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Sec2超抗原基因工程肽及其編碼基因和異源表達方法

文檔序號:441751閱讀:324來源:國知局
專利名稱:Sec2超抗原基因工程肽及其編碼基因和異源表達方法
技術領域
本發(fā)明涉及基因工程肽的基因克隆和異源表達,具體說是一系列具冇 SEC2超抗原活性的基因工程肽、及其編碼基因的制備和異源表達。
背景技術
超抗原(superantigen, SAg)是一組由細菌或病毒編碼的蛋白質分子, 可以極低濃度(l 10ng/mL)刺激大部分T細胞增生,具有超強的增強機 體免疫反應功能和一定的抗腫瘤活性。因此,超抗原是一種極好的免疫調 節(jié)劑和增效劑,可望被開發(fā)成潛在的新型抗腫瘤藥物,用于腫瘤治療。
金黃色葡萄球菌腸毒素(Staphylococcal enterotoxins, SEs)是一類 具有代表性的微生物外毒素。由于其極強的T細胞激活功能,成為一類典 型微生物超抗原,受到人們的廣泛重視。近年來,人們在對金黃色葡萄球 菌腸毒素(SE)結構、免疫學功能及其抗腫瘤等進行了大量研究工作,其 中主要集中在對SEA\SEB等的研究方面。我所在世界上首次對SEC2的基 因進行了克隆、測序并在靶向融合蛋白研究方面取得了開創(chuàng)性成果,為進 一步開展腸毒素C2 (SEC2)分子改造及其靶向融合蛋白的研發(fā)奠定了基礎。
實驗腫瘤學研究顯示利用SEC2作為腫瘤治療的超抗原藥物具有其它藥 物不可比擬的優(yōu)點SEC2較能抗消化并且耐熱以及只需使用很小的劑量就 可引發(fā)T細胞應答和明顯的腫瘤抑制效應。盡管如此,在臨床使用過程中 還不完全盡如人意。1)作為潛在腸胃毒素可引起伴隨著嘔吐和嚴重腹瀉等 毒副作川;2) SEC2超抗原對腫瘤細胞作用位點缺乏靶向性,在增強機體 免疫功能抑制腫瘤細胞生長的同時,可能對人體正常細胞產生細胞毒作HJ; 劑量過大或應用不當亦可產生免疫耐受;3)作為潛在的臨床開發(fā)藥物,超 抗原SEC2分子量過大(約為27.6kD),不易于靜脈注射和人體吸收。這些 問題限制了其在臨床上的應用。因此,如何避免不利義素因素,充分利用 其強大的免疫功能,對于探索SEC2在抗腫瘤、甚至抗病毒中的作用,具有 非常重要的意義。
針對超抗原SEC2實際臨床應用中所面臨的毒性效應、缺乏靶向性以及 分子量偏大等問題,本發(fā)明根據金黃色葡萄球菌基因組、生物信息學等理 論,利用現(xiàn)代分子生物學技術實現(xiàn)SEC2蛋白分子的定向改造,以獲得--系 列具有超抗原活性的基因工程多肽,這種經遺傳改造的超抗原基因工程肽 對于擴大其臨床應用范圍,改善療效、降低毒副作川具有重要的實踐意義,
;i有潛在的幵發(fā)應用前景。

發(fā)明內容
本發(fā)明涉及SEC2超抗原基因工程肽及其編碼基因和異源表達方法,其為一系列
具有超抗原活性的基因工程肽,利用本發(fā)明可以在人工控制的條件下,大 量獲得高純度的具有超抗原活性的基因工程肽。
為實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明的技術方案如下
SEC2超抗原基因工程肽分別為下列任意氨基酸序列之--,
SEC2-1具有序列表SEQ ID N0: 2中氨基酸序列;
SEC2-2具有序列表SEQ ID NO: 4中氨基酸序列;
SEC2-3具有序列表SEQ ID NO: 6中氨基酸序列;
SEC2-4具有序列表SEQ ID NO: 8中氨基酸序列; -
SEC2-5具有序列表SEQ ID NO: 10中氨基酸序列;
SEC2-6具有序列表SEQ ID NO: 12中氨基酸序列;
SEC2-7具有序列表SEQ ID NO: 14中氨基酸序列;
SEC2-8具有序列表SEQ ID NO: 16中氨基酸序列;
SEC2-9具有序列表SEQ ID NO: 18中氨基酸序列;
SEC2-10具有序列表SEQ ID NO: 20中氨基酸序列;
SEC2-11具有序列表SEQ ID NO: 22中氨基酸序列;
SEC2-12具有序列表SEQ ID NO: 24中氨基酸序列;
SEC2-13具有序列表SEQ ID NO: 26中氨基酸序列;
或SEC2-14具有序列表SEQ ID NO: 28屮氨基酸序列。
所述基因工程肽的編碼基因分別對應于下列核苷酸序列之 ,
SEC2-1對應的基因具有序列表SEQIDNO:1 1中堿基序列;
SEC2-2對應的基因具有序列表SEQIDNO:3 '中堿基序列;
SEC2-3對應的基因具有序列表SEQIDNO:5中堿基序列;
SEC2-4對應的基因具有序列表SEQIDNO:7中堿基序列;
SEC2-5對應的基因具有序列表SEQIDNO:9中堿基序歹lj;
SEC2-6對應的基因具有序列表SEQIDNO:11中堿基序列;
SEC2-7 X寸應的基因具有序列表SEQID NO:13中堿基序列;
SEC2-8對應的基因具有序列表SEQIDNO:15中堿基序歹'J;
SEC2-9對應的基因具有序列表SEQIDNO:17中堿基序列;
SEC2-10對應的基因具有序列表SEQ ID NO: 19屮堿基序列; SEC2-11對應的基因具有序列表SEQ [D NO: 21中堿基序列; SEC2-12對應的基因具有序列表SEQ ID NO: 23屮堿基序列; SEC2-13對應的基因具有序列表SEQ ID NO: 25中堿基序列; 或SEC2-14對應的基因具有序列表SEQ ID NO: 27中堿基序列。 SEC2超抗原基因工程肽的異源表達方法
將編碼這一系列SEC2超抗原基因工程肽的核苷酸序列sec2-l、sec2-2、 sec2-3、 sec2-4、 sec2-5、 sec2-6、 sec2-7、 sec2-8、 sec2-9、 sec2-10、 sec2-ll、 sec2-12、 sec2-i3或sec2-14分別克隆入表達載體pET-28a,以大腸桿菌 BL21(DE3)為宿主菌,構建成異源表達超抗原活性基因工程肽的基因工程
菌,在培養(yǎng)基中異源表達有超抗原活性的SEC2-l、SEC2-2、SEC2-3、SEC2-4、 SEC2-5、 SEC2-6、 SEC2-7、 SEC2-8、 SEC2-9、 SEC2-10、 SEC2-11 、 SEC2-12、 SEC2-13或SEC2-14基因工程肽。
所述編碼SEC2超抗原基因工程肽的核苷酸序列的克隆方法如下,
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-l-F: 5' gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3,禾tl sec2-l-R: 5, gCCTCgAgTTATTTTATgTCTAgTTC :3' 通過PCR技術擴增出sec2-l基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,釆用引物sec2-2-F: 5, gAATTCgAgAgTCAA(XAgACCCTAC 3'禾卩sec2-2-R: 5, gCTL'gAgTTAgTggTTTCCTTCATg 3'通過 PCR技術擴增出sec2-2基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-3-F: 5' gAATTCgAgAgTCAACCAgA 3,和sec2-3-R: 5' gCCTCgAgTTATCCATACATACAAg 3,通過PCR 技術擴增出sec2-3基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-4-F: 5' GAATTCGAGAGTCAACCAGACCCTA 3,和sec2-4-R: 5, gCTCgAgTTATTTTgTTATTCCTCCA 3'通過 PCR技術擴增出sec2-4基因片段; —
