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診斷增殖性紊亂的方法_3

文檔序號(hào):9264611閱讀:來源:國知局
通過患有和未患有腦癌或增殖性素亂的受試者的代表性的橫截切片的血液樣品中的細(xì) 胞因子/血管生成因子水平的之前研究確定的)或相對(duì)于彼此(例如比較關(guān)注的細(xì)胞因子 /血管生成因子的相對(duì)水平/序型)進(jìn)行評(píng)價(jià)。然后,該樣的評(píng)價(jià)可W與診斷和/或預(yù)測(cè) 關(guān)聯(lián)。特別地,一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的每一種的升高的或降低的水 平的觀察結(jié)果,無論是相對(duì)于預(yù)先確定的闊值還是相對(duì)于彼此,都可W與有利的或不利的 診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。例如,在特定的實(shí)施方案中,與有利的或不利的診斷結(jié)果和 /或預(yù)測(cè)結(jié)果的關(guān)聯(lián)可W參照特定的細(xì)胞因子和/或血管生成因子的集之間的一個(gè)或更多 個(gè)比來進(jìn)行。在特定的實(shí)施方案中,PECAM-1對(duì)PDGF-BB的水平的比可W被用于確定有利 的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果。
[0137] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品用免疫測(cè)定,例如基于抗原-抗體反應(yīng),來測(cè)定。 [013引測(cè)定血液樣品可包括本領(lǐng)域中任何合適的測(cè)定。一種或更多種細(xì)胞因子和/或血 管生成因子的每一種可W單獨(dú)地,任選地連續(xù)地測(cè)定。該樣,血液樣品可W被分成用于測(cè)試 的多個(gè)等分試樣??蛇x地,一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的每一種可平 行方式(例如作為多個(gè)等分試樣)進(jìn)行測(cè)定??蛇x地,一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管 生成因子的每一種可W在同一測(cè)定中(即,用單一血液樣品)W平行方式進(jìn)行測(cè)定,例如通 過多重測(cè)定進(jìn)行測(cè)定。
[0139] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品使用被設(shè)計(jì)W測(cè)量多種細(xì)胞因子和/或血管生成 因子的基于磁珠的多重測(cè)定來測(cè)定。多重化特征使得在僅3小時(shí)內(nèi),使用少至12. 5y1的 血清或血漿,在單一孔中定量多種蛋白的水平是可能的。合適的測(cè)定試劑盒包括Bio-Plex? 和Bio-Plex?Pro系統(tǒng),其將磁珠并入其設(shè)計(jì)。磁珠允許在洗漆步驟期間使用磁性分 離而非真空過濾的選擇。磁性分離允許更高的自動(dòng)化而不會(huì)明顯改變標(biāo)準(zhǔn)Bio-Plex測(cè) 定方案。標(biāo)準(zhǔn)Bio-Plex測(cè)定方案在WWW,bio-rad,com/bio-plex/在線可得,并且被描 述在Bio-PlexPro?測(cè)定手冊(cè)中-http://www.bi〇-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/ literature/10014905.pdf。
[0140]測(cè)定合適地使用多種巧光染色的珠(例如xMAP技術(shù))W在單個(gè)測(cè)定(例如單個(gè) 孔)中同時(shí)檢測(cè)多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子。該樣,兩種或更多種細(xì)胞因子和/或 血管生成因子可W是分析的對(duì)象。在特定的實(shí)施方案中,多達(dá)100個(gè)獨(dú)特的巧光染色的珠 被用于細(xì)胞因子/血管生成因子檢測(cè)。
[0141] 測(cè)定合適地使用具有兩種激光和相關(guān)的光學(xué)器件的流式細(xì)胞儀W測(cè)量結(jié)合在珠 的表面的不同細(xì)胞因子/血管生成因子。
