專利名稱：一種啟動子BgIosP548、其制備方法及用途的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一種啟動子，特別是一種單子葉植物例如水稻的啟動子，以及所述啟 動子的制備方法及用途。
背景技術(shù)：
啟動子是基因的一個組成部分，通常位于結(jié)構(gòu)基因5’端上游，是RNA聚合酶識別、 結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。啟動子能夠指導(dǎo)全酶(holoenzyme)同模板正確結(jié)合，活 化RNA聚合酶，啟動基因轉(zhuǎn)錄，從而控制基因表達(轉(zhuǎn)錄)的起始時間和表達的程度。在轉(zhuǎn) 基因植物中，啟動子是影響轉(zhuǎn)基因表達效率的重要因素之一，選擇高效率的啟動子是高效 率表達外源基因的關(guān)鍵。根據(jù)啟動子的轉(zhuǎn)錄模式可將其分為3類組成型啟動子、組織或器官特異性啟動 子和誘導(dǎo)型啟動子。所謂組成型啟動子是指在組成型啟動子調(diào)控下，不同組織器官和發(fā)育 階段的基因表達沒有明顯差異，因而稱之組成型啟動子。雙子葉植物中最常使用的組成型 啟動子是花椰菜花葉病毒(CaMV) 35S啟動子。另一種高效的組成型啟動子CsVMV是從木薯 葉脈花葉病毒(cassava vein mosaic virus)中分離的。人們高度重視從植物本身克隆組成型啟動子。例如肌動蛋白(actin)和泛素 (ubiquitin)等基因的啟動子已被克隆。用這些啟動子代替CaMV 35S啟動子，可以更有效 地在單子葉植物中驅(qū)動外源基因的轉(zhuǎn)錄。Naomi等分別從擬南芥的色氨酸合酶β亞基基因 和植物光敏色素基因中克隆了相應(yīng)啟動子，用其代替CaMV 35S啟動子，在轉(zhuǎn)基因煙草中也 取得了很好的表達效果(Plant biotechnology, 2002,19(1) 19-26)。單子葉植物基因中常見的啟動子有Ubi啟動子(Plant ubiquitin promoter)、 Actin 啟動子(Plant Actin promoter)禾口 Adh-1 啟動子(Maize alcohol dehydrogenase 1 promoter)。Ubi啟動子以其啟動效率高、甲基化程度低、遺傳性狀穩(wěn)定等因素而倍受青睞。目 前，已經(jīng)從很多泛素基因中分離得到啟動子序列，包括玉米基因組中的Ubi-I啟動子、水稻 泛素RUBQ2啟動子、擬南芥泛素啟動子、向日葵泛素UbBl啟動子、煙草泛素Ubi. U4啟動子、 馬鈴薯泛素Ubi7啟動子、番茄泛素Ubil-I啟動子，大麥泛素Mubl啟動子。玉米泛素Ubi-I 啟動子已經(jīng)廣泛地應(yīng)用于玉米、小麥、水稻等單子葉植物中，水稻泛素RUBQ2啟動子在水稻 和甘蔗中也有較多的應(yīng)用。Actin啟動子1990年由康奈爾大學(xué)的McElroy等首次在水稻中發(fā)現(xiàn)，屬于強組成 型啟動子。Actin啟動子在單子葉禾本科中作用顯著，但是鄰近科屬的植物中的基因調(diào)控功 能卻十分不理想。因此，許多相關(guān)研究通過其他單子葉植物尋找Actin啟動子，并成功在香 蕉、甜瓜、玉米和擬南芥中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)。Actin啟動子由于對基因表達的強調(diào)控作用，在單子葉 植物優(yōu)良性狀的轉(zhuǎn)基因中已經(jīng)得到越來越廣泛的應(yīng)用。Adh-I啟動子調(diào)控ADH(alcohol dehydrogenase)基因，對植物在缺氧環(huán)境下乙醇 脫氫酶的表達至關(guān)重要。Adh-I啟動子對單子葉植物特別是谷類植物如水稻、燕麥和大麥，和少部分雙子葉植物如煙草，基因的調(diào)控功能比CaMV (花椰菜花葉病毒CaMV) 35S啟動子提 高10-50倍。Adh-I啟動子主要應(yīng)用于單子葉植物，對絕大部分雙子葉植物基因表達的調(diào)控 效果都很有限。單子葉植物是被子植物的主要類群，單子葉植物中的禾本科、百合科、棕櫚科和天 南星等，是非常重要的農(nóng)業(yè)作物。單子葉植物基因的強效啟動子，能夠調(diào)控植物高效率表達 具有特殊性狀的外源基因，對優(yōu)良作物的分子育種研究意義重大。 在強效啟動子相關(guān)研究領(lǐng)域，發(fā)現(xiàn)并驗證了許多單子葉植物的啟動子。此外，雙子 葉植物中的一些強效啟動子如CsVMV(Cassava Vein Mosaic Virus)啟動子、番茄E8啟動 子、白藜蘆醇合酶基因Vstl啟動子等高效啟動子，在單子葉植物中也有很強的基因調(diào)控作 用。盡管已經(jīng)有上述已知的單子葉植物的啟動子，本發(fā)明人通過對水稻基因組的深入 研究，提供了一種新的單子葉植物啟動子，所述啟動子能夠用于調(diào)控單子葉植物中目的基 因表達，同時為研究單子葉植物中目的基因表達提供了一種新的工具和選擇。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的一個方面，提供了一種具有SEQ ID NO 1所示核苷酸序列的單子葉植物 啟動子。在本發(fā)明中，所述啟動子的具體堿基序列長度為2844個堿基，如SEQ ID N0:1所 示TTGAACGAAGACCAGGTCAACACCTTCACATCAGCTGAAACTGTCATCCAAACTATCGAGGAAGTCAAA TTATACCGGTTTTAATAGTTGGATGGTTGAGAAATCTGGTATTGTGGTTAGATATACGAATTAGATTCAGCCGCTTA ACTAGTGAAAAACATATATGTGGACTCGTTCGTCATTCACACAACAAAAAATTTAGGCTCACTGACATGTGGGGCCG ACATGTCATCCCCCCTCTCTCATCCTTCCTTCTCCCTCCCTCTCTGTTTCTCTTCCTCTCCCCTTCGGCAGCGAGCG GGCGAGAGCCGGAGCGGCGACACCATCTCTCCGGCCCTCACCCCTCCGGAGATGGAGGAGGTGTCGTGGCCGGCGAA GAGGGTGACCATGGCGGTGTCGATGATCCCCTCTTTGGTCAGCAGCGACCCGCCGCTGTTCAATGCCGCCACGTAGG CGCCACGTCAACGAAACTGCCCTTCAAAACCGCTGAGGGAGTCAAATTGCACTGGTTTTAATAGTTGGGGGTCGAGA TATCCGGTATCGTGGTTCAGGGATATGAATTAGATTCGACCACTAGTTAAGGGAGCCTAAGTGAACTTATTTCCCTG GACAAACCTATGTCCGGCTCGTCTCAGTTTGGATTGTGTGGGTCATCTAGATGGGCTTTGTATTGCTAGGAAGGAGA TAAGAGCCCGTTTAGATGGAGGAGCCCACAATAATCTCTTTAAGCTAACATGAAGTCCTAGTATAAGGTTTGGCTAG GAAAATCAGAGCCAAACTTTAGCTAGCAATAAGTAAGGGACAAAACCGTCACATTTCCTCTTGTATCATTGTTGTGA GGAAGGTGCCAAGAAAACATACAATTGTCACAAGTATTGCCGTGGTACCTAATACAATCATAGCTCTGATTGGTTCA GCCACGAGTGACAGGCTATAAAAAAATATAAATGAAGAAACCAGCAAAGTTTGTGATTTAAAAGTTAAGGTTGAAAG ATAGACTATGAATAAGAAACCCCAAATCAACCTGGAACTAAAATTAAGTTTTAAAACTTAAATTTTAACTGTGAATG ACAGTTAAAATTTTAACTTCACTATACCACTCAGCGTGTGAATTGCCACAATGAATAAAAACCGTTGCAATTTTGTG