本發(fā)明涉及一種對蝦過氧化物還原酶的基因序列,更具體涉及斑節(jié)對蝦過氧化物還原酶1編碼基因序列及其用途。
背景技術(shù):
對蝦只能依靠先天免疫作為第一道防線來防止入侵病原微生物和環(huán)境毒性應(yīng)激;過氧化物還原酶可用于對蝦的先天免疫反應(yīng)。過氧化物還原酶是普遍存在的、分子量為20-30kda的、豐富的、多功能的和進(jìn)化上保守的抗氧化酶家族。過氧化物還原酶主要通過清除過氧化物以保護(hù)細(xì)胞免受活性氧引起的氧化損傷。此外,過氧化物還原酶在免疫反應(yīng),分子伴侶,細(xì)胞內(nèi)氧化還原信號轉(zhuǎn)導(dǎo),細(xì)胞增殖,分化和凋亡,dna突變,腫瘤,癌癥,nk細(xì)胞活性增強(qiáng)等方面也起重要作用。
過氧化物還原酶1(prx1)屬于過氧化物還原酶家族中重要的一員,在各個(gè)門類中都發(fā)揮重要作用。斑節(jié)對蝦prx1的cdna是從斑節(jié)對蝦中分離出序列。斑節(jié)對蝦prx1cdna編碼198個(gè)氨基酸多肽,具有951個(gè)堿基對(bp)。斑節(jié)對蝦prx1蛋白有保守的過氧化物還原酶結(jié)構(gòu)域和過氧化物酶催化中心。從系統(tǒng)發(fā)育分析和序列圖中可以看出,斑節(jié)對蝦prx1在對蝦過氧化物還原酶家族中屬于典型的2-cys過氧化物還原酶成員,和過氧化物具有較強(qiáng)的親和性質(zhì)。對于轉(zhuǎn)錄水平,斑節(jié)對蝦prx1的mrna在各組織中被普遍檢測到,表明其在對蝦生理過程中起關(guān)鍵作用。科學(xué)研究還表明,斑節(jié)對蝦prx1在消除由病毒或細(xì)菌感染介導(dǎo)的免疫反應(yīng)和炎癥過程中起著關(guān)鍵作用(wangetal.,2015)。
本研究提供了斑節(jié)對蝦prx1基因在對蝦中具有應(yīng)對各種毒物因子的有用信息,有助于進(jìn)一步探索斑節(jié)對蝦prx1的功能機(jī)制,可作為應(yīng)用于生態(tài)毒理學(xué)的新型分子生物標(biāo)志物,或作為蝦類抗病或增強(qiáng)蝦類免疫力藥物使用,有助于了解多種生理活動(dòng)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的第一個(gè)目的是提供一種斑節(jié)對蝦prx1的cdna。
本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供一種由上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna編碼的氨基酸序列。
本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供一種含有上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna的表達(dá)載體。
本發(fā)明的第四個(gè)目的是提供一種制備斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的方法。
本發(fā)明的第五個(gè)目的是提供一種檢測由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的活性的方法。
本發(fā)明的第六個(gè)目的是提供一種檢測由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白對提高對蝦免疫力和成活率的效果的方法。
本發(fā)明的第一個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種斑節(jié)對蝦prx1的cdna,其特征在于:其核苷酸序列如seqidno.1所示。
本發(fā)明上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna,其具體通過如下方法獲得:根據(jù)已構(gòu)建的cdna文庫篩選斑節(jié)對蝦prx1的est序列,在對目的基因的est序列進(jìn)行驗(yàn)證后,設(shè)計(jì)pcr引物。利用cdna末端快速擴(kuò)增(rapidamplificationofcdnaends,race)技術(shù)對目的基因的3ˊ和5ˊ末端進(jìn)行pcr擴(kuò)增獲得斑節(jié)對蝦prx1基因的全長序列。來自斑節(jié)對蝦的prx1的全長cdna序列為951bp,含有43bp的5'-非翻譯區(qū)(utr),314bp的3'-utr,具有poly(a)尾巴。開放閱讀框(orf)為594bp,編碼198個(gè)氨基酸,分子量22kda,pi為5.3。在所有實(shí)驗(yàn)組織中,斑節(jié)對蝦prx1mrna中被普遍檢測到,表明在生理過程中起持續(xù)起作用。我們選擇鰓和肝胰腺作為目標(biāo)組織,用細(xì)菌刺激(哈維氏弧菌和無乳鏈球菌)及環(huán)境毒性應(yīng)激(重金屬,滲透壓和酸堿度應(yīng)激)處理后,結(jié)果顯示該基因在免疫器官中表達(dá)量明顯升高,并被外源刺激誘導(dǎo)表達(dá),預(yù)示在斑節(jié)對蝦抗菌及抗應(yīng)激等生理過程中起重要作用。
