專利名稱:海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類病原菌-溶藻弧菌基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及海洋水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物和人類病原菌的診斷試劑盒及檢測(cè)方法,主要是針對(duì)溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)基因診斷的試劑盒及檢測(cè)方法。
背景技術(shù):
溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)是一種廣布于世界各地的海灣和海岸線區(qū)域以及海產(chǎn)品中的嗜鹽菌。此菌是一種條件致病菌,在一定條件下可暴發(fā)流行。近年來,隨著養(yǎng)殖環(huán)境的日益惡化,我國沿海地區(qū)因溶藻弧菌引起海產(chǎn)品發(fā)病或大面積死亡以及人類食物中毒的報(bào)道日益增多。目前已知溶藻弧菌可引起中國對(duì)蝦黑腮、褐斑綜合癥,大黃魚、紅笛鯛、石斑魚敗血癥,雜色鮑潰瘍癥等病;另外,該菌是文蛤的病原菌,還是合浦珠母貝體內(nèi)的主要菌群,是合浦珠母貝潛在的病原菌,隨時(shí)都有可能導(dǎo)致合浦珠母貝的死亡。同時(shí)該菌可通過受污染的海產(chǎn)品感染人類,引發(fā)人類腸道急性傳染病。因此,可以說溶藻弧菌是海洋水生經(jīng)濟(jì)動(dòng)物弧菌病主要病原菌,也是人類食品安全的敵人。溶藻弧菌病具有暴發(fā)快、流行廣、死亡率高等特點(diǎn),由于細(xì)菌極易對(duì)抗生素產(chǎn)生抗藥性,因此目前對(duì)溶藻弧菌病還未有特效的治療方法,推行海洋水產(chǎn)品的健康養(yǎng)殖是最有效的預(yù)防措施,而這主要依賴于早期的快速檢測(cè)。目前對(duì)弧菌的檢測(cè)技術(shù)主要包括傳統(tǒng)的TCBS培養(yǎng)及進(jìn)一步的形態(tài)及生理生化鑒定法、免疫學(xué)方法(主要有單克隆抗體技術(shù)、酶聯(lián)免疫檢測(cè)法(ELISA))、免疫電鏡技術(shù)、分子生物學(xué)方法(主要有分子雜交技術(shù)、限制性內(nèi)切酶長度多態(tài)(RELP))等。這些檢測(cè)方法有些對(duì)技術(shù)條件要求高,檢測(cè)時(shí)間長。有些所需的材料制備麻煩,費(fèi)用高,有些方法靈敏度不高,特異性不強(qiáng),因此廣大水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)主和醫(yī)生掌握的技術(shù)難度很大,很難推廣,限制了這些技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。
早期快速診斷海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌是目前海洋經(jīng)濟(jì)動(dòng)物養(yǎng)殖的主要措施和減少損失的有效途徑,因此,簡便快速、特異性好又靈敏度高的診斷試劑盒及其檢測(cè)方法是廣大水產(chǎn)養(yǎng)殖者急切盼望的。
多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,簡稱PCR技術(shù)),是上世紀(jì)80年代發(fā)展起來的一種體外擴(kuò)增特異DNA片斷的技術(shù),由于具有快速、敏感、特異性強(qiáng)等特點(diǎn),所以這種方法建立后,很快就被應(yīng)用于實(shí)踐中。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是利用溶藻弧菌基因保守序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物,建立溶藻弧菌PCR反應(yīng)體系,在此基礎(chǔ)上優(yōu)化和設(shè)計(jì),提供海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌溶藻弧菌的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法。該試劑盒可批量生產(chǎn),操作簡單,簡便快速,特異性好,靈敏度高;可用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過程細(xì)菌中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類腸道急性傳染病的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。