CTAATTAAAACATAAAGTGAACAATTTAGACGCAAACTATATCGATCTGTTTTTAAAGTTCAGTTTATAAGATAGAA ATTTTACCAAGTAGGTCCTATTTCACTATTTTTATAGAATTGAAGATTAAAAACTGTCCGGAAGAGAATGACAGTAG CAGGGCGTGTGATGGTTAAGTCGTGAACATTGAAGTCGTCCGGAAGAGAATGGTGGAGCAGTATGCGATGGTGGAGT CGTGGGAAGGGAGGATATTGAGCTAGCTTAGTGCGTTTGGGTTTGTTATCTTAACTCGGTTTGGTAACCTTAACGAT CTAAAAGCATAACTCAGCTTGGCTCGACTCACAACTTGACTCGTTAACGAGTTCTCTCATTAATATCACATTTGCAT CTTTGAATTGATTTACCAATTTATCATATATTAATATAATGAATAAACACCAAATGATAAATAACTCATTGAATCCAAATAATTTATAAGCAATTAATGGACTAATGTACTTATGTATAAAATGTATAAAAATATATATTGACCTCATGGCCTA GCAAGCTACACAAGTAGCTAACGGTATATCTTATTAAGCTAATGAGCTAAAAACCTAGCTCGACTCAATATACTATG GCTATGAGTTCAAGCCGTTCGAAACCATCGGCTTTTTTTTTAACCGCTAGTCATGAGTTCAGTGCATGGCTAGCGCA TATCCCACACCACATGTGCGGGTGTGTTTTTAATAGGAATTTAGTAATGTTGAGAGGATTTATCATCTATCTTTCTT TTTCTTAAACGTGTGTTAGAGATCTACCCGCAAATGTGTAACTATAGTGTATGTGCACAATGCACAGTGCACGTGTG TTTTCTGTGTAACAGGGGGAAAAAAGAAAGAAAAAGAACGGCAGCGGCAACGTGGGCGCCCAACGAAATCTGAATTT CTGAACATCCCGGAACGTAAGAACAGCGCTACGTTGGCCGAGACCGGAGAGCGACGTGGATGTTAAGCTTACTCCAG GCCTCAGAAAAACAAGAGGATCCGGGAGACTGAACTGATGATGGACCGGGGGCGAGGGCCACCGCAAGATGCATTGC AGCAGGCGCGAGCCCGCATGGCCACATCTCGCAAATCCTCGCTTCCCCTCCCCCTCGCCCATCGTTTACCGACGCAA TCTGCCAATCTCGCATTCGCAAGAGCTGTACCGCTCGGTCCACGAGCAGCCAACCTTGGCATTTTTACCTCCGAAAG CGAGCTCGACCTCCTCAAGAATGACAGAATCGAACGCCGAATATCCATCAGCTGCGTAGCCATCACCGCCTGCGTCG CAGAGAGGGCCTCCCATGCAGTACCGCGTACAATATCACGTACTACCTGAAAGGCTGGAACGCTCAGTTCTTCACCG CGACAAGAATCACCGAGGGGAAAAAGAAAAAACGGCGGACACATAATGGATGGAGCAGCTGAACTTTGAGATGTGTG TGACACACATGTGTTTGTGTGGGTGACGCGATGGCTGTGCGAGAACGCTGGGAGCCATACGTTGGGCTATCCGAAAT CTCATCTCTCGCCCAATCCGGGCCTCACGATGACACCTCGCTGCACCGCGCACCACAAACCCCTGGCGCGCCCAATC CCACACTCATATATACACACTTCCCGGCCTCGCCGTCCTAGCTTGCTGCTGCTGCATTCTTCTTGATCTGATCGTCG GAC (SEQ ID NO 1)在本發(fā)明中，將SEQ ID NO :1所示的啟動子序列稱為啟動子BgIosP548，或簡稱為 P548啟動子。該啟動子為組成型啟動子，帶有該啟動子和GUS的水稻愈傷組織經(jīng)GUS染色實驗 后，所述水稻愈傷組織變?yōu)樗{色。本發(fā)明的又一方面，涉及具有與SEQ ID NO :1所示核苷酸序列互補的序列的啟動子。本發(fā)明的又一方面，還涉及SEQ ID NO :1所示單子葉植物啟動子的具有啟動子功 能的選自如下的變體1)在高等嚴(yán)緊條件下與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列雜交的核苷酸序列，2)對SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修 飾的核苷酸序列，和3)與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一性的核苷酸序列。典型地，“雜交條件”根據(jù)測量雜交時所用條件的“嚴(yán)緊性”程度來分類。嚴(yán)緊性程度可以以 例如核酸結(jié)合復(fù)合物或探針的解鏈溫度(Tm)為依據(jù)。例如，“最大嚴(yán)緊性”典型地發(fā)生在約 Tm-5°C (低于探針Tm 5°C )；“高等嚴(yán)緊性”發(fā)生在Tm以下約5_10°C ；“中等嚴(yán)緊性”發(fā)生 在探針Tm以下約10-20°C ；“低嚴(yán)緊性”發(fā)生在Tm以下約20_25°C。作為替代，或者進一步 地，雜交條件可以以雜交的鹽或離子強度條件和/或一或多次的嚴(yán)緊性洗滌為依據(jù)。例如， 6XSSC=極低嚴(yán)緊性；3XSSC =低至中等嚴(yán)緊性；IXSSC=中等嚴(yán)緊性；0.5XSSC=高等 嚴(yán)緊性。從功能上說，可以采用最大嚴(yán)緊性條件確定與雜交探針嚴(yán)緊同一或近嚴(yán)緊同一的 核酸序列；而采用高等嚴(yán)緊性條件確定與該探針有約80%或更多序列同一性的核酸序列。對于要求高選擇性的應(yīng)用，典型地期望采用相對嚴(yán)緊的條件來形成雜交體，例如， 選擇相對低的鹽和/或高溫度條件。Sambrook等(Sambr00k，J.等(1989)分子克隆，實驗室手冊，Cold Spring Harbor Press, Plainview, N. Y.)提供了包括中等嚴(yán)緊性和高等嚴(yán)緊 性在內(nèi)的雜交條件。為便于說明，用于檢測本發(fā)明的多核苷酸與其它多核苷酸雜交的合適的中度嚴(yán)緊 條件包括用 5XSSC、0. 5% SDS、1. OmM EDTA(ρΗ8· 0)溶液預(yù)洗；在 50-65°C下在 5XSSC 中 雜交過夜；隨后用含0. SDS的2X、0. 5X和0. 2XSSC在65°C下各洗滌兩次2 0分鐘。 本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解，能容易地操作雜交嚴(yán)緊性，如改變雜交溶液 的含鹽量和/或雜 交溫度。例如，在另一個實施方案中，合適的高度嚴(yán)緊雜交條件包括上述條件，不同之處在 于雜交溫度升高到例如60-65°C或65-70°C。在本發(fā)明中，所述在高等嚴(yán)緊條件下與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列雜交的核 苷酸序列，其具有與SEQ ID NO :1所示的核苷酸序列相同或相似的啟動子活性。在本發(fā)明中，所述對SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、 缺失、添加修飾的核苷酸序列，是指分別或同時在所述核苷酸序列的5’端和/或3’端，和 /或序列內(nèi)部進行例如不超過2-45個，或者不超過2-30個，或者不超過3-20個，或者不超 過4-15個，或者不超過5-10個，或者不超過6-8個的分別用逐個連續(xù)整數(shù)表示的堿基的取 代、缺失、添加修飾。