技術特征：

1.一種水稻抗褐飛虱基因Bph3的等位變異體Bph3^p，其特征在于：所述等位變異體Bph3^p的核苷酸序列如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示。

2.一種與Bph3或Bph3^p共分離的InDel分子標記In1，其特征如下：

前引物序列：5′-ATAGTGTATGAGGGTTGTTCTG-3′；

后引物序列：5′-CATTCAACTTGGCTACACCT-3′。

3.一種與Bph3或Bph3^p共分離的InDel分子標記In2，其特征如下：

前引物序列：5′-TATAGCCCTTGGAGAACG-3′；

后引物序列：5′-GATCATGTCAGGAGAACCC-3′。

4.一種可區(qū)分抗褐飛虱基因Bph3或Bph3^p的基因InDel分子標記InDel80，其特征如下：

前引物序列：5′-AGCAAGGATCATGTCAGGAG-3′；

后引物序列：5′-AGCAGGTAAGAGGAGGAGTT-3′。

5.一種水稻抗褐飛虱基因Bph3^p在水稻選育和抗稻飛虱選育中的應用。