本發(fā)明涉及一種人Gal-3重組蛋白誘導表達方法,屬于獲得肽的基因工程方法技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
人半乳糖凝集素(galectin)蛋白家族是動物凝集素的一類,galectin具有大約135個氨基酸組成的高度保守的糖識別結(jié)構(gòu)域(carbohydrate recognition domain, CRD),能特異性性識別并結(jié)合β-半乳糖苷。目前已從多種動物的組織和細胞中分離到15種galectin,其中半乳糖凝集素-3(galectin-3,簡稱Gal-3)是galectin家族中唯一的嵌合型代表。Gal-3在正常細胞(如上皮細胞和免疫細胞)和腫瘤細胞中都廣泛表達。作為一個多功能蛋白,Gal-3參與細胞生長、分化、細胞黏附、血管發(fā)生、腫瘤演進、細胞凋亡、轉(zhuǎn)移等多種生物過程。在20世紀80年代末90年代初,研究人員就發(fā)現(xiàn)Gal-3存在于結(jié)腸癌、胃癌、黑色素瘤、頭頸部鱗癌、卵巢癌、肺癌、淋巴瘤、顱后窩腫瘤等腫瘤組織,并具有一定的診斷、預后、治療價值。Gal-3因此成為備受關(guān)注的腫瘤診斷和治療新靶點。目前,包括多糖、Gal-3C(N-端截短型Gal-3)、多肽、抗體、核酸類等多種抑制劑已相繼被研發(fā)出來,用于抗腫瘤或抗肺纖維化(IPF)等疾病治療。但如何實現(xiàn)人Gal-3的構(gòu)建、表達尚未見有報道。
基于此,做出本申請。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
針對現(xiàn)有人類半乳糖凝集素-3表達與合成過程中所存在的上述缺陷,本申請針對人Gal-3開放閱讀框的密碼子進行優(yōu)化和化學合成,成功構(gòu)建原核表達重組質(zhì)粒pET-25b-Gal3-Homo,并對其重組蛋白誘導表達條件進行了優(yōu)化。
為實現(xiàn)上述目的,本申請采取的技術(shù)方案如下:
人Gal-3重組蛋白誘導表達方法,具體步驟如下:
(1)密碼子優(yōu)化:
對大腸桿菌20個氨基酸所對應的密碼子進行統(tǒng)計,然后對人Gal-3 ORF碼子優(yōu)化,將優(yōu)化的ORF進行化學合成并連接至pET-28b的Nde I和Xho I克隆位點上,制備重組質(zhì)粒pET-28b-Gal3-Homo;
(2)重組蛋白的誘導表達
①將pET-28b-Gal3重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細胞BL21中,將轉(zhuǎn)化液在含卡那霉素Kanamycin的瓊脂盤上劃線后37℃培養(yǎng)12 h,獲得大量單菌落;
②在誘導重組蛋白前一天,挑取單菌落接種于1 mL LB培養(yǎng)液中,進行12h的前培養(yǎng);
③將前培養(yǎng)按1%的體積接種于20 mL LB培養(yǎng)液中,37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 介于0.7~1.0時,向菌液中加入IPTG,然后繼續(xù)37℃震蕩培養(yǎng)后,進行離心,徹底去上清。
進一步的,作為優(yōu)選:
步驟(1)中,所述的優(yōu)化是指:人Gal-3gORF中某種氨基酸所對應的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率較高的,則保留該密碼子;反之,當使用的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率很低的或不出現(xiàn)的時,則對其進行優(yōu)化,將原密碼子修改為大腸桿菌的密碼子。
步驟①中,所述的瓊脂盤中,卡那霉素Kanamycin的含量為50 μg ?mL-1。
步驟②和步驟③中,所述的LB培養(yǎng)液中,卡那霉素Kanamycin的含量為50 μg?mL-1。
步驟③中,所述的IPTG在菌液中的終濃度為0-1 mmol?L-1,添加IPTG后,所述的培養(yǎng)時間為1-4小時。