在本發(fā)明中，所述對SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列進行如上述一個或多個堿基 的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列具有與SEQ ID NO :1所示的核苷酸序列相同或相似的 啟動子活性。通過一種多核苷酸進行說明，其所具有的核苷酸序列例如與SEQ ID NO 1的參考 核苷酸序列至少具95%的“同一性”是指在SEQ ID NO :1的參考核苷酸序列之每100個 核苷酸中，該多核苷酸的核苷酸序列除了含有多達5個核苷酸的不同外，該多核苷酸之核 苷酸序列與參考序列相同。換句話說，為了獲得核苷酸序列與參考核苷酸序列至少95%相 同的多核苷酸，參考序列中多達5%的核苷酸可被刪除或被另一核苷酸替代；或可將一些 核苷酸插入?yún)⒖夹蛄兄?，其中插入的核苷酸可多達參考序列之總核苷酸的5% ；或在一些核 苷酸中，存在刪除、插入和替換的組合，其中所述核苷酸多達參考序列之總核苷酸的5%。參 考序列的這些突變可發(fā)生在參考核苷酸序列的5或3末端位置，或在這些末端位置之間的 任意地方，它們或單獨散在于參考序列的核苷酸中，或以一個或多個鄰近的組存在于參考 序列中。在本發(fā)明中，用于確定序列同一性和序列相似性百分數(shù)的算法是例如BLAST和 BLAST 2.0 算法，它們分別描述在 Altschul 等(1977)Nucl. Acid. Res. 25 :3389_3402 和 Altschul等(1990) J. Mol. Biol. 215 :403_410。采用例如文獻中所述或者默認參數(shù)，BLAST 和BLAST 2.0可以用于確定本發(fā)明的核苷酸序列同一性百分數(shù)。執(zhí)行BLAST分析的軟件可 以通過國立生物技術(shù)信息中心為公眾所獲得。在本發(fā)明中，所述與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一 性的核苷酸序列包括與SEQ ID NO :1所公開序列基本同一的多核苷酸序列，例如當(dāng)采用本 文所述方法(例如采用標(biāo)準(zhǔn)參數(shù)的BLAST分析)時，與本發(fā)明多核苷酸序列相比含有至少 90%序列同一性、優(yōu)選至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%或更高的 序列同一性的那些序列。在本發(fā)明中，所述與SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一性的核苷酸序列具有與SEQ ID NO :1所示的核苷酸序列相同或相似的啟動子活性。本發(fā)明中，所述的啟動子來源于單子葉植物，具體的，所述單子葉植物為水稻，例 如所述水禾S為日本晴(Oryza sativa L. ssp. japonica cv. Nipponbare) 0本發(fā)明的又一方面，還涉及一種含有本發(fā)明所述單子葉植物啟動子的重組載體。 所述重組載體可以通過將上述啟動子插入到克隆載體或表達載體而得到。適于構(gòu)建本發(fā)明所述重組載體的克隆載體包括但不限于，例如pUC18、pUC19、 pUC118、pUC119、pMD19-T、pMD20-T、pMD18-T Simple Vecter、pMD19_T Simple Vecter 等。
適于構(gòu)建本發(fā)明所述的表達載體包括但不限于，例如pBI121、pl3W4、pGEM等。在本發(fā)明的一個實施方案中，所述重組載體為p8+P548重組載體。本發(fā)明的又一方面，還涉及含有本發(fā)明所述單子葉植物啟動子的所述重組載體的 重組細胞。所述重組細胞可以通過將含有本發(fā)明所述單子葉植物啟動子的所述重組載體轉(zhuǎn) 化至宿主細胞而得到。適于構(gòu)建本發(fā)明所述重組細胞的宿主細胞包括但不限于，例如根癌農(nóng)桿菌細胞 LBA4404、EHA105、GV3101 等。在本發(fā)明的一個實施方案中，所述重組細胞為重組根癌農(nóng)桿菌 (Agrobacteriumtumefaciens)EHA105-P548。本發(fā)明的又一方面，還涉及一種單子葉植物愈傷組織，所述愈傷組織轉(zhuǎn)化有本發(fā) 明所述的啟動子。在本發(fā)明的一個實施方案中，所述單子葉植物為水稻。所述水稻包括但不 限于，日本晴，中花9、中花10、中花11、臺北309、丹江8號、云稻2號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐 優(yōu)22，黔優(yōu)88、11優(yōu)416、11優(yōu)107,11優(yōu)128,11優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu)527、川農(nóng)1號、雜0152、皖 稻88、皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、 皖稻195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207，以及津原101 (上述水 稻品種均可購自安徽徽商農(nóng)家福有限公司)。在本發(fā)明的又一實施方案中，所述水稻為日本 晴。本發(fā)明的又一方面，還涉及一種制備本發(fā)明所述啟動子的方法，包括如下步驟1)根據(jù)SEQ ID NO 1所示的核苷酸序列，設(shè)計PCR擴增引物對，2)以水稻日本晴基因組DNA為模板，使用步驟1)中所設(shè)計的PCR擴增引物對進行 PCR擴增。本領(lǐng)域技術(shù)人員周知，可以根據(jù)待擴增的目的核苷酸序列按照堿基互補原則設(shè)計 相應(yīng)的PCR擴增引物對。在本發(fā)明的一個實施方案中，所述PCR擴增引物對如SEQ ID NO 2 和 SEQ ID NO 3 所示。本發(fā)明的又一方面，還涉及一種調(diào)控單子葉植物中目的基因表達的方法，所述方 法包括用本發(fā)明所述單子葉植物啟動子轉(zhuǎn)化單子葉植物的愈傷組織的步驟。在本發(fā)明的一 個實施方案中，所述單子葉植物愈傷組織的轉(zhuǎn)化利用了含有本發(fā)明所述單子葉植物啟動子 的重組細胞。在本發(fā)明的一個具體實施方案中，所述單子葉植物的愈傷組織為水稻愈傷組 織，具體地，所述水稻為日本晴。在本發(fā)明中，可采用植物基因轉(zhuǎn)化技術(shù)將目的基因插入到植物基因組中，包括農(nóng) 桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化、病毒介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化、顯微注射、粒子轟擊、基因槍轉(zhuǎn)化和電穿孔等。本領(lǐng)域周 知，農(nóng)桿菌介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)化常被用于單子葉植物和雙子葉植物的基因轉(zhuǎn)化，但其它轉(zhuǎn)化技術(shù)也可用于本發(fā)明所述單子葉植物的基因轉(zhuǎn)化。當(dāng)然，適于本發(fā)明的轉(zhuǎn)化單子葉植物的另 一種方法是粒子轟擊(顯微金或鎢粒子包覆轉(zhuǎn)化的DNA)胚性愈傷組織或胚胎開發(fā)。另外， 還可以采用的轉(zhuǎn)化單子葉植物的方法是原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化?；蜣D(zhuǎn)化后，采用通用的方法來篩 選和再生整合有表達單元的植株。本發(fā)明中，可利用所述單子葉植物啟動子調(diào)控目的基因表達的所述單子葉植物包 括但不限于，例如水稻、小麥、玉米、小米、甘蔗、高粱、大麥等。
