本發(fā)明涉及分子診斷
技術(shù)領(lǐng)域:
,具體涉及一種有助于青光眼診斷的長(zhǎng)鏈非編碼rna標(biāo)志物、試劑盒及應(yīng)用。
背景技術(shù):
:眼睛是人體十分重要的感覺(jué)器官,能夠接受外部的光刺激,并將光沖動(dòng)傳送到大腦中樞而引起視覺(jué)。達(dá)芬奇曾說(shuō):“眼睛是心靈的窗戶,通過(guò)眼睛,人們得以擁抱和欣賞世界的無(wú)限美妙,靈魂才得以安居于體內(nèi)”。信息時(shí)代,人通過(guò)感覺(jué)器官?gòu)耐饨绔@得的信息中,大約90%是由眼睛來(lái)完成的。世界衛(wèi)生組織的資料顯示,眼科疾病已成為繼腫瘤、心血管疾病之后的第三位危害及影響人們生存質(zhì)量的疾病。在所有眼科疾病中,青光眼則是首位不可逆轉(zhuǎn)的致盲性眼病,其影響視覺(jué)質(zhì)量的原因是通過(guò)威脅和損害視神經(jīng)及其通路而導(dǎo)致失明,從而嚴(yán)重威脅人類(lèi)的視覺(jué)健康,給個(gè)人、家庭和社會(huì)造成難以估量的損失。青光眼造成的主要危害是影響視覺(jué)功能,即便是在發(fā)達(dá)國(guó)家中,也只有50%左右的青光眼患者能夠得到及時(shí)的診斷和治療,而且,青光眼的發(fā)病因素、遺傳學(xué)規(guī)律等均不明了,因此我們要科學(xué)地掌握其發(fā)生發(fā)展規(guī)律,從而進(jìn)行早期診斷和早期治療,避免青光眼患者的失明。目前,青光眼的診斷主要是依靠病史、形態(tài)學(xué)和功能學(xué)方面的檢查,如眼壓測(cè)量、超聲生物顯微鏡、眼底照相、光學(xué)相干斷層掃描和視野檢查等。雖然這些檢查可以診斷青光眼,但研究表明,通過(guò)形態(tài)學(xué)和功能學(xué)手段診斷的青光眼,患者視覺(jué)功能的損害已經(jīng)超過(guò)50%。而青光眼相關(guān)的生化檢查、血清學(xué)篩查及檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)仍處于相對(duì)空白狀態(tài),因此尋找一種高靈敏度和高特異性的標(biāo)志物對(duì)青光眼診斷和監(jiān)控尤為重要?;蚪M計(jì)劃研究表明,在組成人類(lèi)基因組的30億個(gè)堿基對(duì)中,僅有1.5%的核苷酸序列用于蛋白質(zhì)編碼,其余98.5%的基因組為非蛋白編碼序列。這些序列曾被認(rèn)為是在進(jìn)化過(guò)程中累積的“垃圾序列”而未予以關(guān)注,在隨后啟動(dòng)的人類(lèi)基因組dna元件百科全書(shū)(encyclopediaofdnaelements,encode)計(jì)劃中,研究表明75%的基因序列能夠被轉(zhuǎn)錄成rna,其中近74%的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為非編碼rna(non-codingrnas,ncrnas)。在ncrna中,序列長(zhǎng)度大于200個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄本為長(zhǎng)鏈非編碼rnas(longnoncodingrna,lncrnas),它們由于功能的豐富性及作用機(jī)制的多樣性而備受關(guān)注。lncrnas能夠在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后和翻譯多個(gè)層面上調(diào)節(jié)蛋白編碼基因的表達(dá),從而廣泛地參與包括細(xì)胞分化和機(jī)體發(fā)育在內(nèi)的重要生命過(guò)程,其異常表達(dá)還與人類(lèi)多種重大疾病的發(fā)生密切相關(guān)。lncrna具有高度保守性及組織特異性,在腦部含量非常豐富。lncrna不僅參與了神經(jīng)系統(tǒng)的生長(zhǎng)發(fā)育和功能完善,使神經(jīng)系統(tǒng)按照一定的時(shí)間順序和在一定的空間內(nèi)進(jìn)行生長(zhǎng)和發(fā)育,并且參與執(zhí)行神經(jīng)系統(tǒng)的功能。lncrna通過(guò)多種機(jī)制參與到神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育及功能執(zhí)行中,包括作為順式作用元件及反式作用因子參與基因印記、染色質(zhì)重塑、細(xì)胞周期調(diào)控、剪接調(diào)控、mrna降解和翻譯調(diào)控等過(guò)程。因此,利用檢測(cè)lncrnas的組成及表達(dá)水平的變化來(lái)反映神經(jīng)系統(tǒng)的生理及病理狀態(tài)是可行的手段。房水屬于眼內(nèi)容物,由睫狀體產(chǎn)生,經(jīng)過(guò)瞳孔、小梁網(wǎng)等最終進(jìn)入血液,且處于動(dòng)態(tài)循環(huán)之中,其成分構(gòu)成與眼球局部生理及病理環(huán)境密切相關(guān)。