本發(fā)明涉及棉花檢測領(lǐng)域,更具體而言,本發(fā)明涉及棉花全生育期冠層SPAD(“土壤作物分析儀器開發(fā)”的縮寫,Soil and Plant Analyzer Development)值遙感估算及估算模型構(gòu)建方法。
背景技術(shù):
葉綠素是植物光合作用中最主要的色素,也是植物與外界進(jìn)行能量交換的重要物質(zhì)。葉綠素含量與植株光合能力、發(fā)育階段和氮素狀況密切相關(guān),已經(jīng)成為評價植物長勢的一種有效手段,對植物葉綠素含量的實(shí)時監(jiān)測有著重要的意義[1]。SPAD值是一個相對葉綠素含量讀數(shù),可用作植物單位面積的葉綠素含量[2]。通常采用SPAD-502葉綠素儀測量植物SPAD值,該儀器通過測量葉子對兩個波長段里的吸收率,來評估當(dāng)前葉子中的葉綠素的相對含量,它已成為當(dāng)前全世界測量葉綠素的常用方法[3]。研究表明,葉綠素含量與葉片反射率之間存在高度相關(guān)性。因此,近年來,基于高光譜預(yù)測葉綠素含量的研究在國內(nèi)外得到了廣泛地展開。
高光譜遙感具有光譜分辨率高(<10nm)、波段連續(xù)性強(qiáng)、光譜信息量大等特點(diǎn),其分辨率低于一般地表物質(zhì)的半吸收寬度(約20--40nm)。而逐步成熟的植被高光譜分析算法,為更準(zhǔn)確地探測植被精細(xì)光譜信息、描述各關(guān)鍵生育時期的光譜變化特征、定量反演棉花SPAD值、建立棉花生長信息定量模型提供了可能。
已有研究表明,對作物的近紅外光譜分析中,偏最小二乘算法方法的預(yù)測效果優(yōu)于一般線性模型,且對連續(xù)光譜分析有明顯的優(yōu)勢[4,5]。偏最小二乘(PLS)回歸分析方法是集多元線性回歸分析、典型相關(guān)分析和主成分分析的基本功能為一體的一種新型多元統(tǒng)計數(shù)據(jù)分析方法,能有效克服一般最小二乘回歸分析方法無法解決的難題。本發(fā)明運(yùn)用PLSR構(gòu)建了棉花全生育期冠層光譜的SPAD預(yù)測模型。
目前國內(nèi)外植被高光譜分析算法研究大多集中在水稻[6]、小麥[6]、油菜[3,8]等糧油作物,對棉花研究的相對較少。國內(nèi)對棉花的研究區(qū)主要集中在我國的新疆干旱地區(qū)[9-11],而對于渭北旱塬區(qū)棉花冠層葉片葉綠素含量的研究極少見到。渭北旱塬區(qū)地處陜北丘陵溝壑區(qū)的南部、關(guān)中平原的北部,是陜西省重要的農(nóng)業(yè)基地,因此選取渭北旱塬區(qū)的重要的經(jīng)濟(jì)作物棉花為對象開展研究工作,這對解決當(dāng)?shù)丶Z食問題、農(nóng)民增收和加快農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展有著重要的戰(zhàn)略意義。同時,以往對棉花冠層葉綠素的研究由于天氣條件限制和實(shí)驗(yàn)條件有限等因素,往往是針對關(guān)鍵生育期的估測,尚未有全生育期的估測,故本發(fā)明以全生育期詳實(shí)的田間棉花基礎(chǔ)數(shù)據(jù)建模,來進(jìn)一步提高估測模型的可靠性,為棉花長勢的高光譜遙感監(jiān)測提供依據(jù)。
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技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
鑒于此,本發(fā)明提供了一種棉花全生育期冠層SPAD值遙感估算模型構(gòu)建方法,包括以下步驟:選擇多個實(shí)驗(yàn)小區(qū),在每個實(shí)驗(yàn)小區(qū)選擇多個樣點(diǎn);分別于棉花的不同成長關(guān)鍵生育期進(jìn)行冠層光譜測量;每個樣點(diǎn)測多條完整曲線,最后取其均值作為該樣點(diǎn)的平均反射光譜,每個小區(qū)取多個樣點(diǎn)的反射光譜平均值作為該小區(qū)的反射光譜;在測定光譜的樣點(diǎn)處,選擇棉花冠層展開的第二、三片葉片進(jìn)行測量,每個樣點(diǎn)隨機(jī)測量多個SPAD值,取其平均值作為該樣點(diǎn)的冠層葉綠素值;將棉花原始冠層光譜反射率與葉片SPAD值進(jìn)行單相關(guān)分析;將棉花冠層光譜反射率作一階微分后與葉片SPAD值進(jìn)行相關(guān)分析;將選取的多種遙感光譜參數(shù)與SPAD值進(jìn)行相關(guān)分析,選取相關(guān)性最大的遙感光譜參數(shù)進(jìn)行建模。