本發(fā)明的又一方面，還涉及本發(fā)明所述單子葉植物啟動子在單子葉植物中調(diào)控目 的基因表達的應(yīng)用。在本發(fā)明的一個實施方案中，利用本發(fā)明所述啟動子調(diào)控的目的基因 是GUS。在本發(fā)明的一個實施方案中，所述單子葉植物為水稻，具體的所述水稻為日本晴。為實現(xiàn)上述調(diào)控目的基因表達的目的，本發(fā)明所述啟動子可以以單拷貝和/或多 拷貝的形式應(yīng)用，也可以與現(xiàn)有技術(shù)中已知的啟動子聯(lián)用。本發(fā)明的又一方面，涉及本發(fā)明所述啟動子在水稻育種中的用途。所述水稻為日 本晴、中花9、中花10、中花11、臺北309、丹江8號、云稻2號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐優(yōu)22，黔 優(yōu)88、II優(yōu)416、II優(yōu)107、II優(yōu)128、II優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu)527、川農(nóng)1號、雜0152、皖稻88、 皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻 195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207，以及津原101等，在本發(fā)明 的一個實施方案中，所述水稻為日本晴。本發(fā)明的啟動子可成為一種新的啟動子作為單子葉植物、尤其是水稻轉(zhuǎn)基因的工 具啟動子，為開展低表達基因轉(zhuǎn)化苗篩選、植物花器官敗育等分子育種研究提供便利，從而 極大的縮短優(yōu)良品種的選育時間。本發(fā)明的啟動子可廣泛用于培育水稻、小麥、玉米、小米、 甘蔗、高粱、大麥等單子葉植物。發(fā)明的有益效果為了尋找新的單子葉植物啟動子，用于調(diào)控單子葉植物目的基因表達，同時為研 究單子葉植物基因表達提供新的工具和選擇，本發(fā)明人通過生物信息學(xué)研究獲得，并采用 生物學(xué)實驗驗證了所述啟動子BgIosP548的功能。具體地，所述啟動子能夠在水稻中調(diào)控 ⑶S基因表達。


圖1是啟動子BgIosP548的PCR擴增檢測結(jié)果，其中，泳道1 :200bp DNA LadderMarker，泳道 2 :PCR 擴增產(chǎn)物，泳道 3 :lkb DNA Ladder Marker，其右側(cè)的數(shù)字 2000 和3000表示所指向的Ladder Marker的條帶的大小，單位都是bp。圖2是用于構(gòu)建p8質(zhì)粒的pCAMBIA-1301質(zhì)粒示意圖。圖3是p8質(zhì)粒示意圖中多克隆位點和⑶S序列部分的示意圖。圖4是p8質(zhì)粒示意圖。圖5是經(jīng)轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織的GUS染色結(jié)果。其中，由帶有本發(fā)明所述啟動子 P548序列的重組根癌農(nóng)桿菌P8+P548轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織(左)經(jīng)⑶S染色后呈現(xiàn)藍色； 不帶有本發(fā)明啟動子序列的重組根癌農(nóng)桿菌p8質(zhì)粒的水稻愈傷組織(對照，右)經(jīng)⑶S染 色后顏色未發(fā)生變化。
具體實施例方式下面將結(jié)合實施例對本發(fā)明的實施方案進行詳細描述，但是本領(lǐng)域技術(shù)人員將會 理解，下列實施例僅用于說明本發(fā)明，而不應(yīng)視為限定本發(fā)明的范圍。實施例中未注明具體 技術(shù)或條件者，按照本領(lǐng)域內(nèi)的文獻所描述的技術(shù)或條件(例如參考J.薩姆布魯克等著， 黃培堂等譯的《分子克隆實驗指南》，第三版，科學(xué)出版社)或者按照產(chǎn)品說明書進行。所用 試劑或儀器未注明生產(chǎn)廠商者，均為可以通過市購獲得的常規(guī)產(chǎn)品。實施例1P548啟動子片段的PCR擴增和pMD18_T+P548重組載體的構(gòu)建PCR 擴增使用植物基因組DNA提取試劑盒(TIANGEN新型植物基因組DNA提取試劑盒，目錄 號DP3 20-02)提取水稻日本晴(2009年12月18日保藏于湖北省武漢市武昌珞珈山武漢 大學(xué)保藏中心，即中國典型培養(yǎng)物保藏中心(CCTCC)，保藏編號為CCTCC-P200910)的基因 組DNA，根據(jù)該啟動子在水稻日本晴gDNA中的序列，分別在首尾設(shè)計一對PCR特異性擴增引 物(上游引物F1，加限制性酶切位點EcoR I和保護堿基，下游引物R1，加限制性酶切位點 Sbf I和保護堿基)。以上述提取的水稻日本晴的gDNA為模板，高保真Ex TaqTM(TaKaRa, DRR100B)聚合酶進行PCR擴增。如表1所示。表1基因啟動子擴增的PCR體系
組成_體積(μ 1 )
基因組DNA0. 2dNTPs (2.5 mM)2
10 χ Ex Buffer (含鎂離子)2.5
引物 Fl ( 50 μ Μ)1
引物 Rl ( 50 μ Μ)1Ex taq0. 2
ddH2Q_補滿至總體積25 μ 1PCR擴增程序為94°C預(yù)變性5min，然后以94°C變性45s，55°C退火50s，72°C延伸 90s，進行35個反應(yīng)循環(huán)，最后72°C延伸7min。其中，上游引物Fl =GgaattcGAATTCTTGAACGAAGACCAGGTCAAC (SEQ ID NO :2)，其中 小寫字母代表EcoR I酶切位點。下游引物Rl TGcctgcaggGTCCGACGATCAGATCAAGAA(SEQ ID NO :3)，其中小寫字母 代表Sbf I酶切位點。PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)1. 0%瓊脂糖凝膠電泳分離，得到大小為2861bp的條帶(圖1)，使 用TIANGEN瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(目錄號DP209-03)進行純化回收。pMD18-T+P548重組載體的構(gòu)建將上述得到的PCR擴增產(chǎn)物進行T/A克隆(pMD18-T質(zhì)粒，TaKaRa，D103A)，轉(zhuǎn)化大 腸桿菌，挑取陽性克隆測序(如SEQ ID N0:4所示)，證明準(zhǔn)確。其中，T/A克隆的連接條件如下
Τ/Α 連接體系10 μ 1pMD18-T 1 μ 12氺solution I 5μ 1PCR擴增產(chǎn)物(回收插入片段)IOng 20ng， 根據(jù)其濃度定ddH20 補齊至 10 μ 1于16 °C在節(jié)能型智能恒溫槽(寧波新芝，SDC-6)中連接8h以上，得到 PMD18-T+P548重組載體。將經(jīng)過上述連接后的產(chǎn)物按照如下方法轉(zhuǎn)化大腸桿菌從超低溫冰箱中取出按照《分子克隆實驗指南》(第三版，科學(xué)出版社)所示氯 化鈣法制備的感受態(tài)細胞100μ 1 DH5a (中國科學(xué)院昆明動物研究所董楊提供；或者可從 例如上海生工購得)，冰上融化后，加入10 μ 1如上所得的連接產(chǎn)物，即pMD18-T+P548重 組載體，輕輕攪勻，冰浴30min，42°C熱激60s，冰浴5min，加入600 μ 1 4°C預(yù)冷的SOC培養(yǎng) 基(具體配方詳見《分子克隆實驗指南》，第三版，科學(xué)出版社)，37°C 220rpm復(fù)蘇45min， 8000rpm離心30s，去上清，留取150 μ 1，用剩下的150 μ 1上清重懸沉淀后的混合物，輕輕吹 勻，玻璃珠涂布LB (卡那霉素)平板(具體配方詳見《分子克隆實驗指南》，第三版，科學(xué)出 版社)，37°C倒置培養(yǎng)16h 24h。獲得含有pMD18-T+P548克隆載體的重組大腸桿菌，命名 為DH5 a -P548。深圳華大基因科技股份有限公司對pMD18_T+P548克隆載體中的P548進行 測序，結(jié)果如下ggaattc |ttgaacgaagaccaggtcaac| accttcacatcagctgaaactgtcatccaaactatcgag