本發(fā)明的海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌的基因診斷試劑盒包括下列部件1).樣品稀釋液A液,1管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4;2).PCR反應(yīng)液B液,1管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液,包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VaF、引物VaR和TaqE;3).陽性對(duì)照液C液,1管,內(nèi)裝溶藻弧菌的總DNA,作為陽性模板;4).盒子;5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,裝于盒子中;泡沫板上有不少于上述小管數(shù)量的小孔,上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中。
上述海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌的基因診斷試劑盒中所述的一對(duì)引物VaF和VaR是根據(jù)溶藻弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的,其DNA序列分別如下VaF5’-TAG ACG GCA TTC GGT CAG CVaR5’-TCA AGT CAT AGA TTT CCG用本發(fā)明上述試劑盒檢測(cè)海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌的方法,按下列步驟進(jìn)行1).取新鮮待檢樣品,加入樣品稀釋液A液稀釋10~20倍,于無菌勻漿器中冰浴勻漿;待檢樣品可以是直接取自待檢動(dòng)物的任何部位組織,最好是消化道或肌肉組織,對(duì)于人,可取糞便或傷口膿液作為待檢樣品。
2).6000~8000r/min離心5~10min;3).取上清200μl,煮沸15min,立刻放于冰上5~10min;4).6000~8000r/min離心10min,上清作PCR模板;5).分別取模板和C液,加入到PCR反應(yīng)液B液中,混勻后離心數(shù)秒(通常為500~1000r/min離心5~10sec),置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存48℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘后于紫外儀上觀察,若在306bp處出現(xiàn)明亮的反應(yīng)條帶,則為溶藻弧菌陽性;若無反應(yīng)條帶顯示,則為陰性。
本發(fā)明的有益效果本發(fā)明的海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法,是以根據(jù)溶藻弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物為主體而設(shè)計(jì)的。利用該對(duì)引物,可以特異性地?cái)U(kuò)增攜帶溶藻弧菌的待測(cè)樣品的有關(guān)基因片斷,所建立的優(yōu)化的PCR體系保證檢測(cè)結(jié)果的快速性、準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。因此,使用本發(fā)明的試劑盒及檢測(cè)方法,可以簡便、快速、靈敏而特異的地檢測(cè)感染溶藻弧菌的海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類腸道內(nèi)容物,大大高于傳統(tǒng)和常規(guī)的生物學(xué)方法,可運(yùn)用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過程細(xì)菌中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類腸道急性傳染病的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。
圖1是感染溶藻弧菌的雜色鮑肝臟組織樣品的PCR擴(kuò)增結(jié)果。其中MDNA分子量標(biāo)準(zhǔn);1溶藻弧菌陽性對(duì)照;2溶藻弧菌陰性對(duì)照;3檢測(cè)樣品;具體實(shí)施方式
以下通過具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步說明。
實(shí)施例1溶藻弧菌的基因診斷試劑盒該試劑盒由下列部分構(gòu)成(10樣份)1).樣品稀釋液(A液),1管,5ml/管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4。
2).PCR反應(yīng)液(B液),1管,250μl/管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液(25μl體系),包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VaF、引物VaR和TaqE。
3).陽性對(duì)照液(C液),1管,20μl/管,內(nèi)裝溶藻弧菌的總DNA,作為陽性模板;4).長方體盒子,8.5×5.8×6.2cm3。
5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,高2.2cm,有四排孔,第一排四個(gè)孔,孔徑1.3cm,第二排五個(gè)孔,孔徑1.0cm,第三、四排分別六個(gè)孔,孔徑0.6cm。上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中,裝于長方體盒子中。
