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H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒的制作方法

文檔序號(hào):458855閱讀:252來源:國知局
H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,旨在提供一種操作簡便、靈敏快捷的H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒;其技術(shù)要點(diǎn)包括:1)等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液、陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品,2)分隔并集中包裝這些試劑瓶或管的包裝盒;所述的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液由等溫?cái)U(kuò)增緩沖液、反應(yīng)酶、正、反向引物、分子信標(biāo)組成;其中:正向引物的堿基序列為GACACTATCAAGAGTTGGAGAAA;反向引物的堿基序列為AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGACTTGGTCCATCGGTCATTA;分子信標(biāo)的堿基序列為CGAACCAAGAGTCTGAATGTGCCTGTGTAAATGGTTCG,3)可用于熒光定量PCR儀的實(shí)時(shí)檢測和手持式熒光檢測儀的終點(diǎn)檢測。
【專利說明】H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001 ] 本發(fā)明公開了一種檢測流感病毒的試劑盒,具體地說,是一種檢測Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增的試劑盒。
【背景技術(shù)】
[0002]流行性感冒簡稱流感,主要是指人群中,由普通流感病毒引起的一種病毒性急性呼吸道傳染病。流感傳染性強(qiáng),傳染迅速,會(huì)導(dǎo)致每年的流行,并且歷史上每隔幾十年會(huì)造成流感大流行,在短時(shí)間內(nèi)使很多人患病甚至死亡。流感病毒可分為甲(A)、乙(B)、丙(C)三型。其特點(diǎn)是容易發(fā)生變異,其中甲型流感病毒最容易發(fā)生變異,可感染人和多種動(dòng)物,為人類流感的主要病原,常引起大流行和中小流行。對(duì)流感疫情的防控最根本的途徑就是早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療和切斷傳染源。由此可見,快速靈敏的流感病毒檢測技術(shù)成為了保護(hù)人民生命健康、防控疫情在國內(nèi)大范圍流行的第一道屏障。[0003]現(xiàn)有的快速檢測技術(shù)主要有兩類:第一類為免疫學(xué)方法,包括酶聯(lián)免疫吸附法、免疫熒光法、同位素標(biāo)記抗體法、乳膠凝集法、免疫傳感器法、免疫擴(kuò)散法及免疫色譜法等;第二類是以核酸為基礎(chǔ)的分子生物學(xué)方法,主要有核酸探針法和聚合酶鏈反應(yīng)法(Polymerase Chain Reaction, PCR)。其中的PCR方法是核酸擴(kuò)增技術(shù)的典型代表,該技術(shù)是由美國PE-Cetus公司人類遺傳研究室的Mul I in等人于1985年發(fā)明的,在過去的二十年里,PCR技術(shù)作為分子生物學(xué)的核心得到了迅猛的發(fā)展和應(yīng)用,特別是在疾病的臨床診斷中,PCR技術(shù)以其快速、靈敏和特異的優(yōu)勢,不僅日益取代了傳統(tǒng)的診斷方法,而且使以往無法完成的診斷成為了可能。
[0004]盡管PCR技術(shù)長期以來占據(jù)著核酸擴(kuò)增壟斷技術(shù)的地位,新近研發(fā)的一系列等溫核酸擴(kuò)增檢測技術(shù)正逐漸成為PCR技術(shù)的替代技術(shù)而被廣泛應(yīng)用。與PCR技術(shù)相比,核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的特點(diǎn)是可在特定溫度條件下實(shí)現(xiàn)核酸的擴(kuò)增。由于擴(kuò)增反應(yīng)的全過程均在同一溫度下進(jìn)行,使它們對(duì)儀器的要求大大簡化,可通過加熱模塊、水浴槽等簡單的,甚至是非專業(yè)的設(shè)備完成反應(yīng)。目前常用的等溫技術(shù)有以下幾類:
[0005]1、依賴核酸序列擴(kuò)增(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)2、自主序列復(fù)制(Self-sustained Sequence Replication, 3SR)
