本發(fā)明涉及基因測序領(lǐng)域,尤其涉及一種流體系統(tǒng)、控制方法、測序系統(tǒng)和存儲介質(zhì)。
背景技術(shù):
1、基因測序技術(shù)意指通過檢測獲取dna或rna堿基序列的技術(shù)手段。目前占主導(dǎo)的測序技術(shù)為高通量測序技術(shù),在基于邊合成邊測序?qū)崿F(xiàn)高通量測序的測序平臺中,基因測序的大致過程包括將待測核酸樣本以例如雜交的方式固定在流動池(flow?c?ell)上;再利用pcr擴增使得待測核酸樣本形成核酸分子簇;然后通過流體系統(tǒng)往流動池中加入測序試劑,例如帶有熒光基團的堿基、聚合酶以及引物等,通過堿基互補配對原理,使帶有熒光基團的堿基與待測核酸樣本上的堿基進行結(jié)合;最后通過光學(xué)成像系統(tǒng)激發(fā)熒光基團產(chǎn)生熒光并對熒光進行采集形成圖像,通過圖像進行堿基識別,從而實現(xiàn)待測核酸樣本的堿基序列測定。
2、然而,若測序試劑和/或待測核酸樣本中存在氣體,氣體隨著測序試劑和/或待測核酸樣本進入流動池,則會在流動池內(nèi)形成氣泡,從而影響拍照質(zhì)量,進而影響測序質(zhì)量。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本技術(shù)為至少解決現(xiàn)有技術(shù)中存在的技術(shù)問題之一,提供一種流體系統(tǒng)、控制方法、測序系統(tǒng)和存儲介質(zhì)。
2、一方面,本技術(shù)提供一種流體系統(tǒng),流體系統(tǒng)包括反應(yīng)裝置、管路和除氣裝置,反應(yīng)裝置用于提供進行生化反應(yīng)的場所,管路與反應(yīng)裝置連通,管路用于向反應(yīng)裝置輸送液體和/或接收從反應(yīng)裝置流出的液體,除氣裝置與管路連接,除氣裝置用于去除管路內(nèi)液體中的氣體。
3、如此,通過除氣裝置去除管路內(nèi)液體中的氣體,可以減少或避免氣體在反應(yīng)裝置中形成氣泡。
4、在某些實施方式中,反應(yīng)裝置包括進液口和出液口;
5、管路包括第一管路和第二管路,第一管路與進液口連通,第二管路與出液口連通,第一管路和/或第二管路與除氣裝置連接。
6、在某些實施方式中,反應(yīng)裝置包括進液口和出液口,管路包括旁通管路,旁通管路的一端與進液口連通,另一端與出液口連通,旁通管路與除氣裝置連接。
7、在某些實施方式中,除氣裝置包括密閉腔室,管路穿過密閉腔室,管路位于密閉腔室內(nèi)的部分,在密閉腔室處于負壓條件下,能夠允許管路內(nèi)液體中的氣體透出,以使管路內(nèi)的液體經(jīng)過密閉腔室后去除氣體。
8、在某些實施方式中,除氣裝置包括負壓裝置和排氣管路,排氣管路的一端與密閉腔室連通,負壓裝置設(shè)置在排氣管路上并且用于使密閉腔室內(nèi)產(chǎn)生負壓。
9、在某些實施方式中,除氣裝置包括位于負壓裝置和密閉腔室之間的檢測器,檢測器與排氣管路連通,檢測器用于通過排氣管路檢測密閉腔室內(nèi)的氣壓。
10、在某些實施方式中,除氣裝置包括設(shè)置在排氣管路上并位于檢測器與負壓裝置之間的多通閥,多通閥能夠使負壓裝置連通密閉腔室或大氣。
11、另一方面,本技術(shù)提供一種控制流體系統(tǒng)中的液體進行脫氣的方法,方法包括:
12、判斷除氣裝置是否正常;
13、在除氣裝置正常的情況下,控制管路內(nèi)的液體經(jīng)過除氣裝置進行脫氣。
14、在某些實施方式中,判斷除氣裝置是否正常,包括:
15、利用檢測器獲取密閉腔室內(nèi)的氣壓;
16、根據(jù)氣壓的變化判斷除氣裝置是否正常。
17、在某些實施方式中,根據(jù)氣壓的變化判斷除氣裝置是否正常,包括:
18、在初始時刻獲取密閉腔室內(nèi)的第一氣壓;
19、在預(yù)設(shè)時間間隔獲取密閉腔室內(nèi)的第二氣壓;
20、利用第一氣壓、第二氣壓和預(yù)設(shè)時間間隔計算得到氣壓變化速率;
