歐當(dāng)歸的檢測試劑盒和檢測方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及一種歐當(dāng)歸的檢測試劑盒和檢測方法。
【背景技術(shù)】
[0002] 歐當(dāng)歸(Levisticum officinale Koch),又名保當(dāng)歸,系傘形科歐當(dāng)歸屬多年生 草本植物。1957年,當(dāng)歸緊缺時從保加利亞引種,在我國河北、北京、山東、河南、內(nèi)蒙古、遼 寧、陜西、山西及江蘇等地均有栽培。歐當(dāng)歸以干燥的根入藥,早為德國藥典所收載,香氣特 異而渾濁,性甘、味微辣、微甘而有麻舌感,具有利尿、健胃、祛痰、治療婦科病等功效,是正 品當(dāng)歸常見的偽品。
[0003] 由于歐當(dāng)歸的藥效不及當(dāng)歸,而且藥理上也有較大的不同,因而不能作為當(dāng)歸使 用,但是其本身有藥效,而且栽培容易,生長期短,因此,有效鑒別歐當(dāng)歸,對其進合理使用 是非常必要的。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0004] 為了克服現(xiàn)有技術(shù)的缺陷,本發(fā)明提供了一種新的、方便、快速、準(zhǔn)確地檢測歐當(dāng) 歸的試劑盒和方法。
[0005] 本發(fā)明提供了 SEQ ID NO. 1所示的種核苷酸序列。
[0006] 本發(fā)明還提供了檢測SEQ ID NO. 1所示核苷酸序列的試劑在制備歐當(dāng)歸檢測試劑 中的用途。
[0007] 所述檢測SEQ ID NO. 1所述核苷酸序列的試劑包括擴增SEQ ID NO. 1所示核苷酸 序列的試劑。
[0008] 所述歐當(dāng)歸是傘形科植物歐當(dāng)歸Levisticum officinalis Koch所述擴增的試劑 包括SEQ ID NO. 2~3所示的引物對。
[0009] 本發(fā)明檢測歐當(dāng)歸的試劑盒,包括檢測SEQ ID NO. 1所述核苷酸序列的相關(guān)試劑。
[0010] 所述試劑包括擴增SEQ ID NO. 1所示核苷酸序列的試劑。
[0011] 所述擴增的試劑包括SEQ ID NO. 2~3所示的引物對。
[0012] 本發(fā)明一種歐當(dāng)歸的檢測方法,包括如下步驟:
[0013] a,DNA提?。禾崛〈龣z樣本中的DNA ;
[0014] b,檢測:用前述的試劑盒檢測待檢樣本,即可。
[0015] 本發(fā)明SEQ ID NO. 1所示核苷酸序列為歐當(dāng)歸特異性序列,通過檢測這些序列可 以準(zhǔn)確區(qū)分歐當(dāng)歸與當(dāng)歸、日本當(dāng)歸,從而有效鑒定待檢樣本是否為歐當(dāng)歸,為藥材的合理 使用提供指導(dǎo),本發(fā)明方法操作簡便,具有良好的應(yīng)用前景。
[0016] 下面通過【具體實施方式】對本發(fā)明做進一步詳細(xì)說明,但是并不是對本發(fā)明的限 制,根據(jù)本發(fā)明的上述內(nèi)容,按照本領(lǐng)域的普通技術(shù)知識和慣用手段,在不脫離本發(fā)明上述 基本技術(shù)思想前提下,還可以做出其它多種形式的修改、替換或變更,都是本發(fā)明保護的內(nèi) 容。
【附圖說明】
[0017] 圖1.歐當(dāng)歸的改良RAPD擴增。箭頭為A23的RPAD片段,用于膠回收和克隆。
[0018] 圖2陽性克隆的菌落PCR鑒定。藍(lán)色所指通道的陽性克隆用于Sanger測序。通道 "M"顯示有分子重量(bp)的DL2000 DNA標(biāo)記。泳道1-4分別代表不同陽性克隆的菌落。