優(yōu)選地,將得到的原始光譜進(jìn)行處理后得到光滑完整的光譜曲線,再對反射光譜做一階微分處理以消除噪聲影響、減小誤差。
優(yōu)選地,測量時避開葉脈部分,SPAD測量時間與光譜數(shù)據(jù)采集同步。
優(yōu)選地,選取對SPAD值相關(guān)性最顯著的特征光譜參數(shù)為自變量,對全生育期SPAD值作線性擬合,構(gòu)建模型。
優(yōu)選地,應(yīng)用預(yù)測模型偏最小二乘回歸法PLSR對全生育期的所有測試樣本的光譜特征參數(shù)建立棉花冠層葉片的SPAD預(yù)測模型。
優(yōu)選地,所述成長關(guān)鍵生育期包括:苗期、盛蕾期、盛花期、盛鈴期、吐絮期。
優(yōu)選地,所述棉花全生育期冠層SPAD值遙感估算模型構(gòu)建方法包括:利用檢驗(yàn)樣本對不同輸入變量的模型精度進(jìn)行檢驗(yàn),采用決定系數(shù)R2、均方根誤差RMSE和回歸方程斜率三個指標(biāo)來檢驗(yàn)全生育期模型的預(yù)測能力,決定系數(shù)R2和斜率絕對值越接近1,RMSE值越小,則預(yù)測模型精度越高。
本發(fā)明還提供了一種棉花全生育期冠層SPAD值遙感估算方法,包括利用根據(jù)上述方法構(gòu)建的模型來估算棉花全生育期冠層SPAD值。
根據(jù)在下文中所描述的附圖和實(shí)施例,本發(fā)明的這些和其它方面將是清楚明白的,并且將參考在下文中所描述的實(shí)施例而被闡明。
附圖說明
將參考附圖中所說明的優(yōu)選實(shí)施例而在下文中更詳細(xì)地解釋本發(fā)明。
圖1示出了根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的棉花葉片SPAD與冠層原始光譜的相關(guān)性。
圖2示出了根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的棉花葉片SPAD與冠層一階微分光譜的相關(guān)性。
圖3示出了根據(jù)本發(fā)明實(shí)施例的葉片SPAD預(yù)測值與實(shí)測值分布。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合附圖詳細(xì)描述本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例。
1材料與方法
1.1研究區(qū)概況
試驗(yàn)于2014-2015年在渭北旱塬區(qū)的乾縣梁山鄉(xiāng)三合村(108°00′13″E~108°24′18″E,34°19′36″N~34°45′05″N)進(jìn)行,當(dāng)?shù)貙儆谂瘻貛О敫珊?、半濕潤大陸性季風(fēng)氣候,年降水量為550-730mm,雨熱同季,干旱威脅大。因水土流失嚴(yán)重,導(dǎo)致土壤貧瘠化,使農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)特別薄弱,嚴(yán)重制約農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。研究區(qū)前茬作物棉花,供試品種為魯棉研28號。本發(fā)明設(shè)計46個實(shí)驗(yàn)小區(qū),小區(qū)大小為5m*6m。棉花種植方式為地膜覆蓋壟種。
1.2數(shù)據(jù)獲取
1.2.1棉花冠層高光譜數(shù)據(jù)的測量