[0006]3、轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)擴(kuò)增(Transcription mediated amplification, TMA)
[0007]4、單引物等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(Single Primer Isothermal Amplification, SPIA)
[0008]5、滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)(rolling circle amplification, RCA)
[0009]6、環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)
[0010]7、鏈替代擴(kuò)增技術(shù)(Strand displacement amplification, SDA)
[0011]這些核酸擴(kuò)增技術(shù)(PCR技術(shù)、等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)等)的擴(kuò)增產(chǎn)物為DNA或RNA,與之相對(duì)應(yīng)的擴(kuò)增產(chǎn)物檢測方法主要有以下幾種:
[0012]電泳分析:常規(guī)變性凝膠電泳后用EB或SYBR Green I染色,在1%_1.5%瓊脂糖凝膠中可以輕易識(shí)別。目前該方法已很少使用;[0013]雜交技術(shù):產(chǎn)物通過與特異性探針標(biāo)記的序列雜交,如32P標(biāo)記的寡核苷酸序列與擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行Northern雜交以檢測擴(kuò)增產(chǎn)物;
[0014]酶聯(lián)凝膠(enzyme-1 inked gel assay,ELGA)技術(shù):用非放射性的辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的探針檢測擴(kuò)增產(chǎn)物。未雜交的探針通過在垂直凝膠電泳中得以分離,然后將凝膠置于有HRP底物的溶液中孵育,則可目測反應(yīng)結(jié)果;
[0015]電化學(xué)發(fā)光(electrochemiluminescence, ECL)技術(shù):5’端標(biāo)記有生物素的捕獲探針將擴(kuò)增產(chǎn)物固定在鏈霉親和素結(jié)合的磁珠上,下游引物的5’末端含有和釘標(biāo)電化學(xué)發(fā)光檢測探針互補(bǔ)的序列。擴(kuò)增產(chǎn)物與ECL探針形成復(fù)合物,攜帶該復(fù)合物的磁珠被電極的表面磁性捕獲。電極上的電壓引起電化學(xué)發(fā)光(ECL)反應(yīng)。已雜交上的釘標(biāo)磁珠發(fā)出的光和擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)生的RNA擴(kuò)增產(chǎn)物總量成比例對(duì)應(yīng),由此可以對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測和定量;
[0016]分子信標(biāo)技術(shù):分子信標(biāo)是根據(jù)核酸堿基配對(duì)原則和熒光共振能量轉(zhuǎn)移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)現(xiàn)象設(shè)計(jì)的。分子信標(biāo)為一莖環(huán)結(jié)構(gòu)的寡核苷酸探針,其環(huán)狀區(qū)核苷酸序列長度一般為15~30個(gè)堿基,能與目標(biāo)序列互補(bǔ),靠近兩端的部分序列構(gòu)成分子信標(biāo)的莖干區(qū),大約有6-8個(gè)堿基對(duì),兩端分別標(biāo)記熒光基團(tuán)(f luorophore )和淬滅基團(tuán)(quencher )。沒有目標(biāo)序列存在時(shí),分子信標(biāo)保持莖環(huán)結(jié)構(gòu),突光基團(tuán)與淬滅基團(tuán)靠近,此時(shí)發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移,使熒光基團(tuán)發(fā)出的熒光被猝滅基團(tuán)吸收并以熱的形式散發(fā),熒光幾乎完全被猝滅,熒光本底極低。當(dāng)目標(biāo)序列存在時(shí),分子信標(biāo)與序列完全互補(bǔ)的靶序列結(jié)合形成雙鏈雜交體時(shí),信標(biāo)莖干互補(bǔ)區(qū)被拉開,熒光基團(tuán)和猝滅基團(tuán)距離增大,熒光產(chǎn)生。在核酸擴(kuò)增體系中應(yīng)用分子信標(biāo)可隨著擴(kuò)增的進(jìn)行,均一地產(chǎn)生熒光信號(hào),使分子信標(biāo)的環(huán)狀序列不斷與擴(kuò)增子雜交產(chǎn)生熒光信號(hào)進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測。分子信標(biāo)中常用4- (4’ - 二甲基氨基偶氮苯基)苯甲酸(DABCYL)作為淬滅基團(tuán),德克薩斯紅(TexasRed)、突光素(Fluoresein)等作為突光基團(tuán)。