[0019] 圖3不同物種及當(dāng)歸品種的鑒定。通道1-18號分別為甘肅岷縣當(dāng)歸,日本當(dāng)歸, 四川阿壩當(dāng)歸,甘肅平?jīng)霎?dāng)歸,湖北當(dāng)歸,四川九寨當(dāng)歸,歐當(dāng)歸,云南麗江當(dāng)歸,四川綿陽 當(dāng)歸,銀杏,荔枝,龍眼,青果,金銀花,梔子花,靈芝,龍荔,趕黃草。藍(lán)色所指的通道2為日 本當(dāng)歸,通道7為歐當(dāng)歸。通道"M"顯示有分子重量(bp)的DL2000DNA標(biāo)記。
[0020] 圖4不同歐當(dāng)歸品種的鑒定。通道1、2和3是日本當(dāng)歸,分別來自重慶,四川峨眉, 延吉吉林;通道4和5是歐當(dāng)歸,來自長春吉林和四川甘孜;6是正常岷縣當(dāng)歸;通道"M"顯 示有分子重量(bp)的DL2000DNA標(biāo)記。
【具體實施方式】
[0021] 實施例1 RAPD技術(shù)擴增歐當(dāng)歸特異SCAR標(biāo)記
[0022] 一、CTAB法提取植物DNA
[0023] 取歐當(dāng)歸0. 2g置于I. 5mL EP管中,加入液氮約半分鐘后用研缽棒碾碎成細(xì)粉,立 即加入 500 μ 1 的 CTAB 提取緩沖液[CTAB2%,Tris-HCl (ρΗ8· 0) IOOmmol · L-1,EDTA20mmol mmol · L-1,NaCL I. 4mol · L-SO. 4%的β -巰基乙醇],60°C水浴保溫1小時后,加入等體 積的氯仿-異戊醇(24 :1)抽提,輕顛倒混勻,10000轉(zhuǎn)每分鐘離心10分鐘,吸取上清液,取 上清加入2/3體積的預(yù)冷的異丙醇,輕輕上下顛倒混勻;12000轉(zhuǎn)每分鐘離心10分鐘,棄上 清,小心傾去上清液,沉淀用70 %乙醇和無水乙醇各輕洗一次,棄洗液,留沉淀,空氣干燥。 用100 μ 1的IXTE溶液溶解備用。將樣品用1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的濃度和質(zhì)量, 用分光光度計測定濃度,稀釋至濃度IOng/μ 1,-20°C保存?zhèn)溆?。詳見《精編醫(yī)學(xué)分子生物 學(xué)實驗指導(dǎo)》(中國醫(yī)藥科技出版社,主編:傅俊江)。
[0024] 二、RAPD 技術(shù) PCR 擴增
[0025] 利用 RAPD 技術(shù)進行擴增(參照 Fu J, Yang L, Khan MA, Mei Z (2〇I3) Genetic characterization and authentication of Lonicera japonica Thunb.by using improved RAPD analysis. Mol Biol Repj40(10):5993-9):
[0026] 以步驟一提取的核酸作為模板,用RAH)引物SBA-Al和SBS-A2進行擴增(序列見 表2,北京賽百盛公司合成),PCR擴增采用10 μ 1反應(yīng)體系包括μ 1的引物(2.5 μπιο?/ L),1. 5 μ I (15ng)模板 DNA,5 μ 1 的 2 X PCR Taq Mastermix (天根生物公司,北京)和 2. 5 μ 1的滅菌雙蒸水。充分混勾后,于離心機12000rpm離心15s,置于PCR儀(Applied Biosystems Veriti?96-Well Thermal Cycler,Life Technology, USA)。PCR 反應(yīng)條件是: 95°C I分30秒,94°C 40秒,36度60秒,72°C I分30秒,40個循環(huán),最后72°C 5分鐘,其中 RAMP為5%。然后用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳,曝光顯色。
