技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種建立膿腫分枝桿菌RUO數(shù)據(jù)庫和構(gòu)建亞型的超級圖譜的方法，其特征在于：包括如下步驟：步驟1：膿腫分枝桿菌菌株收集和DNA抽提；步驟2：基因文庫制備和illumina?HiSeq測序；步驟3：基因組建立與系統(tǒng)進化樹構(gòu)建；步驟4：樣本準(zhǔn)備和對菌株的檢測；步驟5：準(zhǔn)確性的確認(rèn)。本發(fā)明通過分析明確膿腫分枝桿菌亞種；通過基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜檢測亞種信息，建立RUO數(shù)據(jù)庫和構(gòu)建出的超級圖譜，并通過菌株盲測檢驗其敏感性和特異性，制定用于亞種層面實驗室鑒定的操作流程及診斷標(biāo)準(zhǔn)，并加入微生物標(biāo)準(zhǔn)體外診斷流程的工作鏈，提高了各微生物實驗室對膿腫分枝桿菌亞型鑒定的效率。

技術(shù)研發(fā)人員：褚海青
受保護的技術(shù)使用者：上海市肺科醫(yī)院
文檔號碼：201611024152
技術(shù)研發(fā)日：2016.11.17
技術(shù)公布日：2017.03.08