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一種草酸脫羧酶的制備方法及應(yīng)用與流程

文檔序號(hào):12813206閱讀:556來源:國知局
一種草酸脫羧酶的制備方法及應(yīng)用與流程

本發(fā)明涉及微生物酶制備技術(shù)領(lǐng)域,具體而言,涉及一種草酸脫羧酶的制備方法及其應(yīng)用。



背景技術(shù):

草酸(oxalicacid),又叫乙二酸(ethanedioicacid),是生物體的一種代謝產(chǎn)物,廣泛分布于植物、動(dòng)物和真菌體中,并在不同的生命體中發(fā)揮不同的功能。研究發(fā)現(xiàn)至少有100多種植物富含草酸,尤以菠菜、莧菜、甜菜、馬齒莧、芋頭、茶葉、可可、甘薯和大黃等植物的葉片和種子中含量最高,由于草酸可降低礦質(zhì)元素的生物利用率,在人體中容易與鈣離子形成草酸鈣導(dǎo)致腎結(jié)石,所以草酸往往被認(rèn)為是一種礦質(zhì)元素吸收利用的拮抗物。草酸在人體內(nèi)不容易被氧化分解掉,經(jīng)代謝作用后形成的產(chǎn)物,屬于酸性物質(zhì),可導(dǎo)致人體內(nèi)酸堿度失去平衡,吃得過多還會(huì)中毒。而且草酸在人體內(nèi)如果遇上鈣和鋅便生成草酸鈣和草酸鋅,不易吸收而排出體外,影響鈣與鋅的吸收。兒童生長發(fā)育需要大量的鈣和鋅,如果體內(nèi)缺乏鈣和鋅,不僅可導(dǎo)致骨骼、牙齒發(fā)育不良,而且還會(huì)影響智力發(fā)育,過量攝入草酸還會(huì)造成人體內(nèi)血液和尿液中的草酸含量過高,容易與鈣離子形成不溶性的草酸鈣晶體,草酸鈣晶體很容易形成泌尿系結(jié)石。因此,控制從飲食中攝取的草酸,很大程度上就可以降低尿草酸量,從而降低患結(jié)石風(fēng)險(xiǎn)。低草酸飲食或降解食物中草酸的防治草酸鈣結(jié)石的策略在醫(yī)學(xué)界已成為共識(shí)。

泌尿系結(jié)石是泌尿系統(tǒng)的常見病和多發(fā)病,該病的主要特點(diǎn)是臨床治愈后復(fù)發(fā)率較高,給患者帶來了極大的痛苦,給家庭帶來了沉重的心理和經(jīng)濟(jì)上的負(fù)擔(dān)。草酸鈣是泌尿系結(jié)石的主要成分,占比達(dá)80%,導(dǎo)致草酸鈣結(jié)石癥的重要原因是人體內(nèi)缺乏降解草酸的代謝途徑。近年來,研究酶法降解草酸預(yù)防治療草酸鈣結(jié)石癥成為該領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)(賀俊斌,林日輝,龍寒等.草酸降解酶預(yù)防治療草酸鈣結(jié)石癥的研究進(jìn)展.[j]廣東醫(yī)學(xué),36(7):1132-1136)。

目前生物界降解草酸的酶包括草酸氧化酶(oxalateoxidase,ec1.2.3.4)、草酸脫羧酶(oxalatedecarboxylase,ec4.1.1.2,以下簡稱oxdc)和草酰輔酶a脫羧酶(oxaly1-coenzymeadecarboxylase,ec4.1.1.8)。oxdc是將草酸分解為甲酸和二氧化碳的酶,其內(nèi)部含有錳。迄今已知,許多細(xì)菌如芽胞桿菌(bacillus)屬,集胞藻和乳酸菌屬等、霉菌如曲霉(aspergillus)屬等、金針菇(flammulinavelutipes),彩絨革蓋菌(coriolusversicolor),疣孢漆斑菌(myrotheciumverrucaria),白腐菌(trametesversicolor),褐腐菌屬(monilinia)等含有草酸脫羧酶基因(以下也稱“oxdc基因”)。

草酸脫羧酶在上述物種中的表達(dá)量極低,而且多數(shù)菌種生長緩慢,成分復(fù)雜,分離提取純化十分困難,不具備商業(yè)化應(yīng)用可能,所以將草酸脫羧酶進(jìn)行重組表達(dá)生產(chǎn)成為其商業(yè)化應(yīng)用的必然選擇。目前草酸脫羧酶中實(shí)現(xiàn)原核重組表達(dá)的還比較少,多數(shù)是在大腸桿菌中進(jìn)行重組表達(dá)。金針菇來源的oxdc有通過煙草表達(dá)成功過報(bào)道,但表達(dá)量極低。但目前用芽胞桿菌中表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)外源的oxdc尚未見有文獻(xiàn)報(bào)道,尤其是來源于真核生物的oxdc。另外,大腸桿菌中表達(dá)真菌來源的oxdc存在酶活力低,不能實(shí)現(xiàn)分泌表達(dá),非常易于形成包涵體,復(fù)性和純化困難,用作食品原料和藥物原料的oxdc在生產(chǎn)純化過程中需要去除內(nèi)毒素。真菌來源的oxdc多數(shù)在酸性ph條件下活力較高且較為穩(wěn)定,溶解狀態(tài)的oxdc對(duì)環(huán)境的ph比較敏感,而枯草芽胞桿菌中的最適生長ph一般在6.5-7.5之間,ph低于5.5幾乎不生長,因此在枯草芽胞桿菌中和其它芽胞桿菌系統(tǒng)中表達(dá)真菌來源的oxdc還沒有成功的案例。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

為了解決現(xiàn)有技術(shù)中真菌來源oxdc無法在芽胞桿菌表達(dá)系統(tǒng)中高效分泌表達(dá),以及分泌到胞外的oxdc能在發(fā)酵液中維持穩(wěn)定的這一技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種高效生產(chǎn)真菌來源的草酸脫羧酶的方法。具體而言,本發(fā)明的目的在于提供對(duì)于高效生產(chǎn)真菌來源的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體、使用該載體制備的重組菌和使用該重組菌的草酸脫羧酶生產(chǎn)方法及其應(yīng)用。

一種高效生產(chǎn)真菌來源的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體,包括含有酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子、分泌信號(hào)肽、去原始信號(hào)肽的草酸脫羧酶基因和trpa終止子的表達(dá)質(zhì)粒,其中,所述酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子是在指ph值為1.5~4.5的條件下,能在芽胞桿菌中啟動(dòng)基因表達(dá)的啟動(dòng)子,所述分泌信號(hào)肽是指在芽胞桿菌中能促進(jìn)真菌來源的草酸脫羧酶基因分泌表達(dá)信號(hào)肽序列。

如上所述的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體,優(yōu)選地,所述酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子自枯草芽胞桿菌bs168菌株的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子,所述分泌信號(hào)肽來源于解淀粉芽胞桿菌的α-淀粉酶amyq或堿性蛋白酶、枯草芽胞桿菌的堿性蛋白酶apre或α-淀粉酶amye、地衣芽胞桿菌的α-淀粉酶amyl或堿性蛋白酶、嗜熱脂肪地芽胞桿菌的α-淀粉酶amys或堿性蛋白酶。

