本傳授內(nèi)容的這些實(shí)施例和其它特征將從本文中的描述變得更清楚。
【附圖說(shuō)明】
[0016] 圖1是所選擇的Y-STR標(biāo)志物的圖形表示，其中基因多樣性值圖示在x軸上并且 突變率沿著 y軸映射。
[0017] 圖2是Y-STR多重分析組的一個(gè)實(shí)施例第1組的示意性圖示。
[0018] 圖3是Y-STR多重分析組的一個(gè)實(shí)施例第2組的示意性圖示。
[0019] 圖4是Y-STR多重分析組的另一個(gè)實(shí)施例第3組的示意性圖示。
[0020] 圖5是Y-STR多重分析組的再一個(gè)實(shí)施例第4組的示意性圖示。
[0021] 圖6是Y-STR多重分析組的又另一個(gè)實(shí)施例第5組的示意性圖示。
[0022] 圖7是Y-STR多重分析組的又另一個(gè)實(shí)施例第6組的示意性圖示。
[0023] 圖8是關(guān)于圖7的Y-STR組（第6組）運(yùn)行的電泳的圖形表示，顏色分離。第6 個(gè)染料標(biāo)準(zhǔn)泳道圖中未示。
[0024] 圖9是一張表，比較了來(lái)自各種來(lái)源的所選擇的Y-STR標(biāo)志物組與第6組并且包 括每個(gè)組的等位基因的編號(hào)。
[0025] 圖10是Y-STR多重分析組的另一個(gè)實(shí)施例第7組的示意性圖示。
[0026] 圖11是關(guān)于圖10的Y-STR組（第7組）運(yùn)行的電泳的圖形表示，顏色分離。第 6個(gè)染料標(biāo)準(zhǔn)泳道圖中未示。
[0027] 圖12是一張表，比較了來(lái)自各種來(lái)源的所選擇的Y-STR標(biāo)志物組與第7組并且包 括每個(gè)組的等位基因的編號(hào)。
[0028] 圖13是圖形表示，針對(duì)DYS438標(biāo)志物，比較了 Yfilcr?多重分析的等位基因與第 1組到第7組的擴(kuò)展等位基因。
[0029] 圖14是當(dāng)擴(kuò)增所選擇的男性/女性DNA混合物時(shí)DYS456標(biāo)志物的引物長(zhǎng)度影響 的圖形表示。
[0030] 圖15A是圖10的多重組（第7組）的等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物的一個(gè)實(shí)施例的圖形 表不。
[0031] 圖15B是圖10的多重組（第7組）的等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物的另一個(gè)實(shí)施例的圖 形表示。
[0032] 圖16是圖形表示，使用Y-STR第6組和Yfiler?|比較當(dāng)使用遞減量的目標(biāo)DNA時(shí) 從PCR擴(kuò)增回收的等位基因的數(shù)量。
[0033] 圖17是圖形表示，使用Y-STR第7組和YTiler?丨比較當(dāng)使用遞減量的目標(biāo)DNA時(shí) 從PCR擴(kuò)增回收的等位基因的數(shù)量。
[0034] 圖18是圖形表示，比較使用恒定濃度的女性DNA，當(dāng)男性DNA與女性DNA的比率減 小時(shí)，使用Y-STR第6組和Yfikr?多重分析鑒別的等位基因的百分比。
[0035] 圖19是圖形表示，比較使用恒定濃度的女性DNA，當(dāng)男性DNA與女性DNA的比率減 小時(shí)，使用Y-STR第7組和Ylller?多重分析鑒別的等位基因的百分比。
[0036] 圖20是圖形表示，比較使用遞增濃度的女性DNA，當(dāng)男性DNA與女性DNA的比率減 小時(shí)，使用Y-STR第6組和Yfiler?多重分析鑒別的等位基因的百分比。
[0037] 圖21是圖形表示，比較當(dāng)使用第6組多重分析或YPilcrS多重分析時(shí)的顏色內(nèi)平 衡。
[0038] 圖22是圖形表示，比較當(dāng)使用第7組多重分析或Yfiler?多重分析時(shí)，在兩種不同 的男性DNA:女性DNA的比率下的顏色內(nèi)平衡。