采用美國的SVCHR1024i便攜式全波段地物光譜儀,光譜范圍350-2500nm,其中350-1000nm區(qū)間光譜分辨率為1.4nm,1000-1850nm區(qū)間光譜分辨率為3.8nm,1850-2500nm為2.4nm,選擇晴朗無云無風(fēng)天氣的10:00-14:00,在每個小區(qū)選取3個具有代表性的、均勻的無病蟲危害的樣點(diǎn),分別在棉花的成長關(guān)鍵生育期(苗期、盛蕾期、盛花期、盛鈴期、吐絮期)進(jìn)行冠層光譜測量。每次測定均進(jìn)行參考白板的標(biāo)定,傳感器探頭垂直向下,距離棉花冠層頂部約50cm,光譜掃描時間設(shè)為3s,每樣點(diǎn)測3-5條完整曲線,最后取其均值作為該樣點(diǎn)的平均反射光譜,每個小區(qū)取三個樣點(diǎn)的反射光譜平均值作為該小區(qū)的反射光譜。
1.2.2 SPAD值的測量
采用SPAD儀進(jìn)行無破壞性的田間即時測定,測量光譜對應(yīng)的冠層葉綠素。在測定光譜的樣點(diǎn)處,選擇棉花冠層展開的第二、三片葉片進(jìn)行測量,每個樣點(diǎn)隨機(jī)測量10個SPAD值,取其平均值作為該樣點(diǎn)的冠層葉綠素值。為了減小誤差,在每片葉子的中部選取均勻分布的10個點(diǎn),測量時避開葉脈部分。SPAD測量時間與光譜數(shù)據(jù)采集同步。
1.3數(shù)據(jù)處理
1.3.1高光譜圖像信息選擇
為了剔除背景、大氣散射的影響和提高不同吸收特征的對比度,在實(shí)際分析處理高光譜數(shù)據(jù)的過程中,常常需要對原始高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行各種變換[13]?;镜淖儞Q形式主要是微分變換、對數(shù)變換和對數(shù)的微分變換。
將得到的原始光譜首先用SVC HR-1024i軟件做Overlap/Matching處理,得到光滑完整的光譜曲線,再采用origin對反射光譜做一階微分處理以消除噪聲影響、減小誤差,其原理:
式中λi為通道i處的波長值,R(λi)為波長λi處的光譜反射值,Δλ為相鄰波長間隔。
1.3.2遙感光譜參數(shù)選擇
遙感植被光譜參數(shù)通過不同波段反射率的線性或非線性組合變化,削弱背景信息對植被光譜特征的干擾,有助于提高遙感數(shù)據(jù)表達(dá)葉綠素含量的精度。本發(fā)明提取了22種對葉綠素含量敏感的寬波段光譜指數(shù)和7種紅邊參數(shù)來構(gòu)建棉花冠層葉片SPAD值估算模型。光譜參數(shù)計算方式見表1。
表1 遙感光譜參數(shù)及其計算公式
注:R為原始光譜的反射率,NIR為近紅外范圍內(nèi)第一個拐點(diǎn)對應(yīng)的波長。
1.3.3特征光譜建模預(yù)測
將上述29種光譜參數(shù)與SPAD值進(jìn)行相關(guān)分析,選取相關(guān)性最大的遙感光譜參數(shù)進(jìn)行建模。全生育期觀測得到920個樣本,其中800個作為測試樣本,120個留作檢驗(yàn)樣本。
2結(jié)果與分析
2.1 SPAD值與光譜反射率的相關(guān)性
2.1.1 SPAD值與原始光譜相關(guān)性
將棉花原始冠層光譜反射率與葉片SPAD值進(jìn)行單相關(guān)分析(樣本數(shù)n=800),結(jié)果如圖1所示。由圖可知,棉花葉片SPAD與冠層光譜反射率在紅邊至1250nm的正紅外波段呈極顯著正相關(guān),在500-715nm的綠-紅波段和1340-2500nm的近紅外波段呈極顯著負(fù)相關(guān),這主要是葉綠素在此光譜區(qū)間的特殊收斂反射性能所決定的。其中,SPAD值的敏感波段出現(xiàn)在708.2nm處,對應(yīng)r=-0.533,達(dá)到99%置信水平顯著相關(guān)。
2.1.2 SPAD與一階微分光譜相關(guān)性
將棉花冠層光譜反射率作一階微分后與葉片SPAD值進(jìn)行相關(guān)分析,結(jié)果如圖2所示。從圖2可以看出,SPAD值與光譜一階微分的相關(guān)性整體上優(yōu)于原始光譜的相關(guān)性。波長500-760nm的相關(guān)系數(shù)大于0.6,其中反映SPAD含量的敏感波段出現(xiàn)在734.7nm處,r=0.6992。
2.2棉花葉片光譜參數(shù)與SPAD相關(guān)性