如上所述的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體,優(yōu)選地,所述去原始信號(hào)肽的草酸脫羧酶基因的序列如seqidno.1~seqidno.5任一所述的序列。

如上所述的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體,優(yōu)選地,所述酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子的序列如seqidno.6所示,所述分泌信號(hào)肽的序列如seqidno.7所示,所述去原始信號(hào)肽的草酸脫羧酶基因的序列如seqidno.1~seqidno.5任一所述的序列,所述trpa終止子的序列如seqidno.8所示。

如上所述的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體,優(yōu)選地,酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子為發(fā)生突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子,其序列如seqidno.9所示。

一種草酸脫羧酶的制備方法,將如上所述的重組草酸脫羧酶表達(dá)載體轉(zhuǎn)化到在ph≤4.5下正常生長的耐酸性的芽胞桿菌中,制備草酸脫羧酶重組菌,在發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng)該重組菌,并補(bǔ)加酸至ph值為3.0~4.5進(jìn)行草酸脫羧酶的誘導(dǎo)表達(dá)。

如上所述的制備方法,優(yōu)選地,所述耐酸性的芽胞桿菌為環(huán)狀芽胞桿菌、嗜熱脂肪地芽胞桿菌或解淀粉芽胞桿菌。

如上所述的制備方法,優(yōu)選地,所述補(bǔ)加酸時(shí)所用的酸為鹽酸、磷酸、硫酸、草酸/草酸鹽、乙酸、丙二酸、丁二酸、檸檬酸或植酸。

如上所述的制備方法,優(yōu)選地,培養(yǎng)重組菌至od600達(dá)到0.8~3.0后,再補(bǔ)加酸,誘導(dǎo)表達(dá)結(jié)束后通過離心收集上清,調(diào)節(jié)該上清的ph值和硫酸銨沉淀實(shí)現(xiàn)重組草酸脫羧酶的初步純化。

如上所述的制備方法制備的草酸脫羧酶在診斷試劑,藥物組合物、食品制品中的應(yīng)用。

本發(fā)明方法制備的胞外草酸脫羧酶用于診斷試劑原料,藥物組合物、保健食品或特殊醫(yī)學(xué)用途配方食品的原料。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果在于:

本發(fā)明的重組表達(dá)方法,將真菌來源草酸脫羧酶基因oxdc成功通過耐酸性芽胞桿菌表達(dá)系統(tǒng)進(jìn)行重組表達(dá),直接重組草酸脫羧酶重組分泌到發(fā)酵液中,且分泌到發(fā)酵液中的oxdc穩(wěn)定性較好,表達(dá)量高,不形成包涵體,無需細(xì)胞破碎和包涵體復(fù)性,提高了表達(dá)效率,簡化生產(chǎn)和純化步驟,降低了生產(chǎn)成本;且分泌的蛋白質(zhì)產(chǎn)品中不會(huì)混雜有內(nèi)毒素(熱源性脂多糖),具有生物安全性。本發(fā)明采用的芽胞桿菌系統(tǒng)具有較強(qiáng)的分泌能力,能在相對(duì)簡單的培養(yǎng)基中能生長到很高的密度,生產(chǎn)成本低。

本發(fā)明還采用了突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子替換重組表達(dá)載體中的原始酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子,轉(zhuǎn)化芽胞桿菌獲得更高的表達(dá)量。

附圖說明

圖1為包含酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子的重組表達(dá)載體phyaq-oxdc的構(gòu)建示意圖。

圖2為本發(fā)明一優(yōu)選的重組菌株在不同ph值產(chǎn)oxdc的相對(duì)酶活力。

圖3為本發(fā)明一優(yōu)選的重組菌株采用不同的酸誘導(dǎo)產(chǎn)oxdc的相對(duì)酶活力。

圖4為本發(fā)明優(yōu)選的重組菌株與對(duì)照菌株的產(chǎn)oxdc的酶活力。

圖5為本發(fā)明一優(yōu)選的重組菌株產(chǎn)oxdc的sds-page電泳圖。

具體實(shí)施方式

本發(fā)明人為了發(fā)現(xiàn)高效生產(chǎn)真菌來源的oxdc的方法進(jìn)行了反復(fù)研究。具體而言,使用五種真菌來源的oxdc作為代表,構(gòu)建其高效生產(chǎn)系統(tǒng)。

首先,制作枯草芽胞桿菌屬的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子,在該啟動(dòng)子的調(diào)控下連接有分泌信號(hào)肽和去原始信號(hào)肽的oxdc基因的重組表達(dá)質(zhì)粒載體,所述的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子是在酸性條件下(ph1.5~4.5)能在芽胞桿菌中啟動(dòng)基因表達(dá)的啟動(dòng)子,優(yōu)選來自枯草芽胞桿菌bs168菌株的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子。

信號(hào)肽是影響低ph穩(wěn)定且有活力的草酸脫羧酶表達(dá)的關(guān)鍵因素,因此編碼信號(hào)肽部分的基因必須能夠高效引導(dǎo)外源草酸脫羧酶的分泌;所述的分泌信號(hào)肽來源于解淀粉芽胞桿菌(bacillusamyloliquefaciens)的α-淀粉酶amyq或堿性蛋白酶,枯草芽胞桿菌(bacillussubtilis)的堿性蛋白酶apre或α-淀粉酶amye,地衣芽胞桿菌(bacilluslicheniformis)的α-淀粉酶amyl或堿性蛋白酶,嗜熱脂肪地芽胞桿菌(bacillusstearothermophilus)的α-淀粉酶amys或堿性蛋白酶等,優(yōu)選來自淀粉酶的信號(hào)肽,更優(yōu)選來解淀粉芽胞桿菌的α-淀粉酶amyq的信號(hào)肽。

優(yōu)選地,上述真菌來源的oxdc序列(seqidno.1~5)是經(jīng)過密碼子優(yōu)化的序列;所述密碼子優(yōu)化是將其密碼子更換為更加適合于芽胞桿菌系統(tǒng)表達(dá)的密碼子。然后,得到用該載體轉(zhuǎn)化耐酸性性的芽胞桿菌屬的菌株,得到系列重組菌。絕大多數(shù)的芽胞桿菌能在ph5.5~9.0的范圍生長,只有少數(shù)的幾種芽胞桿菌耐酸性較強(qiáng),能在ph≤4.5的培養(yǎng)基中正常生長。通常情況下,真菌來源的草酸脫羧酶很難在原核表達(dá)系統(tǒng)中表達(dá)成功。以上所述的耐酸性芽胞桿菌為環(huán)狀芽胞桿菌(bacilluscirculans),嗜熱脂肪地芽胞桿菌和解淀粉芽胞桿菌,但不限于這三種菌,能在ph4.5及以下的培養(yǎng)條件下正常生長的芽胞桿菌菌株都在上述耐酸性芽胞桿菌的范圍??疾熘亟M菌的草酸脫羧酶活力,結(jié)果發(fā)現(xiàn)三種耐酸性的重組芽胞桿菌都有草酸脫羧酶活性,優(yōu)選解淀粉芽胞桿菌。