本發(fā)明的第二個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種由上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna編碼的氨基酸序列,其特征在于:如seqidno.2所示。
本發(fā)明的第三個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種含有上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna的表達(dá)載體,其特征在于:所述的表達(dá)載體包含上述斑節(jié)對蝦prx1的orf序列。
本發(fā)明的第四個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種制備斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的方法,其特征在于包括:使用上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化寄主細(xì)胞、培養(yǎng)轉(zhuǎn)化體、純化獲得重組的斑節(jié)對蝦prx1蛋白,所述的寄主細(xì)胞為原核或真核細(xì)胞。
優(yōu)選地,所述的寄主細(xì)胞為大腸桿菌bl21(de3)。
本發(fā)明的第五個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種檢測由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的活性的方法,其特征在于:在體外對由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的抗氧化酶活性進(jìn)行測定,并利用瓊脂糖擴(kuò)散法檢測重組的對蝦prx1結(jié)合蛋白的抑菌效果。
本發(fā)明的第六個(gè)目的是通過如下技術(shù)方案來實(shí)現(xiàn)的:
一種檢測由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白對提高對蝦免疫力和成活率的效果的方法,其特征在于包括以下步驟:
步驟1:將斑節(jié)對蝦分為實(shí)驗(yàn)組和對照組,向所述的實(shí)驗(yàn)組中的斑節(jié)對蝦注射由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白;所述的對照組不作任何處理;
步驟2:對實(shí)驗(yàn)組和對照組的斑節(jié)對蝦進(jìn)行細(xì)菌刺激和環(huán)境毒性應(yīng)激處理后,進(jìn)行死亡率統(tǒng)計(jì);所述的細(xì)菌刺激中的細(xì)菌包括哈維氏弧菌和無乳鏈球菌;所述的環(huán)境毒性應(yīng)激包括重金屬,滲透壓和酸堿度應(yīng)激。
通過比較實(shí)驗(yàn)組和對照組的死亡率,可以確定由上述方法制備而成的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白在抗逆過程中的實(shí)際效果。
有益效果:
本發(fā)明從對蝦樣品中得到一個(gè)新的斑節(jié)對蝦prx1的cdna序列,通過基因工程技術(shù)對其功能研究,發(fā)現(xiàn)該序列在真核或原核細(xì)胞中可以高效表達(dá);本發(fā)明還將上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna序列克隆到原核或真核表達(dá)載體上,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,通過陽性克隆子的誘導(dǎo)表達(dá)得到其重組蛋白,研究其性質(zhì)發(fā)現(xiàn),斑節(jié)對蝦prx1基因在免疫組織中特異性高表達(dá),并受外源毒性刺激后通過上調(diào)或者下調(diào),其重組純化蛋白對細(xì)菌具有抑制生長作用,在斑節(jié)對蝦活體注射實(shí)驗(yàn)中亦發(fā)現(xiàn)其可以降低有害刺激所引發(fā)的死亡率升高現(xiàn)象,揭示其可以作為蝦類抗菌或增強(qiáng)蝦類免疫力藥物使用。
