本發(fā)明涉及一種檢測玉米分子標(biāo)記的試劑盒,特別是涉及一種檢測玉米品種良玉88號純度的SSR分子標(biāo)記試劑盒。
背景技術(shù):
玉米是我國的重要作物,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中占有重要地位。玉米種子質(zhì)量直接影響產(chǎn)量,玉米種子純度是評價種子質(zhì)量的重要指標(biāo)。實踐中,我國玉米種子純度鑒定仍以籽粒形態(tài)鑒定、幼苗鑒定和田間小區(qū)種植鑒定為主體,輔以同工酶和蛋白質(zhì)電泳技術(shù)。
利用種子、幼苗或者株型等形態(tài)差異鑒定純度的方法費時費力、受環(huán)境和基因顯隱性等的影響較大,檢測結(jié)果易出現(xiàn)偏差。同工酶和蛋白質(zhì)電泳技術(shù)具有簡單、快速、成本低等優(yōu)點,然而,而且隨著玉米品種的數(shù)量逐年增多,種質(zhì)資源狹窄,同質(zhì)化問題愈顯突出,難以找到雜交種特征帶,難以進行有效的品種純度檢測。
利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對玉米品種純度鑒定的優(yōu)越性在于:(1)SSR分子標(biāo)記數(shù)量大,特異性高,可鑒定表型難于鑒別的品種;(2)SSR分子標(biāo)記不受任何環(huán)境因素的影響,可在生長發(fā)育的任何階段取材鑒定;(3)SSR分子標(biāo)記呈共顯性遺傳,操作靈活、簡便、快速,易于分析;(4)利用SSR分子標(biāo)記鑒定品種,不僅準(zhǔn)確可靠,而且還便于實現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化。
玉米品種良玉88號是丹東登海良玉種業(yè)有限公司于2008年遼寧省審定的品種,編號為遼審玉[2008]387號,是以M54為母本,以S122為父本組配而成的。幼苗葉鞘紫色、苗勢強。株型緊湊,株高302厘米,花絲淡紫色,花藥綠色。穗軸紅色,籽粒黃色。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種檢測玉米品種良玉88號純度的SSR分子標(biāo)記試劑盒,用以檢測玉米品種良玉88號的純度,可以及時準(zhǔn)確的檢測出純度結(jié)果,能夠減少假劣種子坑農(nóng)害農(nóng)案件的發(fā)生,保證糧食種植安全。
本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)的:
一種玉米品種良玉88號純度檢測的SSR分子標(biāo)記試劑盒,以玉米品種良玉88號及父母本雙親的基因組DNA為模板,通過對覆蓋全基因組200對SSR引物進行篩選,獲得兩對雙親互補特異性高、重復(fù)性好、結(jié)果穩(wěn)定的SSR引物,SEQ ID NO:1和2和SEQ ID NO:3和4。
SEQ ID NO:1 序列(5'→3') CGGAGGTCGTCAGATGGAGTTCGG
SEQ ID NO:2序列(5'→3') CCACGTACGGCAATGCAGACAAGG
SEQ ID NO:3 序列(5'→3') GATCCGCATTGTCAAATGACCAC
SEQ ID NO:4 序列(5'→3') AGGACACGCCATCGTCATCA
所述的一種玉米品種良玉88號純度檢測SSR分子標(biāo)記試劑盒,以玉米品種良玉88號的基因組DNA為模板,以SEQ ID NO:1和2或SEQ ID NO:3和4為SSR 特異性引物,進行 PCR擴增。
所述的一種玉米品種良玉88號純度檢測SSR分子標(biāo)記試劑盒,其PCR反應(yīng)體系總體積20μL,包括14.1μL超純水、2μL 10倍PCR緩沖液、1.2μL dNTPs(2.5mmol/L)、0.5μL SSR引物(0.25μmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)、2μL DNA,混勻。
所述的一種玉米品種良玉88號純度檢測SSR分子標(biāo)記試劑盒,其反應(yīng)程序為94℃預(yù)變性5min;94℃變性40s,60℃退火35s,72℃延伸45s,循環(huán)35次;72℃延伸5min;4℃保存。
所述的一種玉米品種良玉88號純度檢測的SSR分子標(biāo)記試劑盒,其純度結(jié)果通過帶型統(tǒng)計,用具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)占檢測樣品種子粒數(shù)的百分率表示。
試劑盒中還可包括抽提樣品DNA所需的各種試劑。這些試劑是本領(lǐng)域技術(shù)人員周知的。
本發(fā)明的優(yōu)點與效果是:
1.本發(fā)明在對覆蓋玉米全基因組的200對SSR引物進行篩選,獲得兩對雙親互補特異性高、重復(fù)性好、結(jié)果穩(wěn)定的SSR引物,由其兩對特異性引物和Taq酶等試劑開發(fā)出針對玉米品種良玉88號純度檢測的試劑盒,可以快速、準(zhǔn)確、簡便的檢測出玉米品種良玉88號的純度,為品種管理和市場監(jiān)管提供技術(shù)支撐,還對保證糧食種植安全具有一定的指導(dǎo)意義。