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-5-F: 5' gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,和sec2-5-R: 5, CTCgAgTTATCCATTCTTTgTTgTAAggT 3, 通過PCR技術擴增出sec2-5基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-6-F: 5' gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,和sec2-6-R: 5, CTCgAgTTATTTTgTTATTCCT(XAT 3,通過 PCR技術擴增出sec2-6基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-7-F: 5' gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,禾n sec2-7-R: 5, CgCTCgAgTTATCCATACATA(;AAg 3,通過 PCR技術擴增出sec2-7基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采/lj引物sec2-8-F: 5' gAATTCgCAAAgAAgTACAAAgATg 3,和sec2-8-R: 5' CgCTCgAgTTATTTTATgTCTAgTTC 3,通過 PCR技術擴增出sec2-8基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-9-F: 5' ggAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3,和sec2-9-R: 5, CgCTCgAgTTATCCATACACATCAAC 3,通 過PCR技術擴增出sec2-9基因片段; '
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-10-F: 5, g八ATTCgAgAgTCAACCAgAC 3,和sec2-10-R: 5' CgCTCgAgTTAATCTTTgTACTTC 3,通過PCR 技術擴增出sec2-10基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-ll-F: 5, gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3,和sec2-ll-R: 5, CCCgCT(:gAgTTA(;TTTACATAgTAAT 3' 通過PCR技術擴增出sec2-11基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-12-F: 5,
gAATTCAAATCAAgTgAg'n'TACTg 3'禾卩sec2-12-R: 5, CgCTCgAgTTAgTTTACATAgTAAT 3',通過 PCR技術擴增出sec2-12基因片段;
以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-13-F: 5, gAATTCggTACgATgggTAATAT 3'禾卩sec2隱13-R: 5, CCgCTCgAgTTAgTTTACATAgTAA 3'通過 PCR技術擴增出sec2-13基因片段 ,
或,以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-14-F: 5' gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA3,禾卩sec2-14-R: 5, CgCTCgAgTTATMTAACTCTgTTTTCAC 3, 通過PCR技術擴增出sec2-14基因片段。
本發(fā)明具有如下優(yōu)點
1. 本發(fā)明為人工構建的一系列編碼超抗原基因工程肽的核苷酸序列,竹 次獲知其基因全序列的組成。
2. 本發(fā)明利用PCR技術,克隆一系列編碼超抗原基因工程肽的核卄酸 基因,并在大腸桿菌中表達,表達的一系列超抗原基因工程肽經檢驗A冇 超抗原的生物學活性;應用本發(fā)明,可提供直接用于^產該一系列超抗原 基l亂T.程肽的基因工程菌株。
3. 本發(fā)明基因的異源表達提供了制備超抗原抗腫瘤生物制劑的,'新 方法,具有產量高,生產穩(wěn)定,方便純化的特點。


圖l為sec2-i、 sec2-2、 sec2-3、 sec2-4、 sec2-5和sec2-6基因的PCR擴 增瓊脂糖凝膠電泳圖,其中1為DL2000DNA分子量標準,2-7為sec2-l、 sec2隱2、 sec2-3、 sec2-4、 sec2-5和sec2-6基因的PCR擴增產物;
圖2為sec2-7、 sec2-8、 sec2-9、 sec2-10、 sec2-11、 sec2-12、 sec2-13禾TI sec2-14基因的PCR擴增瓊脂糖凝膠電泳圖,其屮l為DL2000 DNA分子 量冷示準;,2-9為ssec2-7、 sec2-8、 sec2-9、 sec2-10、 sec2-11、 sec2-12、 sec2-13 和sec2-14基因的PCR擴增產物;
圖3為超抗原基因工程肽SEC2-1、 SEC2-2、 SEC2-3、 SEC2-4、 SEC2-5、 SEC2-6、 SEC2-7、 SEC2-8、 SEC2-9、 SEC2-10、 SEC2-11、 SEC2-12、 SEC2-13 和SEC2-14的超抗原活性檢測實驗(外周血單個核細胞PBMC增殖實驗) 結果圖。橫坐標為陰性對照牛血清白蛋白(BSA)、系列超抗原基因工程肽 和陽性對照腸毒素C2;縱坐標為酶標儀在OD570nm下的讀數(shù)位。
具體實施例方式
實施例l (1)
(A)超抗原基因工程肽SEC2-1,具有序列表SEQ ID NO: 2屮的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdllynlsdkklknydkvktellnedlakkykdevvdvygsnyyvn cyfsskdnvgkvtggktcmyggltkhegnhfdngnlqnv-llrvyen krntlsfevqtdkksvtaqeldlk
SEQIDNO.2的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度162個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的OC螺旋和8個P折疊構成。其屮
氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的oc螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-87, 108-118分別形成四個(3折疊結構, 129-154位氨基酸殘基形成三個p折疊。除了7-11, 13-17位兩個a螺旋及殘 基129-154形成的三個(3折疊外,其他a螺旋和(3折疊在三維結構中形成-個 獨立的結構域,構成一個"P-桶"狀結構,而118位和122位組氨酸殘基形 成兩個Zn原子結合位點。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(C)假設否
(d) 反義否 .