附圖說明
圖1顯示斑節(jié)對蝦prx1的blastp結(jié)果,含有thioredoxin(trx)-likesuperfamily家族中typical2-cysprxsubfamily結(jié)構(gòu)域;
圖2斑節(jié)對蝦prx1的核苷酸和推導(dǎo)的氨基酸序列;每行的數(shù)字表示核苷酸或氨基酸的位置;起始密碼子(atg)和終止子密碼子(taa)被框著;硫氧還蛋白超家族信號區(qū)標(biāo)注為灰色;氧化還原活性位點(diǎn)標(biāo)為成綠色;兩個(gè)活性半胱氨酸標(biāo)為紅色(被三角形圈起),聚腺苷酸化信號序列(aataaa)是粗體,poly(a)信號序列是斜體;
圖3是通過實(shí)時(shí)定量pcr檢測不同組織中斑節(jié)對蝦prx1的相對表達(dá)水平,ef-1α被選為內(nèi)參基因;
圖4a經(jīng)細(xì)菌刺激(哈維氏弧菌和無乳鏈球菌)后,斑節(jié)對蝦prx1在鰓中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖4b經(jīng)細(xì)菌刺激(哈維氏弧菌和無乳鏈球菌)后,斑節(jié)對蝦prx1在肝胰腺中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖5a經(jīng)銅、鋅、鉻刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在鰓中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖5b經(jīng)銅、鋅、鉻刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在肝胰腺中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖6a經(jīng)高、低鹽刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在鰓中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖6b經(jīng)高、低鹽刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在肝胰腺中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖7a經(jīng)不同ph(ph=7,ph=9)刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在鰓中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖7b經(jīng)不同ph(ph=7,ph=9)刺激后,斑節(jié)對蝦prx1在肝胰腺中表達(dá)分布特征,ef-1α被選為內(nèi)參基因,*代表p<0.05,**代表p<0.01;
圖8斑節(jié)對蝦prx1基因在大腸桿菌中的融合表達(dá)蛋白,其中:m:蛋白marker;1.prset空載體的e.colibl21菌株,iptg誘導(dǎo)表達(dá);2-4.prset-pmprx1的e.colibl21重組菌株,iptg誘導(dǎo)表達(dá),誘導(dǎo)時(shí)間分別為:0小時(shí),2小時(shí),6小時(shí),8小時(shí);圖a是其sds-page結(jié)果,圖b為其westernblot結(jié)果;
圖9ni-nta樹脂親和純化的斑節(jié)對蝦prx1原核表達(dá)蛋白,其中m:蛋白marker;1-2.ni-nta樹脂親和純化的prset-pmprx1,分別為第一收集管,第二收集管;
圖10重組斑節(jié)對蝦prx1的抗氧化活性檢測實(shí)驗(yàn),通過催化過氧化氫反應(yīng)的方法測定;
圖11斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白的體外對細(xì)菌的抗菌效果檢測。
圖12示出了斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白注射組死亡率明顯低于pbs注射組。
具體實(shí)施方式
下面通過以下具體實(shí)施方式對本發(fā)明作進(jìn)一步闡述,但是本發(fā)明的內(nèi)容完全不局限于此。
1.總rna的提取和全長cdna文庫構(gòu)建
1.1總rna的提取
