一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片的制作方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及牛生物芯片領(lǐng)域，具體涉及一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片。
【背景技術(shù)】
[0002]基因芯片的測序原理是雜交測序方法，即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法，在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。當(dāng)溶液中帶有熒光標(biāo)記的核酸序列，與基因芯片上對應(yīng)位置的核酸探針產(chǎn)生互補匹配時，通過確定熒光強度最強的探針位置，獲得一組序列完全互補的探針序列，據(jù)此可重組出靶核酸的序列?，F(xiàn)有牛的生物芯片有3K，50K和770K商業(yè)生物芯片，這些芯片中的單核苷酸多態(tài)性位點都是均勻分部在染色體上。3Κ芯片計算個體育種值的準(zhǔn)確性較低，因此，奶牛一般用50Κ芯片進行遺傳評估，而對于育種歷程較短的肉牛，一般選用770Κ芯片進行基因組選擇。相對于高密度的770Κ芯片，大部分無效應(yīng)的位點，對于育種值的計算貢獻率很低。為節(jié)約成本，同時推動我國基因組選擇快速應(yīng)用于肉牛遺傳評估，還能夠準(zhǔn)確地估計出個體的基因組育種值，設(shè)計出一種專門針對生長發(fā)育性狀的16Κ小芯片成為加快我國肉牛育種歷程的一個迫在眉睫的技術(shù)難題。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]為了解決上述現(xiàn)有技術(shù)存在的問題，本發(fā)明提供一種智能配對基因序列生成的針對生長發(fā)育性狀的肉牛遺傳評估小芯片。
[0004]本發(fā)明通過以下技術(shù)方案來實現(xiàn)上述目的:
[0005]—種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，包括Illumina770k SNP芯片、基因識別體、核酸探針膜、探針移動軌道，3個為一組的所述Illumina770k SNP芯片的前方依次是宰前活重優(yōu)良基因、胴體重優(yōu)良基因、育肥期日增重優(yōu)良基因，9個所述Illumina770k SNP芯片下方分別是均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片、大效應(yīng)值的增重優(yōu)良基因芯片、P值大的增重優(yōu)良基因芯片，和均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片、大效應(yīng)值的胴體重優(yōu)良基因芯片、P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片，以及均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片、大效應(yīng)值的宰前活重優(yōu)良基因芯片、P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片，綜上所述生成的基因芯片中央是所述核酸探針膜，所述核酸探針膜之間是所述探針移動軌道，所述核酸探針膜周圍是所述基因識別體，所述基因識別體下方是載片。
[0006]其中，所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重優(yōu)良基因依次與所述Illumina770k SNP芯片相接觸并且識別。
[0007]其中，所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片利用均勻抽取得出均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片、所述均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片。
[0008]其中，所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片基于BayesB方法所得所述大效應(yīng)值的增重優(yōu)良基因芯片、所述大效應(yīng)值的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述大效應(yīng)值的宰前活重優(yōu)良基因芯片。
[0009]其中，所述宰前活重優(yōu)良基因、所述胴體重優(yōu)良基因、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片基于GWAS所得P值大小得出所述P值大的增重優(yōu)良基因芯片、所述P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片、所述P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片。
[0010]其中，所述載片與所述基因識別體剛性連接，所述核酸探針膜與所述探針移動軌道密封連接。
[0011]本發(fā)明的有益效果在于:利用小芯片，大大降低了用于肉牛遺傳評估中利用高密度生物芯片獲得基因型的成本，同時計算個體的基因組育種值能夠達到一定的準(zhǔn)確性，實現(xiàn)了一片多用，加速我國肉牛遺傳評估進展。
【附圖說明】
[0012]下面結(jié)合附圖和實施例對本發(fā)明進一步說明。
[0013]圖1是本發(fā)明所述一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片的制造流程圖；
[0014]圖2是本發(fā)明所述一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片的主視圖。
【具體實施方式】
[0015]如圖1-圖2所示，一種智能配對基因序列生成的肉牛遺傳評估小芯片，包括Illumina770k SNP芯片4、基因識別體15、核酸探針膜16、探針移動軌道17，3個為一組的所述Illumina770k SNP芯片4的前方依次是宰前活重優(yōu)良基因1、胴體重優(yōu)良基因2、育肥期日增重優(yōu)良基因3，9個所述111111^11&77(^ SNP芯片4下方分別是均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片5、大效應(yīng)值的增重優(yōu)良基因芯片6、P值大的增重優(yōu)良基因芯片7、和均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片8、大效應(yīng)值的胴體重優(yōu)良基因芯片9、P值大的胴體重優(yōu)良基因芯片10，以及均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片11、大效應(yīng)值的宰前活重優(yōu)良基因芯片12、P值大的宰前活重優(yōu)良基因芯片13，綜上所述生成的基因芯片中央是所述核酸探針膜16，所述核酸探針膜16之間是所述探針移動軌道17，所述核酸探針膜16周圍是所述基因識別體15，所述基因識別體15下方是載片14。
[0016]在本實施例中，所述宰前活重優(yōu)良基因1、所述胴體重優(yōu)良基因2、所述育肥期日增重優(yōu)良基因3依次與所述Illumina770k SNP芯片4相接觸并且識別，繼而能夠得出具有相應(yīng)優(yōu)良性狀的所述Illumina770k SNP芯片4。
[0017]在本實施例中，所述宰前活重優(yōu)良基因1、所述胴體重優(yōu)良基因2、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片4利用均勻抽取得出均勻抽取的增重優(yōu)良基因芯片5所述均勻抽取的胴體重優(yōu)良基因芯片8、所述均勻抽取的宰前活重優(yōu)良基因芯片11，用以與肉?；蚱坞s交，獲得相應(yīng)的SNP位點。
[0018]在本實施例中，所述宰前活重優(yōu)良基因1、所述胴體重優(yōu)良基因2、所述育肥期日增重通過所述Illumina770k SNP芯片4基于BayesB所得效應(yīng)值大小得出所述大效應(yīng)值的增重優(yōu)良基因芯片6、所述大效應(yīng)值的胴體重優(yōu)良基因芯片9、所述