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Stop/^/ococcwm^eM)
編碼SEC2-1的基因sec2-l,具有序列表SEQ ID NO: 1中核苷酸序列。
ACTTACAAAATGTACTTATAAGAGTTTATGAAAAT
A AAA
SEQIDNO.l的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度486堿基對
*類型核酸 *鏈型雙鏈 *拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(StojoA[y/ococcMsaweMS)
(B)超抗原基因工程肽SEC2-2,具有序列表SEQ ID NO: 4巾的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdliynlsdkklknydkvktellnedlakkykdevvdvyg3nyyvn cyfsskdnvgkvtggktcmyggltkhegnh SEQ ID NO.4的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度122個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的a螺旋和5個P折疊構成。其屮 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-87, 108-118分別形成四個P折疊結構。 除了7-11, 13-17位兩個a螺旋外,其他a螺旋和P折疊在三維結構屮形成- 個獨立的結構域,構成一個"P-桶"狀結構,而118位和122位組氨酸殘基 形成兩個Zn原子結合位點。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Stop/oVococcwm/wwj)
編碼SEC2-2的基因sec2-2,具有序列表SEQIDNO: 3中核苷酸序列。 GAGAGTCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGTTGC ACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGATGGGTAAT
AACTAAAGTTATGTCTGTAGATAAATTTTTGGCAC
ACAGGTGGTAAAACTTGTATGTATGGAGGAATAA CAAAACATGAAGGAAACCAC SEQIDN0.3的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度366堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性 (b)分子類型CDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Stop/yVococcitf awe"s)
(C)超抗原基因工程肽SEC2-3,具有序列表SEQ ID NO: 6屮的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla
hdliynlsdkklknydkvktellnedlakkykde.vvdvygsnyyvn
cyfsskdnvgkvtggktcmyg
SEQIDNO.6的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度113個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的a螺旋和4個p折疊構成。其中 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-87分別形成四個P折疊結構。除了 7-11 , 13-17位兩個a螺旋外,其他a螺旋和P折疊在三維結構中形成一個獨立的結 構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(沒—少/ococc附咖re"s)
編碼SEC2-3的基因sec2-3,具有序列表SEQ ID NO: 5屮核苷酸序列。
TTATGACAAAGTGAAAACAGAGTTATTAAATGAAG
TAAAACTTGTATGTATGGA SEQIDNO.5的信息(參見序列表)
A
c
G
T
G
A
G
A
G
A
c
c
c
A
T
c
c
c
A
G
A
c
c
A
A
c
T
G
A
G
A
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T
A
A
G
G
G
T
A
G
c
A
G
G
El
c
T
G
A
G
T
G
A
A
c
T
A
A
A
c
c A A
A: G A
T A
A: A
c A
A A
c T
G c
G A
丁 A
T A
A T
A
El
A
G
T
G
T
c
T
G
c A
A A
A A T
G T T
A
c
G
A
c
T
A
T
G
T
A
T
A
c
A
G
T
A
G
T
A
T
A
T
T
A
A
A
A
G
T
G
A
T
T
A
c
A
A
T
A
(a) 序列特征
*長度339堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(C) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(5!to/ /^/ococc附m/w附)
(D) 超抗原基因工程肽SEC2-4,具有序列表SEQ ID NO: 8中的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdliynlsdkklknydkvktennedlakkykdevvdvygsnyyvn cyfsskdnvgkvtggktcmyggltk SEQIDNO.8的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度117個氨基酸
*類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的a螺旋和5個P折疊構成。其中 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-87, 108-117分別形成五個P折疊結構。 除了7-11, 13-17位兩個a螺旋外,其他a螺旋和P折疊在三維結柚中形成一 個獨立的結構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源-金黃色葡萄球菌(iSto/ /zy/ococcMs
編碼SEC2-4的基因sec2-4,具有序列表SEQ ID NO: 7中核tf酸序列。 GAGAGTCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGTTGC ACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGATGGGTAA TATGAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAG CAACTAAAGTTATGTCTGTAGATAAATTTTTGGCA
AAAAAATTATGACAAAGTGAAAACAGAGTTATTA AATGAAGATTTAGCAAAGAAGTACAAAGATGAAG