[0017]其中基于T7RNA聚合酶、AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、分子信標(biāo)及RNA酶H的NASBA等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)因其靈敏度高、特異性強(qiáng)、可對(duì)核酸進(jìn)行實(shí)時(shí)測定而得到了一定的運(yùn)用。但是目前的NASBA等溫?cái)U(kuò)增結(jié)果檢測需要在價(jià)格昂貴的熒光定量PCR儀上進(jìn)行,目前我國裝備有大型熒光定量PCR儀的實(shí)驗(yàn)室及醫(yī)院有限,不能滿足口岸、基層和偏遠(yuǎn)地區(qū)對(duì)于流感病毒檢測的需求。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0018]針對(duì)上述問題,本發(fā)明的目的在于提供一種操作簡便、價(jià)格低廉的手Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒。
[0019]為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明提供的技術(shù)方案是這樣的:該Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,包括:1)等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液、陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品,和2)分隔并集中包裝這些試劑瓶或管的包裝盒;所述的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液由等溫?cái)U(kuò)增緩沖液、反應(yīng)酶、正、反向引物、分子信標(biāo)組成;
[0020]所述的正向引物、反向引物;其中正向引物的堿基序列如其中:
[0021] 所述的正向引物的堿基序列SEQ ID N0.1為:
[0022]GACACTATCAAGAGTTGGAGAAA ;
[0023]所述的反向引物的堿基序列為SEQ ID N0.2為:
[0024]AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGACTTGGTCCATCGGTCATTA ;[0025]所述的分子信標(biāo)的堿基序列為SEQ ID N0.3為:
[0026]CGAACCAAGAGTCTGAATGTGCCTGTGTAAATGGTTCG。
[0027]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的等溫?cái)U(kuò)增緩沖液包括TrisHCl 40mM、KCl 50mM, MgCl2 12mM, DTT IOmM,dNTP ImM, rNTP 2mM,山梨糖醇 375mM。
[0028]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的反應(yīng)酶由T7 RNA聚合酶、AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶H組成。
[0029]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品為重組質(zhì)粒pET_32a0
[0030]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品的濃度為IO5Copies/ 反應(yīng)~IO2Copies/ 反應(yīng)。
[0031]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的T7RNA聚合酶的酶活力32U,AVM聚合酶的酶活力6.4U、RNA酶H的酶活力0.08U。
[0032]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的分子信標(biāo)熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM,熒光淬滅基團(tuán)為BHQ1。 [0033]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的分子信標(biāo)使用濃度為ΙΟΟηΜ。
[0034]上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)的條件為:65°C 5min、42°C 5min預(yù)處理,加入酶液42V反應(yīng)90分鐘。