[0142] 測(cè)定合適地使用具有有效控制巧光數(shù)據(jù)的(高速)數(shù)字信號(hào)處理器的診斷試劑 盒。
[0143] 基于珠的測(cè)定合適地W與捕獲夾屯、免疫測(cè)定(capUiresandwichimmunoassay) 類似的方式操作。例如,針對(duì)期望的細(xì)胞因子和/或血管生成因子祀的抗體合適地共價(jià)結(jié) 合至內(nèi)部染色的珠。在測(cè)定期間,珠與相關(guān)血液樣品合適地接觸W有助于共價(jià)結(jié)合的抗體 和祀細(xì)胞因子和/或血管生成因子之間的反應(yīng)。在足夠的接觸時(shí)間之后,將珠合適地洗漆 (任選地?cái)?shù)次)W移除未結(jié)合的蛋白。其后,將對(duì)于與捕獲抗體的表位的不同的表位特異 性的生物素化的檢測(cè)抗體合適地添加至珠反應(yīng)混合物。該合適地產(chǎn)生圍繞細(xì)胞因子/血管 生成因子祀的抗體的夾屯、。然后,合適地添加報(bào)告物復(fù)合物(例如鏈霉親和素-藻紅蛋白 (鏈霉親和素-P巧)W結(jié)合珠表面上的生物素化的檢測(cè)抗體。
[0144] 使用合適的讀取器系統(tǒng)從珠反應(yīng)混合物合適地獲取數(shù)據(jù)。在特定的實(shí)施方案中, 使用Bio-Plex系統(tǒng)(或Luminex系統(tǒng))、雙波長(zhǎng)激光器、基于流體的酶標(biāo)儀系統(tǒng)獲得數(shù)據(jù)。 將珠反應(yīng)混合物合適地吸入讀取器系統(tǒng)。激光和相關(guān)的光學(xué)器件合適地檢測(cè)單個(gè)染色的珠 的內(nèi)部巧光W及珠表面上的巧光報(bào)告物信號(hào)。該合適地鑒定出每一個(gè)測(cè)定并且報(bào)告了樣品 中細(xì)胞因子/血管生成因子的水平。珠上檢測(cè)的巧光強(qiáng)度指示測(cè)試的樣品中祀細(xì)胞因子和 /或血管生成因子分子的相對(duì)量。數(shù)字處理器合適地控制數(shù)據(jù)輸出,數(shù)據(jù)輸出可能地使用 Bio-PlexManager?軟件被合適地進(jìn)一步分析并且呈現(xiàn)為巧光強(qiáng)度(FI)和祀濃度數(shù)據(jù)。
[0145] 然后一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的水平可W如W上描述的被用 于手動(dòng)地或自動(dòng)地(即,如本文定義的通過計(jì)算機(jī)直接處理數(shù)據(jù))確定有利的或不利的診 斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果。
[0146] 在一些實(shí)施方案中,在一種或更多種(合適地預(yù)先指定的)細(xì)胞因子和/或血管 生成因子方面測(cè)定受試者的血液樣品(或其組分)是對(duì)受試者的血液樣品(或其組分)執(zhí) 行光譜分析W產(chǎn)生血液樣品(或其組分)特有的光譜特征。預(yù)想血液中關(guān)于一種或更多種 (合適地預(yù)先指定的)細(xì)胞因子和/或血管生成因子的改變可W導(dǎo)致相關(guān)光譜特征的改變。 陽147]血液樣品的化譜分析
[014引最合適地,光譜分析中使用的血液樣品是血清或血漿,最優(yōu)選地血清。血液樣品優(yōu) 選地是人類血清。
[0149]光譜分析可包括本領(lǐng)域中已知的任何該樣的分析。例如,光譜分析可包括紅外 (1時(shí)、紫外扣V)、核磁共振(NMR)、拉曼和光譜法的許多其他可行的形式。
[0150]然而,在優(yōu)選的實(shí)施方案中,光譜分析是紅外(IR)光譜分析。合適地,IR光譜分 析是傅里葉轉(zhuǎn)換IR(FTIR)光譜分析,合適地使用至少10次掃描、合適地至少15次、合適地 至少30次掃描。合適地,F(xiàn)TIR光譜分析使用至多100次掃描、合適地至多50次掃描并且 最合適地至多40次掃描。在優(yōu)選的實(shí)施方案中,使用32次掃描。合適地,掃描是共加的。 掃描的數(shù)目合適地被選擇W優(yōu)化數(shù)據(jù)容量和數(shù)據(jù)獲取時(shí)間。
[0151]合適地在400-4000的波數(shù)(cm4)區(qū)收集IR光譜。合適地IR光譜具有l(wèi)Ocm4或 更小、合適地Scnfi或更小、尤其4cnTi的分辨率。血液樣品特有的光譜特征(即,特征區(qū)) 合適地是在500至2500cnTi之間的相關(guān)IR光譜的部分或全部、更合適地在800和2000cnTi 之間的光譜的部分或全部、W及最合適地在900和ISOOcnfi之間的光譜(全部)。
