物、方法,以及一種利用該 啟動子來調(diào)控植物中基因表達的方法。本發(fā)明的再一目的在于提供一種制備轉(zhuǎn)基因植物的方法,以及上述啟動子在調(diào)控 植物中目的基因表達或植物育種中的用途。為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用了以下技術(shù)方案本發(fā)明公開了一種啟動子,所述啟動子含有選自以下任意一組并具有啟動子功能 的核苷酸序列a、Seq ID No. 1所示的核苷酸序列;以與kq ID No. 1互補的核苷酸序列;C、在高等嚴(yán)緊條件下能夠與上述a或b的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;d、對上述a或b所示核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核 苷酸序列;e、與上述a或b所示核苷酸序列具有至少90%同一性的核苷酸序列。本發(fā)明還公開了一種核酸構(gòu)建體,包含上述啟動子,以及與啟動子可操作連接的 基因序列,其中所述啟動子與所述基因序列來源相同或者不同。本發(fā)明還公開了一種載體,所述載體含有上述啟動子或上述核酸構(gòu)建體,優(yōu)選的, 所述載體為上述啟動子與PMD18-T或p8質(zhì)粒經(jīng)重組得到的重組載體。本發(fā)明進一步公開了一種重組細胞,所述細胞含有上述啟動子、上述核酸構(gòu)建體 或上述載體,優(yōu)選的,所述重組細胞為重組大腸桿菌細胞或重組農(nóng)桿菌細胞。本發(fā)明進一步公開了含有上述啟動子、核酸構(gòu)建體、載體或重組細胞的植物愈傷 組織、植物外植體或植物,優(yōu)選的,所述植物為單子葉植物或雙子葉植物,再優(yōu)選的,所述植 物為稻屬或煙草屬,更優(yōu)選的,所述植物為水稻或煙草,進一步優(yōu)選的,所述植物為水稻日 本晴(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare)或煙草 NC89。本發(fā)明進一步公開了一組引物對,用于擴增得到上述啟動子,所述引物對的兩條引物分別含有IDID No :3所示的序列,優(yōu)選的,所述引物對的兩條引物
在5’端還分別連接有限制性酶切位點和/或保護堿基,更優(yōu)選的,所述引物對的兩條引物 分別具有Seq ID No 4和Seq ID No 5所示的序列。本發(fā)明還公開了制備SEQ ID No 1所示啟動子的方法,包括以水稻日本晴基因 組DNA為模板,使用一對擴增引物進行擴增,所述擴增引物根據(jù)SEQ ID NO :1在水稻日本晴 gDNA中的序列分別針對首尾進行設(shè)計,優(yōu)選是上述的引物對。本發(fā)明進一步公開了一種調(diào)控植物中基因表達的方法,所述方法包括,將上述啟 動子、核酸構(gòu)建體、載體或重組細胞導(dǎo)入植物細胞。優(yōu)選導(dǎo)入植物愈傷組織。進一步優(yōu)選的, 啟動子或核酸構(gòu)建體導(dǎo)入植物細胞是利用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化植物愈傷組織,所述植物優(yōu)選為單子 葉植物或雙子葉植物,所述植物再優(yōu)選為稻屬或煙草屬,所述植物更優(yōu)選為水稻或煙草,所 述植物進一步優(yōu)選為水稻日本晴(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare)或煙草 NC89。本發(fā)明還公開了一種制備轉(zhuǎn)基因植物的方法,包括在有效產(chǎn)生植物的條件下培養(yǎng)上 述的重組細胞或植物愈傷組織或植物外植體或植物。本發(fā)明還公開了上述啟動子、核酸構(gòu)建體、載體、重組細胞或植物愈傷組織或植物 外植體或植物在調(diào)控植物中目的基因表達或植物育種中的用途,優(yōu)選植物是單子葉植物或 雙子葉植物,再優(yōu)選的植物為稻屬或煙草屬,更優(yōu)選植物為水稻或煙草,進一步優(yōu)選植物為 7jC稻日本晴(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare)或煙草 NC89。