1.一種判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)準備好相關(guān)實驗試劑;
2)野生型小鼠和miR-144/451基因敲除的雄性小鼠各兩只,通過繁殖得到大量的野生型小鼠和miR-144/451基因敲除鼠;
3)按照SPF級飼養(yǎng)標準飼養(yǎng)小鼠,濕度控制在40%-70%,溫度控制在20-25℃,用已滅菌處理的飼料、墊料和飲水一周更換二到三次;
4)合籠方式為1只miR-144/451基因敲除的雄鼠和1-5只miR-144/451基因敲除的雌鼠交配進行繁殖,發(fā)現(xiàn)雌鼠有懷孕表現(xiàn)立即分籠生育,并及時記錄生育出的小鼠父母系來源;
5)步驟4)中的小鼠DNA提取:取3周齡的小鼠尾部末端組織,長度為0.5cm,放入1.5ml EP管中,每管加l00μl裂解液,95℃,靜置20分鐘,冷卻后加入l00μl中和液混勻,取以上的含鼠DNA的上清液用于PCR進行小鼠基因型鑒定;
6)小鼠DNA的PCR:下列反應(yīng)物構(gòu)成20μl的PCR反應(yīng)體系:含鼠DNA的上清液2μl、引物1μl、DNA聚合酶混合物10μl、雙蒸水7μl;上述材料混勻離心后置于PCR儀設(shè)定條件循環(huán)擴增:預變性,95℃,5分鐘;變性,95℃,40秒;退火,60.5℃,40秒;延伸,72℃,1min;循環(huán),72℃,5分鐘;
7)進行瓊脂糖凝膠電泳:取瓊脂糖粉末0.75g加入50ml的TAE電泳緩沖液中,微波爐中加熱至沸騰,將溶解澄清的瓊脂物室溫冷卻至60℃加入Goldview 5μl或EB 3μl混勻,緩緩倒入已置好梳子的膠板中,室溫放置30min,待凝膠完全凝固后輕輕拔出梳子;將制備好的1.5%瓊脂糖凝膠放入電泳槽,加入1×TAE溶液至高出凝膠表面;取PCR反應(yīng)終產(chǎn)物10μl加樣到膠孔中,電壓100V電泳,時間為30min;
8)凝膠成像:電泳結(jié)束后,取出凝膠置于凝膠成像分析儀下拍照,小鼠電泳基因型片段為:miR-144/451野生型小鼠為290bp、純合子190bpheterozygous (-/+)250bp和190bp;
9)喂食:使用帶有抗凝劑的玻璃毛細管從miR-144/451野生型小鼠小內(nèi)眥靜脈取血200微升,使用12#灌胃器將野生型小鼠的血液喂食給miR-144/451基因敲除型小鼠;
10)提取樣本:在喂食3小時、6小時、12小時、24小時后,分別使用帶有抗凝劑的玻璃毛細管從miR-144/451基因敲除型小鼠小內(nèi)眥靜脈取血200微升;
11)提取樣本中的RNA:每0.1mL步驟10)得到的全血加入裂解液Trizolreagent 1 ml,大力混勻,靜置5到10分鐘;加入200μl氯仿,劇烈搖晃15s,靜置5分鐘;4℃,12000g離心15min;將上清轉(zhuǎn)入新的EP管,加入500μl異丙醇,顛倒混勻后室溫沉淀10min; 4℃,12000g離心20min;棄上清,加入1ml75%乙醇;4℃,12000g離心5min;棄上清,室溫靜置至干燥加入20μlDEPC水溶解;55℃水浴5min;
12)反轉(zhuǎn)錄RNA:配置反應(yīng)液體系:步驟11)中得到的總RNA 1 ng、RTase Mix 1μl、5xReaction Buffer 5μl,使用ddH2O將反應(yīng)體系補足至25μl;混勻后加溫至37℃,而后保溫60分鐘,再加溫至85℃,保溫10分鐘;
13)全血DNA的PCR:下列反應(yīng)物構(gòu)成20μl的PCR反應(yīng)體系:步驟12)得到的全血DNA 2μl、上游引物2μl、下游引物2μl 、DNA聚合酶混合物10μl、雙蒸水7μl;混勻離心后置于PCR儀設(shè)定條件循環(huán)擴增:預變性,95℃,5分鐘;變性,95℃,40秒;退火,60.5℃,40秒;延伸,72℃,1min;循環(huán),72℃,5分鐘;
14)使用U6作為內(nèi)參,判斷miR-451的表達水平。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征是,步驟7)中,50ml的TAE電泳緩沖液由57.1ml的冰乙酸、242g的Tris-base、100ml濃度為0.5mol/L 的EDTA配制而成,并由雙蒸水定容至1L。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征是,步驟7)中,1×TAE電泳緩沖液由10ml的50xTAE電泳緩沖液加雙蒸水定容至500ml。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征是,步驟7)中,所述EB濃度為10mg/ml,由1g的EB、100ml的去離子水混勻溶解后避光保存,室溫放置而制成。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征是,步驟5)中,所述裂解液由40μl的0.5M EDTA、25μl的10N NaOH、100ml的蒸餾水制成,并調(diào)節(jié) PH 至 8.0。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的判斷MircroRNA基因敲除動物作為實驗動物模型的可靠性的方法,其特征是,步驟5)中,所述中和液由4ml的1M Tris-HCl加蒸餾水定容至100ml。