根據(jù)表1計算各種光譜參數(shù)并與SPAD值進(jìn)行相關(guān)性分析,得到表2。29個光譜參數(shù)中只有6個與SPAD值相關(guān)性較差,未達(dá)到顯著相關(guān)水平,多達(dá)21個與SPAD值呈極顯著相關(guān)水平。
表2 棉花全生育期各光譜變量與SPAD的相關(guān)性
注:1.**表示在0.01水平上顯著相關(guān);2.*表示在0.05水平上顯著相關(guān)。
由表2可以看出,與全生育期棉花葉片SPAD相關(guān)性最好的幾個光譜變量其相關(guān)系數(shù)從高到低依次為改進(jìn)的葉綠素吸收反射指數(shù)MCARI、復(fù)合植被指數(shù)MCARI/OSAVI、抗大氣植被指數(shù)VARI,說明與SPAD值都是顯著負(fù)相關(guān),其中MCARI的相關(guān)系數(shù)最高,達(dá)到了-0.679;R紅邊、MERIS陸地葉綠素指數(shù)MTCI與SPAD呈顯著正相關(guān)。這幾個光譜變量的計算都與紅光波段有關(guān),而紅光波段正是葉綠素的強(qiáng)吸收波段。另外,MCARI、MCARI/OSAVI、MTCI、VARI、R紅邊均通過了99%置信水平的顯著性檢驗(yàn),表明這五個光譜變量對SPAD值的變化有較好的表征作用。
2.3棉花冠層SPAD值估算模型構(gòu)建
利用冠層光譜數(shù)據(jù)對SPAD值進(jìn)行估算時,采用兩種方法建模。1)選取對SPAD值相關(guān)性最顯著的五個特征光譜參數(shù)(MCARI、MCARI/OSAVI、MTCI、VARI和R紅邊)為自變量,對全生育期SPAD值作線性擬合,構(gòu)建的模型見表3。
表3 棉花全生育期葉片SPAD值的回歸預(yù)測模型
由表3可以看出,五種入選變量與SPAD值建立的回歸方程相關(guān)系數(shù)均達(dá)到極顯著水平,其中以MCARI為自變量的線性回歸方程擬合的絕對系數(shù)R2和相關(guān)系數(shù)r都最高,分別為0.461和-0.6789。
2)偏最小二乘回歸法(Partial least squares regression,PLSR)是一種新型的多元統(tǒng)計數(shù)據(jù)分析方法,它主要研究的是多因變量對多自變量的回歸建模,特別當(dāng)各變量內(nèi)部高度線性相關(guān)時,用偏最小二乘回歸法更有效。PLSR集主成分、典型相關(guān)和多元線性回歸分析三種分析方法的優(yōu)點(diǎn)為一體,能夠利用所有有效的光譜參數(shù)構(gòu)建模型,提取出反映數(shù)據(jù)變異的最大信息,具有良好的預(yù)測功能[4]。應(yīng)用PLSR[15]對全生育期800個樣本的光譜特征參數(shù)建立棉花冠層葉片的SPAD預(yù)測模型,模型的R2=0.733,RMSEC=4.546,各光譜變量與SPAD值的回歸系數(shù)見表4。
表4 棉花各光譜變量與SPAD的回歸系數(shù)
2.4模型檢驗(yàn)
為了檢驗(yàn)?zāi)P托Ч?20個檢驗(yàn)樣本對不同輸入變量的模型精度進(jìn)行檢驗(yàn),采用決定系數(shù)R2、均方根誤差RMSE和回歸方程斜率三個指標(biāo)來檢驗(yàn)全生育期模型的預(yù)測能力,決定系數(shù)R2和斜率絕對值越接近1,RMSE值越小,說明預(yù)測模型精度越高。模型檢驗(yàn)結(jié)果見表5和圖3。
表5 SPAD估算模型精度檢驗(yàn)
由表5可知,由光譜特征變量MCARI、MCARI/OSAVI、MTCI、VARI、R紅邊建立的SPAD估算模型預(yù)測全生育期棉花冠層SPAD值的精度較低,除MTCI外,另外四個參數(shù)的估算模型的驗(yàn)證R2都在0.53左右,都沒有SPAD-PLSR模型的驗(yàn)證R2大(0.7370)。在所有模型中,SPAD-PLSR模型的驗(yàn)證R2最大,RMSE最小,分別為0.737和4.135,所以SPAD-PLSR模型相較于其他模型有明顯的優(yōu)勢,能有效地對SPAD值進(jìn)行估測。比較前五個模型,SPAD-VARI(700)的R2最大,但是其均方根誤差RMSE也最大,同時回歸方程斜率僅0.553,說明該模型預(yù)測精度不高;SPAD-MCARI模型的R2僅次于SPAD-VARI(700),同時均方根誤差在五個模型中是最小的、回歸方程斜率最接近于1,說明SPAD-MCARI在前五個模型中精度最高、預(yù)測能力最好。
