本發(fā)明涉及一種GyV6新型環(huán)形病毒VP3蛋白的制備方法。此發(fā)明可直接提供VP3蛋白作為GyV6診斷抗原;作為免疫原獲得抗VP3多克隆抗體;為開展GyV6血清學(xué)流行病學(xué)調(diào)查及VP3功能研究提供有效免疫學(xué)試劑,填補國內(nèi)外空白。
背景技術(shù):
雞傳染性貧血病毒(Chicken Infectious Anemia Virus,CAV)一直被認為是圓環(huán)病毒科(Circoviridae)中環(huán)形病毒屬(Gyrovirus)唯一成員。直到2011年,Rijsewijk等從發(fā)病雞的血清樣品中檢測到新型環(huán)形病毒序列,即環(huán)形病毒屬中第二個成員,命名為AGV2。同年,Sauvage等在健康人的皮膚棉試樣品中檢測到首個與AGV2高度同源的人源環(huán)形病毒HGyV序列。自2012年,其它新型環(huán)形病毒包括GyV3,GyV4,GyV5,GyV6,GyV7,GyV8及GyV9被陸續(xù)發(fā)現(xiàn)鑒定,并具有潛在的公共衛(wèi)生意義。然目前尚無檢測GyV6抗原及其抗體的血清學(xué)方法。因此,對GyV6病毒早期表達蛋白VP3基因在體外進行克隆,構(gòu)建VP3表達載體,實現(xiàn)其表達,將為深入開展GyV6蛋白抗原及其抗體檢測、血清學(xué)調(diào)查,明確GyV6在雞群以及人群中的感染復(fù)制情況提供有效診斷試劑;并為探究GyV6VP3生物學(xué)功能具有重要意義。在傳統(tǒng)表達載體的構(gòu)建中,往往需要設(shè)計選擇限制性內(nèi)切酶酶切位點,通過酶切、連接的方法構(gòu)建載體,實現(xiàn)外源基因的表達。但有時由于找不到合適的酶切位點,往往導(dǎo)致克隆過程繁瑣,效率低下。本發(fā)明中將利用不依賴于酶切位點及限制性內(nèi)切酶的重組酶ExnaseTM II體外重組技術(shù)克隆GyV6病毒VP3基因,簡化克隆過程,實現(xiàn)VP3基因快速克隆表達。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種GyV6新型環(huán)形病毒VP3蛋白,實現(xiàn)VP3蛋白的表達。
本發(fā)明的原理和最核心的關(guān)鍵技術(shù)是科學(xué)地設(shè)計擴增出pGEX-6p-1線性化載體以及GyV6病毒VP3基因片段的引物,利用商品化的重組酶ExnaseTM II不經(jīng)酶切連接反應(yīng),直接在體外快速重組克隆VP3,轉(zhuǎn)化大腸桿菌,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)表達、實現(xiàn)GyV6的VP3蛋白與GST的融合表達,并獲得純化的VP3融合蛋白。
本發(fā)明所述的GyV6新型環(huán)形病毒VP3蛋白的制備方法,以pGEX-6p-1質(zhì)粒以及GyV6病毒VP3基因為模板,PCR分別擴增出含pGEX-6p-1線性化載體以及GyV6病毒VP3基因片段(附圖1,步驟1),并利用重組酶ExnaseTM II進行快速重組克隆(附圖1,步驟2);陽性克隆轉(zhuǎn)化到大腸桿菌,實現(xiàn)VP3蛋白表達(附圖1,步驟3)。
上述方法包括以下步驟:
1)利用下述引物,以pGEX-6p-1質(zhì)粒為模板,PCR擴增出pGEX-6p-1線性化表達載體;
上游引物:5‘TAATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGC3’(SEQ ID NO.1);;
下游引物:5‘CATGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGAT3’’(SEQ ID NO.2);
2)利用下述引物,以GyV6-VP3基因為模板,PCR擴增出VP3基因;