由于采用了以上技術(shù)方案,使本發(fā)明具備的有益效果在于本發(fā)明提供的新的啟動子能夠在植物中調(diào)控基因表達,并且,在單子葉植物如水 稻和雙子葉植物如模式植物-煙草的根和葉中均具有啟動子功能,能夠調(diào)控外源基因的表 達,從而為研究植物(包括單子葉植物和雙子葉植物)中目的基因的表達提供了一種新的 工具和選擇。保藏信息培養(yǎng)物名稱煙草NC89種子保藏日期2010年11月12日保藏單位湖北省武漢市武昌珞珈山武漢大學(xué)保藏中心,即中國典型培養(yǎng)物保藏 中心(CCTCC)保藏編號CCTCCNo :P201017
圖1為用于構(gòu)建p8質(zhì)粒的pCAMBIA-1301質(zhì)粒示意圖。圖2為p8質(zhì)粒示意圖。圖3為經(jīng)轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織的GUS染色結(jié)果。其中,由帶有本發(fā)明所述啟動子 P545序列的重組根癌農(nóng)桿菌P8+P545轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織(右)經(jīng)⑶S染色后呈現(xiàn)藍色; 不帶有本發(fā)明啟動子序列的重組根癌農(nóng)桿菌p8質(zhì)粒的水稻愈傷組織(對照,左)經(jīng)⑶S染 色后顏色未發(fā)生變化。圖4和圖5分別為經(jīng)轉(zhuǎn)化的水稻苗根和葉的GUS染色結(jié)果。經(jīng)含有啟動子的 P8+P545重組載體的重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的水稻苗的根(圖4右)和葉(圖5右)經(jīng) 染色后呈現(xiàn)藍色,經(jīng)不含有啟動子的P8質(zhì)粒重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的水稻苗的根(作為
6對照,圖4左)和葉(圖5左)經(jīng)⑶S染色后顏色未發(fā)生變化。圖6和圖7分別為經(jīng)轉(zhuǎn)化的煙草苗根和葉的GUS染色結(jié)果(三倍光學(xué)顯微鏡下拍 照)。經(jīng)含有啟動子的P8+P545重組載體的重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的煙草苗的根(圖6 右)和葉(圖7右)經(jīng)染色后呈現(xiàn)藍色,經(jīng)不含有啟動子的p8質(zhì)粒重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn) 化的煙草苗的根(作為對照,圖6左)和葉(圖7左)經(jīng)GUS染色后顏色未發(fā)生變化。
具體實施例方式本發(fā)明涉及一種能夠在植物中調(diào)控基因表達的啟動子序列,本發(fā)明的啟動子含有 選自以下任意一組并具有啟動子功能的核苷酸序列a、序列表中kq ID No. 1所示的核苷酸序列;以與kq ID No. 1互補的核苷酸序列;C、在高等嚴(yán)緊條件下能夠與上述a或b的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;d、對上述a或b所示核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核 苷酸序列;e、與上述a或b所示核苷酸序列具有至少90%同一性的核苷酸序列。在本發(fā)明一個具體的實施方式中,本發(fā)明的啟動子優(yōu)選具有kq ID No. 1所示的 核苷酸序列,并在本發(fā)明中被稱為啟動子BgIosPM5,或者簡稱為P545啟動子。在本發(fā)明中,典型地,“雜交條件”根據(jù)測量雜交時所用條件的“嚴(yán)緊性”程度來分 類。嚴(yán)緊性程度可以以例如核酸結(jié)合復(fù)合物或探針的解鏈溫度(Tm)為依據(jù)。例如,“最大嚴(yán) 緊性”典型地發(fā)生在約Tm-5°C (低于探針Tm 5°C );“高等嚴(yán)緊性”發(fā)生在Tm以下約5_10°C ; “中等嚴(yán)緊性”發(fā)生在探針Tm以下約10-20°C ;“低嚴(yán)緊性”發(fā)生在Tm以下約20_25°C。