gaagtcaaattataccggttttaatagttggatggttgagaaatctggtattgtggttagatatacgaattagattc agccgcttaactagtgaaaaacatatatgtggactcgttcgtcattcacacaacaaaaaatttaggctcactgacat gtggggccgacatgtcatcccccctctctcatccttccttctccctccctctctgtttctcttcctctccccttcgg cagcgagcgggcgagagccggagcggcgacaccatctctccggccctcacccctccggagatggaggaggtgtcgtg gccggcgaagagggtgaccatggcggtgtcgatgatcccctctttggtcagcagcgacccgccgctgttcaatgccg ccacgtaggcgccacgtcaacgaaactgcccttcaaaaccgctgagggagtcaaattgcactggttttaatagttgg gggtcgagatatccggtatcgtggttcagggatatgaattagattcgaccactagttaagggagcctaagtgaactt atttccctggacaaacctatgtccggctcgtctcagtttggattgtgtgggtcatctagatgggctttgtattgcta ggaaggagataagagcccgtttagatggaggagcccacaataatctctttaagctaacatgaagtcctagtataagg tttggctaggaaaatcagagccaaactttagctagcaataagtaagggacaaaaccgtcacatttcctcttgtatca ttgttgtgaggaaggtgccaagaaaacatacaattgtcacaagtattgccgtggtacctaatacaatcatagctctg attggttcagccacgagtgacaggctataaaaaaatataaatgaagaaaccagcaaagtttgtgatttaaaagttaa ggttgaaagatagactatgaataagaaaccccaaatcaacctggaactaaaattaagttttaaaacttaaattttaa ctgtgaatgacagttaaaattttaacttcactataccactcagcgtgtgaattgccacaatgaataaaaaccgttgc aattttgtgctaattaaaacataaagtgaacaatttagacgcaaactatatcgatctgtttttaaagttcagtttat aagatagaaattttaccaagtaggtcctatttcactatttttatagaattgaagattaaaaactgtccggaagagaa tgacagtagcagggcgtgtgatggttaagtcgtgaacattgaagtcgtccggaagagaatggtggagcagtatgcga tggtggagtcgtgggaagggaggatattgagctagcttagtgcgtttgggtttgttatcttaactcggtttggtaac cttaacgatctaaaagcataactcagcttggctcgactcacaacttgactcgttaacgagttctctcattaatatca catttgcatctttgaattgatttaccaatttatcatatattaatataatgaataaacaccaaatgataaataactc attgaatccaaataatttataagcaattaatggactaatgtacttatgtataaaatgtataaaaatatatattgacCTCATGGCCTAGCAAGCTACACAAGTAGCTAACGGTATATCTTATTAAGCTAATGAGCTAAAAACCTAGCTCGACT CAATATACTATGGCTATGAGTTCAAGCCGTTCGAAACCATCGGCTTTTTTTTTAACCGCTAGTCATGAGTTCAGTG CATGGCTAGCGCATATCCCACACCACATGTGCGGGTGTGTTTTTAATAGGAATTTAGTAATGTTGAGAGGATTTAT CATCTATCTTTCTTTTTCTTAAACGTGTGTTAGAGATCTACCCGCAAATGTGTAACTATAGTGTATGTGCACAATG CACAGTGCACGTGTGTTTTCTGTGTAACAGGGGGAAAAAAGAAAGAAAAAGAACGGCAGCGGCAACGTGGGCGCCC AACGAAATCTGAATTTCTGAACATCCCGGAACGTAAGAACAGCGCTACGTTGGCCGAGACCGGAGAGCGACGTGGA TGTTAAGCTTACTCCAGGCCTCAGAAAAACAAGAGGATCCGGGAGACTGAACTGATGATGGACCGGGGGCGAGGGC CACCGCAAGATGCATTGCAGCAGGCGCGAGCCCGCATGGCCACATCTCGCAAATCCTCGCTTCCCCTCCCCCTCGC CCATCGTTTACCGACGCAATCTGCCAATCTCGCATTCGCAAGAGCTGTACCGCTCGGTCCACGAGCAGCCAACCTT GGCATTTTTACCTCCGAAAGCGAGCTCGACCTCCTCAAGAATGACAGAATCGAACGCCGAATATCCATCAGCTGCG TAGCCATCACCGCCTGCGTCGCAGAGAGGGCCTCCCATGCAGTACCGCGTACAATATCACGTACTACCTGAAAGGC TGGAACGCTCAGTTCTTCACCGCGACAAGAATCACCGAGGGGAAAAAGAAAAAACGGCGGACACATAATGGATGGAG CAGCTGAACTTTGAGATGTGTGTGACACACATGTGTTTGTGTGGGTGACGCGATGGCTGTGCGAGAACGCTGGGAGC CATACGTTGGGCTATCCGAAATCTCATCTCTCGCCCAATCCGGGCCTCACGATGACACCTCGCTGCACCGCGCACCA CAAACCCCTGGCGCGCCCAATCCCACACTCATATATACACACTTCCCGGCCTCGCCGTCCTAGCTTGCTGCTGCTGC
a |ttcttcttgatctgat||cgtcggac| cctgcaggca (SEQ id no :4)上面的序列中，帶下劃線的為酶切位點(EcoR I和Sbf I)，帶方框的為引物序列。測序結(jié)果表明，獲得的pMD18-T+P548克隆載體中P548啟動子序列正確。