[0152]合適地,光譜分析包括矢量歸一化作為預(yù)處理步驟。
[0153]在優(yōu)選的實(shí)施方案中,F(xiàn)TIR光譜分析是衰減全反射FIR(ATR-FTIR)。由于該樣的 光譜技術(shù)固有的消散波與血液樣品相互作用的方式而引起的對(duì)應(yīng)特征的高信息量,該是用 于診斷和/或預(yù)測(cè)來自血液樣品的增殖性素亂的光譜法的特別有效的形式。ATR是使樣品 能夠W固體或液體狀態(tài)直接檢測(cè)的特定的取樣技術(shù)。"ATR晶體"被合適地使用W在IR分析 期間支持血液樣品。合適地,血液樣品在IR分析期間覆蓋"ATR晶體"的表面(或其部分)。 合適的ATR晶體包括錯(cuò)、KRS-5砸化鋒、金剛石和娃。ATR晶體合適地呈板樣(plate-1化e) 形式。在特定的實(shí)施方案中,ATR晶體是單反射金剛石晶體。
[0154]在ATR-FTIR分析期間,將血液樣品加載至ATR晶體上,并且IR光合適地穿過ATR晶體,并且從與樣品接觸的內(nèi)部表面反射(合適地經(jīng)過全內(nèi)反射)至少一次。該樣的反射 形成"消散波",其透入血液樣品至取決于光的波長(zhǎng)、入射角度和ATR晶體和血液樣品自身 的折射率的程度。反射的次數(shù)可W通過改變?nèi)肷浣嵌雀淖儭:线m地,光束由IR檢測(cè)器最終 接收,因?yàn)槠浯嬖诰w。
[0155]"消散波"僅在ATR晶體是具有比血液樣品更高折射率的光學(xué)材料時(shí)才成功實(shí)現(xiàn)。 該樣,在本發(fā)明的上下文中,ATR-FTIR可化圍過小屯、的樣品制備來優(yōu)化。
[0156] 血液樣品的(相對(duì)薄的)膜在FTIR分析之前被合適地施加至ATR晶體表面。樣 品被合適地制備W便包含最少或沒有滯留空氣。血液樣品膜(或至少其暴露至IR分析的 部分)是合適地(基本上)均一厚度,合適地在+/-40ym或更小的公差內(nèi)、更合適地在 +/-20ym或更小的公差內(nèi)、最合適地在+/-10ym或更小的公差內(nèi)。血液樣品跨ATR晶體的 表面(或至少其暴露至IR分析的部分)的平均膜厚合適地在0. 1和200ym之間、合適地 在1和100ym之間、合適地在2和50ym之間。血液樣品跨ATR晶體的表面(或至少其暴 露至IR分析的部分)的最大膜厚度(即,最大厚度的點(diǎn))合適地在1和200ym之間、合適 地在2和100ym之間、合適地在5和50ym之間、或合適地在2和8ym之間。血液樣品跨 ATR晶體的表面(或至少其暴露至IR分析的部分)的最小膜厚度(即,最小厚度的點(diǎn))合 適地在0和40um之間、合適地在1和20um之間、合適地在2和10um之間。
[0157]合適厚度的血液樣品膜通過將0. 1-10yL、合適地0. 2-5yL、最合適地 0. 5-1. 5yL(或約1yL)的所述血液樣品沉積在ATR晶體的表面上合適地獲得。合適地,然 后允許沉積的血液樣品干燥W產(chǎn)生合適厚度的血液樣品膜。合適地,干燥在標(biāo)準(zhǔn)環(huán)境溫度 和壓強(qiáng)(SAT巧(即,約25°C,在lOOkPa)下持續(xù)2和32分鐘之間、更合適地4和16分鐘之 間、最合適地約8分鐘實(shí)現(xiàn),或在產(chǎn)生相同干燥水平的其他等效條件下實(shí)現(xiàn)。獲得的膜通過 白光干設(shè)法的分析可指示跨ATR晶體的表面的膜的厚度,從而驗(yàn)證合適的膜厚度。本發(fā)明 人已經(jīng)發(fā)現(xiàn)產(chǎn)生合適厚度的膜可W降低與樣品制備相關(guān)的特征差異,使得從血液樣品至血 液樣品的特征中任何觀察到的差異可W更可靠地被歸因于不同的組成而不是樣品制備中 的變化性。
[015引合適地,取自大量血液樣品的單個(gè)等分試樣被用于每一個(gè)光譜分析。W該種方式, 另外的等分試樣之后可W被用于對(duì)樣品血液樣品的另外的光譜分析,從而有助于驗(yàn)證結(jié) 果。合適地,對(duì)每一個(gè)血液樣品執(zhí)行至少兩種光譜分析。此外,合適地,用相同等分試樣重 復(fù)每一種單獨(dú)的光譜分析至少兩次、優(yōu)選地至少=次W有助于驗(yàn)證結(jié)果。