作 為替代,或者進一步地,雜交條件可以以雜交的鹽或離子強度條件和/或一或多次的嚴(yán)緊 性洗滌為依據(jù)。例如,6XSSC =極低嚴(yán)緊性;3XSSC =低至中等嚴(yán)緊性;IXSSC =中等嚴(yán) 緊性;0. 5XSSC =高等嚴(yán)緊性。從功能上說,可以采用最大嚴(yán)緊性條件確定與雜交探針嚴(yán) 緊同一或近嚴(yán)緊同一的核酸序列;或采用高等嚴(yán)緊性條件確定與該探針有約80%或更多 序列同一性的核酸序列。對于要求高選擇性的應(yīng)用,典型地期望采用相對嚴(yán)緊的條件來形成雜交體,例如 選擇相對低的鹽和/或高溫條件。Sambrook等(Sambr00k,J.等(1989)分子克隆,實驗室 手冊,Cold Spring Harbor Press, Plainview, N. Y.)提供了包括中等嚴(yán)緊性和高等嚴(yán)緊性 在內(nèi)的雜交條件。為了便于說明,用于檢測本發(fā)明的雜交的合適的中等嚴(yán)緊條件包括用5XSSC、 0.5% SDS、1. OmM EDTA(pH8. 0)溶液預(yù)洗;在50-65°C下在5XSSC中雜交過夜;隨后用含 0. SDS的2X、0. 5X和0.2XSSC在65°C下各洗滌兩次20分鐘。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)當(dāng) 理解,能容易地操作雜交嚴(yán)緊性,如改變雜交溶液的含鹽量和/或雜交溫度。例如,合適的 高等嚴(yán)緊雜交條件包括上述條件,不同之處在于雜交溫度升高到例如60-65°C或65-70°C。在本發(fā)明中,所述在高等嚴(yán)緊條件下與^^ ID No. 1所示或與其互補的核苷酸序 列雜交的核苷酸序列,其具有與kq ID No. 1所示核苷酸序列相同或相似的啟動子活性。在本發(fā)明中,所述對kq ID No. 1或與其互補的核苷酸序列進行一個或多個堿基 的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列,是指分別或同時在所述核苷酸序列的5’端和/或3’端,和/或序列內(nèi)部進行例如不超過2-45個,或者不超過3-20個,或者不超過3-20個,或 者不超過4-15個,或者不超過5-10個,或者不超過6-8個的分別用逐個連續(xù)整數(shù)表示的堿 基的取代、缺失、添加修飾。在本發(fā)明中,所述對kq ID No. 1或與其互補的核苷酸序列進行如上述一個或多 個堿基的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列,具有與kq ID No. 1所示的核苷酸序列相同 或相似的啟動子活性。通過一種多核苷酸進行說明,其所具有的核苷酸序列例如與kq ID No. 1的參考 核苷酸序列至少90% “同一性”是指在^^ ID No. 1的參考核苷酸序列之每100個核苷 酸中,該多核苷酸的核苷酸序列除了含有多達10個核苷酸的不同外,該多核苷酸之核苷酸 序列與參考序列相同。換句話說,為了獲得核苷酸序列與參考核苷酸序列至少90%相同的 多核苷酸,參考序列中多達10%的核苷酸可以被刪除或被另一核苷酸替代;或可將一些核 苷酸插入?yún)⒖夹蛄兄?,其中插入的核苷酸可多達參考序列之總核苷酸的10% ;或在一些核 苷酸中,存在刪除、插入和替換的組合,其中所述核苷酸多達參考序列之總核苷酸的10%。 參考序列的這些突變可發(fā)生在參考核苷酸序列的5’或3’末端位置,或在這些末端位置之 間的任意地方,它們或單獨散在于參考序列的核苷酸中,或以一個或多個相鄰的組存在于 參考序列中。在本發(fā)明中,用于確定序列同一性和序列相似性百分?jǐn)?shù)的算法是例如BLAST和 BLAST2. 0 算法,它們分別描述在 Altschul 等(1977) Nucl. Acid. Res. 25 :3389-3402 和 Altschul等(1990)J.Mol.Bio. 215 :403-410。采用例如文獻中所述或默認參數(shù),BlAST和 BLAST 2.0可以用于確定本發(fā)明的核苷酸序列同一性百分?jǐn)?shù)。