外泌體作為機(jī)體至關(guān)重要的細(xì)胞間相互交流的中介物質(zhì),包含了lncrnas、mrnas、蛋白質(zhì)及脂質(zhì)等。外泌體內(nèi)包含的物質(zhì)由于特殊保護(hù)機(jī)制能長(zhǎng)期保持穩(wěn)定狀態(tài)。因此,房水中的lncrnas等分子可以外泌體的形式傳遞細(xì)胞間的相互交流信息,并可隨房水的動(dòng)態(tài)循環(huán)進(jìn)入血液。因此青光眼相關(guān)的lncrnas研究具有為青光眼相關(guān)生物標(biāo)志物檢測(cè)提供理論基礎(chǔ)的潛能。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的之一是提供一種用于青光眼早期診斷的長(zhǎng)鏈非編碼rna,對(duì)青光眼的發(fā)病檢測(cè)有重要意義。用于青光眼早期診斷的分子標(biāo)記物lncrnasenst00000508241,其序列如seqidno:1所示。本發(fā)明的目的之二是提供上述分子標(biāo)記物lncrnasenst00000508241的應(yīng)用。檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的產(chǎn)品在制備青光眼早期診斷工具中的應(yīng)用。所述的檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的產(chǎn)品包括:通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的制劑。所述的通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的制劑包括特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物。用實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物序列為:f:5'tttgggtttggctgttactca3’r:5’gaccacatttcccaagaacact3’。本發(fā)明的目的之三是提供一種用于青光眼早期診斷的試劑盒,包含檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的試劑。具體是包含通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的試劑。所述的通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的試劑包含通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物。所述的通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr檢測(cè)lncrnasenst00000508241表達(dá)水平的試劑包含一對(duì)通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量pcr特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物,其引物序列為:f:5'tttgggtttggctgttactca3’r:5’gaccacatttcccaagaacact3’。申請(qǐng)人發(fā)現(xiàn)相對(duì)于對(duì)照組人群,lncrnas:enst00000508241在青光眼患者的房水中表達(dá)上調(diào)。提示enst00000508241是青光眼中的高表達(dá)lncrnas,是有助于青光眼診斷的生物標(biāo)志物。本發(fā)明為青光眼診斷提供了強(qiáng)有力的分子生物學(xué)基礎(chǔ),具有深遠(yuǎn)的臨床意義和推廣性。附圖說(shuō)明圖1為青光眼患者房水中l(wèi)ncrnas和mrnas表達(dá)譜;a:青光眼患者房水中l(wèi)ncrnas表達(dá)譜分析聚類(lèi)圖;b:青光眼患者房水中mrnas表達(dá)譜分析聚類(lèi)圖。圖2為青光眼患者房水中差異表達(dá)的lncrnas和mrnas;a:較年齡相關(guān)性白內(nèi)障而言,青光眼患者房水中2倍差異表達(dá)的lncrnas;b:較年齡相關(guān)性白內(nèi)障而言,青光眼患者房水中2倍差異表達(dá)的mrnas。圖3為青光眼患者房水中l(wèi)ncrnas和mrnas表達(dá)的cnc分析圖;紅色點(diǎn)代表lncrnas,藍(lán)色點(diǎn)代表mrnas,實(shí)線代表正相關(guān),虛線代表負(fù)相關(guān)。