鮮活健康斑節(jié)對蝦(體重約30g)在我們南海水產(chǎn)研究所的深圳實(shí)驗(yàn)基地內(nèi)暫養(yǎng)7d后(水溫約25±1℃,氣泵充氣,鹽度:3.3%),解剖蝦體取出各組織約100mg,放入1mlrnalater(ambion,ca,usa)中,根據(jù)試劑說明,使用trizol試劑(invitrogen,shanghai,china)從解剖組織(約50mg)中純化總rna。通過260/280nm處的uv吸光度比(nanodrop-2000,thermofisher,usa)檢測rna的質(zhì)量,并得到其濃度,同時(shí)通過1.2%瓊脂糖凝膠電泳測量質(zhì)量。
1.2總rna的提取,全長cdna模板的制備
根據(jù)primescripttmreversetranscriptase試劑盒(takara,dalian,china)的說明書,用1μg總rna合成第一條cdna,在42℃,反應(yīng)2分鐘。取以上反應(yīng)液進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),37℃,40分鐘,85℃,5秒,取出將母液于-80℃保存?zhèn)溆?,普通pcr工作液濃度70ng/μl備用,定量pcr工作液濃度30ng/μl備用,放-20℃進(jìn)行使用。
2.斑節(jié)對蝦prx1基因cdna全序列的克隆
2.1est序列驗(yàn)證
從之前構(gòu)建的cdna文庫中篩選斑節(jié)對蝦prx1的est序列。使用pmprx1-f5'-atgagcaacactgttccagc-3’和pmprx1-r5'-caatagctggaacagtgttgc-3’引物驗(yàn)證est序列。
以上述合成的cdna作為模板,用進(jìn)行pcr擴(kuò)增,反應(yīng)體系為:超純水17μl,cdna模版1μl,10mmol/ldntp2μl,10nmol/l引物f和r各1μl,extaq酶0.5μl,10xextaqbuffer2.5μl,共25μl。反應(yīng)條件為:94℃變性3min;33個(gè)循環(huán):94℃高溫變性30s,56℃低溫退火30s,72℃延伸1:30min;72℃延伸10min;4℃保溫。所擴(kuò)增的pcr產(chǎn)物用1.2%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測,從凝膠中純化回收目的產(chǎn)物。然后將純化的pcr產(chǎn)物克隆到puc-19t載體中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh-5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆單菌株,220rpm,搖6h,提質(zhì)粒,并用m13通用引物進(jìn)行測序。
2.2斑節(jié)對蝦prx1全長cdna的獲得
根據(jù)已驗(yàn)證的est序列片段設(shè)計(jì)特異性引物。利用cdna末端快速擴(kuò)增(rapidamplificationofcdnaends,race)技術(shù)對目的基因的3’末端進(jìn)行pcr擴(kuò)增。
依據(jù)序列合成3’-race引物:一擴(kuò)引物5’-gcagaatctccgtcaggtaacaat-3’和2擴(kuò)引物5’-agtatgccctgctggctggaaacc-3’,采用上述合成的全長cdna為模板,采用touchdownpcr和nestpcr的方法,按照
2.3斑節(jié)對蝦prx1的生物信息學(xué)分析
表1-斑節(jié)對蝦prx1的blast分析結(jié)果
用blast(http://www.ncbi.nim.nih.gov/)進(jìn)行同源性分析,結(jié)果上表1所示,該基因與印度明對蝦、日本囊對蝦、凡納濱對蝦等的prx1蛋白有高度同源性,揭示該基因是prx1基因。利用dnastar等工具進(jìn)行生物信息學(xué)分析,揭示起始密碼atg位于44-46核苷酸,終止密碼子位于637-639核苷酸,開放讀碼框?yàn)?94個(gè)核苷酸,推測編碼一個(gè)198個(gè)氨基酸的蛋白(圖2)。5’utr為43bp,3’utr為314bp,3’utr存在典型的加尾信號aataaa(圖2)。預(yù)測分子質(zhì)量22kda和理論pi值為5.3。利用expasy軟件和signalip軟件分析該蛋白顯示,斑節(jié)對蝦prx1蛋白序列屬于硫氧還蛋白超家族,具有從第六個(gè)氨基酸到第164個(gè)的trx折疊結(jié)構(gòu)域。它含有兩個(gè)高度保守的半胱氨酸殘基,一個(gè)氧化還原活性位點(diǎn)(tfvcpt),兩個(gè)prx特征基序(fypldftfvcptei和gevcpa)和兩個(gè)活性半胱氨酸(cys51和cys172)(圖1),但斑節(jié)對蝦prx1缺乏信號肽。