執(zhí)行BLAST分析的軟件可以 通過國立生物技術(shù)信息中心為公眾所獲得。在本發(fā)明中,所述與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一 性的核苷酸序列包括與SEQ ID NO :1所公開序列基本同一的多核苷酸序列,例如當(dāng)采用本 文所述方法(例如采用標(biāo)準(zhǔn)參數(shù)的BLAST分析)時,與本發(fā)明多核苷酸序列相比含有至少 90%序列同一性、優(yōu)選至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%或更高的 序列同一性的那些序列。在本發(fā)明中,所述與SEQ ID No. 1或其互補的核苷酸序列具有至 少90%的序列同一性的核苷酸序列具有與kq ID No. 1所示的核苷酸序列相同或相似的啟 動子活性。本發(fā)明還涉及一種核酸構(gòu)建體,包括基因以及與該基因可操作地連接的上述啟動 子。在本發(fā)明中,“可操作地連接”是指兩個或多個核苷酸區(qū)域或核酸序列的功能性的空間 排列。在本發(fā)明的核酸構(gòu)建體中,例如,啟動子被置于所述基因的核酸序列的特定位置,例 如啟動子位于所述基因核酸序列的上游位置,使得核酸序列的轉(zhuǎn)錄受到該啟動子區(qū)域的引 導(dǎo),從而,啟動子區(qū)域被“可操作地連接”到該基因的核酸序列上。所述基因一般是需要提高 轉(zhuǎn)錄水平的任何核酸序列,或者,可設(shè)計本發(fā)明所述啟動子和基因以便下調(diào)特定核酸序列。 也就是通過將啟動子與反義方向的基因相連來實現(xiàn)。在本發(fā)明一個具體的實施方式中,所 述基因優(yōu)選為GUS基因。本發(fā)明還涉及一種含有上述啟動子或上述核酸構(gòu)建體的載體。本發(fā)明的載體可 以是通過將上述啟動子或上述核酸構(gòu)建體插入到克隆載體或表達載體而得到的重組載 體。適于構(gòu)建本發(fā)明所述重組載體的克隆載體包括但不限于,例如pUC18、pUC19、pUC118、
8pUC119、pMD19-T、pMD20-T、pMD18-T Simple Vecter、pMD19_T Simple Vecter 等。適于構(gòu) 建本發(fā)明所述重組載體的表達載體包括但不限于,例如pMI121、pl3W4、pGEM等。在本發(fā)明 具體的實施方式中,本發(fā)明含有所述啟動子的載體為上述啟動子與PMD18-T或p8質(zhì)粒經(jīng)重 組得到的重組載體,優(yōu)選的,本發(fā)明的重組載體為PMD18-T+P545重組載體或者p8+P545重 組載體。本發(fā)明的又一方面,還涉及含有本發(fā)明所述啟動子的重組細胞。本發(fā)明的重組 細胞可以通過將上述含有本發(fā)明啟動子的重組載體轉(zhuǎn)化宿主細胞而得到。適于構(gòu)建本發(fā) 明所述重組細胞的宿主細胞包括但不限于,例如大腸桿菌細胞DH5ci,根癌農(nóng)桿菌細胞 LBA4404、EHA105、GV3101等。在本發(fā)明一個具體的實施方式中,所述重組細胞為重組根癌 農(nóng)桿菌 EHA105-PM5。本發(fā)明的再一方面,還涉及一種植物愈傷組織或植物外植體或植物,所述愈傷組 織、植物外植體或植物含有有本發(fā)明的上述啟動子。本發(fā)明的植物愈傷組織可以是單子葉 植物愈傷組織例如水稻愈傷組織,或者雙子葉植物愈傷組織例如煙草愈傷組織。本發(fā)明的再一方面,還涉及用于PCR擴增得到本發(fā)明所述啟動子的一組引物對, 該組引物對含有序列表中kq ID似.2及%(1 No.3所示的序列。為了便于操作,通常優(yōu)選 在引物的5’端含設(shè)計連接有限制性酶切位點和/或保護堿基,在本發(fā)明具體的實施方式 中,所述引物對的兩條引物分別具有^^ IDID No :5所示的序列。,^,/KfSH^Hf (Oryza sativaL. ssp. japonica cv. Nipponbare) S 因組DNA為模板進行PCR擴增,能夠制備得到本發(fā)明的啟動子。本發(fā)明進一步公開了一種調(diào)控植物中基因表達的方法,所述方法包括,將上述啟 動子導(dǎo)入植物細胞。