[0039] 圖23是圖形表示，比較當(dāng)在存在遞增量的腐殖酸的情況下擴(kuò)增目標(biāo)DNA時(shí)，使用 Y-STR第6組或Yfiler?多重分析鑒別的等位基因的平均百分比。
[0040] 圖24是圖形表示，比較當(dāng)在存在遞增量血色素的情況下擴(kuò)增目標(biāo)DNA時(shí)，使用 Y-STR第6組或Ynidf多重分析鑒別的等位基因的平均百分比。
[0041] 圖25是圖形表示，比較當(dāng)在存在遞增量的血色素或腐殖酸的情況下擴(kuò)增目標(biāo)DNA 時(shí)，使用Y-STR第7組或Yfiler?多重分析鑒別的等位基因的平均百分比。
[0042] 圖26是圖形表示，比較當(dāng)在存在兩種不同濃度的血色素或腐殖酸的情況下執(zhí)行 分析時(shí)第7組或Yl'ilcr?多重分析的顏色內(nèi)平衡。
[0043]圖27是電泳圖的圖形表示，示出了使用Y-STR第6組多重分析得到的男性/男性 混合物的分辨率。
[0044]圖28是使用第7組多重分析，通過(guò)生物樣品在所選擇的底物上直接擴(kuò)增提供的電 泳信號(hào)的顏色內(nèi)平衡的圖形表示。
[0045] 圖29是圖28的直接擴(kuò)增樣品中的一個(gè)的擴(kuò)增結(jié)果的電泳圖的圖形表示。
【具體實(shí)施方式】
[0046] 為了解釋本說(shuō)明書(shū)，將應(yīng)用以下定義并且只要合適，以單數(shù)形式使用的術(shù)語(yǔ)也將 包括復(fù)數(shù)并且反之亦然。除非明確想要相反含義（例如在最初使用所述術(shù)語(yǔ)的文檔中），否 則為了解釋本說(shuō)明書(shū)和其關(guān)聯(lián)的權(quán)利要求書(shū)，在下文闡述的任何定義與所述詞語(yǔ)在任何其 它文檔、包括以引用的方式并入本文中的任何文檔中的用法沖突的情況下，應(yīng)該總是以下 文闡述的定義為準(zhǔn)。應(yīng)注意，除非明確地并且好不含糊地限于一個(gè)指示物，否則如本說(shuō)明書(shū) 和所附權(quán)利要求書(shū)中所用，單數(shù)形式"一（a/an)"和"所述"包括復(fù)數(shù)個(gè)指示物。除非另外 說(shuō)明，否則"或"的使用意指"和/或"。為了說(shuō)明，但不是作為限制，"X和/或Y"可以意指 "X" 或 "Y" 或 "X 和 Y"。"包含（comprise)"，包含（comprises)"，包含（comprising)"、 "包括（include)"，包括（includes)"和"包括（including)"的使用是可互換的并且并不 打算是限制性的。此外，當(dāng)一或多個(gè)實(shí)施例的描述使用術(shù)語(yǔ)"包含"時(shí)，本領(lǐng)域的技術(shù)人員 應(yīng)了解，在一些特定情況下，所述實(shí)施例可以使用語(yǔ)言"基本上由……組成"和/或"由…… 組成"可替代地描述。術(shù)語(yǔ)"和/或"意指所列要素中的一個(gè)或所有或所列元素中的任何兩 個(gè)或兩個(gè)以上的組合。
[0047] 本文中所用的章節(jié)標(biāo)題僅用于組織目的并且不應(yīng)理解為以任何方式限制所述主 題。本說(shuō)明書(shū)中引用的所有文獻(xiàn)，包括（但不限于）專(zhuān)利、專(zhuān)利申請(qǐng)、文章、書(shū)籍以及論文， 全都出于任何目的以其全文引用的方式明確地并入本文中。在所并入的文獻(xiàn)中的任一個(gè)與 本文中所定義的任一術(shù)語(yǔ)矛盾的情況下，以本說(shuō)明書(shū)為準(zhǔn)。雖然結(jié)合各個(gè)實(shí)施例來(lái)描述本 傳授內(nèi)容，但是并不打算將本傳授內(nèi)容限制為所述實(shí)施例。相反地，如本領(lǐng)域的技術(shù)人員應(yīng) 了解，本傳授內(nèi)容涵蓋各種替代方案、修改和等效物。