[0027] 表 1
[0028]
[0029] 瓊脂糖凝膠電泳(參見《精編醫(yī)學(xué)分子生物學(xué)實驗指導(dǎo)》,中國醫(yī)藥科技出版社, 主編:傅俊江):
[0030] (1)制備1. 5%的瓊脂糖凝膠,將PCR產(chǎn)物按順序全部點樣到凝膠孔內(nèi),同時點樣 一個DNA分子大小標(biāo)記(DL2000, TIANGEN公司,北京)。注意:不需要加載樣緩沖液,PCR擴 增用的2Xmix就預(yù)加了相關(guān)成分。
[0031] (2)電泳(電泳儀由北京百晶生物有限公司生產(chǎn),BG-subMID Icell),常選擇電壓 110V,電泳時間30min即可,
[0032] 三、RAPD擴增條帶的分離
[0033] 1.片段回收
[0034] 1.5%的瓊脂糖凝膠電泳,在紫外線下剪切圖正品歐當(dāng)歸品種的特異片段A1-0,用 DNA瓊脂糖凝膠回收試劑盒(天根生物公司)回收RAH)擴增的DNA片段。
[0035] 2.克隆
[0036] 接著利用pGEM-T載體(Promega Corporation)和回收RAPD擴增的DNA片段在 T4-DNA連接酶作用下連接(16°C連接8小時)。連接后加入30 μ 1活化的DH5 α細(xì)菌,冰 浴30分鐘,接著42 °C激活45秒,然后冰浴2分鐘,再加入300 μ 1無氨芐青霉素的LB培養(yǎng) 基(配制方法:12. 5克LB粉加500ml水高溫滅菌)200轉(zhuǎn)每分鐘搖動45分鐘,然后將液體 均勻涂抹在含氨芐青霉素的固體LB培養(yǎng)基表面,37°C培養(yǎng)15小時[固體培養(yǎng)基配制方法: 12. 5克LB粉,7. 5克瓊脂粉和500毫升水高溫滅菌后,在50°C時加入500 μ 1的氨芐青霉素 (100mg/ml),使用前在固體培養(yǎng)基表面涂抹40 μ 1的20mg/ml的X-GAL (5-溴-4-氯-3-吲 哚-β -D-半乳糖苷)和20 μ 1的24mg/ml的IPTG (異丙基硫代半乳糖苷)]進行藍(lán)白篩選, 篩選白色菌落進行菌落PCR鑒定。
[0037] 3.陽性克隆鑒定
[0038] 每個皿挑選多個白色菌落,分別加入到300 μ 1含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中, 220轉(zhuǎn)每分鐘搖2-4小時,取0. 2~0. 5 μ 1培養(yǎng)基進行菌落PCR反應(yīng)。10 μ 1體積的反應(yīng) 體系是:2XPCR Taq Mastermix 5yl,DNA 0·5μ1,通用引物(SP6+T7)lyl(2.5ymol/L), 水3. 5 μ 1。PCR反應(yīng)條件是:95 °C 1分30秒,94°C 40秒,58 °C 30秒,72 °C 40秒,30個循環(huán), 最后72°C 5分鐘。然后用1. 5%的瓊脂糖凝膠電泳,EB染色、曝光顯色。
[0039] 4.結(jié)果
[0040] 改良RAro擴增見圖1。陽性克隆的菌落PCR擴增和電泳鑒定結(jié)果如圖2。
[0041] 五、測序分析
[0042] 1.測序
[0043] 挑選陽性克隆,進行Sanger測序。測序的核苷酸序列如下(SEQ ID NO. 1所示):
[0044] GCCGAGCTGTATGAACAACTTGTCGAGTTCATCTTCAACTGATCAAAAGGTCCTGTCCTTGACTCGCCG TGTTGTATGAACAACTCATAGAGTTCATCTTCATCCATAAGAAGATTGCCTTAGACTCGCCGAGTCTGCTCATGCAC TCGCTG