圖4為lncrnas在青光眼及年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者房水中的表達(dá)量;a-d為:lncrna:enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241在青光眼及年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者房水中表達(dá)的散點(diǎn)圖。圖5為利用lncrnas在房水中診斷青光眼的roc曲線;a-d為:lncrnaenst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241在房水樣本中診斷青光眼的roc曲線下面積分別為1.000、0.920、0.940和0.880。具體實(shí)施方式以下結(jié)合實(shí)施例旨在進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明,而非限制本發(fā)明。實(shí)施例1:青光眼患者房水中l(wèi)ncrnas及mrnas的表達(dá)譜:1.1材料與試劑1.1.1主要儀器常用離心機(jī)及低溫離心機(jī)購(gòu)自eppendorf公司;高速離心機(jī)購(gòu)自beckman公司;real-timepcr儀器購(gòu)自abi公司;移液器和電動(dòng)移液槍購(gòu)自eppendorf公司;q5000購(gòu)自quawelltechnology公司;制冰機(jī)購(gòu)自sanyan公司。1.1.2材料與試劑不同型號(hào)的離心管及pcr管均購(gòu)自axygen公司;depc水購(gòu)自鼎國(guó)昌盛公司;trizol購(gòu)自invitrogen公司;targetamptm1-roundarnaamplification試劑盒購(gòu)自epicentre公司;transcriptorfirststrandcdnasynthesis試劑盒購(gòu)自roche公司;quickamplabelingkit,one-color試劑盒購(gòu)自agilenttechnologies公司;人lncrnasmicroarray芯片購(gòu)自arraystar公司。1.1.3試劑配置各種免疫印跡所用試劑根據(jù)《分子克隆(第三版)》中提供的方法配置。1.2方法1.2.1房水樣本準(zhǔn)備該研究已通過(guò)中南大學(xué)湘雅二醫(yī)院倫理委員會(huì)審批。術(shù)前與所有研究對(duì)象簽署知情同意書(shū),在正式手術(shù)步驟開(kāi)始前利用1ml的一次性無(wú)菌注射器于角膜緣抽取未稀釋的房水標(biāo)本0.1ml,立即注入高壓滅菌的0.5mlep管中,置于-80℃低溫冰箱避光保存?zhèn)溆?。所有入選患者為在我院住院需要進(jìn)行手術(shù)治療的青光眼患者和年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者。納入標(biāo)準(zhǔn):1.原發(fā)性開(kāi)角型青光眼:a.眼壓>21mmhgb.青光眼性視盤(pán)損害和/rnfl缺損c.典型的青光眼性視野缺損d.前房角開(kāi)放。具有以上四項(xiàng)或具有其中的a,d,b或c者。2.正常眼壓性青光眼:具有類(lèi)似于poag的視盤(pán)改變,rnfl及視野損害,24h眼壓測(cè)量均≤21mmhg,房角開(kāi)放。3.原發(fā)性閉角型青光眼:具有青光眼的視盤(pán)改變,rnfl及視野損害,眼壓>21mmhg,前房角變窄或關(guān)閉4.年齡相關(guān)性白內(nèi)障(對(duì)照組):晶狀體呈皮質(zhì)性和/或核型渾濁和/或后囊下性混濁。排除標(biāo)準(zhǔn):1.伴發(fā)全身性疾病如高血壓和糖尿病等。2.繼發(fā)性青光眼3.可能影響視野、視神經(jīng)或色覺(jué)的眼科或神經(jīng)科疾病。4.視野檢測(cè)可靠性標(biāo)準(zhǔn):固視丟失率、假陽(yáng)性率和/或假陰性率>25%。5.年齡相關(guān)性白內(nèi)障:排除并發(fā)性、外傷性、先天性白內(nèi)障并排除伴有其他眼內(nèi)疾病者、排除過(guò)熟期病例。1.2.2rna提取取房水0.1ml加入0.5mltrizol試劑,劇烈震蕩后加入0.1毫升氯仿。而后經(jīng)離心、沉淀及75%乙醇清洗后溶于10微升dpec水,經(jīng)q5000儀器測(cè)量各管rna濃度。1.2.3rna擴(kuò)增使用targetamptm1-roundarnaamplificationkit103(epicentre)按生廠商說(shuō)明書(shū)所示步驟對(duì)rna進(jìn)行擴(kuò)增。大致步驟如下:首先根據(jù)rna樣本合成單成單鏈cdna:rna雜交產(chǎn)物,然后使用rnaseh酶將上述雜交產(chǎn)物消化為小片段序列,這些小片段序列可協(xié)助雙鏈cdna的合成。最后由雙鏈cdna轉(zhuǎn)錄合成反義rna。1.2.4cdna合成和標(biāo)記使用transcriptorfirststrandcdnasynthesiskit(roche)按生廠商說(shuō)明書(shū)所示步驟合成cdna。