專(zhuān)利名稱(chēng)：與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記SIsv0115的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域，涉及一種分子標(biāo)記，具體地，涉及一種與谷子株高基 因緊密連鎖的分子標(biāo)記。本發(fā)明還涉及該分子標(biāo)記的引物、該分子標(biāo)記在谷子株高基因定 位或谷子遺傳育種中的用途、一種谷子株高基因定位方法、以及一種谷子育種方法。
背景技術(shù)：
谷子(Setaria italica L. Beauv.)是起源于我國(guó)的重要糧食作物，主要在我國(guó)的 北方種植，在國(guó)家糧食生產(chǎn)和糧食安全中占有較為重要的地位。谷子是二倍體自花授粉作 物，其基因組較小，約470Mb，這些特性使其很適合作為基因組研究的對(duì)象。目前，遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建已成為基因定位、圖位克隆以及基因組結(jié)構(gòu)與功能研 究的重要基礎(chǔ)。而分子標(biāo)記又是構(gòu)建遺傳連鎖圖譜的基礎(chǔ)。株高作為關(guān)系到作物高產(chǎn)和穩(wěn) 產(chǎn)的重要農(nóng)藝性狀，直接關(guān)系到品種的株型、抗倒伏性、區(qū)域布局和產(chǎn)量構(gòu)成性狀。因此，迫 切需要發(fā)現(xiàn)與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明人依據(jù)全基因組序列，經(jīng)過(guò)大量的實(shí)驗(yàn)和不懈的努力，提供了一種與谷子 (Setaria italica L. Beauv.)株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記SIsvO 115，并由此提供了下述 發(fā)明本發(fā)明的一個(gè)方面涉及一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記SIsv0115，其核 苷酸序列如seq id n0:1所示。其中加邊框部分為引物設(shè)計(jì)區(qū)段688bp
權(quán)利要求
1. 一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記，其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示；或 者其為含有SEQ ID NO :1所示核苷酸序列的DNA片段。
2. 一種重組載體，其含有權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記。
3. —種重組細(xì)胞，其含有權(quán)利要求2所述的重組載體。
4.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的引物，其核苷酸序列如SEQIDNO 2和SEQ ID NO 3 所示。
5.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的制備方法，包括下述步驟使用非矮株型的谷子的基因組DNA作為模板，以權(quán)利要求4所述的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增； 優(yōu)選地，還包括將PCR擴(kuò)增的產(chǎn)物進(jìn)行純化的步驟；具體地，所述非矮株型的谷子為張谷1 號(hào)、張雜谷3號(hào)、或張雜谷3號(hào)自交產(chǎn)生的F2代中的非矮株型。
6.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的檢測(cè)方法，包括下述步驟(1)根據(jù)權(quán)利要求1的分子標(biāo)記的核苷酸序列設(shè)計(jì)引物；(2)以被檢測(cè)谷子的基因組DNA作為模板進(jìn)行擴(kuò)增；(3)判斷擴(kuò)增產(chǎn)物中是否存在該分子標(biāo)記。
7.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記在谷子株高基因定位或檢測(cè)中的用途。
8. 一種谷子株高基因定位的方法，包括使用權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的步驟。
9.權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記在谷子輔助育種中的用途。
10. 一種谷子輔助育種方法，包括檢測(cè)權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的步驟。
全文摘要
本發(fā)明屬于分子生物學(xué)領(lǐng)域，涉及一種分子標(biāo)記，具體地，涉及一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記，其核苷酸序列如SEQ IDNO1所示，或者其為谷子基因組中含有SEQ ID NO1所示核苷酸序列的DNA片段。本發(fā)明還涉及該分子標(biāo)記的引物、該分子標(biāo)記在谷子株高基因定位或谷子遺傳育種中的用途、一種谷子株高基因定位方法、以及一種谷子育種方法。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了與谷子株高基因緊密連鎖的分子標(biāo)記SIsv0115，將谷子基因組DNA序列與谷子株高基因聯(lián)系起來(lái)，更有利于谷子分子標(biāo)記輔助育種體系的建立。
文檔編號(hào)C12N1/21GK102002497SQ20101055330
公開(kāi)日2011年4月6日 申請(qǐng)日期2010年11月22日 優(yōu)先權(quán)日2010年11月22日
發(fā)明者全志武, 夏秋菊, 張耕耘, 彭小華 申請(qǐng)人:深圳華大基因科技有限公司