人半乳糖凝集素(galectin)蛋白家族是動物凝集素的一類,galectin具有大約135個氨基酸組成的高度保守的糖識別結(jié)構(gòu)域(carbohydrate recognition domain, CRD),能特異性性識別并結(jié)合β-半乳糖苷。目前已從多種動物的組織和細胞中分離到15種galectin,其中半乳糖凝集素-3(galectin-3,簡稱Gal-3)是galectin家族中唯一的嵌合型代表。Gal-3在正常細胞(如上皮細胞和免疫細胞)和腫瘤細胞中都廣泛表達。作為一個多功能蛋白,Gal-3參與細胞生長、分化、細胞黏附、血管發(fā)生、腫瘤演進、細胞凋亡、轉(zhuǎn)移等多種生物過程。在20世紀80年代末90年代初,研究人員就發(fā)現(xiàn)Gal-3存在于結(jié)腸癌、胃癌、黑色素瘤、頭頸部鱗癌、卵巢癌、肺癌、淋巴瘤、顱后窩腫瘤等腫瘤組織,并具有一定的診斷、預后、治療價值。Gal-3因此成為備受關(guān)注的腫瘤診斷和治療新靶點。目前,包括多糖、Gal-3C(N-端截短型Gal-3)、多肽、抗體、核酸類等多種抑制劑已相繼被研發(fā)出來,用于抗腫瘤或抗肺纖維化(IPF)等疾病治療。本申請針對人Gal-3開放閱讀框的密碼子進行優(yōu)化和化學合成,成功構(gòu)建原核表達重組質(zhì)粒pET-25b-Gal-3-Homo,并對其重組蛋白誘導表達條件進行了優(yōu)化。
附圖說明
圖1為本申請中人重組Gal-3誘導表達;
圖2為本申請中人重組Gal-3可溶性檢測、Western-blotting檢測。
其中,圖1中,泳道1、10為未加IPTG的陰性對照,2-5為誘導表達1h,6-9為誘導表達2h,11-14為誘導表達3h,15-18為誘導表達4h;2、6、11、15為0.001 mmol?L-1 IPTG誘導表達,3、7、12、16為0.01 mmol?L-1 IPTG誘導表達,4、8、13、17為0.1 mmol?L-1 IPTG誘導表達,5、9、14、18為1.0 mmol?L-1 IPTG誘導表達;圖2中,1-4為考馬斯亮藍染色、5-8為Western-blotting檢測;泳道1、5為未加IPTG的陰性對照,2、6為全菌,3、7為上清,4、8為沉淀。
具體實施方式
1 材料與方法
1.1 主要材料與試劑
大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細胞BL21購自天根生化科技有限公司;X-Tractor裂解液購自TAKARA;Protein Ladder、脫脂奶粉、PVDF膜、小鼠抗His-tag 抗體、辣根過氧化物酶標記山羊抗小鼠抗體、超敏ECL化學發(fā)光試劑盒購自碧云天生物技術(shù)研究所;DNA片段合成和載體質(zhì)粒構(gòu)建委托蘇州金唯智生物科技有限公司。
1.2 方法
1.2.1密碼子優(yōu)化
統(tǒng)計實驗室常用的重組蛋白原核表達載體,對大腸桿菌20個氨基酸所對應的密碼子進行統(tǒng)計,然后對人Gal-3 ORF碼子優(yōu)化。具體而言,ORF中某氨基酸所對應的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率較高的,則保留該密碼子。反之,如果使用的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率很低的或不出現(xiàn)的,則對其進行優(yōu)化,即將原密碼子修改為大腸桿菌的密碼子(具體參見序列1,即人Gal-3g 密碼子優(yōu)化前后ORF及其編碼氨基酸的推導序列)。將優(yōu)化的ORF進行合成并連接至pET-28b的Nde I和Xho I克隆位點上,制備重組質(zhì)粒pET-28b-Gal3-Homo。
1.2.2 重組蛋白的誘導表達
將pET-28b-Gal-3質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細胞BL21中,將轉(zhuǎn)化液在含卡那霉素Kanamycin(簡稱Kan,50 μg?mL-1)的瓊脂盤上劃線后37℃培養(yǎng)12 h,獲得大量單菌落。在誘導重組蛋白前一天,挑取單菌落接種于1 mL LB培養(yǎng)液中(含50 μg?mL-1 Kan),進行12h的前培養(yǎng)。