[0159] 然后,可W將血液樣品的特征(在特征區(qū)中,在ATR-FTIR光譜法的情況下,通常在 900-1800cnTi)與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián),或另外用W檢測(cè)受試者中 的癌細(xì)胞。通過比較特征與一個(gè)或更多個(gè)預(yù)先關(guān)聯(lián)的特征(即,之前通過例如活組織檢查 獲得的并確認(rèn)的作為指示有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果的特征),該樣的關(guān)聯(lián) 是可能的。該可W通過定性評(píng)價(jià)的方式實(shí)現(xiàn)-例如,某些特征將與具有增殖性素亂的受試 者的血液樣品特有的特征相似(可能在程度上不同),同時(shí)其他特征可能不同于該樣的特 征。該樣,特征表現(xiàn)的定性評(píng)價(jià)可W用于診斷和/或預(yù)測(cè)增殖性素亂。該樣的定性評(píng)價(jià)可 W手動(dòng)地實(shí)施,但是優(yōu)選地通過根據(jù)執(zhí)行該樣的評(píng)價(jià)的計(jì)算機(jī)軟件運(yùn)行的計(jì)算機(jī)數(shù)字化地 實(shí)施。合適地,任何該樣的計(jì)算機(jī)軟件能夠根據(jù)評(píng)價(jià)將特征與有利的或不利的診斷結(jié)果和 /或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。
[0160] 可選地或另外地,與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果的關(guān)聯(lián)可W通過定 量評(píng)價(jià)來進(jìn)行-例如,其中將血液樣品特征與一種或更多種任選地儲(chǔ)存在數(shù)據(jù)庫中的參考 特征(之前已經(jīng)與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián))比較,并且合適地針對(duì) 關(guān)聯(lián)的可能性進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
[0161] 在特定的實(shí)施方案中,將光譜獲得的特征與儲(chǔ)存在數(shù)據(jù)庫(例如"訓(xùn)練集")中 的多個(gè)預(yù)先關(guān)聯(lián)的特征比較,W便得出與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果的關(guān) 聯(lián)。優(yōu)選地基于特征與預(yù)先關(guān)聯(lián)的特征的相似性和差異性的比較合適地執(zhí)行統(tǒng)計(jì)分析 (例如,通過模式識(shí)別算法),然后統(tǒng)計(jì)分析被用于將特征與有利的或不利的診斷結(jié)果和/ 或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。合適地,模式識(shí)別算法包括支持向量機(jī)(SVM)和主成分判別函數(shù)分析 (principalcomponentdiscriminantfunctionanalysis,PC-DFA)。
[0162] 在特定的實(shí)施方案中,基于預(yù)測(cè)模型將光譜獲得的特征與有利的或不利的診斷結(jié) 果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián),所述預(yù)測(cè)模型是通過"訓(xùn)練"(例如通過模式識(shí)別算法)預(yù)先關(guān)聯(lián) 的分析物的數(shù)據(jù)庫開發(fā)的。
[0163] 來自光譜分析的血液樣品特征的檢測(cè)和/或比較不必然地關(guān)注特定的峰或造 成任何特定的峰的特定的物質(zhì)。然而,在ATR-FTIR的情況下,通常作為在約1550cnTi和 1650cnTi的雙峰(尤其當(dāng)TSPA被用作內(nèi)標(biāo)時(shí))出現(xiàn)的兩個(gè)酷胺峰顯示是增殖性素亂的重 要指示物,因?yàn)樵撔┓逯械哪承└淖冎甘颈硎驹鲋承运貋y的蛋白結(jié)構(gòu)的改變。
[0164] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品是全血清。
[0165] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品是通過離屯、過濾移除了lOOkDa W上組分的全血 清。