3.pcr檢測斑節(jié)對蝦prx1在斑節(jié)對蝦不同組織的分布
提取了雌雄斑節(jié)對蝦的不同組織(包括卵巢,心臟,肝胰臟,腸,腦,胸神經(jīng),肌肉,鰓,胃,淋巴)的rna。總rna的提取方法見前所述。
pcr反應(yīng)使用定量引物qpmprx1-f(5’-taccctttggatttcacctttgtc-3’)和qpmprx1-r(5’-attgattgttacctgacggagatt-3’)擴(kuò)增斑節(jié)對蝦prx1基因,看家基因ef-1α(genbank:dq021452.1)(ef-f5’-atggttgtcaactttgcccc-3’,ef-r5’-ttgacctccttgatcacacc-3’)作為內(nèi)參,以上述合成的cdna作為模板。反應(yīng)總體系為12.5μl,含有6.25μl的2×sybrpre-mixextaq(takara,dalian,china),1μlcdna模板,0.5μl30mmol/l的每個(gè)正向和反向引物,以及4.25μl去離子水。pcr反應(yīng)條件設(shè)定為94℃,30s,然后40個(gè)循環(huán):94℃,5s,60℃,30s,72℃,30s。溶解曲線分析為65-95℃,以確保每個(gè)單一產(chǎn)物的擴(kuò)增。通過2-δδct方法分析斑節(jié)對蝦prx1的相對表達(dá)水平。
4.pcr檢測斑節(jié)對蝦prx1的mrna在不同免疫刺激條件下的表達(dá)
現(xiàn)在,病原體和環(huán)境毒性刺激都嚴(yán)重威脅著全球?qū)ξr養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。這其中,包括哈維氏弧菌,無乳鏈球菌病害,以及重金屬,高低ph,高鹽低鹽脅迫。細(xì)菌免疫或環(huán)境脅迫通常會引起吞噬作用,誘導(dǎo)活性氧(ros)的產(chǎn)生。只能依賴先天免疫的甲殼動(dòng)物已發(fā)展出保護(hù)性抗氧化系統(tǒng),其中的過氧化物酶(prx)是最后發(fā)現(xiàn)的,具有免疫功能的基因,prx誘導(dǎo)表達(dá)的基因往往被認(rèn)為參加了宿主抗菌的天然免疫過程。為確認(rèn)斑節(jié)對蝦prx1是否參與這一過程,進(jìn)行了相應(yīng)菌和環(huán)境毒性物質(zhì)刺激表達(dá)實(shí)驗(yàn)。
健康斑節(jié)對蝦按照100μl1×108cfu/ml密度的哈維氏弧菌,無乳鏈球菌,對照組注射100μlpbs緩沖液(nacl137mm,kcl2.7mm,na2hpo410mm,kh2po42mm,ph7.4)血液注射。注射后0,6,12,24,48,72和96h取鰓和肝胰腺,剪碎后置于rnalater中保存。此外,我們分別配置0.18mg/l銅,0.506mg/l鋅和7.73mg/l鎘,ph7.0±0.1,ph9.0±0.1,鹽度為2.3%,4.3%的海水,然后將健康的斑節(jié)對蝦放入其中進(jìn)行浸泡,并以正常海水中的對蝦為對照組,重金屬和酸堿度實(shí)驗(yàn)分別于0,6,12,24,48,和96h取鰓和肝胰腺,高鹽低鹽實(shí)驗(yàn)于0,4,8,16,和32h取鰓和肝胰腺,剪碎后置于rnalater中保存,并帶回實(shí)驗(yàn)室分析。
總rna抽提方法和cdna逆轉(zhuǎn)錄方法見前所述。根據(jù)斑節(jié)對蝦prx1基因的全cdna設(shè)計(jì)熒光定量pcr引物見前所述,同時(shí)選用ef-1α作為內(nèi)參基因。定量體系以及反應(yīng)程序都如前所述。結(jié)果見附圖4a-圖5b,斑節(jié)對蝦prx1在注射后有顯著的上調(diào)或者下調(diào),表達(dá)量顯著異于對照組,說明斑節(jié)對蝦prx1受免疫刺激后參與此免疫過程,是免疫應(yīng)答表達(dá)蛋白。
5.斑節(jié)對蝦prx1融合蛋白的制備
