瘤患者的產(chǎn)品。
[0032] 其中，檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性（即等位基因）或基因型的物質(zhì)可 為通過(guò)下述至少一種方法確定rs2359536的多態(tài)性（即等位基因）或基因型所需的試劑 和/或儀器：DNA測(cè)序、限制性酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性、單鏈構(gòu)象多態(tài)性、變性高效液相色譜、 SNP芯片、TaqMan探針技術(shù)和Sequenom MassArray技術(shù)。其中，利用Sequenom MassArray 技術(shù)確定rs2359536的多態(tài)性（即等位基因）或基因型所需的試劑和/或儀器包括PCR 引物對(duì)、基于單堿基延伸反應(yīng)的延伸引物、磷酸酶（如蟲(chóng)下堿性磷酸酶（shrimp alkaline phosphatase，SAP))、樹(shù)月旨、芯片、MALDI-TOF(matrix-assisted laser desorption/ ionization - time of fligh，基質(zhì)輔助激光解吸附電離飛行時(shí)間質(zhì)譜）和/或Sequenom MassArray技術(shù)所需要的其他試劑和儀器；利用TaqMan探針技術(shù)確定rs2359536的多態(tài)性 (即等位基因）或基因型所需的試劑和/或儀器包括TaqMan探針、PCR引物對(duì)、定量PCR儀、 進(jìn)行基因分型的模塊（如7500System SDS software)和/或TaqMan探針技術(shù)所需要的其 他試劑；SNP芯片包括基于核酸雜交反應(yīng)的芯片、基于單堿基延伸反應(yīng)的芯片、基于等位基 因特異性引物延伸反應(yīng)的芯片、基于"一步法"反應(yīng)的芯片、基于引物連接反應(yīng)的芯片、基于 限制性內(nèi)切酶反應(yīng)的芯片、基于蛋白DNA結(jié)合反應(yīng)的芯片和/或基于熒光分子DNA結(jié)合反 應(yīng)的芯片。
[0033] 所述產(chǎn)品可為試劑或試劑盒，還可為由試劑或試劑盒和儀器組成的系統(tǒng)，如由引 物和DNA測(cè)序儀組成的系統(tǒng)，由PCR試劑和DNA測(cè)序試劑和DNA測(cè)序儀組成的系統(tǒng)，由 TaqMan探針、PCR引物對(duì)、定量PCR儀和進(jìn)行基因分型的模塊以及TaqMan探針技術(shù)所需要 的其他試劑組成的系統(tǒng)，由探針、PCR引物對(duì)以及連接酶檢測(cè)反應(yīng)（LDR)所需要的其他試劑 和儀器組成的系統(tǒng)，由PCR引物對(duì)、單堿基延伸引物、芯片、PCR儀、進(jìn)行基因分型的模塊和/ 或Sequenom MassArray技術(shù)所需要的其他試劑和儀器組成的系統(tǒng)。
[0034] 本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例中，米用Sequenom MassArray技術(shù)確定rs2359536的多態(tài) 性（即等位基因）和基因型。所述PCR引物對(duì)在序列上沒(méi)有特殊要求，只要能擴(kuò)增出包括 rs2359536在內(nèi)的基因組DNA片段即可，具體可為序列表中SEQ ID No. 1和SEQ ID No. 2 所示的單鏈DNA。所述單堿基延伸引物具體可為序列表中SEQ ID No. 7所示的單鏈DNA。 Sequenom MassArray 技術(shù)所需要的其他儀器包括 MassARRAY Nanodispenser RS1000 點(diǎn) 樣儀（Sequenom)和/或MALDI-T0F質(zhì)譜儀。Sequenom MassArray技術(shù)所需要的芯片為 SpectroCHIP(Sequenom)芯片（Sequenom)。所述進(jìn)行基因分型的模塊為T(mén)YPER 4.0軟件 (Sequenom)〇
[0035] 在本發(fā)明的實(shí)施例中，對(duì)rs2359536進(jìn)行基因分型用到的PCR反應(yīng)體系如表1所 示，反應(yīng)條件為：95攝氏度2min (預(yù)變性）；95攝氏度30s，56攝氏度30s，45個(gè)循環(huán)；72攝 氏度60s ;72攝氏度5min ;4攝氏度保存。
[0036] 表1、PCR反應(yīng)體系
[0037]
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備篩查垂體腺瘤患者產(chǎn) 品中的應(yīng)用。
2. 檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備檢測(cè)垂體腺瘤易感性 產(chǎn)品中的應(yīng)用。
3. 檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備檢測(cè)與垂體腺瘤相關(guān) 的單核苷酸多態(tài)性的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
4. 檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備鑒定或輔助鑒定與垂 體腺瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
5. 人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型在制備篩查垂體腺瘤患者產(chǎn)品中的應(yīng)用。
6. 人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型在制備檢測(cè)垂體腺瘤易感性產(chǎn)品中的應(yīng) 用。
7. 根據(jù)權(quán)利要求1-6中任一所述的應(yīng)用，其特征在于：所述產(chǎn)品包括擴(kuò)增包括 rs2359536在內(nèi)的基因組DNA片段的PCR引物和/或單堿基延伸引物； 和/或， 所述檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)為所述PCR引物和/或所述 單堿基延伸引物。
8. 含有檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)的產(chǎn)品，為a)-d)中的任 一種產(chǎn)品： a) 檢測(cè)與垂體腺瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品； b) 鑒定或輔助鑒定與垂體腺瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型的產(chǎn)品； c) 篩查垂體腺瘤患者產(chǎn)品； d) 檢測(cè)垂體腺瘤易感性產(chǎn)品。
9. 根據(jù)權(quán)利要求8所述的產(chǎn)品，其特征在于：所述檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài) 性或基因型的物質(zhì)為權(quán)利要求7所述PCR引物和/或所述單堿基延伸引物。
10. 根據(jù)權(quán)利要求7所述的應(yīng)用或權(quán)利要求9所述的產(chǎn)品，其特征在于：所述PCR引物 為序列表中SEQIDNo. 1所示的單鏈DNA和序列表中SEQIDNo. 2所示的單鏈DNA;所述 單堿基延伸引物為序列表中SEQIDNo. 7所示的單鏈DNA。
【專利摘要】本發(fā)明公開(kāi)了單核苷酸多態(tài)性rs2359536在檢測(cè)垂體腺瘤中的應(yīng)用。本發(fā)明所保護(hù)的一個(gè)技術(shù)方案是檢測(cè)人基因組中rs2359536的多態(tài)性(等位基因)或基因型的物質(zhì)在制備檢測(cè)與垂體腺瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性的產(chǎn)品中的應(yīng)用。可將檢測(cè)rs2359536的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)與其它物質(zhì)(如檢測(cè)其它的與垂體腺瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性或基因型的物質(zhì))聯(lián)合在一起制備篩查垂體腺瘤患者的產(chǎn)品。
【IPC分類】C12N15-11, C12Q1-68
【公開(kāi)號(hào)】CN104762389
【申請(qǐng)?zhí)枴緾N201510155482
【發(fā)明人】趙曜, 師詠勇, 王鏞斐, 李士其, 李志強(qiáng), 陳劍華, 壽雪飛, 沈明, 葉釗, 馬增翼, 張啟麟, 宋智健, 王濤, 何文強(qiáng), 季玨, 溫祖佳, 周良輔, 毛穎
【申請(qǐng)人】復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院, 上海交通大學(xué)
【公開(kāi)日】2015年7月8日
【申請(qǐng)日】2015年4月2日