進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),使用發(fā)生突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子(突變型啟動(dòng)子)時(shí)可以進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)oxdc生產(chǎn)率的提高。另一方面,研究了以解淀粉芽胞桿菌為宿主的生產(chǎn)系統(tǒng)中的培養(yǎng)條件,確定了其最佳產(chǎn)酶條件,成功實(shí)現(xiàn)了真菌來源草酸脫羧酶在解淀粉芽胞桿菌中的高效分泌表達(dá)。

下面通過具體實(shí)施例來說明本發(fā)明,應(yīng)該指出,以下具體說明都是例示性的,旨在對(duì)本發(fā)明提供進(jìn)一步的說明。

在本說明書中,除非特別指明,否則所用技術(shù)術(shù)語為本領(lǐng)域中的普通技術(shù)人員常用術(shù)語;本說明書中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法是按常規(guī)實(shí)驗(yàn)方法;本說明書中所用的試驗(yàn)材料如無特別說明均為市售購買產(chǎn)品,各種試劑及培養(yǎng)基的成分和配制方法可參見常規(guī)實(shí)驗(yàn)手冊(cè)中的操作。

本發(fā)明中用到的cicc編號(hào)的芽胞桿菌菌株均來源于cicc(中國工業(yè)微生物菌種保藏管理中心,http://www.china-cicc.org/),大腸桿菌-芽胞桿菌穿梭質(zhì)粒phy300plk來源于takara公司(http://www.takara.com.cn/);本發(fā)明中用到的所有的phusiondna聚合酶、限制性內(nèi)切酶、dna連接酶、磷酸化酶等分子生物學(xué)試劑從thermofisher公司購買(http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/brands/thermo-scientific.html);無縫克隆試劑盒購自南京諾唯贊生物科技有限公司(http://www.vazyme.com/);其它常用生化試劑均是市售分析純。pcr產(chǎn)物回收和膠回收dna的方法均采用omega公司的試劑盒的方法。

實(shí)施例1耐酸性芽胞桿菌的篩選

本發(fā)明人先后篩選了實(shí)驗(yàn)室保藏和菌種保藏中心購買的百余種芽胞桿菌物種,其中包含環(huán)狀芽胞桿菌cicc10353、cicc10403、cicc21250和cicc23053等,嗜熱脂肪地芽胞桿菌cicc10142、cicc10267、cicc10362、cicc10392、cicc10425、cicc10782和cicc10842等,解淀粉芽胞桿菌cicc10025、cicc10035、cicc10036、cicc10063、cicc10074、cicc10081和cicc10079、cicc10163等。篩選到幾株耐酸性較強(qiáng)的芽胞桿菌。篩選方法如下:

種子培養(yǎng)基為:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl5g/l,kh2po42g/l,葡萄糖10g/l,ph6.0;篩選培養(yǎng)基(1l):玉米粉20g,玉米漿5g,酵母粉2g,氯化銨1.0g,氯化錳0.5g,mgso4·7h2o0.91g,cacl20.5g,ph3.8的檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液(0.1mol/l)500ml,培養(yǎng)過程維持ph值為3.5-4.0之間,初始裝液量為250ml搖瓶裝篩選培養(yǎng)液50ml,接種量為2%,培養(yǎng)溫度30℃,搖床轉(zhuǎn)速200rpm,培養(yǎng)時(shí)間48h。

培養(yǎng)結(jié)束后,測定各菌株的吸光度值od600值,選擇值較高的吸光度值(如od600值大于20)作為候選的耐酸性宿主菌。芽胞桿菌的許多種屬都較難遺傳轉(zhuǎn)化,用phy300plk質(zhì)粒作為測試質(zhì)粒,對(duì)候選宿主菌進(jìn)行遺傳轉(zhuǎn)化,考察轉(zhuǎn)化效率,選擇轉(zhuǎn)化率高(如轉(zhuǎn)化率大于1)的菌株作為優(yōu)選的宿主菌;最終發(fā)現(xiàn),cicc10074,cicc10079,cicc10035和cicc10267等適合為宿主菌。

實(shí)施例2草酸脫羧酶基因的克隆

本發(fā)明中的真菌草酸脫羧酶基因是基于公共數(shù)據(jù)庫中登錄的真菌來源的oxdc基因,按照解淀粉芽胞桿菌的密碼子進(jìn)行優(yōu)化得到優(yōu)化基因,然后通過商業(yè)化的基因測序和合成公司全基因合成。以下是基于公共數(shù)據(jù)庫中登錄的真菌來源oxdc基因的進(jìn)行密碼子優(yōu)化后,經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證獲得的去原始信號(hào)肽的草酸脫羧酶基因的幾個(gè)例子(微生物名:數(shù)據(jù)庫名:原始基因登錄號(hào):優(yōu)化的基因序列在序列表的序列編號(hào))如下:

真姬菇(hypsizygusmarmoreus):genbank:luez01000002.1:seqidno.1;

灰蓋鬼傘菌(coprinopsiscinereaokayama):genbank:xm_001836586.2:seqidno.2;

變色栓菌(trametesversicolor):genbank:xm_008041462.1:seqidno.3;

島生異擔(dān)子菌(heterobasidionirregulare):genbank:xm_009546343.1:seqidno.4;

毛韌革菌(stereumhirsutum):genbank:xm_0073008481:seqidno.5。

本發(fā)明的最大特征在于組合使用芽孢桿菌屬來源的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子和真菌來源的oxdc基因在耐酸性芽胞桿菌表達(dá)系統(tǒng)中高效表達(dá),并且真菌來源的oxdc基因的種類沒有特別限制。因此,只要是迄今為止鑒定的真菌來源的oxdc基因原則上均可以采用,優(yōu)選使用低ph值下穩(wěn)定的可食用真菌來源的oxdc基因,即上述優(yōu)化后去原始信號(hào)肽的oxdc基因序列如seqidno.1~5所示,均可實(shí)現(xiàn)在耐酸性芽胞桿菌表達(dá)系統(tǒng)中高效表達(dá)。

其中,序列seqidno.1所示的真姬菇的oxdc基因hmoxdc,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列為seqidno.10所示。序列seqidno.1可全基因合成得到,也可pcr擴(kuò)增獲得,pcr擴(kuò)增基因hmoxdc可采用的上下游引物為hmoxdc-f1和hmoxdc-r1,擴(kuò)增條件:50μl的pcr體系為:5xphusionhfbuffer10μl,10mmdntp1μl,10μmprimerf/r各1.5μl,模版dna0.5μl,phusiondnapolymerase0.5μl,dh2o35μl;pcr反應(yīng)條件如下:98℃30s,30個(gè)循環(huán)(98℃10s,58℃30s,72℃50s),72℃5min,4℃保溫10min;其中hmoxdc-f1和hmoxdc-r1的序列如下:

hmoxdc-f1(seqidno.11):5’-gcaccggcacctgcagcatcatct-3’

hmoxdc-r1(seqidno.12):5’-ttacttcggaccaaccaccgtcag-3’

seqidno.1~seqidno.5及seqidno.10的序列如下:

seqidno.1:

5’-gcaccggcacctgcagcatcatcttcagcaccgacagtgagcacggtgtcttcagtcattgcaccgatcagcccgacggccgaaagctcagttgctgcctccagcgcctcaaacaaaccgcgtccgacgtcgacggcgacagccacggaaccgacagcaacggtgccgttcattgacctggacccgaatgaaccgctttggaacgaagacacaccgggaatccatcaaccgattcatggctcacttggagccaaacttctgggaccgacaaacaacgcgatcgtcaaacagaacccggacttactggctccgccgacgacagatcacggcagcgtaccgaatgccaaatggccgttcagccttagccataatcgtctgcaaacaggaggctgggcgcgtgaagaaaatattgctgtaatgccggtcgcccaggctatggccagcgtcaacatgcgccttgaagctggtgcagtacgtgaactgcactggcataaaacagcagaatgggcatatgttctgaaaggctccacgcaagtcacagccgtggatgccgatgggcgtaacttcgtctccacggttggcccgggtgacctttggtacttcccgcctggtatcccgcattcacttcaagcaacgaatgacgaccctgatggttctgaattcgtcttagtcttcgactcaggctcttttagcgaagattcaacgttcttacttacagattggttagatcacgttccggctgaaggtacatggtcaattccgatcacgttagtatctcttaactccggacattttcagtattggccgaaaatttccaaatgtcgcaacatctctgccttcgcacacattcctgctgaggaactgtacattttcccggctgcactgccggaacctgatagcgctgctccgaaaagcccgcaaggcacagtcccggatccgttttcattttcaatgtcaaaagtcaaaccgacgcagctgacgggaggcacggtcaaagttgtggattccacaacgttcaaaatctccaaaacaattgccgctgcagaagtcacagttgaaccgggtgcaattcgggagctgcattggcacccgacacaagacgaatggagcttctttattgagggtgaaggtcgtatgacgattttcgcctcgcagtccaatgcccgtacgttcaactatcaggctggtgatatcgcaaaaacgaaccgcagcacagggcattacctggagaacaccggcaacacgacactgcggttcctggagattttcaaatccgagaaattccaggatatcagcttagctcagtggcttgcattgacgccgccgaaattagtcaaagagcatttaggtttctctgacgacgtcattgctcggctttcgaaaacaaaactgacggtggttggtccgaagtaa-3’

seqidno.2:

5’-gtgccgtctccgtgggtgaaacacatcccgagggagcttgagggcagcttctggccgcacccgcctaaaccgcagtctcaaagcgaaatccttggcggcggcacagctccgcactcaggcaacgagtctccgtctacaccgcaggatacgccgagcgcttcaggtacggacacagctgtgccggcgcacgaaacggtcccgacaatttctttggaccgcaacgacccggtttgggactctagctttgagggcccgttcgatgctatccgtggaccgctgggcgcgacgattattggcccgaataacccgaacatcgcggttcagaatccggacttgttcgctccgccgtctacggattctggtacagtaccgaacgtcaaatggccgatgtctttgagccataatcgccttcaaacgggtggatgggcacgtcaacagaacattgatgtcatgccgatcgcgaaagctatggctggtgtgaacatgcgtttgaaaccgggagctattcgtgaactgcactggcattctacggcagaatgggcttatgtgattaaaggatctacacaagtcacatctgtcgatgctgagggtcgtaacttcatctcaacggttggcccgggcgatttgtggtacttcccgccgggtatcccgcattctttgcaagctacaggtgacgacccggaaggctcagagttcttgcttgtgttcgacgatggcgcgttctctgaagacaatacattcatgctgacagactggcttgctcacgtcccggctggagtgctggagaaaaacttccaacttggtgctacagctttcgcagaccttccggctaaagacctgtacatcttcccggctgacgtcccggcagacgaccaagaagcaccggagagcccgttcggaacagtgccggacccgttctctttcgctctttctaaaatgaacgctacgcaatttgaaggtggatctgtgaaaattgtcgattctacaacatttaaaatctctaaaacgattgcggctgctgaggttacggttgaaccgggtgcaatgcgtgagcttcactggcacccgacacaggacgagtgggatttcttcctggagggtcaaggtcgtatcacagtattcgctgctcagggcaatgctcgtacattcgatttccaggctggagatgttggttatattccggcatcattcggacattacatcgagaacacgggtaacacaacattgaaattccttgaaatttggaatacaccgaaattccaggatatctctttggctcagtggctggctcttatcccgccgtctcttgtcaaagctcatcttggattcacggacgaagtgatcgagaaattgccgaaaacgaaaccggttgttgtagtcccgaaaagcgcttctaaataa-3’

seqidno.3:

5’-gcaccggctgctgcgtcttctggcatcgcgagcagcgcagctgctacagcgagctcagcggcttcgtcggctgcgttcgcgagcgctagctctgcggtctctagcgtgtttgcgtctgctagctctgctgtggcttctagcgaccttcgctctagcaaaacagtggctccgacaagctctttctcagctgaaccggcttctgtcacggtgccgttcgctagcgatgacccgaacggcatgttatggggcgaagattctacaacagacccgcaggctattcgtaacacgcttggtgcgacaatcatgggcccgcagaacattccgatcgcgctgcagaacccggaccttcttgcgccgccgagcacagacgaaggcagcgttcagaatgctaaatggccgttcgcgctgagccacaaccgcctgcaaacgggcggatgggcacgtcagcagaacatcgatgtgatgccgatcgcgaaatctatggctggcgttaacatgcgtcttgaagcgggcgcgattcgtgaacttcactggcacaaaacagctgaatggtcttatgttacaaaaggctctgttcaggtgtcttctatcaactctgacggccaaaactaccttgctacggcgagcgcgggcgacctctggtacttcccgccgggcgtgccgcattctcttcaggcgacagctgatgacccggacggcacggaattcctgctggtcttcgacgacggcgcgttcagcgaagactcaacattcctgcttacggattggcttgcacacgtcccgaaagaagtgcttgcgaaaaacttcaaaacaaatatctctgcattcgaccacatcccggcgaaacagctttacatcttcccgtctgcgccgccgccggacaacgctcaggctccgtctgacccgcagggtcagatcccgagcccgttcgtgttccacctgtctcaggtgaaagcgacggatctggacggcggctctgtcaaagtcgtcgactctacaacattcccggttgctcaggcgatcgctgtcgctgaagtcacagtcgagccgggagcgatgcgtgagcttcactggcacccgacacaggacgagtggacatactaccttgagggccagggccgcgtgacgcttttcgcatctagcagcaacgcgcgcacgttcaactacgaggcgggagacgtcggcttcgtgccggcttctttcggacactacgtcgaaaacacgggcaacacaacgcttcgcttccttgaaatcttcaacacgaaccgcttcgaagacatttctctcagccagtggcttgcgcttacgccgccggctctggttaaagcgcacctggaccttgacgacgaaacgatcgctaacctgagcaaaacaaaactgacagtcgtcggcccggcttaa-3’

seqidno.4:

5’-gcaccggcgagcaacccgtctgcagcgacatcttctacagctctggcatctccggtatctgtatctaactctacggattctacagcgtctgtctctggaccgccgtctgcgacgtctgacgcgtcagcagctagcccgagcccgacggttccgtttgcgtctgacgacccgaacacagtcatcttctctccgggcgcagacgtccagccggaagctcaacgtggcacacttggcagcacagttatcggaccgcagaatgtgcaaatcgatcgtcaaaatccggacttcctggcaccgccgacaacggacaatggagacgtgtctaatgcgaaatggccgtttggactgagccacaatcgtatccagacaggaggctgggcacgtcagcaaaacatcgagaatatgccgattgctacgcagatggctggagttgacatgcgtcttgaaccgggcgctgttcgtgagcttcattggcacaaaacgtctgaatggtcttatgtcatcaaaggctctacgcaagttacggctgttgatcaagacggcaaaaactatctggctacagtgaacgcaggtgacctttggtacttcccgccgggcattccgcactctcttcaagcgacgaatgactctgcagagggcacagagttcctgctggtcttcgacgatggagcttttagcgaagacgctacatttctgctgacagattggcttgcgcatgtcccgaaagaggtcatcgctaaaaacttccagacagacatttctgcgtttgatgatatcccgggacgtgagctttacattttcccggctgcggttccgtcttctgatgctacagctgtctcagatccgcaaggccaggttccgaatgctttctctttcgctatgtctaaaatcaatgctacacaattatcaggtggaacagttaaaattgtggattcgacgacattcccgatctcaacgacaatcgctgctgcggacgtcacggttgaaccgggagctatgcgtgagttacactggcatccgacacaggatgaatggacgtatttcattgaaggcgatgctcgcatgacaatctttgcatcacaaagcaacgcacgtacatttgattatcaagctggcgatattggatatgttccggcatctttcggccattatgtcgagaatattggaaatacgacactgcactaccttgagatcttcaaaacggatcgtttccaggatgtcagcctgagccagtggcttgctcttacaccgccggagcttgtcaaagctcatcttggcctttctgatgctacgattgcaacgctgaaaaaaacgaaacaaacggttgttggaccgtcttaa-3’

seqidno.5:

5’-gctccggcagctacgtcttctgacgcgtctctgtctatctctgtcgaatcttcttctacggaaacagcttctgcgtctgctgctgcagaatctccgtctacaacagtgtctctggcaccgacggctccgaatggcccgctgtacacgccgggcgcagacatccaaccggaaccgatccgtggaacgcttggaggcacgatcctgggcccgcagaacattgctatcgaccagcagaatccggacatgcttgcgccgccgacgacagatcatggcgacgtgccgaacgctaaatggccgttttctctgtctcacaatcgtctgcaaacaggaggatgggctcgtcagcagaacattgaagtaatgccgatcgcaacacagatggctggcgtggatatgcgtctggaaccgggcgcaattcgtgaactgcactggcacacaagctctgaatgggcttatgtcctgaaaggatctacacaagtcacagcggtagatcaaaatggcaaaaactttctggctacggtggaaccgggagacctgtggtacttcccgccgggtatcccgcactctctgcaggctacgaacgagtctacagaaggcagcgagtttctgctggtattcgatgatggtgctttctctgaagacgacacatttttactgacagactggttagctcatgtcccgaaagaggtcatcgctaaaaactttcagctggatatttctgacttcaattctctgccgggcgaagaactgtacatcttcccggcagaaccgccgtctccggatgcagtagcgccgtctgacccgctgggccaagtaccgcaagctttttctttcgctatgtctaaaatgaatgctacgcagctgagcggaggcacagtcaaaatcgtggactctacagtcttctctgtttcaacgacaattgctgctgcggatgttacagtcgaaccgggcgctatgcgtgaactgcactggcacccgacgcaggacgaatggtcattcttcatcgaaggcacaggacgtatgacaatcttcgcatctgacagcaacgctcaaacattcgactacgaagctggcgatattggctacgtgccggctacatatggccactacgtggaaaacgtcggcaacacgacgctgcattatctggaaatcttcaaaacggatcgcttccaggacgtttctctggctcagtggctggcactgacaccgccggctctggtcaaagctcacctgggcctgtctgacgaagtcatcgcgcagttcaacaaaacaaaacaggtcgtcgtcggcccgcgccactaa-3’

seqidno.10(真姬菇(hypsizygusmarmoreus)oxdc蛋白序列去信號(hào)肽部分):apapaasssaptvstvssviapisptaessvaassasnkprptstatateptatvpfidldpneplwnedtpgihqpihgslgakllgptnnaivkqnpdllappttdhgsvpnakwpfslshnrlqtggwareeniavmpvaqamasvnmrleagavrelhwhktaewayvlkgstqvtavdadgrnfvstvgpgdlwyfppgiphslqatnddpdgsefvlvfdsgsfsedstflltdwldhvpaegtwsipitlvslnsghfqywpkiskcrnisafahipaeelyifpaalpepdsaapkspqgtvpdpfsfsmskvkptqltggtvkvvdsttfkisktiaaaevtvepgairelhwhptqdewsffiegegrmtifasqsnartfnyqagdiaktnrstghylentgnttlrfleifksekfqdislaqwlaltppklvkehlgfsddviarlsktkltvvgpk。

實(shí)施例3酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子的克隆

酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子使用芽胞桿菌屬來源的啟動(dòng)子,只要是迄今為止鑒定的芽胞桿菌屬來源的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子原則上均可以采用,這里以枯草芽胞桿菌來源的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子為例。首先由枯草芽胞桿菌bs168菌株通過常規(guī)方法獲得染色體dna。參考數(shù)據(jù)庫上的枯草芽胞桿菌oxdc基因(geneid938620)前的序列,設(shè)計(jì)特異性擴(kuò)增酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子區(qū)域的引物f2和r2,以枯草芽胞桿菌bs168菌株的染色體dna作為模板,使用設(shè)計(jì)好的引物(f2和r2)進(jìn)行pcr,由此得到酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子poxdc的dna片段,其序列如seqidno.6所示。

f2(seqidno.13):5’-agcttgaccacttcatttttc-3’

r2(seqidno.14):5’-gaaatgtttcctccttacat-3’

實(shí)施例4重組表達(dá)載體構(gòu)建

在耐酸性的芽胞桿菌中表達(dá)真菌來源的重組oxdc表達(dá)載體中oxdc基因表達(dá)框由以下原件構(gòu)成:酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子序列,分泌信號(hào)肽序列,去原始信號(hào)肽序列的真菌來源oxdc基因序列,終止子序列。其中,所述分泌信號(hào)肽序列是指在芽胞桿菌中能促進(jìn)真菌來源oxdc基因分泌表達(dá)信號(hào)肽序列,如以解淀粉芽胞桿菌作為表達(dá)宿主情況下優(yōu)選來自解淀粉芽胞桿菌的分泌信號(hào)肽。以phy300plk穿梭載體為骨架,構(gòu)建的重組oxdc表達(dá)載體如圖1所示。

具體地,要獲得分泌信號(hào)肽序列,先設(shè)計(jì)引物f3和r3,以解淀粉芽胞桿菌cicc10074的基因組dna為模版,克隆編碼解淀粉芽胞桿菌α-淀粉酶amyq基因信號(hào)肽的dna序列,序列如seqidno.7所示,其對(duì)應(yīng)的蛋白序列如seqidno.15所示。