通過pcr(rpmprx1-f5’-cgacgatgacgataaggatccatgagcaacactgttccagc-3’,rpmprx1-r5’-gttagcagccggatcaagcttcaatagctggaacagtgttgc-3’;)擴(kuò)增整個(gè)斑節(jié)對蝦prx1編碼區(qū),并克隆到prset質(zhì)粒中。將重組質(zhì)粒prset-pmprx1轉(zhuǎn)化到大腸桿菌bl21(de3)菌株中。只有prset的轉(zhuǎn)化體也轉(zhuǎn)化到用作對照組的大腸桿菌bl21(de3)菌株中。將兩種大腸桿菌bl21細(xì)胞在含有100μg/ml氨芐青霉素的luria-bertani(lb)培養(yǎng)基中培養(yǎng),直至大腸桿菌bl21細(xì)胞溶液的od600達(dá)到0.4~0.6。當(dāng)將1mm異丙基-β-d-硫代吡喃半乳糖苷(iptg)以終濃度為1mol/l加入lb培養(yǎng)基中時(shí),在37℃,220rpm下誘導(dǎo)細(xì)胞8h。根據(jù)his-bindingpurificationkit說明書(novagen),通過ni-nta親和層析純化重組斑節(jié)對蝦prx1蛋白。通過sds-page和westernblot對純化蛋白進(jìn)行驗(yàn)證,于29kda左右處有明顯條帶,去除由載體添加的6×his標(biāo)簽融合蛋白,和我們所預(yù)測的斑節(jié)對蝦prx1蛋白為22kda結(jié)果一致。所得斑節(jié)對蝦prx1蛋白的濃度使用改良的bca蛋白測定試劑盒(sangonbiotech,shanghai,china)。我們將純化的重組斑節(jié)對蝦prx1蛋白儲存在-80℃下為進(jìn)一步使用。
6.斑節(jié)對蝦prx1基因編碼蛋白的抗氧化酶活性檢測和抗菌活性測定
我們利用過氧化物酶催化過氧化氫反應(yīng)的原理,通過測定420nm處吸光度的變化得出酶活性的大小。根據(jù)過氧化物測試盒說明書(南京建城生物工程研究所,南京,中國),按要求加入指定試劑和蛋白,37℃下準(zhǔn)確反應(yīng)半小時(shí)后,加入顯色試劑,3500rpm,10min,將樣品冷卻至測量溫度,測試od420nm處的吸光度,根據(jù)說明書,計(jì)算pmprx1蛋白的酶活性大小。其一,我們選擇對蝦的生長低溫20℃和生長高溫37℃作為不同反應(yīng)條件,進(jìn)行了斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白酶活測定試驗(yàn),顯示斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白是溫度依賴型蛋白,隨溫度升高,酶活性升高。其二,我們進(jìn)行了不同斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白劑量的測定,即每個(gè)體系中分別加入10μg,20μgpmprx1蛋白,在37℃溫度下進(jìn)行測定,結(jié)果顯示,該蛋白為劑量依賴性蛋白(圖10)。
通過瓊脂擴(kuò)散試驗(yàn)檢測重組prset-pmprx1蛋白體外抑菌活性。具體步驟為:取哈維氏弧菌和無乳鏈球菌菌種,涂布在營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基平板上,37℃培養(yǎng)
7.斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白在斑節(jié)對蝦活體中的抗菌功能研究
為了進(jìn)一步確定斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白在斑節(jié)對蝦活體中對于哈維氏弧菌及無乳鏈球菌的抗菌效果,進(jìn)行如下實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)用斑節(jié)對蝦分成四組每組25尾.第一組及第二組作為對照組在注射50ul滅菌的磷酸鹽緩沖鹽水(pbs,ph7.4)12小時(shí)后分別注射50ul哈氏弧菌懸液(0.5*109cfu/ml)或50ul無乳鏈球菌懸液(0.5*109cfu/ml);第三組、第四組作為實(shí)驗(yàn)組在注射20ul的斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白(5μg/g)12小時(shí)后,分別注射50ul哈氏弧菌懸液(0.5*109cfu/ml)或50ul無乳鏈球菌懸液(0.5*109cfu/ml)。分別于12h,24h,48h,72h和96h后記錄死亡情況。結(jié)果顯示,斑節(jié)對蝦prx1重組蛋白注射組死亡率明顯低于pbs注射組(圖12)。
上述實(shí)施例為本發(fā)明較佳的實(shí)施方式,但本發(fā)明的實(shí)施方式并不受上述實(shí)施例的限制,其他的任何未背離本發(fā)明的精神實(shí)質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡化,均應(yīng)為等效的置換方式,都包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍。