使用quickamplabelingkit,one-color(agilenttechnologies)對(duì)合成的cdna進(jìn)行標(biāo)記。1.2.5標(biāo)記效率質(zhì)量檢測(cè)取1.5微升已標(biāo)記的cdna樣本,使用nanodropnd-1000檢測(cè)熒光標(biāo)記效率。1.2.6芯片雜交在標(biāo)準(zhǔn)條件下將標(biāo)記好的探針和高密度芯片(humanlncrnamicroarrayv4.0,arraystar公司)進(jìn)行雜交。該芯片共檢測(cè)40173種lncrnas及20730種mrnas表達(dá)水平。1.2.7圖像采集和數(shù)據(jù)分析使用genepix4000b芯片掃描儀掃描芯片的熒光強(qiáng)度,并將實(shí)驗(yàn)結(jié)果轉(zhuǎn)換成數(shù)字型數(shù)據(jù)保存。p值<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。1.3結(jié)果1.3.1青光眼患者房水中l(wèi)ncrnas及mrnas的表達(dá)譜在10份青光眼患者房水樣本中平均檢測(cè)到20653±569.9種lncrnas和11265±268.3種mrnas。其中,10份青光眼患者房水樣本中均檢測(cè)到的lncrnas為11728種,均檢測(cè)到的mrnas為6686種。1.3.2青光眼患者房水中差異表達(dá)的lncrnas及mrnas較年齡相關(guān)性白內(nèi)障而言,青光眼患者房水中2倍上調(diào)表達(dá)的lncrnas為4372種,2倍下調(diào)表達(dá)的lncrnas為2602種。較年齡相關(guān)性白內(nèi)障而言,青光眼患者房水中2倍上調(diào)表達(dá)的mrnas為2783種,2倍下調(diào)表達(dá)的mrnas為1617種。1.4結(jié)果由于其易取性、個(gè)體特異性及相對(duì)受機(jī)體其他器官影響較小的特點(diǎn),房水是一種眼部疾病生物標(biāo)志物相關(guān)研究的價(jià)值較大的研究對(duì)象。并且,盡管目前已有多種研究報(bào)道青光眼相關(guān)的流行病學(xué)及遺傳學(xué)危險(xiǎn)因素,但以房水為研究對(duì)象的相關(guān)研究相對(duì)較少。因此,我們認(rèn)為房水具有應(yīng)用于今后青光眼相關(guān)遺傳學(xué)研究的潛能。由于取樣的限制,人源性房水樣本體積較小。為克服該問(wèn)題,我們?cè)谶M(jìn)行芯片雜交前增加rna擴(kuò)增步驟,如此以保證后續(xù)步驟的順利進(jìn)行。通過(guò)使用lncrnas芯片微陣列分析方法,11728種lncrnas及6686種mrnas在10份青光眼房水樣本中均檢測(cè)到,這與年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者房水中l(wèi)ncrnas和mrnas表達(dá)譜具有顯著差異,因此房水中l(wèi)ncrnas和mrnas表達(dá)譜表現(xiàn)出個(gè)體特異性及疾病特異性。就我們所知,這是第一個(gè)青光眼房水相關(guān)lncrnas和mrnas表達(dá)譜研究。實(shí)施例2:通過(guò)cnc分析明確房水中特定lncrnas與mrnas的相關(guān)性為進(jìn)一步探討青光眼患者房水中表達(dá)的lncrnas的可能功能,我們運(yùn)用cnc(coding-noncodinggeneco-expression)分析明確與青光眼相關(guān)基因的mrnas表達(dá)具有顯著相關(guān)性的lncrnas。cns分析是一種通過(guò)lncrna和mrna共表達(dá)數(shù)據(jù),將lncrna與mrna聯(lián)系起來(lái)的分析方法。通過(guò)cnc分析可以發(fā)現(xiàn)與某個(gè)lncrna具有相同表達(dá)模式的mrna,通過(guò)這些mrna的功能,可以將lncrna與特定信號(hào)通路或疾病狀況聯(lián)系起來(lái),從而便于預(yù)測(cè)lncrna的功能,并揭示其作用機(jī)制。2.1方法挑選房水中差異表達(dá)并且與青光眼發(fā)生發(fā)展具有相關(guān)性的mrnas,將這些mrnas在不同青光眼患者房水中的表達(dá)數(shù)據(jù)求平均值;求挑選出的mrnas標(biāo)準(zhǔn)化之后的數(shù)據(jù)與青光眼患者房水中差異表達(dá)的lncrnas相關(guān)數(shù)據(jù)之間的皮爾遜相關(guān)系數(shù)(pearsoncorrelationcoefficient,pcc)與錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(falsediscoveryrate,fdr);挑選出pcc≥0.90并且fdr≤0.05的記錄;使用相關(guān)記錄,利用cytoscape2.8.3工具繪圖。