21、將氣壓變化速率與預(yù)設(shè)變化速率進行比較,判斷除氣裝置是否正常。
22、在某些實施方式中,將氣壓變化速率與預(yù)設(shè)變化速率進行比較,判斷除氣裝置是否正常,包括:
23、在負壓裝置工作時,若氣壓變化速率大于或等于預(yù)設(shè)變化速率,則判斷除氣裝置正常;若氣壓變化速率小于預(yù)設(shè)變化速率,則判斷除氣裝置異常。
24、在某些實施方式中,將氣壓變化速率與預(yù)設(shè)變化速率進行比較,判斷除氣裝置是否正常,包括:
25、在負壓裝置停止工作時,若氣壓變化速率小于或等于預(yù)設(shè)變化速率,則判斷除氣裝置正常;若氣壓變化速率大于預(yù)設(shè)變化速率,則判斷除氣裝置異常。
26、在某些實施方式中,根據(jù)氣壓的變化判斷除氣裝置是否正常,包括:
27、在負壓裝置停止工作時,獲取氣壓為第一閾值時的第一時刻,并且獲取氣壓為第二閾值時的第二時刻,第二閾值大于第一閾值;
28、利用第一時刻和第二時刻計算得到時間差;
29、將時間差與預(yù)設(shè)時間差進行比較,判斷除氣裝置是否正常。
30、在某些實施方式中,將時間差與預(yù)設(shè)時間差進行比較,判斷除氣裝置是否正常,包括:
31、若時間差大于或等于預(yù)設(shè)時間差,則判斷除氣裝置正常;若時間差小于預(yù)設(shè)時間差,則判斷除氣裝置異常。
32、在某些實施方式中,根據(jù)氣壓的變化判斷除氣裝置是否正常,包括:
33、在負壓裝置停止工作時,記錄氣壓為第一閾值;
34、在氣壓為第二閾值時,啟動負壓裝置;
35、若氣壓在預(yù)設(shè)時間內(nèi)大于第一閾值,則判斷除氣裝置異常,若氣壓在預(yù)設(shè)時間內(nèi)小于或等于第一閾值,則判斷除氣裝置正常,第二閾值大于第一閾值。
36、在某些實施方式中,根據(jù)氣壓的變化判斷除氣裝置是否正常,包括:
37、在負壓裝置停止工作時,記錄氣壓為第一閾值;
38、在預(yù)設(shè)時間間隔的時刻,判斷密閉腔室內(nèi)的氣壓是否大于第一閾值;
39、若密閉腔室內(nèi)的氣壓大于第一閾值,則獲取氣壓的變化速率;
40、若氣壓的變化速率大于預(yù)設(shè)變化速率,則判斷除氣裝置異常;反之,判斷除氣裝置正常。
41、在某些實施方式中,方法還包括:
42、若除氣裝置正常,則啟動負壓裝置;
43、若除氣裝置異常,則不啟動負壓裝置。
44、在某些實施方式中,除氣裝置包括第一除氣裝置,第一管路與第一除氣裝置連接;
45、在除氣裝置正常的情況下,控制管路內(nèi)的液體經(jīng)過除氣裝置進行脫氣,包括:
46、控制第一管路內(nèi)的液體經(jīng)第一除氣裝置進行脫氣并使脫氣后的液體進入反應(yīng)裝置。
47、在某些實施方式中,除氣裝置包括第二除氣裝置,第二管路與第二除氣裝置連接;
48、在除氣裝置正常的情況下,控制管路內(nèi)的液體經(jīng)過除氣裝置進行脫氣,包括:
49、控制流出反應(yīng)裝置并進入第二管路內(nèi)的液體經(jīng)第二除氣裝置進行脫氣。
50、在某些實施方式中,除氣裝置包括第三除氣裝置,
51、管路包括旁通管路,旁通管路的一端與進液口連通,另一端與出液口連通,旁通管路與第三除氣裝置連接;
52、在除氣裝置正常的情況下,控制管路內(nèi)的液體經(jīng)過除氣裝置進行脫氣,包括:
53、控制流出反應(yīng)裝置的液體進入旁通管路,并使旁通管路內(nèi)的液體進入第三除氣裝置進行脫氣。
54、在某些實施方式中,方法還包括:
55、使旁通管路內(nèi)脫氣后的液體進入反應(yīng)裝置。
56、再一方面,本技術(shù)提供了一種測序系統(tǒng),包括上述流體系統(tǒng)。
57、此外,本技術(shù)還提供一種計算機存儲介質(zhì),當(dāng)計算機程序被處理器執(zhí)行時,使得處理器實現(xiàn)上述任一實施方式的方法。
58、本發(fā)明的附加方面和優(yōu)點將在下面的描述中部分給出,部分將從下面的描述中變得明顯,或通過本發(fā)明的實踐了解到。