[0035]進(jìn)一步的,上述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建方法是采用PCR方法對(duì)Hl型流感病毒cDNA模板進(jìn)行擴(kuò)增,得到所需的Hl型流感病毒NA基因序列,序列片段經(jīng)雙酶切后與相應(yīng)雙酶切pET-32a質(zhì)粒載體進(jìn)行連接,用氯化鈣法轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑選陽性克隆,提取質(zhì)粒,并進(jìn)行PCR驗(yàn)證以獲得所需的陽性質(zhì)控樣品。
[0036]與現(xiàn)有現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明提供的技術(shù)方案具有如下優(yōu)點(diǎn):
[0037]1、本發(fā)明涉提供的技術(shù)方案通過設(shè)計(jì)莖干區(qū)與目標(biāo)序列部分互補(bǔ)的分子信標(biāo),提高檢測結(jié)果信噪比,在滿足實(shí)時(shí)熒光檢測的同時(shí),通過結(jié)合手持式熒光檢測儀,實(shí)現(xiàn)了對(duì)于NASBA擴(kuò)增結(jié)果的終點(diǎn)檢測,檢測靈敏度達(dá)到了熒光定量PCR水平,能廣泛運(yùn)用于口岸、基層和偏遠(yuǎn)地區(qū)這些缺乏大型熒光定量PCR儀而人群密度又較大的場所對(duì)Hl型流感病毒檢測的需求;
[0038]2、本發(fā)明提供的技術(shù)方案采用特異引物及分子信標(biāo)在恒溫條件下對(duì)Hl型流感病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)或終點(diǎn)檢測的試劑盒,具有特異性強(qiáng)、靈敏度高、快速、操作簡單方便等優(yōu)點(diǎn),可作為Hl型流感病毒檢測的試劑,用于科研及臨床應(yīng)用。
[0039]3、閉管檢測不需后處理,避免了由于樣本間的交叉污染引起的假陽性和環(huán)境污染。
[0040]4、本發(fā)明涉及的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒可作為Hl型流感病毒檢測的試劑,用于科研及臨床應(yīng)用。
【專利附圖】

【附圖說明】
[0041]圖1構(gòu)建的陽性質(zhì)控樣品電泳結(jié)果。
[0042]圖2H1型流感等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒實(shí)時(shí)檢測結(jié)果;
[0043]圖3H1型流感等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒終點(diǎn)檢測結(jié)果。【具體實(shí)施方式】
[0044]本實(shí)施例在以本發(fā)明技術(shù)方案為前提下進(jìn)行實(shí)施,下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,例如Sambrook等分子克隆:實(shí)驗(yàn)室手冊(New YorkiColdSpring Harbor Laboratory Press, 1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。本發(fā)明給出了詳細(xì)的實(shí)施方式和具體的操作過程,但保護(hù)范圍不限于下述的實(shí)施例。
[0045]1、根據(jù)待檢目標(biāo)的序列特征,設(shè)計(jì)相應(yīng)檢測引物序列。
[0046]所述的待檢目標(biāo)的序列特征,具體為:待檢序列的GC含量、序列保守性及序列二級(jí)結(jié)構(gòu)等特征。
[0047]所述的引物序列特征,具體為:針對(duì)目標(biāo)序列設(shè)計(jì)的兩條核酸序列,具有物種特異性及高的擴(kuò)增效率,其中一條含T7 RNA聚合酶啟動(dòng)序列。
[0048]2、根據(jù)待檢目標(biāo)的序列特征,設(shè)計(jì)相應(yīng)分子信標(biāo)的環(huán)狀區(qū)序列。
[0049]所述的待檢目標(biāo)的序列特征,具體為:待檢序列的GC含量、序列保守性及序列二級(jí)結(jié)構(gòu)等特征;
[0050]所述的設(shè)計(jì)相應(yīng)分子信標(biāo)的環(huán)狀區(qū)序列,具體為:選擇待檢序列中GC含量在20%和80%之間、序列保守性高同時(shí)具有最小二級(jí)結(jié)構(gòu)的片段作為分子信標(biāo)的環(huán)狀區(qū)序列,序列長度在10~45堿基之間;
[0051]3、設(shè)計(jì)合適的分子信標(biāo)莖干區(qū),并選擇相應(yīng)的標(biāo)記基團(tuán)。