TACAGGTGGTAAAACTTGTATGTATGGAGGAATA ACAAAA
SEQIDN0.7的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度351堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto;7/9;/ococc附aMWMS)
(E)超抗原基因工程肽SEC2-5,具有序列表SEQIDNO: IO中的氨 基酸系列
gtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkflahdliynlsdkk-lknydk vktellnedlakkykdevvdvygsnyyvncyfsskdnvgkvtggkt cmyggltkhegnliifdngiilqiivllrvyenkrntlsfevqtdkksvta qeldlkarnninkknlyefnsspyetgylkflenngntfwydmmp apgdkfdqskylmmyndnktvdsksvklevhlttkng SEQIDNO.10的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度221個氨基酸 類型肽鏈
*鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的a螺旋和12個P折疊構成。其中 氨基酸殘基3-11, 52-60, 138-154, 1卯-202分別形成四個完整的a螺旋結 構;氨基酸殘基14-21, 29-35, 44-50, 63-69,卯畫110,111-136,162-182,及 204-207, 210-219分別形成12個P折疊結構。其中138-154位形成的a螺旋 和111-136, 162-182,及204-207,210-219形成的七個P折疊,以及3-ll,52-60, 1卯-202形成的三個a螺旋和14-21, 29-35, 44-50, 63-69,卯-100所形成的 P折疊在三維結構中分別形成兩個獨立的結構域。而100位和104位組氨酸 殘基形成兩個Zn原子結合位點。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto/7/^/ococcwawe鄉(xiāng))
編碼SEC2-5的基因sec2-5,具有序列表SEQIDNO: 9中核苷酸序列,
GTACAAAGATGAAGTAGTTGATGTGTATGGATCA
TAATGTAGGTAAAGTTACAGGTGGTAAAAC-TTGT ATGTATGGAGGAATAACAAAACATGAAGGAAACC
ATAACGGCAATACTTTTTGGTATGATATGATGCCT
AAAAGTGTGAAGATAGAAGTCCACCTTACAACAA AGAATGGA
SEQIDNO.9的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度663堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto/^y/ococcwsflweiw)
(F)超抗原基因工程肽SEC2-6,具有序列表SEQIDNO: 12屮的氨 基酸系列
gtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkflahdllynlsdkklknydk vktellnedlakkykdevvdvygsnyyvncyfsskdnvgkvtggkt cmyggltk
SEQIDNO.12的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度99個氨基酸 *類型肽鏈
L
c
A
T
G
T
A
A
A
A
c
A
T
T
T
A
A
c
c
A
A
A
G
A
T A
c A:
A A:
A丁
G A
G A
G A
T A:
AG
A 丁
T A
A 丁
G 丁
T J
T A
c G
A A
c
A
A
G
T
G
A
A
A
A
G
A
A
A
G
El
c
A
A
A
c
G
T
G
A
A
G
T
T
T
T
A
A
G
G
A
T
c
G
A
A
A
A
T
A
c
A
G
A
T
c
A
A
G
A
A
c
A T
CT
A T
T
T
T
G A
A A
了 w
A A
TT
G A
T T
T A
T G
A G
A A
A c
A A
A A
A A
A G
A T
T A
A T
A A
T c
T c
*鏈型單鏈
*結構二級結構由2個完整的a蟝旋和5個P折疊構成。其中 氨基酸殘基3-11 , 52-60,分別形成兩個完整的a螺旋結構;氨基酸殘基14-21 , 29-35, 44-50, 63-69,卯-99分別形成五個P折疊結構。所有a蟪旋和l3折疊 在三維結構中形成一個獨立的結構域,形成 -個"P-桶"狀結構。
(b)分子類型成熟肽鏈
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto/ ;^/ococc附aM/"e附)
編碼SEC2-6的基因sec2-6,具有序列表SEQ ID NO: 11中核苷酸序列。 GGTACGATGGGTAATATGAAATATTTATATGATGA
ATAAATTTTTGGCACATGATTTAATTTATAACATT AGTGATAAAAAACTAAAAAATTATGACAAAGTGA
GTACAAAGATGAAGTAGTTGATGTGTATGGATCA
TAATGTAGGTAAAGTTACAGGTGGTAAAACTTGT ATGTATGGAGGAATAACAAAA SEQ ID NO. 11的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度297堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源-金黃色葡萄球菌(5!to/7/^/ococcMsa眺"s)
(G)超抗原基因工程肽SEC2-7,具有序列表SEQIDNO:'14中的氨 基酸系列
gtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkflahdliynlsdkklk:iiydk: vktellnedlakkykdevvdvygsnyyvncyfsskdiivgkvtggkt cmy g
SEQIDNO.14的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度95個氨基酸 *類型肽鏈
*鏈型單鏈
*結構二級結構由2個完整的a螺旋和4個P折疊構成。其中 氨基酸殘基3-ll,52-60,分別形成兩個完整的a螺旋結構;氨基酸殘基14-21, 29-35, 44-50, 63-69分別形成四個P折疊結構。兩個a螺旋和四個P折疊在 三維結構中形成一個獨立的結構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源s金黃色葡萄球菌(及。/ /o;/ococ面awieM5)
編碼SEC2-7的基因sec2-7,具有序列表SEQ ID NO: 13中核苷酸序列。
ATAAATTTTTGGCACATGATTTAATTTATAACATT
GTACAAAGATGAAGTAGTTGATGTGTATGGATCA
AATTACTATGTAAACTGCTATTTTTCATCCAAAGA
