技術(shù)特征:
技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了一種DNA甲基化測(cè)序數(shù)據(jù)計(jì)算解讀方法,實(shí)施步驟包括:對(duì)用于DNA甲基化測(cè)序的參考基因組數(shù)據(jù)和原始的測(cè)序樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理;通過(guò)CPU調(diào)用FPGA上硬件實(shí)現(xiàn)的比對(duì)器將預(yù)處理后的測(cè)序樣本數(shù)據(jù)和參考基因組進(jìn)行比對(duì);通過(guò)CPU調(diào)用GPU上編程實(shí)現(xiàn)的識(shí)別器、FPGA上硬件實(shí)現(xiàn)的深度學(xué)習(xí)模型,基于比對(duì)結(jié)果進(jìn)行甲基化識(shí)別;對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化,通過(guò)CPU調(diào)用FPGA上硬件實(shí)現(xiàn)的深度學(xué)習(xí)模型對(duì)結(jié)果數(shù)據(jù)反映的甲基化功能進(jìn)行挖掘和分析,且CPU調(diào)用GPU上編程處理分析挖掘相關(guān)的視頻、動(dòng)畫(huà)和顯示任務(wù),CPU調(diào)用DSP上編程處理和分析挖掘相關(guān)的圖形、圖像和音頻任務(wù)。本發(fā)明具有快速實(shí)時(shí)、精準(zhǔn)深入、通俗易懂、形式多樣的優(yōu)點(diǎn)。
技術(shù)研發(fā)人員:宋卓;劉蓬俠;李根
受保護(hù)的技術(shù)使用者:人和未來(lái)生物科技(長(zhǎng)沙)有限公司
技術(shù)研發(fā)日:2017.05.22
技術(shù)公布日:2017.10.20