2.2結(jié)果較年齡相關(guān)性白內(nèi)障而言,在青光眼患者房水中差異表達(dá)且與青光眼發(fā)生發(fā)展具有相關(guān)性的mrnas為如下十種:骨形態(tài)生成蛋白2(bonemorphogeneticprotein2,bmp2)、室管膜相關(guān)基因1(ependyminrelated1,epdr1)、轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β1(transforminggrowthfactorbeta1,tgfb1)、叉頭蛋白e3(forkheadboxe3,foxe3)、生長(zhǎng)激素促分泌素受體(growthhormonesecretagoguereceptor,ghsr)、叉頭蛋白c1(forkheadboxc1,foxc1)、跨膜及卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域1(transmembraneandcoiled-coildomains1,tmco1)、ph結(jié)構(gòu)域a7(pleckstrinhomologydomaincontaininga7,plekha7)、視神經(jīng)蛋白(optineurin,optn)和整合素亞基β5(integrinsubunitbeta5,itgb5)。在青光眼患者房水中,與這些mrnas表達(dá)的皮爾遜相關(guān)系數(shù)大于0.9并且錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率小于0.05的lncrnas有10種。實(shí)施例3我們利用qrt-pcr在青光眼及年齡相關(guān)白內(nèi)障患者房水中驗(yàn)證實(shí)施例2中的10種lncrnas中,7種lncrnas在兩類(lèi)房水中的差異表達(dá)量具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,3種lncrnas在兩類(lèi)房水中的差異表達(dá)量無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。然后選取具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的lncrna:enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。實(shí)施例4我們運(yùn)用qrt-pcr檢測(cè)方法驗(yàn)證lncrna:enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241分子在房水中的表達(dá)水平,并分析其在青光眼患者和對(duì)照組人群中表達(dá)量的差異。4.1材料與試劑4.1.1主要儀器常用離心機(jī)及低溫離心機(jī)購(gòu)自eppendorf公司;高速離心機(jī)購(gòu)自beckman公司;real-timepcr儀器購(gòu)自abi公司;移液器和電動(dòng)移液槍購(gòu)自eppendorf公司;q5000購(gòu)自quawelltechnology公司;制冰機(jī)購(gòu)自sanyan公司。4.1.2材料與試劑不同型號(hào)的離心管及pcr管均購(gòu)自axygen公司;depc水購(gòu)自鼎國(guó)昌盛公司;trizol購(gòu)自invitrogen公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和熒光定量試劑盒均購(gòu)自roche公司。4.1.3試劑配置各種免疫印跡所用試劑根據(jù)《分子克隆(第三版)》中提供的方法配置。4.2方法4.2.1房水樣本準(zhǔn)備房水樣本按1.2.1所述步驟準(zhǔn)備。4.2.2rna提取0.1毫升房水加入0.5毫升trizol試劑,劇烈震蕩后加入0.1毫升氯仿。而后經(jīng)離心、沉淀及75%乙醇清洗后溶于20微升dpec水,經(jīng)q5000儀器測(cè)量各孔rna濃度。4.2.3qrt-pcr根據(jù)生廠商說(shuō)明書(shū)首先依賴反轉(zhuǎn)錄酶將rna反轉(zhuǎn)錄成cdna,然后用pcr方法擴(kuò)增cdna,通過(guò)測(cè)定熒光強(qiáng)度信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)定量擴(kuò)增的產(chǎn)物量。4.2.2數(shù)據(jù)分析采用spss19.0版統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。計(jì)量資料以中位數(shù)±四分位數(shù)間距表示,青光眼/白內(nèi)障代表兩組中位數(shù)比值,比較進(jìn)行mann-whitneyu檢驗(yàn)。p值<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。