將前培養(yǎng)按1%的體積接種于20 mL LB培養(yǎng)液中(含50 μg?mL-1 Kan),37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 介于0.7~1.0時,取2 mL菌液作為對照樣品,將剩余菌液分為4管,加入IPTG,使其終濃度分別為0.001 mmol?L-1、0. 01 mmol?L-1、0.1 mmol?L-1、1 mmol?L-1,然后繼續(xù)37℃震蕩培養(yǎng),在培養(yǎng)時間為1、2、3、4h時分別取兩個0.5 mL樣品進行離心(13200rpm,1min),徹底去上清。將其中一管的菌體溶于50 μL的蛋白質(zhì)上樣緩沖液中,連同Protein Marker一起于干燥恒溫器中100℃處理3 min,取出后迅速置于冰上冷卻,最后將所有樣品分別取5μL進行SDS-PAGE電泳,檢測人重組Gal3誘導表達情況。剩下的一管保存于-20℃用于后續(xù)的重組蛋白的可溶性檢測。
1.2.4重組蛋白的可溶性檢測
(1)分別取1mL經(jīng)IPTG(終濃度1mmol?L-1)誘導4h的菌液加入已知重量的1.5ml離心管,13200rpm離心1min,去上清,再次稱量離心管重量,得出菌體重量。
(2)按1μg菌體對應20μL比例加入X-tractor裂解液,充分懸浮菌體。加入DNaseⅠ約0.1μL避免溶液出現(xiàn)粘稠,另加入一定量溶菌酶(終濃度為1mg?mL-1),室溫放置10min,每2min上下顛倒一次。4℃ 13 200rpm離心20min。
(3)取上清到另一個離心管中(作為上清樣品保留檢測用),再在離心管中加入與X-tractor等量的ddH2O,將沉淀充分懸浮。
(4)取上清和沉淀懸浮液各10μL,加入2.5μL的5×SDS上樣緩沖液,100℃處理5min后迅速置于冰上。
(5)取5μL處理過的樣品進行SDS-PAGE電泳檢測重組蛋白水溶性。
按照說明,將有表達重組蛋白的細菌溶解于X-Tractor裂解液。離心后,用SDS-PAGE檢測包涵體和沉淀??扇苄缘鞍追植加谏锨逯?,而不可溶性蛋白分布于包涵體中。
1.2.5 免疫印跡檢測
誘導表達的重組蛋白在15%分離膠,5%濃縮膠中進行SDS-PAGE分析,電泳后用PVDF膜將凝膠在轉(zhuǎn)印緩沖溶液中轉(zhuǎn)移電泳,65 V恒壓轉(zhuǎn)印3 h,5%脫脂奶封閉,小鼠抗His-tag分別為一抗,HRP 標記的羊抗小鼠IgG為二抗,超敏Ecl 化學發(fā)光試劑盒顯色。
2 結(jié)果與分析
(1)pET-28b-Gal3-Homo的構(gòu)建、重組蛋白誘導表達及條件優(yōu)化
將優(yōu)化的密碼子進行化學合成并將其連接至pET28b的5’NdeI 和 3’XhoI克隆位點,構(gòu)建pET-28b-Mitogalig-Homo,預測其重組蛋白的分子量為28.351 kD(參見序列2和序列3,即人Gal3優(yōu)化后的ORF插入pET28b的5’NdeI 和 3’XhoI克隆位點及其重組蛋白的推導氨基酸序列)。按材料與方法所述進行重組蛋白誘導表達與檢測。SDS-PAGE結(jié)果表明,0.001mmol?L-1的IPTG不能誘導重組蛋白的表達,當IPTG濃度介于0.01-1mmol?L-1時,均在標準分子量25.0-35.0 kD之間出現(xiàn)明顯過量表達的蛋白,與預期28.351 kD基本吻合(參見圖1和圖2)。當IPTG介于達到0.1-1mmol?L-1時重組蛋白表達量沒有明顯區(qū)別。表達量亦隨誘導時間的延長發(fā)生改變,4h時表達量最佳。根據(jù)可溶性檢測結(jié)果表明,該重組蛋白主要分布于上清中,表明是水溶性蛋白(參見圖2)?;谏鲜龇治觯T導表達的最優(yōu)條件選擇為:37℃條件下,IPTG濃度為0.1mmol?L-1,誘導4 h。
以上內(nèi)容是結(jié)合本發(fā)明創(chuàng)造的優(yōu)選實施方式對所提供技術(shù)方案所作的進一步詳細說明,不能認定本發(fā)明創(chuàng)造具體實施只局限于上述這些說明,對于本發(fā)明創(chuàng)造所屬技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說,在不脫離本發(fā)明創(chuàng)造構(gòu)思的前提下,還可以做出若干簡單推演或替換,都應當視為屬于本發(fā)明創(chuàng)造的保護范圍。
SEQUENCE LISTING
<110> 浙江農(nóng)林大學