TAATGTAGGTAAAGTTACAGGTGGTAAAACTTGT
ATGTATGGA
SEQIDNO.13的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度285堿基對
*類型核酸 *鏈型雙鏈 *拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最豐刀來源金黃色葡萄球菌(5!to/7/^/ococatf "we附)
(H)超抗原基因工程肽SEC2-8,具有序列表SEQIDNO: 16屮的氨 基酸系列
akkykdevvdvygsnyyvncyfsskdnvgkvtggktcmyggltkh egnhfdngnlqnvllrvyeiikrntlsfevqtdkksvtaqeldlk SEQIDNO.16的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度89個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由2個(X螺旋和5個P折疊構成。其中氨基酸
殘基1-5, 83-89分別形成兩個a螺旋結構;氨基酸殘基8-14, 35-45, 56-64, 66-77, 79-81分別形成五個P折疊結構。兩個a螺旋和五個p折疊在三維結構 中形成一個獨立的結構域。而45位和49位組氨酸殘基形成兩個Zn原子結 合位點。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(S啤/^/ococc附aw咖)
編碼SEC2-8的基因sec2-8,具有序列表SEQIDNO: 15中核苷酸序列。 GCAAAGAAGTACAAAGATGAAGTAGTTGATGTGT
TCCAAAGATAATGTAGGTAAAGTTACAGGTGGTA
AGGAAACCACTTTGATAATGGGAACTTACAAAAT
AATTTCTTTTGAAGTGCAAACTGATAAGAAAAGTG TAACAGCTCAAGAACTAGACATAAAA SEQIDNO.15的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度267堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最凈刀來源金黃色葡萄球菌(沒qp/i;;/ococcM5
(I)超抗原基因工程肽SEC2-9,具有序列表SEQ ID NO: 18中的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmlcylyddhyvsatkvinsvdkfla hdliynlsdkklktiydkvktellnedlalcky"evvdvyg
SEQ ID NO. 18的信息(參見序列表)
(a)序列特征
*長度86個氨基酸
*類型肽鏈
*鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的a螺旋和4個l3折疊構成。其屮 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-86分別形成四個p折疊結構。除7-U, 13-17形成的兩個a螺旋外,其他兩個a螺旋和四個p折疊在三維結構中形成 一個獨立的結構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(55top/9;/ococciw
編碼SEC2-9的基因sec2-9,具有序列表SEQ ID NO: 17中核苷酸序列。 GAGAGTCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGTTGC ACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGATGGGTAA TATGAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAG
TAGTTGATGTGTATGGA
SEQ ID NO. 17的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度258堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Slto/7/j[y/ococcMsat/rc旭)
(J)超抗原基因工程肽SEC2-10,具有序列表SEQIDNO: 20屮的氨 基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdliynlsdkklknydkvktellnedlakkykd SEQ ID NO.20的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度79個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
T A
T T
A A
A G
A T
T G
A A
G T
A T
T A
G c
T A
c A
T T
G A
T T
AT
T T
A T
A T
A T
T A
c G
A T
A A
u c
A A
G A
A: A
c c
A T
A G
A A
G A
T G
G A
A A
A A
A c
c G
A A
G T
T T
A T
T A
T G
A A
A A
A G
A T
A A
A A
*結構二級結構由4個完整的ct螺旋和3個p折疊構成。其屮 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68,分別形成三個P折疊結構。除7-11, 13-17 形成的兩個a螺旋外,其他兩個a螺旋和四個p折疊在三維結構中形成一個獨 立的結構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto/7/^/ococc附flwe附)
列,
編碼SEC2-10的基因sec2-10,具有序列表犯QIDNO: 19中核昔酸序
ACAAATCAAGTGA(3TTTACTGGTACGATGGGTAA
TATGAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAG
CAACTAAAGTTATGTCTGTAGATAAATTTTTGGCA
AAAAAATTATGACAAAGTGAAAACAGAGTTATTA AATGAAGATTTAGCAAAGAAGTACAAAGAT SEQIDNO.19的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度237堿基對 *類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(沒qp /ococcM5
(K)超抗原基因工程肽SEC2-11,具有序列表SEQ ID NO: 22中的 氨基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdliynlsdkklknydkvktellnedlakkykdevvdvygsriyyvn SEQIDNO.22的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度92個氨基酸 *類型肽鏈
鏈型單鏈