優(yōu)選的是通過將同時含有外源基因以及本發(fā)明啟動子的核酸構(gòu)建體導(dǎo) 入植物細胞來達到調(diào)控基因表達的目的。所述核酸構(gòu)建體中,外源基因與本發(fā)明的啟動子 可操作地連接。在本發(fā)明優(yōu)選的實施方式中,可以利用含有目的外源基因與本發(fā)明啟動子 的重組載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,再將得到的重組農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化植物愈傷組織,從而實現(xiàn)將所述外源 基因與本發(fā)明啟動子一起導(dǎo)入植物細胞的目的。在本發(fā)明一個具體的實施方式中,外源基 因優(yōu)選為GUS基因。本發(fā)明的植物可以是單子葉植物,例如水稻、小麥、玉米、小米、甘蔗、高 粱、大麥等,也可以是雙子葉植物,例如煙草,大豆,馬鈴薯、蠶豆、蘿卜、花生等。煙草是典型的基因工程模式植物。故本發(fā)明選擇煙草進行轉(zhuǎn)基因研究,以研究本 發(fā)明的啟動子在雙子葉植物中的效果。實驗結(jié)果表明,該啟動子能在轉(zhuǎn)基因煙草中起作用。在本發(fā)明中,可采用植物基因轉(zhuǎn)化技術(shù)將目的基因及所述啟動子插入到植物基因 組中,包括農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化、病毒介導(dǎo)轉(zhuǎn)化、顯微注射、粒子轟擊、基因槍轉(zhuǎn)化和電穿孔等。 本領(lǐng)域周知,農(nóng)桿菌介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)化常被用于單子葉植物和雙子葉植物的基因轉(zhuǎn)化,但其 它轉(zhuǎn)化技術(shù)也可用于本發(fā)明啟動子及外源基因的導(dǎo)入。當(dāng)然,適于本發(fā)明的啟動子及外源 基因?qū)氲牧硪环N方法是粒子轟擊(顯微金或鎢粒子包覆轉(zhuǎn)化的DNA)胚性愈傷組織或胚 胎開發(fā)。另外,還可以采用的轉(zhuǎn)化植物細胞的方法是原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化?;蜣D(zhuǎn)化后,采用通用 的方法來篩選和再生整合有表達單元的植株。為實現(xiàn)上述調(diào)控基因表達的目的,本發(fā)明所述啟動子可以以單拷貝和/或多拷貝 的形式應(yīng)用,可以與現(xiàn)有技術(shù)中已知的啟動子聯(lián)用。本發(fā)明的啟動子以及調(diào)控植物中基因表達的方法,可以應(yīng)用于植物品種的選育。比如,可以用于水稻或煙草的育種。所述水稻可以為日本晴、中花9、中花10、中花11、臺北 309、丹江8號、云稻2號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐優(yōu)22、黔優(yōu)88、II優(yōu)416、II優(yōu)107、II優(yōu) 128,11優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu)527、川農(nóng)1號、雜0152、皖稻88、皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、 皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、 皖稻203、皖稻205、皖稻207,以及津原101等。在本發(fā)明一個具體的實施方式中,所述水 稻為日本晴。所述的煙草可以為K326、K346、K394、NC82、NC89、G140、G28、G80、中煙90、 Cokerl76,以及CV87等。在本發(fā)明另一個具體的實施方式中,所述煙草為煙草NC89。本發(fā)明的啟動子可成為一種新的啟動子,作為植物(包括單子葉植物和雙子葉植 物,尤其是水稻和煙草)轉(zhuǎn)基因的工具啟動子,為開展低表達基因轉(zhuǎn)化苗篩選、植物花器官 敗育等分子育種研究提供便利,從而極大地縮短優(yōu)良品種的選育時間。