分泌信號(hào)肽序列還可采用解淀粉芽胞桿菌(bacillusamyloliquefaciens)的堿性蛋白酶,枯草芽胞桿菌的堿性蛋白酶apre或α-淀粉酶amye,地衣芽胞桿菌的α-淀粉酶amyl或堿性蛋白酶,嗜熱脂肪地芽胞桿菌的α-淀粉酶amys或堿性蛋白酶等。

設(shè)計(jì)重疊pcr引物,通過重疊pcr的方法將酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子poxdc(seqidno.6)、解淀粉芽胞桿菌α-淀粉酶信號(hào)肽序列(seqidno.7)、真姬菇草酸脫羧酶基因hmoxdc和trpa終止子序列(seqidno.8)拼接成一個(gè)完整的基因表達(dá)框序列,再用無縫克隆試劑盒的方法,將這一基因表達(dá)框插入到phy300plk載體中。具體地,第一步以實(shí)施例3和上述的描述分別擴(kuò)增獲得seqidno.6和seqidno.7的dna片段,以濃度1:1混合作為模版,設(shè)計(jì)重疊pcr引物擴(kuò)增兩個(gè)片段的融合片段,標(biāo)記這個(gè)序列為片段a;第二步,真姬菇草酸脫羧酶基因hmoxdc是按實(shí)施例2擴(kuò)增獲得,trpa終止子序列(seqidno.8)是直接合成得到,以真姬菇草酸脫羧酶基因hmoxdc和trpa終止子dna片段濃度的3:1混合物為模版,設(shè)計(jì)重疊pcr引物擴(kuò)增兩個(gè)片段的融合片段,標(biāo)記這個(gè)序列為片段b;然后將片段a和片段b以濃度比1:2混合作為模版,設(shè)計(jì)重疊pcr引物擴(kuò)增兩個(gè)片段的融合片段即獲得拼接的基因表達(dá)框序列;第三步,設(shè)計(jì)引物f4和r4線性化phy300plk載體;第四步,設(shè)計(jì)引物f5和r5擴(kuò)增上述拼接的基因表達(dá)框序列,通過無縫克隆試劑盒的方法,將基因表達(dá)框序列整合到用引物f4和r4線性化后phy300plk載體中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α。用inoue法制備dh5α超級(jí)感受態(tài),方法參考《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南(第3版)》,涂布到含有100μg/ml氨芐青霉素的抗性lb固體培養(yǎng)基平板上篩選,通過pcr驗(yàn)證和測序驗(yàn)證陽性克隆子,測序正確的重組質(zhì)粒命名為phy-hmoxdc;其中,采用f5和r5的擴(kuò)增條件:50μl的pcr體系為:5xphusionhfbuffer10μl,10mmdntp1μl,10μmprimerf5/r5各1.5μl,模版dna0.5μl,phusiondnapolymerase0.5μl,dh2o35μl;pcr反應(yīng)條件如下:98℃30s,30個(gè)循環(huán)(98℃10s,58℃30s,72℃60s),72℃5min,4℃保溫10min。

采用的引物序列如下:

f3(seqidno.16):5’-atgattcaaaaacgaaagcg-3’

r3(seqidno.17):5’-ggctgatgtttttgtaatcg-3’

f4(seqidno.18):

5’-tgagcgggcttttttacggatccccgggaattcct-3’

r4(seqidno.19):5’-cgacctgcagatctctagaag-3’

f5(seqidno.20):

5’-gagatctgcaggtcgagcttgaccacttcatttttc-3’

r5(seqidno.21):5’-aaaaaagcccgctcattaggc-3’。

其它序列如下:

seqidno.6:

5’-agcttgaccacttcatttttcaatcgaagttgacttttcactggtttttttcacttaacaaaacagaagggaaaacgaaaggcctttcaccttctctttctgctatcacatttaaatgtaaggaggaaacatttc-3’

seqidno.7:

5’-atgattcaaaaacgaaagcggacagtttcgttcagacttgtgcttatgtgcacgctgttatttgtcagtttgccgattacaaaaacatcagcc-3’

seqidno.15:miqkrkrtvsfrlvlmctllfvslpitktsa

seqidno.8:

5’-tgaattcgagcactagtgcagcccgcctaatgagcgggctttttt-3’

進(jìn)一步,以啟動(dòng)子poxdc(seqidno.6)為模版,通過定點(diǎn)突變的方法獲得突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子(seqidno.9),將該序列送到基因合成公司進(jìn)行合成,然后將其連接到t載體上,采用f6(seqidno.22)(5’-atgattcaaaaacgaaagcg-3’)和r4線性化phy-hmoxdc載體。具體地,采用f7和r7擴(kuò)增,其擴(kuò)增條件:50μl的pcr體系為:5xphusionhfbuffer10μl,10mmdntp1μl,10μmprimerf7/r7各1.5μl,模版dna0.5μl,phusiondnapolymerase0.5μl,dh2o35μl;pcr反應(yīng)條件如下:98℃30s,30個(gè)循環(huán)(98℃10s,58℃20s,72℃10s),72℃5min,4℃保溫10min;模版是基因合成seqidno.9;擴(kuò)增獲得突變的的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子(seqidno.9),通過無縫克隆試劑盒的操作方法,將通過用f6和r4線性化后的載體phy-hmoxdc中的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子替換成突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子即含有seqidno.9,轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α,涂布到含有100μg/ml氨芐青霉素的抗性lb固體培養(yǎng)基平板上篩選,通過pcr驗(yàn)證和測序驗(yàn)證陽性克隆子,測序正確的重組質(zhì)粒命名為phy2-hmoxdc。其中:

seqidno.9:

5’-atcatgcaagcaatgatttttcaatcgaagttgactttcactggtttggtttcacttaacaaatcaaaatttttaaaaatcgaaatctctttcaccttgtctttgtgctattacatttaaatgtaaggaggaaacatctt-3’

f7(seqidno.23):

5’-gagatctgcaggtcgatcatgcaagcaatgatttttc-3’

r7(seqidno.24):

5’-tcgtttttgaatcataagatgtttcctccttacat-3’

實(shí)施例5重組表達(dá)菌株的構(gòu)建

根據(jù)質(zhì)粒抽提試劑盒說明書的方法提取上述實(shí)施例中制備的phy300plk、phy-hmoxdc和phy2-hmoxdc質(zhì)粒,電轉(zhuǎn)化到解淀粉芽胞桿菌cicc10074中,涂布到含有10μg/ml氯霉素抗性的lb固體培養(yǎng)基平板上篩選陽性克隆子。陽性克隆子命名為cicc10074-phy-hmoxdc和cicc10074-phy2-hmoxdc,即重組表達(dá)菌株,對(duì)照菌株為cicc10074-phy300plk。解淀粉芽胞桿菌cicc10074感受態(tài)細(xì)胞制備和電轉(zhuǎn)化方法參考枯草芽胞桿菌的電轉(zhuǎn)化的方法(參見文獻(xiàn):xuegpetal.,highosmolarityimprovestheelectro-transformationefficiencyofthegram-positivebacteriabacillussubtilisandbacilluslicheniformis.jmicrobiolmeth.1999,34(3):183-191.)。