實施例2表達載體-p8+P548重組載體的構(gòu)建按照TIANGEN普通質(zhì)粒小提試劑盒(目錄號DP103_03)的操作手冊，從實施例1 構(gòu)建的轉(zhuǎn)化有啟動子P548的大腸桿菌DH5 α -Ρ548中提取帶有本發(fā)明Ρ548啟動子序列的 克隆載體PMD18-T+P548 ；純化后用相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶EcoR I (NEB)和Sbf I (NEB)進行 酶切，回收相應(yīng)的啟動子插入片段，并分別與Ρ8質(zhì)粒用相同的限制性內(nèi)切酶酶切后回收的 載體大片段進行連接。將所得連接產(chǎn)物ρ8+Ρ548重組載體轉(zhuǎn)化按照《分子克隆實驗指南》(第三版，科學(xué) 出版社)所示氯化鈣法制備的感受態(tài)細胞DH5ci，37°C倒置培養(yǎng)16 24h，待轉(zhuǎn)化子長出菌 落后，挑取單克隆進行PCR檢測和酶切鑒定。p8質(zhì)粒構(gòu)建本發(fā)明中所使用的p8質(zhì)粒是由pCAMBIA-1301質(zhì)粒(中國科學(xué)院昆明動物研究所 董楊提供；或者可從例如上海國瑞基因科技有限公司購得，該公司的pCAMBIA-1301質(zhì)粒的 原始來源是 The CAMBIA Bios (biological open source) Licensee, Australia)按照如下 方式改造并構(gòu)建的，具體說明如下用Kpn I/Nco I (NEB)雙酶切質(zhì)粒pCAMBIA-1301 (參見圖2)，回收大片段。根據(jù) 所采用的限制性內(nèi)切酶位點合成如下序列GGTACCAAGCTTACTAGTCCTGCAGGTCTAGAGGATCCGT CGACCATGG(SEQ ID NO :5)(包含的酶切位點是Kpn I/HindIII/Spe I/Sbf I/Pst I/Xba I/ BamH I/Sal I/Nco I)，用Kpn I/Nco I雙酶切后回收，與上述所回收的大片段連接后轉(zhuǎn)化 toplO細胞(中國科學(xué)院昆明動物研究所董楊提供；或者可從例如北京索萊寶科技有限公 司購得)。用引物 GCTTCCGGCTCGTATGTTGT(SEQ ID NO 6)/GAGTCGTCGGTTCTGTAAC(SEQ ID NO 7)篩選轉(zhuǎn)化子，通過PCR檢測方法，帶有擴增片段為350bp的轉(zhuǎn)化子即為含有需要構(gòu)建的多克隆位點及gus序列的p8質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化子(參見圖4)。所述p8質(zhì)粒中的多克 隆位點和⑶s序列的長度2353堿基，如seq id no 8所示 (參見圖3)gttggcaagctgctctagccaatacgcaaaccgcctctccccgcgcgttggccgattc attaatgcagctggcacgacaggtttcccgactggaaagcgggcagtgagcgcaacgcaattaat gtgagttagctcactcattaggcaccccaggctttacactttat gcttccggctcgtatgttgt
gtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgaccatgattac jgaattc
gagctc |ggtacc丨 aagctt |actagt| c_ IctgcagI g_ Jtctaga| ggatcc Jgtcgac
c ATGGTAGATCTGAGGGTΑΛΑTTTCTAGTTTTTCTCCTTCATTTTCTTGGTTAGGACCCTTTTCTC TTTTTA TTTTTTTGACCTTTGA TCTTTCTTTAAACTGA TCTA ΤΤΤΤΤΤΛΛ TTGA TTGGTTMGGTCTAAA TA TT ΚΛΤΜ€ΤΤΤ.\.Κ (;.Π’ΜΚΚΑΤΤΛΠ ΤΑΠ Τ νΜΤΩ’Λ7 ΛπΛΤ ΛπΛ ’Λ^^^￡￡β^ ACTCGTCCGTCCTGTAGAAACCCCAACCCGTGAAATCAAAAAACTCGACGGCCTGTGGGCATTCAGTCTGGATC GCGAAAA CTGTGGAA TTGA TCA GCGTTGGTGGGAAAGCGCGTTA CAA GAAAGCCGGGCAA TTGCTGTGCCA GGC A GTTTTAA CGA TCA GTTCGCCGA TGCA GA TA TTCGTAA TTA TGCGGGCAA CGTCTGGTA TCA GCGCGAA GTCTT TA TA CCGAAA GGTTGGGCA GGCCA GCGTA TCGTGCTGCGTTTCGA TGCGGTCA CTCA TTA CGGCAAA GTGTGGG TCAA TAA TCA GGAA GTGA TGGA GCA TCA GGGCGGCTA TA CGCCA TTTGAA GCCGA TGTCA CGCCGTA TGTTA TT GCCGGGAAAA GTGTA CGTA TCA CCGTTTGTGTGAA CAA CGAA CTGAA CTGGCA GA CTA TCCCGCCGGGAA TGGT GA TTA CCGA CGAAAA CGGCAAGAAAAA GCAGTCTTA CTTCCA TGA TTTCTTTAA CTA TGCCGGAA TCCA TCGCAgcgtaa tgctcta ca cca cgccgaa ca cctgggtgga cga ta tca ccgtggtga cgca tgtcgcgcaaga ctgt
aaccacgcgtctgttgactggcaggtggtggccaatggtgatgtcagcgttgaactgcgtgatgcggatcaaca
ggtggttgcaa ctgga caa ggca cta gcggga ctttgcaa gtggtgaa tccgca cctctggcaa ccgggtgaa g
gtta tctcta tgaa ctcgaa gtca ca gccaa aa gcca ga ca ga gtctga ta tcta cccgcttcgcgtcggca tc
cggtca gtggca gtgaa gggccaaca gttcctga ttaaccacaaa ccgttcta cttta ctggctttggtcgtca
tgaa ga tgcgga ctta cgtggcaaa gga ttcga taa cgtgctga tggtgca cga cca cgca ttaa tgga ctgga
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gccgaaagaa ctgta ca gcgaagaggca gtcaa cggggaaactca gcaa gcgca ctta ca ggcga ttaaa ga gc
tga ta gcgcgtga caaaaa cca cccaa gcgtggtga tgtgga gta ttgccaa cgaa ccgga ta cccgtccgcaa
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caa tgtaa tgttctgcga cgctca ca ccga ta cca tca gcga tctctttga tgtgctgtgcctgaa ccgtta tt
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cga ca tgtggagtgaa ga gta tcagtgtgca tggctgga ta tgta tca ccgcgtctttga tcgcgtca gcgccg
tcgtcggtgaaca ggta tggaa tttcgccga ttttgcga cctcgca aggca ta ttgcgcgttggcggtaa caag
aaaggga tcttca ctcgcga ccgcaaa ccgaa gtcggcggcttttctgctgcaaaaa cgctgga ctggca tgaa cttcggtgaaaaa ccgca gcaggga ggcaaa caagctagcca cca cca ccacca cca cgtgtga ( S E Q
IDNO 8)如上序列所示本發(fā)明中所構(gòu)建的p8質(zhì)粒，其多克隆位點中的EcoR I/Sac I/Kpnl/ HindIII/Spe I/Sbf I/Pst I/Xba I/BamH I/Sal I/Nco I 限制性酶切位點分別用加框和下 劃線表示，篩選轉(zhuǎn)化子所用的引物GCTTCCGGCTCGTATGTTGT/GAGTCGTCGGTTCTGTA AC(即SEQ ID NO 6和7)用雙下劃線表示，GUS序列用斜體表示，其內(nèi)含子序列分別用斜體加底紋示
出ο重組載體p8+P548的構(gòu)建根據(jù)限制性內(nèi)切酶EcoR I (NEB)和Sbf I (NEB)操作說明，按照如下條件處理實施 例1中所得到的克隆載體PMD18-T+P548，以及如上所述構(gòu)建的p8質(zhì)粒。其中，克隆載體pMD18-T+P548及p8質(zhì)粒的酶切條件如下酶切體系50 μ 1無菌水34. 8 μ 110*buffer H5 μ 1EcoR I0. 1 μ 1 (IOU)