本發(fā)明的啟動子可 廣泛用于培育水稻、煙草、小麥、玉米、小米、甘蔗、高粱、大麥、大豆,馬鈴薯、蠶豆、蘿卜、花 生等。在本發(fā)明中,術(shù)語“單子葉植物”,具體地,可以為禾本科植物,更具體地,可以為稻 屬植物例如水稻,包括但不限于日本晴、中花9、中花10、中花11、臺北309、丹江8號、云稻2 號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐優(yōu)22、黔優(yōu)88、II優(yōu)416、II優(yōu)107、II優(yōu)128、II優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu) 527、川農(nóng)1號、雜0152、皖稻88、皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖 稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻 207,以及津原101等。在本發(fā)明中,術(shù)語“雙子葉植物”,具體地,可以為茄科植物,更具體地,可以為煙草 屬植物(煙草),包括但不限于煙草 1(326、1(;346、1(394、^82、^89、6140、628、680、中煙 90、 Cokerl76,以及 CV87 等。下面通過具體實施方式
結(jié)合附圖對本發(fā)明作進一步詳細說明。但本領(lǐng)域技術(shù)人員 將會理解,下列實施例僅用于說明本發(fā)明,而不應(yīng)視為限定本發(fā)明的范圍。實施例中未注明 具體技術(shù)或條件者,按照本領(lǐng)域內(nèi)的文獻所描述的技術(shù)或條件(例如參考J.薩姆布魯克等 著,黃培堂等譯的《分子克隆實驗指南》,第三版,科學(xué)出版社)或者按照產(chǎn)品說明書進行。 所用試劑或儀器未注明生產(chǎn)廠商者,均為可以通過市購獲得的常規(guī)產(chǎn)品。實施例1 :P545啟動子片段的PCR擴增和pMD18_T+P545重組載體的構(gòu)建PCR擴增使用植物基因組DNA提取試劑盒(TIANGEN新型植物基因組DNA提取試劑盒,目錄 號DP320-02)提取水稻日本晴(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare)(已在申 請?zhí)枮?00910238992. 0、發(fā)明名稱為“一種啟動子BgIosP587、其制備方法及用途”的發(fā)明 申請中保藏,并于2010年9月22日公開,保藏編號為CCTCC NO :P200910)的基因組DNA,根 據(jù)該啟動子在水稻日本晴gDNA中的序列,分別在首尾設(shè)計一對PCR特異性擴增引物(上游 引物F1,加限制性酶切位點EcoRl和保護堿基,下游引物R1,加限制性酶切位點SbfI和保 護堿基)。以上述提取的水稻日本晴的gDNA為模板,使用高保真Ex Taq(TaKaRa,DRR100B) 聚合酶進行PCR擴增。如表1所示。表1基因啟動子擴增的PCR體系
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權(quán)利要求
1.一種啟動子,所述啟動子含有選自以下任意一組并具有啟動子功能的核苷酸序列a、Seq ID No. 1所示的核苷酸序列;以與kq ID No. 1互補的核苷酸序列;C、在高等嚴(yán)緊條件下能夠與上述a或b的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;d、對上述a或b所示核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核苷酸 序列;e、與上述a或b所示核苷酸序列具有至少90%同一性的核苷酸序列。
2.—種核酸構(gòu)建體,包含權(quán)利要求1所述的啟動子,與啟動子可操作連接的基因序列, 其中所述啟動子與所述基因序列來源相同或者不同。