實(shí)施例6分析方法

草酸hplc測定方法:采用文獻(xiàn)報(bào)道的方法(clausencaetal.,oxalateanalysismethodologyfordecayedwood,internationalbiodeteriorationandbiodegradation.2008,62:372-375)。草酸脫羧酶活力測定:將1ml5mm草酸鹽溶液(其中含50mm檸檬酸鹽緩沖液,ph3.0),在37℃預(yù)熱10分鐘后,加入0.05-0.1ml含草酸脫羧酶的適當(dāng)稀釋的發(fā)酵液上清,37℃,200rpm恒溫震蕩反應(yīng)30分鐘,加入50μl的2.5mh2so4終止反應(yīng),立即將終止反應(yīng)后的樣品12000rpm離心10min,取上清用0.45μm膜過濾至液相進(jìn)樣瓶中,用hplc測定殘留草酸鹽濃度。一個(gè)酶活力單位(u)為在此條件下,每分鐘降解1μmol草酸鹽所需的酶量。蛋白條帶分析采用sds-page分析的方法。

實(shí)施例7重組菌的培養(yǎng)方法

上述制備的重組表達(dá)菌株在5ml種子培養(yǎng)基中,30℃,200rpm培養(yǎng)12h。種子培養(yǎng)基組成為:蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,nacl,5g/l,kh2po42g/l,葡萄糖10g/l,起始ph6.0。以4%的接種量接種到發(fā)酵培養(yǎng)基中,初始裝液量為250ml搖瓶裝液50ml,接種量為2%,培養(yǎng)溫度30℃,搖床轉(zhuǎn)速200rpm,培養(yǎng)到od600到達(dá)0.8~3.0之間開始補(bǔ)酸誘導(dǎo),優(yōu)選采用培養(yǎng)4小時(shí)左右,od600到達(dá)1.0開始誘導(dǎo)。發(fā)酵培養(yǎng)基組成為:玉米粉20g/l,玉米漿5g/l,酵母粉2g/l,氯化銨1.0g/l,氯化錳0.5g/l,mgso4·7h2o0.91g/l,cacl20.5g/l,ph4.8的0.1mol/l檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液500ml/l。

補(bǔ)加酸直到發(fā)酵液ph為3.0~4.5之間進(jìn)行誘導(dǎo)草酸脫羧酶的表達(dá),用20%的磷酸分別調(diào)節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基的ph為3.0,3.5,3.8,4.0,4.2和4.5,37℃誘導(dǎo)培養(yǎng)30h。

用實(shí)施例5制備的重組表達(dá)菌株cicc10074-phy-hmoxdc進(jìn)行上述表達(dá)測試,采用實(shí)施例6所述的方法進(jìn)行檢測,結(jié)果如圖2所示,結(jié)果表明在ph4.0時(shí)酶活力最高。

補(bǔ)酸時(shí)采用鹽酸、磷酸、硫酸、草酸/草酸鹽、乙酸、丙二酸、丁二酸、檸檬酸和植酸,分別用以上的酸誘導(dǎo)劑調(diào)節(jié)發(fā)酵培養(yǎng)基的ph為4.0,37℃誘導(dǎo)培養(yǎng)30h,用實(shí)施例5制備的重組表達(dá)菌株cicc10074-phy-hmoxdc進(jìn)行上述表達(dá)測試,采用實(shí)施例6所述的方法進(jìn)行檢測,結(jié)果如圖3所示,表明用植酸作為酸誘導(dǎo)劑時(shí),酶活力最高。

對(duì)比兩種重組表達(dá)菌株和對(duì)照菌株的產(chǎn)酶效率,在發(fā)酵培養(yǎng)基中,發(fā)酵液的od600達(dá)到1.0時(shí),采用植酸調(diào)節(jié)發(fā)酵液ph為4.0,每隔4-8h取樣一次,每次取樣1ml,采用實(shí)施例6方法測定發(fā)酵液ph和發(fā)酵液上清的oxdc活力。結(jié)果如圖4所示,酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子能成功誘導(dǎo)真菌來源草酸脫羧酶的高效表達(dá),突變的酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子啟動(dòng)oxdc基因表達(dá)的效率比原始酸誘導(dǎo)啟動(dòng)子高,發(fā)酵60小時(shí)時(shí)重組表達(dá)菌株cicc10074-phy2-hmoxdc分泌的oxdc的活力比重組表達(dá)菌株cicc10074-phy-hmoxdc高30%左右,活力達(dá)到50,000u/l。

實(shí)施例8重組oxdc的初步純化

采用實(shí)施例7所述的發(fā)酵條件進(jìn)行發(fā)酵,收集重組表達(dá)菌株cicc10074-phy2-hmoxdc的發(fā)酵液1l,12000g,4℃離心10分鐘,取上清到燒杯中,加熱到55℃保溫10分鐘,用6m的hcl調(diào)節(jié)ph2.5,12000g,4℃離心10分鐘,上清倒入另外一個(gè)燒杯置于冰浴中,加入總體積25%的硫酸銨對(duì)蛋白進(jìn)行沉淀45分鐘,加入固體硫酸銨時(shí),邊加入邊攪拌,12000g,4℃離心10分鐘,沉淀用25mm的ph3.0的檸檬酸緩沖液溶解,對(duì)上述通過離心收集上清,調(diào)節(jié)ph值和硫酸銨沉淀等簡單步驟的初步純化獲得的oxdc即真姬菇的oxdc,進(jìn)行sds-page分析和酶活力測定分析。如圖5是初步純化后的真姬菇的oxdc,分子量大小約為50kda,純度在90%以上。

上述重組表達(dá)的oxdc直接分泌到發(fā)酵液中,穩(wěn)定性較好,且不形成包涵體,無需細(xì)胞破碎和包涵體復(fù)性,表達(dá)量高,提高了表達(dá)效率,有效簡化生產(chǎn)和純化步驟,降低了生產(chǎn)成本。

將實(shí)施例4制備的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)入到其它耐酸性的芽胞桿菌,如環(huán)狀芽胞桿菌、嗜熱脂肪地芽胞桿菌等均可獲得穩(wěn)定表達(dá)的oxdc,在此將不再贅述。

應(yīng)當(dāng)指出,以上所述僅為本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施例,對(duì)于本技術(shù)中的普通技術(shù)人員來說,在不脫離本發(fā)明的核心技術(shù)特征的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤飾,這些潤飾和改進(jìn)也應(yīng)屬于本發(fā)明的專利保護(hù)范圍。

sequencelisting

<110>武漢康復(fù)得生物科技股份有限公司

<120>一種草酸脫羧酶的制備方法及應(yīng)用

<130>

<160>24

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>1413

<212>dna

<213>人工合成

<400>1

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gcaccgatcagcccgacggccgaaagctcagttgctgcctccagcgcctcaaacaaaccg120

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tcacttggagccaaacttctgggaccgacaaacaacgcgatcgtcaaacagaacccggac300

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ttcgtcttagtcttcgactcaggctcttttagcgaagattcaacgttcttacttacagat720