該試劑盒中的一對(duì)引物的DNA序列如下VaF5’-TAG ACG GCA TTC GGT CAG CVaR5’-TCA AGT CAT AGA TTT CCGPCR擴(kuò)增反應(yīng)液體系(25μl體系)如下ddH2O 21μl10×Buffer 1.8μldNTP 0.4μl引物VaF0.3μl
引物VaR 0.3μlTaqE 0.2μl實(shí)施例2海洋水產(chǎn)動(dòng)物和人類病原菌-溶藻弧菌的檢測(cè)方法使用實(shí)施例1的試劑盒,按下列步驟進(jìn)行1).用無菌操作方法,取新鮮雜色鮑肝臟組織0.05g,加入樣品稀釋液(A液)500μl稀釋10倍,于無菌勻漿器中冰浴勻漿;2).6000r/min離心5min;3).取上清100μl,煮沸15min,立刻放于冰上5min;4).6000r/min離心10min,上清作為PCR模板;5).分別取模板和C液1μl,加入到PCR反應(yīng)液(B液)中,混勻后1000r/min離心10sec,置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存48℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘(5V/cm)后于紫外儀上觀察,若在306bp處出現(xiàn)一明亮的反應(yīng)條帶(與陽性對(duì)照在同一位置),則為溶藻弧菌陽性,說明檢測(cè)樣品中攜帶溶藻弧菌;若無反應(yīng)條帶顯示,則為陰性,表明檢測(cè)樣品中不含溶藻弧菌(見圖1)。
權(quán)利要求
1.海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類病原菌-溶藻弧菌的基因診斷試劑盒,其特征是該試劑盒包括下列部件1).樣品稀釋液A液,1管,內(nèi)裝1×PBS,pH7.4;2).PCR反應(yīng)液B液,1管,內(nèi)裝PCR擴(kuò)增反應(yīng)液,包括ddH2O、含Mg2+的10×Buffer、dNTP、引物VaF、引物VaR和TaqE;VaF為5’-TAG ACG GCA TTC GGT CAG C-3’,VaR為5’-TCA AGT CAT AGA TTT CCG-3’;3).陽性對(duì)照液C液,1管,內(nèi)裝溶藻弧菌的總DNA;4).盒子;5).一塊泡沫板,其大小與盒子的底面相同,裝于盒子中;泡沫板上有不少于上述小管數(shù)量的小孔,上述各小管分別對(duì)應(yīng)放置于這些小孔中。
2.一種檢測(cè)海洋水產(chǎn)動(dòng)物及人類病原菌-溶藻弧菌的方法,其特征是使用權(quán)利要求1所述試劑盒,按下列步驟進(jìn)行1).取新鮮待檢樣品,加入樣品稀釋液A液稀釋10~20倍,于無菌勻漿器中冰浴勻漿;2).6000~8000r/min離心5~10min;3).取上清200μl,煮沸15min,立刻放于冰上5~10min;4).6000~8000r/min離心10min,上清作PCR模板;5).分別取模板和C液,加入到PCR反應(yīng)液B液中,混勻后離心數(shù)秒,置于PCR儀上;6).按下列條件擴(kuò)增95℃ 3min預(yù)變性→94℃ 1min 34個(gè)循環(huán)→72℃ 10min→4℃保存48℃ 45sec72℃ 1min7).反應(yīng)結(jié)束后取5~10μl加2μl溴酚藍(lán)混勻,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳20~30分鐘后于紫外儀上觀察,若在306bp處出現(xiàn)明亮的反應(yīng)條帶,則為溶藻弧菌陽性;若無反應(yīng)條帶顯示則為陰性。
全文摘要
本發(fā)明提供一種海洋水產(chǎn)動(dòng)物(如對(duì)蝦,石斑魚,鮑等)及人類病原菌—溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的基因診斷試劑盒及檢測(cè)方法。該試劑盒及檢測(cè)方法是以溶藻弧菌基因保守區(qū)序列設(shè)計(jì)的一對(duì)引物為主體而設(shè)計(jì)的。本發(fā)明采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù),對(duì)海洋水產(chǎn)動(dòng)物(如對(duì)蝦,石斑魚,鮑等)及人類的病原菌—溶藻弧菌的特異性DNA片斷進(jìn)行定性檢測(cè),簡便快速,特異性好,靈敏度高;可用于海洋水產(chǎn)動(dòng)物各時(shí)期養(yǎng)殖過程中的細(xì)菌跟蹤檢測(cè),也可用于人類腸道急性傳染病的臨床檢測(cè),還可以用于環(huán)境監(jiān)測(cè),避免病菌傳播流行,具有很高的實(shí)用價(jià)值。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK1560603SQ200410015460
公開日2005年1月5日 申請(qǐng)日期2004年2月26日 優(yōu)先權(quán)日2004年2月26日
發(fā)明者鄧先余, 何建國, 王智學(xué), 黃志堅(jiān), 翁少萍 申請(qǐng)人:中山大學(xué), 珠海福德隆生物技術(shù)有限公司