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陸地棉6號染色體與纖維強(qiáng)度相關(guān)的SNP分子標(biāo)記的制作方法

文檔序號:12697723閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種與棉花纖維高強(qiáng)度基因連鎖的 SNP分子標(biāo)記,其定位在與纖維強(qiáng)度相關(guān)的8個(gè)QTL中,其中有4個(gè)在多環(huán)境下檢測穩(wěn)定,這些QTL都位于陸地棉6號染色體上,有3個(gè)能夠篩選得到分型較好的SNP標(biāo)記,其中與qFS-chr06-2連鎖的SNP標(biāo)記為CRI-SNP-198773、與qFS-chr06-4連鎖的SNP標(biāo)記為CRI-SNP-198774、與qFS-chr06-7連鎖的SNP標(biāo)記為CRI-SNP-198775、CRI-SNP-198776、CRI-SNP-198777、CRI-SNP-198778、CRI-SNP-198779、CRI-SNP-198780、CRI-SNP-198781、CRI-SNP-198782、CRI-SNP-198783,其特征在于:所述的SNP分子標(biāo)記在染色體上的位置和突變堿基如下表所示,

標(biāo)記名稱SNP位點(diǎn)突變堿基CRI-SNP-19877311830437C/GCRI-SNP-19877415961930G/ACRI-SNP-19877598819023T/CCRI-SNP-19877698819766A/TCRI-SNP-19877798819351G/TCRI-SNP-19877898945368C/TCRI-SNP-19877998946829A/CCRI-SNP-19878098956931T/CCRI-SNP-19878199015203A/TCRI-SNP-19878299050013A/CCRI-SNP-19878399015209T/C

2.一種權(quán)利要求1所述的SNP分子標(biāo)記的篩選方法,包括如下步驟:

(1)利用大田推廣的陸地棉栽培品種中棉所41選系SGK9708和具有亞洲棉高強(qiáng)纖維基因的陸地棉優(yōu)異品系0-153為親本構(gòu)建F2和F2:3群體;

(2)F2:3群體家系內(nèi)每世代自交,在F2:6世代進(jìn)行一次單株選擇,再種植兩代到F6:8,把F6:8及以后的世代作為重組自交系群體進(jìn)行多年多點(diǎn)實(shí)驗(yàn);

(3)提取重組自交系群體和親本的DNA;

(4)構(gòu)建連鎖圖譜:對檢測的各樣品基因組DNA進(jìn)行酶切實(shí)驗(yàn),對得到的酶切片段(SLAF標(biāo)簽)進(jìn)行3’端加A處理,連接Dual-index測序接頭,PCR擴(kuò)增、純化、混樣、切膠選取目的片段,測序,對結(jié)果進(jìn)行遺傳圖譜的構(gòu)建;

(5)纖維強(qiáng)度QTL定位:進(jìn)行多個(gè)環(huán)境下穩(wěn)定的纖維強(qiáng)度主效QTLs篩選,選擇與纖維強(qiáng)度分型明顯的SNP,得到權(quán)利要求1中所述的3個(gè)來自陸地棉的多個(gè)環(huán)境穩(wěn)定的纖維強(qiáng)度主效QTLsqFS-chr06-2、qFS-chr06-4、qFS-chr06-7及其連鎖的SNP標(biāo)記。

3.權(quán)利要求1所述的SNP標(biāo)記可通過SNP分子標(biāo)記的基因分型實(shí)驗(yàn),從而有效地區(qū)分不同SNP位點(diǎn)與不同基因型,可對不同棉花樣品進(jìn)行篩選,達(dá)到分子標(biāo)記輔助育種的目的。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,可篩選出纖維強(qiáng)度高的株系,大大縮短育種周期,提高棉花纖維強(qiáng)度的育種效率。

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