2.本發(fā)明的試劑盒具有快速、準(zhǔn)確、簡便等優(yōu)點,可以及時準(zhǔn)確的檢測出純度結(jié)果,能夠減少假劣種子坑農(nóng)害農(nóng)案件的發(fā)生,保證糧食種植安全,可為品種管理和市場監(jiān)管提供技術(shù)支撐。
附圖說明
圖1為本發(fā)明的SEQ ID NO:1和2擴增玉米品種良玉88號及父母本結(jié)果圖;
圖2為本發(fā)明的SEQ ID NO:3和4擴增玉米品種良玉88號及父母本結(jié)果圖。
具體實施方式
下面結(jié)合實施例對本發(fā)明進行詳細說明。
本發(fā)明的檢測方法為:
(1)玉米品種良玉88號基因組DNA提取 隨機數(shù)取100粒種子,采取CTAB法進行DAN提取。
(2)PCR擴增以SEQ ID NO:1和2或SEQ ID NO:3和4為SSR 特異性引物,配制20ul PCR反應(yīng)體系。
(3)PCR反應(yīng)體系總體積20μL,包括14.1μL超純水、2μL 10倍PCR緩沖液、1.2μL dNTPs(2.5mmol/L)、0.5μL SSR特異性引物(0.25μmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)、2μL DNA,混勻。
(4)反應(yīng)程序為94℃預(yù)變性5min;94℃變性40s,60℃退火35s,72℃延伸45s,循環(huán)35次;72℃延伸5min;4℃保存。
(5)電泳檢測對PCR產(chǎn)物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。
(6)純度結(jié)果通過帶型統(tǒng)計,用具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)占檢測樣品種子粒數(shù)的百分率表示。
實施例1
本實施例中用玉米品種良玉88號純度檢測SSR分子標(biāo)記試劑盒,檢測玉米品種良玉88號樣品A的純度。操作流程如下:
1)隨機數(shù)取玉米品種良玉88號樣品A100粒種子,采取CTAB法進行DAN提取。
(2)PCR擴增以SEQ ID NO:1和2為SSR 特異性引物,配制20ul PCR反應(yīng)體系。
(3)PCR反應(yīng)體系總體積20μL,包括14.1μL超純水、2μL 10倍PCR緩沖液、1.2μL dNTPs(2.5mmol/L)、0.5μL SSR特異性引物(0.25μmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)、2μL DNA,混勻。
(4)反應(yīng)程序為94℃預(yù)變性5min;94℃變性40s,60℃退火35s,72℃延伸45s,循環(huán)35次;72℃延伸5min;4℃保存。
(5)電泳檢測對PCR產(chǎn)物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。
(6)純度結(jié)果通過帶型統(tǒng)計,用具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)占檢測樣品種子粒數(shù)的百分率表示。
具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)為97,按公式:
玉米品種良玉88號樣品A純度為=97/100=97%。
實施例2
本實施例中用玉米品種良玉88號純度檢測SSR分子標(biāo)記試劑盒,檢測玉米品種良玉88號樣品B的純度。操作流程如下:
1)隨機數(shù)取玉米品種良玉88號樣品B100粒種子,采取CTAB法進行DAN提取。
(2)PCR擴增以SEQ ID NO:3和4為SSR 特異性引物,配制20ul PCR反應(yīng)體系。
(3)PCR反應(yīng)體系總體積20μL,包括14.1μL超純水、2μL 10倍PCR緩沖液、1.2μL dNTPs(2.5mmol/L)、0.5μL SSR特異性引物(0.25μmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)、2μL DNA,混勻。
(4)反應(yīng)程序為94℃預(yù)變性5min;94℃變性40s,60℃退火35s,72℃延伸45s,循環(huán)35次;72℃延伸5min;4℃保存。
(5)電泳檢測對PCR產(chǎn)物進行聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測。
(6)純度結(jié)果通過帶型統(tǒng)計,用具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)占檢測樣品種子粒數(shù)的百分率表示。
具有本品種特異帶型的種子粒數(shù)為94,按公式:
玉米品種良玉88號樣品A純度為=94/100=94%。