1.一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,包括步驟:
步驟A、采用第三代測序平臺對放線菌進行建庫測序;
步驟B、采用第二代測序平臺對放線菌進行建庫測序;
步驟C、對第三代測序平臺的下機數(shù)據(jù)進行拼接;
步驟D、對第二代測序平臺的下機數(shù)據(jù)進行拼接;
步驟E、對兩個平臺的拼接結(jié)果進行共線性分析以得到各序列之間的連接關(guān)系,依賴該連接關(guān)系對序列進行連接;
步驟F、利用第二代測序平臺下機數(shù)據(jù)對連接結(jié)果進行校正。
2.如權(quán)利要求1所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟A中,所述第三代測序平臺為PacBio RSⅡ。
3.如權(quán)利要求2所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟B中,所述第二代測序平臺為Illumina MiSeq。
4.如權(quán)利要求3所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟C中,所述拼接軟件為SMRT Analysis。
5.如權(quán)利要求4所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟D中,所述拼接軟件為Newbler。
6.如權(quán)利要求5所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟E中,共線性分析軟件為MUMMER。
7.如權(quán)利要求6所述的一種高效的針對于放線菌基因組拼接的方法,其特征在于,所述步驟F中,所述序列校正軟件為pilon。