<120> 人Gal-3密碼子優(yōu)化及其重組蛋白誘導表達方法
<160> 3
<210> 1
<211> 753
<212> cDNA
<213> 人工序列
<220>
<222> (1)..(753)
<400> 1
Original:ATGGCAGACAATTTTTCGCTCCATGATGCGTTATCTGGGTCTGGAAACCCAAACCCTCAAGGATGGCCTGGCGCATGGGGGAACCAGCCT 90
Optimized:ATGGCAGATAATTTCTCGCTGCATGATGCGCTATCGGGCTCGGGAAATCCAAATCCACAAGGCTGGCCAGGCGCATGGGGCAATCAGCCA
Original:GCTGGGGCAGGGGGCTACCCAGGGGCTTCCTATCCTGGGGCCTACCCCGGGCAGGCACCCCCAGGGGCTTATCCTGGACAGGCACCTCCA 180
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Original:GGCGCCTACCATGGAGCACCTGGAGCTTATCCCGGAGCACCTGCACCTGGAGTCTACCCAGGGCCACCCAGCGGCCCTGGGGCCTACCCA 270
Optimized:GGCGCCTATCATGGCGCACCAGGCGCTTATCCAGGCGCACCAGCACCAGGCGTCTATCCAGGCCCACCAAGCGGCCCAGGCGCCTATCCA
Original:TCTTCTGGACAGCCAAGTGCCCCCGGAGCCTACCCTGCCACTGGCCCCTATGGCGCCCCTGCTGGGCCACTGATTGTGCCTTATAACCTG 360
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Original:AGAGGGAATGATGTTGCCTTCCACTTTAACCCACGCTTCAATGAGAACAACAGGAGAGTCATTGTTTGCAATACAAAGCTGGATAATAAC 540
Optimized:AGAGGCAATGATGTCGCCTTCCACTTCAATCCACGCTTCAATGAGAATAATCGGAGAGTCATCGTCTGCAATACCAAGCTGGATAATAAT
Original:TGGGGAAGGGAAGAAAGACAGTCGGTTTTCCCATTTGAAAGTGGGAAACCATTCAAAATACAAGTACTGGTTGAACCTGACCACTTCAAG 630
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Original:GTTGCAGTGAATGATGCTCACTTGTTGCAGTACAATCATCGGGTTAAAAAACTCAATGAAATCAGCAAACTGGGAATTTCTGGTGACATA 720
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Original:GACCTCACCAGTGCTTCATATACCATGATATAA 753
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<210> 2
<211> 813
<212> cDNA
<213> 人工序列
<400> 2
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<210> 3
<211> 271
<212> cDNA
<213> 人工序列
<400> 3
MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMADNFSLHDALSGSGNPNPQGWPGAWGNQP 50
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GPPSGPGAYPSSGQPSAPGAYPATGPYGAPAGPLIVPYNLPLPGGVVPRM 150
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ISKLGISGDIDLTSASYTMI 271