由圖3可知,在以光譜變量為自變量所建立的回歸方程中,以MCARI為自變量的棉花冠層SPAD值估算值與實(shí)測值分布最接近于1:1線,進(jìn)一步驗(yàn)證了上述SPAD-MCARI在前五個模型中精度最高、對全生育期SPAD值的估測能力最好。而通過SPAD-PLSR模型實(shí)測值與預(yù)測值分布圖與SPAD-MCARI模型實(shí)測值與預(yù)測值分布圖的比較,可以看到SPAD-PLSR模型優(yōu)勢更明顯,其預(yù)測值與實(shí)測值之間的分布更集中、更接近1:1線,因此確定SPAD-PLSR模型為估算棉花全生育期冠層SPAD值的最佳模型。
3結(jié)論與討論
棉花冠層原始光譜反射率數(shù)據(jù)、一階微分光譜數(shù)據(jù)與SPAD的相關(guān)性都較高,可以用來估計SPAD值。一階微分光譜與SPAD的相關(guān)性整體上比原始光譜反射率數(shù)據(jù)做的相關(guān)性結(jié)果更好,這是由于微分消除了背景、大氣散射的影響,并提高了不同吸收特征的對比度。對于原始反射光譜,SPAD值的敏感波段發(fā)生在708.2nm處,對應(yīng)r=-0.533;對于一階微分光譜,SPAD含量的敏感波段發(fā)生在734.7nm處,r=0.6992。
利用冠層光譜數(shù)據(jù)對SPAD值進(jìn)行估算時,通常以原始光譜和一階微分光譜為數(shù)據(jù)源,提取遙感光譜特征參數(shù),以光譜數(shù)據(jù)變換形式對全生育期SPAD值作線性回歸分析,從而建立基于光譜參數(shù)的SPAD預(yù)測模型[16],這與本發(fā)明的第一種建模方法一致,而采用PLSR對全生育期重要光譜變量建模并檢驗(yàn),其預(yù)測值與實(shí)測值之間的分布更集中、更接近1:1線,說明其模型預(yù)測效果更好更精確,說明SPAD-PLSR估算模型對全生育期棉花冠層SPAD值估測更適用,這對指導(dǎo)棉花種植與生產(chǎn)具有積極指導(dǎo)作用,可為棉花遙感監(jiān)測提供依據(jù)。在SPAD值預(yù)測模型參數(shù)選擇方面,之前的學(xué)者應(yīng)用最多的是由一階微分提取的紅邊參數(shù)[17],而本發(fā)明中與SPAD值相關(guān)性最好的光譜變量是MCARI、MCARI/OSAVI和R紅邊,造成這種差異的原因可能是地域不同、光照條件不同或是背景復(fù)雜情況不同。本發(fā)明對重要遙感光譜變量做SPAD值的常規(guī)線性回歸模型,其中預(yù)測效果最好的是SPAD-MCARI模型:y=-64.33x+61.822,R2=0.461,模型精度檢驗(yàn)結(jié)果與其它的相比,R2最大、RMSE最小,所以SPAD-MCARI模型相較于其他模型有一定的優(yōu)勢,可以應(yīng)用到精度要求不高的平臺。
本發(fā)明使用的全生育期SPAD-PLSR模型樣本數(shù)量豐富、預(yù)測精度高,以全生育期詳實(shí)的田間棉花基礎(chǔ)數(shù)據(jù)建模,提高了估測模型的可靠性,為渭北旱塬區(qū)預(yù)測棉花冠層葉綠素提供了參考方法,為全生育期棉花長勢的高光譜遙感監(jiān)測提供依據(jù),為解決當(dāng)?shù)丶Z食問題、農(nóng)民增收和加快農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展有著重要的戰(zhàn)略意義。
上面結(jié)合附圖和實(shí)施例對本發(fā)明做了詳細(xì)的說明。但是,應(yīng)當(dāng)理解,本發(fā)明的實(shí)施例并不限于所公開的特定實(shí)施例,并且對該實(shí)施例的修改和其他實(shí)施例也意圖被包含在所附權(quán)利要求書的范圍內(nèi)。盡管此處使用了特定術(shù)語,但是它們僅在通用和描述性意義上使用,而非為了限制的目的。