Sbf I0. 1 μ 1 (IOU)克隆載體pMD18-T+P548 或 ρ8 質(zhì)粒 10 μ 1 ( < IOOOng)
使用TIANGEN瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(目錄號DP209_03)分別回收經(jīng)酶切 的P8質(zhì)粒，以及啟動子P548插入片段，根據(jù)T4連接酶(TaKaRa，D2011A)操作說明，按照如 下條件進行連接連接體系10 μ 110*T4buffer1 μ 1酶切后的ρ8質(zhì)粒Ιμ (20ng)回收的啟動子P548插入片段 10-20ng，根據(jù)其濃度定無菌水補齊至9. 5μ1Τ4 ligase (TaKaRa, D2011A) 0. 5 μ 1Τ4 buffer冰上融化，酶切后的ρ8質(zhì)粒載體加入量約20ng，本發(fā)明中的Ρ548片段 加10-20ng。于16°C在節(jié)能型智能恒溫槽(寧波新芝，SDC-6)中連接8h以上將100 μ 1氯化鈣法制得的感受態(tài)細胞DH5 α從超低溫冰箱取出，冰上融化后，力口 入10 μ 1上面的連接產(chǎn)物，輕輕攪勻，冰浴3011^11，421熱激608，冰浴51^11，加入60(^1 4°C預(yù)冷的S0C，37°C下220rpm復(fù)蘇45min，8000rpm離心30s，去上清，留取150 μ 1，輕輕吹 勻，玻璃珠涂布LB (kan)，37°C倒置培養(yǎng)16 24h。得到重組載體p8+P548。分別以Fl (SEQ ID NO 2)和Rl (SEQ ID NO 3)為引物對所得重組載體p8+P548進 行PCR檢測，以確證所得重組載體P8+P548中含有所需啟動子P548。通過EcoR I/Sbfl酶 切篩選含有重組載體P8+P548轉(zhuǎn)化子。實施例3重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-P548細胞的制備將如實施例2所述方法構(gòu)建的P8+P548重組載體和作為對照的p8質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化 按照《分子克隆實驗指南》(第三版，科學(xué)出版社)中所述氯化鈣方法制備的根癌農(nóng)桿菌 EHA105(2009年12月24日保藏于湖北省武漢市武昌珞珈山武漢大學(xué)保藏中心，即中國典型 培養(yǎng)物保藏中心(CCTCC)，保藏編號為CCTCC M 209315)的感受態(tài)細胞，具體方法如下將根癌農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞EHA105于超低溫冰箱中取出，至于冰上解凍。融化 后，分別加入5μ 1的ρ8+Ρ548重組載體和ρ8質(zhì)粒以及作為對照的ρ8空載體，輕輕混 勻，冰浴IOmin，放入液氮中冷凍5min，37°C解凍5min，加入800 μ 1常溫的LB液體培養(yǎng) 基，28°C 160rpm復(fù)蘇3h，8000rpm離心30s，吸去上清，留下200 μ 1吹勻，涂布于加有 kan-rif (卡那霉素-利福平)雙抗的YM培養(yǎng)基平板上(50mg/l Kan, 10mg/l Rif，具體配 方參見表4)。28°C倒置培養(yǎng)2-3天。以 Fl (SEQ ID NO 2)和 Rl (SEQ ID NO 3)為引物進行 PCR 檢測和通過 EcoRI/Sbf I酶切篩選轉(zhuǎn)化子。PCR擴增出約2861bp條帶和酶切出約2854bp條帶的為重組載體p8+P548的重組 根癌農(nóng)桿菌。本發(fā)明中，按照如上述方法得到的帶有重組載體P8+P548的重組農(nóng)桿菌，命名為 重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-P548。按照本發(fā)明所述方法，得到的帶有p8質(zhì)粒的對照重組農(nóng)桿菌，命名為重組根癌農(nóng) 桿菌 EHA105-p8。實施例4水稻愈傷組織的誘導(dǎo)和轉(zhuǎn)化按照如下步驟誘導(dǎo)水稻愈傷組織，并分別用重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-P548和重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-p8轉(zhuǎn)化所述愈傷組織。1)將水稻日本晴種子去殼，70%乙醇表面消毒30s，然后用有效氯1.5%的次氯酸 鈉消毒30min，期間劇烈搖動，消毒后用滅菌水清洗5次；將消毒后的種子置于N6D培養(yǎng) 基 (具體配方參見表2)上，用封口膜封口 ；29. 5°C光照培養(yǎng)3-4周；2)選取活躍生長的愈傷組織(黃白色，干燥，直徑l_3mm)，在新N6D培養(yǎng)基上 29. 5°C光照培養(yǎng)3天；3)分別挑取如實施例3所構(gòu)建的重組根癌農(nóng)桿菌單菌落(重組根癌農(nóng)桿菌 EHA105-P548或重組根癌農(nóng)桿菌EHA105_p8)，于添加抗生素(50mg/l Kan, 10mg/lRif)的 YM培養(yǎng)基(具體配方參見表3、表4)上劃線培養(yǎng)3天，培養(yǎng)溫度28 V ；分別刮取上述重組 根癌農(nóng)桿菌置于添加了 30 μ 1 IOOmM的AS (Acetosyringone，乙酰丁香酮)的30ml AAM 培養(yǎng)基(具體配方參見表5)中，溫和重懸所述重組根癌農(nóng)桿菌細胞(重組根癌農(nóng)桿菌 EHA105-P548或重組根癌農(nóng)桿菌EHA105_p8)；4)將繼代培養(yǎng)的愈傷組織置于滅菌培養(yǎng)皿中；將如步驟3制備的重組根癌農(nóng)桿菌 懸液倒入培養(yǎng)皿中，將愈傷組織浸入其中15min ；5)倒掉重組根癌農(nóng)桿菌懸液，將愈傷組織用滅菌吸水紙吸掉多余的液體；于 N6-AS培養(yǎng)基(配方參見表6)上放一張滅菌濾紙，加Iml如上述含AS的AAM培養(yǎng)基，將愈 傷組織轉(zhuǎn)移至濾紙上；密封培養(yǎng)皿，28°C暗培養(yǎng)48-60h ；6)將受感染的愈傷組織置于50ml滅菌管中，用滅菌水搖動清洗，直至上清液變澄 清；將愈傷組織浸泡于含500mg/l羧芐青霉素(Cb)的無菌水中以殺死重組根癌農(nóng)桿菌；用 滅菌吸水紙除去愈傷組織上多余的水分，然后將其轉(zhuǎn)移至含lmg/1潮霉素B(HmB)和50mg/ 1 Carb的N6-AS培養(yǎng)基上；用封口膜密封培養(yǎng)皿，29. 5°C光照培養(yǎng)3_4周。實施例5水稻愈傷組織中的⑶S的表達為檢測經(jīng)過實施例4所述轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織中目的基因⑶S的表達情況，按照 Chen S Y 等在 Journal of Integrative Plant Biology, 2008, 50 (6) :742_751 所述的方 法，對分別用重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-P548或重組農(nóng)桿菌EHA105_p8轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織 進行染色。GUS 染色液的配方(Iml) 610 μ 1 0. 2Μ Na2HPO4 溶液(ρΗ = 7. 0) ；390 μ 1 0. 2Μ NaH2PO4 溶液和 10 μ 1 0. IM X-gluc。