sequencelisting
<110>中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所
<120>斑節(jié)對蝦過氧化物還原酶1編碼基因序列及其用途
<130>002
<160>2
<170>bissap1.3.6
<210>1
<211>951
<212>dna
<213>artificialsequence
<220>
<223>斑節(jié)對蝦prx1的cdna的核苷酸序列
<400>1
ggcacgagggtcgttgagacaagagaataccaagaccaccaccatgagcaacactgttcc60
agctattggcaaacctgcccctgtcttcaagggcactgctgttgttgatgggcagttcaa120
ggagatctccctggaagattacaagggcaaatatgtcattttcttcttctaccctttgga180
tttcacctttgtctgccccactgaaattatcgccttctctgaccgtgttgaagaattcag240
gaaaattggatgcgaagtggttgcttgctctacagactcccacttctcccaccttgcttg300
gatcaacactccccgcaaggaaggtggtcttggtacgatgaagatccctcttctggctga360
caagtcaatggaagttgcaaaggcttacggagtccttaaggaggatgaaggcattgcttt420
cagaggcctctttgttattgatggcaagcagaatctccgtcaggtaacaatcaatgacct480
gccagttgggcgtgatgtagatgaaacgctgcgattagtacaagccttccagttcacaga540
tgagcatggtgaagtatgccctgctggctggaaacccggagccaagacaatgaaggccga600
tcctactggcagcaaagaatacttccagaatgaaaattaatataacatcatcatttcttg660
gatattttttttctccttttataaaatatttaggatctgtcttgttcaaaagagttggca720
ttcaggatatggcattaggttcattctggtaatgatctttccttttgtttaaaaccggtt780
tgaaagctcaagtaattacagtacacaacatagtttgaatcaaaataagttcaggttatt840
ttgaagaaaagctgcgttatatcacagtatcagtattctatgtttagaaggtgtatattt900
aatcaataaacttgccagtcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa951
<210>2
<211>198
<212>prt
<213>artificialsequence
<220>
<223>一種由上述斑節(jié)對蝦prx1的cdna編碼的氨基酸序列
<400>2
metserasnthrvalproalaileglylysproalaprovalphelys
151015
glythralavalvalaspglyglnphelysgluileserleugluasp
202530
tyrlysglylystyrvalilephephephetyrproleuaspphethr
354045
phevalcysprothrgluileilealapheseraspargvalgluglu
505560
phearglysileglycysgluvalvalalacysserthraspserhis
65707580
pheserhisleualatrpileasnthrproarglysgluglyglyleu
859095
glythrmetlysileproleuleualaasplyssermetgluvalala
100105110
lysalatyrglyvalleulysgluaspgluglyilealaphearggly
115120125
leuphevalileaspglylysglnasnleuargglnvalthrileasn
130135140
aspleuprovalglyargaspvalaspgluthrleuargleuvalgln
145150155160
alapheglnphethraspgluhisglygluvalcysproalaglytrp
165170175
lysproglyalalysthrmetlysalaaspprothrglyserlysglu
180185190
tyrpheglnasngluasn*
195