3.一種載體,其特征在于所述載體含有權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán)利要求2所述 的核酸構(gòu)建體,優(yōu)選的,所述載體為權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán)利要求2所述的核酸構(gòu)建 體與pMD18-T或p8質(zhì)粒經(jīng)重組得到的重組載體。
4.一種重組細胞,其特征在于所述細胞含有權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán)利要求2 所述的核酸構(gòu)建體或權(quán)利要求3所述的載體,優(yōu)選的,所述重組細胞為重組大腸桿菌細胞 或重組農(nóng)桿菌細胞。
5.一種含有權(quán)利要求1的啟動子或權(quán)利要求2的核酸構(gòu)建體或權(quán)利要求3的載體或權(quán) 利要求4的重組細胞的植物愈傷組織或植物外植體或植物,優(yōu)選的,所述植物為單子葉植 物或雙子葉植物,再優(yōu)選的,所述植物為稻屬或煙草屬,更優(yōu)選的,所述植物為水稻或煙草, 進一步優(yōu)選的,所述植物為水稻日本晴或煙草NC89。
6.一組引物對,所述引物對用于擴增得到權(quán)利要求1所述的啟動子,其特征在于所述 引物對的兩條引物分別含有kq IDID No :3所示的序列,優(yōu)選的,所述引物對 的兩條引物在5’端還分別連接有限制性酶切位點和/或保護堿基,更優(yōu)選的,所述引物對 的兩條引物分別具有kq ID No ID No :5所示的序列。
7.制備SEQID NO :1所示的啟動子的方法,包括以水稻日本晴基因組DNA為模板,使用一對擴增引物進行擴增,所述擴增引物根據(jù)SEQ ID NO :1在水稻日本晴gDNA中的序列分別針對首尾進行設(shè)計,優(yōu)選是權(quán)利要求6所述的引 物對。
8.—種調(diào)控植物中基因表達的方法,所述方法包括,將權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán) 利要求2的核酸構(gòu)建體或權(quán)利要求3的載體或權(quán)利要求4的重組細胞導(dǎo)入植物,優(yōu)選導(dǎo)入 植物愈傷組織,優(yōu)選的,所述植物為單子葉植物或雙子葉植物,再優(yōu)選的,所述植物為稻屬或煙草屬,更優(yōu)選的,所述植物為水稻或煙草,進一步優(yōu)選的,所述植物為水稻日本晴或煙草NC89。
9.一種制備轉(zhuǎn)基因植物的方法,包括在有效產(chǎn)生植物的條件下培養(yǎng)權(quán)利要求4的重組 細胞或權(quán)利要求5的植物愈傷組織或植物外植體或植物。
10.權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán)利要求2的核酸構(gòu)建體或者權(quán)利要求3的載體或權(quán) 利要求4的重組細胞或權(quán)利要求5的植物愈傷組織或植物外植體或植物在調(diào)控植物中目的 基因表達或植物育種中的用途,植物優(yōu)選是單子葉植物或雙子葉植物,再優(yōu)選為稻屬或煙草屬,更優(yōu)選為水稻或煙草,更進一步優(yōu)選為水稻日本晴或煙草NC89。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種啟動子BgIosP545、制備方法及應(yīng)用。所述啟動子含有選自以下任意一組并具有啟動子功能的核苷酸序列a、Seq ID No.1所示的核苷酸序列;b、與Seq ID No.1互補的核苷酸序列;c、在高等嚴(yán)緊條件下能夠與上述a或b的核苷酸序列雜交的核苷酸序列;d、對上述a或b所示核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列;e、與上述a或b所示核苷酸序列具有至少90%同一性的核苷酸序列。本發(fā)明啟動子能夠在單子葉和雙子葉植物中調(diào)控基因表達,從而為研究植物中目的基因的表達提供了一種新的工具和選擇。
文檔編號A01H4/00GK102146395SQ201010615820
公開日2011年8月10日 申請日期2010年12月30日 優(yōu)先權(quán)日2010年12月30日
發(fā)明者全志武, 夏秋菊, 李河南, 楊爽 申請人:深圳華大基因科技有限公司