[0166] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品是通過離屯、過濾移除了lOkDaW上組分的全血 清。
[0167] 在特定的實(shí)施方案中,血液樣品是通過離屯、過濾移除了 3kDaW上組分的全血清。 [016引任何該樣的離屯、過濾可使用與合適的蛋白過濾器組合的微型離屯、機(jī)W14, 000巧m 按照廠家的說明(Amicon膜過濾器,MerckMillipore)來執(zhí)行。
[0169] 在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中,多種光譜分析使用源自同一全血樣品的多種血清 (即,具有不同過濾程度)來執(zhí)行,并且結(jié)果被比較和/或用于交叉驗(yàn)證。
[0170] 撒據(jù)庫、計(jì)算化敕件巧計(jì)算化連施的方法
[0171]本發(fā)明提供了包含多個(gè)數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)庫,每一個(gè)集與特定受試者的特定血液樣品 (或其組分)中一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的量有關(guān),每一個(gè)集與設(shè)及所述 特定受試者中的腦癌的有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。
[0172] 本發(fā)明提供了包含多個(gè)光譜特征的數(shù)據(jù)庫,每一個(gè)特征與特定受試者的特定血液 樣品(或其組分)有關(guān),每一個(gè)特征與設(shè)及所述特定受試者中的增殖性素亂的有利的或不 利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。
[0173] 本發(fā)明提供了包含如本文定義的數(shù)據(jù)庫的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)(例如,光盤)。
[0174] 本發(fā)明的數(shù)據(jù)庫通過測(cè)定或光譜分析來自不同受試者的多個(gè)血液樣品來合適地 建立,W產(chǎn)生用于每一個(gè)血液樣品的分析數(shù)據(jù),然后將分析數(shù)據(jù)與設(shè)及對(duì)應(yīng)的受試者中的 增殖性素亂的有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果系統(tǒng)性地關(guān)聯(lián)。分析數(shù)據(jù)與有利的 或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果的關(guān)聯(lián)通過本領(lǐng)域中熟知的方法(包括活組織檢查)合 適地實(shí)現(xiàn)。分析數(shù)據(jù)可W進(jìn)一步與診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果的有利性或不利性的程度(即, 檢測(cè)的增殖性素亂的嚴(yán)重性、侵襲性和/或程度)進(jìn)行關(guān)聯(lián)。
[01巧]在包含多種光譜特征的數(shù)據(jù)庫的情況下,數(shù)據(jù)庫可W通過首先獲得來自被確證患 有增殖性素亂(或患有某種嚴(yán)重性、侵襲性和/或程度的增殖性素亂)的受試者的代表性 樣品的多種血液樣品特征,W及來自被確證未患有增殖性素亂的受試者的代表性樣品的多 種血液樣品特征來建立。合適地,樣品還可W與其他標(biāo)準(zhǔn)匹配,例如性別或年齡,W有助于 歸一化另外與同樣的增殖性素亂狀態(tài)相關(guān)的受試者之間的差異。