[0048] 據(jù)稱(chēng)以引用的方式并入本文中但與本文中明確闡述的現(xiàn)有定義、陳述或其它公開(kāi) 內(nèi)容材料相沖突的任何材料或其部分所并入的程度僅為在所并入的材料與本發(fā)明材料之 間不出現(xiàn)沖突。在沖突的情況下，支持本發(fā)明作為優(yōu)選的公開(kāi)內(nèi)容來(lái)解決所述沖突。
[0049] 本發(fā)明的實(shí)踐可以采用在本領(lǐng)域的技能內(nèi)的有機(jī)化學(xué)、聚合物技術(shù)、分子生物學(xué) (包括重組技術(shù)）、細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)以及免疫學(xué)的常規(guī)技術(shù)和描述。所述常規(guī)技術(shù)包 括寡核苷酸合成、雜交、延伸反應(yīng)以及使用標(biāo)記檢測(cè)雜交。合適技術(shù)的具體說(shuō)明可以參看 下文中的實(shí)例。然而，當(dāng)然也可以使用其它等效的常規(guī)程序。所述常規(guī)技術(shù)和描述可見(jiàn)于 標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)指南中，例如基因組分析實(shí)驗(yàn)指南系列（Genome Analysis:A Laboratory Manual Series)(第 I-IV 卷）、PCR 引物實(shí)驗(yàn)指南（PCR Primer:ALaboratory Manual)以及分子克 隆實(shí)驗(yàn)指南（Molecular Cloning:A Laboratory Manual)(全都來(lái)自冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社 (Cold Spring Harbor Laboratory Press), 1989);蓋特（Gait), "寡核苷酸合成的實(shí)用方 法（Oligonucleotide Synthesis:A Practical Approach) "1984, IRL 出版社（IRL Press), 倫敦（London),納爾遜（Nelson)和考克斯（Cox) (2000);勒寧格爾（Lehninger),生物化 學(xué)原理（Principles of Biochemistry)第3版，W.H.弗里曼（W.H.Freeman)出版，紐約 (New York),紐約州（N.Y.);以及伯格（Berg)等人（2002)生物化學(xué)（Biochemistry),第 5版，W.H.弗里曼出版，紐約，紐約州，所有這些都出于所有目的以其全文引用的方式并入 本文中。
[0050] 如本文所用的術(shù)語(yǔ)"等位基因"是指與基因或DNA鏈段相關(guān)的遺傳變異，即，占據(jù) 相同基因座的DNA序列的兩種或兩種以上替代形式中的一種。在一些實(shí)施例中，在基因座 內(nèi)的等位基因涵蓋具有多態(tài)性串聯(lián)重復(fù)堿基對(duì)基元的核酸分子。串聯(lián)重復(fù)單元數(shù)量的變異 區(qū)分基因座內(nèi)的等位基因。
[0051] 術(shù)語(yǔ)"野生型等位基因"或"優(yōu)勢(shì)等位基因"在本文中可互換地使用并且如本文 所用是指在指定的種、屬、科、社會(huì)部分、部落、種族或種族人口中發(fā)現(xiàn)的最常出現(xiàn)的等位基 因。野生型等位基因可以認(rèn)為是最常見(jiàn)的等位基因。
[0052] 如本文所用的術(shù)語(yǔ)"變異體等位基因"是指從最常出現(xiàn)的等位基因變異。它還可 以指在一或多個(gè)核酸位置，核酸序列在一或多個(gè)位置的改變，當(dāng)與在指定的種、屬、科、社會(huì) 部分、部落、種族或種族人口的等位基因中所發(fā)現(xiàn)的在一或多個(gè)核酸位置的最常見(jiàn)等位基 因相比時(shí)，產(chǎn)生了一或多個(gè)差異。