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atctccaaaacaattgccgctgcagaagtcacagttgaaccgggtgcaattcgggagctg1080

cattggcacccgacacaagacgaatggagcttctttattgagggtgaaggtcgtatgacg1140

attttcgcctcgcagtccaatgcccgtacgttcaactatcaggctggtgatatcgcaaaa1200

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ccgccgaaattagtcaaagagcatttaggtttctctgacgacgtcattgctcggctttcg1380

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<210>2

<211>1401

<212>dna

<213>人工合成

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gtgccgtctccgtgggtgaaacacatcccgagggagcttgagggcagcttctggccgcac60

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ccggcgcacgaaacggtcccgacaatttctttggaccgcaacgacccggtttgggactct240

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aataacccgaacatcgcggttcagaatccggacttgttcgctccgccgtctacggattct360

ggtacagtaccgaacgtcaaatggccgatgtctttgagccataatcgccttcaaacgggt420

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aacatgcgtttgaaaccgggagctattcgtgaactgcactggcattctacggcagaatgg540

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atctcaacggttggcccgggcgatttgtggtacttcccgccgggtatcccgcattctttg660

caagctacaggtgacgacccggaaggctcagagttcttgcttgtgttcgacgatggcgcg720

ttctctgaagacaatacattcatgctgacagactggcttgctcacgtcccggctggagtg780

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ggatctgtgaaaattgtcgattctacaacatttaaaatctctaaaacgattgcggctgct1020

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cgtacattcgatttccaggctggagatgttggttatattccggcatcattcggacattac1200

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cttggattcacggacgaagtgatcgagaaattgccgaaaacgaaaccggttgttgtagtc1380

ccgaaaagcgcttctaaataa1401

<210>3

<211>1401

<212>dna

<213>人工合成

<400>3

gcaccggctgctgcgtcttctggcatcgcgagcagcgcagctgctacagcgagctcagcg60

gcttcgtcggctgcgttcgcgagcgctagctctgcggtctctagcgtgtttgcgtctgct120

agctctgctgtggcttctagcgaccttcgctctagcaaaacagtggctccgacaagctct180

ttctcagctgaaccggcttctgtcacggtgccgttcgctagcgatgacccgaacggcatg240

ttatggggcgaagattctacaacagacccgcaggctattcgtaacacgcttggtgcgaca300

atcatgggcccgcagaacattccgatcgcgctgcagaacccggaccttcttgcgccgccg360

agcacagacgaaggcagcgttcagaatgctaaatggccgttcgcgctgagccacaaccgc420

ctgcaaacgggcggatgggcacgtcagcagaacatcgatgtgatgccgatcgcgaaatct480

atggctggcgttaacatgcgtcttgaagcgggcgcgattcgtgaacttcactggcacaaa540

acagctgaatggtcttatgttacaaaaggctctgttcaggtgtcttctatcaactctgac600

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ccgaaagaagtgcttgcgaaaaacttcaaaacaaatatctctgcattcgaccacatcccg840

gcgaaacagctttacatcttcccgtctgcgccgccgccggacaacgctcaggctccgtct900

gacccgcagggtcagatcccgagcccgttcgtgttccacctgtctcaggtgaaagcgacg960

gatctggacggcggctctgtcaaagtcgtcgactctacaacattcccggttgctcaggcg1020

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agcagcaacgcgcgcacgttcaactacgaggcgggagacgtcggcttcgtgccggcttct1200

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acagtcgtcggcccggcttaa1401

<210>4

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<213>人工合成

<400>4

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<213>人工合成

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gctccggcagctacgtcttctgacgcgtctctgtctatctctgtcgaatcttcttctacg60

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gaactgcactggcacacaagctctgaatgggcttatgtcctgaaaggatctacacaagtc480

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gagtttctgctggtattcgatgatggtgctttctctgaagacgacacatttttactgaca660

gactggttagctcatgtcccgaaagaggtcatcgctaaaaactttcagctggatatttct720

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<213>人工合成

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<213>人工合成

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tttgtcagtttgccgattacaaaaacatcagcc93

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<213>人工合成

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<213>人工合成

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atgtaaggaggaaacatctt140

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<212>prt

<213>真姬菇(hypsizygusmarmoreus)oxdc蛋白序列去信號(hào)肽部分

<400>10

alaproalaproalaalaserserseralaprothrvalserthrval

151015

serservalilealaproileserprothralagluserservalala

202530

alaserseralaserasnlysproargprothrserthralathrala

354045

thrgluprothralathrvalpropheileaspleuaspproasnglu

505560

proleutrpasngluaspthrproglyilehisglnproilehisgly

65707580

serleuglyalalysleuleuglyprothrasnasnalailevallys

859095

glnasnproaspleuleualaproprothrthrasphisglyserval

100105110

proasnalalystrppropheserleuserhisasnargleuglnthr

115120125

glyglytrpalaargglugluasnilealavalmetprovalalagln

130135140

alametalaservalasnmetargleuglualaglyalavalargglu

145150155160

leuhistrphislysthralaglutrpalatyrvalleulysglyser

165170175

thrglnvalthralavalaspalaaspglyargasnphevalserthr

180185190

valglyproglyaspleutrptyrpheproproglyileprohisser

195200205

leuglnalathrasnaspaspproaspglysergluphevalleuval

210215220

pheaspserglyserphesergluaspserthrpheleuleuthrasp

225230235240

trpleuasphisvalproalagluglythrtrpserileproilethr

245250255

leuvalserleuasnserglyhispheglntyrtrpprolysileser

260265270

lyscysargasnileseralaphealahisileproalaglugluleu

275280285

tyrilepheproalaalaleuprogluproaspseralaalaprolys

290295300

serproglnglythrvalproasppropheserphesermetserlys

305310315320

vallysprothrglnleuthrglyglythrvallysvalvalaspser

325330335

thrthrphelysileserlysthrilealaalaalagluvalthrval

340345350

gluproglyalailearggluleuhistrphisprothrglnaspglu

355360365

trpserphepheilegluglygluglyargmetthrilephealaser

370375380

glnserasnalaargthrpheasntyrglnalaglyaspilealalys

385390395400

thrasnargserthrglyhistyrleugluasnthrglyasnthrthr

405410415

leuargpheleugluilephelysserglulyspheglnaspileser

420425430

leualaglntrpleualaleuthrproprolysleuvallysgluhis

435440445

leuglypheseraspaspvalilealaargleuserlysthrlysleu

450455460

thrvalvalglyprolys

465470

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<212>dna

<213>人工合成

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gcaccggcacctgcagcatcatct24

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<212>dna

<213>人工合成

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ttacttcggaccaaccaccgtcag24

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<212>dna

<213>人工合成

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agcttgaccacttcatttttc21

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<212>dna

<213>人工合成

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gaaatgtttcctccttacat20

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<212>prt

<213>α-淀粉酶信號(hào)肽

<400>15

metileglnlysarglysargthrvalserpheargleuvalleumet

151015

cysthrleuleuphevalserleuproilethrlysthrserala

202530

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<213>人工合成

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atgattcaaaaacgaaagcg20

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<212>dna

<213>人工合成

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ggctgatgtttttgtaatcg20

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<213>人工合成

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tcgtttttgaatcataagatgtttcctccttacat35

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