*結構二級結構由4個完整的cx螺旋和4個P折疊構成。其屮 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29, 70-78,分別形成四個完整的a螺旋結構; 氨基酸殘基32-39, 47-53, 62-68, 81-86分別形成四個p折疊結構。除7-11, 13-17形成的兩個a螺旋外,其他兩個a螺旋和四個財廠f疊在三維結構中形成 一個獨立的結構域。
(b) 分子類型成熟肽鏈
(c) 假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(沒a/7/2;;/ococc附
編碼SEC2-11的基因sec2-11,具有序列表SEQ ID NO: 21中核苷酸序列。
GAGAGTCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGTTGC ACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGATGGGTAA TATGAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAG
AAAAAATTATGACAAAGTGAAAACAGAGTTATTA
TAGTTGATGTGTATGGATCAAATTACTATGTAAAC SEQIDNO.21的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度276堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(及邵/^/ococcwa"WMj)
(L)超抗原基因工程肽SEC2-12,具有序列表SEQ ID NO: 24屮的 氨基酸系列
ksseftgtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkflahdliynlsdkkl knydkvktellnedlakkykdevvdvygsnyyvn
SEQIDNO.24的信息(參見序列表)
(a)序列特征
*長度80個氨基酸
*類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構由3個完整的a螺旋和4個p折疊構成。其中 氨基酸殘基1-5, 9-17, 58-66,分別形成三個完整的a螺旋結構;氨基酸殘 基20-27, 35-41, 50-56, 69-74分別形成四個p折疊結構。除1-5形成的一 個a螺旋外,其他兩個a螺旋和四個p折疊在三維結構屮形成一個獨立的結構 域。
(b)分子類型成熟肽鏈 (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(5to/ /^/ococcw
編碼SEC2-12的基因sec2-12,具有序列表SEQlt)NO: 23屮核苷酸序列。
GAAATATTTATATGATGATCATTATGTATCAGCAA CTAAAGTTATGTCTGTAGATAAATTTTTGGdACAT
GAAGATTTAGCAAAGAAGTACAAAGATGAAGTAG TTGATGTGTATGGATCAAATTACTATGTAAAC SEQIDNO.23的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度240堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型CDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(&a/ /iy/ococc旭咖rg附)
(M)超抗原基因工程肽SEC2-13,具有序列表SEQ ID NO: 26屮的 氨基酸系列
gtmgnmkylyddhyvsatkvmsvdkflahdliynlsdkklknydk vktellnedlakkykdevvdvygsnyyvn
SEQIDN0.26的信息(參見序列表)
(a)序列特征
*長度74個氨基酸 *類型肽鏈 *鏈型單鏈
*結構二級結構山2個完整的0C螺旋和4個I3折疊構成。其屮 氨基酸殘基3-11 , 70-78,分別形成四個完整的ot螺旋結構;氨基酸殘基14-21 , 29-35, 44-50, 63-68分別形成四個P折疊結構。兩個ot螺旋和四個P折疊在 三維結構中形成一個獨立的結構域。
(b)分子類型成熟肽鏈
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(5!f—y/ococc"sfli/鄉(xiāng)j)
編碼SEC2-13的基因sec2-13,具有序列表SEQIDNO: 25中核苷酸序列。
AATTACTATGTAAAC
SEQIDNO,25的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度222堿基對
*類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sta/ ;^/ococc附aMWMs)
(N)超抗原基因工程肽SEC2-14,具有序列表SEQ ID NO: 28屮的 氨基酸系列
esqpdptpdelhksseftgtmgtimkylyddhyvsatkvmsvdkfla hdllynlsdkklknydkvktell
SEQIDN0.28的信息(參見序列表) (a)序列特征
*長度69個氨基酸 *類型肽鏈
A G
G A
TT
A G
G T
T c
A T
T G
A T
T A
T T
T T
A G
A T
Gc
A A
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G
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A
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A A
A G
A G
c T
G A
A T
丁 G
T T
丁 G
A T
G A
A G
A T
GT
T.G
A A
A T
AG
T A
T A
A G
T T
T A
G G
A A
G A
A A
c c
A A
A T
A G
*鏈型單鏈
*結構二級結構由3個完整的ot螺旋和3個p折疊構成。其中 氨基酸殘基7-11, 13-17, 21-29分別形成四個完整的a螺旋結構;氨基酸殘 基32-39, 47-53, 62-68分別形成三個p折疊結構。除7-11, 13-17形成的兩 個a螺旋外,其他一個a蠊旋和三個p折疊在三維結構中形成一個獨立的結構 域。
(b)分子類型成熟肽鏈
(C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Stop/i;;/ococc附awe附)
編碼SEC2-14的基因sec2-14,具有序列表SEQIDNO: 27屮核苷酸序列。
GAGAGTCAACCAGACCCTACGCCAGATGAGT TGCACAAATCAAGTGAGTTTACTGGTACGAT GGGTAATATGAAATATTTATATGATGATCAT TATGTATCAGCAACTAAAGTTATGTCTGT人G ATAAATTTTTGGCACATGATTTAATTTATAAC ATTAGTGATAAAAAACTAAAAAATTATGACA AAGTGAAAACAGAGTTATTA SEQIDN0.27的信息(參見序列表)
(a) 序列特征
*長度207堿基對 *類型核酸
*鏈型雙鏈
*拓撲結構線性
(b) 分子類型cDNA (C)假設否
(d) 反義否