[0053] 如本文所用的術(shù)語(yǔ)"等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物"是指涵蓋特定STR標(biāo)志物的一或多個(gè) 等位基因的大小標(biāo)準(zhǔn)的核酸大小標(biāo)準(zhǔn)。等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物充當(dāng)從STR標(biāo)志物擴(kuò)增的等位 基因的參照標(biāo)準(zhǔn)和核酸大小標(biāo)志物。
[0054] 如本文所用，術(shù)語(yǔ)"擴(kuò)增引物"和"寡核苷酸引物"可互換地使用并且是指能夠退火 到與目標(biāo)序列相鄰的RNA或DNA區(qū)域并且充當(dāng)在本領(lǐng)域中眾所周知的合適條件下進(jìn)行DNA 合成的起始引物的寡核苷酸。通常，PCR反應(yīng)采用"擴(kuò)增引物對(duì)"，也稱(chēng)為"寡核苷酸引物對(duì)"， 包括"上游"或"正向"引物和"下游"或"反向"引物，它們限定了要擴(kuò)增的RNA或DNA的區(qū) 域。第一引物和第二引物可以是正向或反向引物并且在本文中可互換地使用并且不是限制 性的。
[0055] 如本文所用，"擴(kuò)增"是指以酶促方式增加特定核苷酸序列的量的過(guò)程。這種擴(kuò)增 不限于通過(guò)PCR實(shí)現(xiàn)，但主要是通過(guò)PCR實(shí)現(xiàn)。如本文所用，"變性"是指從退火狀態(tài)分離兩 條互補(bǔ)核苷酸鏈。變性可以通過(guò)多種因素誘導(dǎo)，例如緩沖液的離子強(qiáng)度、溫度或破壞堿基配 對(duì)相互作用的化學(xué)品。如本文所用，"退火"是指核苷酸鏈之間的特定相互相用，其中所述鏈 基本上基于如通過(guò)沃森-克里克（Watson-Crick)堿基配對(duì)所測(cè)定的鏈之間的互補(bǔ)性彼此 結(jié)合。為了發(fā)生退火，互補(bǔ)性不必是100%。如本文所用，"延伸"是指在引物寡核苷酸和目 標(biāo)核酸已經(jīng)彼此退火之后的擴(kuò)增循環(huán)，其中聚合酶催化引物延伸，由此實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增，使用目標(biāo) 核酸作為復(fù)制模板。
[0056] 術(shù)語(yǔ)"擴(kuò)增子"、"擴(kuò)增產(chǎn)物"和"已擴(kuò)增序列"在本文中可互換地使用并且是指用 于以線性方式或以指數(shù)方式增加多核苷酸序列的廣泛技術(shù)并且可以是擴(kuò)增反應(yīng)的產(chǎn)物。擴(kuò) 增子可以是雙鏈或單鏈，并且可以包括通過(guò)使雙鏈擴(kuò)增產(chǎn)物變性獲得的分開(kāi)的組分鏈。在 某些實(shí)施例中，一個(gè)擴(kuò)增循環(huán)的擴(kuò)增子可以充當(dāng)后一擴(kuò)增循環(huán)中的模板。例示性擴(kuò)增技術(shù) 包括（但不限于）PCR或采用引物延伸步驟的任何其它方法。擴(kuò)增的其它非限制性實(shí)例包 括（但不限于）連接酶檢測(cè)反應(yīng)（LDR)和連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（LCR)。擴(kuò)增方法可以包括熱循 環(huán)或可以等溫執(zhí)行。在不同實(shí)施例中，術(shù)語(yǔ)"擴(kuò)增產(chǎn)物"和"已擴(kuò)增序列"包括來(lái)自任何數(shù) 量的擴(kuò)增反應(yīng)循環(huán)的產(chǎn)物。
[0057] 如本文所用，術(shù)語(yǔ)"堿基對(duì)基元"是指核堿基序列配置，包括（但不限于）重復(fù)序 列、具有生物學(xué)意義的序列、串聯(lián)重復(fù)序列等。
[0058] 如本文所用，術(shù)語(yǔ)"比較"廣泛地指兩個(gè)或兩個(gè)以上核酸序列之間的差異。類(lèi)似 性或差異可以通過(guò)各種方法來(lái)測(cè)定，包括（但不限