4.3結(jié)果為進(jìn)一步擴(kuò)大房水樣本量驗(yàn)證相關(guān)lncrnas的表達(dá)水平并且探究特定lncrnas在青光眼患者房水中的表達(dá)量,我們利用qrt-pcr檢測(cè)20個(gè)房水樣本(10個(gè)青光眼患者房水樣本,10個(gè)年齡與性別匹配的年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者房水標(biāo)本)中enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241表達(dá)水平。結(jié)果表明,在兩類(lèi)房水樣本中,enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241的表達(dá)量均有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,其在青光眼患者房水中表達(dá)量依次為在年齡相關(guān)性白內(nèi)障患者房水中表達(dá)量的1.6200、1.9500、1.9302和1.8378倍(表1)(圖4)。為進(jìn)一步了解enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241在房水中診斷青光眼的有效性,我們利用所得數(shù)據(jù)繪制受試者工作特征(receiveroperatingcharacteristic,roc)曲線(圖5)。發(fā)現(xiàn)enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241在房水樣本中診斷青光眼的roc曲線下面積分別為1.000、0.920、0.940和0.880。當(dāng)enst00000564363、nr_026887、tcons_00025577和enst00000508241在房水中的診斷值設(shè)為0.0068、0.0056、0.0074和0.0048時(shí),其診斷的敏感性/特異性依次為1.000/1.000、0.900/0.900、0.900/0.900和0.800/0.800(表2)。表1lncrnas在房水中的表達(dá)量lncrnas青光眼組白內(nèi)障組青光眼/白內(nèi)障p值enst000005643630.0081±0.00200.0050±0.00131.62000.001nr_0268870.0078±0.00210.0040±0.00151.95000.001tcons_000255770.0083±0.00500.0043±0.00181.93020.001enst000005082410.0068±0.00270.0037±0.00171.83780.004表2lncrnas在房水中診斷青光眼的敏感性和特異性sequencelisting<110>中南大學(xué)<120>青光眼診斷分子標(biāo)記物lncrnasenst00000508241、試劑盒及應(yīng)用<130>無(wú)<160>3<170>patentinversion3.3<210>1<211>540<212>dna<213>lncrna:enst00000508241的序列<400>1aaggtacactctactatgtatgcacagccacagaaaaatcatagtgtgtacattgcttga60atgatccttttgggtttggctgttactcacagatgaaggagacatttccaaggttgtaac120cagagtcattctaagcacagtccttgcagcagtagagacaatcccaatgactacaggaaa180tcctcaactctcatccagaacctgtaagctcaggacatgcatcataggaaggatgtgaat240tgctgaagtgcttccatggtagtcttttgctccctgcctacgtgggcaagaagctgtaga300ctctgggataatttggacgatcccagcacgggtatactccactctgcttcatggcactta360ccaaggctggagagagaccacacccatcccttctgttttccattgcattcccttccccaa420actttccatccagaaattcttctttggttgaccctgccacattgtatattcttgttctcc480ccccatgatgcattttatttcagtatccttagattcctaataaatcaattatttaaacat540<210>2<211>21<212>dna<213>特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物序列f<400>2tttgggtttggctgttactca21<210>3<211>22<212>dna<213>特異性擴(kuò)增lncrnasenst00000508241的引物序列r<400>3gaccacatttcccaagaacact22當(dāng)前第1頁(yè)12