上游引物:5‘GTTCCAGGGGCCCATGTCAGAAAACACATC3’(SEQ ID NO.3);
下游引物:5‘GTTTTCACCGTCATTACAGTCTTAGGCCTC3’(SEQ ID NO.4);
3)利用重組酶ExnaseTM II對步驟1)和2)得到的PCR產(chǎn)物進行快速重組克??;陽性克隆經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后進行表達鑒定與純化。
本發(fā)明公開了PCR擴增pGEX-6p-1線性化載體引物以及PCR擴增GyV6病毒VP3基因引物序列。本發(fā)明還公開了一種基于重組酶ExnaseTM II將線性化的pGEX-6p-1線性化載體與GyV6病毒VP3基因片段PCR產(chǎn)物不經(jīng)酶切連接反應(yīng),直接重組克隆技術(shù);并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌,實現(xiàn)VP3蛋白表達。
本發(fā)明設(shè)計的引物及基于重組酶ExnaseTM II的克隆策略,可快速構(gòu)建GyV6病毒VP3基因的原核表達載體。本發(fā)明獲得的GyV6病毒VP3表達及純化的蛋白,可直接提供VP3蛋白作為GyV6診斷抗原;作為免疫原獲得抗VP3多克隆抗體;為開展GyV6流行病學(xué)調(diào)查提供有效診斷試劑;并為進一步探究VP3生物學(xué)功能具有重要意義。
附圖說明
圖1一種GyV6新型環(huán)形病毒VP3蛋白制備方法策略示意圖
步驟1:以人工合成的GyV6病毒VP3基因為模板,利用表1中引物,PCR分別擴增出含pGEX-6p-1線性化載體以及GyV6病毒VP3基因片段。
步驟2:利用重組酶ExnaseTM II進行快速重組克隆。
步驟3:陽性克隆轉(zhuǎn)化到大腸桿菌,實現(xiàn)VP3蛋白表達。
圖2 PCR擴增GyV6病毒VP3片段
泳道 1,GyV6病毒VP3片段PCR產(chǎn)物;泳道M,DNA Marker。
圖3 PCR擴增線性化載體pGEX-6p-1
泳道 1,線性化載體pGEX-6p-1的PCR產(chǎn)物;泳道M,DNA Marker。
圖4 SDS-PAGE分析GyV6病毒VP3基因的表達
泳道M,蛋白Marker;泳道1為GST-VP3上清;泳道2為GST-VP3沉淀;泳道3為pGEX6P-1空載體上清;泳道4為pGEX6P-1空載體沉淀;5為GST-VP3純化后產(chǎn)物。
圖5 Western blot鑒定抗AGV3VP3蛋白多克隆抗體
1,轉(zhuǎn)染EGFP-VP3表達質(zhì)粒的293T細胞裂解物;2,為轉(zhuǎn)染對照EGFP表達質(zhì)粒的293T細胞裂解物。
具體實施方式
為更好的理解本發(fā)明的內(nèi)容,以下實施方式結(jié)合附圖給出了GyV6新型環(huán)形病毒VP3蛋白制備的示例。
實施例
1)設(shè)計擴增含pGEX-6p-1線性化載體以及GyV6病毒VP3基因片段引物:擴增pGEX-6p-1線性化載體上游引物位于pGEX-6p-1質(zhì)粒1022-1047位;且在5’端帶有額外TAA堿基;擴增pGEX-6p-1線性化載體下游引物位于pGEX-6p-1質(zhì)粒916-941位;且在5’端帶有額外CAT堿基。擴增GyV6病毒VP3基因上游引物包括VP3基因起始密碼ATG及其后14個堿基,且在5’端帶有16個與pGEX-6p-1線性化載體下游引物反向互補堿基;擴增GyV6病毒VP3基因下游引物包括VP3基因終止密碼TAA及其前14個堿基,且在5’端帶有16個與pGEX-6p-1線性化載體上游引物反向互補堿基。具體引物序列如下,由Life Technologies上海賽默飛世爾科技公司合成。
pGEX-6p-1線性化表達載體引物:
上游引物:5‘TAATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGC3’(SEQ ID NO.1);
下游引物:5‘CATGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGAT3’’(SEQ ID NO.2);
GyV6-VP3基因引物:
上游引物:5‘GTTCCAGGGGCCCATGTCAGAAAACACATC3’(SEQ ID NO.3);
下游引物:5‘GTTTTCACCGTCATTACAGTCTTAGGCCTC3’(SEQ ID NO.4)。
2)pGEX-6p-1線性化載體以及GyV6病毒VP3基因片段PCR擴增:以pGEX-6p-1質(zhì)粒以及合成的GyV6VP3基因(GenBank:KF294862.1)為模版,表1所述引物為引物進行PCR擴增。如圖1中的步驟1。PCR擴增反應(yīng)體系為:40μl水,5μl 10倍緩沖液,1μl 10mM dNTP,1μl 10μmol上游引物,1μl 10μmol下游引物,1μl 10ng/μl的pGEX-6p-1質(zhì)?;騪cGyV6-VP3質(zhì)粒,1μl商品化的Phanta Super-Fidelity DNA聚合酶。PCR擴增反應(yīng)循環(huán)參數(shù)為:94℃變性5分鐘,隨后進行30個循環(huán)(94℃變性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸3分鐘),最后72℃延伸10分鐘。PCR結(jié)束后,PCR產(chǎn)物在1%的瓊脂糖凝膠中進行電泳。如圖2所示,其中泳道M為DNA Marker,其中泳道1為GyV6病毒VP3片段PCR產(chǎn)物。如圖3所示,其中泳道M為DNA Marker,泳道1為線性化載體pGEX-6p-1的PCR產(chǎn)物
3)GyV6病毒VP3片段快速克隆進pGEX-6p-1載體:將以上純化的表達線性化載體pGEX-6p-1以及GyV6病毒VP3片段PCR產(chǎn)物在商品化重組酶ExnaseTM II的作用下進行重組克隆。如圖1中的步驟2。具體重組反應(yīng)體系如下:純化的GyV6病毒VP3片段產(chǎn)物50-100ng,純化的pGEX-6p-1表達線性化載體50ng,2μl商品化的ExnaseTM II酶,4μl 5倍的緩沖液,其它補加水至20μl。反應(yīng)物于37℃作用30分鐘后,置冰上5分鐘。隨后將20μl反應(yīng)物轉(zhuǎn)化到常規(guī)感受態(tài)細菌,涂LB板。次日挑取細菌克隆進行質(zhì)粒制備,陽性克隆鑒定。
4)GyV6病毒VP3蛋白誘導(dǎo)表達及其純化:將獲得的含GyV6病毒VP3基因的陽性克隆(命名為pGEX-VP3)轉(zhuǎn)化BL21細菌,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)(0.1mmol/ml)后收集細菌,進行超聲(40赫茲)破碎。將超聲破碎樣品離心后分上清與沉淀進行SDS-PAGE(5%的濃縮膠,10%的分離膠)以及Western blot分析(以抗鼠源的GST單抗為一抗,羊抗鼠HRP標記的IgG為二抗)鑒定表達。在圖4中,VP3蛋白可在超聲破碎樣品上清中以可溶性形式存在。在確定VP3的可溶性表達基礎(chǔ)上,將超聲破碎樣品上清通過GST純化柱進行了VP3蛋白的純化。圖4中泳道5是VP3蛋白純化后SDS-PAGE分析結(jié)果。為進一步測定純化后蛋白的抗原性,評價其能否作為免疫原及診斷用抗原,將純化的VP3蛋白免疫小鼠,并通過western blot分析證明了獲得的抗GyV6病毒VP3蛋白的小鼠多抗能與在293T細胞中表達的VP3蛋白進行特異性反應(yīng)(圖5)。這一結(jié)果表明本發(fā)明表達的VP3蛋白具有很好的反應(yīng)性及免疫原性,在GyV6血清學(xué)診斷中將具有良好的應(yīng)用前景。