將分別用重組根癌農(nóng)桿菌EHA105-P548或重組根癌農(nóng)桿菌EHA105_p8轉(zhuǎn)化的水稻 愈傷組織浸泡在GUS染色液中，37°C保溫至出現(xiàn)藍色，拍照記錄，結(jié)果如圖5所示，經(jīng)含有啟 動子的P8+P548重組載體的重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織(圖5左)經(jīng)染色后 呈現(xiàn)藍色，經(jīng)不含有啟動子的p8質(zhì)粒重組根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的水稻愈傷組織(作為對 照，圖5右)經(jīng)GUS染色后顏色未發(fā)生變化。結(jié)果顯示，本發(fā)明的P548啟動子對GUS基因 表達具有調(diào)控作用。本發(fā)明實施例中所使用的相關(guān)培養(yǎng)基配方說明如下以下有關(guān)培養(yǎng)基中所稱的“常規(guī)滅菌”是指如下條件的滅菌121°C下蒸氣滅菌20 分鐘。表2N6D培養(yǎng)基N6Iiiacro 母液(20X) 50 ml 25 ml 100 ml Fe2EDTA 貯存液(100X) 10 ml 5 ml 20 ml N6Inicro 母液(1000X) 1 ml 0.5 ml 2 ml N6維生素貯存液(1000X) 1 ml 0.5 ml 2 ml 肌醇(500X) 2 ml 1 ml 4 ml 2,4-D 貯存液(1 mg/ml ) 2 ml 1 ml 4 ml 脯氨酸(Proline) 2. 88 g 1. 44 g 5. 76 g 水解酪蛋白(CH) 0. 30 g 0.15 g 0.6 g 蔗糖(sucrose) 30 g 15 g 60 g 植物凝膠(Phytagel )_3_g_1. 5 g_6 g用IN氫氧化鉀調(diào)節(jié)pH值到5. 8，封口后按常規(guī)方法滅菌。N6Hiacro母液(20X)硝酸鉀56. 60g,磷酸二氫鉀8. 00g,硫酸銨9. 26g，硫酸鎂
3. 70g，氯化鈣3. 32g，蒸餾水定容至1L，4°C保存?zhèn)溆谩6 micro 母液(1000X)碘化鉀 0. 80g，硼酸 1. 60g，硫酸錳 3. 33g，硫酸鋅 1. 50g，
蒸餾水定容至1L，4°C保存?zhèn)溆谩ｈF鹽(Fe2EDTA)貯存液(100X)將3. 73g 乙二銨四乙酸二鈉(Na2EDTA · 2H20)和
2. 78g FeSO4. 7H20分別溶解，混合并用。用蒸餾水定容至1000ml，70°C溫浴2h，冷卻后4°C
保存不超過1個月。N6維生素貯存液(1000X)維生素B1 0. 10g，維生素B6 0. 05g，煙酸0. 05g，甘氨酸
0. 20g，加蒸餾水定容至100ml，過濾除菌，4°C保存不超過1周。表3YM 液體培養(yǎng)基(含有 50mg/L Kan, 10mg/L Rif)
Γ IL0. 5 L-
YM Broth 干粉_21_g_10. 5 g_常規(guī)滅菌，冷卻至室溫后加入加入
卡那霉素(Kan) ( 5 0mg/ml )1 ml0.5 ml
利福平(Rif) ( 50rag/ral )0.2 ml0.1ml表4YM 固體培養(yǎng)基(含有 50mg/L Kan, 10mg/L Rif)
權(quán)利要求
一種具有SEQ ID NO1所示核苷酸序列或與其互補的核苷酸序列的啟動子，或其具有啟動子功能的選自如下的變體1)在高等嚴(yán)緊條件下與SEQ ID NO1所示的核苷酸序列雜交的核苷酸序列，2)對SEQ ID NO1所示的核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列，和3)與SEQ ID NO1所示的核苷酸序列具有至少90％的序列同一性的核苷酸序列。
2.一種重組載體，其特征在于，所述重組載體含有權(quán)利要求1所述的啟動子，優(yōu)選地， 所述重組載體為P8+P548重組載體。
3.一種含有權(quán)利要求2所述重組載體的重組細胞。
4.權(quán)利要求3所述的重組細胞，其為重組農(nóng)桿菌EHA105-P548。
5.一種單子葉植物愈傷組織，其特征在于，所述愈傷組織轉(zhuǎn)化有權(quán)利要求1所述的啟 動子，優(yōu)選地，所述愈傷組織為水稻愈傷組織，更優(yōu)選地，所述水稻為日本晴、中花9、中花 10、中花11、臺北309、丹江8號、云稻2號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐優(yōu)22，黔優(yōu)88、II優(yōu)416、 II優(yōu)107、II優(yōu)128、II優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu)527、川農(nóng)1號、雜0152、皖稻88、皖稻90、皖稻92、 皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻197、皖 稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207，以及津原101，特別優(yōu)選地，所述水稻為日本 晴。
6. 一種制備權(quán)利要求1中所述的啟動子的方法，包括如下步驟1)根據(jù)SEQID NO :1所示的核苷酸序列，設(shè)計PCR擴增引物對，具體地，所述PCR擴增 引物對為 SEQ ID NO 2 和 SEQ ID NO 3 ；2)以水稻日本晴基因組DNA為模板，使用步驟1)中所設(shè)計的PCR擴增引物對進行PCR 擴增。
7.—種調(diào)控單子葉植物中基因表達的方法，所述方法包括用權(quán)利要求1所述的啟動子 轉(zhuǎn)化單子葉植物的愈傷組織的步驟，優(yōu)選地，所述愈傷組織為水稻愈傷組織，特別優(yōu)選地， 所述水稻為日本晴。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述單子葉植物愈傷組織的轉(zhuǎn)化過程中利用了權(quán) 利要求4所述的重組農(nóng)桿菌EHA105-P548。
9.權(quán)利要求1所述的啟動子在調(diào)控單子葉植物中目的基因表達的用途，其中所述目的 基因為GUS，所述單子葉植物為水稻，優(yōu)選地，所述水稻為日本晴。
10.權(quán)利要求1所述的啟動子在水稻育種中的用途，優(yōu)選地，所述水稻為日本晴、中花 9、中花10、中花11、臺北309、丹江8號、云稻2號、汕優(yōu)63、汕優(yōu)608、豐優(yōu)22，黔優(yōu)88、II 優(yōu)416、II優(yōu)107、II優(yōu)128、II優(yōu)718、準(zhǔn)兩優(yōu)527、川農(nóng)1號、雜0152、皖稻88、皖稻90、 皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻 197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207，以及津原101，特別優(yōu)選地，所述水稻 為日本晴。
全文摘要
本發(fā)明涉及一種啟動子，特別是一種單子葉植物例如水稻的啟動子，以及所述啟動子的制備方法及用途。本發(fā)明所述啟動子具有SEQ ID NO1所示的核苷酸序列，或其具有啟動子功能的選自如下的變體1)在高等嚴(yán)緊條件下與SEQ ID NO1所示的核苷酸序列雜交的核苷酸序列，2)對SEQ ID NO1所示的核苷酸序列進行一個或多個堿基的取代、缺失、添加修飾的核苷酸序列，和3)與SEQ ID NO1所示的核苷酸序列具有至少90％的序列同一性的核苷酸序列。本發(fā)明還涉及所述啟動子的制備方法以及所述啟動子在調(diào)控單子葉植物中目的基因表達中的用途。
文檔編號A01H5/00GK101955935SQ200910238990
公開日2011年1月26日 申請日期2009年12月31日 優(yōu)先權(quán)日2009年12月31日
發(fā)明者倪雪梅, 李寧, 楊爽, 黃剛 申請人:深圳華大基因科技有限公司