[0176]預(yù)測(cè)模型可W進(jìn)一步通過"訓(xùn)練"數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)庫來建立。該樣的模型然后可W被 并入計(jì)算機(jī)軟件W用于W后預(yù)測(cè)的目的。然后,可將特征全部組合并且(任選地、隨機(jī)地或 選擇性地)分為特征的"訓(xùn)練集"(優(yōu)選地超過50%、合適地約66%的特征被選擇用于訓(xùn) 練集)和特征的"盲集"。然后使用模式識(shí)別算法(例如使用支持向量機(jī),例如通過LIBSVM 或PC-DFA可獲得的那些)合適地通過執(zhí)行網(wǎng)格捜索W優(yōu)化成本和伽馬函數(shù)W保證它可W 鑒定出訓(xùn)練集而合適地訓(xùn)練"訓(xùn)練集",從而產(chǎn)生可行的預(yù)測(cè)模型。然后,可W將"盲集"提 供至模型,該模型然后被請(qǐng)求預(yù)測(cè)盲集中的單個(gè)特征是否應(yīng)該與有利的或不利的診斷結(jié)果 和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。然后可W將預(yù)測(cè)翻譯為闡明進(jìn)行哪些預(yù)測(cè)的"混淆矩陣(con化Sion matrix)"。然后可(例如通過確認(rèn)例如來自活組織檢查的實(shí)際結(jié)果)驗(yàn)證該些預(yù)測(cè)W計(jì)算 模型的靈敏度和特異性。
[0177] 預(yù)測(cè)模型合適地具有大于75%、更合適地大于80%、最合適地大于85%的靈敏 度。預(yù)測(cè)模型合適地具有大于85%、更合適地大于90%、最合適地大于98%的特異性。
[0178]自然地,模型可隨著獲得和關(guān)聯(lián)的進(jìn)一步結(jié)果W及考慮的進(jìn)一步的標(biāo)準(zhǔn)和變量而 更新并且改善。
[0179]建立之后,模型可W被并入診斷計(jì)算機(jī)軟件。然后依據(jù)診斷計(jì)算機(jī)軟件(并且任 選地還依據(jù)數(shù)據(jù)庫)運(yùn)行的計(jì)算機(jī)通過所述軟件被合適地配置W對(duì)新輸入的未關(guān)聯(lián)的特 征執(zhí)行預(yù)測(cè)性診斷和/或預(yù)測(cè)(合適地W如W上確立的靈敏度和特異性),從而將所述特征 與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。
[0180] 該樣,本發(fā)明提供了安裝有診斷計(jì)算機(jī)軟件的計(jì)算機(jī),所述診斷計(jì)算機(jī)軟件被配 置W操作計(jì)算機(jī)W基于受試者的血液樣品的光譜特征執(zhí)行與增殖性素亂有關(guān)的預(yù)測(cè)性診 斷和/或預(yù)測(cè)。合適地,診斷計(jì)算機(jī)軟件并入源自被應(yīng)用于多個(gè)預(yù)先關(guān)聯(lián)的特征的一種或 更多種模式識(shí)別算法的預(yù)測(cè)模型。計(jì)算機(jī)還可W安裝有如本文定義的數(shù)據(jù)庫W有助于關(guān)聯(lián) 結(jié)果。
[0181] 在本發(fā)明的另一方面中,提供了計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì),所述計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)含有如本 文定義的診斷計(jì)算機(jī)軟件。
[0182] 在本發(fā)明的另一方面中,提供了將如本文定義的測(cè)定或光譜分析的結(jié)果與有利的 或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)的計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法,所述方法包括:
[0183]-收集來自所述測(cè)定或光譜分析的數(shù)據(jù);
[0184] -使用預(yù)測(cè)模型,合適地基于對(duì)預(yù)先關(guān)聯(lián)的測(cè)定或光譜分析(任選地與如本文定 義的數(shù)據(jù)庫聯(lián)合)實(shí)施的模式識(shí)別算法W將所述數(shù)據(jù)與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù) 測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。 陽1財(cái)診斷試劑念
[0186] 本發(fā)明提供了用于診斷和/或預(yù)測(cè)受試者中腦癌的診斷試劑盒,所述試劑盒包括 被配置W接收來自所述受試者的血液樣品(或其組分)并且在一種或更多種(合適地預(yù)先 指定的)細(xì)胞因子和/或血管生成因子方面測(cè)定所述血液樣品(或其組分)的裝置擬及 將所述血液樣品(或其組分)中所述一種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的量與有 利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)或有助于所述血液樣品(或其組分)中所述一 種或更多種細(xì)胞因子和/或血管生成因子的量與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果 的關(guān)聯(lián)的裝置(任選地與前述提到的相同)。