(e) 最初來源金黃色葡萄球菌(Sto/^/ococcw離e附)
(2)編碼超抗原基因工程肽的全基因sec2-l、 sec2-2、 sec20、 sec2-4、 sec2國5、 sec2-6、 sec2-7、 sec2-8、 sec2誦9、 sec2-10、 sec2-11、 sec2-12、 sec2-13 和sec2-14的PCR擴增
1)金黃色葡萄球菌基因組DNA的提取
接種金黃色葡萄球菌單菌落于5ml液體LB培養(yǎng)基中,37'C搖床過夜培 養(yǎng),取1.5ml的培養(yǎng)物離心收集菌體。提取金黃色葡萄球菌基因組DNA (基 因組DNA提取操作按F.奧斯伯,R.布倫特,R.E.金斯頓,D.D.穆爾, J.G塞德曼,J.A.史密斯,K.斯特拉爾《精編分子生物學實驗指南》美國
紐約John Wiley & Sons出版社1995年第三版P39-40)。
2) PCR引物設計及反應條件
分別設計合成PCR引物用來擴增sec2-l 、sec2-2、sec2-3、sec2-4、sec2隱5、 sec2-6、 sec2-7、 sec2-8、 sec2-9、 sec2-10、 sec2-ll、 sec2-12、 sec2-13和sec2-14 的基因片斷,引物序列如上述發(fā)明內容外所述;
PCR反應體系為10 X Pyrobest buffer 5 u 1、 dNTP250umo1、 0.02% BSA2li 1、上下游引物各25pmol、模板金黃色葡萄球菌基因組DNA0.1 y g、 ExTaq DNA聚合酶2U,無菌超純水補齊體積至50 w 1。
各基因片斷的PCR反應條件均為
第一階段95'C, 5分鐘;
第二階段94'C, 30秒;55'C, 30秒;72。C, 60秒(除secl-5片斷, secl-5片斷采用卯秒)共30個循環(huán); 第三階段72'C, IO分鐘;
3) SEC2基因的鑒定各片斷PCR擴增產物經1.2%瓊脂糖凝膠電泳 分析并分離(參見附圖1、 2所示),切下相應大小的目的帶,按杭州維特 潔生化技術有限公司膠回收試劑盒使用說明書進行膠問收;回收產物分別 與pGEM-T克隆載體連接,構建成一系列超抗原基因工程肽的基因克隆載 體pGEM-T-sec2-l 、 pGEM-T國sec2曙2 、 pGEM-T-sec2-3 、 pGEM-T-sec2-4 、 pGEM-T-sec2-5 、 pGEM-T-sec2-6 、 pGEM-T-sec2-7 、 pGEM陽T-sec2誦8 、 pGEM-T畫sec2-9 、 pGEM誦T-sec2畫10、 pGEM國T-sec2誦11 、 pGEM-T-sec2-12、 pGEM-T-sec2-13和pGEM-T-sec2-14。連接反應按Promega公司產品pGEM國T 試劑盒使用說明書。連接產物轉化大腸桿菌DH5 a感受態(tài)細胞,(轉化操作 按F.奧斯伯,R.布倫特,R.E.金斯頓,D.D.穆爾,J.G塞德曼,J.A.史 密斯,K.斯特拉爾《精編分子生物學實驗指南》美國紐約John Whey & Sons 出版社1995年第三版P39-40),篩選陽性克隆并以Sanger雙脫氧末端終止 法測定DNA序列。
實施例2
超抗原基因工程肽的表達
1)超抗原基因工程肽表達載體的構建分別將基因克隆載體 pGEM-T-sec2-l 、 pGEM-T-sec2曙2 、 pGEM國T-sec2-3 、 pGEM-T-sec2誦4 、 pGEM-T-sec2-5 、 pGEM畫T-sec2隱6 、 pGEM-T-sec2-7 、 pGEM-T-sec2-8 、 pGEM-T-sec2-9 、 pGEM曙T-sec2畫10 、 pGEM誦T-sec2-11 、 pGEM-T國sec2-12 、 pGEM-T-sec2-13和pGEM-T-sec2-14質粒DNA以£co/J/、 JS^o/雙酶切,膠 回收試劑盒回收相應的超抗原基因工程肽的基因片段。以T4 DNA連接酶 分別連接入經同樣雙酶切的pET-28a表達載體,構建^^表達載體pET-28a-sec2國l、 pET歸28a-sec2國2、 pET-28a-sec2-3、 pET-28a-sec2隱4、 pET-28a-sec2-5、 pET-28a-sec2-6 、 pET國28a-sec2-7 、 pET-28a曙sec2畫8 、 pET-28a-sec2-9 、 pET-28a-sec2-10、 pET-28a-sec2-11 、 pET-28a-sec2-12、 pET-28a-sec2-13和
pET-28a-sec2-14。轉化五.co/z'BL21(DE3)感受態(tài)細胞,經Sanger雙脫氧末端 終止法測序鑒定正確重組克隆。
2)超抗原基因工程肽的誘導表達和純化分別接種轉化了各表達載體 質粒的BL21(DE3)單菌落于含40 ng/ml卡那霉素的液體LB培養(yǎng)基中,過 夜活化培養(yǎng),以1%接種量轉接下一級,37'C搖床培養(yǎng)至OD6o。為0.6,加 入終濃度1.0mmol/L的IPTG, 30t!誘導表達6小時。
分別離心收集菌體,重懸于1/5體積的平衡緩沖液(20mM Tirs-HCl, 0. 5M NaCl, 20mM imidazole, pH7.9),以0. 5ml/min速度上樣 于預先平衡好的Ni親和層析柱;以含50mM imidazole的平衡緩沖液洗滌 10個柱體積,洗去非特異性結合的雜蛋白;最后以洗脫緩沖液(20mM Tirs-HCl, 0. 5M NaCl, 200mM imidazole, pH7.9)洗脫下目的產物既各超 抗原基因工程肽SEC2-1、 SEC2-2、 SEC2-3、 SEC2-4、 SEC2-5、 SEC2-6、 SEC2國7、 SEC2國8、 SEC2-9、 SEC2-10、 SEC2國11、 SEC2-12、 SEC2-13和 SEC2-14。
洗脫產物經透析法除鹽濃縮。
實施例3
超抗原基因工程肽的超抗原活性
取正常新鮮人外周血抗凝后,密度梯度離心法分離外周血單個核細胞。 用含10%小牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液調節(jié)細胞濃度,以1X 105cells/well 加到96孔板中,分別將經純化的各超抗原基因工程肽SEC2-1、 SEC2-2、 SEC2國3、 SEC2-4、 SEC2畫5、 SEC2隱6、 SEC2-7、 SEC2-8、 SEC2-9、 SEC2畫10、 SEC2-11、 SEC2-12、 SEC2-13和SEC2-14終濃度50ng/ml加入各孔,以BSA 作為陰性對照,SEC2標準品作為陽性對照,每樣3個復孔。按常規(guī)條件培 養(yǎng)96h,加入50ulAvdl的MTT液。繼續(xù)培養(yǎng)4h, 1000r/min離心收集細胞, 加入DMSO120ul/we11,溶解15min后,酶標儀上以570nm測定各孔的吸光 值(參見附圖3所示,超抗原基因工程肽刺激外周血單個核細胞增殖實驗)。
實驗結果顯示,微量的本發(fā)明中的超抗原基因工程肽即可有效的刺激 人外周血單個核細胞(PBMC)產生增殖。其刺激能力與SEC2標準品相比 未有較顯著降低。其中SEC2-1、 SEC2-4、 SEC2-5和SEC2-8因未破壞超抗 原.卞要功能區(qū)且分子量較SEC2有所減小,等同質量濃度下顯示出與SEC2 標準品相當?shù)腜BMC刺激增殖能力。該實驗結果說明本發(fā)明中的-系列超 抗原基因工程肽都具有一定的超抗原生物活性,其強大的休外刺激PBMC 增被能力顯示出利用本發(fā)明屮的系列超抗原基因工程肽作為新型抗腫癇生 物制劑,具有巨大的開發(fā)潛力。