[0052]所述的設(shè)計(jì)合適的分子信標(biāo)莖干區(qū),具體為:所設(shè)計(jì)的分子信標(biāo)莖干區(qū)序列為互相完全配對(duì)的兩段核酸序列,莖干區(qū)序列部分序列與環(huán)狀區(qū)序列一起作為目標(biāo)雜交區(qū)域,其Tm值應(yīng)該比體系反應(yīng)溫度高5°C以上,且不與環(huán)狀區(qū)序列形成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu),分子信標(biāo)莖干區(qū)序列長度為5~10個(gè)堿基對(duì)。
[0053]所述的選擇相應(yīng)的標(biāo)記基團(tuán),具體為:分子信標(biāo)的信號(hào)產(chǎn)生機(jī)制可以分為熒光共振能量轉(zhuǎn)移、波長紅移、金屬淬滅、接觸淬滅、酶促反應(yīng)及電化學(xué)反應(yīng)等。每種分子信標(biāo)可根據(jù)需要偶聯(lián)多個(gè)熒光基團(tuán)或淬滅基團(tuán),另外還有生物素、辣根過氧化物酶、地高辛、抗原、半抗原、抗體、量子點(diǎn)、二茂鐵及納米金顆粒等標(biāo)記的分子信標(biāo)。本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以根據(jù)具體的檢測需要選擇合適的標(biāo)記。
[0054]4、構(gòu)建陽性質(zhì)控樣品
[0055]所述的陽性質(zhì)控樣品,具體為包含有EV71 VPl基因序列的pET_32a質(zhì)粒。采用PCR技術(shù)對(duì)EV71 cDNA模板進(jìn)行擴(kuò)增,得到所需的EV71 VPl基因序列(如SEQ ID N0.4所示),序列片段經(jīng)雙酶切后與相應(yīng)雙酶切pET-32a質(zhì)粒載體進(jìn)行連接,用氯化鈣法轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑選陽性克隆,并進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證以獲得所需的陽性質(zhì)控樣品,圖中陽性質(zhì)控樣品PCR結(jié)果表明目標(biāo)片段已正確連接入質(zhì)粒載體(結(jié)果如附圖1所示)。
[0056]5、選擇合適的鎖核酸分子信標(biāo)濃度、引物濃度、二硫蘇糖醇(DTT)濃度、K+和Mg2+離子濃度用于等溫?cái)U(kuò)增。
[0057]所述的合適的分子信標(biāo)使用濃度,具體為:根據(jù)等溫?cái)U(kuò)增體系的需要,通過梯度稀釋的鎖核酸分子信標(biāo)(50nM - 500nM),選擇合適的分子信標(biāo)濃度,以獲得最佳的信噪比。
[0058] 所述的合適的引物使用濃度,具體為:根據(jù)等溫?cái)U(kuò)增體系的需要,通過添加不同濃度的引物(50nM - 500nM),以獲得最佳的信噪比。[0059]所述的合適的DTT使用濃度,具體為:根據(jù)等溫?cái)U(kuò)增體系的需要,通過添加不同濃度的DTT (ImM -1OmM),以獲得最佳的信噪比。
[0060]所述的合適的K+使用濃度,具體為:根據(jù)等溫?cái)U(kuò)增體系的需要,通過添加不同濃度的K+ (IOmM-1OOmM),以獲得最佳的信噪比。
[0061]所述的合適的Mg2+使用濃度,具體為:根據(jù)等溫?cái)U(kuò)增體系的需要,通過添加不同濃度的Mg2+ (5mM - 25mM),以獲得最佳的信噪比。
[0062]在本發(fā)明所述的技術(shù)方案中:可以通過熒光識(shí)別儀、質(zhì)譜、凝膠電泳、分子夾、序列分析、DNA/RNA傳感器、檢驗(yàn)層析試紙條、微陣列系統(tǒng)或變色反應(yīng)等方式檢測分子信標(biāo)產(chǎn)生的信號(hào),其檢測方式可以是實(shí)時(shí)檢測也可以是終點(diǎn)檢測。
[0063]實(shí)施例1:H1型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒及其使用
[0064]1、制備包括下列組成成分的試劑盒:等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液I管,引物探針混合液I管,T7 RNA聚合酶、AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶H混合液I管,陽性質(zhì)控樣品I管。
[0065]2、樣本采集:流感病毒樣本采集遵循一般病原體采集程序,采集如下標(biāo)本:包括咽拭子、鼻咽拭子、氣管吸取物。標(biāo)本應(yīng)置于無菌病毒采樣液。
[0066]存放:保存在4°C (不能超過4天)或者_(dá)70°C或_70°C以下。
[0067]3、樣品處理及RNA提取:等溫?cái)U(kuò)增效能依賴于樣品RNA的質(zhì)與量。用戶可采用通用型病毒RNA提取試劑盒提取病毒RNA用于檢測或保存于_20°C (_70°C更佳)以待檢測。
[0068]4、等溫?cái)U(kuò)增及檢測
[0069]4.1試劑準(zhǔn)備:
[0070]將試劑盒中的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液、引物探針混合液、陽性質(zhì)控樣品及RNase FreedH20進(jìn)行解凍。按標(biāo)本的數(shù)量(η)個(gè)加上陽性對(duì)照(I個(gè))、陰性對(duì)照(I個(gè))和空白對(duì)照(I個(gè),RNase Free dH20)的數(shù)量進(jìn)行等溫反應(yīng)液的配制,共(n+4)個(gè),配制方法如下:
[0071]
【權(quán)利要求】
1.一種Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,包括:1)等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液、陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品,和2)分隔并集中包裝這些試劑瓶或管的包裝盒;其特征在于,所述的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)液由等溫?cái)U(kuò)增緩沖液、反應(yīng)酶、正、反向引物、分子信標(biāo)組成; 所述的正向引物、反向引物;其中正向引物的堿基序列如其中: 所述的正向引物的堿基序列SEQ ID N0.1為:
GACACTATCAAGAGTTGGAGAAA ; 所述的反向引物的堿基序列為SEQ ID N0.2為:
AATTCTAATACGACTCACTATAGGGAGACTTGGTCCATCGGTCATTA ; 所述的分子信標(biāo)的堿基序列為SEQ ID N0.3為:
CGAACCAAGAGTCTGAATGTGCCTGTGTAAATGGTTCGo
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的等溫?cái)U(kuò)增緩沖液包括 Tris HCl 40mM、KCl 50mM, MgCl2 12mM,DTT IOmM, dNTP ImM, rNTP 2mM,山梨糖醇375mM。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的反應(yīng)酶由T7RNA聚合酶、AMV逆轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶H組成。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品為重組質(zhì)粒pET-32a。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品的濃度為IO5Copies/反應(yīng)~IO2Copies/反應(yīng)。
6.根據(jù)權(quán)利要求3所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的T7RNA聚合酶的酶活力32U,AVM聚合酶的酶活力6.4U、RNA酶H的酶活力0.08U。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的分子信標(biāo)熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM,熒光淬滅基團(tuán)為BHQl。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的分子信標(biāo)使用濃度為ΙΟΟηΜ。
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)的條件為:65°C 5min、42°C 5min預(yù)處理,加入酶液42°C反應(yīng)90分鐘。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的Hl型流感病毒等溫?cái)U(kuò)增檢測試劑盒,其特征在于,所述的陽性質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建方法是采用PCR方法對(duì)Hl型流感病毒cDNA模板進(jìn)行擴(kuò)增,得到所需的Hl型流感病毒NA基因序列,序列片段經(jīng)雙酶切后與相應(yīng)雙酶切pET-32a質(zhì)粒載體進(jìn)行連接,用氯化鈣法轉(zhuǎn)化大腸桿菌,挑選陽性克隆,提取質(zhì)粒,并進(jìn)行PCR驗(yàn)證以獲得所需的陽性質(zhì)控樣品。
【文檔編號(hào)】C12Q1/70GK103911460SQ201310625455
【公開日】2014年7月9日 申請日期:2013年11月28日 優(yōu)先權(quán)日:2013年11月28日
【發(fā)明者】彭濤, 龍飛, 蘇文瀚, 肖靜, 殷仙麗, 盧然如 申請人:中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院, 佛山市燁泰科技有限公司
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