[0187] 本發(fā)明提供了用于診斷和/或預(yù)測(cè)受試者中增殖性素亂的診斷試劑盒,所述試劑 盒包括被配置W接收來自所述受試者的血液樣品(或其組分)并且對(duì)所述受試者的血液樣 品(或其組分)執(zhí)行光譜分析W產(chǎn)生血液樣品(或其組分)特有的光譜特征的裝置;W及 將所述血液樣品(或其組分)的所述光譜特征與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果 關(guān)聯(lián)或有助于所述血液樣品(或其組分)的所述光譜特征與有利的或不利的診斷結(jié)果和/ 或預(yù)測(cè)結(jié)果的關(guān)聯(lián)的裝置(任選地與前述提到的相同)。
[018引在一些實(shí)施方案中,用于測(cè)定或分析血液樣品的裝置與用于關(guān)聯(lián)結(jié)果或有助于結(jié) 果的關(guān)聯(lián)的裝置相同。本發(fā)明的診斷試劑盒可W是用于接收和測(cè)定/分析樣品并且還將所 述測(cè)定/分析的結(jié)果與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)的單個(gè)整體裝置。
[0189] 在優(yōu)選的實(shí)施方案中,用于關(guān)聯(lián)結(jié)果或有助于結(jié)果的關(guān)聯(lián)的裝置是可操作的W執(zhí) 行如本文定義的計(jì)算機(jī)實(shí)施的關(guān)聯(lián)方法。合適地,用于關(guān)聯(lián)結(jié)果或有助于結(jié)果的關(guān)聯(lián)的裝 置包括計(jì)算機(jī)或與計(jì)算機(jī)通訊(例如,無論是有線的還是無線的),所述計(jì)算機(jī)配置有軟件 W將所述結(jié)果與有利的或不利的診斷結(jié)果和/或預(yù)測(cè)結(jié)果關(guān)聯(lián)。
[0190] 在用于光譜分析血液樣品的診斷試劑盒的情況下,關(guān)聯(lián)裝置合適地包括如本文定 義的計(jì)算機(jī)或是與如本文定義的計(jì)算機(jī)通訊,所述計(jì)算機(jī)安裝有診斷計(jì)算機(jī)軟件,所述診 斷計(jì)算機(jī)軟件被配置W操作計(jì)算機(jī)基于受試者的血液樣品的光譜特征,執(zhí)行與增殖性素亂 有關(guān)的預(yù)測(cè)性診斷和/或預(yù)測(cè)。
[0191] 在用于光譜分析血液樣品的診斷試劑盒的情況下,被配置W接收血液樣品的裝置 可W被配置W自動(dòng)制備如本文定義的血液樣品(或其組分)。例如,在ATR-FTIR的情況下, 裝置可W被配制W在IR分析開始之前在ATR晶體上自動(dòng)地產(chǎn)生需要的厚度的血液樣品的 膜。裝置可W包括膜厚度驗(yàn)證設(shè)備(例如白光干設(shè)儀)W驗(yàn)證ATR晶體上血液樣品的正確 厚度。
[0192] 診斷試劑盒可W被配置W自動(dòng)執(zhí)行本文定義的任何方法步驟,任選地通過計(jì)算機(jī) 實(shí)施的方法。 實(shí)施例 。19引連施例1-血液樣品的測(cè)定
[0194] 在本實(shí)施例中,使用由Bio-PlexPro?測(cè)定試劑盒提供的基于磁珠的多重測(cè)定對(duì) 血漿樣品執(zhí)行細(xì)胞因子和血管生成因子測(cè)定。本實(shí)施例中充分遵循的所有相關(guān)的方案被列 在標(biāo)題為"Bio-PlexPro?測(cè)定細(xì)胞因子、趨化因子和生長(zhǎng)因子說明手冊(cè)炬io-PlexPro? AssaysCytokine,Chemokine,andGrowthFactorsInstructionManual)"的說明手冊(cè)中, 其在網(wǎng)站W(wǎng)WW,bio-rad.com并且具體地在http: //www.bi〇-rad.com/webroot/
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