權利要求
1.SEC2超抗原基因工程肽,其特征在于分別為下列任意氨基酸序列之一,SEC2-1具有序列表SEQ ID NO2中氨基酸序列;SEC2-2具有序列表SEQ ID NO4中氨基酸序列;SEC2-3具有序列表SEQ ID NO6中氨基酸序列;SEC2-4具有序列表SEQ ID NO8中氨基酸序列;SEC2-5具有序列表SEQ ID NO10中氨基酸序列;SEC2-6具有序列表SEQ ID NO12中氨基酸序列;SEC2-7具有序列表SEQ ID NO14中氨基酸序列;SEC2-8具有序列表SEQ ID NO16中氨基酸序列;SEC2-9具有序列表SEQ ID NO18中氨基酸序列SEC2-10具有序列表SEQ ID NO20中氨基酸序列;SEC2-11具有序列表SEQ ID NO22中氨基酸序列;SEC2-12具有序列表SEQ ID NO24中氨基酸序列;SEC2-13具有序列表SEQ ID NO26中氨基酸序列;或SEC2-14具有序列表SEQ ID NO28中氨基酸序列。
4.按照權利要求3所述異源表達方法,其特征在于所述編碼SEC2超抗原基因工程肽的核苷酸序列的克隆方法如下,以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-l-F: 5' gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3'禾H sec2國l-R: 5, gCCTCgAgTTATTTTATgTCTAgTTC 3, 通過PCR技術擴增出sec2-l基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,釆用引物sec2-2-F: 5, gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTAC 3,和sec2-2畫R: 5, gCTCgAgTTAgTggTTTCCTTCATg 3'通過 PCR技術擴增出sec2-2基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-3-F: 5, gAATTCgAgAgTCAACCAgA 3,和sec2咖3-R: 5, gCCTCgAg菌CCATACATACAAg 3'通過PCR 技術擴增出sec2-3基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-4-F: 5' GAATTCGAGAGTCAACCAGACCCTA 3,和sec2-4漏R: 5, gCTCg八gTTATTTTgTTATTCCTCCA 3,通過 PCR技術擴增出sec2-4基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-5-F: 5, gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,和sec2-5-R: 5, CTCgAgTTATCCATTCnTgTTgTAAggT 3, 通過PCR技術擴增出sec2-5基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,釆用引物sec2-6-F: 5, gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,和sec2-6國R: 5, CTCgAgTTATTTTgTTATTCCTCCAT 3'通過 PCR技術擴增出sec2-6基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采.用引物sec2-7-F: 5, gAATTCggTACgATgggTAATATg 3,和sec2-7-R: 5, CgCTCgAgTTATCCATACATACAAg 3'通過 PCR技術擴增出sec2-7基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-8-F: 5, gAATTCgCAAAgAAgTACAAAgATg 3,和sec2-8-R: 5, CgCTCgAgTTATTTTATgTCTA^TTC 3'通過 PCR技術擴增出sec2-8基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-9-F: 5, ggAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3'禾口 sec2畫9-R: 5, CgCTCgAgTTATCCATACACATCAAC 3,通 過PCR技術擴增出sec2-9基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-10-F: 5, gMTTCgAgAgTCMCCAgAC 3,和sec2-10-R: 5, CgCTCgAgTTAA''CTTTgTACTTC 3,通過PCR 技術擴增出sec2-10基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采川引物sec2-ll-F: 5,gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3,和sec2-ll-R: 5, CCCgCTCgAgTTAGTTTAC/VT八gTAAT 3, 通過PCR技術擴增出sec2-11基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-12-F: 5' gAATTCAAATCAAgTgAgTTTACTg 3,和sec2-12國R: 5, CgCTCgAgTTAgTTTACATAgTAAT 3,通過 PCR技術擴增出sec2-12基因片段;以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-13-F: 5, gAATTCggTACgATgggTMTAT 3,和sec2誦13-R: 5, CCgCTCgAgTTAgTTTACATAgTAA 3,通過 PCR技術擴增出sec2-13基因片段;或,以金黃色葡萄球菌基因組DNA為模板,采用引物sec2-14-F: 5, gAATTCgAgAgTCAACCAgACCCTA 3,和sec2-14-R: 5, CgCTCgAgTTATAATAACTCTgTTTTCAC 3, 通過PCR技術擴增出sec2-14基因片段。
全文摘要
本發(fā)明涉及基因工程肽的基因克隆和異源表達,具體說是一系列具有SEC2超抗原活性的基因工程肽、及其編碼基因的制備和異源表達,SEC2-1~SEC2-14分別具有序列表SEQ ID NO2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26和SEQ ID NO28中氨基酸序列。克隆的核苷酸序列可在大腸桿菌BL21(DE3)中表達,其表達的分別所對應的蛋白SEC2-1~SEC2-14經檢驗具有超抗原的生物學活性。
文檔編號C12N1/21GK101113165SQ20061004733
公開日2008年1月30日 申請日期2006年7月28日 優(yōu)先權日2006年7月28日
發(fā)明者迪 常, 張惠文, 張成剛, 徐明愷, 王小剛, 蘇振成, 艷 陳 申請人:沈陽科健生物技術有限公司
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